合成生物学相关文章
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当前共找到 182 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-06 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 在大肠杆菌中，遗传背景效应可以超越经典的顺式调控元件对基因转录的影响 | 发现侧翼非编码合成序列的GC含量能独立于启动子等调控序列，显著影响报告基因的表达水平，揭示了转录倾向性的关键决定因素 | 未阐明低GC侧翼序列影响转录的分子机制，且研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他宿主中验证 | 探究大肠杆菌中遗传背景对转录的影响机制及其与经典顺式调控元件的关系 | 大肠杆菌中不同GC含量侧翼序列对报告基因表达的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 表达量数据 | 涉及多种GC含量（低、中、高）的侧翼序列构建 | NA | 大肠杆菌 | 报告基因表达系统 | NA |
| 2 | 2026-04-30 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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综述 | 综述合成免疫学在编程免疫细胞以实现新型复杂逻辑功能方面的进展，特别是针对CAR T细胞疗法的局限性提出合成生物学解决方案 | 提出“合成免疫疗法”这一新子领域概念，强调通过合成生物学工具赋予T细胞更高级的布尔逻辑能力，如多抗原识别和增强持久性 | CAR T细胞疗法仍不成熟，存在对表达抗原的正常组织的毒性以及细胞因子毒性等严重局限性 | 探讨如何利用合成生物学解决CAR T细胞疗法的局限性，推动免疫疗法向合成免疫疗法方向发展 | 嵌合抗原受体（CAR）T细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-04-13 |
Advances in the Computational Design of Small-Molecule-Controlled Protein-Based Circuits for Synthetic Biology
2022-May, Proceedings of the IEEE. Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI:10.1109/JPROC.2022.3157898
PMID:36531560
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综述 | 本文回顾了合成生物学中基于计算蛋白质设计的小分子控制蛋白质电路的最新进展，特别关注Rosetta软件套件的应用 | 利用计算蛋白质设计技术，特别是Rosetta软件，开发模块化和可调谐的传感器，以克服天然传感器库有限和与工程电路接口困难的限制 | NA | 设计可编程输入-输出行为的生物分子电路，以解决医疗和可持续性领域的全球挑战 | 蛋白质基传感器和小分子输入 | 合成生物学 | NA | 计算蛋白质设计 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | 传感器模块与功能输出耦合的电路，包括蛋白质级电路或靶基因表达调控 | 生物医学, 代谢工程 |
| 4 | 2026-04-02 |
Engineering Toehold-Mediated Switches for Native RNA Detection and Regulation in Bacteria
2022-09-30, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167689
PMID:35717997
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综述 | 本文综述了基于RNA toehold介导的开关在细菌中用于天然RNA检测和调控的工程应用 | 重点讨论了将RNA toehold开关应用于体内天然RNA检测的挑战，包括跨生物体的可转移性，并展望了结构预测算法在提升RNA开关体内功能方面的潜力 | NA | 探讨RNA toehold介导的开关在合成生物学中用于传感和调控的应用，特别是在细菌环境中 | RNA toehold介导的开关及其在天然RNA检测和调控中的设计 | 合成生物学 | NA | RNA toehold介导的开关设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | RNA toehold介导的开关，通过链置换控制开关状态转换，用于传感和调控 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
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综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白（RNP）的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用，并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统，并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白（RNP）复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 6 | 2026-03-04 |
GroovDB: A Database of Ligand-Inducible Transcription Factors
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00382
PMID:36178800
|
研究论文 | 本文介绍了GroovDB，一个用于配体诱导型转录因子的数据库，旨在支持合成生物学中的工程应用 | 开发了一个经过验证的、可访问的数据库，整合了配体诱导型转录因子的序列、配体和操作数据，并提供了自动化数据管理和可视化工具 | NA | 为合成生物学提供一个可靠的配体诱导型转录因子资源库，以促进遗传电路的设计和应用 | 配体诱导型原核转录因子及其相关数据 | 合成生物学 | NA | 自动化数据管理流程 | NA | 序列数据、配体数据、操作数据 | NA | NA | 原核生物 | 化学响应型遗传电路 | 工业生物技术、医学 |
| 7 | 2026-02-13 |
Following the organism to map synthetic genomics
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.001
PMID:39416453
|
研究论文 | 本文提出了一种基于工程生物体角色的启发式标签系统，以理解合成基因组学领域的多样性和未来方向 | 通过关注工程生物体的角色，为合成基因组学项目提供了一种新的分类和组织方法，强调负责任的研究和创新 | NA | 探索合成基因组学领域的多样性，并促进负责任的研究和创新，以构建可持续的未来关系 | 合成基因组学项目和工程生物体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Flux-Balance Analysis and Mobile CRISPRi-Guided Deletion of a Conditionally Essential Gene in Shewanella oneidensis MR-1
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00323
PMID:36219726
|
研究论文 | 本研究结合通量平衡分析和移动CRISPRi技术，成功删除了Shewanella oneidensis MR-1中的一个条件必需基因 | 开发了计算分析与实验验证相结合的基因工程流程，首次实现了对条件必需基因的系统性评估和删除 | 研究仅针对单一菌株和特定基因，方法在其他生物系统中的普适性有待验证 | 开发改进合成生物学工具以工程化模式生物实现二氧化碳固定 | Shewanella oneidensis MR-1细菌及其代谢基因 | 合成生物学 | NA | 通量平衡分析(FBA), 移动CRISPRi基因敲除系统 | 代谢网络模型 | 代谢通量数据, 基因敲除实验数据 | NA | CRISPRi | Shewanella oneidensis MR-1 | NA | 能源, 环境 |
| 9 | 2025-10-05 |
Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies
2022-04-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023
PMID:35427499
|
研究论文 | 本研究通过模块化工程设计开发了合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)，用于编程治疗性细胞的基因调控 | 采用临床驱动设计流程构建受体，展示了系统模块化工程可生成具有可调传感和转录反应能力的受体平台 | NA | 开发用于治疗性细胞程序化基因调控的合成受体 | 合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)和人类原代T细胞 | 合成生物学 | NA | 调节性跨膜蛋白水解技术 | NA | NA | NA | 模块化工程 | 人类原代T细胞 | 合成跨膜蛋白水解受体，具有多抗原识别和剂量控制生物活性载荷产生能力 | 医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression
2022-07-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118
PMID:35858548
|
研究论文 | 本研究揭示了转录激活域强度与核浓度如何调控基因表达噪声的机制 | 首次证明在固定平均表达水平下，激活域的强度与丰度可独立调控基因表达噪声 | 未涉及不同类别激活域之间的差异比较 | 探索调控基因表达噪声的分子机制 | 转录激活域(ADs)与基因表达波动 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 11 | 2025-10-05 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
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综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展，重点关注组蛋白修饰的遗传机制和合成生物学方法 | 总结了新型合成生物学方法用于分析表观遗传组分，并讨论了工程化调控元件在构建合成表观遗传系统中的应用潜力 | NA | 探讨表观遗传修饰建立和维持的机制，以及亲代组蛋白回收对异染色质介导的转录沉默遗传的影响 | 真菌模型和哺乳动物系统中的表观遗传系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌, 哺乳动物细胞 | 合成表观遗传系统 | 医学, 基础研究 |
| 12 | 2025-10-05 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
|
研究论文 | 开发了一个用于设计饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库工具VaLiAnT | 提供了一种新颖的基因组序列检索、突变和注释方法，支持cDNA和prime编辑文库生成 | NA | 开发用于饱和基因组编辑和深度突变扫描实验的寡核苷酸文库设计工具 | 基因组序列和遗传变异 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 饱和基因组编辑, 深度突变扫描 | NA | 基因组序列, 转录本注释 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 合成生物学, 进化遗传学, 宿主-病原体相互作用 |
| 13 | 2025-10-05 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
|
综述 | 本文总结了水凝胶作为工程化活菌治疗系统递送平台的设计策略与应用进展 | 系统阐述水凝胶在活菌介导治疗中的平台作用，整合合成生物学与生物材料科学的交叉创新 | 未涉及具体临床转化挑战的量化分析 | 探讨水凝胶作为活菌治疗递送平台的开发策略与应用前景 | 基于水凝胶的工程化细菌治疗系统 | 合成生物学与生物材料 | 消化系统疾病,皮肤真菌感染,伤口愈合,疫苗,癌症 | NA | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 工程化细菌 | NA | 医药 |
| 14 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli
2022-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33255-3
PMID:36123371
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研究论文 | 本研究通过设计人工生物合成途径，在大肠杆菌中实现了植物源性止血物质三七素的全合成 | 采用逆向生物合成方法设计非天然生物合成途径，通过引入28个同义稀有密码子显著提高了三七素合酶的溶解度 | NA | 实现三七素的异源生物合成 | 三七素及其前体L-2,3-二氨基丙酸和草酰辅酶A | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成、代谢工程、密码子优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 三七素生物合成途径，包括前体合成模块和产物合成模块 | 医药 |
| 15 | 2025-10-05 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本研究通过量化大肠杆菌在12种不同条件下的转录组和相对翻译效率，揭示了基因特异性翻译调控与转录调控协同响应营养限制的机制 | 首次系统量化多条件下mRNA与翻译效率的相关性，发现翻译调控基因自身受翻译调控的反馈机制，并证明密码子使用可预测翻译效率的跨条件变异 | 研究仅关注碳、氮、磷三种营养限制条件，未涵盖其他环境因素；翻译效率为相对值而非绝对定量 | 探究不同环境下mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关联机制及翻译调控作用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）的基因组范围基因表达 | 系统生物学 | NA | 转录组测序，翻译效率量化，随机森林模型 | 随机森林 | 基因组学数据，转录组数据 | 12种不同生长条件的大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Living material assembly of bacteriogenic protocells
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05223-w
PMID:36104562
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研究论文 | 开发基于细菌捕获的原细胞活材料组装方法，构建具有高复杂度和多功能的人工细胞 | 提出细菌源性的活材料组装策略，实现内源性构建膜结合、分子拥挤且结构复杂的合成细胞 | NA | 推进人工细胞自下而上的自发构建，解决生物与非生物物质界面的组织复杂性和功能多样性问题 | 细菌菌落、凝聚微滴、合成细胞 | 合成生物学 | NA | 活材料组装、共凝聚微滴技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 膜结合结构、DNA-组蛋白核样凝聚物、膜化水泡、F-肌动蛋白原细胞骨架网络 | 合成生物学, 生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Current and future techniques for detecting oxytocin: Focusing on genetically-encoded GPCR sensors
2022-01-15, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2021.109407
PMID:34763021
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综述 | 本文全面回顾了神经科学中检测催产素的现有方法，并讨论了未来催产素传感器的发展方向 | 系统比较了不同催产素检测技术的优缺点，并提出了下一代传感器的发展原则 | NA | 评估当前催产素检测技术并指导未来传感器开发 | 催产素检测方法和技术 | 神经科学 | NA | 基因编码GPCR传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Rethinking cancer targeting strategies in the era of smart cell therapeutics
2022-12, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00505-x
PMID:36175644
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综述 | 探讨智能细胞疗法时代下癌症靶向策略的重新思考与未来发展方向 | 提出将合成生物学与机器学习相结合的新型癌症治疗范式，通过细胞编程实现多信号识别的智能靶向 | 新兴智能细胞工程技术尚未在临床完全实施 | 重构癌症靶向治疗策略以提高精准性和有效性 | 嵌合抗原受体T细胞等基于细胞的疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成回路编程、机器学习基因组数据分析 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学回路 | 免疫细胞 | 多信号识别程序（肿瘤细胞内在信号和微环境信号）、局部化治疗响应系统 | 医学 |
| 19 | 2025-10-05 |
Combating Infectious Diseases with Synthetic Biology
2022-02-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00576
PMID:35077138
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在传染病诊断和治疗中的最新应用进展 | 重点关注活体诊疗技术的最新发展及其在传染病防治中的潜力 | NA | 开发新型传染病诊断和治疗方法 | 传染病（寄生虫、真菌、细菌和病毒感染） | 合成生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成系统和设备 | 医学 |
| 20 | 2025-10-05 |
Chaos in synthetic microbial communities
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010548
PMID:36215322
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研究论文 | 本研究开发了一种探索小型微生物群落中混沌动力学潜力的方法 | 首次在合成微生物群落中研究混沌行为的存在 | NA | 探索合成微生物群落中混沌行为的可能性及其控制方法 | 受资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用调控的小型微生物群落 | 合成生物学 | NA | 近似贝叶斯计算 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用网络 | 生物技术, 生物加工, 合成生物学 |