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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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301 | 2024-08-07 |
Computational analysis of protein synthesis, diffusion, and binding in compartmental biochips
2023-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02237-5
PMID:38037098
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研究论文 | 研究在硅基二维分隔生物芯片中蛋白质合成、扩散和结合的动力学过程 | 引入陷阱结合效率来表征系统性能,并通过数学和计算模型识别陷阱结合效率的三种不同状态 | NA | 扩展合成、扩散和结合在分隔系统中的理论知识基础,以更好地控制分子自组装 | 蛋白质复合体的合成和组装 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
302 | 2024-08-07 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 研究通过计算技术和合成生物学方法,探索了脂质II靶向糖肽抗生素(如替考拉宁和万古霉素)的祖先起源及其进化过程 | 首次通过合成生物学技术复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子,并揭示了其结构和抗生素活性 | NA | 理解自然如何围绕共同的机制演化抗生素,并探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化历史 | 脂质II靶向糖肽抗生素及其祖先分子 | NA | 抗生素耐药性细菌感染 | 计算技术,合成生物学技术 | NA | NA | NA |
303 | 2024-08-07 |
Installing xylose assimilation and cellodextrin phosphorolysis pathways in obese Yarrowia lipolytica facilitates cost-effective lipid production from lignocellulosic hydrolysates
2023-Nov-29, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02434-9
PMID:38031183
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研究论文 | 本文通过合理和组合策略,首次成功改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高了脂质产量和降低了生产成本 | 首次在Yarrowia lipolytica中构建了木糖同化和纤维糊精磷酸解途径,并通过增强PPP途径和增加细胞质NADPH供应,缓解了葡萄糖对木糖利用的抑制作用 | NA | 研究如何通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高脂质产量和降低生产成本 | Yarrowia lipolytica细胞,木糖和纤维糊精 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
304 | 2024-08-07 |
Modular Cloning by Golden Gate Assembly and Possible Application in Pathway Design
2023-Jun-28, Chimia
IF:1.1Q3
DOI:10.2533/chimia.2023.437
PMID:38047784
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研究论文 | 本文介绍了模块化克隆技术及其在合成生物学中的应用,特别是通过Golden Gate组装快速生成表达载体库的方法 | 模块化克隆技术通过Golden Gate组装支持一步法和一锅法反应,快速生成表达载体库,为代谢途径或酶级联设计提供了新的解决方案 | 由于缺乏高通量筛选方法,模块化克隆技术在工业应用中仍较少,且某些应用受限 | 探讨模块化克隆技术在合成生物学中的应用及其在工业应用中的潜力 | 模块化克隆技术及其在代谢途径和酶级联设计中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 遗传元素(如启动子、核糖体结合位点和标签) | 涉及多达20种酶的复杂途径 |
305 | 2024-08-07 |
Advancing reproducibility can ease the 'hard truths' of synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad014
PMID:38022744
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学领域中可重复性的现状及其改进方法 | 提出通过教育、激励和投资相关基础设施来提高合成生物学研究的可重复性 | 未具体说明当前可重复性问题的具体限制 | 探讨如何提高合成生物学研究的可重复性以促进其技术应用 | 合成生物学领域的可重复性问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
306 | 2024-08-07 |
Elucidating the impact of in vitro cultivation on Nicotiana tabacum metabolism through combined in silico modeling and multiomics analysis
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1281348
PMID:38023876
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研究论文 | 本文通过结合计算机模拟和多组学分析,系统地阐明了体外培养对烟草代谢网络的影响 | 首次构建了烟草的基因组规模代谢网络(GSMN),并结合多组学分析,揭示了体外培养条件下烟草代谢的系统性变化 | 文章中提到的体外培养对植物整体代谢的系统性影响仍了解不足 | 系统地理解和表征植物代谢行为,为高效的植物代谢工程和合成生物学提供基础 | 烟草的代谢网络及其在体外培养条件下的变化 | 合成生物学 | NA | 多组学分析 | 基因组规模代谢网络(GSMN) | 代谢物 | NA |
307 | 2024-08-07 |
Pyramiding stacking of multigenes (PSM): a simple, flexible and efficient multigene stacking system based on Gibson assembly and gateway cloning
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1263715
PMID:38026899
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Gibson组装和Gateway克隆的Pyramiding Stacking of Multigenes (PSM)系统,用于将多个转基因整合到一个T-DNA中 | PSM系统结合了Gibson组装和Gateway克隆的优点,采用倒金字塔堆叠路线,实现了快速、灵活和高效的多基因堆叠 | NA | 开发一种简单、灵活且高效的多基因堆叠系统,用于遗传工程和合成生物学 | 多基因堆叠系统的设计和其在拟南芥中的应用 | 遗传工程 | NA | Gibson组装, Gateway克隆 | NA | DNA | 四个和九个基因表达盒分别组装到目标载体中,用于生成两个二元表达载体 |
308 | 2024-08-07 |
Biotechnological production of omega-3 fatty acids: current status and future perspectives
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1280296
PMID:38029217
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综述 | 本文综述了omega-3脂肪酸的生物技术生产现状、关键挑战及未来展望 | 利用合成生物学和工程微生物细胞工厂提供更稳定、可持续和经济的omega-3脂肪酸来源 | 目前生物技术生产omega-3脂肪酸仍面临降低生产成本和提高产品质量与可持续性的挑战 | 探讨生物技术在生产omega-3脂肪酸中的应用及未来发展方向 | omega-3脂肪酸,包括ALA、EPA和DHA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
309 | 2024-08-07 |
Unleashing the potential of catalytic RNAs to combat mis-spliced transcripts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1244377
PMID:38047291
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综述 | 本文综述了利用催化RNA和纳米药物递送系统来治疗由于剪接异常导致的遗传疾病的可能性 | 探讨了利用合成生物学、高通量深度测序和计算方法来克服催化RNA递送挑战的新视角 | NA | 探讨利用催化RNA和纳米药物递送系统治疗剪接异常转录本的方法 | 剪接异常导致的遗传疾病,如肌肉萎缩症、阿尔茨海默病、亨廷顿病和骨髓增生异常综合征 | 合成生物学 | 遗传疾病 | 高通量深度测序 | NA | 转录组数据 | NA |
310 | 2024-08-07 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
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研究论文 | 本文介绍了一种基于口服可用的小分子simeprevir及其目标NS3/4A蛋白酶的化学诱导二聚化(CID)模块,用于控制生物过程,如基因表达和细胞凋亡。 | 本文首次将simeprevir用于CID模块,扩展了CID系统在临床应用中的潜力,特别是控制细胞和基因疗法。 | NA | 探索新的化学诱导二聚化系统在临床应用中的潜力,特别是控制细胞和基因疗法。 | 研究simeprevir作为小分子诱导剂的CID模块在控制生物过程中的应用。 | 合成生物学 | 肝炎C病毒 | 化学诱导二聚化(CID) | NA | 细胞 | 使用异种移植小鼠模型进行实验 |
311 | 2024-08-07 |
[Biomanufacturing of bioactive compounds: current situation, challenges, and future perspectives]
2023-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230334
PMID:38013171
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综述 | 本文回顾了生物制造技术的发展历程,探讨了其在生物经济中的应用及未来展望 | 利用合成生物学和自动化技术加速生物制造的发展,推动可持续生产方式 | NA | 全面理解生物制造在生物经济增长和创新中的作用 | 生物制造技术及其在各行业中的应用 | NA | NA | 生物制造 | NA | NA | NA |
312 | 2024-08-07 |
[Advances in the biosynthesis of cyclodipeptide type natural products derived from actinomycetes]
2023-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230068
PMID:38013180
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综述 | 本文综述了由放线菌产生的环二肽类天然产物的生物合成途径及其后修饰机制 | 总结了环二肽骨架的生物合成途径和放线菌中的后修饰机制 | NA | 加速环二肽的基因组挖掘及其分离、纯化和结构鉴定,并揭示新型环二肽的生物合成机制及其合成生物学设计 | 环二肽类天然产物的生物合成 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶 (NRPS) 或环二肽合成酶 (CDPS) | NA | NA | NA |
313 | 2024-08-07 |
Genomic Insights on the Carbon-Negative Workhorse: Systematical Comparative Genomic Analysis on 56 Synechococcus Strains
2023-Nov-18, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10111329
PMID:38002453
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研究论文 | 对56种Synechococcus菌株的完整基因组进行综合分析,阐明其遗传关系、环境适应性及其在基因组水平上的反映 | 揭示了Synechococcus菌株的开放基因组模式,以及冷适应和热适应菌株在核心基因功能单元中的独特KO功能单元 | NA | 深入理解Synechococcus的代谢潜力,促进蓝细菌生物技术的发展和工业应用 | 56种Synechococcus菌株的基因组 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因组数据 | 56种Synechococcus菌株 |
314 | 2024-08-07 |
Evaluation of Reference Genes for Normalizing RT-qPCR and Analysis of the Expression Patterns of WRKY1 Transcription Factor and Rhynchophylline Biosynthesis-Related Genes in Uncaria rhynchophylla
2023-Nov-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216330
PMID:38003520
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研究论文 | 评估用于归一化RT-qPCR的参考基因,并分析钩藤中WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因的表达模式 | 首次报道了钩藤中参考基因的稳定性,并为未来的基因表达分析提供了重要基础 | NA | 选择和评估适用于基因表达分析的适当参考基因,特别是涉及钩藤中生物碱生物合成途径的转录因子和关键酶基因 | 钩藤中的参考基因、WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 14个关键生物碱酶基因和一个转录因子基因在三种实验压力处理下的表达 |
315 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Cyanotoxin Synthesis and Applications: A Comprehensive Review
2023-Oct-26, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11112636
PMID:38004647
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综述 | 本文综述了蓝藻毒素的分类、生物合成途径及其潜在应用 | 强调了蓝藻毒素在生物技术领域的潜力,包括作为化感物质、杀虫剂和生物药物的应用 | NA | 促进对蓝藻毒素的全面理解及其在合成生物学和潜在应用中的研究 | 蓝藻毒素及其生物合成途径和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
316 | 2024-08-07 |
Use of an on/off tetracycline riboswitch to control protein production in Komagataella phaffii
2023-Nov-21, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-023-01637-5
PMID:37989852
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研究论文 | 本研究利用四环素激活的RNA适配体在翻译水平上调控Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 首次在Komagataella phaffii中使用四环素激活的RNA适配体精确控制基因表达 | NA | 开发新的遗传工具以精确控制Komagataella phaffii中的基因表达 | Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 合成生物学 | NA | RNA适配体 | NA | 基因表达 | NA |
317 | 2024-08-07 |
Developing the Limosilactobacillus reuteri Chassis through an Endogenous Programmable Endonuclease-Based Genome Editing Tool
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00450
PMID:37934952
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研究论文 | 本研究开发了一种基于内源性可编程核酸内切酶的基因组编辑工具,用于改进Limosilactobacillus reuteri作为活体生物治疗产品的底盘 | 研究中发现了Limosilactobacillus reuteri中的一种亚型II-A CRISPR-Cas9系统,并对其进行了重新编程,实现了高效的基因删除、点突变、大片段删除和基因整合 | NA | 开发基于内源性核酸内切酶的新型益生菌底盘,为其他微生物的功能基因研究提供基因组编辑工具 | Limosilactobacillus reuteri及其内源性核酸内切酶 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9系统 | CRISPR-Cas9 | 基因组数据 | 304株Limosilactobacillus reuteri菌株 |
318 | 2024-08-07 |
Physical Laboratory Automation in Synthetic Biology
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00345
PMID:37935025
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综述 | 本文综述了合成生物学中实验工作流程的物理自动化现状,并分类了自动化状态 | 强调了智能硬件和软件工具在自动化实验关键元素方面的显著进展 | 缺乏DBTL模块间的连接以及访问和采用的障碍仍然是实现实验室自动化全部潜力的重大挑战 | 探讨合成生物学中实验自动化的现状及未来发展方向 | 合成生物学中的实验自动化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
319 | 2024-08-07 |
Rational design of microRNA-responsive switch for programmable translational control in mammalian cells
2023-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43065-w
PMID:37938567
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研究论文 | 本文设计了一种可编程的miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES)翻译激活与抑制(PROMITAR)平台,用于在单一RNA构建体中实现基于miRNA的翻译上调和下调。 | 开发了一种新的PROMITAR平台,能够在单一RNA构建体中实现miRNA介导的翻译调控,并展示了其在构建逻辑门和细胞类型分类器circRNAs中的应用。 | NA | 设计并验证一种新的RNA合成生物学工具,用于未来的生物医学应用。 | 哺乳动物细胞中的可编程翻译控制策略。 | RNA合成生物学 | NA | miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES) | NA | RNA | NA |
320 | 2024-08-07 |
Expression Patterns and Functional Analysis of Three SmTAT Genes Encoding Tyrosine Aminotransferases in Salvia miltiorrhiza
2023-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242115575
PMID:37958559
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研究论文 | 研究丹参中三种编码酪氨酸氨基转移酶的SmTAT基因的表达模式和功能 | 首次详细研究了丹参中三种SmTAT基因的表达模式和生物化学特性,并验证了它们在烟草叶中的功能 | NA | 探讨丹参中三种SmTAT基因的功能及其在代谢工程或合成生物学中的应用潜力 | 丹参中的三种SmTAT基因及其编码的酪氨酸氨基转移酶 | 生物技术 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 三种SmTAT基因在不同组织中的表达及在烟草叶中的过表达 |