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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-10-19 |
A Synthetic Signaling Network Imitating the Action of Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism
2023-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202301562
PMID:37156014
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研究论文 | 本文设计了一种合成信号网络,模拟免疫细胞对细菌代谢的反应 | 通过设计响应性DNA颗粒和抗生素负载脂质囊泡的协作行动,模拟了免疫细胞对病原体的捕获和失活过程 | NA | 探索合成生物学中复杂生物行为的复制 | 合成信号网络、响应性DNA颗粒、抗生素负载脂质囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-09-25 |
[Research progress in systemic lupus erythematosus from 2021 to 2022]
2023-Aug-15, Zhongguo dang dai er ke za zhi = Chinese journal of contemporary pediatrics
DOI:10.7499/j.issn.1008-8830.2302150
PMID:37668024
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综述 | 总结了2021年至2022年系统性红斑狼疮(SLE)的最新研究数据和成果 | 新技术的出现,如合成生物学、基因组学和蛋白质组学,促进了SLE发病机制和生物标志物的深入研究 | NA | 总结和概述过去两年SLE相关研究 | 系统性红斑狼疮(SLE) | NA | 自身免疫性疾病 | 合成生物学、基因组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA |
3 | 2024-09-25 |
Phage-Inducible Chromosomal Islands as a Diagnostic Platform to Capture and Detect Bacterial Pathogens
2023-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301643
PMID:37358000
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研究论文 | 本文开发了一种基于噬菌体诱导染色体岛(PICI)转导的诊断系统,用于选择性富集和检测细菌病原体 | 该系统能够通过PICI表达的报告基因实现对活体病原体的可视化检测,与传统的核酸分子检测方法相比,具有更高的特异性和敏感性 | NA | 开发一种新的诊断平台,用于捕获和检测细菌病原体 | 大肠杆菌和金黄色葡萄球菌 | 生物技术 | NA | 噬菌体诱导染色体岛(PICI)转导 | NA | NA | NA |
4 | 2024-09-23 |
Phenotypically complex living materials containing engineered cyanobacteria
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40265-2
PMID:37550278
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研究论文 | 本研究利用3D打印技术制造了一种含有工程蓝细菌的生物复合材料,该材料能够对外部化学刺激产生多种功能响应 | 首次展示了通过3D打印技术制造的蓝细菌生物复合材料,能够进行环境生物修复并具有可编程的功能输出 | 研究仅限于实验室规模,尚未在实际环境应用中验证其效果 | 开发能够感知和响应环境的工程生物材料 | 工程蓝细菌及其在生物复合材料中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | 生物材料 | 使用了Synechococcus elongatus PCC 7942菌株及其工程变种 |
5 | 2024-09-13 |
Enabling technology and core theory of synthetic biology
2023-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2214-2
PMID:36753021
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综述 | 本文讨论了合成生物学领域的各种原理和技术进展 | 介绍了合成生物学的使能技术和核心理论的发展,包括基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑等 | NA | 探讨合成生物学的使能技术和核心理论的进展 | 合成生物学的使能技术和核心理论 | 合成生物学 | NA | 基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑、分子进化、功能蛋白从头设计、细胞和基因电路工程、无细胞合成生物学、人工智能辅助合成生物学 | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-05 |
Reprogramming the Cyclization Cascade of epi-Isozizaene Synthase to Generate Alternative Terpene Products
2023-08-01, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00247
PMID:37449555
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研究论文 | 该文章介绍了通过重塑epi-Isozizaene合酶的活性位点,来生成替代的萜烯产品。 | 通过突变将芳香残基替换为极性残基,重新定向了环化级联反应,生成了不同的萜烯产品。 | 未提及特定的局限性 | 研究旨在开发设计师环化酶以产生高价值的萜烯产品,适用于合成生物学。 | 对四种EIZS突变体的生化和结构特征进行表征。 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | NA | 四种EIZS突变体 |
7 | 2024-08-05 |
Beyond natural biology: rewiring cellular networks to study innate immunity
2023-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2023.102349
PMID:37269786
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综述 | 本文描述了合成生物学在研究固有免疫网络中的应用 | 提出了通过合成生物学方法重新连接细胞网络,创新性地研究模式识别受体信号传导及其与病毒的相互作用 | 文中未提及具体的实验数据或样本分析 | 研究合成生物学如何促进对固有免疫信号的理解 | 模式识别受体信号传导、病毒-宿主相互作用和系统性细胞因子反应 | 合成生物学 | NA | 化学输入或光遗传学输入 | NA | NA | NA |
8 | 2024-08-07 |
Engineered calprotectin-sensing probiotics for IBD surveillance in humans
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221121120
PMID:37523538
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研究论文 | 本文介绍了一种能够检测炎症性肠病(IBD)生物标志物——钙卫蛋白的工程化益生菌 | 利用合成生物学技术,开发了一种能够在IBD患者中特异性检测钙卫蛋白的工程化益生菌 | 目前仅在啮齿动物模型和患者粪便样本中进行了测试,需要进一步的人体临床试验验证 | 开发一种非侵入性的方法来监测IBD患者的疾病活动 | 工程化益生菌在IBD患者中的应用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | 粪便样本 | 啮齿动物模型和人类患者粪便样本 |
9 | 2024-08-07 |
The "Duckweed Dip": Aquatic Spirodela polyrhiza Plants Can Efficiently Uptake Dissolved, DNA-Wrapped Carbon Nanotubes from Their Environment for Transient Gene Expression
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554121
PMID:37662322
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研究论文 | 研究报告了水生植物大浮萍(Spirodela polyrhiza)能够高效地从其生长介质中吸收包裹在DNA中的碳纳米管(DNA-CNTs),并实现转基因表达 | 提出了一个简化的转基因传递工具——“浮萍浸泡法”,无需大量纳米材料或直接渗透到植物组织中 | NA | 探索浮萍在合成生物学中的应用潜力 | 大浮萍植物及其转基因表达能力 | 植物生物技术 | NA | 碳纳米管(DNA-CNTs) | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553928
PMID:37662294
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研究论文 | 本文通过贝叶斯优化物理基础模型,逆向工程形态发生过程 | 开发了一种贝叶斯优化框架,用于确定最优的细胞力分布,使预测的器官形状与实验图像数据中的期望器官形状相匹配 | NA | 确定细胞内和细胞间相互作用的最优组合,以预测器官的形状、大小和功能 | 翅膀想象盘,一种高度信息丰富的模型器官系统 | 生物学 | NA | 贝叶斯优化 | 高斯过程回归(GPR) | 图像 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability
2023-08-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14081635
PMID:37628687
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研究论文 | 本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现 | 本文证实了在多细胞群体形成时,集体层面的遗传性不仅存在,而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性 | NA | 探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现 | 多细胞生物的性状遗传性 | NA | NA | 分析模型、合成生物学、生物学模拟 | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
Bioconversion of C1 feedstocks for chemical production using Pichia pastoris
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.006
PMID:36967258
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综述 | 本文综述了利用毕赤酵母(Pichia pastoris)进行C1原料生物转化以生产化学品的潜力和策略 | 探讨了毕赤酵母通过代谢工程或与电催化结合利用CO的潜力,并提出了合成生物学和材料科学的新视角 | NA | 探讨利用毕赤酵母进行C1原料生物转化的挑战和可行策略 | 毕赤酵母在C1原料生物转化中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
13 | 2024-08-07 |
Modularized synthetic biology enabled intelligent biosensors
2023-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.03.005
PMID:36967259
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综述 | 本文综述了智能合成生物学驱动的生物传感器(SBBs)的最新进展及其在即时检测(POCT)和可穿戴监测中的应用 | 介绍了智能SBBs在计算、存储和自校准方面的能力,以及其在实际应用中的适应性 | NA | 探讨智能合成生物学生物传感器的发展及其应用前景 | 智能合成生物学生物传感器及其在即时检测和可穿戴监测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学模块化技术 | NA | NA | NA |
14 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria detect tumor DNA
2023-08-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf3974
PMID:37561843
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,设计了一种能够检测结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中供体DNA的天然感受态细菌 | 开发了一种新型的细胞检测方法,能够检测特定的胞外DNA序列和突变 | NA | 开发一种能够检测特定胞外DNA序列和突变的细胞生物传感器 | 结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中的供体DNA | 合成生物学 | 结直肠癌 | CRISPR-discriminated horizontal gene transfer (CATCH) | NA | DNA | 在携带结直肠肿瘤的小鼠中进行了体内验证 |
15 | 2024-08-07 |
Synthesizing a Smarter CAR T Cell: Advanced Engineering of T-cell Immunotherapies
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0962
PMID:37429007
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学改进现有CAR T细胞技术的方法,并讨论了下一代工程化免疫细胞疗法的前景 | 将合成生物学的发展整合到免疫疗法中,以扩大可治疗疾病的范围,微调所需的免疫反应,并提高治疗细胞的效力 | CAR T细胞在治疗血液癌症方面显示出疗效,但其安全性和效力问题限制了其在更广泛疾病中的应用 | 改进现有的CAR T细胞技术,开发下一代工程化免疫细胞疗法 | CAR T细胞及其在免疫疗法中的应用 | NA | 血液癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
16 | 2024-08-07 |
A Mesorhizobium japonicum quorum sensing circuit that involves three linked genes and an unusual acyl-homoserine lactone signal
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-23
PMID:37227303
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研究论文 | 本文研究了Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统,该系统涉及三个连锁基因和一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号 | 发现了Mesorhizobium japonicum中一种新的群体感应系统,该系统涉及一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号和三个组件,而非传统的两个组件 | NA | 研究Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统及其在根瘤共生中的作用 | Mesorhizobium japonicum的群体感应系统和其产生的独特酰基高丝氨酸内酯信号 | NA | NA | 群体感应 | NA | 基因组序列 | 涉及多个Mesorhizobium japonicum菌株 |
17 | 2024-08-07 |
CSI: Contrastive data Stratification for Interaction prediction and its application to compound-protein interaction prediction
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad456
PMID:37490457
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研究论文 | 本文介绍了一种名为对比分层交互预测(CSI)的新方法,通过对比多视角编码技术来学习最大化互信息的数据嵌入,并应用于化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 提出了一种新的数据分层方法CSI,通过对比学习技术增强对象表示,并展示了在化合物-蛋白质序列交互预测中的有效性 | NA | 开发一种新的方法来准确预测两个对象之间的交互可能性,并应用于化合物-蛋白质序列交互预测 | 化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 计算机科学 | NA | 对比学习 | 对比多视角编码 | 序列数据 | 多个药物-目标和酶数据集 |