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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-20 |
Artificial Self-assembling Nanocompartment for Organizing Metabolic Pathways in Yeast
2021-12-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00045
PMID:34591448
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研究论文 | 本文介绍了一种用于在酵母中组织代谢途径的人工自组装纳米隔室,利用病毒样颗粒(MPyV VLPs)进行内部分隔 | 首次在酵母中展示了能够参与代谢途径的人工生物催化隔室,并确立了MPyV平台作为酵母工程的有前景的合成生物学工具 | NA | 开发一种新的工具用于在酵母中组织代谢途径,以提高特定代谢产物的产量 | 酵母细胞中的代谢途径和特定酶的活性 | 合成生物学 | NA | 病毒样颗粒(MPyV VLPs) | NA | 生物分子 | NA |
22 | 2024-08-20 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏蛋白信号复合体在人工光照调节下的作用及其在开发气候智能型作物中的应用 | 探讨了人工光照对植物生长、产量和次级代谢物产生的影响,以及在藻类中提高生物修复效率的应用 | NA | 旨在探讨光敏蛋白信号复合体和基于人工光照的 photobiotechnological 方法在开发气候智能型作物中的应用 | 光敏蛋白(PHOT)及其在植物中的功能,以及人工光照对作物和藻类的影响 | NA | NA | 基因靶向和合成生物学方法 | NA | NA | NA |
23 | 2024-08-19 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021
2021-Oct-22, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2021-0026
PMID:34674411
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综述 | 本文介绍了2021年系统与合成生物学中COMBINE标准的最新规范 | 提供了四个标准的更新版本:Synthetic Biology Open Language Visual Version 2.3、Synthetic Biology Open Language Visual Version 3.0、Simulation Experiment Description Markup Language Level 1 Version 4和OMEX Metadata specification Version 1.2 | NA | 更新和介绍系统与合成生物学中的标准规范 | 系统与合成生物学中的COMBINE标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
24 | 2024-08-16 |
Plant Metabolic Gene Clusters: Evolution, Organization, and Their Applications in Synthetic Biology
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.697318
PMID:34490002
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综述 | 本文综述了植物代谢基因簇的进化、组织结构及其在合成生物学中的应用 | 探讨了基因簇通过基因重复和新功能化进化而来的机制,并强调了其在代谢工程和合成生物学策略中的重要性 | NA | 总结基因簇的进化,讨论其在特化代谢物生物合成中的组织和重要性,并强调其在未来代谢工程或合成生物学策略中的应用 | 植物代谢基因簇及其在特化代谢物生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇 | 超过20个基因簇 |
25 | 2024-08-14 |
Step-by-step design of proteins for small molecule interaction: A review on recent milestones
2021-08, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4098
PMID:33934427
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综述 | 本文综述了蛋白质设计领域中针对小分子相互作用的最新进展,详细介绍了从活性结合位点的构思到支架设计、序列优化及定制蛋白质的实验表达的每一步骤 | 近期计算技术在硬件和软件方面的进步为高通量筛选和新型折叠及功能改进的详细设计铺平了道路 | NA | 开发定制的蛋白质和多肽以满足特定应用需求 | 蛋白质设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2024-08-13 |
Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24103-x
PMID:34172734
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研究论文 | 本文通过基因工程改造大肠杆菌,使其过量表达光驱动的向内质子泵,并将其封装在人工细胞大小的隔室中,利用光暗循环实现pH值的可逆调节,进而触发DNA结构与隔室边缘的附着 | 本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合,利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制 | NA | 实现光转化为质子梯度,用于驱动合成细胞系统的动作 | 大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 生物分子 | NA |
27 | 2024-08-13 |
Refactoring biosynthetic gene clusters for heterologous production of microbial natural products
2021-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.12.011
PMID:33476936
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综述 | 本文综述了微生物天然产物异源生产的最新进展,重点介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主 | 介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主,为微生物天然产物的发现、产量优化和组合生物合成研究提供了新的合成生物学方法 | NA | 总结微生物天然产物异源生产的最新进展 | 微生物天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | BGC重构技术 | NA | NA | NA |
28 | 2024-08-10 |
Quasi-robust control of biochemical reaction networks via stochastic morphing
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0985
PMID:33849334
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研究论文 | 本文提出了一种通过随机变形控制生物化学反应网络的准鲁棒控制器 | 该控制器能够在适当的时标分离下,将目标分子种类的概率分布变形为预定义的形式,实现多模态或多稳定性 | NA | 开发分子控制器,以操纵最多部分已知的生物化学网络的动力学 | 生物化学反应网络的控制 | 合成生物学 | NA | 随机变形控制 | NA | 概率分布 | NA |
29 | 2024-08-10 |
Metabolic buffer analysis reveals the simultaneous, independent control of ATP and adenylate energy ratios
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0976
PMID:33906384
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研究论文 | 本文通过控制理论和新型缓冲分析研究了能量代谢中的缓冲作用 | 发现缓冲作用可以实现多个耦合输出的同时独立控制,并通过腺苷酸激酶和AMP脱氨酶在代谢中实现ATP和腺苷酸能量比的同时控制 | NA | 揭示生物调节的基本原理,理解生命原理,治疗复杂疾病,创造合成生物学 | 能量代谢中的缓冲作用及其在分子生物学中的协同作用 | 生物学 | NA | 控制理论,缓冲分析 | NA | 数据 | 人类肌肉和老鼠脂肪细胞数据 |
30 | 2024-08-09 |
Bacteria-Based Cancer Immunotherapy
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202003572
PMID:33854892
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research paper | 本文综述了基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展,重点介绍了天然细菌、工程细菌和细菌成分在癌症免疫疗法中的应用 | 利用合成生物学和基因技术使细菌成为高效的免疫治疗剂生产者,以及细菌与纳米材料的结合为癌症免疫疗法提供了多功能性 | NA | 探讨基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展及其未来研究方向 | 基于细菌的癌症免疫疗法 | NA | 癌症 | 基因技术 | NA | NA | NA |
31 | 2024-08-09 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本文研究了使用短肽标签的单拷贝在培养细胞和果蝇中对蛋白质进行操纵的方法 | 开发了一种新的工具箱,利用特定的蛋白质结合剂和合成生物学的进展,实现对蛋白质的直接操纵 | NA | 探索在时间和空间上控制蛋白质相互作用的新方法,以及分析蛋白质在动态细胞过程中的作用 | 短肽标签的单拷贝在细胞内对蛋白质的结合和操纵 | 细胞生物学 | NA | 蛋白质结合剂 | NA | 细胞 | 培养细胞和果蝇 |
32 | 2024-08-09 |
Engineering precision therapies: lessons and motivations from the clinic
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa024
PMID:33817342
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综述 | 本文讨论了过去十年中基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并回顾了有望增强现有治疗策略或为新精准药物铺路的临床前研究 | NA | NA | 探讨基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并评估其临床应用潜力 | 基因和细胞疗法的技术与策略 | 生物医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
33 | 2024-08-08 |
A multiplexed, automated evolution pipeline enables scalable discovery and characterization of biosensors
2021-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21716-0
PMID:33664255
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DRIVER的多重自动化进化流程,用于大规模发现和表征生物传感器 | 使用aptamer-coupled ribozyme库和ribozyme再生方法,实现了RNA生物传感器的快速体外从头进化,并成功应用于小分子检测和基因表达调控 | NA | 开发一种可扩展的流程,用于从头设计和表征生物传感器,应用于生物制造、诊断、治疗和合成生物学 | 生物传感器及其在活细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | DRIVER和CleaveSeq | NA | RNA | 六种小分子,包括五种之前未发现适配体的小分子 |
34 | 2024-08-07 |
Nanobody-mediated control of gene expression and epigenetic memory
2021-01-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20757-1
PMID:33483487
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研究论文 | 本文开发了一种使用小纳米抗体将内源性染色质调节因子招募到基因上以控制基因表达的策略 | 利用纳米抗体作为小型载体,有效结合并招募染色质调节因子,实现对特定基因的控制和表观遗传记忆的调节 | NA | 探索通过纳米抗体介导的染色质调节因子在特定基因位置的作用,以控制基因表达和表观遗传记忆 | 染色质调节因子、纳米抗体、基因表达和表观遗传记忆 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体 | NA | 基因组 | NA |
35 | 2024-08-07 |
Synergistic optimisation of expression, folding, and secretion improves E. coli AppA phytase production in Pichia pastoris
2021-Jan-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-020-01499-7
PMID:33494776
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研究论文 | 研究通过应用双向启动子(BDPs)及多种辅助蛋白优化Pichia pastoris中E. coli AppA植酸酶的表达、折叠和分泌 | 利用未在Pichia pastoris中表征的ERV2编码的黄素蛋白作为替代途径,显著提高了植酸酶的产量 | NA | 优化Pichia pastoris中异源蛋白的生产,特别是植酸酶的表达和分泌 | E. coli AppA植酸酶在Pichia pastoris中的表达、折叠和分泌 | 生物工程 | NA | 遗传工程 | NA | 蛋白质 | NA |
36 | 2024-08-07 |
A Review on Preparation of Betulinic Acid and Its Biological Activities
2021-Sep-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26185583
PMID:34577056
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综述 | 本文回顾了白桦酸的制备方法及其药理活性。 | 文章总结了化学合成和微生物生物转化等新方法来制备白桦酸,并探讨了合成生物学与遗传工程在白桦酸生物合成中的应用。 | 未提及具体的实验数据和结果,主要集中于文献回顾。 | 旨在提供白桦酸研究和利用的参考资料。 | 主要研究白桦酸及其药理活性。 | 药理学 | 抗肿瘤 | 化学合成与微生物生物转化 | NA | 文献 | NA |
37 | 2024-08-05 |
Pollutant Degrading Enzyme: Catalytic Mechanisms and Their Expanded Applications
2021-Aug-06, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26164751
PMID:34443339
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综合评价 | 本文全面总结了不同降解酶的功能,重点强调其催化机制 | 探讨了污染物降解酶的催化机制及其在工业过程中的扩展应用 | 仅有少数微生物株在酶级别上进行了详细研究 | 提高对降解酶催化机制的理解,以提高降解效率 | 各种自然分离微生物及其降解酶 | 数字病理学 | NA | 基因编辑技术和合成生物学 | NA | NA | NA |
38 | 2024-08-07 |
Tuning the ignition of CAR: optimizing the affinity of scFv to improve CAR-T therapy
2021-Dec-29, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04089-x
PMID:34966954
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综述 | 本文综述了单链可变片段(scFv)对嵌合抗原受体(CAR)功能的影响,并讨论了优化scFv亲和力的方法及其在CAR-T疗法中的应用 | 探讨了通过调整scFv亲和力来减轻CAR-T疗法中的靶点/非肿瘤毒性问题 | NA | 提供选择合适scFv用于CAR设计的初步指导 | scFv的亲和力优化及其对CAR功能的影响 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | synNotch受体 | NA | NA |
39 | 2024-08-07 |
Mechanisms supporting aminoadenine-based viral DNA genomes
2021-Dec-15, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04055-7
PMID:34910247
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研究论文 | 本文探讨了支持基于氨基腺嘌呤的病毒DNA基因组的机制 | 阐明了含有氨基腺嘌呤的DNA的生物合成途径以及腺嘌呤的排除机制 | NA | 研究病毒基因组中修饰核苷酸的生物合成途径及其在自然界中的分布 | 细菌噬菌体基因组中的2,6-二氨基嘌呤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
40 | 2024-08-07 |
An overview of signaling pathways regulating YAP/TAZ activity
2021-Jan, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03579-8
PMID:32748155
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综述 | 本文综述了调控YAP/TAZ活性的各种微环境信号和信号通路 | 提供了对YAP/TAZ信号调控机制的新认识,可能为生物材料、组织工程、再生医学和合成生物学等领域开辟新的治疗应用 | NA | 探讨YAP/TAZ的调控机制及其在生物学过程中的作用 | YAP/TAZ及其在细胞增殖、组织再生、细胞系命运决定、肿瘤发生和机械感应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |