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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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241 | 2024-08-07 |
Modeling the effects of strigolactone levels on maize root system architecture
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1329556
PMID:38273953
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Mathematica的平台,用于模拟和预测合成生物学干预对玉米根系架构和激素水平的影响 | 开发了一个结合代谢模型和3D根系生长模型的模拟平台,能够模拟激素水平变化对根系架构的影响 | NA | 研究如何通过调节激素合成来增强玉米对干旱和寄生植物的抵抗力 | 玉米根系架构及其与激素水平的关系 | NA | NA | NA | 代谢模型和3D根系生长模型 | 3D根系架构 | NA |
242 | 2024-08-07 |
Structure, folding and flexibility of co-transcriptional RNA origami
2023-07, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-023-01321-6
PMID:36849548
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研究论文 | 本文通过低温电子显微镜研究RNA折纸结构的结构、折叠和灵活性,揭示了RNA折纸设计中的关键结构参数和折叠机制 | 发现了RNA折纸设计中的动力学折叠陷阱,并通过组合不同结构构建了多域卫星形状,揭示了域的灵活性 | NA | 深入理解RNA折纸结构的结构特性和折叠原理,以改进RNA纳米器件的设计 | RNA折纸片和束的结构、折叠过程及其灵活性 | 合成生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构参数 | NA |
243 | 2024-08-07 |
Biphasic amplitude oscillator characterized by distinct dynamics of trough and crest
2023-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.108.064412
PMID:38243441
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研究论文 | 研究了生物系统中双相振幅动态的特定拓扑结构和调控机制 | 识别了实现稳定振荡的核心振荡器,并利用景观理论研究了系统的随机动力学和全局稳定性 | NA | 理解振荡系统中双相振幅动态的发生机制 | 双相振幅动态的振荡器拓扑结构和调控机制 | 生物学 | NA | NA | 振荡器模型 | 理论分析 | NA |
244 | 2024-08-07 |
A spotlight on global collaboration in the Sc2.0 yeast consortium
2023-11-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100441
PMID:38020973
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研究论文 | 本文重点介绍了合成酵母基因组项目(Sc2.0)中中国研究团队的工作及其对Sc2.0和合成生物学未来的看法 | NA | NA | 创建和优化合成染色体,最终目标是组装一个具有设计特征的合成酵母生物,以促进合成生物学和工程项目的应用 | 合成酵母基因组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
245 | 2024-08-07 |
A Mesorhizobium japonicum quorum sensing circuit that involves three linked genes and an unusual acyl-homoserine lactone signal
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-23
PMID:37227303
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研究论文 | 本文研究了Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统,该系统涉及三个连锁基因和一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号 | 发现了Mesorhizobium japonicum中一种新的群体感应系统,该系统涉及一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号和三个组件,而非传统的两个组件 | NA | 研究Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统及其在根瘤共生中的作用 | Mesorhizobium japonicum的群体感应系统和其产生的独特酰基高丝氨酸内酯信号 | NA | NA | 群体感应 | NA | 基因组序列 | 涉及多个Mesorhizobium japonicum菌株 |
246 | 2024-08-07 |
Biosynthetic pathway of prescription bergenin from Bergenia purpurascens and Ardisia japonica
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1259347
PMID:38239219
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、异源表达和酶学特性研究,功能性地表征了参与bergenin生物合成途径的shikimate脱氢酶(SDH)、两种O-甲基转移酶(OMTs)和一种糖基转移酶(CGT)。 | 首次揭示了bergenin的生物合成途径,为通过合成生物学策略在细胞工厂中合理生产bergenin铺平了道路。 | NA | 揭示bergenin的生物合成途径 | shikimate脱氢酶(SDH)、两种O-甲基转移酶(OMTs)和一种糖基转移酶(CGT) | NA | NA | 生物信息学分析、异源表达、酶学特性研究 | NA | NA | NA |
247 | 2024-08-07 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
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研究论文 | 本文开发了一种新的植物二元表达系统,源自Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径,并在转基因烟草中实现了基因表达的五倍激活 | 本文利用Penicillium citrinum ML-236B途径中的调控元件开发了合成植物转录因子,并成功在转基因烟草中实现了基因表达的显著提升 | NA | 开发和优化植物合成生物学的遗传工具集 | 植物二元表达系统和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草植物和非转基因对照植物 |
248 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Facilitates Semisynthetic Development of Type V Glycopeptide Antibiotics Targeting Vancomycin-Resistant Enterococcus
2023-07-13, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00633
PMID:37315221
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,对第五类糖肽抗生素rimomycin A进行半合成改造,生成了32种新的类似物,其中一种化合物通过N端酰化和C端酰胺化,显示出增强的抗万古霉素耐药肠球菌(VRE)活性和溶解性 | 本研究创新性地通过合成生物学方法改造第五类糖肽抗生素,生成新的类似物,并展示了其增强的抗VRE活性 | NA | 开发针对万古霉素耐药肠球菌的下一代糖肽抗生素 | 第五类糖肽抗生素rimomycin A及其类似物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 32种新的类似物 |
249 | 2024-08-07 |
A Self-Regenerating Artificial Cell, that is One Step Closer to Living Cells: Challenges and Perspectives
2023-12, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300182
PMID:37246263
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综述 | 本文综述了可控自再生人工细胞(SRACs)领域的最新进展及其在合成生物学中的应用前景 | 首次探讨了通过重组实验室中的各种生物分子来创造生殖细胞的可能性 | 目前仍难以在人工创造的空间中复制细胞再生过程中的复杂过程,如遗传物质复制和细胞膜分裂 | 旨在实现创造可控自再生人工细胞的目标 | 可控自再生人工细胞及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
250 | 2024-08-07 |
Biosynthesis, Engineering, and Delivery of Selenoproteins
2023-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010223
PMID:38203392
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综述 | 本文综述了硒代半胱氨酸(Sec)的发现、生物合成及其在工程和递送中的应用 | 强调了遗传密码扩展技术在细菌和酵母中定向插入Sec的最新进展 | NA | 探讨Sec在人类健康和疾病治疗中的重要性及其在合成生物学中的新应用 | Sec的生物合成、遗传编码及其在蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
251 | 2024-08-07 |
Programmable synthetic biomolecular condensates for cellular control
2023-04, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-022-01252-8
PMID:36747054
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研究论文 | 本文介绍了一种理性工程方法,用于编程合成凝聚物的形成和物理特性,以实现预期的细胞功能 | 提出了一种新的理性工程方法,用于设计和控制合成凝聚物的形成和物理特性,以实现特定的细胞功能 | 目前主要集中在细菌和哺乳动物细胞中的实验验证,未来可能需要扩展到更多类型的细胞和生物系统 | 开发一种新的方法来设计和控制合成凝聚物,以应用于合成生物学 | 合成凝聚物的形成和物理特性,以及其在细胞功能调控中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌和哺乳动物细胞 |
252 | 2024-08-07 |
DNA origami: a tool to evaluate and harness transcription factors
2023-12, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02380-x
PMID:37813986
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研究论文 | 本文探讨了DNA折纸技术在评估和利用转录因子(TFs)中的应用 | 提出DNA折纸作为一种新型合成DNA纳米技术方法,能够利用DNA的多个关键特性,如DNA聚合、DNA互补性、DNA可编程性和DNA可编辑性 | NA | 研究如何通过合成生物学/医学手段辅助转录因子的研究和治疗靶向 | 转录因子及其在基因调控中的作用 | 合成生物学 | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA |
253 | 2024-08-07 |
Plasmid Crosstalk in Cell-Free Expression Systems
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00412
PMID:37756020
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研究论文 | 本文探讨了无细胞表达系统中质粒间相互作用(质粒串扰)对蛋白质表达水平的影响 | 首次详细研究了质粒浓度和转录机器类型对质粒串扰效应的影响 | 未提及具体限制 | 研究质粒串扰对无细胞合成生物学应用中遗传电路功能的影响 | 无细胞表达系统中的质粒串扰现象 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质表达 | NA | 蛋白质表达水平 | 未提及具体样本数量 |
254 | 2024-08-07 |
Recent progress and challenges in synthetic biology for improving microbial production of biopolymers
2023-10, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2023.127463
PMID:37479534
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
255 | 2024-08-07 |
Plasmodium-Resistant Indole Diterpenoid Biosynthesis Gene Cluster Derived from Aspergillus oryzae Was Activated by Exogenous P450 Gene Ast B
2023-06-23, Journal of natural products
IF:3.3Q1
DOI:10.1021/acs.jnatprod.2c01172
PMID:37257055
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法激活了来自Aspergillus oryzae的沉默生物合成基因簇,产生了一系列新的吲哚二萜类化合物,并研究了它们的抗疟活性 | 首次报道了吲哚二萜类化合物具有潜在的抗疟疾活性,并通过结构-活性关系研究揭示了线性吲哚二萜类化合物对抗寄生虫活性的重要贡献 | NA | 研究通过合成生物学方法激活沉默生物合成基因簇,探索新型抗疟疾化合物 | 吲哚二萜类化合物的生物合成及其抗疟活性 | 合成生物学 | 疟疾 | NMR, HR-ESI-MS, 单晶X射线衍射, 分子对接 | NA | 化合物结构数据 | 15种吲哚二萜类化合物 |
256 | 2024-08-07 |
Soil as a transdisciplinary research catalyst: from bioprospecting to biorespecting
2023-Nov, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.230963
PMID:38026022
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研究论文 | 本文通过一个公共参与项目,探讨了土壤微生物组在城市六个地点的应用,使用基于纳米孔的DNA测序技术,并结合合成生物学、环境人文学和微生物生态学等多个学科的研究 | 提出了从'生物勘探'到'生物尊重'的概念转变,强调了基因信息使用应考虑其生态系统来源的责任 | NA | 探讨如何公平合理地使用土壤微生物组的潜在价值信息 | 土壤微生物组及其在城市环境中的应用 | 微生物生态学 | NA | 基于纳米孔的DNA测序 | NA | DNA序列 | 六个城市地点的土壤样本 |
257 | 2024-08-07 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 研究显示,过表达PtRWA-C基因增加了木聚糖的乙酰化水平和木质素含量,从而降低了杨树木质生物质的糖化效率 | 首次揭示了PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化中的功能作用,并发现了AP2家族转录因子HRD对其表达的调控机制 | NA | 探讨PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的作用及其调控机制 | 杨树(Populus trichocarpa)的PtRWA-C基因及其在生物质转化中的作用 | NA | NA | 基因共表达网络分析,表达数量性状位点(eQTL)分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
258 | 2024-08-07 |
Postbiotic production: harnessing the power of microbial metabolites for health applications
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1306192
PMID:38169918
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综述 | 本文全面分析了后生物生产的多个方面,包括不同后生物类别的广泛检查,揭示了它们复杂的机制和未来可能显著影响人类健康的应用 | 强调了后生物生产领域的创新,包括从传统发酵到尖端酶转化和合成生物学方法的应用 | 指出了后生物生产中存在的问题,如提高产量、增强稳定性和确保安全性 | 探讨后生物在治疗干预和功能性食品成分生产中的应用潜力 | 后生物及其生产机制 | 微生物组科学 | NA | 发酵、酶转化、合成生物学 | NA | NA | NA |
259 | 2024-08-07 |
Biosensor-assisted titratable CRISPRi high-throughput (BATCH) screening for over-production phenotypes
2023-01, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2022.11.004
PMID:36375746
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研究论文 | 本文开发了一种生物传感器辅助的可调式CRISPRi高通量(BATCH)筛选方法,用于在Escherichia coli中筛选高产量表型 | 首次开发了一种可编程的错配CRISPRi,能够通过一个sgRNA池实现多级干扰效果,并结合生物传感器进行高产量表型的筛选 | NA | 优化代谢通量并加速微生物生物生产中的高通量表型筛选 | Escherichia coli中的代谢通量和表型筛选 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 生物传感器数据 | 20个相关基因的sgRNA池,以及pfkA和ptsI的组合敲降 |
260 | 2024-08-07 |
Improving cooperativity of transcription activators by oligomerization domains in mammalian cells
2023-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2022.12.003
PMID:36605704
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研究论文 | 本研究通过在哺乳动物细胞中融合寡聚化域,开发了具有协同激活功能的转录因子 | 本研究采用了一种新型寡聚化域CarH,其寡聚化能力不依赖于C端域,与转录因子和激活域融合,显著提高了协同激活能力 | NA | 提高哺乳动物细胞中合成生物学应用的协同激活 | 哺乳动物细胞中的转录因子协同激活 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |