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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-05 |
Data-driven statistical modeling of the emergent behavior of biohybrid microrobots
2020-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/1.5134926
PMID:32128471
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研究论文 | 本文提出了一种数据驱动的统计模型,用于预测生物混合微型机器人群体的自发行为 | 提出了一种结合统计模型和合作基因表达的计算模型,能够有效复现细菌基础的生物混合群体的运动动态 | 模型主要依赖于特定环境下的实验数据,可能无法完全适应复杂、异质的真实环境 | 研究生物混合微型机器人的自发行为,以指导合成基因电路的设计 | 细菌基础的生物混合机器人群体NanoBEADS和BacteriaBots | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | 统计模型 | 动力学数据 | 两种类型的细菌群体(NanoBEADS和BacteriaBots) | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-05 |
Formal reasoning about synthetic biology using higher-order-logic theorem proving
2020-Oct, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/iet-syb.2020.0026
PMID:33095748
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研究论文 | 本文提出了一种通过高阶逻辑定理证明对合成生物学进行形式推理的方法 | 使用高阶逻辑定理证明补充传统的分析方法,以确保生物系统分析的准确性 | 传统分析方法的固有限制可能导致结果不准确 | 研究合成生物学中生物电路和生物控制器的分析方法 | 合成生物学中的基因电路和生物控制器 | 数字病理学 | 癌症 | 高阶逻辑定理证明 | NA | 数学模型 | 广泛分析的基因电路和控制器,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-05 |
Improved betulinic acid biosynthesis using synthetic yeast chromosome recombination and semi-automated rapid LC-MS screening
2020-02-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14708-z
PMID:32054834
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研究论文 | 本研究改进了贝图林酸的生物合成,结合了合成酵母染色体重组和半自动快速LC-MS筛选。 | 提出了一种结合自动化样品准备和超快速LC-MS方法的半自动工作流程,以快速分离和表征最佳表现的酵母株。 | 尽管改进了筛选能力,但仍可能受到样本多样性和规模的限制。 | 优化工程酵母株以提高贝图林酸的产量。 | 使用SCRaMbLE系统优化生产贝图林酸的酵母株。 | 合成生物学 | NA | LC-MS | NA | 生物样本 | 1,000个菌落,识别和测序12个菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
What is (synthetic) life? basic concepts of life in synthetic biology
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0235808
PMID:32722674
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research paper | 本文通过定性访谈研究,探讨了合成生物学领域科学家对生命基本概念的理解和应用 | 本文首次通过访谈研究,揭示了合成生物学领域内对生命基本概念的四种主要理解,为该领域的科学研究和实验提供了基础框架 | 本文仅基于定性访谈数据,可能未能涵盖所有合成生物学领域内对生命概念的理解 | 旨在更好地理解合成生物学中生命的基本概念及其对科学研究和实验的影响 | 合成生物学领域的科学家及其对生命基本概念的理解 | synthetic biology | NA | NA | NA | interview | 多位合成生物学领域的科学家 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Building sophisticated sensors of extracellular cues that enable mammalian cells to work as "doctors" in the body
2020-Sep, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03486-y
PMID:32185403
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术开发用于检测细胞外环境信号的传感器系统,并探讨了其在治疗难治性疾病中的应用潜力 | 介绍了先进的工程原理,用于设计检测可溶性因子和特定细胞接触的传感器系统 | 讨论了这些新兴技术面临的挑战 | 探讨工程化细胞作为体内“医生”,诊断疾病状态并按需产生和递送治疗分子的潜力 | 工程化细胞和传感器系统 | 合成生物学 | 难治性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Quorum sensing for population-level control of bacteria and potential therapeutic applications
2020-Apr, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-019-03326-8
PMID:31612240
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综述 | 本文综述了群体感应(QS)在细菌群体水平控制及其在开发新型临床治疗中的潜在应用 | 总结了遗传振荡器、切换开关和逻辑门与基于AHL的QS设备在革兰氏阴性菌中的结合发展,并概述了基于AIP的QS设备在革兰氏阳性菌中的应用 | NA | 探讨群体感应在单克隆合成生物学和合成生态学中的应用挑战和未来展望 | 群体感应在细菌群体控制和临床治疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
A Generative Neural Network for Maximizing Fitness and Diversity of Synthetic DNA and Protein Sequences
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.05.007
PMID:32711843
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研究论文 | 本文开发了一种名为深度探索网络(DENs)的生成模型,用于最大化合成DNA和蛋白质序列的适应性和多样性 | DENs通过梯度下降最小化神经网络适应度预测器的成本,并基于相似性度量惩罚任何两个生成的模式,从而显式地最大化序列多样性 | NA | 工程化具有定义功能属性的基因和蛋白质序列 | 合成DNA和蛋白质序列的适应性和多样性 | 机器学习 | NA | 梯度上升优化 | 生成神经网络 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
A short review on cell-based biosensing: challenges and breakthroughs in biomedical analysis
2020-Dec-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.34.20200128
PMID:33888671
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综述 | 本文综述了基于细胞的生物传感器的最新进展,重点介绍了其在生物医学分析中的挑战和突破 | 介绍了基于细胞的生物传感器在生物医学分析中的新概念和合成生物学工具箱的应用,以及如何开发具有定制性能的生物传感平台 | NA | 旨在激发对基于细胞的生物传感器的兴趣,并提高其接受度和应用 | 基于细胞的生物传感器及其在生物医学分析中的应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetases for use in synthetic biology
2020, The Enzymes
DOI:10.1016/bs.enz.2020.06.004
PMID:33837709
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研究论文 | 本文讨论了在合成生物学领域中,通过遗传密码扩展技术利用工程化的氨酰-tRNA合成酶(aaRSs)来扩展蛋白质氨基酸集合的方法 | 本文介绍了如何通过实验室技术创建设计型的aaRSs和tRNAs,并强调了正交性在遗传密码扩展中的重要性 | NA | 探索和优化遗传密码扩展技术,以在治疗学、生物修复和生物催化等领域中应用 | 工程化的氨酰-tRNA合成酶及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
An endoribonuclease-based feedforward controller for decoupling resource-limited genetic modules in mammalian cells
2020-11-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19126-9
PMID:33173034
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research paper | 本文研究了在哺乳动物细胞中,由于转录和翻译资源的加载导致的遗传模块耦合问题,并开发了一种基于内切酶的前馈控制器来适应这种资源加载,实现基因表达水平的精确调控 | 开发了一种新型的基于内切酶的前馈控制器,能够在哺乳动物细胞中实现对基因表达水平的精确调控,且设计可跨细胞系移植 | NA | 解决合成生物学中遗传设备因资源限制导致的模块性缺失问题,实现基因表达的可预测、鲁棒和上下文无关控制 | 哺乳动物细胞中的遗传系统 | 生物技术 | NA | 内切酶 | 前馈控制器 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Single enzyme RT-PCR of full-length ribosomal RNA
2020, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa028
PMID:33409375
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研究论文 | 本文开发了一种使用合成的热稳定逆转录酶(RTX)的方法,以实现和优化16S和23S rRNA的全长逆转录PCR | 采用了一种合成的热稳定逆转录酶(RTX),以克服rRNA逆转录的挑战,并优化了全长rRNA的RT-PCR过程 | NA | 旨在通过工程化rRNA来深化对分子翻译的理解,并创造具有改变性质的核糖体,从而扩展生命的化学 | 16S和23S rRNA,它们分别构成了30S小亚基和50S大亚基 | NA | NA | 逆转录PCR(RT-PCR) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Bioengineering Approaches to Accelerate Clinical Translation of Stem Cell Therapies Treating Osteochondral Diseases
2020, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2020/8874742
PMID:33424981
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综述 | 本文综述了利用生物工程方法加速干细胞治疗骨软骨疾病的临床转化进展 | 探讨了利用合成生物学工具控制分化命运和传递治疗性生物分子以调节免疫反应的新方法 | NA | 旨在强调利用生物工程方法改进干细胞治疗骨软骨疾病的最新进展 | 骨软骨组织及其疾病 | 生物工程 | 骨软骨疾病 | 微凝胶包封、粘附性生物墨水和生物打印 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Evaluation and Comparison of the Efficiency of Transcription Terminators in Different Cyanobacterial Species
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.624011
PMID:33519785
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研究论文 | 本研究评估并比较了不同蓝细菌物种中转录终止子的效率 | 首次在蓝细菌中系统地评估了34个内源性转录终止子的效率,并发现了在不同物种中表现一致的高效终止子 | 研究仅限于特定的蓝细菌物种和终止子序列,可能无法推广到所有蓝细菌 | 探索蓝细菌中转录终止子的效率,以优化人工基因表达系统 | 蓝细菌中的转录终止子 | 合成生物学 | NA | CyanoGate MoClo Assembly system | NA | DNA序列 | 34个内源性转录终止子在三种蓝细菌物种中进行测试 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Caffeine and Theophylline Inhibit β-Galactosidase Activity and Reduce Expression in Escherichia coli
2020-Dec-22, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c03909
PMID:33376862
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研究论文 | 本文研究了咖啡因和茶碱对大肠杆菌中β-半乳糖苷酶的表达和活性的影响 | 首次展示了咖啡因和茶碱对β-半乳糖苷酶的表达和活性的负面影响 | 建议在预期存在此类甲基黄嘌呤时使用替代报告系统 | 探讨咖啡因和茶碱对β-半乳糖苷酶的影响 | β-半乳糖苷酶的表达和活性 | 微生物学 | NA | NA | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Biofilm and swarming emergent behaviours controlled through the aid of biophysical understanding and tools
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200972
PMID:33300966
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综述 | 本文综述了通过生物物理学理解和工具控制生物膜和群集涌现行为的最新研究 | 介绍了利用物理刺激调控细菌群落行为的新技术,特别是在工程化活体材料和设备开发中的应用 | NA | 探讨生物物理学和生物工程学在微生物群落研究中的未来发展 | 生物膜和群集中的细菌群落 | 生物工程学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Reverse C-glycosidase reaction provides C-nucleotide building blocks of xenobiotic nucleic acids
2020-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20035-0
PMID:33293530
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研究论文 | 本文通过逆向C-糖苷酶反应,成功合成了C-核苷酸构建模块,这些模块是合成生物学中异种核酸(XNA)的重要组成部分。 | 首次使用伪尿苷单磷酸C-糖苷酶进行选择性的5-β-C-糖基化反应,实现了从五碳糖5-磷酸(如D-核糖、2-脱氧-D-核糖、D-阿拉伯糖、D-木糖)合成C-核苷酸。 | NA | 开发一种生物催化方法,用于合成C-核苷酸,以促进合成生物学中异种核酸(XNA)的工程应用。 | C-核苷酸的合成及其在异种核酸(XNA)中的应用。 | 合成生物学 | NA | C-糖苷酶反应 | NA | 酶催化反应 | 多种五碳糖5-磷酸及其衍生物 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
The biosecurity benefits of genetic engineering attribution
2020-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19149-2
PMID:33293537
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研究论文 | 本文探讨了遗传工程溯源技术在生物安全中的应用 | 提出了通过分析基因序列来推断基因改造生物可能来源实验室的技术 | NA | 研究如何通过遗传工程溯源技术来辅助识别由基因工程病原体引起的疫情的责任方 | 基因改造生物及其可能的来源实验室 | 生物技术 | NA | 遗传工程 | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
FAMSi: A Synthetic Biology Approach to the Fast Assembly of Multiplex siRNAs for Silencing Gene Expression in Mammalian Cells
2020-Dec-04, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.10.007
PMID:33230483
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研究论文 | 本研究利用IIS型限制性内切酶合成生物学方法,开发了一种快速组装多重siRNAs(FAMSi)系统,用于在哺乳动物细胞中沉默基因表达 | 开发了一种新的合成生物学方法FAMSi系统,能够快速有效地组装多重siRNAs,用于基因沉默 | NA | 探索RNA干扰技术在基因功能研究和基于siRNA的新型治疗药物开发中的应用 | Smad4、Smad1、Smad5和Smad8基因在骨髓间充质干细胞(BMSCs)中的表达及其对BMP9信号通路的影响 | 合成生物学 | NA | IIS型限制性内切酶 | NA | siRNA | 涉及三、四或五个siRNA位点的多个片段,用于靶向Smad4和/或BMPR特异性Smad1、Smad5和Smad8 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Physical stimuli-responsive cell-free protein synthesis
2020-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2020.11.001
PMID:33294650
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综述 | 本文综述了利用物理信号控制无细胞系统中基因表达的方法 | 探讨了物理信号在无细胞蛋白合成系统中的应用,提高了系统的灵活性和可控性 | 讨论了信号源和信号传输等现有问题 | 探讨物理信号在无细胞蛋白合成中的应用及其未来在制药和工业生产中的潜力 | 无细胞蛋白合成系统中的基因表达控制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
The Model System Saccharomyces cerevisiae Versus Emerging Non-Model Yeasts for the Production of Biofuels
2020-Nov-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10110299
PMID:33233378
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综述 | 本文综述了利用酵母生产生物燃料的现状,特别是标准模型系统酿酒酵母与新兴的非模型酵母在生物燃料生产中的应用 | 介绍了合成生物学和代谢工程在设计策略和构建最优生物催化剂方面的最新进展,特别是在非传统酵母中的应用 | 合成生物学在非传统酵母中的研究仍处于初级阶段,需要进一步开发和应用先进的合成工程工具 | 探讨如何通过代谢工程和合成生物学开发高效的非传统酵母菌株,以生产多种化学品 | 酵母,特别是酿酒酵母和非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |