合成生物学相关文章
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当前共找到 178 篇文献，本页显示第 161 - 178 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Overcoming Leak Sensitivity in CRISPRi Circuits Using Antisense RNA Sequestration and Regulatory Feedback
2022-Sep-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00155
PMID:36017994
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研究论文 | 本文介绍了一种通过使用反义RNA（asRNA）捕获gRNA转录本以及CRISPRi反馈来自我调节asRNA生产的机制，以抑制CRISPRi的不必要抑制并提高基因电路功能 | 利用asRNA和CRISPRi反馈机制，有效减少了CRISPRi电路中的泄漏敏感性和反向效应，特别是在静态表达期间 | NA | 改进CRISPRi逆变器在复杂遗传电路中的应用，同时保持dCas蛋白的可编程性和正交性 | CRISPRi电路的性能和逻辑功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-07 |
Utilizing RNA origami scaffolds in Saccharomyces cerevisiae for dCas9-mediated transcriptional control
2022-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac470
PMID:35648481
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研究论文 | 研究利用RNA折纸支架在酵母中通过dCas9介导的转录调控 | 首次探讨了单引导RNA与RNA折纸支架融合体（sgRNAO）在酵母中调控基因表达的能力，并展示了不同适配子位置和支架方向对转录激活的影响 | 尚未完全理解支架上多个适配子的定位及其方向对功能特性的影响 | 研究RNA折纸支架在酵母中的应用，特别是通过CRISPR-dCas9系统进行基因表达调控 | RNA折纸支架、单引导RNA、酵母 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | CRISPR-dCas9 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-07 |
Design of Multiplexing CRISPR/Cas9 Constructs for Plant Genome Engineering Using the GoldenBraid DNA Assembly Standard
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1791-5_2
PMID:35188654
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研究论文 | 本文介绍了如何使用GoldenBraid DNA组装系统设计多重CRISPR/Cas9构建体，用于植物基因组工程 | 首次展示了使用GoldenBraid系统进行多重CRISPR/Cas9构建体的设计和应用 | NA | 探索CRISPR/Cas9技术在植物基因组工程中的应用 | 植物基因组 | 基因组工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 涉及烟草（Nicotiana benthamiana）叶片样本 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
The sound of silence: Transgene silencing in mammalian cell engineering
2022-12-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.11.005
PMID:36549273
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综述 | 本文综述了转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的挑战，探讨了沉默的分子机制及预防方法，并展望了未来研究方向 | NA | NA | 阐明转基因沉默在哺乳动物细胞工程中的原理和挑战 | 转基因沉默现象及其对细胞工程的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-07 |
Discovery, Structure, and Mechanism of a Class II Sesquiterpene Cyclase
2022-12-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09412
PMID:36416740
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研究论文 | 本文报道了从基因组挖掘中发现并结构表征了两类II型倍半萜环化酶（STCs），这些drimenyl二磷酸合酶（DMSs）是首次被证明具有β,γ-双域结构的STCs。 | 本研究首次揭示了II型倍半萜环化酶的结构和机制细节，特别是通过高分辨率X射线晶体结构展示了DMS与法呢基二磷酸和镁的复合物，揭示了一种前所未有的镁结合模式。 | NA | 研究目的是揭示II型倍半萜环化酶的结构和机制，为环化酶工程和合成生物学提供新的机制见解。 | 研究对象是两类II型倍半萜环化酶（STCs）及其结构和机制。 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 两类II型倍半萜环化酶（STCs） | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
Detection and validation of cis-regulatory motifs in osmotic stress-inducible synthetic gene switches via computational and experimental approaches
2022-11, Functional plant biology : FPB
IF:2.6Q2
DOI:10.1071/FP21314
PMID:35940614
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研究论文 | 本文通过计算和实验方法，研究了在渗透胁迫诱导的合成基因开关中cis调控基序的检测和验证 | 发现了与已知cis元件相似但尚未涉及干旱响应的新型cis调控基序，并设计了合成启动子以提高作物对干旱胁迫的耐受性 | NA | 研究合成cis调控模块以加深对基因调控网络的理解，并提高作物对干旱胁迫的耐受性 | 大豆和拟南芥的干旱诱导基因及其cis调控基序 | 合成生物学 | NA | 结合使用计算工具（BEST）和实验方法 | NA | 基因序列 | 181个干旱诱导的不同表达大豆基因，以及转基因大豆幼苗和3周龄的转基因拟南芥植物 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-07 |
Construction of 5-aminolevulinic acid synthase variants by cysteine-targeted mutation to release heme inhibition
2022-Nov, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2022.07.019
PMID:36089467
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研究论文 | 本文通过半胱氨酸靶向突变构建了5-氨基乙酰丙酸合酶变体，以解除血红素抑制 | 通过半胱氨酸靶向突变策略，成功提高了5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除了血红素抑制 | NA | 研究如何通过突变提高5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除血红素抑制 | 5-氨基乙酰丙酸合酶及其在生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症, 冠状病毒病2019 (COVID-19), 代谢疾病 | 半胱氨酸靶向突变 | NA | 酶活性数据 | 两种来源的5-氨基乙酰丙酸合酶及其八个变体 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Synthetic biology-instructed transdermal microneedle patch for traceable photodynamic therapy
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33837-1
PMID:36266306
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法构建了一种透皮治疗诊断微针贴片，该贴片集成了5-氨基乙酰丙酸和过氧化氢酶共载的肿瘤酸度响应性铜掺杂磷酸钙纳米粒子，用于提高5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗效率。 | 通过合成生物学方法，实现了肿瘤内原卟啉IX的富集最大化，并通过过氧化氢酶在体内的持续氧气生成，逆转肿瘤缺氧，增强原卟啉IX的积累。 | NA | 优化5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的参数，实现对不同癌症的重复性光动力治疗。 | 5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的效果及肿瘤内原卟啉IX的代谢动力学。 | 生物技术 | NA | 光动力治疗 | NA | 荧光/光声双模态成像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-07 |
Natural variation meets synthetic biology: Promiscuous trichome-expressed acyltransferases from Nicotiana
2022-08-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiac192
PMID:35477794
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研究论文 | 本研究通过转录组学引导的酶发现和体内外分析，探索了烟草属中腺毛表达的酰基转移酶在酰基糖合成中的多样性和机制 | 发现了烟草属中超过300种独特的酰基糖，并揭示了酰基转移酶在酰基供体和酰基受体选择性上的多变性，为合成生物学工具的开发提供了新思路 | NA | 深入理解烟草属中酰基糖的多样性和合成机制 | 烟草属中的腺毛提取物和酰基转移酶 | 生物技术 | NA | 转录组学，液相色谱-质谱联用 | NA | 转录组数据，代谢物 | 涉及烟草属中多个物种的腺毛提取物和酰基转移酶 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-07 |
Building the Plant SynBio Toolbox through Combinatorial Analysis of DNA Regulatory Elements
2022-08-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00147
PMID:35901078
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研究论文 | 本文通过组合分析DNA调控元件，设计、构建并测试了91个转基因盒，用于评估植物中的相对表达强度。 | 本文首次在植物中进行了调控元件的组合分析，并建立了一个包含37个成员的植物调控元件库，为植物精准代谢工程的构建设计标准化提供了必要数据。 | 文章未提及具体的局限性。 | 旨在扩展植物合成生物学工具箱，通过组合分析DNA调控元件来优化转基因植物的设计和构建。 | 研究对象包括91个转基因盒和37个植物调控元件。 | 合成生物学 | NA | 转基因技术 | NA | 表达数据 | 91个转基因盒，37个植物调控元件 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Manufacturing specialized wax esters in plants
2022-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2022.05.005
PMID:35598886
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研究论文 | 本研究探讨了通过在烟草叶片中瞬时表达不同组合的基因来实现植物内合成特定应用的蜡酯的可能性 | 成功在植物中合成具有工业重要性的类似鲸蜡蜡酯，并捕获了结构类似于蛾信息素化合物的非饱和脂肪酸和脂肪酸酯 | 识别了可能的积累瓶颈，需要进一步稳定转化以积累特定蜡酯 | 探索在植物中合成特定应用的蜡酯的可能性 | 烟草叶片中的蜡酯合成 | NA | NA | 瞬时基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-07 |
High-Throughput Transfection and Analysis of Soybean (Glycine max ) Protoplasts
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2164-6_17
PMID:35258837
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研究论文 | 本文描述了一种优化的方法，用于制备大豆暗培养细胞悬浮液，随后进行原生质体分离、自动化转染及后续筛选 | 本文引入了低成本食品级酶用于细胞壁消化和聚乙二醇（PEG）介导的转染，使原生质体特别适合自动化和高通量筛选 | NA | 开发基于植物的系统，以有效加快设计-构建-测试循环的速度，筛选大量合成构建体 | 大豆（Glycine max）原生质体 | 合成生物学 | NA | 聚乙二醇（PEG）介导的转染 | NA | 细胞悬浮液 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-07 |
An in vivo plant platform to assess genes encoding native and synthetic enzymes for carotenoid biosynthesis
2022, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2022.03.005
PMID:35878991
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研究论文 | 本文介绍了如何在植物体内评估编码天然和合成酶的基因，用于类胡萝卜素生物合成 | 提供了在植物体内表达候选或改造酶的详细步骤，并使用高效液相色谱法（HPLC）和脉冲振幅调制（PAM）荧光测量法评估酶活性 | NA | 研究如何利用植物平台测试编码类胡萝卜素生物合成酶的候选基因及其合成生物学应用 | 编码类胡萝卜素生物合成酶的候选基因及其工程化酶版本 | 合成生物学 | NA | 高效液相色谱法（HPLC），脉冲振幅调制（PAM）荧光测量法 | NA | 植物组织 | 涉及烟草（Nicotiana benthamiana）叶片组织 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-07 |
De Novo Biosynthesis of Vindoline and Catharanthine in Saccharomyces cerevisiae
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0002
PMID:37905202
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法在酵母中从头合成文多灵和长春花碱，这两种物质可以化学或生物学方式结合成长春碱 | 文多灵生物合成途径是迄今为止在微生物细胞工厂中重建的最复杂的途径之一 | NA | 开发一种可靠且成本效益高的方法来生产长春碱 | 文多灵和长春花碱的生物合成 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | 酵母菌株能够生产长春花碱和文多灵，产量分别为527.1和305.1 μg·liter | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
iGEM 2021: A Year in Review
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794609
PMID:37850126
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综述 | 本文回顾了2021年国际遗传工程机器基金会（iGEM）在合成生物学教育方面的进展，总结了该年度竞赛的成果和项目特点 | NA | NA | 回顾和总结2021年iGEM竞赛的成果，并探讨未来竞赛的发展方向 | iGEM竞赛中的项目和参与者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 350个项目，7314名创新者 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
Benchmarking Intrinsic Promoters and Terminators for Plant Synthetic Biology Research
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9834989
PMID:37850139
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研究论文 | 本文通过瞬时表达萤火虫/荧光素酶来定量表征植物启动子库，并研究了终止子-启动子组合对基因表达的影响，以及使用定量表征的启动子在植物中工程化甜菜碱途径 | 首次系统地研究了植物启动子和终止子组合对基因表达的影响，并展示了其在植物工程中的应用 | NA | 优化植物基因表达控制，推动植物合成生物学研究 | 植物启动子和终止子在基因表达中的作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术 | NA | 基因表达数据 | 使用了叶片和BY2悬浮细胞进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Cell-Free PURE System: Evolution and Achievements
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9847014
PMID:37850137
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成系统（CFPS）中的PURE系统的组成、功能蛋白设计与制备、以及其在多个领域的应用和发展 | PURE系统因其定义明确和可定制的组件以及缺乏蛋白降解酶而受到广泛关注，相比传统的基于粗提物的CFPS系统具有更高的灵活性和可控性 | NA | 探讨PURE系统在科学研究和多样化应用中的机遇与挑战 | PURE系统的组成元素、功能蛋白的设计与制备以及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成（CFPS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Hardware, Software, and Wetware Codesign Environment for Synthetic Biology
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794510
PMID:37850136
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研究论文 | 本文描述了一种硬件、软件和湿件（wetware）协同设计的环境，用于合成生物学中的生物设计自动化 | 提出了一种将软件工具作为‘遗传编译器’，将高级规范转化为工程化‘遗传电路’的方法，并结合自动化设备和微流控装置进行测试和执行 | NA | 探索合成生物学中生物设计自动化的方法 | 生物设计自动化中的硬件、软件和湿件的协同设计 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |