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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2024-08-28 |
Engineering Light-Control in Biology
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.901300
PMID:35573251
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综述 | 本文综述了在生物学中利用工程技术创建和优化光调控蛋白的方法 | 探讨了通过蛋白质工程和合成生物学方法开发新型光遗传蛋白的创新策略 | 并非对光敏感调节剂的百科全书式总结,而是通过选定实例讨论光调控蛋白工程的重要方面 | 旨在讨论通过选定实例进行光调控蛋白工程的重要方面 | 光遗传蛋白的开发和优化 | 生物工程 | NA | 光遗传学 | NA | 蛋白质 | NA |
102 | 2024-08-28 |
Natural Composition and Biosynthetic Pathways of Alkaloids in Medicinal Dendrobium Species
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.850949
PMID:35599884
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综述 | 本文综述了药用石斛属植物中生物碱的自然组成及其生物合成途径 | 探讨了高通量测序技术在生物碱途径发现中的应用以及合成生物学在大规模生产生物碱中的应用 | NA | 深入研究生物碱的组成及其生物合成途径 | 石斛属植物中的生物碱 | NA | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组注释 | NA |
103 | 2024-08-27 |
Advanced Wound Diagnostics: Toward Transforming Wound Care into Precision Medicine
2022-06, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2020.1319
PMID:34128387
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综述 | 本文综述了先进的伤口诊断技术,包括生物标志物和成像系统,以及它们在将伤口护理转变为精准医学中的应用 | 介绍了多种生物标志物和成像技术,如蛋白酶、急性期反应物、挥发性排放物和超声、自体荧光、光谱成像及光学相干断层扫描等,这些技术正在改变我们对分子伤口环境的理解,并引入现代治疗策略 | 尽管已经识别出许多潜在的生物标志物并开发了多种成像系统,但仍需要更多高质量的随机对照试验来阐明这些工具在临床环境中改变愈合动态或预测伤口闭合的作用 | 推动伤口护理向精准医学转变,开发基于证据的方法,这些方法具有预测性、规定性和个性化 | 非愈合伤口的诊断和治疗 | NA | NA | 生物标志物检测和成像技术 | NA | 生物标志物数据和成像数据 | NA |
104 | 2024-08-27 |
Bottlenecks and opportunities for synthetic biology biosafety standards
2022-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29889-y
PMID:35449163
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
105 | 2024-08-27 |
A hierarchy of biomolecular proportional-integral-derivative feedback controllers for robust perfect adaptation and dynamic performance
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29640-7
PMID:35440114
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研究论文 | 本文探讨了通过生物分子反应实现比例-积分-微分(PID)控制器的方法,并提出了一系列在简单性和高性能之间取得平衡的拓扑结构。 | 本文首次展示了不同生物分子PI控制器的性能增强能力,并介绍了基于非一致前馈环的微分控制器,以及通过将分子积分器置于负反馈环中实现微分器的方法。 | NA | 研究如何通过生物分子反应实现PID控制器,以提高系统的稳定性和动态性能。 | 生物分子PID控制器的实现及其在合成生物学和网络遗传学领域的应用。 | 合成生物学 | NA | 生物分子反应 | PID控制器 | 生物分子 | 单个酵母细胞 |
106 | 2024-08-27 |
A Versatile Transcription Factor Biosensor System Responsive to Multiple Aromatic and Indole Inducers
2022-04-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00063
PMID:35316041
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研究论文 | 本文构建了一种基于TetR家族抑制子CmeR的变构转录因子(aTF)遗传回路,该回路作为水杨酸盐生物传感器在模型生物中发挥作用,并能响应多种芳香族和吲哚诱导物 | 本文展示了CmeR调控的启动子对多种芳香族和吲哚诱导物的响应能力,扩展了aTF生物传感器的应用范围 | NA | 开发多功能变构转录因子生物传感器系统,以促进代谢工程、生物技术和合成生物学中的应用 | 变构转录因子CmeR及其在微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
107 | 2024-08-27 |
Harnessing phosphonate antibiotics argolaphos biosynthesis enables a synthetic biology-based green synthesis of glyphosate
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29188-6
PMID:35365617
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research paper | 本文通过合成生物学方法优化了氨基甲基膦酸(AMP)的生产,并开发了一种将AMP转化为草甘膦的高效化学工艺 | 利用合成生物学策略提高了AMP的生产效率,并开发了一种新的化学转化工艺 | NA | 开发一种环保的草甘膦生产方法 | 氨基甲基膦酸(AMP)和草甘膦的生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 化学物质 | NA |
108 | 2024-08-27 |
Harnessing the Algal Chloroplast for Heterologous Protein Production
2022-Mar-30, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10040743
PMID:35456794
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综述 | 本文综述了利用藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主,并讨论了当前的技术工具和需要解决的技术瓶颈 | 藻类叶绿体因其基因组较小,成为合成生物学方法的理想目标,并可作为产品分隔积累和储存的便利亚细胞位点 | 需要解决的主要技术瓶颈包括开发稳健和可持续的绿色细胞生物工厂 | 探讨利用藻类叶绿体进行异源蛋白生产的技术现状和未来发展 | 藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
109 | 2024-08-27 |
Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis and Identification of Dammarenediol-II Synthase Involved in Saponin Biosynthesis in Gynostemma longipes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.852377
PMID:35401630
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学和转录组学分析,鉴定了参与Gynostemma longipes中皂苷生物合成的达玛烯二醇-II合酶 | 首次鉴定了新的达玛烯二醇-II合酶,并通过生物信息学分析、酵母表达实验和酶活性测定验证了其功能 | NA | 揭示达玛烯二醇-II的生物合成机制,以提高珍贵的人参皂苷和绞股蓝皂苷的产量 | Gynostemma longipes中的皂苷生物合成相关基因和代谢物 | 代谢组学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS) | NA | 代谢物和基因表达数据 | 46种三萜类化合物在不同组织中被检测 |
110 | 2024-08-26 |
Ultrasound-controllable engineered bacteria for cancer immunotherapy
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29065-2
PMID:35332124
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研究论文 | 本文开发了一种可通过聚焦超声控制的工程化细菌,用于癌症免疫治疗 | 利用聚焦超声非侵入性地控制工程化细菌在特定解剖部位(如实体肿瘤)释放治疗性负载,通过温度激活的遗传状态开关实现治疗输出 | 目前方法中,系统性给药的细菌在健康组织中也可能释放有害负载 | 开发一种新型的癌症免疫治疗方法,通过工程化细菌在肿瘤微环境中释放免疫检查点抑制剂 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 聚焦超声 | 遗传状态开关 | NA | NA |
111 | 2024-08-26 |
Using single-cell models to predict the functionality of synthetic circuits at the population scale
2022-03-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2114438119
PMID:35271387
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研究论文 | 本文展示了如何基于化学主方程的增强,获得同时跟踪单细胞和群体过程的多尺度随机动力学模型,以量化预测酵母光遗传分化系统的复杂群体动态 | 提出了基于化学主方程增强的多尺度随机动力学模型,能够同时跟踪单细胞和群体过程 | NA | 预测合成电路在群体规模上的功能性 | 单细胞模型在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 化学主方程 | 多尺度随机动力学模型 | NA | NA |
112 | 2024-08-26 |
Engineering microbial consortia of Elizabethkingia meningoseptica and Escherichia coli strains for the biosynthesis of vitamin K2
2022-Mar-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-022-01768-7
PMID:35279147
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研究论文 | 本研究报道了设计和优化Elizabethkingia meningoseptica和Escherichia coli共培养系统,以提高维生素K2的生物合成 | 通过共培养策略,成功提高了维生素K2的产量,并建立了进一步工程化MK-n的基础 | NA | 研究微生物共培养在代谢工程和合成生物学领域的应用 | Elizabethkingia meningoseptica和Escherichia coli菌株 | 代谢工程 | NA | 扫描电子显微镜, 共聚焦激光扫描显微镜, 流式细胞术 | NA | 微生物 | Elizabethkingia meningoseptica sp. F2和Escherichia coli共培养系统 |
113 | 2024-08-26 |
Penicillium chrysogenum, a Vintage Model with a Cutting-Edge Profile in Biotechnology
2022-Mar-06, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10030573
PMID:35336148
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综述 | 本文综述了青霉菌从发现青霉素到成为次级代谢产物生产和调控的模型生物的历史,以及其在合成生物学领域的最新进展 | 介绍了青霉菌在合成生物学领域的应用,以及如何利用分子工具进一步提高生产效率 | NA | 回顾青霉菌的历史,并更新其在次级代谢产物生产和调控方面的研究进展 | 青霉菌及其在工业生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 分子工具 | NA | NA | NA |
114 | 2024-08-26 |
Genome Sequencing and Analysis of Trichoderma (Hypocreaceae) Isolates Exhibiting Antagonistic Activity against the Papaya Dieback Pathogen, Erwinia mallotivora
2022-Feb-28, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof8030246
PMID:35330248
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研究论文 | 本研究分析了五株来自马来西亚的根际Trichoderma分离株对木瓜萎蔫病原体Erwinia mallotivora的拮抗活性,并通过牛津纳米孔和Illumina测序技术对其基因组进行了研究 | 首次揭示了Trichoderma分离株的基因组特征,并探讨了其潜在的次级代谢途径与其抗菌特性的关系 | NA | 探索Trichoderma分离株作为木瓜萎蔫病生物防治剂的潜力及其分子机制 | Trichoderma分离株的基因组及其对Erwinia mallotivora的拮抗活性 | NA | 木瓜萎蔫病 | 牛津纳米孔测序技术, Illumina测序技术 | NA | 基因组数据 | 三株Trichoderma分离株(UKM-M-UW RA5, UKM-M-UW RA6, UKM-M-UW RA3a) |
115 | 2024-08-26 |
From Sharks to Yeasts: Squalene in the Development of Vaccine Adjuvants
2022-Feb-22, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph15030265
PMID:35337064
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综述 | 本文综述了角鲨烯基疫苗佐剂增强免疫反应的生物机制,并比较了现有角鲨烯来源及其环境影响 | 提出使用基因工程微生物作为可持续的角鲨烯生产替代方案,有望成为未来制药级角鲨烯的唯一来源 | NA | 探讨角鲨烯在疫苗佐剂开发中的应用及其可持续生产方法 | 角鲨烯及其在疫苗佐剂中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
116 | 2024-08-26 |
Xanthopsin-Like Systems via Site-Specific Click-Functionalization of a Retinoic Acid Binding Protein
2022-01-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202100449
PMID:34647400
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研究论文 | 本文展示了利用Morita-Baylis-Hillman加合物进行位点特异性、不可逆和立体选择性的点击功能化,从而在疏水结合口袋中埋藏的赖氨酸残基上生成具有扩展π系统的不自然发色团,为体外合成类似黄视蛋白的细菌光感受器结构的人工蛋白质库提供了可能性。 | 本文引入了一种新的方法,通过位点特异性的点击功能化,扩展了人工蛋白质库的范围,使其类似于黄视蛋白的光感受器,并作为光遗传学和“分子实验室”工具。 | NA | 开发一种新的方法来准备光响应蛋白质系统,以扩展光遗传学和合成生物学的工具箱。 | 研究如何通过位点特异性的点击功能化方法,在蛋白质中引入不自然的发色团,以模拟黄视蛋白的光感受器结构。 | 合成生物学 | NA | 点击功能化 | NA | 蛋白质 | NA |
117 | 2024-08-26 |
Tracing back variations in archaeal ESCRT-based cell division to protein domain architectures
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0266395
PMID:35358274
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研究论文 | 本文通过生物信息学方法分析了古菌中ESCRT系统的蛋白质域结构,以探讨细胞分裂机制的进化 | 首次在蛋白质域水平上分析古菌ESCRT系统,揭示了至少三种不同的细胞分裂机制,并重建了ESCRT机制的进化历程 | 由于技术挑战,实验数据有限 | 探讨古菌和真核生物细胞分裂机制的进化关系 | 古菌中的ESCRT系统蛋白质 | 细胞生物学 | NA | 生物信息学分析 | NA | 蛋白质域数据 | NA |
118 | 2024-08-25 |
CRISPR-Cas gene editing technology and its application prospect in medicinal plants
2022-Mar-04, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-022-00584-w
PMID:35246186
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas基因编辑技术的发展历程、结构特征、工作机制及其最新衍生技术,并首次讨论了其在药用植物中的应用前景 | 首次讨论了CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用,并提出了该技术在药用植物基因编辑中的发展方向 | CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用仍处于早期阶段 | 探讨CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用,为药用植物的基因组功能研究、合成生物学、遗传改良和种质创新提供参考 | 药用植物 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
119 | 2024-08-25 |
Comparative analysis of genome code complexity and manufacturability with engineering benchmarks
2022-02-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-06723-5
PMID:35181687
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研究论文 | 本文通过比较自然基因组与现有工程基准的复杂性和可制造性,评估了合成生物学设计的实际限制 | 本文首次将自然基因组的复杂性与大型软件程序的规模进行比较,揭示了两者在复杂性上的相似性 | 文章未详细讨论合成生物学在实际应用中的具体挑战和解决方案 | 评估和比较自然基因组的复杂性与工程基准,探讨合成生物学设计的可行性 | 自然基因组的复杂性和可制造性 | NA | NA | NA | NA | 基因组序列 | 从几百万到超过1000亿个碱基对的不同自然基因组 |
120 | 2024-08-25 |
Viral protein instability enhances host-range evolvability
2022-02, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010030
PMID:35176040
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研究论文 | 研究病毒蛋白热稳定性如何影响其适应新受体的能力,从而影响宿主范围的进化 | 提出了蛋白质热稳定性与进化能力之间关系的新模型,并指出蛋白质不稳定性可能是预测病毒宿主范围进化的潜在指标 | 研究仅基于一种模型病毒(噬菌体λ),可能需要进一步研究以验证在其他病毒中的适用性 | 探讨病毒蛋白热稳定性对宿主范围进化的影响 | 噬菌体λ的宿主识别蛋白 | NA | NA | 定向进化和合成生物学技术 | NA | 蛋白质稳定性数据 | 多个稳定性不同的宿主识别蛋白变体 |