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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-07 |
Engineering CAR T cells for enhanced efficacy and safety
2022-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0073746
PMID:35071966
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法优化嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的最新进展,旨在提高其对实体瘤的疗效和安全性 | 讨论了CAR和其他非CAR分子的改进策略,以及可由环境信号和/或外部刺激控制的诱导型CAR T细胞的开发 | NA | 提高CAR T细胞疗法的疗效和安全性,特别是针对实体瘤 | CAR T细胞疗法的优化策略 | 生物技术 | 血液恶性肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
142 | 2024-08-07 |
Temporal signaling, population control, and information processing through chromatin-mediated gene regulation
2022-02-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2021.110977
PMID:34919934
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研究论文 | 本文构建了一个数学框架,用于分析含有染色质调节因子的遗传电路对哺乳动物细胞群体中时间信号的响应 | 展示了染色质介导的基因控制能够实现复杂的细胞群体对时间信号的响应,并且能够传输比先前测量在基因调节中更高的信息水平 | NA | 研究染色质调节在细胞对时间刺激响应中的作用,并探索其在合成生物学应用中的潜力 | 染色质调节因子在遗传电路中的作用及其对时间信号的响应 | 合成生物学 | NA | 数学建模 | NA | 时间序列数据 | 哺乳动物细胞群体 |
143 | 2024-08-07 |
Lipid membranes modulate the activity of RNA through sequence-dependent interactions
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119235119
PMID:35042820
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研究论文 | 本文研究了脂质膜如何通过序列依赖性相互作用调节RNA的活性 | 首次展示了脂质膜作为RNA组织平台的机制,并介绍了RNA-脂质相互作用作为开发合成核糖开关和基于RNA的脂质生物传感器的新工具 | NA | 阐明RNA生物活性的控制机制,以及其在生理角色和合成生物学中的潜在应用 | RNA与脂质膜的相互作用及其对RNA活性的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
144 | 2024-08-07 |
Making Sense of "Nonsense" and More: Challenges and Opportunities in the Genetic Code Expansion, in the World of tRNA Modifications
2022-Jan-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020938
PMID:35055121
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展(GCE)在增强蛋白质结构特性和功能方面的最新进展,并讨论了tRNA修饰和代谢在蛋白质设计中的新兴影响 | 遗传密码扩展通过引入非规范氨基酸(ncAAs),增强了蛋白质的功能性和结构特性,为生物化学、生物物理和细胞研究提供了广泛的应用潜力 | 不同的中介因素降低了非规范氨基酸在合成蛋白质中的掺入产量和效率 | 探讨遗传密码扩展在提高非规范氨基酸掺入效率中的相关性和系统生物学的作用 | 遗传密码扩展技术及其在蛋白质设计和合成蛋白治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
145 | 2024-08-07 |
The Systems and Synthetic Biology of Auxin
2022-01-04, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a040071
PMID:34127446
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研究论文 | 本文综述了生长素生物学领域在解析植物生长网络结构、动态和控制方面的进展,强调了系统生物学和合成生物学方法的结合 | 通过结合系统生物学和合成生物学的互补方法,推动了对生长素控制植物生长、发育和生理的理解和工程化 | NA | 探讨生长素生物学领域的发展,并强调系统生物学和合成生物学方法的结合 | 生长素的生物学机制及其在植物生长和发育中的作用 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
146 | 2024-08-07 |
Reprogramming Stars #8: A Synthetic Biology Approach to Cellular Reprogramming-An Interview with Dr. Katie Galloway
2022-08, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.29068.kg
PMID:35900269
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
147 | 2024-08-07 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the food and feed risk assessment of genetically modified plants obtained through synthetic biology
2022-Jul, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2022.7410
PMID:35873722
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研究论文 | 评估现有指南对于通过合成生物学获得的转基因植物在食品和饲料风险评估中的充分性和充足性 | 未发现通过当前和近未来合成生物学方法获得的转基因植物食品和饲料可能带来的新型潜在危害和风险 | 现有指南在某些合成生物学应用中可能仅是充分的,因此需要更新,特别是与新蛋白质的安全评估和比较分析相关的领域 | 评估合成生物学在农业食品中的发展,并确定现有风险评估指南的充分性和充足性 | 通过合成生物学获得的转基因植物的食品和饲料风险评估 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
148 | 2024-08-07 |
Manufacturing polymeric porous capsules
2022-Apr-05, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d1cc06565c
PMID:35298578
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综述 | 本文综述了制造聚合物多孔胶囊的主要策略,并提供了设计具有可控孔径的聚合物胶囊的实用指导 | NA | NA | 探讨聚合物多孔胶囊的制造方法及其在多个领域的应用潜力 | 聚合物多孔胶囊的制造技术和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
149 | 2024-08-07 |
Vesicle-based artificial cells: materials, construction methods and applications
2022-03-07, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d1mh01431e
PMID:34908080
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综述 | 本文综述了基于囊泡的人工细胞的材料选择、构建方法及其应用 | 探讨了人工细胞的设计及其在模拟细胞行为和信号传导过程中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 探索复杂的生物过程和细胞功能,并提供对生命起源的见解 | 人工细胞的材料、构建方法及其应用 | NA | NA | 温和水合、电形成、相转移和微流控方法 | NA | NA | NA |
150 | 2024-08-07 |
The geometry of life: when mathematics meets synthetic biology
2022-Aug-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/d41586-022-02176-y
PMID:35953574
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
151 | 2024-08-07 |
An Account of Models of Molecular Circuits for Associative Learning with Reinforcement Effect and Forced Dissociation
2022-Aug-07, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s22155907
PMID:35957464
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研究论文 | 本文对Fernando的模型进行了深入的计算分析,并展示了通过选择适当的参数值可以实现强化效应,同时构建了一个新的电路以展示在Fernando模型中未观察到的强制解离现象。 | 本文构建了一个新的电路以展示强制解离现象,这是在Fernando模型中未观察到的。 | NA | 理解分子电路层面的联想学习形成机制 | 基因调控网络的设计与研究 | 合成生物学 | NA | Hill方程 | NA | NA | NA |
152 | 2024-08-07 |
Triggered Assembly of a DNA-Based Membrane Channel
2022-03-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06598
PMID:35253434
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研究论文 | 本文利用定义明确的DNA模块,合理设计了一种可触发的合成纳米孔,该纳米孔集成了生物膜蛋白的多种功能。 | 通过分子识别结合可溶性触发器,改变纳米孔组件的结构和膜位置,从而控制其组装成定义明确的通道,实现高效的跨膜货物运输。 | NA | 研究DNA组装在膜界面处的动力学和结构动态特性,并推动功能性DNA纳米技术和合成生物学的发展。 | DNA纳米孔及其在跨膜货物运输中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
153 | 2024-08-07 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VaLiAnT的工具,用于设计和注释用于饱和基因组编辑和其他深度突变扫描实验的寡核苷酸文库 | VaLiAnT提供了一种新颖的方式来检索、突变和注释基因组序列,以生成寡核苷酸文库,并支持cDNA和prime编辑饱和文库生成 | NA | 开发一种工具,用于生成和注释用于饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库 | 寡核苷酸文库的设计和注释 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因组序列 | 用户定义的基因组坐标范围 |
154 | 2024-08-07 |
Engineering Cancer Selective Virotherapies: Are the Pieces of the Puzzle Falling into Place?
2022-11, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2022.178
PMID:36178346
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综述 | 本文综述了利用病毒载体针对人类癌症的基因治疗策略,包括新型衣壳、合成启动子和治疗载荷的开发 | 结合新型衣壳和启动子以及基于免疫疗法的载荷,旨在开发创新的癌症基因治疗方法 | NA | 探讨如何通过精确工程化的病毒靶向肿瘤细胞生物学的不同方面,同时不损害正常组织和器官功能 | 病毒载体在细胞外在和内在水平的癌症选择性工程化 | NA | 癌症 | 基因治疗、合成生物学、癌症基因组学 | NA | 细胞模型、器官模型 | 使用患者来源的细胞培养和类器官进行疾病相关模型的快速筛选和分类 |
155 | 2024-08-07 |
In Vitro Synthesis and Reconstitution Using Mammalian Cell-Free Lysates Enables the Systematic Study of the Regulation of LINC Complex Assembly
2022-07-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00118
PMID:35737522
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研究论文 | 本文介绍了一种基于HeLa细胞的无细胞表达系统,用于研究膜蛋白的结构和功能关系,特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 开发了一种新的无细胞表达系统,能够高效重组全长膜蛋白,并研究其在支持脂双层中的相互作用 | 该平台不能替代基于细胞的研究,但在难以研究的膜蛋白生物学机制方面提供了重要见解 | 研究膜蛋白的结构和功能关系,特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 全长膜蛋白,特别是SUN1和SUN2蛋白及其与KASH蛋白的相互作用 | 生物医学研究 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 膜蛋白 | NA |
156 | 2024-08-07 |
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
2022-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31421-1
PMID:35773252
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研究论文 | 本文升级了GECKO工具箱,以增强任何具有兼容GEM重建的生物体的酶和蛋白质组学约束模型,并生成了几种酵母的酶约束模型,以研究它们对多种应激因子的长期适应 | 引入了自动化框架,用于酶约束GEM的连续和版本控制更新,并扩展了GECKO的功能 | NA | 研究微生物在应激和营养限制条件下的生长,以及代谢鲁棒性与蛋白质利用最优性之间的关系 | 酵母菌属的Saccharomyces cerevisiae、Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus,以及大肠杆菌和人类 | 代谢工程 | NA | GECKO 2.0 | GEM(基因组规模代谢模型) | 蛋白质组学数据 | 涉及多种酵母菌和大肠杆菌及人类 |
157 | 2024-08-07 |
Overcoming Leak Sensitivity in CRISPRi Circuits Using Antisense RNA Sequestration and Regulatory Feedback
2022-Sep-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00155
PMID:36017994
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研究论文 | 本文介绍了一种通过使用反义RNA(asRNA)捕获gRNA转录本以及CRISPRi反馈来自我调节asRNA生产的机制,以抑制CRISPRi的不必要抑制并提高基因电路功能 | 利用asRNA和CRISPRi反馈机制,有效减少了CRISPRi电路中的泄漏敏感性和反向效应,特别是在静态表达期间 | NA | 改进CRISPRi逆变器在复杂遗传电路中的应用,同时保持dCas蛋白的可编程性和正交性 | CRISPRi电路的性能和逻辑功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 基因表达数据 | NA |
158 | 2024-08-07 |
Utilizing RNA origami scaffolds in Saccharomyces cerevisiae for dCas9-mediated transcriptional control
2022-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac470
PMID:35648481
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研究论文 | 研究利用RNA折纸支架在酵母中通过dCas9介导的转录调控 | 首次探讨了单引导RNA与RNA折纸支架融合体(sgRNAO)在酵母中调控基因表达的能力,并展示了不同适配子位置和支架方向对转录激活的影响 | 尚未完全理解支架上多个适配子的定位及其方向对功能特性的影响 | 研究RNA折纸支架在酵母中的应用,特别是通过CRISPR-dCas9系统进行基因表达调控 | RNA折纸支架、单引导RNA、酵母 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | CRISPR-dCas9 | RNA | NA |
159 | 2024-08-07 |
Design of Multiplexing CRISPR/Cas9 Constructs for Plant Genome Engineering Using the GoldenBraid DNA Assembly Standard
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1791-5_2
PMID:35188654
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研究论文 | 本文介绍了如何使用GoldenBraid DNA组装系统设计多重CRISPR/Cas9构建体,用于植物基因组工程 | 首次展示了使用GoldenBraid系统进行多重CRISPR/Cas9构建体的设计和应用 | NA | 探索CRISPR/Cas9技术在植物基因组工程中的应用 | 植物基因组 | 基因组工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 涉及烟草(Nicotiana benthamiana)叶片样本 |
160 | 2024-08-07 |
The sound of silence: Transgene silencing in mammalian cell engineering
2022-12-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.11.005
PMID:36549273
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综述 | 本文综述了转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的挑战,探讨了沉默的分子机制及预防方法,并展望了未来研究方向 | NA | NA | 阐明转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的原理和挑战 | 转基因沉默现象及其对细胞工程的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |