合成生物学相关文章
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当前共找到 166 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-07 |
Vesicle-based artificial cells: materials, construction methods and applications
2022-03-07, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d1mh01431e
PMID:34908080
|
综述 | 本文综述了基于囊泡的人工细胞的材料选择、构建方法及其应用 | 探讨了人工细胞的设计及其在模拟细胞行为和信号传导过程中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 探索复杂的生物过程和细胞功能，并提供对生命起源的见解 | 人工细胞的材料、构建方法及其应用 | NA | NA | 温和水合、电形成、相转移和微流控方法 | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-07 |
The geometry of life: when mathematics meets synthetic biology
2022-Aug-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/d41586-022-02176-y
PMID:35953574
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-07 |
An Account of Models of Molecular Circuits for Associative Learning with Reinforcement Effect and Forced Dissociation
2022-Aug-07, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s22155907
PMID:35957464
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研究论文 | 本文对Fernando的模型进行了深入的计算分析，并展示了通过选择适当的参数值可以实现强化效应，同时构建了一个新的电路以展示在Fernando模型中未观察到的强制解离现象。 | 本文构建了一个新的电路以展示强制解离现象，这是在Fernando模型中未观察到的。 | NA | 理解分子电路层面的联想学习形成机制 | 基因调控网络的设计与研究 | 合成生物学 | NA | Hill方程 | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-07 |
Triggered Assembly of a DNA-Based Membrane Channel
2022-03-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06598
PMID:35253434
|
研究论文 | 本文利用定义明确的DNA模块，合理设计了一种可触发的合成纳米孔，该纳米孔集成了生物膜蛋白的多种功能。 | 通过分子识别结合可溶性触发器，改变纳米孔组件的结构和膜位置，从而控制其组装成定义明确的通道，实现高效的跨膜货物运输。 | NA | 研究DNA组装在膜界面处的动力学和结构动态特性，并推动功能性DNA纳米技术和合成生物学的发展。 | DNA纳米孔及其在跨膜货物运输中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-07 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VaLiAnT的工具，用于设计和注释用于饱和基因组编辑和其他深度突变扫描实验的寡核苷酸文库 | VaLiAnT提供了一种新颖的方式来检索、突变和注释基因组序列，以生成寡核苷酸文库，并支持cDNA和prime编辑饱和文库生成 | NA | 开发一种工具，用于生成和注释用于饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库 | 寡核苷酸文库的设计和注释 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因组序列 | 用户定义的基因组坐标范围 |
| 146 | 2024-08-07 |
Engineering Cancer Selective Virotherapies: Are the Pieces of the Puzzle Falling into Place?
2022-11, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2022.178
PMID:36178346
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综述 | 本文综述了利用病毒载体针对人类癌症的基因治疗策略，包括新型衣壳、合成启动子和治疗载荷的开发 | 结合新型衣壳和启动子以及基于免疫疗法的载荷，旨在开发创新的癌症基因治疗方法 | NA | 探讨如何通过精确工程化的病毒靶向肿瘤细胞生物学的不同方面，同时不损害正常组织和器官功能 | 病毒载体在细胞外在和内在水平的癌症选择性工程化 | NA | 癌症 | 基因治疗、合成生物学、癌症基因组学 | NA | 细胞模型、器官模型 | 使用患者来源的细胞培养和类器官进行疾病相关模型的快速筛选和分类 |
| 147 | 2024-08-07 |
In Vitro Synthesis and Reconstitution Using Mammalian Cell-Free Lysates Enables the Systematic Study of the Regulation of LINC Complex Assembly
2022-07-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00118
PMID:35737522
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研究论文 | 本文介绍了一种基于HeLa细胞的无细胞表达系统，用于研究膜蛋白的结构和功能关系，特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 开发了一种新的无细胞表达系统，能够高效重组全长膜蛋白，并研究其在支持脂双层中的相互作用 | 该平台不能替代基于细胞的研究，但在难以研究的膜蛋白生物学机制方面提供了重要见解 | 研究膜蛋白的结构和功能关系，特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 全长膜蛋白，特别是SUN1和SUN2蛋白及其与KASH蛋白的相互作用 | 生物医学研究 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 膜蛋白 | NA |
| 148 | 2024-08-07 |
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
2022-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31421-1
PMID:35773252
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研究论文 | 本文升级了GECKO工具箱，以增强任何具有兼容GEM重建的生物体的酶和蛋白质组学约束模型，并生成了几种酵母的酶约束模型，以研究它们对多种应激因子的长期适应 | 引入了自动化框架，用于酶约束GEM的连续和版本控制更新，并扩展了GECKO的功能 | NA | 研究微生物在应激和营养限制条件下的生长，以及代谢鲁棒性与蛋白质利用最优性之间的关系 | 酵母菌属的Saccharomyces cerevisiae、Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus，以及大肠杆菌和人类 | 代谢工程 | NA | GECKO 2.0 | GEM（基因组规模代谢模型） | 蛋白质组学数据 | 涉及多种酵母菌和大肠杆菌及人类 |
| 149 | 2024-08-07 |
Overcoming Leak Sensitivity in CRISPRi Circuits Using Antisense RNA Sequestration and Regulatory Feedback
2022-Sep-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00155
PMID:36017994
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研究论文 | 本文介绍了一种通过使用反义RNA（asRNA）捕获gRNA转录本以及CRISPRi反馈来自我调节asRNA生产的机制，以抑制CRISPRi的不必要抑制并提高基因电路功能 | 利用asRNA和CRISPRi反馈机制，有效减少了CRISPRi电路中的泄漏敏感性和反向效应，特别是在静态表达期间 | NA | 改进CRISPRi逆变器在复杂遗传电路中的应用，同时保持dCas蛋白的可编程性和正交性 | CRISPRi电路的性能和逻辑功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Utilizing RNA origami scaffolds in Saccharomyces cerevisiae for dCas9-mediated transcriptional control
2022-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac470
PMID:35648481
|
研究论文 | 研究利用RNA折纸支架在酵母中通过dCas9介导的转录调控 | 首次探讨了单引导RNA与RNA折纸支架融合体（sgRNAO）在酵母中调控基因表达的能力，并展示了不同适配子位置和支架方向对转录激活的影响 | 尚未完全理解支架上多个适配子的定位及其方向对功能特性的影响 | 研究RNA折纸支架在酵母中的应用，特别是通过CRISPR-dCas9系统进行基因表达调控 | RNA折纸支架、单引导RNA、酵母 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | CRISPR-dCas9 | RNA | NA |
| 151 | 2024-08-07 |
Design of Multiplexing CRISPR/Cas9 Constructs for Plant Genome Engineering Using the GoldenBraid DNA Assembly Standard
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1791-5_2
PMID:35188654
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研究论文 | 本文介绍了如何使用GoldenBraid DNA组装系统设计多重CRISPR/Cas9构建体，用于植物基因组工程 | 首次展示了使用GoldenBraid系统进行多重CRISPR/Cas9构建体的设计和应用 | NA | 探索CRISPR/Cas9技术在植物基因组工程中的应用 | 植物基因组 | 基因组工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 涉及烟草（Nicotiana benthamiana）叶片样本 |
| 152 | 2024-08-07 |
The sound of silence: Transgene silencing in mammalian cell engineering
2022-12-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.11.005
PMID:36549273
|
综述 | 本文综述了转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的挑战，探讨了沉默的分子机制及预防方法，并展望了未来研究方向 | NA | NA | 阐明转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的原理和挑战 | 转基因沉默现象及其对细胞工程的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-07 |
Discovery, Structure, and Mechanism of a Class II Sesquiterpene Cyclase
2022-12-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09412
PMID:36416740
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研究论文 | 本文报道了从基因组挖掘中发现并结构表征了两类II型倍半萜环化酶（STCs），这些drimenyl二磷酸合酶（DMSs）是首次被证明具有β,γ-双域结构的STCs。 | 本研究首次揭示了II型倍半萜环化酶的结构和机制细节，特别是通过高分辨率X射线晶体结构展示了DMS与法呢基二磷酸和镁的复合物，揭示了一种前所未有的镁结合模式。 | NA | 研究目的是揭示II型倍半萜环化酶的结构和机制，为环化酶工程和合成生物学提供新的机制见解。 | 研究对象是两类II型倍半萜环化酶（STCs）及其结构和机制。 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 两类II型倍半萜环化酶（STCs） |
| 154 | 2024-08-07 |
Detection and validation of cis-regulatory motifs in osmotic stress-inducible synthetic gene switches via computational and experimental approaches
2022-11, Functional plant biology : FPB
IF:2.6Q2
DOI:10.1071/FP21314
PMID:35940614
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研究论文 | 本文通过计算和实验方法，研究了在渗透胁迫诱导的合成基因开关中cis调控基序的检测和验证 | 发现了与已知cis元件相似但尚未涉及干旱响应的新型cis调控基序，并设计了合成启动子以提高作物对干旱胁迫的耐受性 | NA | 研究合成cis调控模块以加深对基因调控网络的理解，并提高作物对干旱胁迫的耐受性 | 大豆和拟南芥的干旱诱导基因及其cis调控基序 | 合成生物学 | NA | 结合使用计算工具（BEST）和实验方法 | NA | 基因序列 | 181个干旱诱导的不同表达大豆基因，以及转基因大豆幼苗和3周龄的转基因拟南芥植物 |
| 155 | 2024-08-07 |
Construction of 5-aminolevulinic acid synthase variants by cysteine-targeted mutation to release heme inhibition
2022-Nov, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2022.07.019
PMID:36089467
|
研究论文 | 本文通过半胱氨酸靶向突变构建了5-氨基乙酰丙酸合酶变体，以解除血红素抑制 | 通过半胱氨酸靶向突变策略，成功提高了5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除了血红素抑制 | NA | 研究如何通过突变提高5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除血红素抑制 | 5-氨基乙酰丙酸合酶及其在生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症, 冠状病毒病2019 (COVID-19), 代谢疾病 | 半胱氨酸靶向突变 | NA | 酶活性数据 | 两种来源的5-氨基乙酰丙酸合酶及其八个变体 |
| 156 | 2024-08-07 |
Synthetic biology-instructed transdermal microneedle patch for traceable photodynamic therapy
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33837-1
PMID:36266306
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法构建了一种透皮治疗诊断微针贴片，该贴片集成了5-氨基乙酰丙酸和过氧化氢酶共载的肿瘤酸度响应性铜掺杂磷酸钙纳米粒子，用于提高5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗效率。 | 通过合成生物学方法，实现了肿瘤内原卟啉IX的富集最大化，并通过过氧化氢酶在体内的持续氧气生成，逆转肿瘤缺氧，增强原卟啉IX的积累。 | NA | 优化5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的参数，实现对不同癌症的重复性光动力治疗。 | 5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的效果及肿瘤内原卟啉IX的代谢动力学。 | 生物技术 | NA | 光动力治疗 | NA | 荧光/光声双模态成像 | NA |
| 157 | 2024-08-07 |
Natural variation meets synthetic biology: Promiscuous trichome-expressed acyltransferases from Nicotiana
2022-08-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiac192
PMID:35477794
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研究论文 | 本研究通过转录组学引导的酶发现和体内外分析，探索了烟草属中腺毛表达的酰基转移酶在酰基糖合成中的多样性和机制 | 发现了烟草属中超过300种独特的酰基糖，并揭示了酰基转移酶在酰基供体和酰基受体选择性上的多变性，为合成生物学工具的开发提供了新思路 | NA | 深入理解烟草属中酰基糖的多样性和合成机制 | 烟草属中的腺毛提取物和酰基转移酶 | 生物技术 | NA | 转录组学，液相色谱-质谱联用 | NA | 转录组数据，代谢物 | 涉及烟草属中多个物种的腺毛提取物和酰基转移酶 |
| 158 | 2024-08-07 |
Building the Plant SynBio Toolbox through Combinatorial Analysis of DNA Regulatory Elements
2022-08-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00147
PMID:35901078
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研究论文 | 本文通过组合分析DNA调控元件，设计、构建并测试了91个转基因盒，用于评估植物中的相对表达强度。 | 本文首次在植物中进行了调控元件的组合分析，并建立了一个包含37个成员的植物调控元件库，为植物精准代谢工程的构建设计标准化提供了必要数据。 | 文章未提及具体的局限性。 | 旨在扩展植物合成生物学工具箱，通过组合分析DNA调控元件来优化转基因植物的设计和构建。 | 研究对象包括91个转基因盒和37个植物调控元件。 | 合成生物学 | NA | 转基因技术 | NA | 表达数据 | 91个转基因盒，37个植物调控元件 |
| 159 | 2024-08-07 |
Manufacturing specialized wax esters in plants
2022-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2022.05.005
PMID:35598886
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研究论文 | 本研究探讨了通过在烟草叶片中瞬时表达不同组合的基因来实现植物内合成特定应用的蜡酯的可能性 | 成功在植物中合成具有工业重要性的类似鲸蜡蜡酯，并捕获了结构类似于蛾信息素化合物的非饱和脂肪酸和脂肪酸酯 | 识别了可能的积累瓶颈，需要进一步稳定转化以积累特定蜡酯 | 探索在植物中合成特定应用的蜡酯的可能性 | 烟草叶片中的蜡酯合成 | NA | NA | 瞬时基因表达 | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-07 |
High-Throughput Transfection and Analysis of Soybean (Glycine max ) Protoplasts
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2164-6_17
PMID:35258837
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研究论文 | 本文描述了一种优化的方法，用于制备大豆暗培养细胞悬浮液，随后进行原生质体分离、自动化转染及后续筛选 | 本文引入了低成本食品级酶用于细胞壁消化和聚乙二醇（PEG）介导的转染，使原生质体特别适合自动化和高通量筛选 | NA | 开发基于植物的系统，以有效加快设计-构建-测试循环的速度，筛选大量合成构建体 | 大豆（Glycine max）原生质体 | 合成生物学 | NA | 聚乙二醇（PEG）介导的转染 | NA | 细胞悬浮液 | NA |