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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-09-01 |
New destination vectors facilitate Modular Cloning for Chlamydomonas
2022-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01239-x
PMID:35429260
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研究论文 | 本文介绍了通过构建新的目的载体,简化Chlamydomonas reinhardtii中Modular Cloning(MoClo)策略的基因组装步骤 | 开发了五个新的目的载体,这些载体包含抗常用抗生素的基因和一个直接组装基本遗传部件的位点,使用红色/白色颜色选择,无需昂贵的化合物如X-gal和IPTG | NA | 旨在简化Chlamydomonas reinhardtii中MoClo策略的基因组装步骤 | Chlamydomonas reinhardtii中的基因组装 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | 基因 | 五个新的目的载体 |
82 | 2024-09-01 |
Ecological firewalls for synthetic biology
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104658
PMID:35832885
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研究论文 | 本文探讨了利用工程微生物菌株作为生态防火墙,保护生态系统免受不良临界点和生物多样性丧失的影响 | 提出了一种基于生态网络模式非线性吸引子动态的替代观点,设计生态防火墙执行新功能(如塑料去除),并在当地社区内实现 containment | NA | 研究如何利用工程微生物菌株保护生态系统 | 工程微生物菌株及其在生态系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
83 | 2024-09-01 |
Low-cost anti-mycobacterial drug discovery using engineered E. coli
2022-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31570-3
PMID:35798732
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research paper | 本文介绍了一种合成生物学框架,用于在工程改造的大肠杆菌中检测结核分枝杆菌(Mtb)的药物靶点,通过构建目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型,成功发现了一种针对Mtb丙氨酸消旋酶(Alr)的抑制剂——贝那普利。 | 本文创新性地利用工程改造的大肠杆菌作为筛选平台,替代直接使用结核分枝杆菌进行药物筛选,提高了筛选效率和安全性。 | 尽管在体外生物化学实验中验证了贝那普利的抑制机制,但尚未在临床环境中进行全面评估。 | 开发一种高效且低成本的抗结核分枝杆菌药物筛选方法。 | 结核分枝杆菌的药物靶点和潜在抑制剂。 | 合成生物学 | 结核病 | NA | 目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型 | NA | 涉及四种额外的目标靶点 |
84 | 2024-09-01 |
Engineering consortia by polymeric microbial swarmbots
2022-07-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31467-1
PMID:35790722
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研究论文 | 本文展示了一种通过聚合物微胶囊封装微生物亚群来构建稳定微生物共生体的方法 | 提出了一种工程化的空间隔离方法,能够灵活精确地组装稳定的共生体 | NA | 探索合成生物学中新型的微生物共生体构建方法 | 微生物共生体的稳定性和功能性 | 合成生物学 | NA | 聚合物微胶囊技术 | NA | NA | NA |
85 | 2024-09-01 |
Reprogramming Microbial CO2-Metabolizing Chassis With CRISPR-Cas Systems
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.897204
PMID:35814004
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在微生物CO2代谢底盘中的应用及其在碳负性生物技术中的革命性作用 | 介绍了CRISPR-Cas系统在蓝藻、醋酸菌和甲烷菌中的最新进展,并展望了未来基于CRISPR-Cas系统的创新技术,如碱基编辑、前导编辑和转座子介导的基因组编辑 | NA | 探讨如何利用合成生物学工具,特别是CRISPR-Cas系统,开发和应用微生物CO2代谢底盘,以实现碳中和和碳负性生物技术,从而应对全球变暖问题 | 微生物CO2代谢底盘,包括蓝藻、醋酸菌和甲烷菌 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
86 | 2024-09-01 |
Molecular Advancements Establishing Chlamydomonas as a Host for Biotechnological Exploitation
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.911483
PMID:35845675
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综述 | 本文综述了近期在利用莱茵衣藻作为生物技术平台的进展,包括核转基因表达的改进、MoClo合成生物学策略的应用、转基因设计和表达的优化以及CRISPR/Cas9基因编辑技术的进步。 | 文章介绍了莱茵衣藻作为生物技术平台的多个创新点,包括核转基因表达的稳定性和效率提升、MoClo合成生物学策略的发展、转基因设计的系统性改进以及CRISPR/Cas9技术的应用。 | NA | 探讨莱茵衣藻作为生物技术平台的潜力和应用前景。 | 莱茵衣藻的生物技术应用和合成生物学潜力。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
87 | 2024-08-31 |
Bifurcation drives the evolution of assembly-line biosynthesis
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30950-z
PMID:35715397
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研究论文 | 本文探讨了生物合成装配线的重编程及其在抗生素结构进化中的作用 | 揭示了基因重复和新功能化如何导致生物合成途径的分支,以及这种分支如何促进抗生素结构的进化 | NA | 深入了解生物合成装配线的设计过程及其进化机制 | 抗结核药物wollamides的生物合成途径 | 生物技术 | 结核病 | 基因重复和新功能化 | NA | 基因组数据 | NA |
88 | 2024-08-31 |
Chemical Communication in Artificial Cells: Basic Concepts, Design and Challenges
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.880525
PMID:35720123
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综述 | 本文综述了人工细胞间分子通信的基本概念、设计及挑战 | 强调了人工细胞间通信的重要性,并分类讨论了不同通信模式,如自分泌、邻分泌、旁分泌和内分泌信号 | NA | 探讨人工细胞间通信的设计及其在生物技术、高级胶体材料和再生医学中的应用潜力 | 人工细胞间的分子通信 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
89 | 2024-08-30 |
Synthetic spatial patterning in bacteria: advances based on novel diffusible signals
2022-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13979
PMID:34843638
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综述 | 本文综述了细菌中合成空间模式化的进展,特别是基于新型可扩散信号的研究 | 介绍了新的潜在候选小分子信号,这些信号可以调节大肠杆菌中的基因表达,有助于合成生物学家设计更复杂、稳健和可调的空间结构 | NA | 探讨工程化多细胞模式化在理解模式形成基本规律中的作用,并可能对发育生物学领域做出贡献 | 细菌中的合成空间模式化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
90 | 2024-08-30 |
Phylogeny-Informed Synthetic Biology Reveals Unprecedented Structural Novelty in Type V Glycopeptide Antibiotics
2022-May-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c01389
PMID:35647273
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研究论文 | 本文通过结合系统发育引导的基因组挖掘策略和异源生产技术,利用GPAHex合成生物学平台,发现了五种新型V型糖肽抗生素,并对其结构和生物活性进行了表征 | 本文发现了具有前所未有结构新颖性的V型糖肽抗生素,包括rimomycin和misaugamycin,后者具有独特的N-C交叉连接和N-端酰化 | NA | 旨在发现能够克服糖肽抗生素抗性的新型糖肽抗生素 | 五种新型V型糖肽抗生素:rimomycin-A/B/C和misaugamycin-A/B | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘策略,异源生产技术 | GPAHex合成生物学平台 | 糖肽抗生素结构 | 五种新型V型糖肽抗生素 |
91 | 2024-08-28 |
Over the rainbow: structural characterization of the chromoproteins gfasPurple, amilCP, spisPink and eforRed
2022-May-01, Acta crystallographica. Section D, Structural biology
DOI:10.1107/S2059798322002625
PMID:35503208
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研究论文 | 本文介绍了四种开放源代码的色蛋白gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed的高分辨率X射线晶体结构 | 首次提供了这四种色蛋白的高分辨率结构信息,有助于蛋白质工程和合成生物学应用 | 色蛋白在合成生物学中的应用不如相关荧光蛋白广泛,部分原因是缺乏结构表征 | 研究色蛋白的结构特性,以促进其在蛋白质工程和合成生物学中的应用 | gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed四种色蛋白 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 四种色蛋白 |
92 | 2024-08-28 |
Engineering Light-Control in Biology
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.901300
PMID:35573251
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综述 | 本文综述了在生物学中利用工程技术创建和优化光调控蛋白的方法 | 探讨了通过蛋白质工程和合成生物学方法开发新型光遗传蛋白的创新策略 | 并非对光敏感调节剂的百科全书式总结,而是通过选定实例讨论光调控蛋白工程的重要方面 | 旨在讨论通过选定实例进行光调控蛋白工程的重要方面 | 光遗传蛋白的开发和优化 | 生物工程 | NA | 光遗传学 | NA | 蛋白质 | NA |
93 | 2024-08-28 |
Natural Composition and Biosynthetic Pathways of Alkaloids in Medicinal Dendrobium Species
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.850949
PMID:35599884
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综述 | 本文综述了药用石斛属植物中生物碱的自然组成及其生物合成途径 | 探讨了高通量测序技术在生物碱途径发现中的应用以及合成生物学在大规模生产生物碱中的应用 | NA | 深入研究生物碱的组成及其生物合成途径 | 石斛属植物中的生物碱 | NA | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组注释 | NA |
94 | 2024-08-27 |
Advanced Wound Diagnostics: Toward Transforming Wound Care into Precision Medicine
2022-06, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2020.1319
PMID:34128387
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综述 | 本文综述了先进的伤口诊断技术,包括生物标志物和成像系统,以及它们在将伤口护理转变为精准医学中的应用 | 介绍了多种生物标志物和成像技术,如蛋白酶、急性期反应物、挥发性排放物和超声、自体荧光、光谱成像及光学相干断层扫描等,这些技术正在改变我们对分子伤口环境的理解,并引入现代治疗策略 | 尽管已经识别出许多潜在的生物标志物并开发了多种成像系统,但仍需要更多高质量的随机对照试验来阐明这些工具在临床环境中改变愈合动态或预测伤口闭合的作用 | 推动伤口护理向精准医学转变,开发基于证据的方法,这些方法具有预测性、规定性和个性化 | 非愈合伤口的诊断和治疗 | NA | NA | 生物标志物检测和成像技术 | NA | 生物标志物数据和成像数据 | NA |
95 | 2024-08-27 |
Bottlenecks and opportunities for synthetic biology biosafety standards
2022-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29889-y
PMID:35449163
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
96 | 2024-08-27 |
A hierarchy of biomolecular proportional-integral-derivative feedback controllers for robust perfect adaptation and dynamic performance
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29640-7
PMID:35440114
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研究论文 | 本文探讨了通过生物分子反应实现比例-积分-微分(PID)控制器的方法,并提出了一系列在简单性和高性能之间取得平衡的拓扑结构。 | 本文首次展示了不同生物分子PI控制器的性能增强能力,并介绍了基于非一致前馈环的微分控制器,以及通过将分子积分器置于负反馈环中实现微分器的方法。 | NA | 研究如何通过生物分子反应实现PID控制器,以提高系统的稳定性和动态性能。 | 生物分子PID控制器的实现及其在合成生物学和网络遗传学领域的应用。 | 合成生物学 | NA | 生物分子反应 | PID控制器 | 生物分子 | 单个酵母细胞 |
97 | 2024-08-27 |
A Versatile Transcription Factor Biosensor System Responsive to Multiple Aromatic and Indole Inducers
2022-04-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00063
PMID:35316041
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研究论文 | 本文构建了一种基于TetR家族抑制子CmeR的变构转录因子(aTF)遗传回路,该回路作为水杨酸盐生物传感器在模型生物中发挥作用,并能响应多种芳香族和吲哚诱导物 | 本文展示了CmeR调控的启动子对多种芳香族和吲哚诱导物的响应能力,扩展了aTF生物传感器的应用范围 | NA | 开发多功能变构转录因子生物传感器系统,以促进代谢工程、生物技术和合成生物学中的应用 | 变构转录因子CmeR及其在微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
98 | 2024-08-27 |
Harnessing phosphonate antibiotics argolaphos biosynthesis enables a synthetic biology-based green synthesis of glyphosate
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29188-6
PMID:35365617
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research paper | 本文通过合成生物学方法优化了氨基甲基膦酸(AMP)的生产,并开发了一种将AMP转化为草甘膦的高效化学工艺 | 利用合成生物学策略提高了AMP的生产效率,并开发了一种新的化学转化工艺 | NA | 开发一种环保的草甘膦生产方法 | 氨基甲基膦酸(AMP)和草甘膦的生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 化学物质 | NA |
99 | 2024-08-27 |
Harnessing the Algal Chloroplast for Heterologous Protein Production
2022-Mar-30, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10040743
PMID:35456794
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综述 | 本文综述了利用藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主,并讨论了当前的技术工具和需要解决的技术瓶颈 | 藻类叶绿体因其基因组较小,成为合成生物学方法的理想目标,并可作为产品分隔积累和储存的便利亚细胞位点 | 需要解决的主要技术瓶颈包括开发稳健和可持续的绿色细胞生物工厂 | 探讨利用藻类叶绿体进行异源蛋白生产的技术现状和未来发展 | 藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
100 | 2024-08-27 |
Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis and Identification of Dammarenediol-II Synthase Involved in Saponin Biosynthesis in Gynostemma longipes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.852377
PMID:35401630
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学和转录组学分析,鉴定了参与Gynostemma longipes中皂苷生物合成的达玛烯二醇-II合酶 | 首次鉴定了新的达玛烯二醇-II合酶,并通过生物信息学分析、酵母表达实验和酶活性测定验证了其功能 | NA | 揭示达玛烯二醇-II的生物合成机制,以提高珍贵的人参皂苷和绞股蓝皂苷的产量 | Gynostemma longipes中的皂苷生物合成相关基因和代谢物 | 代谢组学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS) | NA | 代谢物和基因表达数据 | 46种三萜类化合物在不同组织中被检测 |