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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2024-09-14 |
Marinobacter: A case study in bioelectrochemical chassis evaluation
2023-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14170
PMID:36464922
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综述 | 本文综述了Marinobacter属在生物电化学系统中的代谢和电化学潜力,并探讨了其在合成电微生物学应用中的优势和劣势 | 本文首次系统地评估了Marinobacter属作为生物电化学系统底盘生物的潜力 | 许多Marinobacter菌株的特性尚未充分表征,且基因操作工具箱相对不成熟 | 探讨Marinobacter属在生物电化学系统中的应用潜力,并为选择合适的底盘生物提供指导 | Marinobacter属的代谢和电化学特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
122 | 2024-09-14 |
A Synthetic Biology Approach for Vaccine Candidate Design against Delta Strain of SARS-CoV-2 Revealed Disruption of Favored Codon Pair as a Better Strategy over Using Rare Codons
2023-Feb-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11020487
PMID:36851364
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计针对SARS-CoV-2 delta变种的疫苗候选物,发现破坏优选密码子对比使用稀有密码子更有效 | 提出了一种通过破坏优选密码子对来减弱SARS-CoV-2 delta变种病毒适应性的新策略 | NA | 开发针对SARS-CoV-2 delta变种的安全有效疫苗 | SARS-CoV-2 delta变种的结构基因及其密码子使用模式 | NA | COVID | 合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
123 | 2024-09-14 |
Current Metabolic Engineering Strategies for Photosynthetic Bioproduction in Cyanobacteria
2023-Feb-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020455
PMID:36838420
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综述 | 本文综述了蓝细菌在光合生物生产中的代谢工程策略 | 总结了最新的合成生物学工具和代谢途径工程策略,以提高有价值化合物的生产 | NA | 探讨蓝细菌在工业应用中的代谢工程优化策略 | 蓝细菌及其在生物产品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | NA | NA |
124 | 2024-09-14 |
Regulation of pSYSA defense plasmid copy number in Synechocystis through RNase E and a highly transcribed asRNA
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1112307
PMID:36876071
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研究论文 | 研究了蓝细菌Synechocystis中pSYSA防御质粒拷贝数的调控机制,揭示了RNase E和高度转录的反义RNA在其中的作用 | 发现了RNase E介导的pSYSA编码转录本的切割机制,以及与ColE1型质粒复制机制的相似性 | NA | 理解蓝细菌中天然质粒复制系统和CRISPR-Cas防御机制,以开发适用于合成生物学的质粒载体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803中的pSYSA质粒及其复制机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | NA |
125 | 2024-09-14 |
Synthetic peptides for the precise transportation of proteins of interests to selectable subcellular areas
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1062769
PMID:36890909
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研究论文 | 本文首次报道了一组名为reflectins及其衍生肽在细胞内具有特定的分布偏好,并通过设计一系列reflectin衍生肽,展示了其在细胞内选择性定位的能力 | 本文创新性地利用reflectins的保守基序和灵活连接子作为构建模块,设计并表达了具有选择性细胞内定位的合成肽,并展示了其在核质定位调控中的精确时空应用 | NA | 研究旨在开发一种模块化、正交且经过充分表征的合成肽库,用于精确调控蛋白质的核质定位 | reflectins及其衍生肽在细胞内的选择性定位 | 生物材料设计 | NA | NA | NA | NA | NA |
126 | 2024-09-13 |
Enabling technology and core theory of synthetic biology
2023-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2214-2
PMID:36753021
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综述 | 本文讨论了合成生物学领域的各种原理和技术进展 | 介绍了合成生物学的使能技术和核心理论的发展,包括基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑等 | NA | 探讨合成生物学的使能技术和核心理论的进展 | 合成生物学的使能技术和核心理论 | 合成生物学 | NA | 基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑、分子进化、功能蛋白从头设计、细胞和基因电路工程、无细胞合成生物学、人工智能辅助合成生物学 | NA | NA | NA |
127 | 2024-09-13 |
Call for biotechnological approach to degrade plastic in the era of COVID-19 pandemic
2023-Mar, Saudi journal of biological sciences
DOI:10.1016/j.sjbs.2023.103583
PMID:36748033
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review | 本文综述了在COVID-19大流行背景下,利用生物技术方法降解塑料的潜力和挑战 | 本文提出了利用合成生物学、代谢工程和生物信息学方法来增强微生物降解塑料的能力 | 目前对基因、酶和细菌与塑料相互作用的研究不足 | 探讨如何利用现代生物技术增强微生物降解塑料的能力 | 研究对象包括塑料污染、微生物降解塑料的机制以及相关的生物技术方法 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学 | NA | NA | NA |
128 | 2024-09-13 |
Elucidation of the (R)-enantiospecific benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathways in sacred lotus (Nelumbo nucifera)
2023-02-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-29415-0
PMID:36805479
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研究论文 | 研究揭示了神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 首次探索了神圣莲花中独特的苯基异喹啉生物碱生物合成途径,并鉴定了负责R-手性形成的酶 | 研究主要集中在酶的鉴定和初步功能验证,未深入探讨整个生物合成网络的调控机制 | 阐明神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 神圣莲花中的苯基异喹啉生物碱及其生物合成酶 | NA | NA | 酶标记实验、体外重组酶和植物蛋白提取物分析 | NA | NA | NA |
129 | 2024-09-13 |
Bacterial Form II Rubisco can support wild-type growth and productivity in Solanum tuberosum cv. Desiree (potato) under elevated CO2
2023-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac305
PMID:36743474
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研究论文 | 本文描述了通过叶绿体转化技术将马铃薯中的天然Rubisco替换为细菌来源的Rubisco,以提高其光合作用效率 | 首次在作物中通过叶绿体转化技术替换Rubisco,并展示了在不同CO2浓度下马铃薯的产量和叶生物化学特性 | 研究仅限于特定品种的马铃薯和特定的CO2浓度,未探讨其他环境因素的影响 | 通过叶绿体转化技术改善作物光合作用,提高产量 | 马铃薯品种Desiree | NA | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 涉及不同CO2浓度的马铃薯植株 |
130 | 2024-09-13 |
Current Landscape of Methods to Evaluate Antimicrobial Activity of Natural Extracts
2023-Jan-20, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28031068
PMID:36770734
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综述 | 本文综述了评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 本文介绍了新技术在提高分析能力、时间效率、灵敏度和可重复性方面的应用 | NA | 分析和比较评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 天然提取物的抗菌活性 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
131 | 2024-09-13 |
Recent Advances in CRISPR-Cas Technologies for Synthetic Biology
2023-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-022-00005-5
PMID:36723794
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas技术在合成生物学中的最新进展 | 介绍了CRISPR-Cas技术在基因组编辑、分子诊断和代谢生物技术中的应用 | NA | 总结CRISPR技术在合成生物学中的应用现状,并讨论其在微生物学中的发展 | CRISPR-Cas技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas技术 | NA | NA | NA |
132 | 2024-09-13 |
PLATERO: A calibration protocol for plate reader green fluorescence measurements
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1104445
PMID:36741754
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PLATERO的校准协议,用于将板式读取器绿色荧光测量结果转换为参考荧光素的浓度单位 | PLATERO协议消除了测量设备的增益对数据的影响,并将荧光强度值转换为浓度单位,提供了一个单一的数学表达式,返回标准化、增益无关且可比较的数据 | NA | 开发一种校准协议,以标准化板式读取器荧光测量结果,并消除设备增益的影响 | 板式读取器绿色荧光测量数据 | 合成生物学 | NA | 荧光测量 | 校准模型 | 荧光数据 | NA |
133 | 2024-09-13 |
Transcription factor-based biosensors for screening and dynamic regulation
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1118702
PMID:36814719
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综述 | 本文综述了基于转录因子的生物传感器在筛选和动态调控中的应用 | 讨论了实验和计算方法在改进和优化基于转录因子的生物传感器中的应用 | 目前基于转录因子的生物传感器在广泛应用中仍面临挑战 | 总结当前基于转录因子的生物传感器的知识,并提出未来研究方向 | 基于转录因子的生物传感器及其在生物生产筛选和遗传电路动态调控中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
134 | 2024-09-11 |
Synthetic biology-inspired cell engineering in diagnosis, treatment, and drug development
2023-03-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01375-x
PMID:36906608
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综述 | 本文综述了合成生物学在细胞工程领域的最新进展及其在诊断、治疗和药物开发中的应用 | 介绍了合成生物学提供的遗传工具,用于重新编程和工程化细胞以提高性能、赋予新功能和多样化的应用 | 讨论了在临床实践中应用基因工程细胞的局限性和挑战 | 更新合成生物学在生物医学应用中的最新进展,并探讨未来的优化方向 | 合成生物学驱动的细胞工程在诊断、治疗和药物开发中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
135 | 2024-09-11 |
Exploring a chemical scaffold for rapid and selective photoaffinity labelling of non-ribosomal peptide synthetases in living bacterial cells
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0026
PMID:36633280
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研究论文 | 本文介绍了一种用于快速和选择性光亲和标记非核糖体肽合成酶(NRPSs)的化学支架,适用于纯化系统、粗生物样本和活细菌细胞 | 开发了一种基于三氟甲基苯基重氮的新型光亲和标记探针,能够在较短的紫外线照射时间内实现高选择性和敏感性的标记 | NA | 研究非核糖体肽合成酶(NRPSs)在细菌细胞中的生物学功能 | 非核糖体肽合成酶(NRPSs)及其在细菌细胞中的活性 | 化学合成生物学 | NA | 光亲和标记 | NA | 蛋白质 | NA |
136 | 2024-09-11 |
Discovery, implications and initial use of semi-synthetic organisms with an expanded genetic alphabet/code
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0030
PMID:36633274
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综述 | 本文综述了通过扩展遗传字母表创建半合成生物体以生产下一代蛋白质疗法的发现、意义和初步应用 | 介绍了通过合成核苷酸形成非天然碱基对,并将其整合到DNA中以稳定维持、转录和翻译蛋白质的创新方法 | NA | 探讨扩展遗传字母表以生产具有不同功能的蛋白质的潜力 | 半合成生物体及其在生产下一代蛋白质疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成核苷酸 | NA | NA | NA |
137 | 2024-09-11 |
Orthoester formation in fungal meroterpenoid austalide F biosynthesis
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0037
PMID:36633279
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研究论文 | 研究揭示了真菌倍半萜austalide F的生物合成途径,特别是orthoester的形成机制 | 首次阐明了α-酮戊二酸依赖性加氧酶AstB和甲基转移酶AstL在orthoester形成中的作用 | NA | 揭示真菌倍半萜austalide F的生物合成途径 | 真菌倍半萜austalide F及其生物合成机制 | NA | NA | 异源基因表达 | NA | NA | NA |
138 | 2024-09-11 |
Genome mining of cryptic bisabolenes that were biosynthesized by intramembrane terpene synthases from Antrodia cinnamomea
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0033
PMID:36633275
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘方法,发现了一种来自Antrodia cinnamomea的真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶,能够合成(+)-(,)-α-bisabolene,并揭示了其生物合成途径 | 首次发现真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶能够合成bisabolene,并鉴定了相关的修饰酶 | NA | 揭示真菌中bisabolene的生物合成途径及其酶学机制 | Antrodia cinnamomea中的萜烯合酶及其生物合成途径 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |
139 | 2024-09-11 |
Success probability of high-affinity DNA aptamer generation by genetic alphabet expansion
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0031
PMID:36633272
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研究论文 | 本文研究了通过遗传字母扩展生成高亲和力DNA适配体的成功概率 | 引入了非天然碱基作为第五个字母,显著提高了DNA适配体对目标蛋白的亲和力 | 生成高亲和力UB-DNA适配体的成功概率仍需提高 | 评估生成高亲和力DNA适配体的成功概率,并探讨通过引入非天然碱基提高传统适配体亲和力的可能性 | 高亲和力DNA适配体及其生成方法 | NA | NA | 遗传字母扩展 | NA | NA | 多个UB-DNA适配体作为示例 |
140 | 2024-09-11 |
A conserved SH3-like fold in diverse putative proteins tetramerizes into an oxidoreductase providing an antimicrobial resistance phenotype
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0040
PMID:36633286
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研究论文 | 本文探讨了一种非催化蛋白折叠如何演变为具有生存必需的催化活性的潜在机制 | 首次揭示了SH3-like折叠在现代耐药组中出现的潜在进化路径 | NA | 研究DfrB酶及其同源物的结构和功能,揭示其催化活性和耐药性的机制 | DfrB酶及其同源物的SH3-like折叠 | 生物化学 | NA | 结构和生物物理表征 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 从数据库中识别的DfrB同源物 |