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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2024-08-07 |
Elucidating the impact of in vitro cultivation on Nicotiana tabacum metabolism through combined in silico modeling and multiomics analysis
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1281348
PMID:38023876
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研究论文 | 本文通过结合计算机模拟和多组学分析,系统地阐明了体外培养对烟草代谢网络的影响 | 首次构建了烟草的基因组规模代谢网络(GSMN),并结合多组学分析,揭示了体外培养条件下烟草代谢的系统性变化 | 文章中提到的体外培养对植物整体代谢的系统性影响仍了解不足 | 系统地理解和表征植物代谢行为,为高效的植物代谢工程和合成生物学提供基础 | 烟草的代谢网络及其在体外培养条件下的变化 | 合成生物学 | NA | 多组学分析 | 基因组规模代谢网络(GSMN) | 代谢物 | NA |
62 | 2024-08-07 |
Pyramiding stacking of multigenes (PSM): a simple, flexible and efficient multigene stacking system based on Gibson assembly and gateway cloning
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1263715
PMID:38026899
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Gibson组装和Gateway克隆的Pyramiding Stacking of Multigenes (PSM)系统,用于将多个转基因整合到一个T-DNA中 | PSM系统结合了Gibson组装和Gateway克隆的优点,采用倒金字塔堆叠路线,实现了快速、灵活和高效的多基因堆叠 | NA | 开发一种简单、灵活且高效的多基因堆叠系统,用于遗传工程和合成生物学 | 多基因堆叠系统的设计和其在拟南芥中的应用 | 遗传工程 | NA | Gibson组装, Gateway克隆 | NA | DNA | 四个和九个基因表达盒分别组装到目标载体中,用于生成两个二元表达载体 |
63 | 2024-08-07 |
Biotechnological production of omega-3 fatty acids: current status and future perspectives
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1280296
PMID:38029217
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综述 | 本文综述了omega-3脂肪酸的生物技术生产现状、关键挑战及未来展望 | 利用合成生物学和工程微生物细胞工厂提供更稳定、可持续和经济的omega-3脂肪酸来源 | 目前生物技术生产omega-3脂肪酸仍面临降低生产成本和提高产品质量与可持续性的挑战 | 探讨生物技术在生产omega-3脂肪酸中的应用及未来发展方向 | omega-3脂肪酸,包括ALA、EPA和DHA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
64 | 2024-08-07 |
Unleashing the potential of catalytic RNAs to combat mis-spliced transcripts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1244377
PMID:38047291
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综述 | 本文综述了利用催化RNA和纳米药物递送系统来治疗由于剪接异常导致的遗传疾病的可能性 | 探讨了利用合成生物学、高通量深度测序和计算方法来克服催化RNA递送挑战的新视角 | NA | 探讨利用催化RNA和纳米药物递送系统治疗剪接异常转录本的方法 | 剪接异常导致的遗传疾病,如肌肉萎缩症、阿尔茨海默病、亨廷顿病和骨髓增生异常综合征 | 合成生物学 | 遗传疾病 | 高通量深度测序 | NA | 转录组数据 | NA |
65 | 2024-08-07 |
Safety risks and ethical governance of biomedical applications of synthetic biology
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1292029
PMID:37941726
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研究论文 | 本文概述了合成生物学在生物医学中的应用现状,并系统分析了该领域的安全风险,提出了应对这些问题的基本原则和伦理治理的实际建议 | 提出了针对合成生物学在生物医学应用中安全风险的基本原则和伦理治理建议 | 未明确提及 | 分析合成生物学在生物医学应用中的安全风险并提出伦理治理建议 | 合成生物学在生物医学中的应用及其安全风险 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
66 | 2024-08-07 |
Enabling AI in synthetic biology through Construction File specification
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0294469
PMID:37956196
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研究论文 | 本文介绍了Construction File (CF)规范,这是一个用于分子生物学操作的标准化接口,旨在为实验设计的自动化和效率提升奠定基础 | CF规范不仅标准化和模块化了分子生物学操作,还促进了协作、自动化和重用,显著减少了潜在错误,并探索了与GPT-4等人工智能的集成潜力 | 尽管存在令牌限制、数据存储和生物安全等挑战,但提出的解决方案为利用AI进行实验设计提供了前进的道路 | 推动合成生物学中从人工驱动设计到AI辅助工作流程的转变 | 分子生物学操作的标准化和自动化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
67 | 2024-08-07 |
Engineering TNA polymerases through iterative cycles of directed evolution
2023, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2023.04.014
PMID:37914450
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research paper | 本文报道了一种定向进化策略,用于发现能够在DNA模板上合成苏糖核酸(TNA)的聚合酶 | 通过定向进化方法,成功开发出能够识别人工遗传聚合物(XNA)的工程化聚合酶 | NA | 开发能够复制DNA和XNA之间遗传信息的工程化聚合酶 | DNA聚合酶及其在合成苏糖核酸(TNA)中的应用 | synthetic biology | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
68 | 2024-08-07 |
Ice Cores as a Source for Antimicrobials: From Bioprospecting to Biodesign
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0024
PMID:37928441
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研究论文 | 探讨冰芯作为新型抗生素来源的潜力,并利用合成生物学工具设计更优的抗微生物药物 | 提出冰芯作为新型抗生素的潜在来源,并利用合成生物学和生物工程技术提高化合物产量、效力和稳定性 | NA | 探索冰芯中微生物及其基因材料作为抗生素新来源的可能性 | 冰芯中的微生物及其基因材料 | 分子生物学 | NA | 遗传序列分析 | NA | 基因组数据 | NA |
69 | 2024-08-07 |
Systems and synthetic biology-driven engineering of live bacterial therapeutics
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1267378
PMID:37929193
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综述 | 本文综述了利用系统和合成生物学方法对活细菌疗法进行工程化的最新进展和挑战 | 近期系统和合成生物学的进步使得能够有效利用原生肠道共生菌进行治疗和诊断 | 遗传可操作性有限是主要障碍 | 探讨利用合成生物学和系统生物学理解驱动肠道共生菌工程化的进展和挑战 | 肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
70 | 2024-08-07 |
Revealing the Host-Dependent Nature of an Engineered Genetic Inverter in Concordance with Physiology
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0016
PMID:37849456
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研究论文 | 本研究通过多变量统计方法比较了模型和新颖的细菌宿主,以确定遗传电路性能的预测因子是系统发育相关性还是宿主生理相似性 | 首次系统地展示了遗传逆变器电路在不同宿主中的性能动态,并确定了宿主生理特征对遗传设备性能的影响 | NA | 探讨遗传电路性能在不同宿主中的表现,并确定影响性能的主要因素 | 遗传逆变器电路在6种γ-变形菌中的性能 | 合成生物学 | NA | 多变量统计方法 | NA | 遗传电路性能数据 | 6种γ-变形菌 |
71 | 2024-08-07 |
SLICER: A Seamless Gene Deletion Method for Deinococcus radiodurans
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0009
PMID:37849465
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SLICER的方法,用于在Deinococcus radiodurans中创建无缝基因删除 | SLICER方法通过整合无缝删除盒、引入pSLICER质粒以介导盒切除和治愈辅助质粒,实现了多基因删除 | 大多数敲除菌株的转化效率未显著提高 | 开发一种新的无缝基因删除方法,以促进Deinococcus radiodurans的合成生物学应用和工业生物生产 | Deinococcus radiodurans中的基因删除 | 合成生物学 | NA | 无缝基因删除技术 | NA | 基因组数据 | 5个潜在的限制修饰系统基因 |
72 | 2024-08-07 |
Engineering Nitrogenases for Synthetic Nitrogen Fixation: From Pathway Engineering to Directed Evolution
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0005
PMID:37849466
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法,将氮酶工程化以促进作物生长并减少对工业化肥依赖的最新研究进展 | 探讨了在异源宿主中调控氮酶基因表达以提高活性及氧耐受性的方法,并可能构建与植物的合成共生关系 | NA | 旨在通过工程化氮酶,实现作物对工业化肥依赖的减少 | 氮酶的功能表达要求及其在作物或与作物形成共生关系的细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |