合成生物学相关文章
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当前共找到 18 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-06 |
Genetic manipulation and tools in myxobacteria for the exploitation of secondary metabolism
2023-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2023.100075
PMID:39629250
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综述 | 本文综述了黏细菌基因操作工具及其在次级代谢产物开发中的应用 | 强调了构建黏细菌底盘用于合成生物学研究和未开发次级代谢产物利用的必要性和紧迫性 | 黏细菌的独特社会性是其操作的主要限制因素 | 综述黏细菌基因操作的进展，特别是次级代谢产物的开发 | 黏细菌及其次级代谢产物 | NA | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-12-06 |
Applications of toxin-antitoxin systems in synthetic biology
2023-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2023.100069
PMID:39629251
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综述 | 本文综述了毒素-抗毒素系统的最新分类及其在合成生物学中的应用 | 本文介绍了毒素-抗毒素系统在合成生物学中的新应用 | NA | 探讨毒素-抗毒素系统在合成生物学中的潜在应用 | 毒素-抗毒素系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Synthetic biology to revive microbial natural product discovery
2023-Jun, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12071
PMID:38817621
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-09-23 |
Molecular imaging with aquaporin-based reporter genes: quantitative considerations from Monte Carlo diffusion simulations
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544324
PMID:37333205
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研究论文 | 本文开发并实验验证了一种蒙特卡罗模型，用于分析细胞半径和细胞内体积分数如何定量影响基于水通道蛋白的分子成像信号 | 提出了基于时间依赖性扩散变化的差异成像方法，以提高水通道蛋白信号的特异性，并建立了水通道蛋白表达细胞体积分数的简单映射 | NA | 开发一种新的方法来定量分析水通道蛋白在分子成像中的作用 | 水通道蛋白信号与组织背景的区分 | 生物医学成像 | NA | 蒙特卡罗模拟 | 蒙特卡罗模型 | 图像 | NA |
| 5 | 2024-09-21 |
In Vivo Sampling of Intracellular Heterogeneity of Pseudomonas putida Enables Multiobjective Optimization of Genetic Devices
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00009
PMID:37196337
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研究论文 | 本文研究了土壤细菌铜绿假单胞菌细胞内物理化学异质性对基因表达的影响，并通过随机插入DNA片段实现基因装置的多目标优化 | 利用细胞内异质性进行多目标优化，而不是抑制这种异质性 | NA | 研究细胞内异质性对基因装置表达的影响，并实现多目标优化 | 铜绿假单胞菌细胞内异质性及其对基因装置表达的影响 | 合成生物学 | NA | DNA随机插入技术 | NA | 基因数据 | 野生型和生物膜缺陷型铜绿假单胞菌的多个克隆 |
| 6 | 2024-09-21 |
Synthetic Biology─High Time to Deliver?
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00238
PMID:37322887
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评论 | 本文讨论了合成生物学领域面临的挑战和需要解决的问题 | NA | 本文指出合成生物学领域存在过度承诺和夸大宣传的问题，并强调需要更多基础信息来实现生命过程的设计和重设计 | 探讨合成生物学领域的发展方向和面临的挑战 | 合成生物学领域及其在生命科学、工程学和社会科学中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
BioAutoMATED: An end-to-end automated machine learning tool for explanation and design of biological sequences
2023-06-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.05.007
PMID:37348466
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research paper | 本文介绍了一个名为BioAutoMATED的端到端自动化机器学习工具，用于生物序列的解释和设计 | BioAutoMATED整合了多种自动化机器学习方法，形成了一个统一的框架，专门用于生物序列分析，并能自动提供相关技术进行序列分析、解释和设计 | NA | 旨在降低生物学家在研究中应用机器学习的门槛 | 生物序列，包括核酸、氨基酸或糖链序列 | machine learning | NA | AutoML | AutoML | sequence | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Introduction to Engineering Biology: A Conceptual Framework for Teaching Synthetic Biology
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00194
PMID:37322886
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research paper | 本文介绍了一个可适应的课程模块，用于教授工程生物学的基础原理和应用 | 创建了一个由工程生物学专家设计的概念性幻灯片组，涵盖了关键主题领域，并可在现有课程材料中独立使用或整合 | NA | 旨在提高当前工程生物学主题的教学便利性并增加公众对该领域的参与度 | 工程生物学的基础原理和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Instructional materials that control cellular activity through synthetic Notch receptors
2023-06, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MATRIX的平台，通过结合工程化材料和表达相应合成生物学控制模块的细胞，实现对生物材料细胞反应的定制化定义 | 该平台通过激活合成Notch受体，能够调控多种细胞活动，如转录组工程、炎症抑制和多能干细胞分化，并且这些反应仅限于编程的生物材料表面 | NA | 开发一种新的方法来可靠地调控治疗细胞的行为，以支持细胞疗法和组织替代 | 工程化生物材料和表达合成Notch受体的细胞 | 再生工程 | NA | 合成生物学 | 合成Notch受体 | 生物材料 | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Protein and peptide engineering for chemical exchange saturation transfer imaging in the age of synthetic biology
2023-06, NMR in biomedicine
IF:2.7Q1
DOI:10.1002/nbm.4712
PMID:35150021
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综述 | 本文综述了化学交换饱和转移（CEST）成像中基于蛋白质的对比剂的发展历程，并讨论了合成生物学对其未来发展的影响 | 介绍了基于多肽的CEST对比剂的设计和工程化，以及酶-底物对作为CEST对比增强剂的合理化 | NA | 探讨如何提高多肽的选择性、特异性及CEST对比度，并讨论合成生物学对下一代基于蛋白质的CEST对比剂开发的影响 | 基于蛋白质的CEST对比剂及其在成像中的应用 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移成像（CEST） | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Pathway to Nucleoside Triphosphates for Expanded Genetic Alphabets
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00060
PMID:37227319
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中通过重排氢键供体和受体基团来形成12种独立复制核苷酸的方法，并介绍了利用“多磷酸激酶”制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 首次报道了利用“多磷酸激酶”与天然二磷酸激酶和工程化核苷酸激酶合作，制造AEGIS三磷酸的途径，包括第三代三磷酸，其在活细菌细胞中的生存能力得到改善。 | NA | 探索合成生物学中扩展遗传字母表的途径，特别是制造AEGIS三磷酸的代谢途径。 | 12种独立复制的核苷酸及其三磷酸的合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多磷酸激酶 | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-Jun, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 本文探讨了合成生物学与机器学习在癌症治疗中的应用，特别是通过非自然信号传导途径和复杂的合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤特性 | 文章介绍了通过机器学习辅助筛选过程，成功预测CAR T细胞表型依赖于信号传导模体选择的新方法，以及合成锌指蛋白作为可控转录调节因子的应用 | NA | 探索合成生物学和机器学习如何通过新的技术手段增强工程化T细胞的抗肿瘤能力 | CAR T细胞的信号传导途径和合成基因电路的设计 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | 机器学习 | 基因电路 | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
RNAs as Sensors of Oxidative Stress in Bacteria
2023-06-08, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了氧化应激的本质，强调了已知的蛋白质传感器（转录因子）作为氧化应激中分子传感器标准的作用，并描述了探索RNA直接感受氧化应激潜力的分子研究 | RNA传感器有望成为理解和调控细菌氧化应激反应中动态生物途径的关键层，代表了合成生物学的重要前沿 | 关于RNA传感器的知识存在空白，特别是关于RNA核苷酸化学修饰的部分 | 探讨RNA作为细菌中氧化应激传感器的潜力 | RNA传感器在氧化应激反应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543449
PMID:37398067
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研究论文 | 本文利用计算设计方法，研究了蛋白质基材料的宏观粘弹性与其微观结构之间的关系 | 通过计算设计，实现了对蛋白质水凝胶的宏观粘弹性的系统编程和模块化构建 | NA | 探索分子参数如何影响蛋白质水凝胶的宏观粘弹性 | 蛋白质水凝胶的粘弹性特性 | 生物医学工程 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 蛋白质 | 包含2、5、24或120个蛋白质成分的对称蛋白质同寡聚体 |
| 15 | 2024-08-07 |
Unlocking the secrets of the microbiome: exploring the dynamic microbial interplay with humans through metabolomics and their manipulation for synthetic biology applications
2023-06-28, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210534
PMID:37378961
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综述 | 本文综述了代谢组学在探索微生物与人类动态相互作用及其在合成生物学应用中的应用 | 强调了代谢组学在生物科学中的广泛应用，特别是在微生物系统及其在宿主和环境中的复杂相互作用 | 仍存在挑战需要克服，以最大化代谢组学在理解生物系统中的潜力 | 探讨代谢组学在合成生物学和肠道微生物与人类宿主相互作用中的应用 | 微生物组及其与人类和环境的相互作用 | NA | NA | GC-MS, LC-MS | NA | 代谢物 | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Plasmodium-Resistant Indole Diterpenoid Biosynthesis Gene Cluster Derived from Aspergillus oryzae Was Activated by Exogenous P450 Gene Ast B
2023-06-23, Journal of natural products
IF:3.3Q1
DOI:10.1021/acs.jnatprod.2c01172
PMID:37257055
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法激活了来自Aspergillus oryzae的沉默生物合成基因簇，产生了一系列新的吲哚二萜类化合物，并研究了它们的抗疟活性 | 首次报道了吲哚二萜类化合物具有潜在的抗疟疾活性，并通过结构-活性关系研究揭示了线性吲哚二萜类化合物对抗寄生虫活性的重要贡献 | NA | 研究通过合成生物学方法激活沉默生物合成基因簇，探索新型抗疟疾化合物 | 吲哚二萜类化合物的生物合成及其抗疟活性 | 合成生物学 | 疟疾 | NMR, HR-ESI-MS, 单晶X射线衍射, 分子对接 | NA | 化合物结构数据 | 15种吲哚二萜类化合物 |
| 17 | 2024-08-07 |
Live Biotherapeutic Products as Cancer Treatments
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2626
PMID:37317784
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研究论文 | 本文探讨了利用活体生物治疗产品作为癌症治疗手段的最新进展和当前挑战 | 文章强调了微生物在癌症治疗中的新角色，特别是通过合成生物学工具开发的工程化生物治疗产品 | 尽管取得了进展，但目前只有 Bacillus Calmette-Guérin 被批准用于人类使用 | 研究旨在探索和改进使用活细菌作为癌症治疗的方法 | 研究对象包括微生物在癌症治疗中的应用及其工程化产品 | NA | 癌症 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Modular Cloning by Golden Gate Assembly and Possible Application in Pathway Design
2023-Jun-28, Chimia
IF:1.1Q3
DOI:10.2533/chimia.2023.437
PMID:38047784
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研究论文 | 本文介绍了模块化克隆技术及其在合成生物学中的应用，特别是通过Golden Gate组装快速生成表达载体库的方法 | 模块化克隆技术通过Golden Gate组装支持一步法和一锅法反应，快速生成表达载体库，为代谢途径或酶级联设计提供了新的解决方案 | 由于缺乏高通量筛选方法，模块化克隆技术在工业应用中仍较少，且某些应用受限 | 探讨模块化克隆技术在合成生物学中的应用及其在工业应用中的潜力 | 模块化克隆技术及其在代谢途径和酶级联设计中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 遗传元素（如启动子、核糖体结合位点和标签） | 涉及多达20种酶的复杂途径 |