合成生物学相关文章
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当前共找到 25 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-09 |
Stability, robustness, and containment: preparing synthetic biology for real-world deployment
2023-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2022.102880
PMID:36621221
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学领域在实际应用中稳定性和鲁棒性的策略 | 提出了多层传感电路、遗传上下文和资源控制电路等工具，以增强微生物系统在复杂环境中的鲁棒性和功能稳定性 | NA | 探讨合成生物学在实际应用中的稳定性和鲁棒性策略 | 工程化微生物在人类健康和生物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-09-30 |
An optogenetic toolkit for light-inducible antibiotic resistance
2023-02-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36670-2
PMID:36823420
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光遗传学工具包实现光诱导抗生素抗性的方法 | 首次使用光诱导的Cre重组酶在Escherichia coli中激活药物抗性基因的表达，实现了对四种抗生素的抗性 | NA | 开发一种能够精确控制抗生素抗性的光遗传学工具 | Escherichia coli中的药物抗性基因 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-09-23 |
Multi-input drug-controlled switches of mammalian gene expression based on engineered nuclear hormone receptors
2023-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.01.526549
PMID:36778233
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研究论文 | 本文研究了基于工程化核激素受体的多输入药物控制哺乳动物基因表达开关 | 本文通过交换蜕皮激素受体（EcR）配体结合域（LBD）为其他人源NHR衍生的LBD，实现了新型（多）药物调控 | NA | 研究多输入开关在合成生物学中的应用，特别是通过核激素受体超家族实现对临床批准药物的多输入控制 | 工程化的核激素受体及其在多药物控制基因表达中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-09-14 |
A Synthetic Biology Approach for Vaccine Candidate Design against Delta Strain of SARS-CoV-2 Revealed Disruption of Favored Codon Pair as a Better Strategy over Using Rare Codons
2023-Feb-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11020487
PMID:36851364
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计针对SARS-CoV-2 delta变种的疫苗候选物，发现破坏优选密码子对比使用稀有密码子更有效 | 提出了一种通过破坏优选密码子对来减弱SARS-CoV-2 delta变种病毒适应性的新策略 | NA | 开发针对SARS-CoV-2 delta变种的安全有效疫苗 | SARS-CoV-2 delta变种的结构基因及其密码子使用模式 | NA | COVID | 合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
| 5 | 2024-09-14 |
Current Metabolic Engineering Strategies for Photosynthetic Bioproduction in Cyanobacteria
2023-Feb-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020455
PMID:36838420
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综述 | 本文综述了蓝细菌在光合生物生产中的代谢工程策略 | 总结了最新的合成生物学工具和代谢途径工程策略，以提高有价值化合物的生产 | NA | 探讨蓝细菌在工业应用中的代谢工程优化策略 | 蓝细菌及其在生物产品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-09-13 |
Elucidation of the (R)-enantiospecific benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathways in sacred lotus (Nelumbo nucifera)
2023-02-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-29415-0
PMID:36805479
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研究论文 | 研究揭示了神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 首次探索了神圣莲花中独特的苯基异喹啉生物碱生物合成途径，并鉴定了负责R-手性形成的酶 | 研究主要集中在酶的鉴定和初步功能验证，未深入探讨整个生物合成网络的调控机制 | 阐明神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 神圣莲花中的苯基异喹啉生物碱及其生物合成酶 | NA | NA | 酶标记实验、体外重组酶和植物蛋白提取物分析 | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-09-13 |
Bacterial Form II Rubisco can support wild-type growth and productivity in Solanum tuberosum cv. Desiree (potato) under elevated CO2
2023-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac305
PMID:36743474
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研究论文 | 本文描述了通过叶绿体转化技术将马铃薯中的天然Rubisco替换为细菌来源的Rubisco，以提高其光合作用效率 | 首次在作物中通过叶绿体转化技术替换Rubisco，并展示了在不同CO2浓度下马铃薯的产量和叶生物化学特性 | 研究仅限于特定品种的马铃薯和特定的CO2浓度，未探讨其他环境因素的影响 | 通过叶绿体转化技术改善作物光合作用，提高产量 | 马铃薯品种Desiree | NA | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 涉及不同CO2浓度的马铃薯植株 |
| 8 | 2024-09-11 |
Exploring a chemical scaffold for rapid and selective photoaffinity labelling of non-ribosomal peptide synthetases in living bacterial cells
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0026
PMID:36633280
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研究论文 | 本文介绍了一种用于快速和选择性光亲和标记非核糖体肽合成酶（NRPSs）的化学支架，适用于纯化系统、粗生物样本和活细菌细胞 | 开发了一种基于三氟甲基苯基重氮的新型光亲和标记探针，能够在较短的紫外线照射时间内实现高选择性和敏感性的标记 | NA | 研究非核糖体肽合成酶（NRPSs）在细菌细胞中的生物学功能 | 非核糖体肽合成酶（NRPSs）及其在细菌细胞中的活性 | 化学合成生物学 | NA | 光亲和标记 | NA | 蛋白质 | NA |
| 9 | 2024-09-11 |
Discovery, implications and initial use of semi-synthetic organisms with an expanded genetic alphabet/code
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0030
PMID:36633274
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综述 | 本文综述了通过扩展遗传字母表创建半合成生物体以生产下一代蛋白质疗法的发现、意义和初步应用 | 介绍了通过合成核苷酸形成非天然碱基对，并将其整合到DNA中以稳定维持、转录和翻译蛋白质的创新方法 | NA | 探讨扩展遗传字母表以生产具有不同功能的蛋白质的潜力 | 半合成生物体及其在生产下一代蛋白质疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成核苷酸 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-09-11 |
Orthoester formation in fungal meroterpenoid austalide F biosynthesis
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0037
PMID:36633279
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研究论文 | 研究揭示了真菌倍半萜austalide F的生物合成途径，特别是orthoester的形成机制 | 首次阐明了α-酮戊二酸依赖性加氧酶AstB和甲基转移酶AstL在orthoester形成中的作用 | NA | 揭示真菌倍半萜austalide F的生物合成途径 | 真菌倍半萜austalide F及其生物合成机制 | NA | NA | 异源基因表达 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-09-11 |
Genome mining of cryptic bisabolenes that were biosynthesized by intramembrane terpene synthases from Antrodia cinnamomea
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0033
PMID:36633275
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘方法，发现了一种来自Antrodia cinnamomea的真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶，能够合成(+)-(,)-α-bisabolene，并揭示了其生物合成途径 | 首次发现真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶能够合成bisabolene，并鉴定了相关的修饰酶 | NA | 揭示真菌中bisabolene的生物合成途径及其酶学机制 | Antrodia cinnamomea中的萜烯合酶及其生物合成途径 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12 | 2024-09-11 |
Success probability of high-affinity DNA aptamer generation by genetic alphabet expansion
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0031
PMID:36633272
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研究论文 | 本文研究了通过遗传字母扩展生成高亲和力DNA适配体的成功概率 | 引入了非天然碱基作为第五个字母，显著提高了DNA适配体对目标蛋白的亲和力 | 生成高亲和力UB-DNA适配体的成功概率仍需提高 | 评估生成高亲和力DNA适配体的成功概率，并探讨通过引入非天然碱基提高传统适配体亲和力的可能性 | 高亲和力DNA适配体及其生成方法 | NA | NA | 遗传字母扩展 | NA | NA | 多个UB-DNA适配体作为示例 |
| 13 | 2024-09-11 |
A conserved SH3-like fold in diverse putative proteins tetramerizes into an oxidoreductase providing an antimicrobial resistance phenotype
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0040
PMID:36633286
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研究论文 | 本文探讨了一种非催化蛋白折叠如何演变为具有生存必需的催化活性的潜在机制 | 首次揭示了SH3-like折叠在现代耐药组中出现的潜在进化路径 | NA | 研究DfrB酶及其同源物的结构和功能，揭示其催化活性和耐药性的机制 | DfrB酶及其同源物的SH3-like折叠 | 生物化学 | NA | 结构和生物物理表征 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 从数据库中识别的DfrB同源物 |
| 14 | 2024-09-11 |
Allosteric inhibition of Staphylococcus aureus MenD by 1,4-dihydroxy naphthoic acid: a feedback inhibition mechanism of the menaquinone biosynthesis pathway
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0035
PMID:36633276
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研究论文 | 研究了1,4-二羟基萘甲酸对金黄色葡萄球菌MenD的变构抑制作用及其在甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制 | 发现1,4-二羟基萘甲酸对MenD的变构抑制作用在不同属中是保守的机制 | NA | 探讨甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制及其在不同属中的保守性 | 金黄色葡萄球菌MenD酶及其下游代谢物1,4-二羟基萘甲酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-09-11 |
Crystal structures of 'ALternative Isoinformational ENgineered' DNA in B-form
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0028
PMID:36633282
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研究论文 | 研究了在B型结构中的人工DNA的晶体结构，特别是ALIEN DNA的结构特征 | 首次确定了含有非天然核苷酸对的ALIEN DNA在B型结构中的高分辨率晶体结构，并发现其具有比天然DNA更多的B型结构变体 | NA | 研究人工DNA在B型结构中的结构特征 | ALIEN DNA及其在B型结构中的晶体结构 | NA | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | 三个包含5'-CTTAAG的复合物，每个复合物含有16 bp的自互补双链寡核苷酸 |
| 16 | 2024-09-11 |
On-demand biomanufacturing through synthetic biology approach
2023-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100518
PMID:36636637
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法实现按需生物制造的进展，并提出了未来方向 | 利用合成生物学技术重新设计无细胞系统和活细胞，以实现便携式、现场和按需制造生物分子 | NA | 探讨通过合成生物学方法实现按需生物制造的潜力和未来方向 | 生物制药产品，包括蛋白质疗法、工程化蛋白质疫苗和单克隆抗体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac733
PMID:36100255
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研究论文 | 本文通过新的结构和生化数据，提出了一种新的Tn3解离酶复合体（synaptosome）的详细模型，并讨论了其如何利用DNA拓扑结构来调节重组酶的酶活性 | 本文提出了一个新的、详细的Tn3解离酶复合体模型，该模型基于新的结构和生化数据，解决了之前模型与实验数据不一致的问题 | NA | 研究Tn3解离酶如何通过DNA拓扑结构来调节其酶活性 | Tn3解离酶及其复合体（synaptosome） | NA | NA | NA | NA | 结构和生化数据 | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体（TERMs）的神经网络模型，提出了一种新的蛋白质设计方法，通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合，提出两种神经网络架构（TERMinator和COORDinator），用于生成序列空间的Potts模型，并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能，如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Ribosomal incorporation of negatively charged d-α- and N-methyl-l-α-amino acids enhanced by EF-Sep
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0038
PMID:36633283
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研究论文 | 研究通过使用EF-Tu变体EF-Sep和人工开发的嵌合tRNA，成功增强了负电荷d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸在新生肽中的整合效率 | 首次展示了包含多个d-Asp或Asp的巨环肽的核糖体合成 | NA | 研究如何提高负电荷氨基酸在新生肽中的整合效率 | d-α-氨基酸和N-甲基-l-α-氨基酸的整合效率 | 生物化学 | NA | 核糖体合成 | EF-Tu变体EF-Sep | 氨基酸 | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Rethinking nucleic acids from their origins to their applications
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0027
PMID:36633284
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综述 | 本文综述了实验室在过去三十年中关于合成生物学的研究，探讨了替代标准DNA和RNA的信息系统的生成及其在支持达尔文进化和理解其自然历史中的应用 | 合成生物学已生成多种能够支持分子信息进化的分子系统，这些替代标准DNA和RNA的系统支持生物技术应用，如DNA合成、人类诊断、生物医学研究和医学 | 需要多电解质结构和尺寸规则的构建块来支持信息聚合物以支持达尔文进化 | 探讨核苷酸的起源及其在地球和宇宙中的应用，以及它们如何支持生命和达尔文进化 | 核苷酸及其替代分子系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |