合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-05	Optimization of Yarrowia lipolytica-based consolidated biocatalyst through synthetic biology approach: transcription units and signal peptides shuffling 2020-Jul, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-020-10644-6 PMID:32358762	研究论文	本文探讨了多元素表达盒的组织如何影响Yarrowia lipolytica转化体的表型	研究表明转录单位的顺序和信号肽的类型可以影响最终的生物催化剂特性	没有提及样本的多样性和实际应用中的可行性	研究Yarrowia lipolytica作为综合生物催化剂的优化途径	研究对象为不同信号肽和表达盒结构的Yarrowia lipolytica转化体	合成生物学	NA	基因转化	NA	细胞生长数据	多个改造的Yarrowia lipolytica菌株
2	2024-08-07	A Generative Neural Network for Maximizing Fitness and Diversity of Synthetic DNA and Protein Sequences 2020-07-22, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2020.05.007 PMID:32711843	研究论文	本文开发了一种名为深度探索网络（DENs）的生成模型，用于最大化合成DNA和蛋白质序列的适应性和多样性	DENs通过梯度下降最小化神经网络适应度预测器的成本，并基于相似性度量惩罚任何两个生成的模式，从而显式地最大化序列多样性	NA	工程化具有定义功能属性的基因和蛋白质序列	合成DNA和蛋白质序列的适应性和多样性	机器学习	NA	梯度上升优化	生成神经网络	序列数据	NA
3	2024-08-07	Synthetic Glycobiology: Parts, Systems, and Applications 2020-07-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.0c00210 PMID:32526139	review	本文概述了合成糖生物学这一新兴领域，探讨了如何利用合成生物学工具和设计原则来更好地理解和工程化糖基化过程。	文章介绍了如何利用合成生物学的生物合成和分析工具重新设计糖基化系统，以获得在蛋白质上定义的糖基化结构，应用于医学、材料和诊断等多个领域。	NA	旨在更好地理解和工程化糖基化过程，以解决糖科学中的重要问题。	糖基化系统及其在蛋白质上的应用。	合成生物学	NA	合成生物学工具	NA	NA	NA
4	2024-08-07	Building biosecurity for synthetic biology 2020-07, Molecular systems biology IF:8.5Q1 DOI:10.15252/msb.20209723 PMID:32692486	评论	本文讨论了合成生物学领域快速发展对全球生物安全框架的影响，并提出了加强生物安全的三种策略	提出了将安全视为技术未来应用的投资、早期引入社会科学家和政策制定者参与技术开发和预测、以及全球利益相关者之间的协调等创新策略	NA	探讨合成生物学对现有生物安全措施的挑战，并提出改进策略	合成生物学领域的生物安全问题	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5	2024-08-07	Developing a Multidisciplinary Approach for Engineering Stem Cell Organoids 2020-Jul, Annals of biomedical engineering IF:3.0Q3 DOI:10.1007/s10439-019-02391-1 PMID:31659603	研究论文	本文探讨了多学科方法在干细胞衍生类器官开发中的应用	文章介绍了干细胞生物学、合成生物学、生物工程和生物技术领域的最新进展，特别是干细胞衍生类器官的开发	文中指出类器官研究在可重复性和规模化方面仍面临挑战	旨在通过多学科方法优化类器官的形成条件，以促进其在疾病模型、药物发现和再生医学中的应用	研究对象包括干细胞、细胞外基质以及生物化学和生物物理信号	生物工程	NA	NA	NA	NA	NA
6	2024-08-07	Functional replacement of isoprenoid pathways in Rhodobacter sphaeroides 2020-07, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13562 PMID:32207882	研究论文	本研究在工业相关细菌 Rhodobacter sphaeroides 中，通过合成生物学和代谢工程技术，成功替换了内源性的 2-C-甲基-D-赤藓糖醇 4-磷酸（MEP）途径，引入了一种正交代谢途径，即来自相关细菌的异源甲羟戊酸（MVA）途径，以提高倍半萜的生产效率	通过替换内源性代谢途径为异源途径，实现了在 Rhodobacter sphaeroides 中倍半萜生产效率的提升	NA	探索在细胞工厂中引入代谢旁路以提高生产效率的可能性	Rhodobacter sphaeroides 细菌中的代谢途径替换	代谢工程	NA	代谢工程	NA	代谢途径分析	NA
7	2024-08-07	Rapid prototyping of microbial production strains for the biomanufacture of potential materials monomers 2020-07, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2020.04.008 PMID:32335188	研究论文	本文评估了一种生物制造流水线的能力，该流水线能够快速原型化微生物细胞工厂，用于生产化学多样性的工业相关材料构建块	通过结合160个遗传部件构建115条独特的生物合成途径，实现了17种潜在材料单体和关键中间体的生产	NA	探索通过微生物菌株工程高效生产化学品的方法，并评估其在可持续材料生产中的潜力	微生物生产菌株和生物制造流水线的能力	合成生物学	NA	微生物菌株工程	NA	遗传部件	160个遗传部件，115条独特的生物合成途径
8	2024-08-07	Multiplexing cell-cell communication 2020-07, Molecular systems biology IF:8.5Q1 DOI:10.15252/msb.20209618 PMID:32672881	研究论文	本文开发了一种基于CRISPRi的遗传编码通道选择器设备，使单个通信系统能够传输两个独立的细胞间对话	设计了多路复用器和解多路复用器子电路，由12个基于CRISPRi的转录逻辑门、一个酰基高丝氨酸内酯基通信模块和三个可诱导启动子组成，实现了对细胞间通信的精细控制	NA	开发用于合成生物学的高级多细胞行为的细胞间通信系统	细胞间通信系统的遗传工程	合成生物学	NA	CRISPRi	转录逻辑门	NA	NA
9	2024-08-07	Activity evaluation of glycolytic promoters from Escherichia coli and application for mevalonate biosynthesis 2020-07, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4 DOI:10.1016/j.mimet.2020.105946 PMID:32413369	研究论文	本研究通过使用单体红色荧光蛋白（mRFP）作为报告基因，克隆并表征了来自大肠杆菌糖酵解途径的十个启动子，并将其应用于甲羟戊酸生物合成系统，以评估其活性并探索其在代谢工程中的应用。	本研究发现糖酵解启动子具有组成型启动子的优势，并且在强度上高于常用的诱导型启动子Plac，为大肠杆菌的代谢工程提供了新的工具。	NA	识别更多组成型启动子以避免诱导型启动子带来的代谢负荷和成本问题。	大肠杆菌糖酵解途径的启动子及其在甲羟戊酸生物合成中的应用。	代谢工程	NA	基因克隆	NA	基因表达	十个来自大肠杆菌糖酵解途径的启动子
10	2024-08-07	Construction of a novel dual-inducible duet-expression system for gene (over)expression in Pseudomonas putida 2020-07, Plasmid IF:1.8Q4 DOI:10.1016/j.plasmid.2020.102514 PMID:32504628	研究论文	本文构建了一种新型双诱导二重表达系统，用于在假单胞菌中进行基因（过度）表达	开发了一种名为pRGPDuo2的新型表达载体，适用于假单胞菌中的基因共表达研究	NA	扩大假单胞菌中用于异源蛋白生产的表达载体范围	假单胞菌中的基因共表达	合成生物学	NA	基因表达载体构建	NA	基因序列	NA