合成生物学相关文章
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当前共找到 383 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-01 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
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研究论文 | 该研究利用Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径中的调控元件，开发了新的植物二元表达系统，并在本氏烟草和转基因烟草中验证了其功能 | 首次利用compactin生物合成途径中的mlcR调控元件构建植物合成转录因子和二元表达系统，并实现了高达六倍的基因表达激活 | 研究仅在烟草中进行了验证，未在其他植物物种中测试；系统的正交性和通用性有待进一步评估 | 开发新的植物合成生物学二元表达系统，以丰富植物基因表达调控工具 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana）和转基因烟草（Nicotiana tabacum） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、转录因子工程、荧光报告基因检测 | NA | 图像（荧光）、文本（RNA表达数据） | 28株转基因烟草 | NA | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana）、烟草（Nicotiana tabacum） | 基于mlcR调控元件的合成转录因子和合成启动子组成的二元表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 2 | 2026-11-01 |
Molecular switches in plant stress adaptation
2023-Dec-18, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09051-7
PMID:38108912
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综述 | 综述植物在生物与非生物胁迫适应中分子开关的调控机制及其在作物改良中的应用 | 系统阐述单个分子开关可调控多个胁迫网络、多个开关可调控单一胁迫条件的多因素调控关系，并强调合成生物学在分子开关应用中的潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对分子开关调控网络的具体分子机制和实际应用效果缺乏深入验证 | 探讨分子开关在植物胁迫适应中的调控作用，并讨论利用先进生物技术工具开发抗逆作物的方法 | 不同植物物种（包括拟南芥）的分子开关及其胁迫响应 | 植物科学 | NA | 文献检索（PubMed、Google Scholar、Web of Science、SCOPUS） | NA | 文本 | NA | NA | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-11-01 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | GENETTA是一个基于图论的软件工具，将合成生物学设计转化为网络以进行分析和操作 | 利用图论将合成生物学设计表示为互连节点，实现可视化动态定制、多数据库设计数据合并以及交互式网络编辑 | 未明确提及 | 提出并展示GENETTA工具的功能及其在合成生物学设计分析中的实际应用 | 合成生物学设计数据 | 合成生物学 | NA | 图论 | NA | 网络数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-11-01 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-12-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
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研究论文 | 通过对澳大利亚合成生物学中心的科学家进行访谈，探讨合成生物学实践中的伦理、承诺与实践问题 | 从实践科学家的视角出发，揭示了合成生物学领域中实际存在的伦理挑战，如不稳定就业、产业压力、性别不平等和过度宣传的负面影响，这些与伦理文献中主要关注的抽象和推测性问题显著不同 | 研究仅基于澳大利亚一个合成生物学中心的科学家访谈，样本范围有限，可能无法代表全球合成生物学领域的多样性 | 了解合成生物学实践中的伦理问题，并探讨这些问题与现有伦理文献中讨论的合成生物学伦理议题之间的关系 | 澳大利亚合成生物学中心的在职合成生物学家 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | 来自澳大利亚一个合成生物学中心的在职合成生物学家（具体人数未在摘要中说明） | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 5 | 2026-10-31 |
The current situations and limitations of genetic engineering in cyanobacteria: a mini review
2023-Jun, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-08456-8
PMID:37119415
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综述 | 本文综述了蓝细菌遗传工程的研究现状与局限性，并提出了改进策略以提高目标产物的产量 | 系统总结了蓝细菌遗传工程工具的现状与不足，并提出了未来改进方向，包括开发新的菌株操作工具和构建性能优良的新型底盘生物 | 蓝细菌的遗传工程工具仍落后于常规异养微生物，且目标产物产量较低，限制了其工业应用潜力 | 阐述蓝细菌遗传工程的研究现状与局限性，并提出改进策略以提高目标产物的产量 | 蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 文本 | NA | NA | 蓝细菌 | NA | 工业生物技术, 能源 |
| 6 | 2026-10-31 |
Improvements in Bioremediation Agents and Their Modified Strains in Mediating Environmental Pollution
2023-May-11, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-023-03316-x
PMID:37169903
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综述 | 本文综述了生物修复技术及其改良菌株在介导环境污染治理中的应用，重点探讨了合成生物学和可编程核酸酶（ZFN、TALEN、CRISPR-Cas）对细菌、真菌和藻类进行基因工程改造以增强有毒污染物降解能力的研究进展。 | 系统性地将新型遗传学方法（可编程核酸酶如ZFN、TALEN、CRISPR-Cas）与生物修复的三个基本层次（自然衰减、生物强化、生物刺激）相关联，阐明了通过敲入/敲除特定基因重构微生物代谢通路来获得重金属抗性、更广底物范围、增强酶活性和结合亲和力的基因工程微生物，从而加速有毒污染物降解至环境安全水平。 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证；未深入讨论基因工程微生物的生态风险、基因水平转移可能性及监管审批障碍；对不同污染物类型和不同环境条件下的具体修复效率缺乏定量比较分析。 | 全面理解如何将新型遗传学方法应用于生产基因工程微生物以增强危险污染物的生物降解，从而构建清洁可持续的生态系统。 | 生物修复剂及其改良菌株，包括细菌、真菌和藻类等微生物。 | 环境生物技术 | NA | ZFN, TALEN, CRISPR-Cas | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 细菌, 真菌, 藻类 | 代谢通路重构 | 环境 |
| 7 | 2026-10-31 |
Quorum sensing-mediated dynamic regulation of 4-hydroxyisoleucine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum
2023-May-05, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-023-03633-0
PMID:37142865
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研究论文 | 本研究将ComQXPA-P群体感应系统整合到谷氨酸棒杆菌染色体中，实现4-羟基异亮氨酸的动态生物合成调控 | 将质粒携带的ComQXPA-P系统整合到染色体上提高遗传稳定性，并利用不同强度的突变P启动子动态调控关键基因表达，实现细胞密度依赖的4-HIL生产 | 未明确提及 | 利用稳定的群体感应系统动态调控谷氨酸棒杆菌中4-羟基异亮氨酸的生物合成 | 谷氨酸棒杆菌SN01菌株及4-羟基异亮氨酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 染色体整合、绿色荧光蛋白报告基因、群体感应系统 | NA | 荧光强度、代谢物浓度 | NA | 染色体整合 | 谷氨酸棒杆菌 | 群体感应介导的动态调控回路（ComQXPA-PM系统） | 医药、工业生物技术 |
| 8 | 2026-10-25 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543449
PMID:37398067
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研究论文 | 利用计算设计指定蛋白质构建块的尺寸、柔性和效价以及相互作用动力学，研究分子参数如何调控蛋白质水凝胶的宏观粘弹性 | 通过计算设计模块化构建蛋白质水凝胶，系统编程细胞内和细胞外粘弹性，并首次在活哺乳动物细胞内组装蛋白质网络并定量表征其力学性质 | 未明确讨论设计蛋白质水凝胶在体内的长期稳定性、免疫原性以及大规模生产的可行性 | 探究分子参数如何决定蛋白质水凝胶的宏观粘弹性，并实现可编程的细胞内和细胞外力学性质 | 由对称蛋白质同源寡聚体（含2、5、24或120个蛋白质组分）构建的蛋白质水凝胶系统 | 合成生物学、蛋白质材料科学 | NA | 流变学评估、分子动力学模拟、荧光漂白恢复技术 | 分子动力学模拟 | 流变学数据、模拟数据、荧光显微图像 | NA | 计算蛋白质设计 | 哺乳动物细胞 | 蛋白质网络（物理或共价交联的阶梯增长生物聚合物网络） | 医学、组织工程、治疗递送、合成生物学 |
| 9 | 2026-10-07 |
Optogenetic manipulation of BMP signaling to drive chondrogenic differentiation of hPSCs
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113502
PMID:38032796
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研究论文 | 本研究利用光遗传学BMP信号系统（optoBMP）驱动人类胚胎干细胞向软骨细胞分化 | 首次通过CRISPR-Cas9将光遗传BMP系统整合到AAVS1位点，实现用蓝光代替BMP生长因子驱动hESCs软骨分化 | 未明确说明光遗传系统长期激活的稳定性及体内应用潜力 | 探索光遗传学在人类发育研究和组织工程中的应用 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 合成生物学、组织工程 | NA | 光遗传学、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 转录组数据、图像 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类胚胎干细胞 | 光遗传BMP信号系统（optoBMP） | 医学、组织工程 |
| 10 | 2026-09-21 |
Molecular imaging with aquaporin-based reporter genes: quantitative considerations from Monte Carlo diffusion simulations
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544324
PMID:37333205
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研究论文 | 开发并验证了一个蒙特卡洛模型，用于分析细胞半径和胞内容积分数如何定量影响水通道蛋白信号，并证明了一种基于时间依赖性扩散率变化的差分成像方法能够提高特异性 | 开发并实验验证了蒙特卡洛模型，定量分析细胞半径和胞内容积分数对水通道蛋白信号的影响；提出基于时间依赖性扩散率变化的差分成像方法，能够明确区分水通道蛋白驱动的对比度与组织背景；建立了准确确定混合群体中水通道蛋白表达细胞体积分数的简单映射 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 分析细胞半径和胞内容积分数对水通道蛋白信号的定量影响，提高水通道蛋白成像特异性，并建立确定水通道蛋白表达细胞体积分数的方法 | 水通道蛋白作为报告基因的分子成像 | 分子成像 | NA | 蒙特卡洛扩散模拟 | 蒙特卡洛模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物医学，体内合成生物学 |
| 11 | 2026-09-20 |
Elongated Riboflavin-Producing Shewanella oneidensis in a Hybrid Biofilm Boosts Extracellular Electron Transfer
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206622
PMID:36710254
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研究论文 | 通过合成生物学与材料科学策略，构建产核黄素且细胞延长的Shewanella oneidensis，并制备蛛网状杂化生物膜，显著提升胞外电子传递效率 | 首次将核黄素合成途径定向增强、MtrC细胞色素过表达、细胞分裂抑制剂sulA过表达以增加生物膜厚度与生物量，并结合多壁碳纳米管与氧化石墨烯构建蛛网状杂化生物膜，实现产电功率相对MR-1提升77.83倍 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 提升Shewanella oneidensis的胞外电子传递效率，解决核黄素浓度低、生物膜形成能力差及导电性弱的问题 | Shewanella oneidensis（希瓦氏菌）及其工程化菌株与杂化生物膜 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、合成生物学、材料科学 | NA | NA | NA | NA | Shewanella oneidensis | 核黄素合成途径、MtrC细胞色素过表达、sulA过表达 | 能源，环境 |
| 12 | 2026-08-29 |
Functional Nanopores Enabled with DNA
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202303103
PMID:37186432
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综述 | 本文综述了利用DNA链功能化现有纳米孔以及通过DNA纳米技术创建新型DNA纳米孔的研究进展 | 通过DNA功能化扩展纳米孔的结构和功能库，并创建全新类别的DNA纳米孔 | 摘要中未提及具体局限性 | 概述功能性DNA纳米孔领域的发展，并展望新应用 | DNA纳米孔及其功能化方法 | 纳米技术、合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | DNA纳米孔结构 | 生物传感、单分子检测、核酸测序 |
| 13 | 2026-08-19 |
The technology, opportunities, and challenges of Synthetic Biological Intelligence
2023-11, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108233
PMID:37558186
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综述 | 本文综述了合成生物智能（SBI）的发展技术、潜在应用及其伦理挑战，旨在为负责任的研究和应用提供伦理框架 | 首次系统梳理了合成生物智能发展中的关键技术与潜在应用，并提出结构化伦理考量框架 | 未深入探讨具体技术细节，伦理框架尚需实际验证 | 探讨合成生物智能的发展技术、机遇与挑战，并提出伦理考量框架 | 合成生物智能（SBI），包括神经培养物与数字计算集成系统 | 机器学习 | NA | 合成生物学方法（具体如细胞培养技术） | NA | 文本 | NA | NA | 神经培养物（具体宿主未明确） | NA | 医疗, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-08-04 |
Turn-On Protein Switches for Controlling Actin Binding in Cells
2023-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.561921
PMID:37961502
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研究论文 | 本文描述了一套名为可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs）的蛋白质设计，能够通过外部刺激控制其肌动蛋白结合行为，并在细胞中实现局部调控 | 设计出可响应多种外部输入、具有可调开启动力学和正交性的可遗传编码蛋白质开关，并证明其可插入天然蛋白序列或构建新结构以控制细胞和组织形态与行为 | 文中未明确提及研究的局限性 | 开发可控制肌动蛋白结合行为的蛋白质开关，以研究肌动蛋白结合蛋白的细胞功能并推动合成生物学应用 | 肌动蛋白结合蛋白和丝状肌动蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs） | 合成生物学 |
| 15 | 2026-06-19 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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research paper | 系统鉴定植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域 | 首次在两种模式真核生物（拟南芥和酿酒酵母）的全蛋白质组中，系统挖掘并实验验证非转录因子蛋白中的转录激活域，发现这些激活域可能具有未知的生物学功能，并鉴定出能在酵母和植物中普遍有效的短激活域 | 仅基于预测工具PADDLE的预测结果进行验证，可能遗漏某些激活域；实验验证仅在酵母中进行，植物中的功能验证有限；未深入探究激活域在非核蛋白中的生理角色 | 揭示非转录因子蛋白中转录激活域的存在和功能，发掘可用于合成生物学的通用遗传元件 | 拟南芥和酿酒酵母中800多个非转录因子基因的18,000个片段 | synthetic biology | NA | PADDLE预测、酵母单杂交实验 | NA | 蛋白质序列数据 | 从超过800个非转录因子基因中选取18,000个片段，在酵母中验证89%的蛋白质含有激活片段 | NA | 酿酒酵母, 拟南芥 | 转录激活域作为遗传元件，未涉及具体电路设计 | synthetic biology |
| 16 | 2026-06-07 |
Visioning synthetic futures for yeast research within the context of current global techno-political trends
2023-10, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3897
PMID:37653687
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综述 | 本文综述了酵母研究在当前全球技术政治趋势下的新方向，重点关注酿酒酵母，并将这些趋势置于其地缘政治背景中 | 将酵母研究的新科学工具和方向与全球技术竞争的地缘政治背景相结合，强调生命科学与信息科学的融合 | 作为综述，未提供具体实验数据或验证新方法 | 概述酵母研究的新方向，并探讨其在全球技术政治背景下的机遇和挑战 | 酿酒酵母 | 合成生物学， 生命科学 | NA | 计算机辅助设计， AI工具， 合成基因组技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9， 计算机辅助设计工具 | 酿酒酵母 | 合成基因组， 最小基因组， 泛基因组， 新染色体， 宏基因组 | 工业生物技术， 农业， 环境， 医学 |
| 17 | 2026-06-02 |
Construction of stable microbial consortia for effective biochemical synthesis
2023-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.05.008
PMID:37330325
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综述 | 综述了通过合成生物学和代谢工程技术构建稳定微生物联合体以有效生产化学品的进展 | 系统总结了控制微生物共培养中社会互作用的策略，包括底物分离、副产物消除、交叉喂养和群体感应电路设计，并提出了跨学科方法提高联合体稳定性 | 未涉及实际工业应用中微生物联合体的长期稳定性验证 | 探讨构建稳定微生物联合体的设计原则，以增强化学品生产 | 微生物联合体 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 多种微生物（如大肠杆菌、酿酒酵母等） | 群体感应电路 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
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研究论文 | 结合大规模测量和机器学习，提出了两种精确设计遗传传感器的方法：计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合，实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程，包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法，特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器（剂量响应电路） | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-05-17 |
Opportunities to accelerate extracellular vesicle research with cell-free synthetic biology
2023-May, Journal of extracellular biology
DOI:10.1002/jex2.90
PMID:38938277
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观点文章 | 讨论利用无细胞合成生物学加速细胞外囊泡研究的机会与挑战 | 提出将无细胞合成生物学技术应用于细胞外囊泡工程，以实现理性设计和制造携带定制分子货物的囊泡 | 当前对细胞外囊泡异质性、货物装载机制的理解有限，且囊泡计量学发展尚处于初期阶段 | 探索无细胞合成生物学在加速细胞外囊泡研究和医疗应用中的潜力 | 细胞外囊泡及其在人类生理和病理中的功能 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 囊泡工程，包括货物装载和膜蛋白生产 | 医学,生物技术 |
| 20 | 2026-05-06 |
Special Issue "Synthetic Biology for Biosensing in Health and Environmental Applications"
2023-Oct-19, Biosensors
DOI:10.3390/bios13100937
PMID:37887130
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评论 | 本期特刊专注于合成生物学在健康与环境应用中的生物传感技术 | 通过合成生物学方法设计和构建高灵敏度、高特异性的生物传感器，以应对健康和环境监测中的挑战 | NA | 探讨合成生物学在生物传感领域的最新进展及其在健康与环境中的应用 | 生物传感器及其在健康和环境监测中的靶标分析物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器 | 医学, 环境 |