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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-09-04 |
Current Advances in Biodegradation of Polyolefins
2022-Jul-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10081537
PMID:36013955
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综述 | 本文综述了聚烯烃降解的最新进展,包括分离和工程化的菌株、酶及相关途径 | 提出了通过人工微生物群落进行聚烯烃降解的新策略 | NA | 探讨聚烯烃的生物降解方法及其环境友好性和低能耗特性 | 聚烯烃(如聚乙烯、聚丙烯和聚苯乙烯)的生物降解 | NA | NA | 合成生物学和代谢工程策略 | NA | NA | NA |
82 | 2024-09-04 |
The transcription activator AtxA from Bacillus anthracis was employed for developing a tight-control, high-level, modulable and stationary-phase-specific transcription activity in Escherichia coli
2022, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysac014
PMID:36046151
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研究论文 | 本研究利用炭疽杆菌的转录激活因子AtxA,在埃希氏菌中开发了一种紧密控制、高表达、可调节且特异于静止期的转录活性系统 | 首次发现并构建了一种由AtxA、-10序列和RNA聚合酶三者协同作用的新型转录系统,该系统具有紧密控制、高表达、可调节和静止期特异性等特点 | NA | 阐明AtxA调控的转录机制,并开发一种新的转录系统用于静止期聚羟基丁酸酯的生产 | AtxA、-10序列、RNA聚合酶及其协同作用 | 分子生物学 | NA | DNA克隆 | NA | DNA序列 | 509 bp DNA片段 |
83 | 2024-09-04 |
Diversification of aminoacyl-tRNA synthetase activities via genomic duplication
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.983245
PMID:36060688
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研究论文 | 本文讨论了基因组重复如何与新型氨基酸tRNA连接酶(aaRS)及类似蛋白的出现相关,这些蛋白为其宿主提供了适应性优势 | 本文揭示了aaRS基因重复的广泛发生和系统发育多样性,并强调了探索当前未被研究的aaRS基因重复的重要性,因为它们可能揭示新的生物过程、药物靶点、生物活性分子和合成生物学工具 | 目前只有一部分重复的aaRS基因被研究,许多基因的生物学功能尚未被发现 | 探讨基因组重复与新型aaRS及其类似蛋白出现的关系 | aaRS及其类似蛋白的基因重复 | NA | NA | 生物信息学分析 | NA | 基因组数据 | 涉及所有aaRS家族的基因重复事件 |
84 | 2024-09-02 |
Identification of genome integration sites for developing a CRISPR-based gene expression toolkit in Yarrowia lipolytica
2022-08, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14060
PMID:35436041
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研究论文 | 本研究通过识别与高表达相关的中性整合位点,扩展了Yarrowia lipolytica中基于CRISPR的基因表达工具包 | 识别了新的中性整合位点,这些位点具有高表达和高整合效率,并表征了多样化的遗传组件(包括启动子和终止子),以扩展表达范围 | NA | 优化和重构Yarrowia lipolytica的代谢途径 | Yarrowia lipolytica中的基因表达工具包 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 基因组数据 | NA |
85 | 2024-09-02 |
Switchable Control of Scaffold Protein Activity via Engineered Phosphoregulated Autoinhibition
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00122
PMID:35765959
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化和可切换的合成支架系统,该系统集成了支架介导的信号传导与可切换的激酶/磷酸酶输入控制 | 通过将磷酸化响应抑制肽基序融合到14-3-3蛋白上,生成具有附加调节肽基序的二聚体蛋白支架,实现了对支架蛋白活性的可控调节 | NA | 开发一种可控的支架平台,用于合成生物学中的调节过程 | 14-3-3蛋白支架及其在细胞信号传导中的作用 | 合成生物学 | NA | 磷酸化调节 | NA | 蛋白质 | 使用三种不同的激酶进行实验 |
86 | 2024-09-02 |
The Origin of Life: What Is the Question?
2022-07, Astrobiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1089/ast.2021.0162
PMID:35594335
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research paper | 本文旨在梳理科学中关于生命起源问题的不同解读,并识别出三个主要维度:历史适宜性、自然自发性和与我们已知生命的相似性。 | 本文提出了生命起源问题的不同约束条件,并探讨了这些约束如何影响问题的认知状态和性质。 | 文章主要集中在理论分析上,未涉及具体的实验或数据支持。 | 探讨生命起源问题的不同解读及其对科学领域的影响。 | 生命起源问题的不同解读及其约束条件。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
87 | 2024-09-02 |
Biotechnological Approaches to Optimize the Production of Amaryllidaceae Alkaloids
2022-06-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12070893
PMID:35883449
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综述 | 本文综述了利用生物技术方法优化石蒜科生物碱(AAs)生产的现状 | 探讨了通过体外培养和合成生物学等生物技术手段提高AAs产量的方法 | AAs生产水平的变异性限制了其在制药领域的广泛应用 | 旨在提高石蒜科生物碱的生产效率,以满足日益增长的需求 | 石蒜科植物及其产生的生物碱 | NA | 阿尔茨海默病 | 体外培养、合成生物学 | NA | NA | NA |
88 | 2024-09-02 |
Synthetic Cells: From Simple Bio-Inspired Modules to Sophisticated Integrated Systems
2022-04-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202110855
PMID:34856047
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综述 | 本文综述了自底向上的合成生物学方法在设计和构建合成细胞及细胞器方面的最新进展 | 介绍了多种策略和材料,使科学家能够工程化合成细胞和细胞器,模拟自然细胞的基本功能和行为 | NA | 展示代表性的复杂性逐渐增加的合成细胞以及解决自底向上合成生物学中特定挑战的策略 | 合成细胞和细胞器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
89 | 2024-09-02 |
From Biomass-Derived p-Hydroxycinnamic Acids to Novel Sustainable and Non-Toxic Phenolics-Based UV-Filters: A Multidisciplinary Journey
2022, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2022.886367
PMID:35864863
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综述 | 本文综述了从生物质中提取的p-羟基肉桂酸衍生物到新型可持续且无毒的酚类紫外线过滤剂的开发过程 | 采用多学科方法,结合生物技术、绿色化学、下游工艺和光化学,将生物质特别是木质素转化为高附加值的创新紫外线过滤剂 | NA | 寻找可持续且无毒的紫外线过滤剂,以解决现有有机紫外线过滤剂的化石来源和毒性问题 | 从生物质中提取的酚类化合物及其作为紫外线过滤剂的应用 | 绿色化学 | NA | 合成生物学/发酵/在线产品回收 | NA | 生物质 | NA |
90 | 2024-09-01 |
New destination vectors facilitate Modular Cloning for Chlamydomonas
2022-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01239-x
PMID:35429260
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研究论文 | 本文介绍了通过构建新的目的载体,简化Chlamydomonas reinhardtii中Modular Cloning(MoClo)策略的基因组装步骤 | 开发了五个新的目的载体,这些载体包含抗常用抗生素的基因和一个直接组装基本遗传部件的位点,使用红色/白色颜色选择,无需昂贵的化合物如X-gal和IPTG | NA | 旨在简化Chlamydomonas reinhardtii中MoClo策略的基因组装步骤 | Chlamydomonas reinhardtii中的基因组装 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | 基因 | 五个新的目的载体 |
91 | 2024-09-01 |
Ecological firewalls for synthetic biology
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104658
PMID:35832885
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研究论文 | 本文探讨了利用工程微生物菌株作为生态防火墙,保护生态系统免受不良临界点和生物多样性丧失的影响 | 提出了一种基于生态网络模式非线性吸引子动态的替代观点,设计生态防火墙执行新功能(如塑料去除),并在当地社区内实现 containment | NA | 研究如何利用工程微生物菌株保护生态系统 | 工程微生物菌株及其在生态系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
92 | 2024-09-01 |
Low-cost anti-mycobacterial drug discovery using engineered E. coli
2022-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31570-3
PMID:35798732
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research paper | 本文介绍了一种合成生物学框架,用于在工程改造的大肠杆菌中检测结核分枝杆菌(Mtb)的药物靶点,通过构建目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型,成功发现了一种针对Mtb丙氨酸消旋酶(Alr)的抑制剂——贝那普利。 | 本文创新性地利用工程改造的大肠杆菌作为筛选平台,替代直接使用结核分枝杆菌进行药物筛选,提高了筛选效率和安全性。 | 尽管在体外生物化学实验中验证了贝那普利的抑制机制,但尚未在临床环境中进行全面评估。 | 开发一种高效且低成本的抗结核分枝杆菌药物筛选方法。 | 结核分枝杆菌的药物靶点和潜在抑制剂。 | 合成生物学 | 结核病 | NA | 目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型 | NA | 涉及四种额外的目标靶点 |
93 | 2024-09-01 |
Engineering consortia by polymeric microbial swarmbots
2022-07-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31467-1
PMID:35790722
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研究论文 | 本文展示了一种通过聚合物微胶囊封装微生物亚群来构建稳定微生物共生体的方法 | 提出了一种工程化的空间隔离方法,能够灵活精确地组装稳定的共生体 | NA | 探索合成生物学中新型的微生物共生体构建方法 | 微生物共生体的稳定性和功能性 | 合成生物学 | NA | 聚合物微胶囊技术 | NA | NA | NA |
94 | 2024-09-01 |
Reprogramming Microbial CO2-Metabolizing Chassis With CRISPR-Cas Systems
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.897204
PMID:35814004
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在微生物CO2代谢底盘中的应用及其在碳负性生物技术中的革命性作用 | 介绍了CRISPR-Cas系统在蓝藻、醋酸菌和甲烷菌中的最新进展,并展望了未来基于CRISPR-Cas系统的创新技术,如碱基编辑、前导编辑和转座子介导的基因组编辑 | NA | 探讨如何利用合成生物学工具,特别是CRISPR-Cas系统,开发和应用微生物CO2代谢底盘,以实现碳中和和碳负性生物技术,从而应对全球变暖问题 | 微生物CO2代谢底盘,包括蓝藻、醋酸菌和甲烷菌 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
95 | 2024-09-01 |
Molecular Advancements Establishing Chlamydomonas as a Host for Biotechnological Exploitation
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.911483
PMID:35845675
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综述 | 本文综述了近期在利用莱茵衣藻作为生物技术平台的进展,包括核转基因表达的改进、MoClo合成生物学策略的应用、转基因设计和表达的优化以及CRISPR/Cas9基因编辑技术的进步。 | 文章介绍了莱茵衣藻作为生物技术平台的多个创新点,包括核转基因表达的稳定性和效率提升、MoClo合成生物学策略的发展、转基因设计的系统性改进以及CRISPR/Cas9技术的应用。 | NA | 探讨莱茵衣藻作为生物技术平台的潜力和应用前景。 | 莱茵衣藻的生物技术应用和合成生物学潜力。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
96 | 2024-08-31 |
Bifurcation drives the evolution of assembly-line biosynthesis
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30950-z
PMID:35715397
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研究论文 | 本文探讨了生物合成装配线的重编程及其在抗生素结构进化中的作用 | 揭示了基因重复和新功能化如何导致生物合成途径的分支,以及这种分支如何促进抗生素结构的进化 | NA | 深入了解生物合成装配线的设计过程及其进化机制 | 抗结核药物wollamides的生物合成途径 | 生物技术 | 结核病 | 基因重复和新功能化 | NA | 基因组数据 | NA |
97 | 2024-08-31 |
Chemical Communication in Artificial Cells: Basic Concepts, Design and Challenges
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.880525
PMID:35720123
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综述 | 本文综述了人工细胞间分子通信的基本概念、设计及挑战 | 强调了人工细胞间通信的重要性,并分类讨论了不同通信模式,如自分泌、邻分泌、旁分泌和内分泌信号 | NA | 探讨人工细胞间通信的设计及其在生物技术、高级胶体材料和再生医学中的应用潜力 | 人工细胞间的分子通信 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
98 | 2024-08-30 |
Synthetic spatial patterning in bacteria: advances based on novel diffusible signals
2022-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13979
PMID:34843638
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综述 | 本文综述了细菌中合成空间模式化的进展,特别是基于新型可扩散信号的研究 | 介绍了新的潜在候选小分子信号,这些信号可以调节大肠杆菌中的基因表达,有助于合成生物学家设计更复杂、稳健和可调的空间结构 | NA | 探讨工程化多细胞模式化在理解模式形成基本规律中的作用,并可能对发育生物学领域做出贡献 | 细菌中的合成空间模式化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
99 | 2024-08-30 |
Phylogeny-Informed Synthetic Biology Reveals Unprecedented Structural Novelty in Type V Glycopeptide Antibiotics
2022-May-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c01389
PMID:35647273
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研究论文 | 本文通过结合系统发育引导的基因组挖掘策略和异源生产技术,利用GPAHex合成生物学平台,发现了五种新型V型糖肽抗生素,并对其结构和生物活性进行了表征 | 本文发现了具有前所未有结构新颖性的V型糖肽抗生素,包括rimomycin和misaugamycin,后者具有独特的N-C交叉连接和N-端酰化 | NA | 旨在发现能够克服糖肽抗生素抗性的新型糖肽抗生素 | 五种新型V型糖肽抗生素:rimomycin-A/B/C和misaugamycin-A/B | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘策略,异源生产技术 | GPAHex合成生物学平台 | 糖肽抗生素结构 | 五种新型V型糖肽抗生素 |
100 | 2024-08-28 |
Over the rainbow: structural characterization of the chromoproteins gfasPurple, amilCP, spisPink and eforRed
2022-May-01, Acta crystallographica. Section D, Structural biology
DOI:10.1107/S2059798322002625
PMID:35503208
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研究论文 | 本文介绍了四种开放源代码的色蛋白gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed的高分辨率X射线晶体结构 | 首次提供了这四种色蛋白的高分辨率结构信息,有助于蛋白质工程和合成生物学应用 | 色蛋白在合成生物学中的应用不如相关荧光蛋白广泛,部分原因是缺乏结构表征 | 研究色蛋白的结构特性,以促进其在蛋白质工程和合成生物学中的应用 | gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed四种色蛋白 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 四种色蛋白 |