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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-30 |
Discovering design principles for biological functionalities:Perspectives from systems biology
2022, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:36222149
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综述 | 本文综述了从系统生物学角度发现生物功能设计原理的三种主要方法:计算方法、基于规则的方法和系统理论方法 | 围绕三种已充分研究的生物表型(振荡、双稳态切换和适应性),对三种方法进行了定性和定量比较研究,并讨论了它们的优缺点和未来研究方向 | 本文为综述性文章,未提出新的计算方法或实验验证;仅聚焦于三种已充分研究的表型,可能未覆盖其他生物功能 | 总结和比较从网络结构到输出功能映射的设计原理发现方法,以理解生物系统并应用于合成生物学和治疗学 | 生物网络(特别是振荡、双稳态切换和适应性三种表型相关的网络) | 系统生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 2 | 2026-10-13 |
Antibiotic residues in environment: antimicrobial resistance development, ecological risks, and bioremediation
2022-Jan, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-021-17374-w
PMID:34773239
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综述 | 本文综述了抗生素在环境中的残留问题,包括抗微生物耐药性的产生、生态风险以及生物修复方法 | 从分子和合成生物学角度提出了工程化微生物-代谢物生物器件以及开发具有理想特性的新型菌株来修复抗生素残留的新思路 | 未提供具体的实验数据或验证结果,仅对现有方法进行总结与展望 | 总结抗生素对环境的影响、耐药性产生机制以及不同的生物修复方法 | 环境中的抗生素残留、抗生素抗性基因和抗性细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 3 | 2026-10-03 |
Artificial nondirectional site-specific recombination systems
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103716
PMID:35072008
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研究论文 | 该研究设计并验证了6种新型人工非定向位点特异性重组系统(Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2),它们能够在基因组中随机触发删除、整合、倒位和易位,并与Cre/loxPsym正交 | 设计了6种新型人工非定向位点特异性重组系统,全部与Cre/loxPsym正交,且成对正交的非定向重组系统可同时在基因组两个不同区域独立启动大规模基因重组,这是此前正交系统无法实现的 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 设计并构建新型人工非定向位点特异性重组系统,以实现大规模基因组重组并扩展合成生物学中的位点特异性重组工具箱 | 人工非定向位点特异性重组系统(Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2)及其在细胞中的重组功能 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组 | NA | NA | NA | 位点特异性重组系统 | NA | 非定向位点特异性重组系统(可随机触发删除、整合、倒位和易位) | 医学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-28 |
Material Engineering in Gut Microbiome and Human Health
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/2022/9804014
PMID:35958108
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综述 | 本文综述了材料工程在肠道微生物组与人类健康研究中的应用,包括类器官、器官芯片、水凝胶、生物传感器和口服递送系统等生物材料技术 | 首次将肠道微生物组与材料研究两个不同领域进行综合聚焦的综述,提出材料工程在肠道微生物组与人类健康中的交叉研究主题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据;临床转化所需的监管规则尚不完善 | 加速肠道微生物组研究工具的开发和靶向肠道微生物组的治疗手段的开发 | 肠道微生物组、肠道类器官、肠道芯片模型、水凝胶、微生物组生物传感器、口服细菌递送系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
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综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白(RNP)的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用,并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统,并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白(RNP)复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 6 | 2026-02-13 |
Following the organism to map synthetic genomics
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.001
PMID:39416453
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研究论文 | 本文提出了一种基于工程生物体角色的启发式标签系统,以理解合成基因组学领域的多样性和未来方向 | 通过关注工程生物体的角色,为合成基因组学项目提供了一种新的分类和组织方法,强调负责任的研究和创新 | NA | 探索合成基因组学领域的多样性,并促进负责任的研究和创新,以构建可持续的未来关系 | 合成基因组学项目和工程生物体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
|
综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展,重点关注组蛋白修饰的遗传机制和合成生物学方法 | 总结了新型合成生物学方法用于分析表观遗传组分,并讨论了工程化调控元件在构建合成表观遗传系统中的应用潜力 | NA | 探讨表观遗传修饰建立和维持的机制,以及亲代组蛋白回收对异染色质介导的转录沉默遗传的影响 | 真菌模型和哺乳动物系统中的表观遗传系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌, 哺乳动物细胞 | 合成表观遗传系统 | 医学, 基础研究 |
| 8 | 2025-10-05 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
|
研究论文 | 开发了一个用于设计饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库工具VaLiAnT | 提供了一种新颖的基因组序列检索、突变和注释方法,支持cDNA和prime编辑文库生成 | NA | 开发用于饱和基因组编辑和深度突变扫描实验的寡核苷酸文库设计工具 | 基因组序列和遗传变异 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 饱和基因组编辑, 深度突变扫描 | NA | 基因组序列, 转录本注释 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 合成生物学, 进化遗传学, 宿主-病原体相互作用 |
| 9 | 2025-10-05 |
Current and future techniques for detecting oxytocin: Focusing on genetically-encoded GPCR sensors
2022-01-15, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2021.109407
PMID:34763021
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综述 | 本文全面回顾了神经科学中检测催产素的现有方法,并讨论了未来催产素传感器的发展方向 | 系统比较了不同催产素检测技术的优缺点,并提出了下一代传感器的发展原则 | NA | 评估当前催产素检测技术并指导未来传感器开发 | 催产素检测方法和技术 | 神经科学 | NA | 基因编码GPCR传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2024-11-18 |
Toward improved terpenoids biosynthesis: strategies to enhance the capabilities of cell factories
2022-Jan-24, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00493-8
PMID:38647812
|
综述 | 本文综述了提高细胞工厂合成萜类化合物能力的策略 | 本文介绍了通过代谢工程和合成生物学改进细胞工厂性能的新策略,包括转录和翻译效率的提高、酶工程和高通量筛选策略、染色体整合、代谢物耐受性和途径模块化 | 本文主要为综述性质,未提供具体实验数据或模型 | 探讨提高细胞工厂合成萜类化合物能力的策略 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-10-19 |
Cell-free synthetic biology: Orchestrating the machinery for biomolecular engineering
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.12.002
PMID:39416440
|
综述 | 本文综述了无细胞合成生物学领域的最新进展及其在生物分子工程中的应用 | 无细胞合成生物学通过无细胞合成触发生化过程,为生物分子工程提供了更多选择 | NA | 探讨无细胞合成生物学在生物分子工程中的应用 | 无细胞合成生物学及其在复杂蛋白质合成、非天然氨基酸掺入、精确翻译后修饰、高通量工作流程和合成生物分子网络调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-10-19 |
Synthetic biology landscape in the UK
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.002
PMID:39416441
|
review | 本文概述了英国合成生物学领域的组织网络及其在社区中的作用 | NA | NA | 概述英国合成生物学领域的组织网络及其在社区中的作用 | 英国合成生物学领域的组织和社区 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-10-19 |
Building the SynBio community in the Czech Republic from the bottom up: You get what you give
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.11.002
PMID:39416447
|
研究论文 | 本文讲述了捷克共和国合成生物学社区的形成过程,并总结了其发展的先决条件 | 本文首次详细描述了捷克共和国合成生物学社区的底层构建过程,并提供了相关实验室、研究机构和公司的概述 | 文章主要集中在捷克共和国的合成生物学发展,未涉及其他国家的比较分析 | 探讨捷克共和国合成生物学社区的发展及其面临的挑战 | 捷克共和国的合成生物学社区及其相关实验室、研究机构和公司 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-10-19 |
2022 The 1st Western China symposium on the international frontier of synthetic biomanufacturing
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.12.004
PMID:39416450
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会议摘要 | 2022年首届中国西部合成生物制造国际前沿研讨会成功举办,旨在展示中国及全球合成生物学领域的尖端知识,促进学术和经济发展 | NA | NA | 展示合成生物学领域的最新研究成果和发展趋势,促进学术交流和经济发展 | 合成生物学和绿色生物制造领域的最新研究成果和发展趋势 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超过400名代表 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-10-19 |
Synthetic biology landscape and community in Germany
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2021.12.001
PMID:39416446
|
评论 | 本文回顾了德国和欧洲的合成生物学景观,并探讨了德国合成生物学协会(GASB)如何通过其活动和社区建设活动应对挑战 | NA | NA | 探讨合成生物学在德国的发展现状及面临的挑战 | 德国和欧洲的合成生物学景观 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-10-19 |
De novo synthesis of synthetic biology ecosystem in Slovakia: Challenges and opportunities
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.06.001
PMID:39416451
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研究论文 | 本文评估了斯洛伐克合成生物学领域的现状,并提出了促进该领域发展的策略 | 本文首次系统评估了斯洛伐克合成生物学领域的现状,并提出了具体的策略 | 本文主要基于斯洛伐克的情况,可能不适用于其他国家 | 评估斯洛伐克合成生物学领域的现状并提出发展策略 | 斯洛伐克合成生物学领域的研究、工业参与、政府政策和教育情况 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-19 |
Construction of an ultra-strong PtacM promoter via engineering the core-element spacer and 5' untranslated region for versatile applications in Corynebacterium glutamicum
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.11.001
PMID:39416452
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研究论文 | 研究通过工程化改造核心元件间隔区和5'非翻译区,构建了一种超强PtacM启动子,用于谷氨酸棒杆菌中的多种应用 | 通过优化-35和-10区域之间的间隔序列长度和5'非翻译区的长度,成功构建了一种超强PtacM启动子,其转录强度约为原始Ptac的3.25倍 | NA | 研究启动子强度与核心元件间隔区和5'非翻译区之间的关系,以构建超强启动子用于工业微生物中的代谢工程 | 谷氨酸棒杆菌中的启动子强度 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 使用ATCC13032作为宿主构建了一系列人工诱导的启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-10-19 |
A SynBio community comes of age: Political, academical, industrial, and societal developments in the Netherlands
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.004
PMID:39416458
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评论 | 本文回顾了荷兰在学术界、工业界、政治界和社会中合成生物学的现状 | NA | 投资、监管和公众认知环境尚未完全优化,以促进合成生物学中的创业活动 | 探讨荷兰合成生物学领域的政治、学术、工业和社会发展 | 荷兰的合成生物学研究社区及其在不同领域的活动 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-10-19 |
Synthetic biology in Europe: current community landscape and future perspectives
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.003
PMID:39416454
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评论 | 本文回顾了欧洲合成生物学社区的现状,讨论了相关学术研究和工业界的状况,并探讨了欧洲合成生物学协会在促进专业人士之间的联系方面的作用 | NA | NA | 回顾和讨论欧洲合成生物学社区的现状及其未来展望 | 欧洲合成生物学社区的学术研究和工业界 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-09-30 |
Technological Approach to Mind Everywhere: An Experimentally-Grounded Framework for Understanding Diverse Bodies and Minds
2022, Frontiers in systems neuroscience
IF:3.1Q2
DOI:10.3389/fnsys.2022.768201
PMID:35401131
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TAME的技术方法,用于理解和操纵非传统基质中的认知 | 提出了TAME框架,这是一种非二元(连续)、基于实验的方法,用于理解强实体代理,并将其应用于再生/发育系统,提出形态发生作为基底认知的视角 | NA | 探讨合成生物学和生物工程在创造新型具身认知系统中的应用,并提出新的框架来理解多样化的智能 | 多样化的具身认知系统和智能 | 生物工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |