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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-09-25 |
Protein engineering for natural product biosynthesis and synthetic biology applications
2021-02-15, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzab015
PMID:34137436
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研究论文 | 本文综述了蛋白质工程在天然产物生物合成和合成生物学应用中的最新进展 | 利用计算工具如机器学习和分子动力学模拟进行理性突变,以及半理性、定向进化和微环境工程策略优化催化 | NA | 重新设计和优化天然产物生物合成 | 蛋白质结构和功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习、分子动力学模拟 | NA | NA | NA |
22 | 2024-09-17 |
Focus on biosensors: Looking through the lens of quantitative biology
2021, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2021.10
PMID:37077214
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研究论文 | 本文探讨了基因编码荧光生物传感器(GEFBs)在定量生物学中的应用及其对数学建模的影响 | 本文介绍了合成生物学在加速生物传感器开发方面的进展,以及同时表达光谱兼容的生物传感器以量化信号网络中多个节点的方法 | NA | 研究生物传感器在定量分子和分子事件中的应用,并探讨其对数学建模的促进作用 | 基因编码荧光生物传感器(GEFBs)及其在细胞和时间尺度上的测量 | 定量生物学 | NA | 基因编码荧光生物传感器(GEFBs) | NA | 图像 | NA |
23 | 2024-09-15 |
Building the UK's industrial base in engineering biology
2021-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12016
PMID:36970556
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研究论文 | 本文描述了英国在工程生物学领域建立研究和工业基础的战略和组成部分 | 本文提出了英国在工程生物学领域的发展战略,包括建立新的研究中心和生物铸造厂 | 本文主要关注英国国内的发展,未详细讨论国际合作和全球影响 | 探讨英国在工程生物学领域的研究和工业基础建设 | 英国的工程生物学研究和工业基础 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
24 | 2024-09-15 |
Ten future challenges for synthetic biology
2021-Sep, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12011
PMID:36968258
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评论 | 本文讨论了合成生物学领域的10个未来挑战 | NA | NA | 探讨合成生物学未来的技术进步和发展方向 | 合成生物学领域的技术挑战 | 合成生物学 | NA | 自动化、深度学习 | NA | NA | NA |
25 | 2024-09-15 |
Implementing adaptive risk management for synthetic biology: Lessons from iGEM's safety and security programme
2021-Sep, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12012
PMID:36968257
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中适应性风险管理的实施,特别是iGEM竞赛中的安全与安全计划 | 提出了适应性风险管理方法,以应对技术和社会需求变化带来的挑战 | 涉及危险材料、动植物和环境的风险管理,以及术语差异和伦理问题 | 研究合成生物学中的风险管理策略 | iGEM竞赛中的风险管理实践 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2024-09-15 |
Building capacity for the engineering of biology in Australia
2021-Jun, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12009
PMID:36969479
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研究论文 | 本文探讨了澳大利亚合成生物学从零散实践者和小规模项目逐步发展到能力建设举措的过程 | 本文提出了通过政策变化和基础设施网络的加强来促进合成生物学发展的创新方法 | NA | 探讨澳大利亚合成生物学的发展及其对创新生态系统的影响 | 澳大利亚的合成生物学发展及其政策和投资环境 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
27 | 2024-08-24 |
Decoding and recoding plant development
2021-10-05, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab336
PMID:35237818
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综述 | 本文综述了利用CRISPR/Cas9和噬菌体整合酶等技术追踪细胞分化和解码细胞分子状态的最新进展,并探讨了这些技术在植物发育研究中的应用前景 | 结合合成生物学和分子生物学的方法,为理解生物学开辟了新的途径,并能塑造新的形态 | 目前这些工具主要在动物中实施,植物领域的应用尚处于起步阶段 | 探讨如何利用这些工具监测多种植物物种的发育过程,并指导感兴趣的程序的重编码 | 多细胞生物的发育过程及其调控机制 | NA | NA | CRISPR/Cas9, 噬菌体整合酶 | NA | NA | NA |
28 | 2024-08-22 |
Turing pattern design principles and their robustness
2021-Dec-27, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2020.0272
PMID:34743598
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综述 | 本文回顾了近期大规模数学分析尝试缩小潜在设计原则范围的研究,并探讨了这些模型的不同方面的鲁棒性 | 本文提出了鲁棒性视角在寻找合成图灵模式系统中的重要性 | NA | 探讨图灵模式设计原则及其鲁棒性 | 图灵模式在合成生物学中的应用 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
29 | 2024-08-21 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文综述了微生物系统生态学(MSE)如何帮助理解微生物群落中的交叉喂养现象 | 提出了微生物系统生态学框架,结合系统生物学和整合组学数据,用于解析微生物群落中的相互作用 | 主要依赖于代谢网络重建,可能忽略了其他类型的微生物相互作用 | 探讨微生物系统生态学在微生物研究中的应用,特别是如何通过代谢建模来解析微生物共存机制 | 微生物群落中的交叉喂养现象及其对微生物群落组成的影响 | 微生物学 | NA | 代谢建模 | NA | 组学数据 | NA |
30 | 2024-08-20 |
Artificial Self-assembling Nanocompartment for Organizing Metabolic Pathways in Yeast
2021-12-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00045
PMID:34591448
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研究论文 | 本文介绍了一种用于在酵母中组织代谢途径的人工自组装纳米隔室,利用病毒样颗粒(MPyV VLPs)进行内部分隔 | 首次在酵母中展示了能够参与代谢途径的人工生物催化隔室,并确立了MPyV平台作为酵母工程的有前景的合成生物学工具 | NA | 开发一种新的工具用于在酵母中组织代谢途径,以提高特定代谢产物的产量 | 酵母细胞中的代谢途径和特定酶的活性 | 合成生物学 | NA | 病毒样颗粒(MPyV VLPs) | NA | 生物分子 | NA |
31 | 2024-08-20 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏蛋白信号复合体在人工光照调节下的作用及其在开发气候智能型作物中的应用 | 探讨了人工光照对植物生长、产量和次级代谢物产生的影响,以及在藻类中提高生物修复效率的应用 | NA | 旨在探讨光敏蛋白信号复合体和基于人工光照的 photobiotechnological 方法在开发气候智能型作物中的应用 | 光敏蛋白(PHOT)及其在植物中的功能,以及人工光照对作物和藻类的影响 | NA | NA | 基因靶向和合成生物学方法 | NA | NA | NA |
32 | 2024-08-19 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021
2021-Oct-22, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2021-0026
PMID:34674411
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综述 | 本文介绍了2021年系统与合成生物学中COMBINE标准的最新规范 | 提供了四个标准的更新版本:Synthetic Biology Open Language Visual Version 2.3、Synthetic Biology Open Language Visual Version 3.0、Simulation Experiment Description Markup Language Level 1 Version 4和OMEX Metadata specification Version 1.2 | NA | 更新和介绍系统与合成生物学中的标准规范 | 系统与合成生物学中的COMBINE标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
33 | 2024-08-16 |
Plant Metabolic Gene Clusters: Evolution, Organization, and Their Applications in Synthetic Biology
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.697318
PMID:34490002
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综述 | 本文综述了植物代谢基因簇的进化、组织结构及其在合成生物学中的应用 | 探讨了基因簇通过基因重复和新功能化进化而来的机制,并强调了其在代谢工程和合成生物学策略中的重要性 | NA | 总结基因簇的进化,讨论其在特化代谢物生物合成中的组织和重要性,并强调其在未来代谢工程或合成生物学策略中的应用 | 植物代谢基因簇及其在特化代谢物生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇 | 超过20个基因簇 |
34 | 2024-08-14 |
Step-by-step design of proteins for small molecule interaction: A review on recent milestones
2021-08, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4098
PMID:33934427
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综述 | 本文综述了蛋白质设计领域中针对小分子相互作用的最新进展,详细介绍了从活性结合位点的构思到支架设计、序列优化及定制蛋白质的实验表达的每一步骤 | 近期计算技术在硬件和软件方面的进步为高通量筛选和新型折叠及功能改进的详细设计铺平了道路 | NA | 开发定制的蛋白质和多肽以满足特定应用需求 | 蛋白质设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
35 | 2024-08-13 |
Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24103-x
PMID:34172734
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研究论文 | 本文通过基因工程改造大肠杆菌,使其过量表达光驱动的向内质子泵,并将其封装在人工细胞大小的隔室中,利用光暗循环实现pH值的可逆调节,进而触发DNA结构与隔室边缘的附着 | 本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合,利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制 | NA | 实现光转化为质子梯度,用于驱动合成细胞系统的动作 | 大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 生物分子 | NA |
36 | 2024-08-13 |
Refactoring biosynthetic gene clusters for heterologous production of microbial natural products
2021-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.12.011
PMID:33476936
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综述 | 本文综述了微生物天然产物异源生产的最新进展,重点介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主 | 介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主,为微生物天然产物的发现、产量优化和组合生物合成研究提供了新的合成生物学方法 | NA | 总结微生物天然产物异源生产的最新进展 | 微生物天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | BGC重构技术 | NA | NA | NA |
37 | 2024-08-10 |
Quasi-robust control of biochemical reaction networks via stochastic morphing
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0985
PMID:33849334
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研究论文 | 本文提出了一种通过随机变形控制生物化学反应网络的准鲁棒控制器 | 该控制器能够在适当的时标分离下,将目标分子种类的概率分布变形为预定义的形式,实现多模态或多稳定性 | NA | 开发分子控制器,以操纵最多部分已知的生物化学网络的动力学 | 生物化学反应网络的控制 | 合成生物学 | NA | 随机变形控制 | NA | 概率分布 | NA |
38 | 2024-08-10 |
Metabolic buffer analysis reveals the simultaneous, independent control of ATP and adenylate energy ratios
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0976
PMID:33906384
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研究论文 | 本文通过控制理论和新型缓冲分析研究了能量代谢中的缓冲作用 | 发现缓冲作用可以实现多个耦合输出的同时独立控制,并通过腺苷酸激酶和AMP脱氨酶在代谢中实现ATP和腺苷酸能量比的同时控制 | NA | 揭示生物调节的基本原理,理解生命原理,治疗复杂疾病,创造合成生物学 | 能量代谢中的缓冲作用及其在分子生物学中的协同作用 | 生物学 | NA | 控制理论,缓冲分析 | NA | 数据 | 人类肌肉和老鼠脂肪细胞数据 |
39 | 2024-08-09 |
Bacteria-Based Cancer Immunotherapy
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202003572
PMID:33854892
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research paper | 本文综述了基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展,重点介绍了天然细菌、工程细菌和细菌成分在癌症免疫疗法中的应用 | 利用合成生物学和基因技术使细菌成为高效的免疫治疗剂生产者,以及细菌与纳米材料的结合为癌症免疫疗法提供了多功能性 | NA | 探讨基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展及其未来研究方向 | 基于细菌的癌症免疫疗法 | NA | 癌症 | 基因技术 | NA | NA | NA |
40 | 2024-08-09 |
Engineering precision therapies: lessons and motivations from the clinic
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa024
PMID:33817342
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综述 | 本文讨论了过去十年中基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并回顾了有望增强现有治疗策略或为新精准药物铺路的临床前研究 | NA | NA | 探讨基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并评估其临床应用潜力 | 基因和细胞疗法的技术与策略 | 生物医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |