合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 360 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
CSI: Contrastive data Stratification for Interaction prediction and its application to compound-protein interaction prediction
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad456
PMID:37490457
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为对比分层交互预测（CSI）的新方法，通过对比多视角编码技术来学习最大化互信息的数据嵌入，并应用于化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 提出了一种新的数据分层方法CSI，通过对比学习技术增强对象表示，并展示了在化合物-蛋白质序列交互预测中的有效性 | NA | 开发一种新的方法来准确预测两个对象之间的交互可能性，并应用于化合物-蛋白质序列交互预测 | 化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 计算机科学 | NA | 对比学习 | 对比多视角编码 | 序列数据 | 多个药物-目标和酶数据集 |
| 282 | 2024-08-07 |
Structural features of sensory two component systems: a synthetic biology perspective
2023-01-31, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210798
PMID:36688908
|
综述 | 本文从结构生物学的角度探讨了如何利用双组分系统中的传感器和效应蛋白模块构建新的合成电路 | 综述了过去二十年中对信号检测、别构机制和特异性决定因素的分子理解进展，并讨论了这些信息如何被用于开发新的合成网络 | NA | 探讨如何利用双组分系统中的传感器和效应蛋白模块构建新的合成电路 | 双组分系统中的传感器和效应蛋白模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-07 |
Genome sequence and characterization of a novel Pseudomonas putida phage, MiCath
2023-12-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48634-z
PMID:38071193
|
研究论文 | 报道了一种新的Pseudomonas putida噬菌体MiCath，这是首个已知的感染P. putida S12菌株的噬菌体 | MiCath是一种新型噬菌体，与已知的任何噬菌体相比，其基因组中最多只有74%的核苷酸序列相似，且编码许多独特的基因产物 | NA | 研究并描述一种新型Pseudomonas putida噬菌体的基因组特征 | Pseudomonas putida噬菌体MiCath及其基因组 | NA | NA | 比较基因组学 | NA | 基因组 | 涉及一个新型噬菌体MiCath和五个Pseudomonas putida菌株 |
| 284 | 2024-08-07 |
Application and Technical Challenges in Design, Cloning, and Transfer of Large DNA
2023-Dec-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10121425
PMID:38136016
|
综述 | 本文综述了在合成生物学领域中，设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的技术挑战和应用 | 介绍了在合成基因组学和大型DNA工程领域中，通过设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的关键步骤 | NA | 推进合成基因组学和大型DNA工程领域的发展 | 大型DNA的设计、克隆和转移 | 合成生物学 | NA | DNA组装和编辑 | NA | DNA | NA |
| 285 | 2024-08-07 |
Digital microfluidics as an emerging tool for bacterial protocols
2023-Dec-13, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2023.12.005
PMID:38101571
|
研究论文 | 本文探讨了数字微流控技术（DMF）在细菌实验流程中的应用 | DMF技术提供了一个微型化平台，能够简化从样本准备到分析的多步骤细菌实验流程 | 文章指出了当前工作的局限性，并提出了未来该技术在领域内扩展的方向 | 旨在优化细菌实验流程，提高实验效率 | 细菌实验流程及其在合成生物学、测序和诊断测试中的应用 | NA | NA | 数字微流控技术（DMF） | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
Oncolytic Viruses in the Era of Omics, Computational Technologies, and Modeling: Thesis, Antithesis, and Synthesis
2023-Dec-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417378
PMID:38139207
|
综述 | 本文综述了在肿瘤免疫病毒治疗中，如何利用大数据分析、模拟、建模和计算技术来整合和解释“组学”信息，并推动新型合成生物学和个性化溶瘤病毒工程方法的发展 | 结合大数据分析和计算技术，推动个性化溶瘤病毒工程方法的发展，实现针对特定患者的肿瘤清除 | NA | 探讨如何利用现代技术和模型来优化溶瘤病毒治疗，实现个性化免疫治疗 | 溶瘤病毒及其在个性化免疫治疗中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 组学技术 | NA | 大数据 | NA |
| 287 | 2024-08-07 |
Transcriptome Identification and Analysis of Fatty Acid Desaturase Gene Expression at Different Temperatures in Tausonia pullulans 6A7
2023-Dec-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11122916
PMID:38138060
|
研究论文 | 本研究对低温酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因表达进行了转录组鉴定和分析 | 本研究发现了8455个差异表达基因，并确定了16个候选基因，这些发现有助于深入研究酵母中脂肪酸代谢相关重要基因的功能和分子机制 | NA | 研究酵母菌株6A7在不同温度下脂肪酸去饱和酶基因的表达 | 酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 在不同温度（15°C、20°C、20°C无玉米油、25°C）下对产脂酶的6A7进行了RNA-seq分析 |
| 288 | 2024-08-07 |
Genome Mining Reveals a Surprising Number of Sugar Reductases in Aspergillus niger
2023-Nov-24, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof9121138
PMID:38132739
|
研究论文 | 本研究通过基因组挖掘揭示了Aspergillus niger中糖还原酶的多样性 | 发现了五个额外的同源基因，这些基因可以替代原有的三种戊糖还原酶，并参与其他糖代谢途径 | NA | 探索真菌中初级碳代谢的多样性，并为合成生物学和代谢工程提供新的代谢工具 | Aspergillus niger中的戊糖还原酶及其同源基因 | 代谢工程 | NA | 基因组挖掘，系统发育分析，体外和体内功能分析 | NA | 基因表达数据 | 五个额外的同源基因 |
| 289 | 2024-08-07 |
Tuning the Transcriptional Activity of the CaMV 35S Promoter in Plants by Single-Nucleotide Changes in the TATA Box
2023-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00457
PMID:36563338
|
研究论文 | 研究通过单核苷酸替换改变CaMV 35S启动子的TATA盒序列，以调整其在植物中的转录活性 | 通过引入所有单核苷酸替换到CaMV 35S启动子的TATA盒序列，生成了一系列变体，并发现某些变体在植物中的活性低于野生型 | NA | 研究旨在通过调整启动子活性来优化植物中合成遗传电路的行为 | CaMV 35S启动子的TATA盒序列及其在植物中的转录活性 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | 21种CaMV 35S启动子变体在同源转基因植物中进行活性测试 |
| 290 | 2024-08-07 |
Customizing cellular signal processing by synthetic multi-level regulatory circuits
2023-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44256-1
PMID:38110405
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成多级调控电路定制工程化生物系统中的信号处理电路 | 引入了前所未有的复杂性调控机制和遗传电路，如转录和翻译控制，并将其整合到称为“多级电路”的混合电路中 | NA | 旨在通过合成生物学定制细胞信号处理电路，以应对全球挑战 | 多级电路设计及其在遗传电路设计范式中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-Dec-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
|
研究论文 | 本文通过计算生物学流程生成了一种属特异性的单链DNA结合蛋白库，并在不同假单胞菌中进行了高吞吐量的重组酶筛选和牛津纳米孔NGS分析，以提高假单胞菌属的基因组编辑能力 | 发现了新的单链DNA结合蛋白变体，这些变体在假单胞菌属中的等位基因替换频率高于现有变体，并扩展了假单胞菌属中的重组工程领域 | NA | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力，增强其在生物转化和合成生物学应用中的潜力 | 假单胞菌属的基因组编辑能力 | 合成生物学 | NA | NGS, ONT | NA | DNA | 四种假单胞菌属物种 |
| 292 | 2024-08-07 |
Automated Design of Synthetic Gene Circuits in the Presence of Molecular Noise
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00033
PMID:37812682
|
研究论文 | 本文探讨了在分子噪声影响下，如何自动化设计合成基因电路 | 结合混合整数非线性全局优化方法与部分积分-微分方程模型，有效近似化学主方程，实现了在分子噪声影响下的合成基因电路自动化设计 | NA | 解决分子噪声对微生物细胞中基因调控动态影响的问题 | 合成生物学中的合成基因电路设计 | 合成生物学 | NA | 混合整数非线性全局优化方法 | 部分积分-微分方程模型 | NA | NA |
| 293 | 2024-08-07 |
Challenges and advances towards the rational design of microalgal synthetic promoters in Chlamydomonas reinhardtii
2023-07-18, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad100
PMID:37025006
|
研究论文 | 本文讨论了在Chlamydomonas reinhardtii中设计和开发合成启动子的挑战和进展 | 提出了适用于微藻的高通量研究方法和新的方法来研究藻类启动子 | 微藻的合成启动子开发存在主要限制，但提供了克服这些限制的新建议和展望 | 优化和修改微藻的代谢输出，使其与现有的工业生物技术宿主竞争 | Chlamydomonas reinhardtii中的合成启动子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-08-07 |
Efficient de novo production of bioactive cordycepin by Aspergillus oryzae using a food-grade expression platform
2023-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02261-5
PMID:38071331
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用食品级表达平台Aspergillus oryzae高效生产生物活性化合物cordycepin的方法 | 通过合成生物学方法，成功构建了能够过量表达两个参与cordycepin生物合成代谢基因的A. oryzae工程菌株，实现了高效且成本有效的cordycepin生产 | NA | 克服传统Cordyceps spp.生产cordycepin的局限性，满足市场对cordycepin日益增长的需求 | cordycepin的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-07 |
The Construction of the Self-Induced Sal System and Its Application in Salicylic Acid Production
2023-Nov-28, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237825
PMID:38067556
|
研究论文 | 本文研究了自诱导Sal系统的构建及其在水杨酸生产中的应用 | 首次构建了完整的自诱导Sal系统，并通过引入人工反义RNA（atsRNAs）抑制生长必需基因，提高了水杨酸的产量 | NA | 开发新的合成生物学和代谢工程中的通信工具和诱导系统 | 自诱导Sal系统的构建及其在水杨酸合成中的应用 | 代谢工程 | NA | 人工遗传控制电路 | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-07 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-Dec-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
|
综述 | 本文综述了通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产植物萜类化合物的进展，特别是针对酵母的工程化 | 利用合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物，通过操纵宿主代谢、重构代谢途径、工程化酶的催化活性和亚细胞定位等创新方法 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法在酵母中生产植物萜类化合物的技术进展 | 植物萜类化合物在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-Dec-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
|
研究论文 | 本文比较了五种噬菌体衍生重组酶在三种与生物技术相关的假单胞菌株中的重组效率 | 首次展示了这些重组酶在假单胞菌属中的应用，为该属的基因操作提供了新的有效工具 | 研究仅限于三种特定的假单胞菌株，可能需要进一步验证在其他菌株中的效果 | 探索和优化假单胞菌属的基因操作工具，以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学中的应用 | 三种生物技术相关的假单胞菌株：P. putida KT2440, P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 重组酶技术 | NA | 基因组数据 | 三种假单胞菌株 |
| 298 | 2024-08-07 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-Dec-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
|
research paper | 本文报道了迄今为止最大的真核生物染色体synIV的从头合成，该染色体长度为1,454,621 bp，通过广泛的基因组简化和修改得到。 | 开发了megachunk组装结合分层集成策略，显著提高了合成染色体构建的准确性和灵活性。此外，通过操纵synIV的三维结构，探索了空间基因调控，并发现基因表达变化有限，表明在酵母核质中定位在基因调控中起次要作用。 | NA | 探索合成基因组是否能驱动生命，并研究染色体三维结构对基因调控的影响。 | 合成酵母染色体synIV及其三维结构。 | synthetic biology | NA | megachunk assembly, hierarchical integration strategy | NA | DNA sequence | 一个1,454,621 bp的酵母染色体synIV |
| 299 | 2024-08-07 |
Improving statins production: From non-genetic strategies to genetic strategies
2023-Dec, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300229
PMID:37563745
|
综述 | 本文综述了通过微生物细胞工厂生产他汀类药物的策略，包括传统发酵培养和现代合成生物制造 | 强调了可回收农业废弃物作为发酵底物在固态发酵中的潜在应用，并讨论了代谢工程策略和定向进化 | NA | 旨在促进他汀类药物的绿色生产模式 | 他汀类药物的生产策略 | 生物技术 | NA | 发酵技术，代谢工程 | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-08-07 |
Cell-free protein synthesis system: A new frontier for sustainable biotechnology-based products
2023-Dec, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.2514
PMID:37735977
|
综述 | 本文主要探讨了无细胞蛋白合成系统在多种产品生产中的应用及其在生物治疗方面的挑战和未来展望 | 无细胞蛋白合成系统是一种创新技术，具有广泛的应用潜力，能够挑战现有思维并解决环境和健康问题 | 尽管无细胞蛋白合成系统在多种应用中已被证明是成功的，但仍存在一些需要克服的障碍 | 探讨无细胞蛋白合成系统在可持续生物技术产品中的应用及其未来发展 | 无细胞蛋白合成系统及其在生物医学工业中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | NA | NA | NA |