合成生物学相关文章
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当前共找到 178 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Flux-Balance Analysis and Mobile CRISPRi-Guided Deletion of a Conditionally Essential Gene in Shewanella oneidensis MR-1
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00323
PMID:36219726
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研究论文 | 本研究结合通量平衡分析和移动CRISPRi技术，成功删除了Shewanella oneidensis MR-1中的一个条件必需基因 | 开发了计算分析与实验验证相结合的基因工程流程，首次实现了对条件必需基因的系统性评估和删除 | 研究仅针对单一菌株和特定基因，方法在其他生物系统中的普适性有待验证 | 开发改进合成生物学工具以工程化模式生物实现二氧化碳固定 | Shewanella oneidensis MR-1细菌及其代谢基因 | 合成生物学 | NA | 通量平衡分析(FBA), 移动CRISPRi基因敲除系统 | 代谢网络模型 | 代谢通量数据, 基因敲除实验数据 | NA | CRISPRi | Shewanella oneidensis MR-1 | NA | 能源, 环境 |
| 2 | 2025-10-05 |
Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies
2022-04-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023
PMID:35427499
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研究论文 | 本研究通过模块化工程设计开发了合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)，用于编程治疗性细胞的基因调控 | 采用临床驱动设计流程构建受体，展示了系统模块化工程可生成具有可调传感和转录反应能力的受体平台 | NA | 开发用于治疗性细胞程序化基因调控的合成受体 | 合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)和人类原代T细胞 | 合成生物学 | NA | 调节性跨膜蛋白水解技术 | NA | NA | NA | 模块化工程 | 人类原代T细胞 | 合成跨膜蛋白水解受体，具有多抗原识别和剂量控制生物活性载荷产生能力 | 医学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression
2022-07-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118
PMID:35858548
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研究论文 | 本研究揭示了转录激活域强度与核浓度如何调控基因表达噪声的机制 | 首次证明在固定平均表达水平下，激活域的强度与丰度可独立调控基因表达噪声 | 未涉及不同类别激活域之间的差异比较 | 探索调控基因表达噪声的分子机制 | 转录激活域(ADs)与基因表达波动 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 4 | 2025-10-05 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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综述 | 本文回顾了CAR-T细胞的现有逻辑功能及其局限性，并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法这一新领域的发展 | 提出“合成免疫疗法”新概念，通过合成生物学技术为免疫细胞编程复杂逻辑功能 | 当前获批的CAR-T细胞仅具备简单逻辑功能，存在对正常组织的毒性和细胞因子毒性等问题 | 探讨如何通过合成生物学改进CAR-T细胞疗法，实现更精准的癌症免疫治疗 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其合成生物学改造 | 合成生物学 | 癌症 | 细胞免疫疗法、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | T细胞 | 模块化受体、可定制传感器、布尔逻辑门、多抗原识别系统 | 医学 |
| 5 | 2025-10-05 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
|
综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展，重点关注组蛋白修饰的遗传机制和合成生物学方法 | 总结了新型合成生物学方法用于分析表观遗传组分，并讨论了工程化调控元件在构建合成表观遗传系统中的应用潜力 | NA | 探讨表观遗传修饰建立和维持的机制，以及亲代组蛋白回收对异染色质介导的转录沉默遗传的影响 | 真菌模型和哺乳动物系统中的表观遗传系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌, 哺乳动物细胞 | 合成表观遗传系统 | 医学, 基础研究 |
| 6 | 2025-10-05 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
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研究论文 | 开发了一个用于设计饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库工具VaLiAnT | 提供了一种新颖的基因组序列检索、突变和注释方法，支持cDNA和prime编辑文库生成 | NA | 开发用于饱和基因组编辑和深度突变扫描实验的寡核苷酸文库设计工具 | 基因组序列和遗传变异 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 饱和基因组编辑, 深度突变扫描 | NA | 基因组序列, 转录本注释 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 合成生物学, 进化遗传学, 宿主-病原体相互作用 |
| 7 | 2025-10-05 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文总结了水凝胶作为工程化活菌治疗系统递送平台的设计策略与应用进展 | 系统阐述水凝胶在活菌介导治疗中的平台作用，整合合成生物学与生物材料科学的交叉创新 | 未涉及具体临床转化挑战的量化分析 | 探讨水凝胶作为活菌治疗递送平台的开发策略与应用前景 | 基于水凝胶的工程化细菌治疗系统 | 合成生物学与生物材料 | 消化系统疾病,皮肤真菌感染,伤口愈合,疫苗,癌症 | NA | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 工程化细菌 | NA | 医药 |
| 8 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli
2022-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33255-3
PMID:36123371
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研究论文 | 本研究通过设计人工生物合成途径，在大肠杆菌中实现了植物源性止血物质三七素的全合成 | 采用逆向生物合成方法设计非天然生物合成途径，通过引入28个同义稀有密码子显著提高了三七素合酶的溶解度 | NA | 实现三七素的异源生物合成 | 三七素及其前体L-2,3-二氨基丙酸和草酰辅酶A | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成、代谢工程、密码子优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 三七素生物合成途径，包括前体合成模块和产物合成模块 | 医药 |
| 9 | 2025-10-05 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本研究通过量化大肠杆菌在12种不同条件下的转录组和相对翻译效率，揭示了基因特异性翻译调控与转录调控协同响应营养限制的机制 | 首次系统量化多条件下mRNA与翻译效率的相关性，发现翻译调控基因自身受翻译调控的反馈机制，并证明密码子使用可预测翻译效率的跨条件变异 | 研究仅关注碳、氮、磷三种营养限制条件，未涵盖其他环境因素；翻译效率为相对值而非绝对定量 | 探究不同环境下mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关联机制及翻译调控作用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）的基因组范围基因表达 | 系统生物学 | NA | 转录组测序，翻译效率量化，随机森林模型 | 随机森林 | 基因组学数据，转录组数据 | 12种不同生长条件的大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Living material assembly of bacteriogenic protocells
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05223-w
PMID:36104562
|
研究论文 | 开发基于细菌捕获的原细胞活材料组装方法，构建具有高复杂度和多功能的人工细胞 | 提出细菌源性的活材料组装策略，实现内源性构建膜结合、分子拥挤且结构复杂的合成细胞 | NA | 推进人工细胞自下而上的自发构建，解决生物与非生物物质界面的组织复杂性和功能多样性问题 | 细菌菌落、凝聚微滴、合成细胞 | 合成生物学 | NA | 活材料组装、共凝聚微滴技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 膜结合结构、DNA-组蛋白核样凝聚物、膜化水泡、F-肌动蛋白原细胞骨架网络 | 合成生物学, 生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Current and future techniques for detecting oxytocin: Focusing on genetically-encoded GPCR sensors
2022-01-15, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2021.109407
PMID:34763021
|
综述 | 本文全面回顾了神经科学中检测催产素的现有方法，并讨论了未来催产素传感器的发展方向 | 系统比较了不同催产素检测技术的优缺点，并提出了下一代传感器的发展原则 | NA | 评估当前催产素检测技术并指导未来传感器开发 | 催产素检测方法和技术 | 神经科学 | NA | 基因编码GPCR传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Rethinking cancer targeting strategies in the era of smart cell therapeutics
2022-12, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00505-x
PMID:36175644
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综述 | 探讨智能细胞疗法时代下癌症靶向策略的重新思考与未来发展方向 | 提出将合成生物学与机器学习相结合的新型癌症治疗范式，通过细胞编程实现多信号识别的智能靶向 | 新兴智能细胞工程技术尚未在临床完全实施 | 重构癌症靶向治疗策略以提高精准性和有效性 | 嵌合抗原受体T细胞等基于细胞的疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成回路编程、机器学习基因组数据分析 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学回路 | 免疫细胞 | 多信号识别程序（肿瘤细胞内在信号和微环境信号）、局部化治疗响应系统 | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Combating Infectious Diseases with Synthetic Biology
2022-02-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00576
PMID:35077138
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综述 | 本文探讨了合成生物学在传染病诊断和治疗中的最新应用进展 | 重点关注活体诊疗技术的最新发展及其在传染病防治中的潜力 | NA | 开发新型传染病诊断和治疗方法 | 传染病（寄生虫、真菌、细菌和病毒感染） | 合成生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成系统和设备 | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Chaos in synthetic microbial communities
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010548
PMID:36215322
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研究论文 | 本研究开发了一种探索小型微生物群落中混沌动力学潜力的方法 | 首次在合成微生物群落中研究混沌行为的存在 | NA | 探索合成微生物群落中混沌行为的可能性及其控制方法 | 受资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用调控的小型微生物群落 | 合成生物学 | NA | 近似贝叶斯计算 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用网络 | 生物技术, 生物加工, 合成生物学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Engineering artificial photosynthetic life-forms through endosymbiosis
2022-04-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29961-7
PMID:35474066
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研究论文 | 通过设计光合蓝细菌与酵母的内共生系统，构建人工光合生命形式 | 首次在光合蓝细菌与芽殖酵母之间建立可遗传调控的人工内共生关系 | 对自然内共生进化过程的理解仍有限 | 研究内共生进化机制并开发合成生物学应用平台 | 光合蓝细菌与芽殖酵母的内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | 多种光合蓝细菌突变株 | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 内共生能量供给系统 | 合成生物学, 进化研究 |
| 16 | 2025-10-05 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 本研究证明在大肠杆菌中，基因的局部染色体背景效应可以超越经典顺式调控元件对转录的影响 | 发现低GC含量的侧翼合成序列能显著降低报告基因表达，且这种遗传背景效应独立于启动子等调控序列 | 未阐明染色体位置依赖性表达变异的根本原因 | 探究遗传背景对基因转录的影响机制 | 大肠杆菌中的报告基因表达 | 合成生物学 | NA | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学构建 | 大肠杆菌 | 报告基因构建体，包含不同GC含量的侧翼序列 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Functional diversity and metabolic engineering of plant-specialized metabolites
2022-Oct, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loac019
PMID:39872355
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综述 | 本文综述植物特异性代谢物的功能多样性及其在微生物宿主中的代谢工程策略 | 系统整合多组学工具与合成生物学方法，优化植物特异性代谢物在微生物宿主中的异源生物合成途径 | NA | 阐明植物特异性代谢物的生物合成途径及其在微生物宿主中的异源重构 | 植物特异性代谢物 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、相关性分析、遗传图谱、生物合成基因簇预测 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物宿主 | 植物特异性代谢途径的异源重构 | 医药, 食品, 农业 |
| 18 | 2024-12-12 |
Quantifying heterologous gene expression during ectopic MazF production in Escherichia coli
2022-May-13, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-022-06061-9
PMID:35562780
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研究论文 | 本研究量化了在Escherichia coli中异位过表达MazF对异源基因表达的影响 | 首次量化了MazF过表达对异源蛋白表达的影响，并探讨了不同mRNA结构对表达的影响 | 研究结果表明MazF过表达会增加细菌群体的异质性，需要在实验中优化过表达的强度和持续时间 | 探讨MazF过表达对异源蛋白表达的影响 | Escherichia coli中异源蛋白的表达 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 荧光蛋白表达水平 | 使用了包含ACA序列和不含ACA序列的mRNA作为报告基因 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-12-06 |
Recent developments in the identification and biosynthesis of antitumor drugs derived from microorganisms
2022-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2022.100047
PMID:39628704
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综述 | 本文综述了从微生物中提取的抗癌药物的最新发展，包括其识别和生物合成 | 讨论了基因编辑技术和合成生物学工具在识别新基因簇、扩展天然产物和阐明生物合成途径中的应用 | NA | 总结微生物来源的抗癌化合物在生物合成方面的最新进展 | 微生物中的次级代谢产物及其衍生的抗癌药物 | NA | NA | 基因编辑技术，合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-12-06 |
Engineered bacteria as drug delivery vehicles: Principles and prospects
2022-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2022.100034
PMID:39629029
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造细菌作为药物递送载体的发展现状 | 探讨了合成生物学策略在改造细菌作为药物载体中的应用，包括工程细菌的靶向实现方法、遗传回路的设计方案以及治疗化合物的释放途径 | NA | 探讨工程细菌作为药物递送载体的原理和前景 | 工程细菌作为药物递送载体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |