合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-09-16	The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods 2022-Oct-21, Foods (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/foods11203297 PMID:37431045	综述	本文综述了宏基因组学在发酵食品中微生物群落研究及其在开发理想性状中的应用	本文介绍了宏基因组学在发酵食品研究中的广泛应用，并探讨了其与合成生物学技术的结合，以解决食品行业中大量废物产生的问题	NA	研究发酵食品中的微生物群落及其在生产过程中的作用	发酵食品中的微生物群落及其代谢产物	宏基因组学	NA	高通量测序（HTS）	NA	序列数据	NA
2	2024-09-11	Improving plant productivity by re-tuning the regeneration of RuBP in the Calvin-Benson-Bassham cycle 2022-10, The New phytologist DOI:10.1111/nph.18394 PMID:35860861	研究论文	本文探讨了通过重新调整卡尔文-本森-巴斯汉循环中RuBP的再生来提高植物生产力的潜力	本文展示了通过操纵RuBP再生来提高光合作用的潜力，并介绍了新的组学和合成生物学技术在提高光合作用和增加作物产量方面的未来机会	NA	提高植物生产力和作物产量	卡尔文-本森-巴斯汉循环中的RuBP再生	NA	NA	组学和合成生物学	NA	NA	NA
3	2024-09-07	Ribosome-mediated biosynthesis of pyridazinone oligomers in vitro 2022-10-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-33701-2 PMID:36280685	研究论文	本文展示了核糖体介导的吡嗪酮寡聚物的体外生物合成	本文首次展示了核糖体介导的吡嗪酮键的聚合反应，并合成了包含多个序列定义的交替吡嗪酮连接的肽-杂合寡聚物	本文未深入探讨核糖体介导聚合反应的极限	研究核糖体介导的非经典聚合反应机制	核糖体、吡嗪酮寡聚物、肽-杂合寡聚物	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4	2024-09-07	Actomyosin-Driven Division of a Synthetic Cell 2022-10-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.2c00287 PMID:36164967	综述	本文综述了重建最小细胞分裂机制的最新研究进展	提出了构建最小肌动蛋白分裂装置的两条主要途径，并强调了脂质膜在合成细胞分裂中的被动和主动作用	未提供具体的实验数据或模型验证	探讨重建动物细胞分裂机制的物理和分子机制	肌动蛋白介导的细胞分裂机制	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
5	2024-09-07	Construction of an rAAV Producer Cell Line through Synthetic Biology 2022-10-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.2c00207 PMID:36219557	研究论文	本文通过合成生物学方法构建了一种无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系	首次通过合成生物学方法构建了无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系，实现了对病毒载体质量的调控	NA	开发一种无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系，以提高基因治疗应用中病毒载体的生产效率	rAAV生产细胞系	合成生物学	NA	合成生物学	NA	细胞系	HEK293细胞
6	2024-09-07	Stimuli-responsive vesicles as distributed artificial organelles for bacterial activation 2022-10-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2206563119 PMID:36223394	研究论文	本文报道了两种基于远程控制的囊泡型人工细胞器，能够将物理输入转化为化学信号，从而激活细菌	本文提出了一种分布式方法，通过人工细胞而非细菌细胞本身来设计刺激响应性细菌，与现有方法不同	NA	研究人工细胞与活细胞之间的通信，探索其在生物医学和生物技术中的应用	刺激响应性囊泡型人工细胞器及其对细菌的激活作用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
7	2024-09-06	Glycosyltransferase engineering and multi-glycosylation routes development facilitating synthesis of high-intensity sweetener mogrosides 2022-Oct-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.105222 PMID:36248741	研究论文	本文报道了通过UDP-糖基转移酶（UGTs）工程和多糖基化途径开发，成功合成高强度甜味剂罗汉果苷V	通过活性序列保守分析工程策略，将分支糖基化的催化效率提高了74-400倍，并提供了区域和键可控的多糖基化途径	NA	解决罗汉果苷V生物合成中多糖基化过程低效和不稳定的问题	罗汉果苷V的生物合成	代谢工程	NA	UDP-糖基转移酶（UGTs）工程	NA	NA	NA
8	2024-09-06	Heterologous Assembly of the Type VI Secretion System Empowers Laboratory Escherichia coli with Antimicrobial and Cell Penetration Capabilities 2022-10-11, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01305-22 PMID:36154120	研究论文	本文通过异源组装Aeromonas dhakensis的T6SS系统，赋予实验室常用的大肠杆菌BL21(DE3)抗菌和细胞穿透能力	首次在非致病性宿主大肠杆菌中成功组装并展示了T6SS系统的功能，实现了蛋白质从细胞质到细胞质的传递	T6SS系统的复杂结构和基因调控使其在非致病性宿主中的重建并非易事	研究T6SS系统在非致病性宿主中的组装及其功能	Aeromonas dhakensis的T6SS系统和大肠杆菌BL21(DE3)	合成生物学	NA	荧光显微镜和生化分析	NA	NA	一系列携带T6SS结构和效应基因的质粒(pT6S)
9	2024-09-06	DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of Escherichia coli and giant lipid vesicles 2022-Oct-06, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d2nr03105a PMID:36129323	研究论文	本文介绍了一种名为DNA辅助选择性电融合（DASE）的新技术，用于实现大肠杆菌和巨型脂质囊泡的选择性融合	DASE技术结合了标准电融合的高效性和融合纳米结构的选择性，通过膜锚定的DNA结构将目标物体聚集在一起，并通过电脉冲触发其融合	NA	开发一种新的方法来实现细胞和脂质囊泡的选择性融合	大肠杆菌和巨型脂质囊泡	合成生物学	NA	电融合	NA	细胞	NA
10	2024-09-06	From peptides to proteins: coiled-coil tetramers to single-chain 4-helix bundles 2022-Oct-05, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/d2sc04479j PMID:36320580	研究论文	本文探讨了从肽到蛋白质的设计，特别是从卷曲螺旋四聚体到单链4-螺旋束的设计规则	本文通过分析已知的反平行4-螺旋卷曲螺旋结构，推导出设计规则，并应用于合成肽的理性设计，最终形成单链4-螺旋束蛋白质	尽管本文提出了设计规则，但蛋白质折叠、组装和稳定的序列-结构关系仍不完全清楚	确定设计反平行4-螺旋束的通用和稳健的序列背景	反平行4-螺旋束蛋白质的设计规则	蛋白质设计	NA	X射线晶体学	NA	蛋白质结构	NA
11	2024-09-06	Engineering functional thermostable proteins using ancestral sequence reconstruction 2022-10, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbc.2022.102435 PMID:36041629	综述	本文综述了利用祖先序列重建工程化功能性耐热蛋白质的方法及其在工业化学、医学和合成生物学中的应用	利用生物信息学工具和序列数据，通过祖先序列重建生成高度稳定的折叠结构，为工业化学、医学和合成生物学中的新应用提供了可能性	理性设计方法需要结构信息，而即使使用先进的计算方法，也难以精确预测或参数化所有相关的结构因素	探讨通过祖先序列重建推断耐热蛋白质的成功因素及其对蛋白质稳定性决定因素的揭示	耐热蛋白质的工程化及其在工业、医学和合成生物学中的应用	生物工程	NA	祖先序列重建	NA	序列数据	NA
12	2024-09-05	Efficient assembly of long DNA fragments and multiple genes with improved nickase-based cloning and Cre/loxP recombination 2022-10, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.13882 PMID:35767383	研究论文	本文开发了一种基于独特核苷酸序列引导的核酸内切酶（UNiE）介导的DNA组装（UNiEDA）策略，用于高效克隆长DNA片段和多基因堆叠	UNiEDA方法简化了DNA组装过程，提高了效率，降低了成本	NA	开发高效工具以满足功能基因组学、合成生物学和代谢工程中对长DNA片段或多基因构建体的需求	长DNA片段和多基因构建体的克隆与组装	合成生物学	NA	核酸内切酶（nickases）和Cre/loxP重组	NA	DNA序列	涉及野生烟草（Nicotiana benthamiana）和转基因水稻（Oryza sativa）的生物合成验证
13	2024-08-07	Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli 2022-10-14, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac787 PMID:36134716	研究论文	本文研究了在大肠杆菌中，基因的局部染色体环境对其转录的深刻影响，并展示了1 kb的非编码合成序列（低GC含量）如何显著降低报告基因表达。	本文揭示了转录倾向性的关键决定因素，这些因素作为可调节的转录调制器，独立于启动子等调控序列。	NA	探究大肠杆菌中基因的染色体位置依赖性表达变化的原因。	研究基因的局部染色体环境对转录的影响。	NA	NA	NA	NA	NA	NA
14	2024-08-07	Minimization and optimization of α-amylase terminator for heterologous protein production in Bacillus licheniformis 2022-Oct-10, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s40643-022-00597-1 PMID:38647575	研究论文	本研究对芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1进行了特性分析和优化，以提高其在异源蛋白生产中的终止效率	通过多方面优化策略，成功提高了终止子T1的终止效率，并验证了其在蛋白表达中的通用性	NA	解决芽孢杆菌中缺乏可用和通用终止子的问题，扩展合成生物学工具箱	芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1及其优化	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
15	2024-08-07	Synthetic biology-instructed transdermal microneedle patch for traceable photodynamic therapy 2022-10-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-33837-1 PMID:36266306	研究论文	本文利用合成生物学方法构建了一种透皮治疗诊断微针贴片，该贴片集成了5-氨基乙酰丙酸和过氧化氢酶共载的肿瘤酸度响应性铜掺杂磷酸钙纳米粒子，用于提高5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗效率。	通过合成生物学方法，实现了肿瘤内原卟啉IX的富集最大化，并通过过氧化氢酶在体内的持续氧气生成，逆转肿瘤缺氧，增强原卟啉IX的积累。	NA	优化5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的参数，实现对不同癌症的重复性光动力治疗。	5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的效果及肿瘤内原卟啉IX的代谢动力学。	生物技术	NA	光动力治疗	NA	荧光/光声双模态成像	NA