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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-01 |
Artificial Diploid Escherichia coli by a CRISPR Chromosome-Doubling Technique
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205855
PMID:36642845
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研究论文 | 利用CRISPR染色体加倍技术构建人工二倍体大肠杆菌细胞 | 首次通过CRISPR技术构建稳定的人工二倍体大肠杆菌单细胞,并验证其特性 | 二倍体大肠杆菌生长显著减慢,且仅限于细菌中应用 | 探索合成生物学中人工多倍体细胞构建方法及其基础生命科学问题 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR、流式细胞术、定量PCR、荧光原位杂交、第三代基因组测序 | NA | 基因组序列、细胞图像 | 多个大肠杆菌菌株样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 染色体加倍电路 | 基础生命科学、工业生物技术 |
| 22 | 2026-04-13 |
A Genetic Engineering Toolbox for the Lignocellulolytic Anaerobic Gut Fungus Neocallimastix frontalis
2023-04-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00502
PMID:36920337
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研究论文 | 本文开发了一种用于厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis的遗传工程工具箱,实现了其瞬时转化 | 首次发现厌氧真菌具有天然DNA摄取能力,并基于此开发了包含多种选择标记、报告蛋白、启动子、终止子和核定位标签的遗传工具箱 | 目前仅实现了瞬时转化,稳定转化体系尚未建立;遗传工具数量仍有限 | 开发厌氧真菌的遗传操作工具以促进其在生物技术中的应用 | 厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis | 合成生物学 | NA | 遗传转化、基因组学分析 | NA | 基因组数据、实验验证数据 | NA | CRISPR-Cas9(潜在应用,文中未明确使用),遗传转化体系 | Neocallimastix frontalis(厌氧真菌) | NA | 能源、环境、工业生物技术 |
| 23 | 2026-04-03 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
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综述 | 本文综述了通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的研究进展,比较了两者的结构特征,并强调了合成生物学在核糖体途径工程中的应用 | 揭示了非核糖体肽中曾被认为独特的结构特征也存在于核糖体合成肽中,并利用核糖体途径的简化性和修饰酶的多功能性进行工程化设计 | NA | 探讨如何通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽,以生产具有增强生物活性的类似物 | 非核糖体肽和核糖体合成并翻译后修饰的肽 | 合成生物学 | NA | 核糖体生物合成、翻译后修饰 | NA | NA | NA | 核糖体途径工程 | NA | NA | 医药 |
| 24 | 2026-03-31 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟以进行疾病建模的工程化平台的设计、特征及应用 | 系统总结了多种先进技术(如蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控装置和合成生物学)在提升肝细胞样细胞成熟度方面的创新应用 | 未提供具体实验数据验证各平台效果,主要基于现有文献进行归纳分析 | 开发更成熟的人类肝细胞体外模型,用于疾病机制研究、药物开发和细胞治疗 | 人多能干细胞(包括诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化产生的肝细胞样细胞 | 合成生物学与组织工程 | 肝脏疾病(包括病毒性肝炎、脂肪肝、疟疾、单基因疾病和药物性肝损伤等) | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 人类多能干细胞 | 通过遗传修饰加速和增强肝细胞样细胞成熟的合成生物学回路 | 医学(疾病建模、药物开发、细胞治疗) |
| 25 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
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研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包,扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化,具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包,以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 26 | 2026-03-13 |
Biosensor-based high-throughput screening enabled efficient adipic acid production
2023-Sep, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12669-z
PMID:37421473
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研究论文 | 本研究开发了一种基于生物传感器的高通量筛选平台,用于高效生产己二酸 | 通过组成性表达反向己二酸降解途径、设计和优化己二酸生物传感器,建立了高通量筛选平台,有效减少了遗传异质性对产物滴度的影响 | NA | 克服遗传异质性导致的产物滴度下降问题,推动己二酸的生物基生产工业化 | 己二酸生产菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 反向己二酸降解途径、己二酸生物传感器 | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-02-15 |
Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life
2023-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.22
PMID:41675531
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综述 | 本文回顾了人造生命领域的两种主要研究方法,并提出了基于生命起源过程的第三种可能途径 | 提出了“从生命起源出发的自下而上”新方法,该方法模拟生命起源过程,旨在建立自催化化学反应网络和定向进化系统 | 文中承认该领域仍缺乏定量数学模型和工具的应用,且所提新方法尚属理论构想 | 探讨人造生命的理论构建方法,促进合成生物学与生命起源研究领域的交流 | 人造生命的理论模型与构建方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自催化化学反应网络 | 基础研究 |
| 28 | 2026-02-15 |
From qualitative to quantitative: the state of the art and challenges for plant synthetic biology
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0326
PMID:41675245
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综述 | 本文综述了植物合成生物学从定性到定量的研究现状、面临的挑战及成功案例 | 强调了植物合成生物学向定量和可预测性研究转型的必要性,并指出该领域仍处于早期阶段 | 植物合成生物学面临工具不足和定量研究挑战,目前主要局限于模式植物 | 探讨植物合成生物学的研究现状、挑战及未来发展方向 | 植物合成生物学领域,特别是模式植物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式植物 | NA | 农业 |
| 29 | 2026-01-22 |
A zinc finger transcription factor tunes social behaviors by controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535374
PMID:37066210
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法重编程锌指转录因子ZFP189,探究其在鼠前额叶皮层中调控转座元件和免疫反应以调节社会行为的作用 | 利用合成生物学创建新型合成ZFP189转录因子,揭示其通过结合DNA转座元件富集区域调控免疫相关基因,从而协调社会行为所需的结构和转录神经适应 | 研究仅基于鼠模型,未在人类或其他物种中验证,且社会行为评估可能受实验条件限制 | 探究ZFP189在前额叶皮层中调控社会行为的神经生物学机制 | 鼠前额叶皮层中的ZFP189转录因子及其对转座元件和免疫基因的调控 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、病毒递送、RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 鼠前额叶皮层组织 | 合成生物学方法 | 鼠 | 合成ZFP189转录因子,包括激活型ZFP189以调控目标基因转录 | 医学 |
| 30 | 2025-12-23 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-12-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 本研究通过过表达PtRWA-C基因,揭示了其在杨树木质生物质中增加木聚糖乙酰化、木质素含量和S/G比例,从而降低糖化效率的作用,并发现其受HRD转录因子调控 | 首次在杨树中证明PtRWA-C过表达对木聚糖乙酰化和生物质抗降解性的影响,并识别HRD作为其直接调控因子 | 未涉及PtRWA-C在其他植物物种中的功能验证或大规模田间试验 | 探究PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的功能及调控机制 | 毛果杨(Populus trichocarpa)的PtRWA-C基因及其对次级细胞壁特性的影响 | 合成生物学 | NA | 基因共表达网络分析、表达数量性状位点(eQTL)分析、启动子结合实验 | NA | 基因表达数据、生物化学分析数据 | 未明确指定样本数量,但基于杨树转基因材料 | 基因过表达 | 毛果杨(Populus trichocarpa) | NA | 能源、工业生物技术 |
| 31 | 2025-12-23 |
Transcription factor module NLP-NIGT1 fine-tunes NITRATE TRANSPORTER2.1 expression
2023-11-22, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad458
PMID:37595050
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研究论文 | 本研究通过实验和数学模型揭示了转录因子模块NLP-NIGT1如何精细调控拟南芥高亲和硝酸盐转运蛋白NRT2.1的表达 | 结合微孔板实时检测和常微分方程建模两种方法,首次系统阐明了NIGT1在宽浓度硝酸盐条件下稳定NRT2.1表达振幅的作用机制 | 模型参数基于特定实验条件,在更复杂的体内环境或不同植物物种中的普适性有待验证 | 解析植物硝酸盐转运蛋白NRT2.1受多转录因子复杂调控的分子机制 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)的NRT2.1基因及其调控转录因子NLP和NIGT1 | 植物分子生物学 | NA | 微孔板实时启动子活性检测、常微分方程(ODE)数学模型 | 常微分方程模型 | 基因表达时序数据、启动子活性动态数据 | NA | NA | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | NLP-NIGT1前馈调控环路 | 农业 |
| 32 | 2025-12-16 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-12-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 比较五种噬菌体衍生重组酶在三种生物技术相关假单胞菌株中的重组效率,以开发高效遗传操作工具 | 首次在三种假单胞菌株中系统测试并比较多种噬菌体衍生重组酶的重组效率,为假单胞菌属提供快速、高效的靶向突变方法 | 研究仅针对三种假单胞菌株,可能无法代表整个假单胞菌属的多样性,且未在其他非模式细菌中验证策略的普适性 | 开发适用于假单胞菌属的高效遗传操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学等领域的应用 | 三种生物技术相关假单胞菌株:P. putida KT2440、P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 噬菌体衍生重组酶介导的重组工程 | NA | NA | 三种假单胞菌株 | 噬菌体衍生重组酶 | Pseudomonas putida KT2440, Pseudomonas protegens Pf-5, Pseudomonas protegens CHA0 | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 33 | 2025-12-12 |
A new paradigm in transplant immunology: At the crossroad of synthetic biology and biomaterials
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.002
PMID:37244257
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综述 | 本文探讨了合成生物学与生物材料在移植免疫学中的交叉应用,旨在通过工程化活体和非活体结构进行免疫调节 | 提出了合成生物学与生物材料结合的新范式,以增强移植免疫治疗的多样性和精准性 | NA | 研究合成生物学和生物材料在解决实体器官移植临床挑战中的潜在应用 | 实体器官移植受者及其免疫系统 | 移植免疫学 | 实体器官移植相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 34 | 2025-12-09 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-12-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
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研究论文 | 本文报道了合成酵母染色体synIV的从头合成,并探索了其三维结构对基因调控的影响 | 开发了megachunk组装结合分层整合策略,首次合成最大的真核染色体,并通过操纵三维结构实现染色体范围的转录调控 | 研究发现酵母核质内定位对基因调控作用较小,可能限制了空间调控的应用范围 | 探索合成基因组能否支持生命活动,并研究三维结构在基因调控中的作用 | 合成的酵母染色体synIV | 合成生物学 | NA | megachunk组装、分层整合策略、loxPsym位点锚定 | NA | 基因组序列数据、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酵母 | 通过loxPsym位点将染色体锚定至核内膜,实现转录抑制的合成生物电路 | 工业生物技术 |
| 35 | 2025-12-09 |
Engineered gut symbiont inhibits microsporidian parasite and improves honey bee survival
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2220922120
PMID:37307477
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研究论文 | 本研究通过工程化改造蜜蜂肠道共生菌,使其表达靶向微孢子虫寄生虫必需基因的双链RNA,从而抑制寄生虫增殖并提高蜜蜂存活率 | 首次利用合成生物学方法,工程化蜜蜂肠道共生菌来靶向抑制微孢子虫寄生虫,并通过RNA干扰机制实现长期保护 | NA | 开发一种替代小分子药物的长期策略,以对抗蜜蜂微孢子虫寄生虫感染,防止蜂群崩溃 | 蜜蜂及其肠道共生菌,以及微孢子虫寄生虫 | 合成生物学 | 寄生虫感染 | RNA干扰(RNAi),双链RNA(dsRNA)表达 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道共生菌 | 工程化共生菌表达靶向寄生虫必需基因的dsRNA,激活寄生虫的RNAi通路 | 农业 |
| 36 | 2025-12-06 |
[Improvement of the Approval System for the Development and Experimentation of Living Modified Organisms in Synthetic Biology]
2023-Aug-17, Jugan geon-gang gwa jilbyeong
DOI:10.56786/PHWR.2023.16.32.3
PMID:41334470
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中活体修饰生物体(LMOs)的开发和实验审批系统的现状,并提出改进方案以平衡安全与科研活力 | 提出一个旨在确保LMO研究安全同时促进相关研究活力的国家审批系统改进计划 | NA | 探索合成生物学相关LMOs的法律法规现状,识别LMO开发和实验趋势,并提出审批系统改进方案 | 活体修饰生物体(LMOs)的开发和实验审批系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-12-06 |
Engineering longevity-design of a synthetic gene oscillator to slow cellular aging
2023-04-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add7631
PMID:37104589
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研究论文 | 本文设计了一种合成基因振荡器,通过重编程酵母细胞的内源性切换开关,创建了自主遗传时钟,以减缓细胞衰老过程 | 首次将合成生物学方法应用于工程化长寿,通过构建基因振荡器来延迟细胞衰老的承诺,连接了基因网络架构与细胞寿命 | 研究基于酵母细胞模型,尚未在更复杂生物体中验证;可能未全面考虑所有衰老相关因素 | 工程化细胞长寿,通过合成基因网络设计来减缓衰老过程 | 酵母细胞 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 基因网络设计、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母细胞 | 合成基因振荡器,基于内源性切换开关重编程,产生核仁与线粒体衰老过程之间的持续振荡 | 医学 |
| 38 | 2025-11-20 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-06, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 探讨合成生物学、遗传电路和机器学习在癌症治疗中的新兴应用 | 结合非经典信号通路与合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤表型,并利用机器学习预测CAR-T细胞表型 | NA | 扩展未来基因电路的设计选择,开发能响应多重环境线索的细胞疗法 | 工程化T细胞、合成受体、信号传导通路 | 合成生物学 | 癌症 | 合成锌指工程、机器学习预测 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 合成受体信号电路、可控转录调节电路 | 医学 |
| 39 | 2025-11-18 |
Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
2023-05-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79815
PMID:37255080
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研究论文 | 本研究通过粗粒度模型验证了资源分配策略可解释不同细菌菌株生长速率和生长产量的显著差异 | 建立了连接蛋白质组组成与生长表型的资源分配模型,揭示了高生长速率不一定伴随低生长产量的新机制 | 模型基于标准实验室条件,在复杂环境中的适用性有待验证 | 探究细菌菌株生长速率和产量差异的生物学机制 | 不同细菌菌株 | 系统生物学 | NA | 计算建模、表型数据库分析 | 粗粒度资源分配模型 | 生长表型数据、代谢通量数据 | 数百个已发表菌株表型数据 | NA | 细菌 | NA | 代谢工程、合成生物学 |
| 40 | 2025-11-15 |
A unified approach to dissecting biphasic responses in cell signaling
2023-12-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86520
PMID:38054655
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研究论文 | 本文提供了一个统一的理论框架来分析细胞信号系统中的双相响应现象 | 通过分析从基础生化构件到典型网络结构再到特征明确的实例,建立了双相响应的统一理论框架,并揭示了其设计原则和结构限制因素 | 主要基于理论分析和计算模型,需要实验验证来证实理论预测 | 研究细胞信号系统中双相响应的机制和设计原理 | 细胞信号系统和转录后修饰系统 | 系统生物学 | NA | 分析和计算方法 | NA | 理论模型和计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 系统生物学和合成生物学 |