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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-05 |
Expanding the Scope of Orthogonal Translation with Pyrrolysyl-tRNA Synthetases Dedicated to Aromatic Amino Acids
2020-Sep-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules25194418
PMID:32992991
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研究论文 | 该论文探讨了通过改造PylRS以扩展正交翻译中香味氨基酸的底物范围 | 研究展示了通过系统性突变和重新设计PylRS来提高对香味氨基酸的特异性和酶活性的创新策略 | 研究主要集中在特定的氨基酸和突变位点上,可能限制了其广泛的应用性 | 扩展正交翻译的底物范围,以便引入更多非标准氨基酸 | 研究对象为改造的PylRS变体,特别关注于色氨酸和酪氨酸类似物 | 合成生物学 | NA | 半理性设计 | NA | NA | 通过系统突变生成多个PylRS变体 |
2 | 2024-08-07 |
Building sophisticated sensors of extracellular cues that enable mammalian cells to work as "doctors" in the body
2020-Sep, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03486-y
PMID:32185403
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术开发用于检测细胞外环境信号的传感器系统,并探讨了其在治疗难治性疾病中的应用潜力 | 介绍了先进的工程原理,用于设计检测可溶性因子和特定细胞接触的传感器系统 | 讨论了这些新兴技术面临的挑战 | 探讨工程化细胞作为体内“医生”,诊断疾病状态并按需产生和递送治疗分子的潜力 | 工程化细胞和传感器系统 | 合成生物学 | 难治性疾病 | NA | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
A machine learning Automated Recommendation Tool for synthetic biology
2020-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18008-4
PMID:32978379
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研究论文 | 本文介绍了一种利用机器学习和概率建模技术指导合成生物学系统化发展的自动化推荐工具(ART) | ART工具无需对生物系统进行完全的机制理解,通过基于采样的优化方法提供推荐菌株及其生产水平的概率预测 | 讨论了该方法的局限性及底层假设失败时的实际后果 | 开发一种新的工具以加速合成生物学中的工程开发过程 | 合成生物学中的菌株推荐和生产水平预测 | 机器学习 | NA | 机器学习,概率建模 | NA | 模拟数据,实验数据 | 涉及多个代谢工程项目,包括生产可再生生物燃料、无啤酒花的啤酒、脂肪酸和色氨酸的项目 |
4 | 2024-08-07 |
Immune Literacy: Reading, Writing, and Editing Adaptive Immunity
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101519
PMID:32905040
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学方法,通过免疫组库测序、免疫信息学和免疫基因组工程等先进技术,对适应性免疫中分子识别的定量和精确理解,以及这些技术在转化医学中重新编程免疫反应的应用。 | 本文展示了新颖且跨学科的方法,有望改变分子和细胞免疫疗法的设计和广度。 | NA | 探讨如何通过先进的生物技术方法重新编程免疫反应,以应用于转化医学。 | 适应性免疫系统中的分子识别和免疫反应。 | NA | NA | 免疫组库测序、免疫信息学、免疫基因组工程 | NA | DNA序列 | NA |
5 | 2024-08-07 |
Engineered Niches to Analyze Mechanisms of Metastasis and Guide Precision Medicine
2020-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0079
PMID:32409307
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研究论文 | 本文探讨了通过工程化微环境来分析癌症转移机制并指导精准医疗的方法 | 提出了一种新兴的方法——工程化转移微环境,以解决转移性病变形成的随机性问题,并提供了一个可调节的平台技术来分子水平上解析转移性疾病机制 | NA | 旨在通过工程化微环境来分析癌症转移的机制,并推动精准医疗的发展 | 癌症转移的机制及如何通过工程化微环境指导精准医疗 | 生物工程 | 癌症 | 生物工程技术 | 工程化微环境 | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Are synthetic biology standards applicable in everyday research practice?
2020-09, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13612
PMID:32567248
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评论 | 本文探讨了合成生物学中的标准化问题,特别是标准在日常研究实践中的适用性和实用性 | NA | NA | 旨在将标准适用性问题纳入标准化讨论议程,并为合成生物学研究人员提供日常实践中的见解 | 合成生物学中的标准化问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Challenges and advances in genome mining of ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs)
2020-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2020.06.002
PMID:32637669
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综述 | 本文综述了利用生物信息学策略识别和优先处理编码RiPPs的生物合成基因簇(BGCs)的方法,以及基于基因组挖掘的新型RiPPs发现 | 文章展望了未来基于基因组指导的RiPPs发现,特别是从占主导地位但未培养的微生物中发现RiPPs,这将通过合成生物学和宏基因组挖掘策略的结合得到促进 | NA | 总结生物信息学策略以发现新的RiPPs,并展望未来基于基因组的RiPPs发现 | RiPPs及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |
8 | 2024-08-07 |
FlopR: An Open Source Software Package for Calibration and Normalization of Plate Reader and Flow Cytometry Data
2020-09-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00296
PMID:32854500
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研究论文 | 本文介绍了一个名为FlopR的开源软件包,用于校准和标准化酶标仪和流式细胞仪数据的荧光测量 | 将现有方法整合并改进为单一软件工具,提高了数据的可互操作性 | NA | 开发和传播用于定量测量和数据分析的实用工具,以改善合成生物学社区的互操作性 | 酶标仪和流式细胞仪的荧光测量数据 | 合成生物学 | NA | 荧光测量 | NA | 荧光数据 | 使用绿色荧光蛋白(GFP)表达的一组常用组成型启动子进行验证 |
9 | 2024-08-07 |
Use of synthetic biology tools to optimize the production of active nitrogenase Fe protein in chloroplasts of tobacco leaf cells
2020-09, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13347
PMID:31985876
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研究论文 | 本文利用合成生物学工具优化烟草叶绿体中活性固氮酶铁蛋白(NifH)的生产 | 首次在烟草叶绿体中成功优化活性固氮酶铁蛋白的生产,并证明了叶绿体作为功能性固氮酶蛋白宿主的适宜性 | NA | 旨在通过合成生物学工具优化固氮酶铁蛋白在烟草叶绿体中的生产,以推动农业绿色革命 | 烟草叶绿体中的固氮酶铁蛋白(NifH)及其相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 蛋白质 | NA |