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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-09-30 |
Importance of the 5' regulatory region to bacterial synthetic biology applications
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13868
PMID:34171170
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综述 | 本文综述了细菌合成生物学中5'调控区域(包括启动子、非翻译区域和编码序列的5'端)的创建方法及其重要性 | 本文总结了细菌工程中的关键进展,并强调了这些方法的优缺点 | 本文指出了该领域在未来可能面临的问题 | 探讨细菌合成生物学中5'调控区域的创建方法及其在基因表达调控和化合物生产中的重要性 | 细菌合成生物学中的5'调控区域,包括启动子、非翻译区域和编码序列的5'端 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | DNA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering strategies for de novo biosynthesis of sterols and steroids in yeast
2021-Nov-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-021-00460-9
PMID:38650187
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综述 | 本文综述了基于调控机制的代谢工程策略,用于提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成 | 介绍了酵母中一些典型甾醇和甾体化合物的最新从头合成进展 | 讨论了当前面临的挑战和未来展望 | 提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成效率 | 甾醇和甾体化合物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Artificial nucleic acid backbones and their applications in therapeutics, synthetic biology and biotechnology
2021-11-12, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20210169
PMID:34297063
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研究论文 | 本文探讨了人工核酸骨架的改良技术及其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的应用 | 提出了多种易于合成的人工核酸骨架及其引入寡核苷酸的稳健方法 | 目前人工核酸骨架的合成可及性有限,限制了其在更广泛领域的应用 | 开发新型人工核酸骨架,以充分利用其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的潜力 | 人工核酸骨架及其在寡核苷酸中的应用 | 生物技术 | NA | 核酸骨架改良技术 | NA | NA | NA |
4 | 2024-08-07 |
Independent control of mean and noise by convolution of gene expression distributions
2021-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27070-5
PMID:34845228
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研究论文 | 本文通过理论证明和实验验证,展示了通过在同一细胞中从两个可诱导启动子表达两个基因拷贝,可以独立控制基因表达的均值和噪声 | 提出了一种新的方法,通过在同一细胞中使用两个可诱导启动子表达两个基因拷贝,实现对基因表达均值和噪声的独立控制 | NA | 研究基因表达噪声对细胞适应性和生物过程的影响 | 基因表达的均值和噪声控制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 使用大肠杆菌进行实验验证 |
5 | 2024-08-07 |
Bioremediation of Per- and Poly-Fluoroalkyl Substances (PFAS) by Synechocystis sp. PCC 6803: A Chassis for a Synthetic Biology Approach
2021-Nov-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121300
PMID:34947832
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研究论文 | 本文评估了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力,并探讨了其在PFAS去除中的作用机制 | 首次报道了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS富集水体中的应用,并揭示了其在PFAS去除中的潜在机制 | 研究仅初步探讨了PFAS的去除机制,仍需进一步的代谢工程研究以优化其应用 | 评估Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力 | Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的应用及其去除机制 | 生物技术 | NA | 呼吸测量法 | NA | 生物数据 | 未具体说明样本数量 |
6 | 2024-08-07 |
Capsid Structure of Anabaena Cyanophage A-1(L)
2021-11-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.01356-21
PMID:34549983
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研究论文 | 本文报道了淡水蓝藻病毒A-1(L)的3.35 Å冷冻电镜结构,这是首个接近原子分辨率的T数为9的病毒衣壳结构 | A-1(L)病毒衣壳采用了一种独特的非共价链甲结构,通过两种榫卯式衣壳间相互作用稳定,这种结构使得A-1(L)具有仅由主要衣壳蛋白组成的刚性衣壳 | NA | 揭示蓝藻病毒A-1(L)衣壳的结构,以更好地理解其组装过程,并为未来的研究与应用提供结构平台 | 淡水蓝藻病毒A-1(L)的衣壳结构 | NA | NA | 冷冻电镜 | NA | 结构 | NA |
7 | 2024-08-07 |
LoxTnSeq: random transposon insertions combined with cre/lox recombination and counterselection to generate large random genome reductions
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13714
PMID:33325626
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research paper | 本文介绍了一种名为LoxTnSeq的新方法,用于生成和编录基因组减少突变体库 | LoxTnSeq结合了通过转座子突变随机整合lox位点,以及通过Cre重组酶生成突变体,并通过深度测序进行编录 | LoxTnSeq方法在删除基因后可能由于上位相互作用导致基因必需性的意外变化,导致这些必需性图谱的冗余 | 开发一种新的方法来生成和编录基因组减少突变体库,以去除不需要的遗传物质 | 自然基因组减少的细菌Mycoplasma pneumoniae | synthetic biology | NA | deep sequencing | NA | genomic data | 285个独特的删除突变体,删除范围从50bp到28Kb,占基因组总量的21% |
8 | 2024-08-07 |
High-efficiency production of bisabolene from waste cooking oil by metabolically engineered Yarrowia lipolytica
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13768
PMID:33605546
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研究论文 | 本研究首次通过合成生物学和代谢工程策略,将油脂酵母Yarrowia lipolytica工程化,以从废食用油中高效生产α-bisabolene、β-bisabolene和γ-bisabolene | 首次报道了利用代谢工程策略在Y. lipolytica中生产bisabolene,并探索了从废食用油中生产bisabolene的潜力 | NA | 开发一种竞争性和环境可持续的方法,用于工业生产bisabolene | α-bisabolene、β-bisabolene和γ-bisabolene的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
9 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of microorganisms for the production of multifunctional non-protein amino acids: γ-aminobutyric acid and δ-aminolevulinic acid
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13783
PMID:33675575
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研究论文 | 本文探讨了通过代谢工程策略在微生物中合成γ-氨基丁酸(GABA)和δ-氨基乙酸(ALA)的效率 | 文章分析并比较了多种代谢策略的效率,并提供了实现工业竞争性菌株的见解 | NA | 研究如何通过代谢工程提高微生物合成GABA和ALA的产量 | γ-氨基丁酸(GABA)和δ-氨基乙酸(ALA)的微生物合成 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Attenuator LRR - a regulatory tool for modulating gene expression in Gram-positive bacteria
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13797
PMID:33720523
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研究论文 | 本研究展示了在先前工作中发现的依赖于核糖体的RNA调节器LRR在调节基因表达方面的吸引力表现 | LRR提供了60倍的表达变化,并且在没有抗生素的情况下具有约1-2%的低泄漏表达,还能与不同启动子结合并在多种细菌中表现良好 | NA | 展示LRR在合成生物学中的应用潜力 | LRR在不同细菌中的基因表达调节能力 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 涉及多种细菌,如Bacillus thuringiensis, B. cereus, B. amyloliquefaciens, B. subtilis和Escherichia coli |
11 | 2024-08-07 |
Programming living sensors for environment, health and biomanufacturing
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13820
PMID:33960658
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综述 | 本文总结了合成生物学的最新进展,并讨论了这些进展如何加速微生物传感器的开发,提高其性能并解决现有局限性,以促进其在实际环境中的应用 | 介绍了合成生物学中的新技术,如电路设计、生物遏制和机器学习,以解决微生物传感器的技术和社会限制 | 尽管实验室中已证明概念成功,但微生物传感器的实际应用仍受限于技术和社会限制 | 探讨合成生物学如何加速微生物传感器的发展,提高性能并解决现有局限性 | 微生物传感器在环境监测、疾病诊断和适应性生物制造中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术,包括电路设计、生物遏制和机器学习 | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
DisCoTune: versatile auxiliary plasmids for the production of disulphide-containing proteins and peptides in the E. coli T7 system
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13895
PMID:34405535
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研究论文 | 本文介绍了两种DisCoTune质粒的设计,这些质粒能够在广泛使用的Escherichia coli T7蛋白生产系统中促进二硫键的形成,从而提高含有二硫键的蛋白质和多肽的产量和活性 | DisCoTune质粒的设计改进了二硫键在E. coli T7系统中的形成效率,显著提高了工业蛋白酶和芋螺毒素的产量和活性 | NA | 开发和优化用于在E. coli T7系统中高效形成二硫键的合成生物学工具和异源生产系统 | 含有二硫键的分泌蛋白和多肽 | 生物技术 | NA | E. coli T7蛋白生产系统 | NA | 蛋白质和多肽 | NA |
13 | 2024-08-07 |
The world of ribonucleases from pseudomonads: a short trip through the main features and singularities
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13890
PMID:34427985
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综述 | 本文综述了假单胞菌中核糖核酸酶的当前知识和独特性质,涉及基因组上下文分析、生物学功能以及利用核糖核酸酶改进生物技术过程的策略 | 探讨了非模型假单胞菌中调控层的复杂性和多样性,以及其在生物技术中的应用潜力 | 假单胞菌缺乏深入的调控层理解和有限的分子工具 | 总结假单胞菌中核糖核酸酶的知识和特性,并探讨其在生物技术中的应用 | 假单胞菌中的核糖核酸酶及其在生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 基因组上下文分析 | NA | 基因组数据 | NA |
14 | 2024-08-07 |
Synthetic biology beyond borders
2021-11, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13966
PMID:34792854
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
15 | 2024-08-07 |
A Novel and Efficient Genome Editing Tool Assisted by CRISPR-Cas12a/Cpf1 for Pichia pastoris
2021-Nov-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00172
PMID:34644057
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cpf1系统的新型高效基因编辑工具,用于Pichia pastoris的基因组编辑 | 首次实现了使用CRISPR-Cpf1系统删除20kb的大DNA片段和一步整合多个基因 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具,用于Pichia pastoris的代谢工程和基因组进化 | Pichia pastoris | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1 | NA | DNA | NA |
16 | 2024-08-07 |
Fine-Tuning Cas9 Activity with a Cognate Inhibitor AcrIIA4 to Improve Genome Editing in Streptomyces
2021-Nov-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00141
PMID:34734710
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研究论文 | 本文通过引入Cas9同源抑制剂AcrIIA4来微调Cas9活性,以提高链霉菌中的基因组编辑效率 | 引入Cas9同源抑制剂AcrIIA4,显著提高了基因组编辑的效率和特异性 | 未提及具体限制 | 提高链霉菌中基因组编辑的效率 | 链霉菌中的基因组编辑 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas9系统 | NA | 基因组数据 | 实验室和工业物种 |
17 | 2024-08-07 |
Advances in production and structural derivatization of the promising molecule ursolic acid
2021-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202000657
PMID:34096160
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综述 | 本文综述了熊果酸(UA)的生产、结构修饰及其在药物活性增强方面的研究进展 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学实现UA及其衍生物的绿色合成,并讨论了大规模微生物生产UA的潜力 | NA | 旨在探索更多多样化的结构以提高UA的药理活性,并增加其生物产量以满足工业需求 | 熊果酸及其衍生物 | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |