合成生物学相关文章
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当前共找到 170 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-05 |
Levels of autonomy in synthetic biology engineering
2020-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010019
PMID:33331138
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综述 | 探讨合成生物学工程中的自主性层次，分析标准化与自动化在工程生物体中的应用现状与挑战 | 系统梳理其他工程领域标准化与自动化经验，对比分析合成生物学领域尚未实现全流程自动化的核心障碍 | 未提供具体实验数据或定量分析，属于概念性综述，缺乏对现有自主性层次划分的实证验证 | 评估合成生物学工程中自主性水平的现状与发展方向 | 合成生物学工程过程及自主化设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-04-30 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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综述 | 该论文综述了利用芽殖酵母作为工厂来工程化部分和完整微生物基因组的最新进展 | 总结了酵母在合成生物学中作为宿主进行高效基因组编辑的新方法，以及快速合成、组装和修改病毒与细菌基因组以应对新兴病原体的潜力 | 大型DNA分子（超过2百万碱基对）难以克隆、细菌基因组的拯救困难，以及技术的双重用途潜力需谨慎考虑 | 探讨酵母细胞在微生物基因组工程中的应用及其生物学意义 | 芽殖酵母及微生物基因组（包括病毒和细菌基因组） | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 基因组合成与组装 | 医学、工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-24 |
Point-of-Care Devices to Detect Zika and Other Emerging Viruses
2020-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了用于检测寨卡病毒及其他新兴病毒的即时检测设备，重点比较了侧向流免疫层析法和合成生物学诊断方法 | 本文创新性地提出侧向流免疫层析法与合成生物学诊断（包括CRISPR诊断）相结合可能是未来可扩展快速诊断的最佳方案，并描述了结合功能化多色纳米颗粒和计算方法来区分密切相关的病原体 | NA | 评估和比较多种快速诊断平台，为应对新兴病毒传播提供有效的即时检测策略 | 寨卡病毒及其他新兴病毒 | 人工智能 | 寨卡病毒感染 | 侧向流免疫层析法，合成生物学诊断，CRISPR诊断 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成基因回路（病原体核酸序列识别激活回路） | 医学 |
| 4 | 2026-04-20 |
Development of a C18 Supercritical Fluid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Methodology for the Analysis of Very-Long-Chain Polyunsaturated Fatty Acid Lipid Matrices and Its Application to Fish Oil Substitutes Derived from Genetically Modified Oilseeds in the Aquaculture Sector
2020-Sep-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c02631
PMID:32923786
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研究论文 | 开发了一种基于C18超临界流体色谱-串联质谱的方法，用于分析含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质基质，并将其应用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的效果 | 首次将高强度的硅胶C18柱与超临界流体色谱-串联质谱联用，实现了对复杂脂质组中脂质类别的离散分离及同类别内异构体的选择性分析，特别适用于合成生物学改造产物的脂质组学研究 | 方法主要针对含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质组，对于其他类型脂质基质的适用性未进行广泛验证 | 开发一种快速、环保且高效的脂质组学分析方法，用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的营养效果 | 鲑鱼肉中的复杂脂质组，特别是含有18:3、20:5和22:6等超长链多不饱和脂肪酸的三酰甘油和磷脂 | NA | NA | 超临界流体色谱-串联质谱、主动扫描四极杆技术、数据非依赖性采集 | NA | 质谱数据 | 饲喂转基因油籽补充饲料的鲑鱼与对照饲料鲑鱼的肉质样本 | NA | 转基因油籽（陆地油籽作物） | NA | 农业、水产养殖、工业生物技术 |
| 5 | 2026-04-08 |
Mycoplasma pneumoniae Genome Editing Based on Oligo Recombineering and Cas9-Mediated Counterselection
2020-07-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00022
PMID:32502342
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研究论文 | 本研究开发了一种基于寡核苷酸重组工程和CRISPR/Cas9反选择技术的支原体基因组编辑方法 | 首次在支原体中建立了基于GP35单链DNA重组酶的寡核苷酸重组工程系统，并结合CRISPR/Cas9反选择技术显著提高了编辑效率 | 基因删除效率随编辑片段增大而降低，对于超过1.8kb的染色体删除可能需要进一步优化 | 开发高效的支原体基因组编辑工具以推动其作为合成生物学底盘菌株的应用 | 肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae） | 合成生物学 | NA | 寡核苷酸重组工程、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, GP35重组酶 | 肺炎支原体 | NA | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-04-03 |
Multifunctional SEVA shuttle vectors for actinomycetes and Gram-negative bacteria
2020-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1024
PMID:32170856
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研究论文 | 本研究开发了23种遵循SEVA标准架构的多功能穿梭载体，用于放线菌和革兰氏阴性菌的基因工程 | 开发了结合革兰氏阴性菌和放线菌（特别是链霉菌）复制起点的多功能SEVA穿梭载体，并引入了新的安普霉素抗性选择标记 | 未明确说明载体在所有放线菌物种中的通用性测试范围，也未讨论长期遗传稳定性 | 扩大链霉菌及其他放线菌的遗传工具库，促进其作为合成生物学通用底盘的应用 | 链霉菌属（特别是Streptomyces albus J1074）及其他放线菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | SEVA (Standard European Vector Architecture), Gibson Assembly | Streptomyces albus J1074, Escherichia coli, 放线菌, 革兰氏阴性菌 | 穿梭载体（含整合型、低拷贝数、中高拷贝数复制起点），异源表达系统（用于GFP和芹菜素生产） | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-03-29 |
Drivers of metabolic diversification: how dynamic genomic neighbourhoods generate new biosynthetic pathways in the Brassicaceae
2020-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.16338
PMID:31769874
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研究论文 | 本研究通过分析十字花科植物基因组，探讨了基因组动态邻域如何通过基因重排驱动三萜类生物合成途径的多样化进化 | 揭示了植物基因组通过动态基因组邻域重组核心酶基因库来产生新生物合成途径的进化机制，为植物代谢多样化提供了基因组学解释 | 研究仅基于13个已测序的十字花科基因组，功能验证仅针对三个代表性基因簇，可能未涵盖该家族的全部代谢多样性 | 探究植物新生物合成途径的进化机制，特别是三萜类代谢途径的多样化过程 | 十字花科植物的三萜类生物合成基因簇及其基因组邻域 | 植物基因组学与代谢工程 | NA | 基因组测序、系统发育分析、功能验证 | NA | 基因组序列数据 | 13个已测序的十字花科植物基因组，包含163个OSC基因 | NA | 十字花科植物 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 8 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略，用于区分近似的DNA和RNA序列，以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略，通过谨慎交换密码子实现，对酵母生理影响最小，并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印，结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型，水印策略对Gpm1基因有轻微影响，且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略，以区分合成与天然基因副本，支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）中的13个糖利用途径基因，包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株，涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径，通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-03-25 |
Machine learning predicts new anti-CRISPR proteins
2020-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa219
PMID:32286628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的工具AcRanker，用于从蛋白质序列中直接预测新的抗CRISPR蛋白 | 首次提出基于XGBoost排序的机器学习方法，仅使用蛋白质序列信息即可预测抗CRISPR蛋白，成功发现两个新型抗CRISPR蛋白AcrIIA20和AcrIIA21 | 预测的候选抗CRISPR蛋白仍需实验验证其抑制活性，且模型性能受训练数据集限制 | 开发快速发现新型抗CRISPR蛋白的生物信息学工具 | 细菌前噬菌体区域中的潜在抗CRISPR蛋白 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列分析，XGBoost机器学习 | XGBoost | 蛋白质序列数据 | 已知抗CRISPR蛋白训练集，从自靶向细菌基因组预测的前噬菌体区域筛选 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学，农业，合成生物学 |
| 10 | 2026-03-25 |
A GoldenBraid cloning system for synthetic biology in social amoebae
2020-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa185
PMID:32232356
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研究论文 | 本文介绍了GoldenBraid克隆系统在盘基网柄菌合成生物学中的应用，包括一个包含250个DNA部件和组件的库，以及一个概念验证菌株 | 首次将GoldenBraid克隆系统应用于盘基网柄菌，提供了一个模块化的合成生物学框架，并开发了一个包含250个DNA部件的库 | NA | 开发一个用于盘基网柄菌的快速、模块化和稳健的克隆系统，以促进合成生物学研究 | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | 合成生物学 | NA | GoldenBraid克隆系统 | NA | NA | NA | GoldenBraid | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | cAMP趋化性概念验证菌株，包含四个荧光报告基因编码于一个质粒 | 医学 |
| 11 | 2025-10-05 |
In situ chromatin interactomics using a chemical bait and trap approach
2020-06, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-020-0474-8
PMID:32472103
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研究论文 | 开发了一种化学诱饵捕获方法用于研究染色质内组蛋白修饰的相互作用组 | 使用合成生物学方法在天然染色质中设置组蛋白修饰控制的光亲和陷阱，能够捕获瞬时相互作用因子 | NA | 探索表观遗传调控和失调的分子机制 | 组蛋白翻译后修饰的相互作用伙伴 | 表观遗传学 | 癌症 | 定量蛋白质组学、原位蛋白质组学、光亲和标记 | NA | 蛋白质组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | 组蛋白修饰控制的光亲和陷阱系统 | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optogenetics
2020-Nov-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10120318
PMID:33260589
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综述 | 本文综述了生物发光作为生物光源在触发生理事件和控制细胞行为方面的新兴应用方法 | 探索了生物发光超越传统报告技术的潜力，将其作为控制细胞行为的生物光源 | NA | 探讨生物发光在合成生物学中的潜在应用 | 细胞和生物体水平的生理过程 | 合成生物学 | NA | 生物发光技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物发光驱动的光遗传学系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
Engineering microbial diagnostics and therapeutics with smart control
2020-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.05.006
PMID:32563763
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术开发具有区域选择性和疾病响应能力的智能微生物用于诊断和治疗应用 | 通过生物传感器使微生物表达具有区域选择性和疾病响应能力的蛋白质，实现智能诊断和治疗 | NA | 探讨合成生物学技术在微生物工程中的应用，以推进生物医学领域发展 | 工程化微生物及其在诊断和治疗中的应用 | 合成生物学 | 细菌感染,癌症,炎症性疾病,代谢性疾病 | 生物传感器技术 | NA | NA | 动物模型和临床样本 | NA | 微生物 | 生物传感器,响应性表达系统 | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Dynamical model fitting to a synthetic positive feedback circuit in E. coli
2020-Jun, Engineering biology
DOI:10.1049/enb.2020.0009
PMID:36970395
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研究论文 | 本研究开发了一个动态模型来拟合大肠杆菌中合成的正反馈电路行为 | 采用逐步方法将模型参数与时间序列数据进行拟合，能够解析不同参数的作用并识别参数间的依赖性和冗余性 | NA | 开发能够精确预测合成生物学组件行为的定量动态模型 | 大肠杆菌中的合成正反馈电路 | 合成生物学 | NA | 动态模型拟合 | 常微分方程模型 | 时间序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 正反馈电路，将丝状噬菌体分泌素pIV置于噬菌体休克启动子控制下 | 工业生物技术 |
| 15 | 2024-11-06 |
Proteolytic Queues at ClpXP Increase Antibiotic Tolerance
2020-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00358
PMID:31860281
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研究论文 | 研究了蛋白酶在抗生素耐受性中的作用，特别是通过排队理论、计算模型和合成生物学方法探讨了ClpXP蛋白酶队列对耐受性的影响 | 发现ClpXP蛋白酶队列增加了抗生素耐受性，为研究细菌耐药性提供了新的方法 | 未观察到对抗生素持久性的影响 | 探讨蛋白酶在抗生素耐受性中的作用 | ClpXP蛋白酶队列在抗生素耐受性中的作用 | NA | NA | 排队理论、计算模型、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-10-01 |
Biological Materials: The Next Frontier for Cell-Free Synthetic Biology
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00399
PMID:32478045
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研究论文 | 本文探讨了无细胞合成生物学在可持续生物制造中的创新应用，特别是其在生物材料生产中的潜力 | 本文提出了无细胞合成生物学在生物材料生产中的新应用，结合化学工程和代谢工程的优势，通过直接添加辅因子、底物和化学物质，实现生物合成途径的组装和优化 | 尽管无细胞合成生物学在生物材料生产中展现出潜力，但仍面临一些挑战，如自动化设计周期的复杂性和优化生物合成途径的难度 | 探讨无细胞合成生物学在生物材料生产中的应用，推动全球制造业向本地化和生态和谐的生产过程转变 | 无细胞合成生物学策略在精细化学品、生物燃料和生物材料生物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-01 |
From Microbial Communities to Distributed Computing Systems
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00834
PMID:32793576
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综述 | 本文讨论了从微生物群落到分布式计算系统的分布式生物系统的潜力和挑战 | 提出利用分布式生物系统来克服单培养的复杂性瓶颈，扩展合成生物学的应用领域 | 讨论了构建共培养物的挑战，包括竞争排斥和维持所需社区组成的问题 | 探讨分布式生物系统在合成生物学中的应用潜力及其面临的挑战 | 微生物群落和分布式计算系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-09-30 |
The Emerging Landscape of Immune Cell Therapies
2020-04-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.001
PMID:32243795
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review | 本文综述了免疫细胞疗法在癌症、传染病和自身免疫性疾病中的现状，并讨论了通过细胞工程克服进展障碍的进展 | 本文介绍了免疫细胞疗法的最新进展，包括基因工程、基因编辑和合成生物学在提高疗法复杂性、效力和安全性方面的应用 | NA | 总结免疫细胞疗法的现状并讨论其未来发展方向 | 免疫细胞疗法在癌症、传染病和自身免疫性疾病中的应用 | NA | NA | 基因工程、基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-09-27 |
Plant Biosystems Design for a Carbon-Neutral Bioeconomy
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/7914051
PMID:37849896
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研究论文 | 本文讨论了利用植物生物系统设计实现碳中和生物经济的策略 | 提出了通过合成生物学加速植物品种、基因型或变种的开发，以优化地上和地下植物组织的生物量和碳封存 | 本文仅简要讨论了知识缺口和合成生物学的潜力，未深入探讨具体实施细节 | 探讨如何通过植物生物系统设计实现碳中和生物经济 | 植物品种、基因型或变种的开发 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-09-27 |
Biosystems Design to Accelerate C3-to-CAM Progression
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/3686791
PMID:37849902
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研究论文 | 本文总结了系统生物学水平上对CAM途径分子过程的理解，并回顾了在进化背景下CAM工程的原理，最后讨论了利用合成生物学工具箱加速C-to-CAM过渡的技术方法 | 利用合成生物学工具箱加速C-to-CAM过渡 | 工程化CAM代谢途径具有挑战性，需要深入理解酶促反应和调控网络，并克服生理代谢限制 | 通过工程化CAM代谢途径提高作物的水分利用效率 | CAM代谢途径及其在作物中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |