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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2024-08-07 |
Engineering Cyborg Bacteria Through Intracellular Hydrogelation
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204175
PMID:36628538
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research paper | 本文首次创建了名为Cyborg Cells的混合材料-细胞实体,通过在每个细菌内部组装合成聚合物网络,使其失去分裂能力,同时保留了细胞代谢、运动、蛋白质合成等基本功能,并获得了抵抗压力因素的新能力,还展示了其对癌细胞的侵入治疗潜力。 | 首次创建了Cyborg Cells,结合了细胞内人造聚合物与活细胞蛋白质网络的相互作用,为细胞生物工程建立了新的范式。 | NA | 探索细胞生物工程的新方法,通过创建Cyborg Cells来实现更可控的生物医学应用。 | Cyborg Cells及其在生物医学应用中的潜力。 | synthetic biology | NA | intracellular hydrogelation | NA | NA | NA |
202 | 2024-08-07 |
Functional characterization of four mono-terpene synthases (TPSs) provided insight into the biosynthesis of volatile monoterpenes in the medicinal herb Blumea balsamifera
2023-Apr, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-023-01306-8
PMID:37187774
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研究论文 | 本研究通过转录组测序结合代谢组学分析,筛选并克隆了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶基因,并通过异源表达和体外酶活性测定验证了其功能 | 首次鉴定并功能验证了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶,揭示了其挥发性单萜的生物合成途径 | NA | 旨在通过生物工程手段缓解Blumea balsamifera资源短缺问题,并提高其活性成分的产量 | Blumea balsamifera中的单萜合酶基因及其编码的酶 | 生物工程 | NA | 转录组测序,代谢组学分析,异源表达,体外酶活性测定 | NA | 基因序列,代谢物 | 根、茎、叶中的基因和代谢物 |
203 | 2024-08-07 |
De novo design of modular peptide-binding proteins by superhelical matching
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05909-9
PMID:37020023
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研究论文 | 本文介绍了一种通过超螺旋匹配设计模块化肽结合蛋白的新方法 | 利用几何哈希技术识别与双齿氢键兼容的蛋白骨架和肽对接排列,并通过优化蛋白序列以实现折叠和肽结合 | NA | 设计具有序列特异性的肽结合蛋白,以应用于蛋白质组学和合成生物学 | 模块化肽结合蛋白及其与肽的相互作用 | 蛋白质工程 | NA | 几何哈希技术 | NA | 蛋白质结构 | 设计了六种不同的三肽重复序列结合蛋白 |
204 | 2024-08-07 |
Engineering living materials by synthetic biology
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0115645
PMID:38505813
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程化活体材料的研究进展,并讨论了面临的挑战和未来的机遇 | 受自然生物材料系统的启发,本文探讨了模仿其复杂精细制造过程和功能的新兴领域 | NA | 探讨合成生物学与材料科学交叉领域的活体材料工程 | 活体材料及其在环境刺激响应和与无机物质耦合中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
205 | 2024-08-07 |
Protein and peptide engineering for chemical exchange saturation transfer imaging in the age of synthetic biology
2023-06, NMR in biomedicine
IF:2.7Q1
DOI:10.1002/nbm.4712
PMID:35150021
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综述 | 本文综述了化学交换饱和转移(CEST)成像中基于蛋白质的对比剂的发展历程,并讨论了合成生物学对其未来发展的影响 | 介绍了基于多肽的CEST对比剂的设计和工程化,以及酶-底物对作为CEST对比增强剂的合理化 | NA | 探讨如何提高多肽的选择性、特异性及CEST对比度,并讨论合成生物学对下一代基于蛋白质的CEST对比剂开发的影响 | 基于蛋白质的CEST对比剂及其在成像中的应用 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移成像(CEST) | NA | NA | NA |
206 | 2024-08-07 |
Synthetic biology identifies the minimal gene set required for paclitaxel biosynthesis in a plant chassis
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.016
PMID:37897038
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研究论文 | 本研究通过转录组学、细胞生物学、代谢组学和途径重构的综合方法,确定了在植物底盘中异源生产紫杉醇所需的最小基因集 | 本研究识别了紫杉醇生物合成中缺失的步骤,并通过在烟草中异源表达确认了大部分缺失酶的活性,特别是发现了一种新的C4β-C20环氧化酶,克服了代谢工程的第一个瓶颈 | NA | 确定紫杉醇生物合成所需的最小基因集,并探索植物产生复杂生物活性代谢物的独特化学机制 | 紫杉醇生物合成途径中的基因和酶 | 生物技术 | 癌症 | 转录组学, 细胞生物学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 涉及烟草(Nicotiana benthamiana)作为实验对象 |
207 | 2024-08-07 |
A unified approach to dissecting biphasic responses in cell signaling
2023-Dec-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86520
PMID:38054655
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研究论文 | 本文通过分析从基本生化构建模块到典型网络结构再到特征明显的实例的信号系统,以及不同类型的剂量,提供了一个统一的理论综合来解析细胞信号系统中的双相响应 | 揭示了双相响应存在的设计原则、结构因素、酶和底物的双相响应组合、广泛鲁棒的双相响应可能性、网络中信号行为的完全改变以及Erk信号网络中不同共存双相响应的倾向 | NA | 解析细胞信号系统中的双相响应 | 细胞信号系统中的双相剂量响应 | 生物学 | NA | 分析和计算方法 | NA | 模型 | 范围广泛的系统 |
208 | 2024-08-07 |
Engineered NF-κB siRNA-encapsulating exosomes as a modality for therapy of skin lesions
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109381
PMID:36845116
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研究论文 | 本文开发了一种合成生物学策略,通过将外泌体与人工遗传电路整合,使脂肪间充质干细胞表达并将siRNA组装进外泌体,实现对皮肤损伤小鼠模型的治疗。 | 首次将siRNA疗法应用于皮肤治疗,通过外泌体作为有效递送载体,实现siRNA的体内递送。 | NA | 开发一种新的治疗皮肤损伤的基因疗法。 | 皮肤损伤的小鼠模型。 | 基因疗法 | 皮肤损伤 | siRNA | NA | 细胞 | 小鼠 |
209 | 2024-08-07 |
Bioconversion of C1 feedstocks for chemical production using Pichia pastoris
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.006
PMID:36967258
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综述 | 本文综述了利用毕赤酵母(Pichia pastoris)进行C1原料生物转化以生产化学品的潜力和策略 | 探讨了毕赤酵母通过代谢工程或与电催化结合利用CO的潜力,并提出了合成生物学和材料科学的新视角 | NA | 探讨利用毕赤酵母进行C1原料生物转化的挑战和可行策略 | 毕赤酵母在C1原料生物转化中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
210 | 2024-08-07 |
Modularized synthetic biology enabled intelligent biosensors
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.005
PMID:36967259
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综述 | 本文综述了智能合成生物学驱动的生物传感器(SBBs)的最新进展及其在即时检测(POCT)和可穿戴监测中的应用 | 介绍了智能SBBs在计算、存储和自校准方面的能力,以及其在实际应用中的适应性 | NA | 探讨智能合成生物学生物传感器的发展及其应用前景 | 智能合成生物学生物传感器及其在即时检测和可穿戴监测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学模块化技术 | NA | NA | NA |
211 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology to enhance ocean health
2023-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2022.12.015
PMID:36669947
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法增强海洋健康的框架 | 提出利用合成生物学工具创新性地增强海洋生物系统的自然适应能力,以应对人类活动引起的快速变化 | NA | 探索合成生物学在解决海洋塑料污染、珊瑚白化和有害藻华等问题中的应用 | 海洋健康、塑料污染、珊瑚白化、有害藻华 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
212 | 2024-08-07 |
Crystal structure and activity of a de novo enzyme, ferric enterobactin esterase Syn-F4
2023-09-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2218281120
PMID:37695900
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研究论文 | 本文描述了从头设计的酶Syn-F4的晶体结构及其活性 | Syn-F4的结构和活性位点与天然enterobactin酯酶完全不同,展示了从头设计的蛋白质可以通过与自然界中出现的结构和机制截然不同的方式提供生命维持的催化活性 | NA | 研究从头设计的酶的结构和活性 | Syn-F4酶及其催化活性 | 生物技术 | NA | 晶体结构分析 | 四螺旋束 | 蛋白质结构 | NA |
213 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Pathway to Nucleoside Triphosphates for Expanded Genetic Alphabets
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00060
PMID:37227319
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中通过重排氢键供体和受体基团来形成12种独立复制核苷酸的方法,并介绍了利用“多磷酸激酶”制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 首次报道了利用“多磷酸激酶”与天然二磷酸激酶和工程化核苷酸激酶合作,制造AEGIS三磷酸的途径,包括第三代三磷酸,其在活细菌细胞中的生存能力得到改善。 | NA | 探索合成生物学中扩展遗传字母表的途径,特别是制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 12种独立复制的核苷酸及其三磷酸的合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多磷酸激酶 | NA | NA | NA |
214 | 2024-08-07 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 本文探讨了合成生物学与机器学习在癌症治疗中的应用,特别是通过非自然信号传导途径和复杂的合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤特性 | 文章介绍了通过机器学习辅助筛选过程,成功预测CAR T细胞表型依赖于信号传导模体选择的新方法,以及合成锌指蛋白作为可控转录调节因子的应用 | NA | 探索合成生物学和机器学习如何通过新的技术手段增强工程化T细胞的抗肿瘤能力 | CAR T细胞的信号传导途径和合成基因电路的设计 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | 机器学习 | 基因电路 | NA |
215 | 2024-08-07 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-Dec-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
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综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞疗法方法,重点介绍了自体软骨细胞移植和矩阵自体软骨细胞移植,并探讨了干细胞在骨关节炎软骨修复中的潜力以及合成生物学在基因工程细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎中的应用 | 探讨了干细胞和合成生物学在软骨修复和骨关节炎治疗中的新应用 | NA | 综述关节软骨再生的细胞疗法方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨及其在骨关节炎中的病理 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 细胞疗法和合成生物学 | NA | NA | NA |
216 | 2024-08-07 |
Graphene oxide aptasensor droplet assay for detection of metabolites secreted by single cells applied to synthetic biology
2023-12-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00959a
PMID:38054213
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研究论文 | 本文开发了一种新型的可修改石墨烯氧化物(GO)适配体传感器,用于检测单细胞分泌的不同目标化合物,应用于合成生物学领域 | 利用荧光标记的适配体通过π-π堆积作用稳定地锚定在GO上,以最小化非特异性相互作用,实现低背景检测和高信噪比 | NA | 开发一种高灵敏度和灵活性的单细胞分泌检测方法,用于合成生物学中的生物生产 | 单细胞分泌的代谢物,如ATP和naringenin | 合成生物学 | NA | 石墨烯氧化物(GO)适配体传感器 | NA | 代谢物 | 单细胞 |
217 | 2024-08-07 |
Biosensor-guided discovery and engineering of metabolic enzymes
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108251
PMID:37690614
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综述 | 本文综述了利用生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和工程化代谢酶方面的应用 | 开发了基于遗传编码的生物传感器,用于在细胞内特定检测由酶活性产生的目标分子,从而促进目标酶的高通量筛选 | 酶发现和工程化中的一个主要挑战是从广泛的酶库中有效筛选具有所需表型的酶 | 探讨生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和改进酶特性中的应用 | 代谢酶的发现和工程化 | 生物技术 | NA | 高通量筛选 | NA | 酶活性数据 | NA |
218 | 2024-08-07 |
Ribosomal incorporation of negatively charged d-α- and N-methyl-l-α-amino acids enhanced by EF-Sep
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0038
PMID:36633283
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研究论文 | 研究通过使用EF-Tu变体EF-Sep和人工开发的嵌合tRNA,成功增强了负电荷d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸在新生肽中的整合效率 | 首次展示了包含多个d-Asp或Asp的巨环肽的核糖体合成 | NA | 研究如何提高负电荷氨基酸在新生肽中的整合效率 | d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸的整合效率 | 生物化学 | NA | 核糖体合成 | EF-Tu变体EF-Sep | 氨基酸 | NA |
219 | 2024-08-07 |
Rethinking nucleic acids from their origins to their applications
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0027
PMID:36633284
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综述 | 本文综述了实验室在过去三十年中关于合成生物学的研究,探讨了替代标准DNA和RNA的信息系统的生成及其在支持达尔文进化和理解其自然历史中的应用 | 合成生物学已生成多种能够支持分子信息进化的分子系统,这些替代标准DNA和RNA的系统支持生物技术应用,如DNA合成、人类诊断、生物医学研究和医学 | 需要多电解质结构和尺寸规则的构建块来支持信息聚合物以支持达尔文进化 | 探讨核苷酸的起源及其在地球和宇宙中的应用,以及它们如何支持生命和达尔文进化 | 核苷酸及其替代分子系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
220 | 2024-08-07 |
Perseverance of protein homeostasis despite mistranslation of glycine codons with alanine
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0029
PMID:36633285
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研究论文 | 研究探讨了人类tRNA变异体在甘氨酸密码子处误读为丙氨酸对蛋白质稳态的影响 | 发现自然发生的tRNA变异体在甘氨酸密码子处误读为丙氨酸,尽管在正常条件下被容忍,但在蛋白酶体抑制的条件下会抑制蛋白质合成 | 研究仅限于特定的tRNA变异体和特定的氨基酸误读情况 | 探究特定tRNA变异体对蛋白质合成和稳态的影响 | 人类tRNA变异体及其对蛋白质合成的影响 | NA | NA | 质谱分析 | NA | 蛋白质数据 | 涉及多种tRNA变异体和哺乳动物细胞 |