合成生物学相关文章
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当前共找到 195 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-30 |
Living material assembly of bacteriogenic protocells
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05223-w
PMID:36104562
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研究论文 | 开发了一种基于凝聚层微滴内捕获和原位处理细菌菌落的活材料组装方法，用于自下而上构建具有复杂结构和功能的合成细胞 | 利用空间分隔的细菌菌落在凝聚层微滴内原位加工，内源性构建膜bounding、分子拥挤、组成结构形态复杂的合成细胞，并继承多样生物组件实现多功能拟细胞特性 | 文中未明确说明该原细胞系统的长期稳定性、可扩展性以及在复杂生物环境中的适应性限制 | 推进具有高组织复杂性和多样功能的人工细胞的自发自下而上构建 | 细菌源性原细胞（bacteriogenic protocells）、大肠杆菌菌落、凝聚层微滴 | 合成生物学 | NA | 活材料组装、凝聚层微滴捕获、原位加工 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-10-30 |
Genetic and metabolic engineering for poly-γ-glutamic acid production: current progress, challenges, and prospects
2022-Aug-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-022-03390-6
PMID:36030456
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综述 | 综述了通过基因和代谢工程提高微生物合成聚γ-谷氨酸（γ-PGA）产量的策略、挑战与前景 | 系统总结了包括增强原料利用和前体供应、强化γ-PGA合成酶基因簇、转录调控工程、辅因子再生、能量工程、阻断副产物合成途径以及调控γ-PGA合成酶、谷氨酸消旋酶和γ-PGA水解酶表达以调控构型和分子量等多方面策略，并涵盖非芽孢杆菌宿主代谢工程 | 作为综述文章，未提供新的实验数据，主要基于已有文献归纳，可能未涵盖所有最新研究进展 | 总结提高γ-PGA产量的基因与代谢工程策略，并讨论该领域的进展、挑战和趋势 | 微生物（主要为芽孢杆菌及其他宿主）的γ-PGA生产 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 基因编辑, 合成生物学工具 | NA | 文本 | NA | 基因编辑工具 | 芽孢杆菌, 其他微生物宿主 | 代谢途径工程（强化前体供应、增强合成酶基因簇、转录调控、辅因子再生、能量工程、阻断副产物途径） | 工业生物技术, 材料, 食品, 医药 |
| 3 | 2026-10-30 |
Discovering design principles for biological functionalities:Perspectives from systems biology
2022, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:36222149
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综述 | 本文综述了从系统生物学角度发现生物功能设计原理的三种主要方法：计算方法、基于规则的方法和系统理论方法 | 围绕三种已充分研究的生物表型（振荡、双稳态切换和适应性），对三种方法进行了定性和定量比较研究，并讨论了它们的优缺点和未来研究方向 | 本文为综述性文章，未提出新的计算方法或实验验证；仅聚焦于三种已充分研究的表型，可能未覆盖其他生物功能 | 总结和比较从网络结构到输出功能映射的设计原理发现方法，以理解生物系统并应用于合成生物学和治疗学 | 生物网络（特别是振荡、双稳态切换和适应性三种表型相关的网络） | 系统生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 4 | 2026-10-13 |
Recent advances in construction and regulation of yeast cell factories
2022-Feb-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-022-03241-4
PMID:35174424
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综述 | 本文综述了过去五年中酵母细胞工厂构建与调控的研究进展，重点关注植物天然产物的生产 | 系统总结了不同酵母底盘（如酿酒酵母、解脂耶氏酵母和毕赤酵母）及新兴基因组编辑工具的应用，并强调了亚细胞通路定位、动态调控和转运蛋白工程等代谢调控策略，同时涵盖了基于C1的化学生物生产 | 未明确提及具体限制，但作为综述，可能缺乏原始实验数据且依赖已发表研究 | 总结酵母工程在生产植物天然产物方面的进展，并讨论现有挑战和未来前景 | 酵母细胞工厂，包括酿酒酵母、解脂耶氏酵母和毕赤酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑工具 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 毕赤酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-10-13 |
Antibiotic residues in environment: antimicrobial resistance development, ecological risks, and bioremediation
2022-Jan, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-021-17374-w
PMID:34773239
|
综述 | 本文综述了抗生素在环境中的残留问题，包括抗微生物耐药性的产生、生态风险以及生物修复方法 | 从分子和合成生物学角度提出了工程化微生物-代谢物生物器件以及开发具有理想特性的新型菌株来修复抗生素残留的新思路 | 未提供具体的实验数据或验证结果，仅对现有方法进行总结与展望 | 总结抗生素对环境的影响、耐药性产生机制以及不同的生物修复方法 | 环境中的抗生素残留、抗生素抗性基因和抗性细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 6 | 2026-10-12 |
Recent advancements in CRISPR/Cas technology for accelerated crop improvement
2022-Apr-23, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-022-03894-3
PMID:35460444
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas及其衍生基因编辑工具在作物遗传改良中的应用进展 | 系统总结了CRISPR/Cas及其仿制工具如碱基编辑、引物编辑、多重基因组编辑、染色体工程等先进生物技术在作物遗传改良中的应用，并讨论了基因驱动、组织特异性基因组编辑、dCas9介导的表观遗传修饰和转基因程序性自我消除等最新技术 | 未提及 | 综述CRISPR/Cas技术及其衍生工具在加速作物改良方面的最新进展，探讨其在作物遗传改良中的应用潜力和前景 | 作物植物 | 植物基因组编辑 | NA | CRISPR/Cas, 碱基编辑, 引物编辑, 多重基因组编辑, 染色体工程, 基因驱动, 组织特异性基因组编辑, dCas9介导的表观遗传修饰 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 7 | 2026-10-12 |
Microbial degradation and valorization of poly(ethylene terephthalate) (PET) monomers
2022-Apr-15, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-022-03270-z
PMID:35426614
|
综述 | 本文综述了降解PET单体的微生物和代谢途径以及将TPA和EG生物转化为高附加值化合物的研究进展 | 聚焦于PET单体（EG和TPA）的微生物降解和代谢途径而非PET水解酶，并详细讨论了将TPA和EG生物转化为高附加值化合物的最新进展 | 未提及具体实验数据，主要基于文献综述，缺乏对现有微生物降解效率和经济可行性的系统评估 | 总结PET单体微生物降解和增值转化的研究现状，探讨利用合成生物学和代谢工程解决PET污染问题 | PET塑料、PET单体（乙二醇EG和对苯二甲酸TPA）、塑料降解微生物、微生物细胞工厂 | 合成生物学, 代谢工程, 环境生物技术 | NA | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-10-03 |
Artificial nondirectional site-specific recombination systems
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103716
PMID:35072008
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研究论文 | 该研究设计并验证了6种新型人工非定向位点特异性重组系统（Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2），它们能够在基因组中随机触发删除、整合、倒位和易位，并与Cre/loxPsym正交 | 设计了6种新型人工非定向位点特异性重组系统，全部与Cre/loxPsym正交，且成对正交的非定向重组系统可同时在基因组两个不同区域独立启动大规模基因重组，这是此前正交系统无法实现的 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 设计并构建新型人工非定向位点特异性重组系统，以实现大规模基因组重组并扩展合成生物学中的位点特异性重组工具箱 | 人工非定向位点特异性重组系统（Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2）及其在细胞中的重组功能 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组 | NA | NA | NA | 位点特异性重组系统 | NA | 非定向位点特异性重组系统（可随机触发删除、整合、倒位和易位） | 医学, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-10-01 |
Enhanced Accumulation of Colloidal Particles in Microgrooved Channels via Diffusiophoresis and Steady-State Electrolyte Flows
2022-11-22, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.2c01755
PMID:36350104
|
研究论文 | 本研究基于扩散泳和稳态电解质流，通过在微沟槽通道中建立盐浓度梯度，实现了胶体颗粒在死端微结构中的快速、可逆富集、保留和去除，并系统研究了盐对比度和沟槽深度对富集过程的影响 | 提出了一种基于扩散泳的新型颗粒操控策略，利用平行电解质流之间的盐浓度梯度在微沟槽中诱导颗粒快速（数分钟内）且可逆地富集，并推导了颗粒富集的充分必要条件，同时在低成本PDMS微沟槽通道中验证了该过程 | 研究主要针对硅和PDMS微沟槽通道中的胶体颗粒，未涉及更复杂的生物颗粒或实际生物医学应用场景的验证 | 探究盐对比度和沟槽深度对胶体颗粒在微沟槽中富集过程的影响，确定实现最大颗粒富集的实验条件，并推导颗粒富集的充分必要条件 | 胶体颗粒、硅微沟槽通道、聚二甲基硅氧烷（PDMS）微沟槽通道、电解质溶液 | 微流控 | NA | 扩散泳、稳态电解质流、盐浓度梯度驱动颗粒操控 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学（药物递送、芯片诊断）、合成生物学 |
| 10 | 2026-09-30 |
Machine learning alternative to systems biology should not solely depend on data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac436
PMID:36184188
|
评论 | 本文讨论了机器学习作为系统生物学替代方法的根本和实践缺陷，并主张整合两种方法 | 指出机器学习方法在阐明生物系统中的涌现行为时存在根本性缺陷，呼吁在适当情况下整合系统生物学与机器学习 | 未深入探讨机器学习的适用性、所需数据质量和预处理方法 | 阐明机器学习作为系统生物学替代方法的缺陷，并倡导整合两种方法 | 机器学习方法与系统生物学方法 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-09-28 |
Advanced "Green" Prebiotic Composite of Bacterial Cellulose/Pullulan Based on Synthetic Biology-Powered Microbial Coculture Strategy
2022-Aug-08, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym14153224
PMID:35956737
|
研究论文 | 该研究通过合成生物学驱动的微生物共培养策略，开发了一种基于细菌纤维素/普鲁兰多糖的先进绿色益生元复合材料。 | 利用合成生物学驱动的微生物共培养策略，将益生元活性“嫁接”到细菌纤维素上，制备出环保且质量更好的复合材料。 | 摘要中未明确提及该研究的局限性。 | 开发细菌纤维素和益生元生产菌的共培养系统，以获得具有益生元活性的细菌纤维素基复合材料。 | 细菌纤维素、普鲁兰多糖、益生菌菌株GG、胶凝糖、黄原胶、共培养系统。 | 合成生物学 | NA | 共培养、扫描电子显微镜、傅里叶变换红外光谱 | NA | 图像、光谱数据 | NA | NA | NA | NA | 食品、医药 |
| 12 | 2026-09-28 |
Anaerobic Digestion of Food Waste and Its Microbial Consortia: A Historical Review and Future Perspectives
2022-08-03, International journal of environmental research and public health
DOI:10.3390/ijerph19159519
PMID:35954875
|
综述 | 本文综述了餐厨垃圾厌氧消化（FWAD）及其微生物群落的研究进展，从全球现状、关键条件与微生物群落变化、分子生物技术发展历程到多组学和合成生物学展望 | 系统梳理了FWAD微生物群落研究从经典菌株分离到高通量测序及同位素示踪的发展历程，并首次提出整合多组学和合成生物学来理解和调控FWAD功能微生物群落 | 目前缺乏对FWAD微生物群落的全面和预测性理解，这是FWAD领域的主要研究挑战 | 综述FWAD及其微生物群落的研究历史与未来展望，以期更好地管理全球可再生餐厨垃圾能源 | 餐厨垃圾厌氧消化过程中的微生物群落 | 环境生物技术 | NA | 高通量测序、同位素示踪、多组学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 能源、环境 |
| 13 | 2026-09-28 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the food and feed risk assessment of microorganisms obtained through synthetic biology
2022-Aug, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2022.7479
PMID:35991959
|
评估报告 | EFSA评估了合成生物学微生物在食品和饲料风险评估中的现有指南是否充分。 | 识别了与使用或生产非寻常或自然界新成分相关的新危害，并建议针对特定领域更新指南。 | 指南在评估生物质营养价值、微生物对肠道微生物组的影响、新自然界蛋白质的过敏潜力、水平基因转移的影响以及活细胞摄入的潜在风险方面存在不足。 | 评估合成生物学在农业食品领域的近期发展，确定其是否构成潜在新危害/风险，并评估现有风险评估指南的充分性。 | 用于食品和饲料链的合成生物学微生物。 | 合成生物学风险评估 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | 15个案例 | NA | 微生物 | NA | 食品, 饲料 |
| 14 | 2026-09-28 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the food and feed risk assessment of genetically modified plants obtained through synthetic biology
2022-Jul, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2022.7410
PMID:35873722
|
评论 | 欧洲食品安全局GMO专家组评估了现有指南对通过合成生物学获得的转基因植物进行食品和饲料风险评估的充分性和适当性 | 通过假设性案例研究，系统评估了当前和近期合成生物学方法在食品和饲料风险评估中的适用性，并识别了需要更新的领域 | 基于假设性案例研究，可能未涵盖所有合成生物学应用；未提供具体的实验数据验证 | 评估现有指南对合成生物学来源转基因植物的食品和饲料风险评估的充分性，并确定是否需要更新指南 | 通过合成生物学获得的转基因植物（GMPs）及其食品和饲料产品 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 食品, 农业 |
| 15 | 2026-09-28 |
Metabolic Engineering Strategies for Improved Lipid Production and Cellular Physiological Responses in Yeast Saccharomyces cerevisiae
2022-Apr-21, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof8050427
PMID:35628683
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母中脂质生产的代谢工程策略，包括脂肪酸合成、脂质积累、脂质储存和脂肪酸修饰四个模块，以及细胞生理响应的变化 | 系统总结了脂质合成的四个模块及其代谢工程策略，并探讨了脂质途径工程与细胞生理特性（如细胞膜完整性、活性氧水平、线粒体膜电位）之间的关系，提出了利用CRISPR基因组编辑和机器学习模型等合成生物学工具的未来趋势 | 作为综述，未提供原始实验数据，且主要聚焦于酿酒酵母，可能未全面涵盖其他产脂微生物的研究进展 | 总结提高酿酒酵母脂质生产的代谢工程策略，并探讨脂质途径工程对细胞生理特性的影响及未来发展方向 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其脂质生产途径 | 代谢工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR基因组编辑工具 | 酿酒酵母 | 脂质合成途径（包括脂肪酸生物合成模块、脂质积累模块、脂质储存模块和脂肪酸修饰模块） | 生物燃料，油脂化学品，化妆品 |
| 16 | 2026-09-28 |
Material Engineering in Gut Microbiome and Human Health
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/2022/9804014
PMID:35958108
|
综述 | 本文综述了材料工程在肠道微生物组与人类健康研究中的应用，包括类器官、器官芯片、水凝胶、生物传感器和口服递送系统等生物材料技术 | 首次将肠道微生物组与材料研究两个不同领域进行综合聚焦的综述，提出材料工程在肠道微生物组与人类健康中的交叉研究主题 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；临床转化所需的监管规则尚不完善 | 加速肠道微生物组研究工具的开发和靶向肠道微生物组的治疗手段的开发 | 肠道微生物组、肠道类器官、肠道芯片模型、水凝胶、微生物组生物传感器、口服细菌递送系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-05-22 |
Easy efficient HDR-based targeted knock-in in Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9 system
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162667
PMID:36602175
|
研究论文 | 基于CRISPR-Cas9系统在酿酒酵母基因组中进行高效HDR导向的靶向敲入 | 优化方法实现了CRISPR-Cas9介导的染色体靶向整合，效率高达74%，且15 bp微同源臂在最小敲入构建体浓度下即可达到50%的靶向敲入率，全基因组测序无脱靶效应 | 未在文中明确提及 | 开发一种高效、特异的CRISPR-Cas9策略，用于酿酒酵母基因组中靶向染色体整合和异源基因的框内表达 | 酿酒酵母基因组中的外源基因靶向敲入 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 多个靶向位点，效率基于74%的整合率评估 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 靶向敲入框架用于外源基因的框内表达，基于同源依赖重组 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 18 | 2026-05-09 |
Engineering Toehold-Mediated Switches for Native RNA Detection and Regulation in Bacteria
2022-09-30, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167689
PMID:35717997
|
综述 | 综述了Toehold介导的RNA开关在细菌中检测和调控天然RNA的应用，重点讨论了设计挑战和未来方向 | 系统总结了十二种最新开发的Toehold开关设计，强调结构预测算法对提升体内功能的重要性 | Toehold开关在跨生物体转移时存在适用性问题，且体内功能受限于当前预测算法的准确性 | 探讨Toehold介导的RNA开关用于细菌中天然RNA检测和调控的挑战与设计考虑 | Toehold介导的RNA开关及其在细菌中的天然RNA检测与调控 | 合成生物学 | NA | RNA开关、链置换 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | Toehold介导的RNA开关（包括传感器、逻辑门等） | 合成生物学、生物传感器 |
| 19 | 2026-05-06 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
|
研究论文 | 在大肠杆菌中，遗传背景效应可以超越经典的顺式调控元件对基因转录的影响 | 发现侧翼非编码合成序列的GC含量能独立于启动子等调控序列，显著影响报告基因的表达水平，揭示了转录倾向性的关键决定因素 | 未阐明低GC侧翼序列影响转录的分子机制，且研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他宿主中验证 | 探究大肠杆菌中遗传背景对转录的影响机制及其与经典顺式调控元件的关系 | 大肠杆菌中不同GC含量侧翼序列对报告基因表达的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 表达量数据 | 涉及多种GC含量（低、中、高）的侧翼序列构建 | NA | 大肠杆菌 | 报告基因表达系统 | NA |
| 20 | 2026-04-30 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
|
综述 | 综述合成免疫学在编程免疫细胞以实现新型复杂逻辑功能方面的进展，特别是针对CAR T细胞疗法的局限性提出合成生物学解决方案 | 提出“合成免疫疗法”这一新子领域概念，强调通过合成生物学工具赋予T细胞更高级的布尔逻辑能力，如多抗原识别和增强持久性 | CAR T细胞疗法仍不成熟，存在对表达抗原的正常组织的毒性以及细胞因子毒性等严重局限性 | 探讨如何利用合成生物学解决CAR T细胞疗法的局限性，推动免疫疗法向合成免疫疗法方向发展 | 嵌合抗原受体（CAR）T细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |