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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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281 | 2024-08-07 |
Genome Mining Reveals a Surprising Number of Sugar Reductases in Aspergillus niger
2023-Nov-24, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof9121138
PMID:38132739
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘揭示了Aspergillus niger中糖还原酶的多样性 | 发现了五个额外的同源基因,这些基因可以替代原有的三种戊糖还原酶,并参与其他糖代谢途径 | NA | 探索真菌中初级碳代谢的多样性,并为合成生物学和代谢工程提供新的代谢工具 | Aspergillus niger中的戊糖还原酶及其同源基因 | 代谢工程 | NA | 基因组挖掘,系统发育分析,体外和体内功能分析 | NA | 基因表达数据 | 五个额外的同源基因 |
282 | 2024-08-07 |
Tuning the Transcriptional Activity of the CaMV 35S Promoter in Plants by Single-Nucleotide Changes in the TATA Box
2023-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00457
PMID:36563338
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研究论文 | 研究通过单核苷酸替换改变CaMV 35S启动子的TATA盒序列,以调整其在植物中的转录活性 | 通过引入所有单核苷酸替换到CaMV 35S启动子的TATA盒序列,生成了一系列变体,并发现某些变体在植物中的活性低于野生型 | NA | 研究旨在通过调整启动子活性来优化植物中合成遗传电路的行为 | CaMV 35S启动子的TATA盒序列及其在植物中的转录活性 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | 21种CaMV 35S启动子变体在同源转基因植物中进行活性测试 |
283 | 2024-08-07 |
Customizing cellular signal processing by synthetic multi-level regulatory circuits
2023-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44256-1
PMID:38110405
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研究论文 | 本文探讨了通过合成多级调控电路定制工程化生物系统中的信号处理电路 | 引入了前所未有的复杂性调控机制和遗传电路,如转录和翻译控制,并将其整合到称为“多级电路”的混合电路中 | NA | 旨在通过合成生物学定制细胞信号处理电路,以应对全球挑战 | 多级电路设计及其在遗传电路设计范式中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
284 | 2024-08-07 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-Dec-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
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研究论文 | 本研究通过访谈澳大利亚合成生物学中心的合成生物学家,探讨了合成生物学领域的伦理问题、承诺和实践 | 本研究揭示了合成生物学领域中伦理挑战的实际问题,与伦理文献中的抽象和推测性讨论形成对比 | NA | 理解合成生物学领域的伦理问题及其与伦理文献的关系 | 合成生物学领域的伦理挑战和实践 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈数据 | 参与访谈的合成生物学家 |
285 | 2024-08-07 |
Detection of viral RNAs at ambient temperature via reporter proteins produced through the target-splinted ligation of DNA probes
2023-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01028-y
PMID:37142844
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研究论文 | 本文介绍了一种无需仪器的环境温度下核酸检测方法INSPECTR,通过DNA探针的目标特异性拼接连接生成表达盒,实现报告蛋白的细胞外合成 | INSPECTR方法无需昂贵和复杂的设备,可在环境温度下进行核酸的准确和多重检测 | NA | 开发一种适用于即时护理点无需复杂设备的核酸检测方法 | 环境温度下的核酸检测技术 | 分子生物学 | NA | DNA探针拼接连接、细胞外报告蛋白合成 | NA | 核酸 | 约4,000份病毒RNA |
286 | 2024-08-07 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-Dec-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
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研究论文 | 本文通过计算生物学流程生成了一种属特异性的单链DNA结合蛋白库,并在不同假单胞菌中进行了高吞吐量的重组酶筛选和牛津纳米孔NGS分析,以提高假单胞菌属的基因组编辑能力 | 发现了新的单链DNA结合蛋白变体,这些变体在假单胞菌属中的等位基因替换频率高于现有变体,并扩展了假单胞菌属中的重组工程领域 | NA | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力,增强其在生物转化和合成生物学应用中的潜力 | 假单胞菌属的基因组编辑能力 | 合成生物学 | NA | NGS, ONT | NA | DNA | 四种假单胞菌属物种 |
287 | 2024-08-07 |
Automated Design of Synthetic Gene Circuits in the Presence of Molecular Noise
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00033
PMID:37812682
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研究论文 | 本文探讨了在分子噪声影响下,如何自动化设计合成基因电路 | 结合混合整数非线性全局优化方法与部分积分-微分方程模型,有效近似化学主方程,实现了在分子噪声影响下的合成基因电路自动化设计 | NA | 解决分子噪声对微生物细胞中基因调控动态影响的问题 | 合成生物学中的合成基因电路设计 | 合成生物学 | NA | 混合整数非线性全局优化方法 | 部分积分-微分方程模型 | NA | NA |
288 | 2024-08-07 |
Challenges and advances towards the rational design of microalgal synthetic promoters in Chlamydomonas reinhardtii
2023-07-18, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad100
PMID:37025006
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研究论文 | 本文讨论了在Chlamydomonas reinhardtii中设计和开发合成启动子的挑战和进展 | 提出了适用于微藻的高通量研究方法和新的方法来研究藻类启动子 | 微藻的合成启动子开发存在主要限制,但提供了克服这些限制的新建议和展望 | 优化和修改微藻的代谢输出,使其与现有的工业生物技术宿主竞争 | Chlamydomonas reinhardtii中的合成启动子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
289 | 2024-08-07 |
Efficient de novo production of bioactive cordycepin by Aspergillus oryzae using a food-grade expression platform
2023-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02261-5
PMID:38071331
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研究论文 | 本研究开发了一种利用食品级表达平台Aspergillus oryzae高效生产生物活性化合物cordycepin的方法 | 通过合成生物学方法,成功构建了能够过量表达两个参与cordycepin生物合成代谢基因的A. oryzae工程菌株,实现了高效且成本有效的cordycepin生产 | NA | 克服传统Cordyceps spp.生产cordycepin的局限性,满足市场对cordycepin日益增长的需求 | cordycepin的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
290 | 2024-08-07 |
The Construction of the Self-Induced Sal System and Its Application in Salicylic Acid Production
2023-Nov-28, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237825
PMID:38067556
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研究论文 | 本文研究了自诱导Sal系统的构建及其在水杨酸生产中的应用 | 首次构建了完整的自诱导Sal系统,并通过引入人工反义RNA(atsRNAs)抑制生长必需基因,提高了水杨酸的产量 | NA | 开发新的合成生物学和代谢工程中的通信工具和诱导系统 | 自诱导Sal系统的构建及其在水杨酸合成中的应用 | 代谢工程 | NA | 人工遗传控制电路 | NA | NA | NA |
291 | 2024-08-07 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-Dec-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产植物萜类化合物的进展,特别是针对酵母的工程化 | 利用合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物,通过操纵宿主代谢、重构代谢途径、工程化酶的催化活性和亚细胞定位等创新方法 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法在酵母中生产植物萜类化合物的技术进展 | 植物萜类化合物在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
292 | 2024-08-07 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-Dec-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 本文比较了五种噬菌体衍生重组酶在三种与生物技术相关的假单胞菌株中的重组效率 | 首次展示了这些重组酶在假单胞菌属中的应用,为该属的基因操作提供了新的有效工具 | 研究仅限于三种特定的假单胞菌株,可能需要进一步验证在其他菌株中的效果 | 探索和优化假单胞菌属的基因操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学中的应用 | 三种生物技术相关的假单胞菌株:P. putida KT2440, P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 重组酶技术 | NA | 基因组数据 | 三种假单胞菌株 |
293 | 2024-08-07 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-Dec-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
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research paper | 本文报道了迄今为止最大的真核生物染色体synIV的从头合成,该染色体长度为1,454,621 bp,通过广泛的基因组简化和修改得到。 | 开发了megachunk组装结合分层集成策略,显著提高了合成染色体构建的准确性和灵活性。此外,通过操纵synIV的三维结构,探索了空间基因调控,并发现基因表达变化有限,表明在酵母核质中定位在基因调控中起次要作用。 | NA | 探索合成基因组是否能驱动生命,并研究染色体三维结构对基因调控的影响。 | 合成酵母染色体synIV及其三维结构。 | synthetic biology | NA | megachunk assembly, hierarchical integration strategy | NA | DNA sequence | 一个1,454,621 bp的酵母染色体synIV |
294 | 2024-08-07 |
Improving statins production: From non-genetic strategies to genetic strategies
2023-Dec, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300229
PMID:37563745
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综述 | 本文综述了通过微生物细胞工厂生产他汀类药物的策略,包括传统发酵培养和现代合成生物制造 | 强调了可回收农业废弃物作为发酵底物在固态发酵中的潜在应用,并讨论了代谢工程策略和定向进化 | NA | 旨在促进他汀类药物的绿色生产模式 | 他汀类药物的生产策略 | 生物技术 | NA | 发酵技术,代谢工程 | NA | NA | NA |
295 | 2024-08-07 |
Cell-free protein synthesis system: A new frontier for sustainable biotechnology-based products
2023-Dec, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.2514
PMID:37735977
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综述 | 本文主要探讨了无细胞蛋白合成系统在多种产品生产中的应用及其在生物治疗方面的挑战和未来展望 | 无细胞蛋白合成系统是一种创新技术,具有广泛的应用潜力,能够挑战现有思维并解决环境和健康问题 | 尽管无细胞蛋白合成系统在多种应用中已被证明是成功的,但仍存在一些需要克服的障碍 | 探讨无细胞蛋白合成系统在可持续生物技术产品中的应用及其未来发展 | 无细胞蛋白合成系统及其在生物医学工业中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | NA | NA | NA |
296 | 2024-08-07 |
Live Biotherapeutic Products as Cancer Treatments
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2626
PMID:37317784
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研究论文 | 本文探讨了利用活体生物治疗产品作为癌症治疗手段的最新进展和当前挑战 | 文章强调了微生物在癌症治疗中的新角色,特别是通过合成生物学工具开发的工程化生物治疗产品 | 尽管取得了进展,但目前只有 Bacillus Calmette-Guérin 被批准用于人类使用 | 研究旨在探索和改进使用活细菌作为癌症治疗的方法 | 研究对象包括微生物在癌症治疗中的应用及其工程化产品 | NA | 癌症 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
297 | 2024-08-07 |
Improving thermo-tolerance of Saccharomyces cerevisiae by precise regulation of the expression of small HSP
2023-Dec-08, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d3ra05216h
PMID:38090074
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,验证了通过精确调控小热休克蛋白(HSP)表达来提高酿酒酵母热耐受性的效果 | 研究首次通过合成生物学方法,精确调控小热休克蛋白的表达,显著提高了酿酒酵母在高温下的生长速率和细胞存活率 | 研究仅限于特定的酿酒酵母菌株和特定的热休克蛋白基因电路,可能不适用于所有微生物或所有类型的热休克蛋白 | 探索和应用其他应激耐受基因电路的科学参考价值 | 酿酒酵母的热耐受性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及多个酿酒酵母菌株和不同强度启动子的热休克蛋白基因电路 |
298 | 2024-08-07 |
Heterologous biosynthesis of medicarpin using engineered Saccharomyces cerevisiae
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.003
PMID:38090379
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研究论文 | 本研究通过工程化的酿酒酵母实现了异源生物合成medicarpin | 首次通过合成生物学策略在酿酒酵母中实现了medicarpin的异源生物合成,并通过增加特定基因的拷贝数提高了产量 | NA | 探索通过合成生物学方法实现medicarpin的经济可持续生产 | medicarpin的生物合成及其在酿酒酵母中的表达 | 合成生物学 | NA | 比较转录组学和生物信息学分析 | NA | 基因和酶活性数据 | 涉及八个关键基因和特定的酶反应 |
299 | 2024-08-07 |
An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness
2023-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43272-5
PMID:38052788
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研究论文 | 本文介绍了一种基于无机多聚磷酸盐(polyP)与二价金属阳离子和阳离子三肽相互作用形成的两类凝聚滴构建的抗辐射原细胞模型 | 首次展示了在极端原生条件下,通过特定的凝聚滴组合形成的原细胞模型具有抗辐射能力,并能有效清除活性氧,保护内部核酸样凝聚体 | NA | 研究原细胞在极端原生条件下的生存能力和适应性,特别是在原生辐射环境中的表现 | 原细胞模型及其在原生辐射条件下的生存和适应性 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
300 | 2024-08-07 |
Carotenoid Pathway Engineering in Tobacco Chloroplast Using a Synthetic Operon
2023-Nov, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00693-3
PMID:36884112
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研究论文 | 本研究通过叶绿体工程操纵烟草植物的天然类胡萝卜素途径,以生产酮类胡萝卜素 | 使用酮化酶基因与番茄红素环化酶和羟化酶基因相结合的新方法,成功重定向了类胡萝卜素途径,生产出酮-玉米黄素 | 仅观察到酮-玉米黄素的少量生产 | 通过叶绿体工程在烟草植物中生产酮类胡萝卜素 | 烟草植物的类胡萝卜素途径 | NA | NA | 叶绿体工程 | NA | NA | 转基因烟草植物 |