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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-10-15 |
Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437
PMID:38020969
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研究论文 | 本文描述了在合成酵母染色体VIII中,通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置,研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性 | 发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性,而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性 | NA | 研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性 | 酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能 | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组序列 | NA |
42 | 2024-08-07 |
Special issue: reproducibility in synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad015
PMID:38022745
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
43 | 2024-10-15 |
Artificial intelligence-driven systems engineering for next-generation plant-derived biopharmaceuticals
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1252166
PMID:38034587
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综述 | 本文综述了利用人工智能驱动的系统工程方法,结合机器学习和深度学习算法,优化植物系统中重组生物制药的生产 | 本文提出通过人工智能的多方法干预,克服植物系统中重组蛋白表达的障碍,显著提高产量和稳定性 | 本文未详细讨论具体的实验验证和实际应用案例 | 探讨如何利用人工智能优化植物系统中重组生物制药的生产 | 重组生物制药,包括抗原、抗体、激素、细胞因子、单链可变片段和肽 | 生物技术 | NA | 人工智能算法 | 神经网络、支持向量机、线性回归、高斯过程和回归器集成 | 蛋白质结构数据 | NA |
44 | 2024-10-14 |
Module-Based Polyketide Synthase Engineering for de Novo Polyketide Biosynthesis
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00282
PMID:37871264
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研究论文 | 本文探讨了基于模块的聚酮合酶工程在从头合成聚酮化合物中的应用 | 提出了新的模块边界设计原则,并利用最新的结构建模和合成生物学工具加速聚酮合酶工程 | 目前仍处于研究初期,基于现有工程努力的设计原则的普遍性尚不明确 | 探索聚酮合酶工程的新方法,以提高从头合成聚酮化合物的效率 | 聚酮合酶的模块边界和功能 | 合成生物学 | NA | 结构建模和合成生物学 | NA | NA | NA |
45 | 2024-10-14 |
Adapting enzymes to improve their functionality in plants: why and how
2023-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230532
PMID:37787016
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法改进植物中酶功能的策略,特别是连续定向进化系统在提高酶与植物细胞环境兼容性方面的应用 | 本文介绍了连续定向进化系统在改进植物中非天然酶功能方面的应用,特别是酵母OrthoRep系统的适用性 | 本文主要集中在理论和方法的综述,缺乏具体的实验数据和案例分析 | 探讨如何通过合成生物学方法改进植物中酶的功能,以提高作物产量和品质 | 植物中的酶功能及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 连续定向进化 | NA | NA | NA |
46 | 2024-10-14 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
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综述 | 本文讨论了利用人工智能在检测、治疗和理解传染病方面的进展 | 强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解以及诊断开发方面的快速进展 | NA | 探讨人工智能在应对传染病爆发和流行病中的未来应用 | 传染病检测、治疗和理解 | 机器学习 | NA | 人工智能 | NA | NA | NA |
47 | 2024-10-13 |
Turn-On Protein Switches for Controlling Actin Binding in Cells
2023-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.561921
PMID:37961502
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研究论文 | 本文介绍了一种可控的肌动蛋白结合开关工具(CASTs),其肌动蛋白结合行为可通过外部刺激控制 | 开发了可响应不同外部输入的CASTs,提供了开启动力学选项并实现了正交性 | NA | 研究如何通过外部刺激控制肌动蛋白结合蛋白的行为,以应用于合成生物学 | 肌动蛋白结合蛋白及其在细胞中的作用 | NA | NA | 基因工程 | NA | 蛋白质 | NA |
48 | 2024-10-13 |
In vitro selection of aptamers and their applications
2023, Nature reviews. Methods primers
DOI:10.1038/s43586-023-00247-6
PMID:37969927
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综述 | 本文综述了体外选择适配体及其应用的发展历程和实验设计指导 | 介绍了SELEX方法在产生功能性核酸配体方面的无限可能性 | NA | 提供实验设计指导并突出该技术的新兴领域 | 适配体及其在分子诊断、合成生物学和治疗学中的应用 | NA | NA | SELEX | NA | NA | NA |
49 | 2024-10-13 |
CRISPR-based bioengineering in microalgae for production of industrially important biomolecules
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1267826
PMID:37965048
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的生物工程技术在微藻中生产工业重要生物分子的进展 | 介绍了CRISPR/Cas系统在微藻基因组编辑中的应用,以提高特定生物分子的生产 | CRISPR/Cas工具在微藻中的应用仍需进一步研究,包括提高基因编辑工具的效率和优化生长条件 | 探讨如何通过CRISPR-based生物工程技术提高微藻生产工业重要生物分子的效率 | 微藻及其生产工业重要生物分子的能力 | NA | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA |
50 | 2024-10-08 |
RNA origami: design, simulation and application
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2237719
PMID:37498217
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综述 | 本文综述了RNA折纸结构的设计、模拟及其应用的发展历程,并与DNA折纸结构进行了比较 | 介绍了RNA折纸结构的设计方法和计算工具,并展望了其在生物物理学、合成生物学和生物医学中的应用前景 | NA | 回顾RNA折纸结构的关键成就,并探讨其设计、模拟和应用 | RNA折纸结构及其在细胞生物学中的应用 | 生物技术 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA |
51 | 2024-10-04 |
Expression of blue pigment synthetase a from Streptomyces lavenduale reveals insights on the effects of refactoring biosynthetic megasynthases for heterologous expression in Escherichia coli
2023-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2023.106317
PMID:37286066
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研究论文 | 研究评估了来自Streptomyces lavendulae的非核糖体肽合成酶(NRPS)在E. coli中的异源表达,并比较了密码子优化序列与天然序列的效果 | 首次直接比较了来自链霉菌的蛋白质在E. coli中异源表达时,密码子优化序列与天然序列的差异 | 研究仅限于评估一种NRPS在E. coli中的表达,未涉及其他类型的生物合成蛋白 | 研究链霉菌中生物合成蛋白在E. coli中的异源表达及其折叠问题 | 来自Streptomyces lavendulae的非核糖体肽合成酶(NRPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
52 | 2024-10-02 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法在实体瘤中的应用 | 介绍了合成生物学和细胞工程的新方法在实体瘤CAR-T细胞疗法中的应用 | 讨论了CAR-T细胞在实体瘤治疗中面临的物理和分子屏障、免疫抑制性肿瘤微环境以及寻找细胞表面靶抗原的困难 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤中的应用及其面临的挑战 | 实体瘤患者及其治疗 | NA | NA | 嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法 | NA | NA | NA |
53 | 2024-10-02 |
Making the connections: physical and electric interactions in biohybrid photosynthetic systems
2023-Oct-11, Energy & environmental science
IF:32.4Q1
DOI:10.1039/d3ee01265d
PMID:38013927
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研究论文 | 本文讨论了共轭有机材料作为生物混合光合系统中的光敏剂的潜力,并比较了其与传统无机半导体的优劣 | 提出共轭有机材料作为生物混合光合系统中的光敏剂,能够调节光物理性质和光敏剂与生物细胞之间的物理化学相互作用,从而提高稳定性和电荷转移 | 当前生物混合光合系统的太阳能效率仍然较低 | 探讨生物混合光合系统中物理和电相互作用,以提高太阳能到化学能的转换效率 | 生物混合光合系统中的光敏剂和电子传输过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
54 | 2024-10-01 |
Chemical Systems for Wetware Artificial Life: Selected Perspectives in Synthetic Cell Research
2023-Sep-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241814138
PMID:37762444
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中湿件技术在人工生命科学中的作用,特别是合成细胞领域的进展 | 提出了湿件技术在生命和认知建模中的独特视角,补充了机器人和人工智能的现有研究 | NA | 探讨湿件技术在人工生命科学中的应用,特别是化学人工智能和语义信息的概念 | 合成细胞和湿件技术在生命和认知建模中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 化学人工智能 | NA | NA |
55 | 2024-10-01 |
Antimicrobial Peptides: The Production of Novel Peptide-Based Therapeutics in Plant Systems
2023-Sep-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13091875
PMID:37763279
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综述 | 本文综述了抗菌肽(AMPs)作为对抗耐药细菌的新型治疗手段的潜力,并探讨了其在植物系统中的生产方法 | 本文介绍了合成生物学和基于植物的表达系统在高效生产抗菌肽方面的最新进展 | 尽管本文提供了对抗菌肽的全面见解,但仍需解决一些知识空白,才能完全利用这些治疗选项 | 探讨抗菌肽作为对抗耐药病原体的有效武器的潜力,并介绍其在植物系统中的生产方法 | 抗菌肽及其在植物系统中的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
56 | 2024-10-01 |
Deploying synthetic coevolution and machine learning to engineer protein-protein interactions
2023-07-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1720
PMID:37499032
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研究论文 | 本文介绍了一种利用合成共进化和机器学习平台来精细调控蛋白质-蛋白质相互作用的方法 | 通过合成共进化平台和预训练的蛋白质语言模型,实现了对蛋白质相互作用的系统级分析和预测,扩展了氨基酸多样性 | NA | 开发一种模拟蛋白质共进化并生成具有多样分子识别特性的蛋白质复合物的方法 | 蛋白质-蛋白质相互作用 | 机器学习 | NA | 合成共进化 | 蛋白质语言模型 | 蛋白质数据 | 大量共进化复合物 |
57 | 2024-09-30 |
A Review of Gut Microbiota-Derived Metabolites in Tumor Progression and Cancer Therapy
2023-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207366
PMID:36951547
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物在肿瘤进展和癌症治疗中的作用 | 探讨了微生物代谢物在放疗和化疗中的应用,以及与免疫治疗的结合,提出了多种调节微生物代谢物的新策略 | 某些微生物代谢物在不同癌症类型中具有矛盾的功能,且对某些抗癌药物的代谢效应可能导致药物失效或加剧副作用 | 总结肠道微生物代谢物与癌症之间的关联,并为未来的科学研究提供新思路 | 肠道微生物代谢物及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
58 | 2024-09-30 |
An optogenetic toolkit for light-inducible antibiotic resistance
2023-02-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36670-2
PMID:36823420
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光遗传学工具包实现光诱导抗生素抗性的方法 | 首次使用光诱导的Cre重组酶在Escherichia coli中激活药物抗性基因的表达,实现了对四种抗生素的抗性 | NA | 开发一种能够精确控制抗生素抗性的光遗传学工具 | Escherichia coli中的药物抗性基因 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
59 | 2024-09-30 |
Bridging the gap with bacterial art
2023-01-17, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnad025
PMID:37028930
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研究论文 | 本文探讨了利用细菌创作的活体艺术的历史、影响及其在当代的发展 | 通过细菌艺术,挑战了科学与艺术之间的界限,并促进了公众对微生物的认知 | NA | 记录微生物艺术的历史、影响及其现状,为教育者、学生和公众提供参考 | 细菌艺术及其在科学与艺术融合中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
60 | 2024-09-30 |
Deciphering chemical logic of fungal natural product biosynthesis through heterologous expression and genome mining
2023-01-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d2np00050d
PMID:36125308
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综述 | 本文综述了通过异源表达和基因组挖掘解析真菌天然产物生物合成化学逻辑的最新进展 | 介绍了通过异源表达和基因组挖掘技术在真菌天然产物发现中的应用,并强调了其在揭示生物合成化学逻辑中的重要性 | 本文并非详尽无遗,而是通过研究领域的实例展示了异源生物合成在真菌天然产物发现中的有用性和局限性 | 探讨异源表达在基因组挖掘和生物合成研究中的应用 | 真菌天然产物生物合成基因簇 | NA | NA | 异源表达、基因组挖掘 | NA | NA | NA |