合成生物学相关文章
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当前共找到 170 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
Controlling the Implementation of Transgenic Microbes: Are We Ready for What Synthetic Biology Has to Offer?
2020-05-21, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2020.03.034
PMID:32442504
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研究论文 | 本文深入总结了迄今为止发表的微生物生物遏制系统，包括通过基因组重编码产生的遗传防火墙和使用营养缺陷型、必需基因调控和毒性基因表达的微生物物理遏制。 | 介绍了通过基因组重编码和物理遏制方法来控制转基因微生物的传播和生存的新技术。 | 文章未明确指出具体的局限性，但可能包括技术实施的复杂性和成本问题。 | 探讨如何安全地实施转基因微生物，并确保其不会对环境造成不良影响。 | 转基因微生物及其生物遏制系统。 | 合成生物学 | NA | 基因组重编码，必需基因调控，毒性基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-07 |
Using heparin molecules to manage COVID-2019
2020-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/rth2.12353
PMID:32542212
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research paper | 本文探讨了使用低分子量肝素分子管理COVID-2019的可能性及其机制 | 提出了一种使用合成生物学方法制造的“设计型”肝素分子来治疗或预防SARS-CoV-2感染的新策略 | NA | 探讨肝素如何减轻SARS-CoV-2感染的过程，并提出新的治疗策略 | COVID-19患者及SARS-CoV-2感染 | NA | COVID-19 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-07 |
A Biosynthetic Platform for Antimalarial Drug Discovery
2020-04-21, Antimicrobial agents and chemotherapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1128/AAC.02129-19
PMID:32152076
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研究论文 | 本文探讨了利用细菌合成生物学平台生产紫色素violacein作为抗疟药物的可能性，并研究了其对疟原虫的作用机制 | 首次展示了细菌合成生物学平台在抗疟药物发现中的应用潜力，并揭示了violacein影响疟原虫肌动蛋白细胞骨架的新机制 | 需要进一步开发violacein及其衍生物作为有效的抗疟药物 | 探索细菌合成生物学平台在抗疟药物发现中的应用 | 紫色素violacein及其衍生物对疟原虫的抗寄生虫活性 | 合成生物学 | 疟疾 | NA | NA | NA | 包括3D7实验室参考株及药物敏感和耐药的患者分离株 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-07 |
Discovery and identification of medium-chain fatty acid responsive promoters in Saccharomyces cerevisiae
2020-Apr, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201900093
PMID:32874182
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和荧光筛选方法，在酵母中发现了对中链脂肪酸响应的启动子 | 本研究首次在酵母中鉴定出对中链脂肪酸响应的启动子，这些启动子能够根据脂肪酸浓度动态调节基因表达 | NA | 提高中链脂肪酸及其衍生物的生产效率 | 中链脂肪酸响应的启动子 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 58个候选基因 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-07 |
Design of Protein Logic Gate System Operating on Lipid Membranes
2020-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00340
PMID:31995709
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研究论文 | 本文展示了在脂质膜上构建的双层蛋白质-膜逻辑门系统，具有OR-AND逻辑功能 | 开发了一种新颖的蛋白质逻辑门系统，该系统基于脂质膜上的工程化pH依赖性孔形成蛋白和DARPin基抑制剂 | NA | 探索脂质膜在合成生物学中的应用，特别是在传感器和执行器平台上的应用 | 脂质膜上的蛋白质逻辑门系统 | 合成生物学 | NA | 工程化蛋白质设计 | 蛋白质逻辑门 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-07 |
Design of a Transcriptional Biosensor for the Portable, On-Demand Detection of Cyanuric Acid
2020-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00348
PMID:31825601
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研究论文 | 本文设计了一种用于快速检测氰尿酸（CYA）的便携式转录生物传感器 | 通过合理设计混合启动子，克服了LTTR在不同宿主间的移植挑战，并将其应用于全细胞生物传感器和冻干的无细胞系统中 | NA | 开发一种便携式、按需检测氰尿酸的转录生物传感器 | 氰尿酸（CYA） | 合成生物学 | NA | 转录调控 | LTTR | NA | 实验室和真实世界样本 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
Resources to Discover and Use Short Linear Motifs in Viral Proteins
2020-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2019.07.004
PMID:31427097
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研究论文 | 本文探讨了病毒蛋白中短线性基序（SLiMs）的发现和应用，这些基序通过分子模拟逃避宿主免疫功能 | 本文介绍了SLiMs在合成生物学中的潜在应用，如更好的免疫原和疗法，并指出了其可能带来的生物安全挑战 | NA | 研究病毒蛋白中短线性基序的发现和应用 | 病毒蛋白中的短线性基序（SLiMs） | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-07 |
Establishing a Eukaryotic Pichia pastoris Cell-Free Protein Synthesis System
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00536
PMID:32626695
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研究论文 | 本文开发并优化了一种源自蛋白酶缺陷型SMD1163株的酵母无细胞蛋白合成系统 | 开发了一种新的酵母无细胞蛋白合成系统，适用于合成生物学应用和高产量的复杂蛋白生产 | NA | 扩展当前的无细胞蛋白合成系统，开发新的源自真核生物的无细胞蛋白合成系统 | 酵母无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学和高产量复杂蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 蛋白质 | 50.16 ± 7.49 μg/ml的sfGFP在5小时批次反应中 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-07 |
Toward Engineering Biosystems With Emergent Collective Functions
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00705
PMID:32671054
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研究论文 | 本文探讨了如何利用多智能体建模作为合成生物学中的设计框架，以克服工程涌现集体功能面临的挑战 | 提出使用多智能体建模来捕捉复杂多尺度系统的核心特征，并提供对指导跨尺度涌现功能的基础机制的新见解 | NA | 探索如何通过多智能体建模在合成生物学中实现具有涌现集体功能的生物系统 | 复杂生物系统中的涌现集体功能 | 合成生物学 | NA | 多智能体建模 | 多智能体模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering Employing Escherichia coli for C2-C6 Bioalcohol Production
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00710
PMID:32719784
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综述 | 本文综述了利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精生产的合成生物学和代谢工程研究进展 | 探讨了生物酒精作为替代化石燃料的潜力，特别是在减少温室气体排放方面的优势 | 分析了当前提高工业应用生产率的挑战 | 旨在增强生物酒精的生产，支持更环保的能源过程 | 利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精的生产 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-07 |
Riboflow: Using Deep Learning to Classify Riboswitches With ∼99% Accuracy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00808
PMID:32760712
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研究论文 | 本文使用深度学习框架，特别是卷积神经网络（CNN）和双向循环神经网络（RNN）与长短期记忆（LSTM），对32种配体类别的综合数据集进行分类，以高精度识别核糖开关的配体特异性 | 本文提出的双向LSTM RNN模型在识别核糖开关配体特异性方面表现出>0.99的准确率和0.96的宏平均F分数，且不需要预先的特征工程，模型具有动态更新功能以适应新发现的核糖开关 | NA | 解决核糖开关特性识别的计算难题，并推动合成生物学中遗传回路设计的精确翻译控制 | 核糖开关及其配体特异性 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM | 数据集 | 32种配体类别 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-07 |
Cell-Free Systems: A Proving Ground for Rational Biodesign
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00788
PMID:32793570
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观点 | 本文探讨了无细胞基因表达系统在合成生物学中的应用，并提出这些系统是测试理性生物设计策略的理想平台 | 无细胞基因表达系统利用非活体生物化学反应来控制生物基因表达，其开放性质使得所有组件可直接访问，便于模型构建和验证 | 这些系统存在反应寿命有限和缺乏稳态等独特困难 | 提出无细胞系统是测试理性生物设计策略的理想平台，并期望从这一方法中获得的进展有助于更可靠和系统地工程化无细胞及活细胞系统 | 无细胞基因表达系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-07 |
Are Antisense Proteins in Prokaryotes Functional?
2020, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2020.00187
PMID:32923454
|
研究论文 | 本文探讨了原核生物中反义蛋白的功能性问题 | 研究揭示了大量新发现的蛋白质对生物体有用，并提出了这些蛋白质应被添加到基因组注释中，以及预测它们的方法应标准化 | 确定这些蛋白质产品的功能部分仍需进一步研究，包括分子相互作用的研究和详细的进化分析 | 旨在揭示大量新型蛋白质，这些蛋白质具有极其多样化的潜在实际应用 | 原核生物中的反义蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
The interplay of spatial organization and biochemistry in building blocks of cellular signalling pathways
2020-05, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0251
PMID:32453980
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研究论文 | 本文探讨了空间组织与生化途径之间的相互作用，重点关注了共价修饰循环和双组分系统等基本构建模块 | 分析了不同类型的空间组织对修饰动力学的影响，以及空间组织与化学反应之间的相互作用 | NA | 理解空间组织在生化途径中的作用，并为合成生物学中的途径空间组织工程提供见解 | 共价修饰循环和双组分系统等生化途径的基本构建模块 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-07 |
Developing a Multidisciplinary Approach for Engineering Stem Cell Organoids
2020-Jul, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-019-02391-1
PMID:31659603
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研究论文 | 本文探讨了多学科方法在干细胞衍生类器官开发中的应用 | 文章介绍了干细胞生物学、合成生物学、生物工程和生物技术领域的最新进展，特别是干细胞衍生类器官的开发 | 文中指出类器官研究在可重复性和规模化方面仍面临挑战 | 旨在通过多学科方法优化类器官的形成条件，以促进其在疾病模型、药物发现和再生医学中的应用 | 研究对象包括干细胞、细胞外基质以及生物化学和生物物理信号 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
Functional replacement of isoprenoid pathways in Rhodobacter sphaeroides
2020-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13562
PMID:32207882
|
研究论文 | 本研究在工业相关细菌 Rhodobacter sphaeroides 中，通过合成生物学和代谢工程技术，成功替换了内源性的 2-C-甲基-D-赤藓糖醇 4-磷酸（MEP）途径，引入了一种正交代谢途径，即来自相关细菌的异源甲羟戊酸（MVA）途径，以提高倍半萜的生产效率 | 通过替换内源性代谢途径为异源途径，实现了在 Rhodobacter sphaeroides 中倍半萜生产效率的提升 | NA | 探索在细胞工厂中引入代谢旁路以提高生产效率的可能性 | Rhodobacter sphaeroides 细菌中的代谢途径替换 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | 代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-07 |
Rapid prototyping of microbial production strains for the biomanufacture of potential materials monomers
2020-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2020.04.008
PMID:32335188
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研究论文 | 本文评估了一种生物制造流水线的能力，该流水线能够快速原型化微生物细胞工厂，用于生产化学多样性的工业相关材料构建块 | 通过结合160个遗传部件构建115条独特的生物合成途径，实现了17种潜在材料单体和关键中间体的生产 | NA | 探索通过微生物菌株工程高效生产化学品的方法，并评估其在可持续材料生产中的潜力 | 微生物生产菌株和生物制造流水线的能力 | 合成生物学 | NA | 微生物菌株工程 | NA | 遗传部件 | 160个遗传部件，115条独特的生物合成途径 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-07 |
sgRNA-PSM: Predict sgRNAs On-Target Activity Based on Position-Specific Mismatch
2020-Jun-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.01.029
PMID:32199128
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研究论文 | 本文提出了一种名为sgRNA-PSM的新方法，用于预测sgRNA在CRISPR-Cas9系统中的靶向活性，通过捕捉长程序列信息和进化信息来减少特征向量的维度，避免过拟合风险 | 提出了两种新方法sgRNA-PSM和sgRNA-ExPSM，通过捕捉长程序列信息和进化信息来提高sgRNA靶向活性预测的准确性 | 目前的方法存在一定的局限性，需要新的计算预测方法来改进 | 开发新的计算方法来预测sgRNA的靶向活性，以支持理论研究和实际应用 | sgRNA的靶向活性 | 生物信息学 | NA | CRISPR-Cas9系统 | NA | 序列数据 | 基准数据集包含11个人类基因和6个老鼠基因，以及一个独立数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-07 |
An Endolysin LysSE24 by Bacteriophage LPSE1 Confers Specific Bactericidal Activity against Multidrug-Resistant Salmonella Strains
2020-May-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms8050737
PMID:32429030
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research paper | 本研究鉴定了一种新型内溶素LysSE24，由噬菌体LPSE1编码，对多药耐药的沙门氏菌具有特异性杀菌活性 | LysSE24表现出对多药耐药沙门氏菌的强效杀菌活性，且在不同pH和温度下稳定性良好 | 需要进一步研究通过合成生物学方法提高其杀菌活性，无需预处理外膜破坏剂 | 探索噬菌体内溶素作为特定抗菌剂控制多药耐药沙门氏菌感染的潜力 | 新型内溶素LysSE24的鉴定及其杀菌活性 | NA | NA | Ni-NTA色谱法 | NA | NA | 23种多药耐药沙门氏菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-07 |
A wish list for synthetic biology in photosynthesis research
2020-04-06, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraa075
PMID:32060550
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review | 本文总结了2018年在上海举行的'国际光合作用研究中的合成生物学研讨会'的演讲和讨论内容 | 探讨了利用现有对光合系统的深入理解，重新设计和工程化光合系统以实现转化目标，并评估了可用的合成生物学新技术/工具及其克服技术障碍所需的工具 | NA | 加速光合作用合成生物学研究 | 光合系统的重新设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |