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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-10 |
If you eat it, or secrete it, they will grow: the expanding list of nutrients utilized by human gut bacteria
2020-Nov-09, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/JB.00481-20
PMID:33168637
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综述 | 本文综述了人类肠道细菌如何适应并利用来自宿主、饮食和细菌来源的碳水化合物营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 强调了先前未被充分研究的底物如单糖、核苷和美拉德反应产物对肠道微生物群的影响,并介绍了合成生物学领域在设计新型饮食控制营养利用途径方面的进展。 | NA | 探讨人类肠道细菌如何适应并利用不同来源的营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 人类肠道细菌及其对不同营养素的利用机制。 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-09 |
Redefining fundamental concepts of transcription initiation in bacteria
2020-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-0254-8
PMID:32665585
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研究论文 | 本文重新定义了细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 提出了精确、更新的定义,这些概念可以通过本体论进行形式化,为改进的生物信息学工具、知识基础资源和科学交流奠定基础 | NA | 重新定义细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 细菌基因调控的基本概念 | 基因学 | NA | NA | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
An endoribonuclease-based feedforward controller for decoupling resource-limited genetic modules in mammalian cells
2020-11-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19126-9
PMID:33173034
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research paper | 本文研究了在哺乳动物细胞中,由于转录和翻译资源的加载导致的遗传模块耦合问题,并开发了一种基于内切酶的前馈控制器来适应这种资源加载,实现基因表达水平的精确调控 | 开发了一种新型的基于内切酶的前馈控制器,能够在哺乳动物细胞中实现对基因表达水平的精确调控,且设计可跨细胞系移植 | NA | 解决合成生物学中遗传设备因资源限制导致的模块性缺失问题,实现基因表达的可预测、鲁棒和上下文无关控制 | 哺乳动物细胞中的遗传系统 | 生物技术 | NA | 内切酶 | 前馈控制器 | 基因表达数据 | NA |
4 | 2024-08-07 |
Bioluminescence-Driven Optogenetics
2020-Nov-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10120318
PMID:33260589
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综述 | 本文综述了利用生物发光作为生物光源触发生理事件和控制细胞行为的新兴方法,并讨论了其在合成生物学中的潜在应用 | 探索了生物发光在报告技术之外的潜力,并介绍了其作为生物光源的新应用 | NA | 探讨生物发光在触发生理事件和控制细胞行为中的应用 | 生物发光技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 生物发光 | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
The Model System Saccharomyces cerevisiae Versus Emerging Non-Model Yeasts for the Production of Biofuels
2020-Nov-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10110299
PMID:33233378
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综述 | 本文综述了利用酵母生产生物燃料的现状,特别是标准模型系统酿酒酵母与新兴的非模型酵母在生物燃料生产中的应用 | 介绍了合成生物学和代谢工程在设计策略和构建最优生物催化剂方面的最新进展,特别是在非传统酵母中的应用 | 合成生物学在非传统酵母中的研究仍处于初级阶段,需要进一步开发和应用先进的合成工程工具 | 探讨如何通过代谢工程和合成生物学开发高效的非传统酵母菌株,以生产多种化学品 | 酵母,特别是酿酒酵母和非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Rational engineering of Kluyveromyces marxianus to create a chassis for the production of aromatic products
2020-Nov-11, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-020-01461-7
PMID:33176787
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研究论文 | 本文通过合成生物学策略,对Kluyveromyces marxianus进行代谢途径的理性工程改造,以生产芳香产品 | 首次展示了如何通过理性工程改造Kluyveromyces marxianus的代谢途径,以生产芳香氨基酸基生物化学品 | 尝试将单独有益的修改结合到一个综合平台时存在挑战 | 开发和验证代谢工程策略,以充分利用Kluyveromyces marxianus的代谢作为生物基生产的基础 | Kluyveromyces marxianus的代谢途径 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 构建了能够从最小培养基中生产超过800 mg/L 2-PE的稳健菌株 |
7 | 2024-08-07 |
SEVA 3.1: enabling interoperability of DNA assembly among the SEVA, BioBricks and Type IIS restriction enzyme standards
2020-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13609
PMID:32710525
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研究论文 | 本文介绍了SEVA 3.1平台,该平台包括SEVA 3.1载体和基于Golden Gate的'SevaBrick Assembly',旨在提高SEVA平台、BioBricks和Type IIs介导的DNA组装之间的互操作性。 | SEVA 3.1平台通过提供广泛的克隆载体库和核心的标准SevaBrick引物,实现了多部分组装和短功能遗传元件的交换,减少了克隆和设计的工作量。 | NA | 优化插入物和载体的兼容性和模块化,以及提供一种成本和时间友好的DNA组装方法。 | SEVA 3.1平台在合成生物学应用中的有效性,特别是在革兰氏阴性细菌中的应用。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | DNA序列 | 包括多个sfGFP表达载体和可诱导的四基因操纵子,所有构建体在Pseudomonas putida和Escherichia coli中进行了表征。 |