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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-09-25 |
Protein engineering for natural product biosynthesis and synthetic biology applications
2021-02-15, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzab015
PMID:34137436
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研究论文 | 本文综述了蛋白质工程在天然产物生物合成和合成生物学应用中的最新进展 | 利用计算工具如机器学习和分子动力学模拟进行理性突变,以及半理性、定向进化和微环境工程策略优化催化 | NA | 重新设计和优化天然产物生物合成 | 蛋白质结构和功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习、分子动力学模拟 | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in the clinic: engineering vaccines, diagnostics, and therapeutics
2021-02-18, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.017
PMID:33571426
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研究论文 | 本文重点介绍了合成生物学在疫苗开发、分子诊断和基于细胞的治疗方法中的应用 | 强调了合成生物学领域的成熟度及其在临床应用中的潜力 | NA | 探讨合成生物学在生物医学领域的应用及其未来发展 | 疫苗、分子诊断和细胞治疗 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Towards a 'chassis' for bacterial magnetosome biosynthesis: genome streamlining of Magnetospirillum gryphiswaldense by multiple deletions
2021-Feb-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-021-01517-2
PMID:33541381
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研究论文 | 本文通过多重删除技术简化了磁性细菌Magnetospirillum gryphiswaldense的基因组,创建了一个用于合成生物学和生物技术的底盘细胞 | 首次证明了多次基因减少和大范围工程化磁性细菌的可行性 | NA | 开发一种大规模基因编辑和简化的方法,以便将Magnetospirillum gryphiswaldense用作合成生物学和生物技术的平台 | 磁性细菌Magnetospirillum gryphiswaldense的基因组 | NA | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 多个基因组区域,包括大型基因簇、移动遗传元件和噬菌体相关基因,总计约227.6 kb |
4 | 2024-08-07 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the molecular characterisation and environmental risk assessment of genetically modified plants obtained through synthetic biology
2021-Feb, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2021.6301
PMID:33598046
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研究论文 | 评估现有指南对通过合成生物学获得的转基因植物的分子特征和环境风险评估的充分性 | NA | 随着合成生物学的发展,可能需要调整指南以确保其充分性和足够性 | 评估合成生物学在农业食品领域的进展,并确定现有风险评估指南是否需要更新 | 通过合成生物学获得的转基因植物的分子特征和环境风险 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 涉及六个合成生物学类别和三个假设的合成生物学案例研究 |
5 | 2024-08-07 |
Toward precise CRISPR DNA fragment editing and predictable 3D genome engineering
2021-02-15, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa060
PMID:33125070
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研究论文 | 本文综述了CRISPR DNA片段编辑机制的当前理解以及精确遗传工程在3D基因组工程中预测结果的最新进展 | 揭示了CRISPR基因组编辑系统由于Cas9对目标DNA的粘性切割而具有精确性和可预测性 | NA | 探讨CRISPR DNA片段编辑机制及其在3D基因组工程中的应用 | CRISPR DNA片段编辑机制及3D基因组工程 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | DNA | NA |
6 | 2024-08-07 |
PlasmidHawk improves lab of origin prediction of engineered plasmids using sequence alignment
2021-02-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21180-w
PMID:33637701
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PlasmidHawk的新工具,用于提高工程质粒实验室来源预测的准确性,通过序列比对方法实现 | PlasmidHawk相比机器学习方法具有更高的预测准确性,并能精确指出用于实验室来源检测的特征子序列 | NA | 开发一种可解释且准确的工具,用于预测合成质粒序列的实验室来源 | 工程质粒的实验室来源 | 合成生物学 | NA | 序列比对 | NA | DNA序列 | NA |
7 | 2024-08-07 |
Prime Editing Guide RNA Design Automation Using PINE-CONE
2021-Feb-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00445
PMID:33464043
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PINE-CONE的软件工具,用于自动化设计prime editing guide RNA(pegRNA),以提高prime editing技术的应用效率 | PINE-CONE能够实现pegRNA的高通量自动化设计,简化了prime editing策略的实施流程 | NA | 开发一种工具以加速prime editing技术在合成生物学和生物医学研究中的应用 | prime editing guide RNA(pegRNA)的设计与应用 | 合成生物学 | 阿尔茨海默病 | prime editing | NA | DNA序列 | 一个针对阿尔茨海默病单核苷酸多态性(SNPs)的pegRNA库 |
8 | 2024-08-07 |
Development of a CRISPR/Cpf1 system for targeted gene disruption in Aspergillus aculeatus TBRC 277
2021-Feb-11, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-021-00669-8
PMID:33573639
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研究论文 | 本研究开发了一种基于AMA1的单CRISPR/Cpf1表达载体,用于在Aspergillus aculeatus TBRC 277中靶向破坏pyrG基因 | 首次报道了在A. aculeatus TBRC 277物种中使用FnCpf1作为替代的II类(V型)核酸酶 | NA | 探索CRISPR/Cpf1技术在丝状真菌中的应用,以促进菌株改良和功能基因组学研究 | Aspergillus aculeatus TBRC 277中的pyrG基因 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cpf1 | NA | DNA | 三种不同的引导crRNAs |