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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2024-08-07 |
The interplay of spatial organization and biochemistry in building blocks of cellular signalling pathways
2020-05, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0251
PMID:32453980
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研究论文 | 本文探讨了空间组织与生化途径之间的相互作用,重点关注了共价修饰循环和双组分系统等基本构建模块 | 分析了不同类型的空间组织对修饰动力学的影响,以及空间组织与化学反应之间的相互作用 | NA | 理解空间组织在生化途径中的作用,并为合成生物学中的途径空间组织工程提供见解 | 共价修饰循环和双组分系统等生化途径的基本构建模块 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
102 | 2024-08-07 |
Developing a Multidisciplinary Approach for Engineering Stem Cell Organoids
2020-Jul, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-019-02391-1
PMID:31659603
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研究论文 | 本文探讨了多学科方法在干细胞衍生类器官开发中的应用 | 文章介绍了干细胞生物学、合成生物学、生物工程和生物技术领域的最新进展,特别是干细胞衍生类器官的开发 | 文中指出类器官研究在可重复性和规模化方面仍面临挑战 | 旨在通过多学科方法优化类器官的形成条件,以促进其在疾病模型、药物发现和再生医学中的应用 | 研究对象包括干细胞、细胞外基质以及生物化学和生物物理信号 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
103 | 2024-08-07 |
Functional replacement of isoprenoid pathways in Rhodobacter sphaeroides
2020-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13562
PMID:32207882
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研究论文 | 本研究在工业相关细菌 Rhodobacter sphaeroides 中,通过合成生物学和代谢工程技术,成功替换了内源性的 2-C-甲基-D-赤藓糖醇 4-磷酸(MEP)途径,引入了一种正交代谢途径,即来自相关细菌的异源甲羟戊酸(MVA)途径,以提高倍半萜的生产效率 | 通过替换内源性代谢途径为异源途径,实现了在 Rhodobacter sphaeroides 中倍半萜生产效率的提升 | NA | 探索在细胞工厂中引入代谢旁路以提高生产效率的可能性 | Rhodobacter sphaeroides 细菌中的代谢途径替换 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | 代谢途径分析 | NA |
104 | 2024-08-07 |
Rapid prototyping of microbial production strains for the biomanufacture of potential materials monomers
2020-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2020.04.008
PMID:32335188
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研究论文 | 本文评估了一种生物制造流水线的能力,该流水线能够快速原型化微生物细胞工厂,用于生产化学多样性的工业相关材料构建块 | 通过结合160个遗传部件构建115条独特的生物合成途径,实现了17种潜在材料单体和关键中间体的生产 | NA | 探索通过微生物菌株工程高效生产化学品的方法,并评估其在可持续材料生产中的潜力 | 微生物生产菌株和生物制造流水线的能力 | 合成生物学 | NA | 微生物菌株工程 | NA | 遗传部件 | 160个遗传部件,115条独特的生物合成途径 |
105 | 2024-08-07 |
sgRNA-PSM: Predict sgRNAs On-Target Activity Based on Position-Specific Mismatch
2020-Jun-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.01.029
PMID:32199128
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研究论文 | 本文提出了一种名为sgRNA-PSM的新方法,用于预测sgRNA在CRISPR-Cas9系统中的靶向活性,通过捕捉长程序列信息和进化信息来减少特征向量的维度,避免过拟合风险 | 提出了两种新方法sgRNA-PSM和sgRNA-ExPSM,通过捕捉长程序列信息和进化信息来提高sgRNA靶向活性预测的准确性 | 目前的方法存在一定的局限性,需要新的计算预测方法来改进 | 开发新的计算方法来预测sgRNA的靶向活性,以支持理论研究和实际应用 | sgRNA的靶向活性 | 生物信息学 | NA | CRISPR-Cas9系统 | NA | 序列数据 | 基准数据集包含11个人类基因和6个老鼠基因,以及一个独立数据集 |
106 | 2024-08-07 |
An Endolysin LysSE24 by Bacteriophage LPSE1 Confers Specific Bactericidal Activity against Multidrug-Resistant Salmonella Strains
2020-May-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms8050737
PMID:32429030
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research paper | 本研究鉴定了一种新型内溶素LysSE24,由噬菌体LPSE1编码,对多药耐药的沙门氏菌具有特异性杀菌活性 | LysSE24表现出对多药耐药沙门氏菌的强效杀菌活性,且在不同pH和温度下稳定性良好 | 需要进一步研究通过合成生物学方法提高其杀菌活性,无需预处理外膜破坏剂 | 探索噬菌体内溶素作为特定抗菌剂控制多药耐药沙门氏菌感染的潜力 | 新型内溶素LysSE24的鉴定及其杀菌活性 | NA | NA | Ni-NTA色谱法 | NA | NA | 23种多药耐药沙门氏菌株 |
107 | 2024-08-07 |
A wish list for synthetic biology in photosynthesis research
2020-04-06, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraa075
PMID:32060550
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review | 本文总结了2018年在上海举行的'国际光合作用研究中的合成生物学研讨会'的演讲和讨论内容 | 探讨了利用现有对光合系统的深入理解,重新设计和工程化光合系统以实现转化目标,并评估了可用的合成生物学新技术/工具及其克服技术障碍所需的工具 | NA | 加速光合作用合成生物学研究 | 光合系统的重新设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
108 | 2024-08-07 |
Bacterial biopolymers: from pathogenesis to advanced materials
2020-04, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-019-0313-3
PMID:31992873
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综述 | 本文综述了细菌生物聚合物在发病机制中的作用及其合成和材料特性,以及设计用于生产定制生物基材料的细胞工厂的方法 | 揭示了细菌聚合物合成的分子机制,为抗菌药物的新靶点识别和合成生物学方法提供了见解 | NA | 总结细菌聚合物在发病机制中的作用及其合成和材料特性,并探讨设计生产定制生物基材料的方法 | 细菌生物聚合物及其在医学和工业应用中的潜力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
109 | 2024-08-07 |
High-Efficiency Multi-site Genomic Editing of Pseudomonas putida through Thermoinducible ssDNA Recombineering
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100946
PMID:32179472
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研究论文 | 本研究开发了一种高效的遗传系统,用于在Pseudomonas putida的染色体中进行多站点基因组编辑,通过热诱导的单链DNA重组技术实现。 | 设计了高水平的温度诱导共转录系统,结合rec2重组酶和P. putida的mutL等位基因,提高了基因组编辑的效率。 | NA | 开发一种高效的基因组编辑方法,用于Pseudomonas putida的代谢重编程。 | Pseudomonas putida的染色体 | 合成生物学 | NA | 单链DNA重组技术 | NA | 基因组数据 | 涉及Pseudomonas putida的特定菌株EM42 |
110 | 2024-08-07 |
Enzyme Assembly for Compartmentalized Metabolic Flux Control
2020-Mar-26, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10040125
PMID:32224973
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综述 | 本文综述了酶组装策略在代谢通量控制中的应用及其最新进展 | 介绍了从直接酶融合到无支架组装以及人工支架等多种酶组装策略 | 酶组装,特别是在体内的应用,仍存在许多问题 | 探讨酶组装策略在代谢工程中的应用及其挑战 | 酶组装策略及其在生物基产品合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
111 | 2024-08-07 |
Polychromatic solar energy conversion in pigment-protein chimeras that unite the two kingdoms of (bacterio)chlorophyll-based photosynthesis
2020-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15321-w
PMID:32210238
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研究论文 | 本文展示了通过基因编码的自组装光系统,将重组植物光捕获复合体与紫色光合细菌的反应中心共价结合,形成能够进行多色太阳光能捕获和转换的分子嵌合体 | 利用合成生物学方法,通过可适应的、即插即用的共价接口,实现了使用自然多样但机制互补的组件来构建光系统的自下而上的方法 | 这些设备的能量捕获能力受限于每种蛋白质的个体色素调色板 | 探索将植物和细菌的光合作用蛋白结合,以实现更高效的多色太阳光能转换 | 植物光捕获复合体和紫色光合细菌的反应中心 | NA | NA | 基因编码的自组装技术 | NA | NA | NA |
112 | 2024-08-07 |
Emerging Advanced Technologies to Mitigate the Impact of Climate Change in Africa
2020-Mar-19, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants9030381
PMID:32204576
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review | 本文综述了新兴的高级技术如何帮助非洲减轻气候变化对农业的影响 | 介绍了CRISPR-Cas9、合成生物学和基因组选择等技术在非洲农业中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用新兴技术增强非洲农业对气候变化的适应能力 | 非洲的农业和气候变化问题 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 基因组选择 | NA | NA | NA |
113 | 2024-08-07 |
Engineering of an enhanced synthetic Notch receptor by reducing ligand-independent activation
2020-03-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0848-x
PMID:32170210
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研究论文 | 本文通过添加一个内源性Notch中的亲水序列RAM7,显著降低了合成Notch受体的配体非依赖性激活 | 开发了一种增强型的合成Notch受体(esNotch),其配体非依赖性激活减少了14.6倍,同时不影响抗原诱导的激活效率 | NA | 改进先前报道的跨膜受体,为真核合成生物学中更好的跨膜信号转导模块的开发提供有力工具 | 合成Notch受体的配体非依赖性激活 | 合成生物学 | NA | NA | 合成Notch受体 | NA | NA |
114 | 2024-08-07 |
On-Chip Inverted Emulsion Method for Fast Giant Vesicle Production, Handling, and Analysis
2020-Mar-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi11030285
PMID:32164221
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研究论文 | 本文介绍了一种集成微流控芯片,用于快速生产、捕获和分析巨型囊泡 | 该芯片集成了囊泡形成、捕获和多种独立实验于同一设备中,优化了缓冲条件以最大化囊泡的产量和捕获效率,并引入了双层设计与集成阀门,实现快速溶液交换 | NA | 开发一种多功能的一体化微流控芯片,用于在低样本体积下生产并进行多种实验 | 巨型单层囊泡(GUVs) | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 囊泡 | 单一批次的囊泡,直径为18 ± 4 µm |
115 | 2024-08-07 |
Transforming Ocean Conservation: Applying the Genetic Rescue Toolkit
2020-02-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11020209
PMID:32085502
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研究论文 | 本文通过海洋基因组学地平线扫描调查,评估了将新型遗传救助工具应用于海洋保护的机会,并提出了相关建议。 | 本文提出将生物技术和基因组研究纳入保护框架,以促进海洋生态系统的持久性,并探讨了合成生物学和基因组学的新方法如何缓解海洋主要威胁。 | 本文主要评估了技术和社会因素对生物技术干预技术开发和部署的影响,未深入讨论伦理框架。 | 探讨如何利用遗传救助工具增强海洋保护,并提出实施建议。 | 海洋生态系统和海洋保护策略。 | 生物技术 | NA | 基因组学 | NA | 调查数据 | NA |
116 | 2024-08-07 |
In vitro self-replication and multicistronic expression of large synthetic genomes
2020-02-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14694-2
PMID:32060271
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研究论文 | 本文介绍了一种体外翻译系统,能够在无细胞条件下实现大型合成DNA基因组的自编码复制和表达 | 本文展示了一种能够自我复制的多部分基因组,并能够在复制DNA的同时合成至少30种编码的翻译因子 | NA | 实现合成生物学中化学系统复制和进化的关键目标 | 大型合成DNA基因组的自复制和表达 | 合成生物学 | NA | 体外重建 | NA | DNA | 一个超过116 kb的多部分基因组 |
117 | 2024-08-07 |
On the road to C4 rice: advances and perspectives
2020-02, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.14562
PMID:31596523
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研究论文 | 本文报道了C4水稻项目的最新进展,旨在通过引入C4光合作用途径提高水稻产量 | 利用Golden Gate克隆和合成启动子系统,促进了基因构建块方法的发展,允许多个酶和代谢转运蛋白从单一基因构建中组装和表达 | 目前对能量学的关注较少,C4光合作用需要更多的ATP,这通过增加束鞘细胞中的循环电子传递来满足 | 研究如何通过引入C4光合作用途径提高水稻产量 | 水稻的光合作用机制 | NA | NA | Golden Gate克隆,合成启动子系统 | NA | NA | NA |
118 | 2024-08-07 |
In vitro multi-enzymatic cascades using recombinant lysates of E. coli: an emerging biocatalysis platform
2020-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-020-00618-3
PMID:31960346
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研究论文 | 本文综述了细胞自由提取物作为生物催化平台的关键进展 | 利用分子生物学和遗传工程的进步,简化了重组细胞自由提取物的生产,丰富了内源酶的异源活性 | NA | 探讨细胞自由提取物作为生物催化平台的前景 | 细胞自由提取物及其在多步酶促反应中的应用 | 生物催化 | NA | 分子生物学和遗传工程 | NA | NA | NA |
119 | 2024-08-07 |
Smallpox in the Post-Eradication Era
2020-Jan-24, Viruses
DOI:10.3390/v12020138
PMID:31991671
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review | 本文回顾了在根除天花后的时代中,天花病毒的现状及其潜在风险 | 探讨了合成生物学在重建天花病毒方面的进展 | NA | 旨在开发诊断测试、抗病毒药物和更安全的疫苗 | 天花病毒及其在现代社会中的潜在影响 | NA | 天花 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
120 | 2024-08-07 |
Encapsulation mechanisms and structural studies of GRM2 bacterial microcompartment particles
2020-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14205-y
PMID:31959751
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研究论文 | 本文研究了GRM2细菌微区室的封装机制及其结构 | 首次报道了从肺炎克雷伯菌GRM2位点分离和重组表达BMC结构基因,并探讨了核心酶的封装机制 | NA | 深入理解BMC壳体组装和封装过程,为合成生物学应用提供支持 | 细菌微区室(BMCs)的结构和封装机制 | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |