合成生物学相关文章
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当前共找到 349 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac733
PMID:36100255
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研究论文 | 本文通过新的结构和生化数据，提出了一种新的Tn3解离酶复合体（synaptosome）的详细模型，并讨论了其如何利用DNA拓扑结构来调节重组酶的酶活性 | 本文提出了一个新的、详细的Tn3解离酶复合体模型，该模型基于新的结构和生化数据，解决了之前模型与实验数据不一致的问题 | NA | 研究Tn3解离酶如何通过DNA拓扑结构来调节其酶活性 | Tn3解离酶及其复合体（synaptosome） | NA | NA | NA | NA | 结构和生化数据 | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
Construction of the genetic switches in response to mannitol based on artificial MtlR box
2023-Jan-30, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00634-7
PMID:38647829
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠的工作流程，用于设计两种类型的遗传元件：基于MtlR盒的开关元件和基于catabolite control protein A (CcpA)盒的转录调控元件，这些元件能够响应甘露醇进行ON/OFF状态的选择。 | 本研究通过理性设计MtlR盒和CcpA盒，实现了对遗传开关的灵活调控，显著提高了开关对诱导物的敏感性，并大幅降低了OFF状态的值。 | 由于对特定转录因子与其目标基因相互作用的分子机制理解不足，遗传开关的理性设计进展有限。 | 设计新型的遗传开关，以在合成生物学中实现代谢途径的精确控制。 | 基于MtlR盒和CcpA盒的遗传开关元件。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传元件 | NA |
| 183 | 2024-08-07 |
Application of synthetic lipid droplets in metabolic diseases
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1441
PMID:37997538
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综述 | 本文综述了内源性脂滴的组装和功能，以及合成脂滴模型在生物学中的最新进展和应用挑战 | 开发了体外合成脂滴的方法，并在蛋白质结合、脂质功能、膜动力学和酶反应方面取得了显著进展 | 细胞生物学方法的局限性导致脂滴功能的分子机制尚未完全理解 | 全面概述脂滴的组装和功能，并探讨合成脂滴模型在未来的实际应用中的作用和挑战 | 脂滴及其在代谢疾病中的作用 | 合成生物学 | 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Two neglected but valuable genetic tools for Escherichia coli and other bacteria: In vivo cosmid packaging and inducible plasmid replication
2023-12, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.15171
PMID:37770255
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研究论文 | 本文介绍了两种被忽视但有价值的遗传工具：大肠杆菌和其他细菌中的体内cosmid包装和可诱导质粒复制 | 通过操纵包装噬菌体和宿主，解决了体内cosmid包装效率低和污染问题，实现了仅包含cosmid DNA的颗粒 | 质粒难以从细胞中去除，但可诱导复制质粒提供了一种“治愈”质粒的方法 | 探索在生理学和合成生物学中，如何高效且无损地将基因引入细菌宿主 | 大肠杆菌和其他细菌 | 合成生物学 | NA | 体内cosmid包装，可诱导质粒复制 | NA | DNA | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Phaeodactylum tricornutum: An established model species for diatom molecular research and an emerging chassis for algal synthetic biology
2023-12, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.13400
PMID:37975560
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研究论文 | 本文综述了Phaeodactylum tricornutum作为硅藻分子研究和藻类合成生物学新兴底盘的贡献 | Phaeodactylum tricornutum作为一种非典型硅藻，因其易于实验室培养和基因表达操作工具的增加，已成为硅藻分子研究的重要模型，并逐渐成为藻类过程工程和合成生物学的新工具 | NA | 探讨Phaeodactylum tricornutum在硅藻生物学研究和藻类合成生物学中的应用 | Phaeodactylum tricornutum | 分子生物学 | NA | 基因表达操作 | NA | 基因组信息 | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability
2023-08-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14081635
PMID:37628687
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研究论文 | 本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现 | 本文证实了在多细胞群体形成时，集体层面的遗传性不仅存在，而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性 | NA | 探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现 | 多细胞生物的性状遗传性 | NA | NA | 分析模型、合成生物学、生物学模拟 | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体（TERMs）的神经网络模型，提出了一种新的蛋白质设计方法，通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合，提出两种神经网络架构（TERMinator和COORDinator），用于生成序列空间的Potts模型，并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能，如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
Engineering Cyborg Bacteria Through Intracellular Hydrogelation
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204175
PMID:36628538
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research paper | 本文首次创建了名为Cyborg Cells的混合材料-细胞实体，通过在每个细菌内部组装合成聚合物网络，使其失去分裂能力，同时保留了细胞代谢、运动、蛋白质合成等基本功能，并获得了抵抗压力因素的新能力，还展示了其对癌细胞的侵入治疗潜力。 | 首次创建了Cyborg Cells，结合了细胞内人造聚合物与活细胞蛋白质网络的相互作用，为细胞生物工程建立了新的范式。 | NA | 探索细胞生物工程的新方法，通过创建Cyborg Cells来实现更可控的生物医学应用。 | Cyborg Cells及其在生物医学应用中的潜力。 | synthetic biology | NA | intracellular hydrogelation | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-07 |
Functional characterization of four mono-terpene synthases (TPSs) provided insight into the biosynthesis of volatile monoterpenes in the medicinal herb Blumea balsamifera
2023-Apr, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-023-01306-8
PMID:37187774
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研究论文 | 本研究通过转录组测序结合代谢组学分析，筛选并克隆了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶基因，并通过异源表达和体外酶活性测定验证了其功能 | 首次鉴定并功能验证了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶，揭示了其挥发性单萜的生物合成途径 | NA | 旨在通过生物工程手段缓解Blumea balsamifera资源短缺问题，并提高其活性成分的产量 | Blumea balsamifera中的单萜合酶基因及其编码的酶 | 生物工程 | NA | 转录组测序，代谢组学分析，异源表达，体外酶活性测定 | NA | 基因序列，代谢物 | 根、茎、叶中的基因和代谢物 |
| 190 | 2024-08-07 |
De novo design of modular peptide-binding proteins by superhelical matching
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05909-9
PMID:37020023
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研究论文 | 本文介绍了一种通过超螺旋匹配设计模块化肽结合蛋白的新方法 | 利用几何哈希技术识别与双齿氢键兼容的蛋白骨架和肽对接排列，并通过优化蛋白序列以实现折叠和肽结合 | NA | 设计具有序列特异性的肽结合蛋白，以应用于蛋白质组学和合成生物学 | 模块化肽结合蛋白及其与肽的相互作用 | 蛋白质工程 | NA | 几何哈希技术 | NA | 蛋白质结构 | 设计了六种不同的三肽重复序列结合蛋白 |
| 191 | 2024-08-07 |
Engineering living materials by synthetic biology
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0115645
PMID:38505813
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程化活体材料的研究进展，并讨论了面临的挑战和未来的机遇 | 受自然生物材料系统的启发，本文探讨了模仿其复杂精细制造过程和功能的新兴领域 | NA | 探讨合成生物学与材料科学交叉领域的活体材料工程 | 活体材料及其在环境刺激响应和与无机物质耦合中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Protein and peptide engineering for chemical exchange saturation transfer imaging in the age of synthetic biology
2023-06, NMR in biomedicine
IF:2.7Q1
DOI:10.1002/nbm.4712
PMID:35150021
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综述 | 本文综述了化学交换饱和转移（CEST）成像中基于蛋白质的对比剂的发展历程，并讨论了合成生物学对其未来发展的影响 | 介绍了基于多肽的CEST对比剂的设计和工程化，以及酶-底物对作为CEST对比增强剂的合理化 | NA | 探讨如何提高多肽的选择性、特异性及CEST对比度，并讨论合成生物学对下一代基于蛋白质的CEST对比剂开发的影响 | 基于蛋白质的CEST对比剂及其在成像中的应用 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移成像（CEST） | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Synthetic biology identifies the minimal gene set required for paclitaxel biosynthesis in a plant chassis
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.016
PMID:37897038
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研究论文 | 本研究通过转录组学、细胞生物学、代谢组学和途径重构的综合方法，确定了在植物底盘中异源生产紫杉醇所需的最小基因集 | 本研究识别了紫杉醇生物合成中缺失的步骤，并通过在烟草中异源表达确认了大部分缺失酶的活性，特别是发现了一种新的C4β-C20环氧化酶，克服了代谢工程的第一个瓶颈 | NA | 确定紫杉醇生物合成所需的最小基因集，并探索植物产生复杂生物活性代谢物的独特化学机制 | 紫杉醇生物合成途径中的基因和酶 | 生物技术 | 癌症 | 转录组学, 细胞生物学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 涉及烟草（Nicotiana benthamiana）作为实验对象 |
| 194 | 2024-08-07 |
A unified approach to dissecting biphasic responses in cell signaling
2023-Dec-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86520
PMID:38054655
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研究论文 | 本文通过分析从基本生化构建模块到典型网络结构再到特征明显的实例的信号系统，以及不同类型的剂量，提供了一个统一的理论综合来解析细胞信号系统中的双相响应 | 揭示了双相响应存在的设计原则、结构因素、酶和底物的双相响应组合、广泛鲁棒的双相响应可能性、网络中信号行为的完全改变以及Erk信号网络中不同共存双相响应的倾向 | NA | 解析细胞信号系统中的双相响应 | 细胞信号系统中的双相剂量响应 | 生物学 | NA | 分析和计算方法 | NA | 模型 | 范围广泛的系统 |
| 195 | 2024-08-07 |
Engineered NF-κB siRNA-encapsulating exosomes as a modality for therapy of skin lesions
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109381
PMID:36845116
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研究论文 | 本文开发了一种合成生物学策略，通过将外泌体与人工遗传电路整合，使脂肪间充质干细胞表达并将siRNA组装进外泌体，实现对皮肤损伤小鼠模型的治疗。 | 首次将siRNA疗法应用于皮肤治疗，通过外泌体作为有效递送载体，实现siRNA的体内递送。 | NA | 开发一种新的治疗皮肤损伤的基因疗法。 | 皮肤损伤的小鼠模型。 | 基因疗法 | 皮肤损伤 | siRNA | NA | 细胞 | 小鼠 |
| 196 | 2024-08-07 |
Bioconversion of C1 feedstocks for chemical production using Pichia pastoris
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.006
PMID:36967258
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综述 | 本文综述了利用毕赤酵母（Pichia pastoris）进行C1原料生物转化以生产化学品的潜力和策略 | 探讨了毕赤酵母通过代谢工程或与电催化结合利用CO的潜力，并提出了合成生物学和材料科学的新视角 | NA | 探讨利用毕赤酵母进行C1原料生物转化的挑战和可行策略 | 毕赤酵母在C1原料生物转化中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Modularized synthetic biology enabled intelligent biosensors
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.005
PMID:36967259
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综述 | 本文综述了智能合成生物学驱动的生物传感器（SBBs）的最新进展及其在即时检测（POCT）和可穿戴监测中的应用 | 介绍了智能SBBs在计算、存储和自校准方面的能力，以及其在实际应用中的适应性 | NA | 探讨智能合成生物学生物传感器的发展及其应用前景 | 智能合成生物学生物传感器及其在即时检测和可穿戴监测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学模块化技术 | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology to enhance ocean health
2023-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2022.12.015
PMID:36669947
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法增强海洋健康的框架 | 提出利用合成生物学工具创新性地增强海洋生物系统的自然适应能力，以应对人类活动引起的快速变化 | NA | 探索合成生物学在解决海洋塑料污染、珊瑚白化和有害藻华等问题中的应用 | 海洋健康、塑料污染、珊瑚白化、有害藻华 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Crystal structure and activity of a de novo enzyme, ferric enterobactin esterase Syn-F4
2023-09-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2218281120
PMID:37695900
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研究论文 | 本文描述了从头设计的酶Syn-F4的晶体结构及其活性 | Syn-F4的结构和活性位点与天然enterobactin酯酶完全不同，展示了从头设计的蛋白质可以通过与自然界中出现的结构和机制截然不同的方式提供生命维持的催化活性 | NA | 研究从头设计的酶的结构和活性 | Syn-F4酶及其催化活性 | 生物技术 | NA | 晶体结构分析 | 四螺旋束 | 蛋白质结构 | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Pathway to Nucleoside Triphosphates for Expanded Genetic Alphabets
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00060
PMID:37227319
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中通过重排氢键供体和受体基团来形成12种独立复制核苷酸的方法，并介绍了利用“多磷酸激酶”制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 首次报道了利用“多磷酸激酶”与天然二磷酸激酶和工程化核苷酸激酶合作，制造AEGIS三磷酸的途径，包括第三代三磷酸，其在活细菌细胞中的生存能力得到改善。 | NA | 探索合成生物学中扩展遗传字母表的途径，特别是制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 12种独立复制的核苷酸及其三磷酸的合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多磷酸激酶 | NA | NA | NA |