合成生物学相关文章
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当前共找到 358 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Coupling chemistry and biology for the synthesis of advanced bioproducts
2023-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.102992
PMID:37688985
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研究论文 | 本文探讨了将化学合成与生物合成相结合以生产高级生物产品的潜力 | 提出了一种结合生物合成和绿色化学的策略，以减少制造过程中的环境影响 | 生物反应器依赖大量水且效率不高，生物体对环境变化敏感 | 探索化学和生物合成相结合的新方法，以实现更可持续的制造过程 | 高级生物产品的合成方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
Recent advances in systems metabolic engineering
2023-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103004
PMID:37778304
|
综述 | 本文综述了系统代谢工程领域的最新工具和策略，包括酶、遗传模块、途径、通量、基因组和细胞层面的工程，并强调了将学术研究转化为商业生产的挑战和前景。 | 系统代谢工程结合了代谢工程、系统生物学、合成生物学和进化工程，通过创建高效的微生物细胞工厂，革新了燃料和材料的可持续生产。 | 文章讨论了将学术级别的代谢工程研究过渡到商业规模生产的挑战。 | 探讨系统代谢工程的最新进展及其在微生物细胞工厂创建中的应用。 | 文章主要研究了微生物细胞工厂的创建及其在燃料和材料生产中的应用。 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-07 |
Emerging nonmodel eukaryotes for biofuel production
2023-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103015
PMID:37913603
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研究论文 | 本文介绍了非模式真核生物在生物燃料生产中的新兴应用，并讨论了它们的特定优势 | 利用合成生物学和代谢工程的进步，非模式真核生物因其天然的优良表型和代谢特性，成为有前景的生物燃料生产者 | 非模式真核生物作为理想宿主用于未来生物燃料生产仍面临挑战 | 探讨非模式真核生物在生物燃料生产中的应用及其发展前景 | 非模式真核生物及其在生产纤维素乙醇、高级醇和脂肪酸/萜类衍生物生物燃料分子中的能力 | NA | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
pyBrick-DNA: A Python-Based Environment for Automated Genetic Component Assembly
2023-12, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0008
PMID:38010519
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Python的软件环境pyBrick-DNA，用于自动化基因组件组装，加速遗传电路的原型设计 | pyBrick-DNA提供了一个用户友好的环境，允许科学家选择基因序列或输入自定义序列来构建基因组件，所有组件模块化融合生成一个即用型单DNA片段 | NA | 开发自动化工具以加速遗传电路的模拟和实现 | 基因组件的自动化组装 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | DNA序列 | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553928
PMID:37662294
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研究论文 | 本文通过贝叶斯优化物理基础模型，逆向工程形态发生过程 | 开发了一种贝叶斯优化框架，用于确定最优的细胞力分布，使预测的器官形状与实验图像数据中的期望器官形状相匹配 | NA | 确定细胞内和细胞间相互作用的最优组合，以预测器官的形状、大小和功能 | 翅膀想象盘，一种高度信息丰富的模型器官系统 | 生物学 | NA | 贝叶斯优化 | 高斯过程回归（GPR） | 图像 | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Mining the Utricularia gibba genome for insulator-like elements for genetic engineering
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1279231
PMID:38023853
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研究论文 | 本文通过分析Utricularia gibba（驼峰狸藻）的基因组，寻找潜在的绝缘子样序列，用于遗传工程 | 本文发现了两个与已发表元素（EXOB）性能相当且尺寸显著较小的绝缘子样元素 | 本文未能识别出选定间隔区与现有植物绝缘子样元素之间的保守基序 | 寻找新的绝缘子样序列，以精确控制多基因遗传工程和合成生物学中的转录 | Utricularia gibba的基因组中的绝缘子样序列 | 遗传工程 | NA | 基因组分析 | NA | 基因组数据 | 4,656个间隔区，10个选定的间隔区 |
| 187 | 2024-08-07 |
Optogenetic manipulation of BMP signaling to drive chondrogenic differentiation of hPSCs
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113502
PMID:38032796
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研究论文 | 本研究利用光遗传学技术调控骨形态发生蛋白（BMP）信号，促进人胚胎干细胞（hESCs）的软骨分化 | 通过CRISPR-Cas9介导的光遗传学BMP信号系统（optoBMP），实现了光控BMP信号激活，从而调控hESCs的软骨分化 | NA | 探索光遗传学技术在人胚胎干细胞分化和组织工程中的应用 | 人胚胎干细胞（hESCs）的软骨分化 | 生物技术 | NA | 光遗传学 | CRISPR-Cas9 | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 188 | 2024-08-07 |
The Effect of Pseudoknot Base Pairing on Cotranscriptional Structural Switching of the Fluoride Riboswitch
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570056
PMID:38106011
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研究论文 | 研究了转录过程中氟离子核开关的结构转换及其对假结碱基配对的影响 | 发现单个摇摆碱基对在功能中的关键作用，并揭示了镁离子在RNA结构转换中的重要角色 | NA | 探讨RNA序列变化如何影响转录过程中动态构象变化 | 氟离子核开关及其在不同温度下的功能 | 生物学 | NA | RNA聚合酶转录和细胞基因表达分析 | 分子动力学模拟 | RNA序列 | 涉及中温和高温氟离子核开关变体 |
| 189 | 2024-08-07 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566095
PMID:37986852
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研究论文 | 本研究证明Aquaporin-1（Aqp1）水通道蛋白在多种细胞类型中产生强扩散型磁共振信号，且不影响细胞活性和形态 | 首次证明Aqp1在多种细胞类型中产生强磁共振信号，且不影响细胞生理功能 | NA | 验证Aqp1作为基因报告器的可行性和安全性 | 来自小鼠和人类的不同细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞 | 多种细胞系 |
| 190 | 2024-08-07 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
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综述 | 本文综述了利用核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的最新进展 | 探讨了非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽的共同结构特征，并强调了通过核糖体途径工程模拟非核糖体肽的合成生物学策略 | NA | 旨在概述这一新兴研究领域的最新进展 | 非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-Oct-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本文报道了在非固氮宿主大肠杆菌中异源合成氮酶P-和M-簇核心的成功 | 首次通过生化和光谱分析证明了在非固氮宿主中成功合成P-和L-簇 | NA | 研究氮酶的异源表达及其生物合成机制 | 氮酶的P-和M-簇核心 | 生物化学 | NA | 电子顺磁共振(EPR)、X射线吸收光谱(XAS)/扩展X射线吸收精细结构(EXAFS) | NA | 生化数据 | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Research progress of multi-enzyme complexes based on the design of scaffold protein
2023-Oct-23, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00695-8
PMID:38647916
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综述 | 本文综述了基于支架蛋白设计的多酶复合体在分子酶工程中的设计策略和应用进展 | NA | NA | 探讨多酶复合体的设计策略及其在合成生物学中的应用 | 多酶复合体及其在酶级联反应中的应用 | 分子酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
De novo synthesis of nervonic acid and optimization of metabolic regulation by Yarrowia lipolytica
2023-Oct-06, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00689-6
PMID:38647797
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在Yarrowia lipolytica中构建了nervonic酸的从头合成途径，并通过代谢工程和发酵优化进一步提高了nervonic酸的产量 | 成功表达和评估了来自不同生物的异源延长酶和脱饱和酶，用于在Y. lipolytica中生产nervonic酸，并分析了添加菜籽油作为辅助碳源对nervonic酸生产的潜力 | NA | 开发一种高效的生产nervonic酸的方法，以替代传统的天然提取或化学合成方法 | nervonic酸的合成及其在Yarrowia lipolytica中的代谢调控 | 合成生物学 | 脑神经系统疾病 | 代谢工程 | NA | NA | 最高浓度达到185.0 mg/L |
| 194 | 2024-08-07 |
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac733
PMID:36100255
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研究论文 | 本文通过新的结构和生化数据，提出了一种新的Tn3解离酶复合体（synaptosome）的详细模型，并讨论了其如何利用DNA拓扑结构来调节重组酶的酶活性 | 本文提出了一个新的、详细的Tn3解离酶复合体模型，该模型基于新的结构和生化数据，解决了之前模型与实验数据不一致的问题 | NA | 研究Tn3解离酶如何通过DNA拓扑结构来调节其酶活性 | Tn3解离酶及其复合体（synaptosome） | NA | NA | NA | NA | 结构和生化数据 | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Construction of the genetic switches in response to mannitol based on artificial MtlR box
2023-Jan-30, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00634-7
PMID:38647829
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠的工作流程，用于设计两种类型的遗传元件：基于MtlR盒的开关元件和基于catabolite control protein A (CcpA)盒的转录调控元件，这些元件能够响应甘露醇进行ON/OFF状态的选择。 | 本研究通过理性设计MtlR盒和CcpA盒，实现了对遗传开关的灵活调控，显著提高了开关对诱导物的敏感性，并大幅降低了OFF状态的值。 | 由于对特定转录因子与其目标基因相互作用的分子机制理解不足，遗传开关的理性设计进展有限。 | 设计新型的遗传开关，以在合成生物学中实现代谢途径的精确控制。 | 基于MtlR盒和CcpA盒的遗传开关元件。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传元件 | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Application of synthetic lipid droplets in metabolic diseases
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1441
PMID:37997538
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综述 | 本文综述了内源性脂滴的组装和功能，以及合成脂滴模型在生物学中的最新进展和应用挑战 | 开发了体外合成脂滴的方法，并在蛋白质结合、脂质功能、膜动力学和酶反应方面取得了显著进展 | 细胞生物学方法的局限性导致脂滴功能的分子机制尚未完全理解 | 全面概述脂滴的组装和功能，并探讨合成脂滴模型在未来的实际应用中的作用和挑战 | 脂滴及其在代谢疾病中的作用 | 合成生物学 | 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Two neglected but valuable genetic tools for Escherichia coli and other bacteria: In vivo cosmid packaging and inducible plasmid replication
2023-12, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.15171
PMID:37770255
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研究论文 | 本文介绍了两种被忽视但有价值的遗传工具：大肠杆菌和其他细菌中的体内cosmid包装和可诱导质粒复制 | 通过操纵包装噬菌体和宿主，解决了体内cosmid包装效率低和污染问题，实现了仅包含cosmid DNA的颗粒 | 质粒难以从细胞中去除，但可诱导复制质粒提供了一种“治愈”质粒的方法 | 探索在生理学和合成生物学中，如何高效且无损地将基因引入细菌宿主 | 大肠杆菌和其他细菌 | 合成生物学 | NA | 体内cosmid包装，可诱导质粒复制 | NA | DNA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
Phaeodactylum tricornutum: An established model species for diatom molecular research and an emerging chassis for algal synthetic biology
2023-12, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.13400
PMID:37975560
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研究论文 | 本文综述了Phaeodactylum tricornutum作为硅藻分子研究和藻类合成生物学新兴底盘的贡献 | Phaeodactylum tricornutum作为一种非典型硅藻，因其易于实验室培养和基因表达操作工具的增加，已成为硅藻分子研究的重要模型，并逐渐成为藻类过程工程和合成生物学的新工具 | NA | 探讨Phaeodactylum tricornutum在硅藻生物学研究和藻类合成生物学中的应用 | Phaeodactylum tricornutum | 分子生物学 | NA | 基因表达操作 | NA | 基因组信息 | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability
2023-08-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14081635
PMID:37628687
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研究论文 | 本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现 | 本文证实了在多细胞群体形成时，集体层面的遗传性不仅存在，而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性 | NA | 探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现 | 多细胞生物的性状遗传性 | NA | NA | 分析模型、合成生物学、生物学模拟 | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体（TERMs）的神经网络模型，提出了一种新的蛋白质设计方法，通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合，提出两种神经网络架构（TERMinator和COORDinator），用于生成序列空间的Potts模型，并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能，如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA |