合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-12-08	Elevation of artemisinin content by co-transformation of artemisinin biosynthetic pathway genes and trichome-specific transcription factors in Artemisia annua 2023, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2023.1118082 PMID:36895880	研究论文	通过共转化青蒿素生物合成途径基因和毛状体特异性转录因子，提高青蒿中青蒿素含量的研究	通过构建包含多个青蒿素生物合成酶基因和毛状体特异性转录因子的过表达载体，实现了青蒿素含量的显著提高	植物遗传工程的稳定性受后代发育的限制	提高青蒿中青蒿素的含量，以实现全球范围内稳定且价格合理的供应	青蒿素生物合成途径基因和毛状体特异性转录因子	NA	疟疾	基因工程	NA	NA	T0和T1代转基因青蒿植株
22	2024-12-06	Genetic manipulation and tools in myxobacteria for the exploitation of secondary metabolism 2023-Jun, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2023.100075 PMID:39629250	综述	本文综述了黏细菌基因操作工具及其在次级代谢产物开发中的应用	强调了构建黏细菌底盘用于合成生物学研究和未开发次级代谢产物利用的必要性和紧迫性	黏细菌的独特社会性是其操作的主要限制因素	综述黏细菌基因操作的进展，特别是次级代谢产物的开发	黏细菌及其次级代谢产物	NA	NA	基因操作技术	NA	NA	NA
23	2024-12-06	Applications of toxin-antitoxin systems in synthetic biology 2023-Jun, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2023.100069 PMID:39629251	综述	本文综述了毒素-抗毒素系统的最新分类及其在合成生物学中的应用	本文介绍了毒素-抗毒素系统在合成生物学中的新应用	NA	探讨毒素-抗毒素系统在合成生物学中的潜在应用	毒素-抗毒素系统及其在合成生物学中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
24	2024-12-06	Next-generation synthetic biology approaches for the accelerated discovery of microbial natural products 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100060 PMID:39628520	综述	本文综述了下一代合成生物学方法在加速微生物天然产物发现中的最新进展和趋势	强调了大规模激活沉默的生物合成基因簇、直接克隆或重构感兴趣的生物合成基因簇以进行异源表达，以及合成生物信息学天然产物方法在快速获取生物活性非核糖体肽中的应用	NA	探讨下一代合成生物学方法在加速微生物天然产物发现中的应用	微生物天然产物及其衍生物的生物合成基因簇	合成生物学	NA	合成生物学	NA	基因组数据	NA
25	2024-12-06	Natural and engineered cyclodipeptides: Biosynthesis, chemical diversity, and engineering strategies for diversification and high-yield bioproduction 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100067 PMID:39628525	综述	本文综述了天然和工程化环二肽的生物合成、化学多样性及其工程策略，以实现多样化和高效生物生产	探讨了通过未发现的NRPS和CDPS基因簇以及工程化方法进一步扩展环二肽化学空间的可能性	目前环二肽天然生物合成的产量较低，需要克服	总结NRPS和CDPS介导的环二肽生物合成知识，探讨工程化方法以增加化学多样性及提高产量	环二肽的生物合成、化学多样性及工程化策略	生物工程	NA	合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
26	2024-12-06	Sustainable biosynthesis of valuable diterpenes in microbes 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100058 PMID:39628524	综述	本文综述了二萜类化合物的生物合成及其在微生物中的可持续生产	本文介绍了利用合成生物学和代谢工程技术在微生物中高效生产高价值二萜类化合物的新进展	NA	总结近期发现的二萜类化合物及其相关酶和生物合成途径，特别是微生物直接从廉价碳源合成高价值二萜类化合物的方法	二萜类化合物及其生物合成途径	NA	NA	DNA测序和合成、组学分析、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
27	2024-12-01	Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations 2023-10-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00372 PMID:37793076	研究论文	本文开发了一种蒙特卡罗模型，用于分析细胞半径和细胞内体积分数如何定量影响基于水通道蛋白的报告基因信号	提出了基于两个扩散时间信号相减的差分成像方法，以提高信号特异性，并使用蒙特卡罗模拟分析了扩散性与水通道蛋白表达细胞百分比之间的关系	NA	开发一种定量框架，用于非侵入性地监测活体动物中基因工程设备的定位和功能	水通道蛋白信号与组织背景的区分	生物医学合成生物学	NA	蒙特卡罗模拟	NA	NA	NA
28	2024-11-22	Standardization of Fluorescent Reporter Assays in Synthetic Biology across the Visible Light Spectrum 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00386 PMID:37981737	研究论文	本文介绍了一种标准化荧光报告基因检测方法，用于合成生物学中可见光谱范围内的荧光报告基因	提出了一个简单且易于访问的校准方法，将设备特定的输出转换为标准化的输出，表达每孔的荧光量作为已知等效荧光染料浓度每细胞	仅限于可见光谱范围内的荧光报告基因	提高不同实验室间板读取器实验结果的可比性和可交换性	荧光报告基因的表达水平	合成生物学	NA	荧光报告基因检测	NA	荧光数据	NA
29	2024-11-22	At-Home, Cell-Free Synthetic Biology Education Modules for Transcriptional Regulation and Environmental Water Quality Monitoring 2023-10-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00223 PMID:37699423	研究论文	开发了四个稳定的无细胞生物传感教育模块，用于转录调控和环境水质监测	开发了无需专业实验室设备的稳定无细胞生物传感教育模块，适用于家庭和课堂使用	仅在K-12教师和高中生中进行了试点测试，需要进一步验证其在大规模教育中的有效性	解决合成生物学领域教育资源不平等的问题，提供易于使用的教育模块	无细胞生物传感教育模块，用于转录调控和环境水质监测	合成生物学	NA	无细胞生物传感技术	NA	NA	130名高中生和K-12教师
30	2024-11-17	Engineering Nannochloropsis oceanica for the production of diterpenoid compounds 2023-Dec, mLife IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mlf2.12097 PMID:38818264	研究论文	本文研究了如何通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产二萜化合物	首次展示了通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica生产二萜化合物casbene，并通过异源过表达和叶绿体定位上游限速酶进一步提高产量	NA	研究如何通过基因工程提高Nannochloropsis oceanica生产二萜化合物的能力	Nannochloropsis oceanica及其二萜化合物casbene的生产	NA	NA	基因工程、代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA
31	2024-11-17	High-throughput, microscopy-based screening and quantification of genetic elements 2023-Dec, mLife IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mlf2.12096 PMID:38818273	研究论文	本文介绍了一种高通量显微镜平台，用于筛选和量化遗传元件	开发了一种高通量显微镜平台，能够同时处理8×12孔琼脂糖垫板，筛选96种独立菌株或实验条件	NA	加速遗传元件的鉴定和表征，理解细胞表型与内部状态之间的关系	天然内源性启动子库中的遗传元件	合成生物学	NA	显微镜	NA	图像	96种独立菌株或实验条件
32	2024-08-07	Synthetic biology to revive microbial natural product discovery 2023-Jun, mLife IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mlf2.12071 PMID:38817621	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
33	2024-11-17	Research advances in probiotic fermentation of Chinese herbal medicines 2023-May, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.93 PMID:38868438	综述	本文综述了利用益生菌发酵中药的优势、发酵技术、益生菌菌株及其未来发展	本文介绍了利用前沿的微生物组和合成生物学工具，通过微生物细胞工厂大规模生产低成本的活性天然产物，加速现代中药生物制造	NA	总结益生菌发酵中药的优势和未来发展	中药及其发酵产物	NA	NA	发酵技术	NA	NA	NA
34	2024-10-27	Unlocking the magic in mycelium: Using synthetic biology to optimize filamentous fungi for biomanufacturing and sustainability 2023-Apr, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2023.100560 PMID:36756210	综述	本文综述了利用合成生物学优化丝状真菌用于生物制造和可持续发展的潜力	本文首次系统总结了合成生物学和计算工具在挖掘、工程化和优化丝状真菌作为生物生产底盘方面的应用	本文主要集中在综述现有技术和方法，未涉及具体的实验数据或案例研究	探讨如何利用合成生物学优化丝状真菌，以实现生物制造和可持续发展的目标	丝状真菌及其在生物制造和可持续发展中的应用潜力	合成生物学	NA	合成生物学、遗传工程、突变、实验进化、计算建模	NA	NA	NA
35	2024-10-27	Synthetic Biology Design as a Paradigm Shift toward Manufacturing Affordable Adeno-Associated Virus Gene Therapies 2023-01-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.2c00589 PMID:36627108	研究论文	本文讨论了利用合成生物学设计降低腺相关病毒（AAV）生产成本的最新努力，并提出这些努力可能在使基因治疗更加广泛可及方面发挥重要作用	本文提出了利用合成生物学设计降低AAV生产成本的新方法，以解决当前基因治疗高成本的问题	本文主要讨论了合成生物学在降低AAV生产成本方面的潜力，但未提供具体的实验数据或实施细节	探讨合成生物学在降低腺相关病毒（AAV）生产成本方面的应用，以使基因治疗更加广泛可及	腺相关病毒（AAV）作为基因治疗载体	合成生物学	NA	合成生物学设计	NA	NA	NA
36	2024-10-26	Mass-Activated Droplet Sorting for the Selection of Lysine-Producing Escherichia coli 2023-10-24, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.3c03080 PMID:37820298	研究论文	本文展示了使用质量激活液滴分选（MADS）技术，通过电喷雾电离质谱（ESI-MS）信号强度选择产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞	首次使用MADS技术进行液滴分选，替代了传统的荧光分析方法，提高了细胞工程的效率	依赖于电喷雾电离质谱（ESI-MS）信号强度进行分选，可能存在信号检测的局限性	开发一种新的方法来筛选和分选合成生物学中的变异细胞库，以提高细胞工程的效率	产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞	合成生物学	NA	电喷雾电离质谱（ESI-MS）	NA	质谱信号	20 nL液滴，0.5样本/秒，96-98%纯度的高产变异细胞
37	2024-10-21	Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators 2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.18.572113 PMID:38187604	研究论文	本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置，能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作	开发了一种可编程的分子系统，能够整合多个细胞表面特征，将目标输入转换为用户定义的输出	NA	探索细胞表面特征的差异，开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞	细胞表面特征和蛋白质装置	合成生物学	NA	邻近门控蛋白剪接	NA	蛋白质	NA
38	2024-10-21	Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells 2023, Synthetic biology (Oxford, England) DOI:10.1093/synbio/ysad016 PMID:38149045	研究论文	研究在合成细胞中通过RuBisCO的细胞外表达实现ATP生产	首次测试了RuBisCO在细胞外表达系统中的表达及其活性介导的ATP合成	尚未实现完全独立的能量生产	探索在合成细胞中实现持续生物能量生产的可能性	RuBisCO酶及其在细胞外表达系统中的ATP合成能力	合成生物学	NA	细胞外表达系统	NA	NA	NA
39	2024-10-20	Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution 2023-Dec-21, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1 PMID:38196584	研究论文	本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法，用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表	提出了一种新的酶辅助测序方法（ESEGA），相比之前的测序方法，具有更高的转录效率和保真度	NA	开发一种新的测序工具，用于测序通过人工扩展遗传信息系统（AEGIS）创建的分子	通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子	生物技术	NA	酶辅助测序	NA	DNA序列	涉及三种任务的实验，包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估
40	2024-10-20	The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation 2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.10.13.562147 PMID:37873347	研究论文	研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响	提出了一个新的模型，解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性	NA	探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化	H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响	表观遗传学	NA	NA	NA	NA	NA