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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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221 | 2024-08-07 |
Functionalized DNA-Origami-Protein Nanopores Generate Large Transmembrane Channels with Programmable Size-Selectivity
2023-01-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c11226
PMID:36577119
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研究论文 | 本文利用pneumolysin(PLY)和DNA折纸技术构建了具有可编程尺寸选择性的大型跨膜纳米孔 | 首次结合PLY毒素和DNA折纸技术构建了可功能化的大型纳米孔,具有均匀的孔径和可编程的尺寸选择性 | NA | 开发新型生物传感器和合成细胞构建技术 | 跨膜纳米孔的工程化 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | 纳米孔 | 涉及脂质体和红细胞 |
222 | 2024-08-07 |
Advances in Metabolic Engineering of Plant Monoterpene Indole Alkaloids
2023-Jul-27, Biology
DOI:10.3390/biology12081056
PMID:37626942
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综述 | 本文综述了植物单萜吲哚生物碱(MIAs)代谢工程的最新进展和策略 | 探讨了通过合成生物学方法在异源宿主中增加MIAs产量和扩展其化学多样性的策略 | 讨论了当前制造MIAs的问题和未来发展 | 旨在通过代谢工程和合成生物学方法提高MIAs的产量和多样性 | 植物单萜吲哚生物碱(MIAs) | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
223 | 2024-08-07 |
RNAs as Sensors of Oxidative Stress in Bacteria
2023-06-08, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了氧化应激的本质,强调了已知的蛋白质传感器(转录因子)作为氧化应激中分子传感器标准的作用,并描述了探索RNA直接感受氧化应激潜力的分子研究 | RNA传感器有望成为理解和调控细菌氧化应激反应中动态生物途径的关键层,代表了合成生物学的重要前沿 | 关于RNA传感器的知识存在空白,特别是关于RNA核苷酸化学修饰的部分 | 探讨RNA作为细菌中氧化应激传感器的潜力 | RNA传感器在氧化应激反应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
224 | 2024-08-07 |
Engineering a dual vaccine against COVID-19 and tuberculosis
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1273019
PMID:37965265
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研究论文 | 研究通过合成生物技术构建了一种重组BCG菌株AspikeRBD,该菌株表达由Ag85A蛋白和SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域(RBD)组成的融合蛋白,旨在开发一种针对COVID-19和结核病的双重疫苗 | 首次成功构建了一种能够同时表达Ag85A蛋白和SARS-CoV-2 RBD的重组BCG菌株,显示出对两种疾病的免疫反应增强 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中进行临床试验 | 开发一种新型双重疫苗,同时预防COVID-19和结核病 | 重组BCG菌株AspikeRBD的免疫效果及其作为双重疫苗的潜力 | NA | COVID-19和结核病 | 合成生物技术 | NA | NA | 老鼠模型 |
225 | 2024-08-07 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543449
PMID:37398067
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研究论文 | 本文利用计算设计方法,研究了蛋白质基材料的宏观粘弹性与其微观结构之间的关系 | 通过计算设计,实现了对蛋白质水凝胶的宏观粘弹性的系统编程和模块化构建 | NA | 探索分子参数如何影响蛋白质水凝胶的宏观粘弹性 | 蛋白质水凝胶的粘弹性特性 | 生物医学工程 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 蛋白质 | 包含2、5、24或120个蛋白质成分的对称蛋白质同寡聚体 |
226 | 2024-08-07 |
A New EBS2b-IBS2b Base Paring (A-8/T-8) Improved the Gene-Targeting Efficiency of Thermotargetron in Escherichia coli
2023-Feb-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03159-22
PMID:36809044
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research paper | 本文通过构建随机基因靶向质粒池(RGPP),研究了Thermotargetron(TMT)在不同靶点上的基因靶向效率,并发现了一种新的EBS2b-IBS2b碱基配对(A/T)显著提高了TMT的基因靶向效率。 | 发现了一种新的EBS2b-IBS2b碱基配对(A/T),显著提高了Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率,并开发了基于新序列识别角色的计算机算法(TMT 1.0)。 | TMT在不同靶点上的基因靶向效率存在显著差异,导致成功率相对较低。 | 提高Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率和成功率,扩展其在耐热中温菌和耐热菌基因组工程中的应用。 | Thermotargetron(TMT)的基因靶向效率和序列识别偏好。 | 基因工程 | NA | 基因靶向技术 | NA | DNA序列 | 随机基因靶向质粒池(RGPP)中的多个样本 |
227 | 2024-08-07 |
Cell-Free Dot Blot: an Ultra-Low-Cost and Practical Immunoassay Platform for Detection of Anti-SARS-CoV-2 Antibodies in Human and Animal Sera
2023-Jan-31, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02457-22
PMID:36719206
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研究论文 | 介绍了一种名为细胞自由点印迹(CFDB)的超低成本免疫诊断平台,用于快速检测人类和动物血清中的抗SARS-CoV-2抗体 | CFDB方法的创新之处在于使用线性DNA在无细胞表达系统中产生融合了SpyTag肽的目标病毒抗原,无需传统克隆和抗原纯化;使用由大肠杆菌生产的SpyCatcher2-Apex2作为通用次级检测试剂;血清直接点在硝酸纤维素膜上,简化了下游孵育和洗涤步骤 | NA | 开发一种快速适应、经济实惠且全球可访问的诊断平台,以应对现有和新兴的公共卫生威胁,如COVID-19大流行 | 检测人类和动物血清中的抗SARS-CoV-2抗体 | 生物技术 | COVID-19 | 细胞自由点印迹(CFDB) | NA | 血清 | 人类血清(23份阴性,36份阳性)和仓鼠血清(16份阴性,36份阳性) |
228 | 2024-08-07 |
The Use of Cell-free Protein Synthesis to Push the Boundaries of Synthetic Biology
2023-Jan-14, Biotechnology and bioprocess engineering : BBE
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s12257-022-0279-2
PMID:36687336
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成的关键发展及其在合成生物学中的应用 | 无细胞系统利用提取的合成细胞机器,解决了活体系统复杂性和变异性的问题,提供了高灵活性和可访问性 | NA | 探讨无细胞蛋白合成系统的发展及其未来方向 | 无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 遗传信息 | NA |
229 | 2024-08-07 |
Unlocking the secrets of the microbiome: exploring the dynamic microbial interplay with humans through metabolomics and their manipulation for synthetic biology applications
2023-06-28, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210534
PMID:37378961
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综述 | 本文综述了代谢组学在探索微生物与人类动态相互作用及其在合成生物学应用中的应用 | 强调了代谢组学在生物科学中的广泛应用,特别是在微生物系统及其在宿主和环境中的复杂相互作用 | 仍存在挑战需要克服,以最大化代谢组学在理解生物系统中的潜力 | 探讨代谢组学在合成生物学和肠道微生物与人类宿主相互作用中的应用 | 微生物组及其与人类和环境的相互作用 | NA | NA | GC-MS, LC-MS | NA | 代谢物 | NA |
230 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of cannabigerol and cannabigerolic acid: the gateways to further cannabinoid production
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad010
PMID:37323510
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研究论文 | 本文描述了通过识别和重新利用芳香性异戊二烯转移酶(AtaPT),结合天然酶,形成在细胞裂解液中生产cannabigerolic acid(CBGA)和在完整细胞中生产cannabigerol(CBG)的生产系统 | 首次展示了在微生物系统中通过优化的合成生物学平台进行CBG生物合成的技术 | NA | 建立可持续生产经过充分研究和稀有大麻素的基础 | cannabigerolic acid(CBGA)和cannabigerol(CBG)的生物合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
231 | 2024-08-07 |
Redox-enabled electronic interrogation and feedback control of hierarchical and networked biological systems
2023-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44223-w
PMID:38129428
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研究论文 | 本文探讨了通过氧化还原反应在生物系统中实现微电子设备与生物体的直接通信,并展示了在蛋白质、细胞和细胞群等多个层次上对生物系统进行电子询问和控制的方法 | 通过工程化生物的天然氧化还原网络,实现了对生物系统的电子询问和控制,并开发了电生物制造、电极驱动的氧化还原数据传输和氧化还原连接的合成生物学技术 | NA | 探索和开发对生物系统进行复杂控制的方法 | 蛋白质、细胞和细胞群等生物系统的电子询问和控制 | 生物技术 | NA | 氧化还原反应 | NA | 电子信息 | NA |
232 | 2024-08-07 |
A Small-Molecule Approach to Bypass In Vitro Selection of New Aptamers: Designer Pre-Ligands Turn Baby Spinach into Sensors for Reactive Inorganic Targets
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551132
PMID:38168427
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研究论文 | 本文介绍了一种利用小分子方法,通过设计预配体将婴儿菠菜(一种RNA适配体)转化为传感器,用于检测无机目标物 | 该方法无需体外筛选新的适配体序列,即可检测短寿命目标物,从而扩展了荧光增强适配体系统的能力 | NA | 开发一种新的生物传感平台,用于检测无机分子目标 | 荧光增强适配体系统、无机目标物(如硫化氢和过氧化氢) | 生物化学 | NA | 荧光增强适配体系统 | NA | 荧光信号 | NA |
233 | 2024-08-07 |
Mammalian Genomic Manipulation with Orthogonal Bxb1 DNA Recombinase Sites for the Functional Characterization of Protein Variants
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00355
PMID:37922210
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研究论文 | 本文利用两个正交的Bxb1重组酶位点,通过设计带有辅助重组位点的质粒,实现了在同一细胞中避免不希望的细菌DNA元件整合,并创建了同时携带两个正交Bxb1重组酶位点的细胞,用于复杂的细胞遗传学分析。 | 本文首次利用两个正交的Bxb1重组酶位点,实现了在同一细胞中进行复杂的遗传操作,包括实时监测细胞内钙信号动力学和识别蛋白质相互作用。 | NA | 利用正交Bxb1重组酶位点进行哺乳动物基因组操作,以功能性表征蛋白质变体。 | 哺乳动物细胞中的基因组操作和蛋白质变体的功能表征。 | 基因工程 | NA | Bxb1重组酶 | NA | 基因组数据 | NA |
234 | 2024-08-07 |
A Multiplex MoClo Toolkit for Extensive and Flexible Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00423
PMID:37930278
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研究论文 | 本文介绍了一种新的多重MoClo工具包——多重酵母工具包(MYT),该工具包扩展了MoClo酵母工具包(YTK)的能力,并解决了酵母菌株工程的局限性 | MYT工具包提供了新的整合载体和选择性标记,增加了装配盒以增加多基因构建体中的转录单元数量,并引入了CRISPR-Cas9工具和三种正交且可诱导的启动子系统 | YTK工具包在创建新酵母菌株的广度和灵活性方面存在局限 | 扩展酵母合成生物学工具包的能力,以实现更广泛和灵活的酵母工程 | 酵母菌株的工程化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
235 | 2024-08-07 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本文介绍了一种名为INSPIRE-seq的方法,利用纳米抗体库和下一代测序技术,在复杂的肿瘤微环境中并行富集免疫细胞结合的纳米抗体 | INSPIRE-seq提供了一种无偏见的方法来研究复杂的微环境,并辅助纳米抗体的开发 | NA | 开发一种新技术来发现治疗性生物制剂的靶向分子 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及肿瘤、淋巴结和脾脏中的免疫细胞亚型 |
236 | 2024-08-07 |
The technology, opportunities, and challenges of Synthetic Biological Intelligence
2023-11, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108233
PMID:37558186
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综述 | 本文综述了合成生物智能(SBI)的发展及其潜在应用,并探讨了相关的伦理问题 | 首次详细探讨了合成生物智能技术的伦理机会与挑战 | 尚未深入探索合成生物智能技术背后的具体技术细节 | 提供一个坚实的框架来构建伦理考量,确保SBI技术能够负责任地进行研究和应用 | 合成生物智能技术及其伦理影响 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
237 | 2024-08-07 |
Compact Programmable Control of Protein Secretion in Mammalian Cells
2023-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.04.560774
PMID:37873144
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Compact RELEASE的新型合成生物学平台,用于在哺乳动物细胞中控制蛋白质分泌 | 通过利用内源性14-3-3蛋白的招募和拮抗行为,创建了RELEASE-NOT系统,结合RELEASE和RELEASE-NOT,形成了一套名为Compact RELEASE的蛋白质水平处理和输出模块,实现了单一输入蛋白酶的逻辑处理和模拟信号过滤 | NA | 开发一种新型的合成生物学平台,用于精确控制哺乳动物细胞中的蛋白质分泌,以应用于生物医学领域 | 哺乳动物细胞中的蛋白质分泌控制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 蛋白质 | NA |
238 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria detect tumor DNA
2023-08-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf3974
PMID:37561843
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,设计了一种能够检测结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中供体DNA的天然感受态细菌 | 开发了一种新型的细胞检测方法,能够检测特定的胞外DNA序列和突变 | NA | 开发一种能够检测特定胞外DNA序列和突变的细胞生物传感器 | 结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中的供体DNA | 合成生物学 | 结直肠癌 | CRISPR-discriminated horizontal gene transfer (CATCH) | NA | DNA | 在携带结直肠肿瘤的小鼠中进行了体内验证 |
239 | 2024-08-07 |
Unigems: plasmids and parts to facilitate teaching on assembly, gene expression control and logic in E. coli
2023, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000596.v3
PMID:37841098
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研究论文 | 开发了一套名为unigems的十种质粒,用于在课堂上研究基因表达控制和生物逻辑门,以促进合成生物学和遗传工程的教学 | unigems基于高拷贝质粒骨架,易于扩展,通过通用引物集促进Gibson组装,包括两种报告基因和单质粒AND逻辑门实现 | NA | 开发教育资源,促进合成生物学和遗传工程的教学 | 基因表达控制和生物逻辑门 | 合成生物学 | NA | Gibson组装 | NA | 质粒 | 十种质粒 |
240 | 2024-08-07 |
Modularly engineering Rhodotorula toruloides for α-terpineol production
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1310069
PMID:38312511
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研究论文 | 本文通过模块化工程策略改造红酵母Rhodotorula toruloides,以直接生物合成α-松油醇 | 采用模块化工程策略,包括增强前体供应、阻断下游途径和破坏竞争途径,以提高α-松油醇的产量 | NA | 研究目的是通过工程化红酵母直接生物合成α-松油醇 | 红酵母Rhodotorula toruloides和α-松油醇的生物合成 | 合成生物学 | NA | 模块化工程 | NA | NA | 工程化菌株5L6HE5达到最高产品滴度1.5 mg/L |