合成生物学相关文章
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当前共找到 375 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-09-11 |
Genome mining of cryptic bisabolenes that were biosynthesized by intramembrane terpene synthases from Antrodia cinnamomea
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0033
PMID:36633275
|
研究论文 | 本文通过基因组挖掘方法，发现了一种来自Antrodia cinnamomea的真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶，能够合成(+)-(,)-α-bisabolene，并揭示了其生物合成途径 | 首次发现真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶能够合成bisabolene，并鉴定了相关的修饰酶 | NA | 揭示真菌中bisabolene的生物合成途径及其酶学机制 | Antrodia cinnamomea中的萜烯合酶及其生物合成途径 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-09-11 |
Success probability of high-affinity DNA aptamer generation by genetic alphabet expansion
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0031
PMID:36633272
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研究论文 | 本文研究了通过遗传字母扩展生成高亲和力DNA适配体的成功概率 | 引入了非天然碱基作为第五个字母，显著提高了DNA适配体对目标蛋白的亲和力 | 生成高亲和力UB-DNA适配体的成功概率仍需提高 | 评估生成高亲和力DNA适配体的成功概率，并探讨通过引入非天然碱基提高传统适配体亲和力的可能性 | 高亲和力DNA适配体及其生成方法 | NA | NA | 遗传字母扩展 | NA | NA | 多个UB-DNA适配体作为示例 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-09-11 |
A conserved SH3-like fold in diverse putative proteins tetramerizes into an oxidoreductase providing an antimicrobial resistance phenotype
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0040
PMID:36633286
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研究论文 | 本文探讨了一种非催化蛋白折叠如何演变为具有生存必需的催化活性的潜在机制 | 首次揭示了SH3-like折叠在现代耐药组中出现的潜在进化路径 | NA | 研究DfrB酶及其同源物的结构和功能，揭示其催化活性和耐药性的机制 | DfrB酶及其同源物的SH3-like折叠 | 生物化学 | NA | 结构和生物物理表征 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 从数据库中识别的DfrB同源物 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-09-11 |
Allosteric inhibition of Staphylococcus aureus MenD by 1,4-dihydroxy naphthoic acid: a feedback inhibition mechanism of the menaquinone biosynthesis pathway
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0035
PMID:36633276
|
研究论文 | 研究了1,4-二羟基萘甲酸对金黄色葡萄球菌MenD的变构抑制作用及其在甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制 | 发现1,4-二羟基萘甲酸对MenD的变构抑制作用在不同属中是保守的机制 | NA | 探讨甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制及其在不同属中的保守性 | 金黄色葡萄球菌MenD酶及其下游代谢物1,4-二羟基萘甲酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-09-11 |
Crystal structures of 'ALternative Isoinformational ENgineered' DNA in B-form
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0028
PMID:36633282
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研究论文 | 研究了在B型结构中的人工DNA的晶体结构，特别是ALIEN DNA的结构特征 | 首次确定了含有非天然核苷酸对的ALIEN DNA在B型结构中的高分辨率晶体结构，并发现其具有比天然DNA更多的B型结构变体 | NA | 研究人工DNA在B型结构中的结构特征 | ALIEN DNA及其在B型结构中的晶体结构 | NA | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | 三个包含5'-CTTAAG的复合物，每个复合物含有16 bp的自互补双链寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-09-11 |
On-demand biomanufacturing through synthetic biology approach
2023-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100518
PMID:36636637
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学方法实现按需生物制造的进展，并提出了未来方向 | 利用合成生物学技术重新设计无细胞系统和活细胞，以实现便携式、现场和按需制造生物分子 | NA | 探讨通过合成生物学方法实现按需生物制造的潜力和未来方向 | 生物制药产品，包括蛋白质疗法、工程化蛋白质疫苗和单克隆抗体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-09-07 |
Engineered probiotics introduced to improve intestinal microecology for the treatment of chronic diseases: present state and perspectives
2023-Dec, Journal of diabetes and metabolic disorders
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s40200-023-01279-1
PMID:37975092
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综述 | 本文综述了合成生物学在改善肠道微生态以治疗慢性疾病中的应用现状和前景 | 合成生物学技术提高了肠道微生态疗法的鲁棒性和可控性，成为下一代微生态疗法的重要组成部分 | 传统微生态疗法如益生元疗法、益生菌疗法和粪便微生物群移植疗法仍面临安全性和可控性低的问题 | 总结合成生物学在肠道微生态疗法治疗慢性疾病中的应用 | 合成生物学在肠道微生态疗法中的应用，涉及代谢疾病、消化疾病和神经退行性疾病 | NA | 慢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-09-01 |
Phase Separation in Biology and Disease; Current Perspectives and Open Questions
2023-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.167971
PMID:36690068
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚物（biomolecular condensates）的存在、形成、生物功能及其与疾病关联的研究进展，并探讨了该领域的关键问题和未来方向 | 生物分子凝聚物通过相分离形成，这一发现革新了我们对细胞内生物分子空间和时间组织方式的理解 | 尽管在某些情况下，生物分子凝聚物的形成与生物功能之间的联系得到了严格证据的支持，但在许多其他情况下，这种联系的支持不够充分，导致了对相分离在生物学和疾病中普遍作用的合理审查 | 探讨生物分子凝聚物在多种生物过程和系统中的作用，以及其在正常和疾病细胞状态中的应用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 生物分子凝聚物及其在生物学和疾病中的作用 | 生物学 | 神经退行性疾病，癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-16 |
Genome Engineering for Next-Generation Cellular Immunotherapies
2023-12-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00340
PMID:35930700
|
研究论文 | 本文探讨了通过基因组工程技术改进下一代细胞免疫疗法的策略 | 利用CRISPR-Cas系统和合成生物学方法，开发具有更高效力和精细模块控制的细胞疗法，并提供同种异体疗法开发的工具包 | 目前尚未提及具体限制 | 克服现有细胞免疫疗法中的挑战，如抗原逃逸、肿瘤微环境中的免疫抑制、毒性和靶向非肿瘤效应 | CAR-T、TCR-T、NK细胞疗法及其他免疫细胞类型 | 基因组学 | 癌症 | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-06 |
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis
2023-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.10.548208
PMID:37503273
|
研究论文 | 本研究展示了时间分辨的蛋白质合成技术揭示细胞信号传递的不同阶段 | 开发了一种邻近触发的蛋白质转拼接技术，可以时间分辨地合成目标蛋白，揭示与癌症转化相关的新型治疗靶标 | 在抽象中未提及具体的样本大小和实验条件 | 利用合成生物学工具操控细胞状态并揭示细胞信号传递的动态过程 | 应用于包括BCR/ABL和DNAJB1/PRKACA等多种蛋白的细胞磷酸化事件 | 合成生物学 | 癌症 | 邻近触发的蛋白质转拼接技术 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-05 |
Reprogramming the Cyclization Cascade of epi-Isozizaene Synthase to Generate Alternative Terpene Products
2023-08-01, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00247
PMID:37449555
|
研究论文 | 该文章介绍了通过重塑epi-Isozizaene合酶的活性位点，来生成替代的萜烯产品。 | 通过突变将芳香残基替换为极性残基，重新定向了环化级联反应，生成了不同的萜烯产品。 | 未提及特定的局限性 | 研究旨在开发设计师环化酶以产生高价值的萜烯产品，适用于合成生物学。 | 对四种EIZS突变体的生化和结构特征进行表征。 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | NA | 四种EIZS突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-05 |
Beyond natural biology: rewiring cellular networks to study innate immunity
2023-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2023.102349
PMID:37269786
|
综述 | 本文描述了合成生物学在研究固有免疫网络中的应用 | 提出了通过合成生物学方法重新连接细胞网络，创新性地研究模式识别受体信号传导及其与病毒的相互作用 | 文中未提及具体的实验数据或样本分析 | 研究合成生物学如何促进对固有免疫信号的理解 | 模式识别受体信号传导、病毒-宿主相互作用和系统性细胞因子反应 | 合成生物学 | NA | 化学输入或光遗传学输入 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Cutting Out COVID: Tackling COVID (and more) with synthetic biology
2023-Mar-01, Scientific American
IF:3.1Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-07 |
Understanding Autologous Spliceostatin Transcriptional Regulation to Derive Parts for Heterologous Expression in a Burkholderia Bacterial Host
2023-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00228
PMID:37338297
|
研究论文 | 研究利用β-变形菌FERM BP-3421作为合成生物学平台，探索其天然产物的发现与开发 | 开发了一种Fr9A调控的启动子系统，用于优化异源表达，并成功应用于GFP和capistruin lasso肽的表达 | NA | 开发合成生物学平台以促进天然产物的发现 | β-变形菌FERM BP-3421及其产生的autologous spliceostatins | 合成生物学 | NA | 转录组学、绿色荧光蛋白（GFP）报告基因检测 | NA | 转录组数据、荧光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Engineered calprotectin-sensing probiotics for IBD surveillance in humans
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221121120
PMID:37523538
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研究论文 | 本文介绍了一种能够检测炎症性肠病（IBD）生物标志物——钙卫蛋白的工程化益生菌 | 利用合成生物学技术，开发了一种能够在IBD患者中特异性检测钙卫蛋白的工程化益生菌 | 目前仅在啮齿动物模型和患者粪便样本中进行了测试，需要进一步的人体临床试验验证 | 开发一种非侵入性的方法来监测IBD患者的疾病活动 | 工程化益生菌在IBD患者中的应用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | 粪便样本 | 啮齿动物模型和人类患者粪便样本 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
MaxCal can infer models from coupled stochastic trajectories of gene expression and cell division
2023-07-11, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2023.05.017
PMID:37218129
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研究论文 | 本文展示了最大熵原理（MaxCal）结合贝叶斯框架，可以从耦合的随机轨迹数据中推断出细胞和分子层面的细节信息 | 提出了使用MaxCal方法从耦合的随机轨迹数据中推断细胞分裂速率、蛋白质生产和降解速率等细节信息，即使在数据存在荧光噪声的情况下也能有效 | 文章主要使用合成数据进行验证，实际生物系统中的应用效果需要进一步验证 | 探索如何从耦合的基因表达和细胞分裂的随机轨迹数据中推断模型 | 基因表达和细胞分裂的耦合随机轨迹 | 生物信息学 | NA | 最大熵原理（MaxCal） | 贝叶斯框架 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Enzymatic Fluoromethylation Enabled by the S-Adenosylmethionine Analog Te-Adenosyl-L-(fluoromethyl)homotellurocysteine
2023-May-24, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.2c01385
PMID:37252363
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研究论文 | 本文描述了一种新型生物相关氟甲基化试剂Te-Adenosyl-L-(fluoromethyl)homotellurocysteine（FMeTeSAM）的合成及其应用 | FMeTeSAM与细胞内通用甲基供体S-腺苷甲硫氨酸（SAM）结构和化学相关，支持氟甲基团向氧、氮、硫和某些碳亲核体的稳健转移 | NA | 探索氟甲基、二氟甲基和三氟甲基在药物和农药中的应用及其对分子疗效和代谢稳定性的影响 | 新型氟甲基化试剂FMeTeSAM及其在复杂天然产物如oxaline和daunorubicin中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
Opportunities to accelerate extracellular vesicle research with cell-free synthetic biology
2023-May, Journal of extracellular biology
DOI:10.1002/jex2.90
PMID:38938277
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研究论文 | 本文探讨了利用无细胞合成生物学加速外泌体研究的机会和挑战 | 提出利用无细胞基因表达系统进行外泌体的理性工程设计和制造，以用于基础或转化外泌体研究 | 目前对外泌体异质性、货物装载机制和外泌体计量学的理解存在局限 | 加速外泌体研究和其在医疗应用中的发展 | 外泌体的生物发生机制及其在医疗传感器和治疗生物制造平台中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Multiplex Single-Nucleotide Microbial Genome Editing Achieved by CRISPR-Cas9 Using 5'-End-Truncated sgRNAs
2023-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00323
PMID:37368988
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研究论文 | 本文通过使用5'-端截断的单分子引导RNA（sgRNA）方法，实现了CRISPR-Cas9系统在微生物基因组中高效且精确的单核苷酸水平多重编辑 | 采用5'-端截断的sgRNA方法，提高了基因编辑的效率和准确性，并成功应用于多个基因的同时编辑 | 未提及具体限制 | 探索CRISPR-Cas9系统在微生物基因组编辑中的应用，特别是单核苷酸水平的多重编辑 | 微生物基因组中的特定基因 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
De novo design of protein interactions with learned surface fingerprints
2023-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05993-x
PMID:37100904
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研究论文 | 本文利用几何深度学习框架在蛋白质表面生成指纹，描述驱动蛋白质-蛋白质相互作用的几何和化学特征，以实现蛋白质相互作用的新设计。 | 提出了一种基于蛋白质表面指纹的新型计算设计方法，用于设计新型蛋白质相互作用。 | NA | 探索蛋白质相互作用的分子决定因素，并开发一种新的计算方法来设计蛋白质结合剂。 | 蛋白质相互作用及其在合成生物学和转化应用中的设计。 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | NA | 蛋白质结构数据 | 涉及四个蛋白质目标：SARS-CoV-2 spike, PD-1, PD-L1 和 CTLA-4。 | NA | NA | NA | NA |