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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2024-08-07 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 本文探讨了合成生物学与机器学习在癌症治疗中的应用,特别是通过非自然信号传导途径和复杂的合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤特性 | 文章介绍了通过机器学习辅助筛选过程,成功预测CAR T细胞表型依赖于信号传导模体选择的新方法,以及合成锌指蛋白作为可控转录调节因子的应用 | NA | 探索合成生物学和机器学习如何通过新的技术手段增强工程化T细胞的抗肿瘤能力 | CAR T细胞的信号传导途径和合成基因电路的设计 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | 机器学习 | 基因电路 | NA |
202 | 2024-08-07 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-Dec-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
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综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞疗法方法,重点介绍了自体软骨细胞移植和矩阵自体软骨细胞移植,并探讨了干细胞在骨关节炎软骨修复中的潜力以及合成生物学在基因工程细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎中的应用 | 探讨了干细胞和合成生物学在软骨修复和骨关节炎治疗中的新应用 | NA | 综述关节软骨再生的细胞疗法方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨及其在骨关节炎中的病理 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 细胞疗法和合成生物学 | NA | NA | NA |
203 | 2024-08-07 |
Graphene oxide aptasensor droplet assay for detection of metabolites secreted by single cells applied to synthetic biology
2023-12-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00959a
PMID:38054213
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研究论文 | 本文开发了一种新型的可修改石墨烯氧化物(GO)适配体传感器,用于检测单细胞分泌的不同目标化合物,应用于合成生物学领域 | 利用荧光标记的适配体通过π-π堆积作用稳定地锚定在GO上,以最小化非特异性相互作用,实现低背景检测和高信噪比 | NA | 开发一种高灵敏度和灵活性的单细胞分泌检测方法,用于合成生物学中的生物生产 | 单细胞分泌的代谢物,如ATP和naringenin | 合成生物学 | NA | 石墨烯氧化物(GO)适配体传感器 | NA | 代谢物 | 单细胞 |
204 | 2024-08-07 |
Biosensor-guided discovery and engineering of metabolic enzymes
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108251
PMID:37690614
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综述 | 本文综述了利用生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和工程化代谢酶方面的应用 | 开发了基于遗传编码的生物传感器,用于在细胞内特定检测由酶活性产生的目标分子,从而促进目标酶的高通量筛选 | 酶发现和工程化中的一个主要挑战是从广泛的酶库中有效筛选具有所需表型的酶 | 探讨生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和改进酶特性中的应用 | 代谢酶的发现和工程化 | 生物技术 | NA | 高通量筛选 | NA | 酶活性数据 | NA |
205 | 2024-08-07 |
Ribosomal incorporation of negatively charged d-α- and N-methyl-l-α-amino acids enhanced by EF-Sep
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0038
PMID:36633283
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研究论文 | 研究通过使用EF-Tu变体EF-Sep和人工开发的嵌合tRNA,成功增强了负电荷d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸在新生肽中的整合效率 | 首次展示了包含多个d-Asp或Asp的巨环肽的核糖体合成 | NA | 研究如何提高负电荷氨基酸在新生肽中的整合效率 | d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸的整合效率 | 生物化学 | NA | 核糖体合成 | EF-Tu变体EF-Sep | 氨基酸 | NA |
206 | 2024-08-07 |
Rethinking nucleic acids from their origins to their applications
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0027
PMID:36633284
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综述 | 本文综述了实验室在过去三十年中关于合成生物学的研究,探讨了替代标准DNA和RNA的信息系统的生成及其在支持达尔文进化和理解其自然历史中的应用 | 合成生物学已生成多种能够支持分子信息进化的分子系统,这些替代标准DNA和RNA的系统支持生物技术应用,如DNA合成、人类诊断、生物医学研究和医学 | 需要多电解质结构和尺寸规则的构建块来支持信息聚合物以支持达尔文进化 | 探讨核苷酸的起源及其在地球和宇宙中的应用,以及它们如何支持生命和达尔文进化 | 核苷酸及其替代分子系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
207 | 2024-08-07 |
Perseverance of protein homeostasis despite mistranslation of glycine codons with alanine
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0029
PMID:36633285
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研究论文 | 研究探讨了人类tRNA变异体在甘氨酸密码子处误读为丙氨酸对蛋白质稳态的影响 | 发现自然发生的tRNA变异体在甘氨酸密码子处误读为丙氨酸,尽管在正常条件下被容忍,但在蛋白酶体抑制的条件下会抑制蛋白质合成 | 研究仅限于特定的tRNA变异体和特定的氨基酸误读情况 | 探究特定tRNA变异体对蛋白质合成和稳态的影响 | 人类tRNA变异体及其对蛋白质合成的影响 | NA | NA | 质谱分析 | NA | 蛋白质数据 | 涉及多种tRNA变异体和哺乳动物细胞 |
208 | 2024-08-07 |
Functionalized DNA-Origami-Protein Nanopores Generate Large Transmembrane Channels with Programmable Size-Selectivity
2023-01-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c11226
PMID:36577119
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研究论文 | 本文利用pneumolysin(PLY)和DNA折纸技术构建了具有可编程尺寸选择性的大型跨膜纳米孔 | 首次结合PLY毒素和DNA折纸技术构建了可功能化的大型纳米孔,具有均匀的孔径和可编程的尺寸选择性 | NA | 开发新型生物传感器和合成细胞构建技术 | 跨膜纳米孔的工程化 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | 纳米孔 | 涉及脂质体和红细胞 |
209 | 2024-08-07 |
Advances in Metabolic Engineering of Plant Monoterpene Indole Alkaloids
2023-Jul-27, Biology
DOI:10.3390/biology12081056
PMID:37626942
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综述 | 本文综述了植物单萜吲哚生物碱(MIAs)代谢工程的最新进展和策略 | 探讨了通过合成生物学方法在异源宿主中增加MIAs产量和扩展其化学多样性的策略 | 讨论了当前制造MIAs的问题和未来发展 | 旨在通过代谢工程和合成生物学方法提高MIAs的产量和多样性 | 植物单萜吲哚生物碱(MIAs) | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
210 | 2024-08-07 |
RNAs as Sensors of Oxidative Stress in Bacteria
2023-06-08, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了氧化应激的本质,强调了已知的蛋白质传感器(转录因子)作为氧化应激中分子传感器标准的作用,并描述了探索RNA直接感受氧化应激潜力的分子研究 | RNA传感器有望成为理解和调控细菌氧化应激反应中动态生物途径的关键层,代表了合成生物学的重要前沿 | 关于RNA传感器的知识存在空白,特别是关于RNA核苷酸化学修饰的部分 | 探讨RNA作为细菌中氧化应激传感器的潜力 | RNA传感器在氧化应激反应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
211 | 2024-08-07 |
Engineering a dual vaccine against COVID-19 and tuberculosis
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1273019
PMID:37965265
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研究论文 | 研究通过合成生物技术构建了一种重组BCG菌株AspikeRBD,该菌株表达由Ag85A蛋白和SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域(RBD)组成的融合蛋白,旨在开发一种针对COVID-19和结核病的双重疫苗 | 首次成功构建了一种能够同时表达Ag85A蛋白和SARS-CoV-2 RBD的重组BCG菌株,显示出对两种疾病的免疫反应增强 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中进行临床试验 | 开发一种新型双重疫苗,同时预防COVID-19和结核病 | 重组BCG菌株AspikeRBD的免疫效果及其作为双重疫苗的潜力 | NA | COVID-19和结核病 | 合成生物技术 | NA | NA | 老鼠模型 |
212 | 2024-08-07 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543449
PMID:37398067
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研究论文 | 本文利用计算设计方法,研究了蛋白质基材料的宏观粘弹性与其微观结构之间的关系 | 通过计算设计,实现了对蛋白质水凝胶的宏观粘弹性的系统编程和模块化构建 | NA | 探索分子参数如何影响蛋白质水凝胶的宏观粘弹性 | 蛋白质水凝胶的粘弹性特性 | 生物医学工程 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 蛋白质 | 包含2、5、24或120个蛋白质成分的对称蛋白质同寡聚体 |
213 | 2024-08-07 |
A New EBS2b-IBS2b Base Paring (A-8/T-8) Improved the Gene-Targeting Efficiency of Thermotargetron in Escherichia coli
2023-Feb-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03159-22
PMID:36809044
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research paper | 本文通过构建随机基因靶向质粒池(RGPP),研究了Thermotargetron(TMT)在不同靶点上的基因靶向效率,并发现了一种新的EBS2b-IBS2b碱基配对(A/T)显著提高了TMT的基因靶向效率。 | 发现了一种新的EBS2b-IBS2b碱基配对(A/T),显著提高了Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率,并开发了基于新序列识别角色的计算机算法(TMT 1.0)。 | TMT在不同靶点上的基因靶向效率存在显著差异,导致成功率相对较低。 | 提高Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率和成功率,扩展其在耐热中温菌和耐热菌基因组工程中的应用。 | Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率和序列识别偏好。 | 基因工程 | NA | 基因靶向技术 | NA | DNA序列 | 随机基因靶向质粒池(RGPP)中的多个样本 |
214 | 2024-08-07 |
Cell-Free Dot Blot: an Ultra-Low-Cost and Practical Immunoassay Platform for Detection of Anti-SARS-CoV-2 Antibodies in Human and Animal Sera
2023-Jan-31, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02457-22
PMID:36719206
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研究论文 | 介绍了一种名为细胞自由点印迹(CFDB)的超低成本免疫诊断平台,用于快速检测人类和动物血清中的抗SARS-CoV-2抗体 | CFDB方法的创新之处在于使用线性DNA在无细胞表达系统中产生融合了SpyTag肽的目标病毒抗原,无需传统克隆和抗原纯化;使用由大肠杆菌生产的SpyCatcher2-Apex2作为通用次级检测试剂;血清直接点在硝酸纤维素膜上,简化了下游孵育和洗涤步骤 | NA | 开发一种快速适应、经济实惠且全球可访问的诊断平台,以应对现有和新兴的公共卫生威胁,如COVID-19大流行 | 检测人类和动物血清中的抗SARS-CoV-2抗体 | 生物技术 | COVID-19 | 细胞自由点印迹(CFDB) | NA | 血清 | 人类血清(23份阴性,36份阳性)和仓鼠血清(16份阴性,36份阳性) |
215 | 2024-08-07 |
The Use of Cell-free Protein Synthesis to Push the Boundaries of Synthetic Biology
2023-Jan-14, Biotechnology and bioprocess engineering : BBE
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s12257-022-0279-2
PMID:36687336
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成的关键发展及其在合成生物学中的应用 | 无细胞系统利用提取的合成细胞机器,解决了活体系统复杂性和变异性的问题,提供了高灵活性和可访问性 | NA | 探讨无细胞蛋白合成系统的发展及其未来方向 | 无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 遗传信息 | NA |
216 | 2024-08-07 |
Unlocking the secrets of the microbiome: exploring the dynamic microbial interplay with humans through metabolomics and their manipulation for synthetic biology applications
2023-06-28, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210534
PMID:37378961
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综述 | 本文综述了代谢组学在探索微生物与人类动态相互作用及其在合成生物学应用中的应用 | 强调了代谢组学在生物科学中的广泛应用,特别是在微生物系统及其在宿主和环境中的复杂相互作用 | 仍存在挑战需要克服,以最大化代谢组学在理解生物系统中的潜力 | 探讨代谢组学在合成生物学和肠道微生物与人类宿主相互作用中的应用 | 微生物组及其与人类和环境的相互作用 | NA | NA | GC-MS, LC-MS | NA | 代谢物 | NA |
217 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of cannabigerol and cannabigerolic acid: the gateways to further cannabinoid production
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad010
PMID:37323510
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研究论文 | 本文描述了通过识别和重新利用芳香性异戊二烯转移酶(AtaPT),结合天然酶,形成在细胞裂解液中生产cannabigerolic acid(CBGA)和在完整细胞中生产cannabigerol(CBG)的生产系统 | 首次展示了在微生物系统中通过优化的合成生物学平台进行CBG生物合成的技术 | NA | 建立可持续生产经过充分研究和稀有大麻素的基础 | cannabigerolic acid(CBGA)和cannabigerol(CBG)的生物合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
218 | 2024-08-07 |
Redox-enabled electronic interrogation and feedback control of hierarchical and networked biological systems
2023-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44223-w
PMID:38129428
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研究论文 | 本文探讨了通过氧化还原反应在生物系统中实现微电子设备与生物体的直接通信,并展示了在蛋白质、细胞和细胞群等多个层次上对生物系统进行电子询问和控制的方法 | 通过工程化生物的天然氧化还原网络,实现了对生物系统的电子询问和控制,并开发了电生物制造、电极驱动的氧化还原数据传输和氧化还原连接的合成生物学技术 | NA | 探索和开发对生物系统进行复杂控制的方法 | 蛋白质、细胞和细胞群等生物系统的电子询问和控制 | 生物技术 | NA | 氧化还原反应 | NA | 电子信息 | NA |
219 | 2024-08-07 |
A Small-Molecule Approach to Bypass In Vitro Selection of New Aptamers: Designer Pre-Ligands Turn Baby Spinach into Sensors for Reactive Inorganic Targets
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551132
PMID:38168427
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研究论文 | 本文介绍了一种利用小分子方法,通过设计预配体将婴儿菠菜(一种RNA适配体)转化为传感器,用于检测无机目标物 | 该方法无需体外筛选新的适配体序列,即可检测短寿命目标物,从而扩展了荧光增强适配体系统的能力 | NA | 开发一种新的生物传感平台,用于检测无机分子目标 | 荧光增强适配体系统、无机目标物(如硫化氢和过氧化氢) | 生物化学 | NA | 荧光增强适配体系统 | NA | 荧光信号 | NA |
220 | 2024-08-07 |
Mammalian Genomic Manipulation with Orthogonal Bxb1 DNA Recombinase Sites for the Functional Characterization of Protein Variants
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00355
PMID:37922210
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研究论文 | 本文利用两个正交的Bxb1重组酶位点,通过设计带有辅助重组位点的质粒,实现了在同一细胞中避免不希望的细菌DNA元件整合,并创建了同时携带两个正交Bxb1重组酶位点的细胞,用于复杂的细胞遗传学分析。 | 本文首次利用两个正交的Bxb1重组酶位点,实现了在同一细胞中进行复杂的遗传操作,包括实时监测细胞内钙信号动力学和识别蛋白质相互作用。 | NA | 利用正交Bxb1重组酶位点进行哺乳动物基因组操作,以功能性表征蛋白质变体。 | 哺乳动物细胞中的基因组操作和蛋白质变体的功能表征。 | 基因工程 | NA | Bxb1重组酶 | NA | 基因组数据 | NA |