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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-07 |
Guide RNA Engineering Enables Dual Purpose CRISPR-Cpf1 for Simultaneous Gene Editing and Gene Regulation in Yarrowia lipolytica
2020-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00498
PMID:32208677
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研究论文 | 本文介绍了一种双功能CRISPR-Cpf1系统,能够在Yarrowia lipolytica中同时进行基因编辑和基因调控 | 通过将guide RNA的间隔区长度截短至16 nt,抑制了核酸酶活性但保留了与目标位点的结合能力,从而实现了基因激活和抑制 | NA | 开发一种多功能的基因编辑工具,用于快速菌株生成 | Yarrowia lipolytica酵母 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cpf1 | NA | 基因表达数据 | NA |
142 | 2024-08-07 |
An expanded CRISPRi toolbox for tunable control of gene expression in Pseudomonas putida
2020-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13533
PMID:32045111
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research paper | 本文介绍了一种单质粒CRISPR干扰(CRISPRi)系统,该系统在诱导性XylS/P表达系统控制下表达无核酸酶活性的cas9基因,并可选择性地表达组成型引导RNA(sgRNA或crRNA和tracrRNA),用于在Pseudomonas putida中可调节地控制基因表达。 | 该系统能够实现对染色体表达基因的荧光蛋白编码基因的调节性、紧密控制抑制(高达90%),并能抑制必需基因pyrF和ftsZ的表达,从而显著降低生长速率或引起形态变化。 | NA | 开发一种高效的、目标性的和可控的基因表达调控工具,以扩展Pseudomonas putida在工业和环境应用中的合成生物学和代谢工程方法。 | Pseudomonas putida中的基因表达调控。 | synthetic biology | NA | CRISPRi | NA | 基因表达 | NA |
143 | 2024-08-07 |
Tunable Repression of Key Photosynthetic Processes Using Cas12a CRISPR Interference in the Fast-Growing Cyanobacterium Synechococcus sp. UTEX 2973
2020-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00417
PMID:31829621
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研究论文 | 本文描述了一种可调节的dCas12a(dCpf1)CRISPRi系统,并将其应用于快速生长的蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973中抑制关键光合作用过程 | 开发了一种新的合成生物学工具,即可调节的dCas12a CRISPRi系统,用于精确调控蓝细菌中的基因表达 | NA | 研究蓝细菌作为模型生物和生产平台的关键光合作用过程 | 蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973中的光合作用过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | dCas12a(dCpf1) | 基因表达数据 | 蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973 |
144 | 2024-08-07 |
Engineering Cellular Signal Sensors based on CRISPR-sgRNA Reconstruction Approaches
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.42299
PMID:32210731
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review | 本文总结了基于CRISPR-sgRNA重构方法构建细胞信号传感器的优缺点及重新编程细胞信号网络的可能途径 | 提出了如何进一步改进基于sgRNA-riboswitch的信号传感器设计 | 控制CRISPR系统的基因编辑活性仍是一个挑战 | 促进环境检测、疾病诊断和基因治疗等领域的发展 | CRISPR系统在细胞信号传感器中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR-sgRNA | NA | NA | NA |
145 | 2024-08-07 |
Rebooting Synthetic Phage-Inducible Chromosomal Islands: One Method to Forge Them All
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/5783064
PMID:37849900
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研究论文 | 本文采用合成生物学方法快速编辑噬菌体诱导的染色体岛(PICIs),并验证了其在细菌疾病诊断和治疗中的应用。 | 开发了一种新的合成生物学方法,用于快速编辑PICIs,并展示了其在生物技术和医学领域的应用潜力。 | NA | 研究PICIs的生物学特性,并探索其在细菌疾病诊断和治疗中的应用。 | 噬菌体诱导的染色体岛(PICIs)及其在细菌中的应用。 | 合成生物学 | 细菌疾病 | CRISPR-Cas9系统 | NA | 基因 | 多个PICIs |
146 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology of Cannabinoids and Cannabinoid Glucosides in Nicotiana benthamiana and Saccharomyces cerevisiae
2020-10-23, Journal of natural products
IF:3.3Q1
DOI:10.1021/acs.jnatprod.0c00241
PMID:33000946
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研究论文 | 本文通过元转录组分析大麻,识别了UbiA超家族的芳香性预转移酶和查尔酮异构酶样(CHIL)蛋白基因,并在烟草和酵母中进行了异源生物合成大麻素的研究。 | 首次在烟草和酵母中实现了大麻素的异源生物合成,并发现了新的糖基化大麻素。 | NA | 探索大麻素的异源生物合成及其糖基化衍生物的生产。 | 大麻素及其糖基化衍生物。 | 合成生物学 | NA | 元转录组分析 | NA | 基因数据 | NA |
147 | 2024-08-07 |
Use of synthetic biology tools to optimize the production of active nitrogenase Fe protein in chloroplasts of tobacco leaf cells
2020-09, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13347
PMID:31985876
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研究论文 | 本文利用合成生物学工具优化烟草叶绿体中活性固氮酶铁蛋白(NifH)的生产 | 首次在烟草叶绿体中成功优化活性固氮酶铁蛋白的生产,并证明了叶绿体作为功能性固氮酶蛋白宿主的适宜性 | NA | 旨在通过合成生物学工具优化固氮酶铁蛋白在烟草叶绿体中的生产,以推动农业绿色革命 | 烟草叶绿体中的固氮酶铁蛋白(NifH)及其相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 蛋白质 | NA |
148 | 2024-08-07 |
Activity evaluation of glycolytic promoters from Escherichia coli and application for mevalonate biosynthesis
2020-07, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2020.105946
PMID:32413369
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研究论文 | 本研究通过使用单体红色荧光蛋白(mRFP)作为报告基因,克隆并表征了来自大肠杆菌糖酵解途径的十个启动子,并将其应用于甲羟戊酸生物合成系统,以评估其活性并探索其在代谢工程中的应用。 | 本研究发现糖酵解启动子具有组成型启动子的优势,并且在强度上高于常用的诱导型启动子Plac,为大肠杆菌的代谢工程提供了新的工具。 | NA | 识别更多组成型启动子以避免诱导型启动子带来的代谢负荷和成本问题。 | 大肠杆菌糖酵解途径的启动子及其在甲羟戊酸生物合成中的应用。 | 代谢工程 | NA | 基因克隆 | NA | 基因表达 | 十个来自大肠杆菌糖酵解途径的启动子 |
149 | 2024-08-07 |
Construction of a novel dual-inducible duet-expression system for gene (over)expression in Pseudomonas putida
2020-07, Plasmid
IF:1.8Q4
DOI:10.1016/j.plasmid.2020.102514
PMID:32504628
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研究论文 | 本文构建了一种新型双诱导二重表达系统,用于在假单胞菌中进行基因(过度)表达 | 开发了一种名为pRGPDuo2的新型表达载体,适用于假单胞菌中的基因共表达研究 | NA | 扩大假单胞菌中用于异源蛋白生产的表达载体范围 | 假单胞菌中的基因共表达 | 合成生物学 | NA | 基因表达载体构建 | NA | 基因序列 | NA |
150 | 2024-08-07 |
Transfer of Nitrogen Fixation (nif) Genes to Non-diazotrophic Hosts
2020-06-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201900784
PMID:32009294
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研究论文 | 本文探讨了将固氮(nif)基因转移到非固氮宿主中的可能性 | 成功将来自不同细菌的nif基因转移到模型细菌、酵母和烟草植物中,为实现谷物作物自身固氮奠定了基础 | NA | 旨在开发能够固氮的谷物作物,以替代化学氮肥 | 固氮基因在非固氮宿主中的转移和表达 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 基因 | 涉及多种细菌、酵母和烟草植物 |
151 | 2024-08-07 |
A memory switch for plant synthetic biology based on the phage ϕC31 integration system
2020-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa104
PMID:32083668
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研究论文 | 本文报道了一种基于噬菌体ϕC31位点特异性整合酶的植物记忆开关,用于控制植物中两个目标基因的转录状态(开或关) | 该记忆开关是基于DNA位点特异性重组构建的,能够在植物中实现长期和稳定的合成记忆 | NA | 开发一种新的植物合成生物学工具,以实现对植物基因表达的精确控制 | 基于噬菌体ϕC31整合系统的植物记忆开关 | 合成生物学 | NA | DNA位点特异性重组 | NA | DNA | 在Nicotiana benthamiana植物中进行了广泛表征 |
152 | 2024-08-07 |
An expanded library of orthogonal split inteins enables modular multi-peptide assemblies
2020-03-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15272-2
PMID:32251274
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研究论文 | 本文评估了34种内含子的剪接活性,并建立了一个包含15种相互正交的分裂内含子库,用于体内应用,其中10种可在体外同时使用。 | 展示了正交分裂内含子在合成生物学和蛋白质工程领域的广泛应用潜力。 | NA | 建立一个扩大的正交分裂内含子库,并评估其在复杂逻辑电路和大型重复蛋白质体外无缝组装中的应用。 | 内含子的剪接活性和正交分裂内含子的应用。 | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质剪接 | NA | 蛋白质序列 | 34种内含子 |
153 | 2024-08-07 |
Development of a Quorum-Sensing Based Circuit for Control of Coculture Population Composition in a Naringenin Production System
2020-03-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00451
PMID:32040906
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研究论文 | 本文开发了一种基于群体感应的电路,用于控制共培养系统中柚皮素生产过程中的种群组成 | 引入了一种基于群体感应的生长调节电路,作为控制共培养组成的新参数,并展示了其与通信模块结合使用的可能性 | NA | 克服单细胞内机械和资源的限制,提高共培养发酵系统中柚皮素的产量 | 共培养发酵系统中的微生物种群组成 | 代谢工程 | NA | 群体感应 | NA | NA | NA |
154 | 2024-08-07 |
Constructing a yeast to express the largest cellulosome complex on the cell surface
2020-02-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916529117
PMID:31953261
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研究论文 | 本文通过合成支架蛋白基因和锚定蛋白基因,成功在工业酵母细胞表面表达了最大的纤维小体复合物 | 本文合成的纤维小体复合物能够容纳多达63种酶,远超先前报道的最大12种酶的纤维小体,并且通过染色体整合而非质粒表达 | NA | 在工业酵母中构建纤维小体复合物 | 纤维小体复合物的合成与表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 蛋白质 | 81%的酵母细胞显示OlpB-GPI |
155 | 2024-08-07 |
Co-administration of tecovirimat and ACAM2000™ in non-human primates: Effect of tecovirimat treatment on ACAM2000 immunogenicity and efficacy versus lethal monkeypox virus challenge
2020-01-16, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2019.10.049
PMID:31677948
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研究论文 | 研究在非人灵长类动物中同时使用tecovirimat和ACAM2000™疫苗的效果,评估tecovirimat对ACAM2000免疫原性和对抗致命猴痘病毒挑战效力的影响 | 首次探讨了tecovirimat与ACAM2000疫苗同时使用时对疫苗免疫原性和保护效力的影响 | 研究仅在非人灵长类动物模型中进行,结果可能不完全适用于人类 | 探讨在小型爆发情况下,疫苗和TPOXX的联合使用效果 | 非人灵长类动物 | NA | 猴痘 | NA | NA | 免疫响应数据 | 37只非人灵长类动物 |
156 | 2024-08-07 |
Agrobacterium tumefaciens: A Bacterium Primed for Synthetic Biology
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/8189219
PMID:37849895
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法对Agrobacterium tumefaciens及其植物宿主进行精确遗传控制,以提高植物转化效率的研究进展。 | 文章探讨了通过调节Agrobacterium tumefaciens毒力相关因子的表达,利用合成生物学方法进行精确工程化,以开拓植物生物技术的新机遇。 | NA | 旨在通过合成生物学方法,提高Agrobacterium tumefaciens在植物转化中的效率和适用范围。 | 研究对象包括Agrobacterium tumefaciens细菌及其植物宿主。 | 植物生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
157 | 2024-08-07 |
Engineering a Circular Riboregulator in Escherichia coli
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1916789
PMID:37849901
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research paper | 本文通过在I组置换内含子-外显子核酶中插入一个核糖调控序列,创造了一种自我剪接产生环状核糖调控因子的小非编码RNA,并在中展示了其激活基因表达的能力。 | 首次报道了环状RNA在中的基因表达调控作用,增加了RNA合成生物学部件的多样性。 | NA | 研究环状RNA在原核生物中的调控作用。 | 环状RNA及其在基因表达调控中的作用。 | NA | NA | RNA合成生物学 | NA | RNA | NA |
158 | 2024-08-08 |
The Role of Synthetic Biology in Atmospheric Greenhouse Gas Reduction: Prospects and Challenges
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1016207
PMID:37849905
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在减少大气中温室气体方面的应用前景和挑战 | 提出通过合成生物学技术,如改造植物将呼吸产生的CO2转化为稳定碳酸盐,设计根茎比更高的植物,以及创造自施肥植物,来减少大气中的碳含量 | 在实际应用前,需要解决一系列生态和社会挑战 | 研究合成生物学在减少大气碳排放中的作用 | 大气中的温室气体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |