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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-10-27 |
Synthetic Biology Design as a Paradigm Shift toward Manufacturing Affordable Adeno-Associated Virus Gene Therapies
2023-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00589
PMID:36627108
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研究论文 | 本文讨论了利用合成生物学设计降低腺相关病毒(AAV)生产成本的最新努力,并提出这些努力可能在使基因治疗更加广泛可及方面发挥重要作用 | 本文提出了利用合成生物学设计降低AAV生产成本的新方法,以解决当前基因治疗高成本的问题 | 本文主要讨论了合成生物学在降低AAV生产成本方面的潜力,但未提供具体的实验数据或实施细节 | 探讨合成生物学在降低腺相关病毒(AAV)生产成本方面的应用,以使基因治疗更加广泛可及 | 腺相关病毒(AAV)作为基因治疗载体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计 | NA | NA | NA |
22 | 2024-10-26 |
Mass-Activated Droplet Sorting for the Selection of Lysine-Producing Escherichia coli
2023-10-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c03080
PMID:37820298
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研究论文 | 本文展示了使用质量激活液滴分选(MADS)技术,通过电喷雾电离质谱(ESI-MS)信号强度选择产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞 | 首次使用MADS技术进行液滴分选,替代了传统的荧光分析方法,提高了细胞工程的效率 | 依赖于电喷雾电离质谱(ESI-MS)信号强度进行分选,可能存在信号检测的局限性 | 开发一种新的方法来筛选和分选合成生物学中的变异细胞库,以提高细胞工程的效率 | 产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 电喷雾电离质谱(ESI-MS) | NA | 质谱信号 | 20 nL液滴,0.5样本/秒,96-98%纯度的高产变异细胞 |
23 | 2024-10-21 |
Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572113
PMID:38187604
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研究论文 | 本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置,能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作 | 开发了一种可编程的分子系统,能够整合多个细胞表面特征,将目标输入转换为用户定义的输出 | NA | 探索细胞表面特征的差异,开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞 | 细胞表面特征和蛋白质装置 | 合成生物学 | NA | 邻近门控蛋白剪接 | NA | 蛋白质 | NA |
24 | 2024-10-21 |
Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad016
PMID:38149045
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研究论文 | 研究在合成细胞中通过RuBisCO的细胞外表达实现ATP生产 | 首次测试了RuBisCO在细胞外表达系统中的表达及其活性介导的ATP合成 | 尚未实现完全独立的能量生产 | 探索在合成细胞中实现持续生物能量生产的可能性 | RuBisCO酶及其在细胞外表达系统中的ATP合成能力 | 合成生物学 | NA | 细胞外表达系统 | NA | NA | NA |
25 | 2024-10-20 |
Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution
2023-Dec-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1
PMID:38196584
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研究论文 | 本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法,用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表 | 提出了一种新的酶辅助测序方法(ESEGA),相比之前的测序方法,具有更高的转录效率和保真度 | NA | 开发一种新的测序工具,用于测序通过人工扩展遗传信息系统(AEGIS)创建的分子 | 通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子 | 生物技术 | NA | 酶辅助测序 | NA | DNA序列 | 涉及三种任务的实验,包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估 |
26 | 2024-10-20 |
The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562147
PMID:37873347
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研究论文 | 研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 提出了一个新的模型,解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性 | NA | 探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化 | H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 表观遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA |
27 | 2024-10-20 |
Long oligodeoxynucleotides: chemical synthesis, isolation via catching-by-polymerization, verification via sequencing, and gene expression demonstration
2023, Beilstein journal of organic chemistry
IF:2.2Q2
DOI:10.3762/bjoc.19.146
PMID:38170048
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研究论文 | 本文报道了一种直接从头化学合成400个核苷酸的寡脱氧核苷酸(ODN)的方法,并通过捕获-聚合(CBP)方法从复杂的反应混合物中分离这些ODN | 本文提出了一种新的化学合成方法,能够合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组,这是现有技术难以实现的 | NA | 开发一种新的化学合成方法,用于合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组 | 400个核苷酸的寡脱氧核苷酸(ODN)及其在绿色荧光蛋白(GFP)基因表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 捕获-聚合(CBP)方法、Sanger测序、Gibson组装 | NA | DNA序列 | 400个核苷酸的ODN、399和401个核苷酸的ODN、800个核苷酸的GFP基因构建体 |
28 | 2024-10-19 |
LcSAO1, an Unconventional DOXB Clade 2OGD Enzyme from Ligusticum chuanxiong Catalyzes the Biosynthesis of Plant-Derived Natural Medicine Butylphthalide
2023-Dec-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417417
PMID:38139246
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研究论文 | 研究了川芎中一种非传统的DOXB Clade 2OGD酶LcSAO1在植物源天然药物丁苯酞生物合成中的作用 | 发现了LcSAO1酶在丁苯酞生物合成中的关键作用,并通过结构建模和定点突变揭示了其活性位点 | 研究主要集中在酶的鉴定和功能验证,未涉及完整的生物合成途径 | 揭示丁苯酞生物合成途径中的关键酶及其作用机制 | 川芎中的LcSAO1酶及其在丁苯酞生物合成中的作用 | 生物化学 | 中风 | 2-OGD酶分析 | NA | 转录组数据 | 多个川芎组织样本 |
29 | 2024-10-19 |
Advances in the Discovery and Engineering of Gene Targets for Carotenoid Biosynthesis in Recombinant Strains
2023-12-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13121747
PMID:38136618
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综述 | 本文综述了类胡萝卜素生物合成途径及其在重组菌株中的基因靶点发现与工程化 | 本文总结了影响类胡萝卜素产量的基因靶点及其在重组菌株中的应用潜力 | NA | 探讨类胡萝卜素生物合成途径中的基因靶点及其在重组菌株中的应用 | 类胡萝卜素生物合成途径中的基因靶点 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因 | NA |
30 | 2024-10-19 |
A Synthetic Signaling Network Imitating the Action of Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism
2023-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202301562
PMID:37156014
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研究论文 | 本文设计了一种合成信号网络,模拟免疫细胞对细菌代谢的反应 | 通过设计响应性DNA颗粒和抗生素负载脂质囊泡的协作行动,模拟了免疫细胞对病原体的捕获和失活过程 | NA | 探索合成生物学中复杂生物行为的复制 | 合成信号网络、响应性DNA颗粒、抗生素负载脂质囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
31 | 2024-10-19 |
Synthetic microbes and biocatalyst designs in Thailand
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2023.02.003
PMID:39416912
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综述 | 本文对泰国在过去十年中进行的合成生物学相关学术研究进行了批判性回顾 | 本文讨论了支持未来BCG合成生物学发展的技术领域,如酶催化、酶工程和与培养条件相关的系统生物学 | NA | 进一步推动泰国合成生物学领域的发展 | 泰国在合成生物学领域的研究,包括基因操作、代谢工程、辅因子增强以生产有价值的化学品,以及使用系统生物学分析合成细胞 | 合成生物学 | NA | 基因操作、代谢工程、酶催化、酶工程、系统生物学 | NA | NA | NA |
32 | 2024-10-19 |
Synthetic biology in Indonesia: Potential and projection in a country with mega biodiversity
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2023.02.002
PMID:39416916
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综述 | 本文概述了合成生物学在印度尼西亚的发展,特别是利用其丰富的生物多样性 | 探讨了合成生物学在解决国家问题中的潜力,并展望了其在印度尼西亚的未来发展 | 简要提及了发展过程中可能遇到的挑战 | 探讨合成生物学在印度尼西亚的潜力和未来发展 | 印度尼西亚的生物多样性和合成生物学应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
33 | 2024-10-19 |
SynBio Africa's story from the grassroots, the present, and the future
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.11.003
PMID:39416917
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研究论文 | 本文介绍了SynBio Africa的愿景及其在非洲推广合成生物技术、产品和服务的途径 | 提出了在非洲建立首个合成生物学卓越中心的建议,并设定了六个主题 | 非洲关于合成生物学及其监管政策的信息非常有限 | 推动非洲合成生物学技术的发展,促进国家发展 | 合成生物学在非洲的应用,包括生物经济、创新药物、减少污染和增加作物产量 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
34 | 2024-10-18 |
A microbial evolutionary approach for a sustainable future
2023-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14331
PMID:37602659
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物进化方法实现可持续发展的潜力 | 提出利用快速进化的原核生物及其在合成生物学中的可操作性,以及其在处理有机和无机化学物质方面的天然多样性,来解决社会面临的紧迫问题 | NA | 探讨如何利用微生物进化方法实现可持续发展 | 原核生物及其在可持续发展中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
35 | 2024-10-17 |
Dynamic RNA synthetic biology: new principles, practices and potential
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2269508
PMID:38044595
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综述 | 本文综述了动态RNA合成生物学在分子、电路和细胞尺度上的最新进展及其在环境、人类健康和生物生产等社会规模应用中的潜力 | 本文介绍了动态RNA折叠和功能的核心概念,并讨论了将这些概念纳入的最新技术,如工程化核开关、核酶、RNA折纸、RNA链置换电路、生物材料、生物分子凝聚物、细胞外囊泡和合成细胞 | NA | 探讨动态RNA合成生物学在不同尺度上的应用及其对RNA生物技术的影响 | 动态RNA系统在分子、电路和细胞尺度上的设计和应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程技术 | NA | NA | NA |
36 | 2024-10-16 |
Protein engineering in the computational age: An open source framework for exploring mutational landscapes in silico
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12028
PMID:38094241
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研究论文 | 本文介绍了在计算时代下蛋白质工程的发展,并提出了一个开源框架InFinity 1.0,用于探索蛋白质突变景观的计算模拟 | 提出了InFinity 1.0框架,旨在提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 目前蛋白质工程项目所需的专门知识仍集中在少数专业人士手中,且iGEM竞赛的资源和时间限制阻碍了复杂项目的进展 | 开发一个计算框架,以提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 蛋白质工程及其在药物发现和工业生物技术中的应用 | 生物信息学 | NA | 计算工具和高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
37 | 2024-10-16 |
Israel and the global synthetic biology ecosystem
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12027
PMID:38094240
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综述 | 本文概述了以色列在合成生物学领域的活动,包括历史背景、当前策略、前景和相关发展 | NA | NA | 提供以色列合成生物学领域的概述 | 以色列的合成生物学生态系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
38 | 2024-10-15 |
Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering
2023-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02251-7
PMID:38031061
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研究论文 | 本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术,在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰,以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 通过计算机设计算法和湿实验筛选,成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量 | NA | 通过系统生物学和合成生物学工具,设计高效的微生物细胞工厂,以合成高价值产品 | 工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 代谢工程 | NA | 基于约束的重建与分析(COBRA)方法 | NA | 基因组数据 | 17种基因组修饰,包括9个基因敲除和8个基因过表达 |
39 | 2024-10-15 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
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研究论文 | 本文设计并合成了23,640个B细胞特异性启动子,并通过深度学习模型预测其转录强度 | 本文首次将合成生物学与深度学习结合,用于解码和重编DNA调控语法,并设计了大量B细胞特异性启动子 | NA | 解码B细胞特异性转录调控机制,并为B细胞工程提供大量非相似启动子 | B细胞特异性启动子及其在免疫球蛋白V基因转录中的作用 | 合成生物学 | NA | MPRA(大规模并行报告分析) | 深度学习模型 | DNA序列 | 23,640个合成的B细胞特异性启动子 |
40 | 2024-10-15 |
Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438
PMID:38020966
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研究论文 | 本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用 | 本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展,特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台,开启了定制生物学的新时代 | 尽管取得了显著进展,但仍存在一些障碍,限制了工程真核细胞的更广泛应用 | 探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力 | 酵母作为真核生物的研究和工业用途 | 生物技术 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA |