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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-09 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本文研究了使用短肽标签的单拷贝在培养细胞和果蝇中对蛋白质进行操纵的方法 | 开发了一种新的工具箱,利用特定的蛋白质结合剂和合成生物学的进展,实现对蛋白质的直接操纵 | NA | 探索在时间和空间上控制蛋白质相互作用的新方法,以及分析蛋白质在动态细胞过程中的作用 | 短肽标签的单拷贝在细胞内对蛋白质的结合和操纵 | 细胞生物学 | NA | 蛋白质结合剂 | NA | 细胞 | 培养细胞和果蝇 |
2 | 2024-08-08 |
A multiplexed, automated evolution pipeline enables scalable discovery and characterization of biosensors
2021-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21716-0
PMID:33664255
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DRIVER的多重自动化进化流程,用于大规模发现和表征生物传感器 | 使用aptamer-coupled ribozyme库和ribozyme再生方法,实现了RNA生物传感器的快速体外从头进化,并成功应用于小分子检测和基因表达调控 | NA | 开发一种可扩展的流程,用于从头设计和表征生物传感器,应用于生物制造、诊断、治疗和合成生物学 | 生物传感器及其在活细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | DRIVER和CleaveSeq | NA | RNA | 六种小分子,包括五种之前未发现适配体的小分子 |
3 | 2024-08-07 |
A suppressor tRNA-mediated feedforward loop eliminates leaky gene expression in bacteria
2021-03-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1179
PMID:33290521
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研究论文 | 本文开发了一种泄漏抑制工具,通过抑制tRNA介导的前馈环路,显著减少了诱导型遗传系统在无诱导剂时的泄漏表达,同时保持信号在Escherichia coli中的传递。 | 该系统利用抑制tRNA实现对调控基因中静默无义突变的条件性读通,可应用于任何配体诱导的转录因子,提供了一种模块化工具来减少泄漏并提高遗传电路中的诱导倍数。 | NA | 开发一种工具,用于减少细菌中诱导型遗传系统的泄漏表达并提高诱导倍数。 | Escherichia coli中的诱导型遗传系统和两种生物传感器(乳酸传感器LldR和阿拉伯糖传感器AraC)。 | 合成生物学 | NA | 抑制tRNA介导的前馈环路 | NA | 生物传感器输出 | 涉及两种生物传感器和一种诱导型突变质粒 |
4 | 2024-08-07 |
Virus Eradication and Synthetic Biology: Changes with SARS-CoV-2?
2021-03-28, Viruses
DOI:10.3390/v13040569
PMID:33800626
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在病毒消除中的作用,特别是针对SARS-CoV-2的影响 | 强调了合成生物学在快速响应和疫苗开发中的潜力 | NA | 研究合成生物学在病毒消除中的长期可持续性和对公共健康的影响 | SARS-CoV-2病毒及其疫苗开发 | 生物技术 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
Stability and Robustness of Unbalanced Genetic Toggle Switches in the Presence of Scarce Resources
2021-Mar-24, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11040271
PMID:33805212
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研究论文 | 本文研究了在资源稀缺条件下,不平衡遗传触发开关的稳定性和鲁棒性 | 揭示了资源竞争对触发开关动态特性的不利影响,并提出了通过优化资源竞争来减轻这些影响的方法 | 文章未明确提及研究的具体限制 | 探讨资源稀缺对遗传触发开关性能的影响,并提供优化设计指南 | 遗传触发开关在资源稀缺条件下的动态行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Scaffold-Mediated Microcompartment Assembly and Size Control
2021-03-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.0c05715
PMID:33683101
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研究论文 | 本文通过理论和计算研究,探讨了蛋白质壳在多种货物分子和长而灵活的支架分子组成的复合体周围的动态组装过程 | 研究预测了壳体大小、封装货物量及组装路径对支架特性(如长度和支架-货物相互作用的价数)的敏感依赖性,并揭示了蛋白质壳的自组装能力与其自发曲率半径和弹性长度尺度的关系 | NA | 研究细菌微隔间的组装及其大小控制的机制 | 蛋白质壳、货物分子、支架分子 | NA | NA | 理论和计算模拟 | NA | NA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Guanidine Biosensors Enable Comparison of Cellular Turn-on Kinetics of Riboswitch-Based Biosensor and Reporter
2021-03-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00583
PMID:33646758
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研究论文 | 本研究开发了基于RNA的荧光(RBF)生物传感器,用于检测常见的 chaotropic 试剂胍,并比较了基于核糖开关的生物传感器与报告基因的激活动力学。 | 首次系统地比较了同一配体下基于核糖开关的生物传感器与报告基因的性能,并展示了RBF生物传感器在监测细胞生物学、生物技术和合成生物学中动态过程的优势。 | NA | 开发和优化基于RNA的荧光生物传感器,用于监测胍的细胞内激活动力学。 | 基于RNA的荧光生物传感器和报告基因。 | 生物技术 | NA | RNA-based fluorescent (RBF) biosensors | NA | 荧光信号 | NA |
8 | 2024-08-07 |
A computational workflow for the expansion of heterologous biosynthetic pathways to natural product derivatives
2021-03-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22022-5
PMID:33741955
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研究论文 | 本文介绍了一种计算工作流程,用于系统筛选生物合成途径的生物化学邻近区域,以发现可通过衍生化途径中间体生产的药物化合物 | 该工作流程能够识别新的生物合成途径和酶候选物,用于生产已知的药物和新的衍生化合物 | NA | 探索和生产新的植物天然产物(PNP)衍生药物 | 植物天然产物及其衍生药物的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 计算筛选 | NA | 生物合成途径 | NA |
9 | 2024-08-07 |
Biotechnological Activities and Applications of Bacterial Pigments Violacein and Prodigiosin
2021-Mar-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-021-00262-9
PMID:33706806
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综述 | 本文综述了两种色素的生物技术活动和应用,即紫色素和血色素 | 尽管这两种化合物在七十年前就被发现,但过去二十年中对它们的生物应用兴趣显著增加,尤其是它们的抗菌和抗癌特性 | NA | 探讨紫色素和血色素的生物活性及其在生物技术中的应用 | 紫色素和血色素 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Recent developments in microfluidic synthesis of artificial cell-like polymersomes and liposomes for functional bioreactors
2021-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0048441
PMID:33833845
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综述 | 本文综述了利用微流控技术合成类似细胞的人工聚合物囊泡和脂质体的方法及其在功能生物反应器中的应用 | 介绍了微流控技术在制造多功能囊泡方面的最新进展,这些囊泡能够模拟细胞膜结构并实现多种生物反应 | 讨论了当前设计和应用人工细胞样囊泡作为功能生物反应器所面临的问题 | 总结微流控合成聚合物囊泡和脂质体的方法,并探讨其在功能生物反应器中的应用及未来展望 | 人工细胞样囊泡,包括聚合物囊泡和脂质体 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 囊泡 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Interfacing Living and Synthetic Cells as an Emerging Frontier in Synthetic Biology
2021-Mar-08, Angewandte Chemie (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/ange.202006941
PMID:38505493
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研究论文 | 本文讨论了将生物细胞与人工细胞结合以创建混合系统的可能性,并介绍了该领域的现状及三种通用的混合模式 | 提出了一种新的细胞仿生学方法,通过结合自上而下和自下而上的合成生物学,模糊了生物与非生物之间的界限 | 目前人工细胞无法与生物细胞的强大功能和行为复杂性相匹配 | 探讨生物细胞与人工细胞结合的可能性,以利用两者的优势 | 生物细胞与人工细胞的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
Expanding the Potential of Mammalian Genome Engineering via Targeted DNA Integration
2021-Mar-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00576
PMID:33596056
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综述 | 本文综述了通过CRISPR/Cas9系统和位点特异性重组酶在哺乳动物细胞中进行靶向DNA插入的两种不同机制 | 强调了位点特异性重组酶在靶向DNA插入方面的优势,特别是可编程重组酶的最新发展 | CRISPR/Cas9系统依赖于线性化DNA供体和细胞内修复途径,存在插入尺寸小和编辑结果不理想等局限 | 探讨如何通过蛋白质工程进一步扩展哺乳动物细胞中靶向DNA插入的工具箱 | CRISPR/Cas9系统和位点特异性重组酶在哺乳动物细胞中的应用 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9, 位点特异性重组酶 | NA | DNA序列 | NA |