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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-12-09 |
Interplay of emerging and established technologies drives innovation in natural product antibiotic discovery
2023-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102359
PMID:37517368
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研究论文 | 本文探讨了新兴技术和现有技术在天然产物抗生素发现中的相互作用,强调了这些技术在推动新型抗生素开发中的关键作用 | 本文介绍了近期在筛选方法、微生物学、生物信息学、代谢组学技术以及天然产物启发合成和合成生物学领域的创新,这些创新在过去两年中推动了新型天然产物抗生素的发现 | NA | 探讨新兴技术和现有技术在天然产物抗生素发现中的相互作用,推动新型抗生素的开发 | 天然产物抗生素及其对抗耐药病原体的新作用机制 | 生物信息学 | NA | 筛选方法、微生物学、生物信息学、代谢组学技术、天然产物启发合成、合成生物学 | NA | NA | NA |
2 | 2024-12-01 |
Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00372
PMID:37793076
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研究论文 | 本文开发了一种蒙特卡罗模型,用于分析细胞半径和细胞内体积分数如何定量影响基于水通道蛋白的报告基因信号 | 提出了基于两个扩散时间信号相减的差分成像方法,以提高信号特异性,并使用蒙特卡罗模拟分析了扩散性与水通道蛋白表达细胞百分比之间的关系 | NA | 开发一种定量框架,用于非侵入性地监测活体动物中基因工程设备的定位和功能 | 水通道蛋白信号与组织背景的区分 | 生物医学合成生物学 | NA | 蒙特卡罗模拟 | NA | NA | NA |
3 | 2024-11-22 |
At-Home, Cell-Free Synthetic Biology Education Modules for Transcriptional Regulation and Environmental Water Quality Monitoring
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00223
PMID:37699423
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研究论文 | 开发了四个稳定的无细胞生物传感教育模块,用于转录调控和环境水质监测 | 开发了无需专业实验室设备的稳定无细胞生物传感教育模块,适用于家庭和课堂使用 | 仅在K-12教师和高中生中进行了试点测试,需要进一步验证其在大规模教育中的有效性 | 解决合成生物学领域教育资源不平等的问题,提供易于使用的教育模块 | 无细胞生物传感教育模块,用于转录调控和环境水质监测 | 合成生物学 | NA | 无细胞生物传感技术 | NA | NA | 130名高中生和K-12教师 |
4 | 2024-10-26 |
Mass-Activated Droplet Sorting for the Selection of Lysine-Producing Escherichia coli
2023-10-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c03080
PMID:37820298
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研究论文 | 本文展示了使用质量激活液滴分选(MADS)技术,通过电喷雾电离质谱(ESI-MS)信号强度选择产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞 | 首次使用MADS技术进行液滴分选,替代了传统的荧光分析方法,提高了细胞工程的效率 | 依赖于电喷雾电离质谱(ESI-MS)信号强度进行分选,可能存在信号检测的局限性 | 开发一种新的方法来筛选和分选合成生物学中的变异细胞库,以提高细胞工程的效率 | 产生赖氨酸的变异大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 电喷雾电离质谱(ESI-MS) | NA | 质谱信号 | 20 nL液滴,0.5样本/秒,96-98%纯度的高产变异细胞 |
5 | 2024-10-20 |
The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562147
PMID:37873347
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研究论文 | 研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 提出了一个新的模型,解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性 | NA | 探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化 | H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 表观遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-10-18 |
A microbial evolutionary approach for a sustainable future
2023-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14331
PMID:37602659
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物进化方法实现可持续发展的潜力 | 提出利用快速进化的原核生物及其在合成生物学中的可操作性,以及其在处理有机和无机化学物质方面的天然多样性,来解决社会面临的紧迫问题 | NA | 探讨如何利用微生物进化方法实现可持续发展 | 原核生物及其在可持续发展中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
7 | 2024-10-14 |
Adapting enzymes to improve their functionality in plants: why and how
2023-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230532
PMID:37787016
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法改进植物中酶功能的策略,特别是连续定向进化系统在提高酶与植物细胞环境兼容性方面的应用 | 本文介绍了连续定向进化系统在改进植物中非天然酶功能方面的应用,特别是酵母OrthoRep系统的适用性 | 本文主要集中在理论和方法的综述,缺乏具体的实验数据和案例分析 | 探讨如何通过合成生物学方法改进植物中酶的功能,以提高作物产量和品质 | 植物中的酶功能及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 连续定向进化 | NA | NA | NA |
8 | 2024-10-13 |
Turn-On Protein Switches for Controlling Actin Binding in Cells
2023-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.561921
PMID:37961502
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研究论文 | 本文介绍了一种可控的肌动蛋白结合开关工具(CASTs),其肌动蛋白结合行为可通过外部刺激控制 | 开发了可响应不同外部输入的CASTs,提供了开启动力学选项并实现了正交性 | NA | 研究如何通过外部刺激控制肌动蛋白结合蛋白的行为,以应用于合成生物学 | 肌动蛋白结合蛋白及其在细胞中的作用 | NA | NA | 基因工程 | NA | 蛋白质 | NA |
9 | 2024-10-04 |
Expression of blue pigment synthetase a from Streptomyces lavenduale reveals insights on the effects of refactoring biosynthetic megasynthases for heterologous expression in Escherichia coli
2023-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2023.106317
PMID:37286066
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研究论文 | 研究评估了来自Streptomyces lavendulae的非核糖体肽合成酶(NRPS)在E. coli中的异源表达,并比较了密码子优化序列与天然序列的效果 | 首次直接比较了来自链霉菌的蛋白质在E. coli中异源表达时,密码子优化序列与天然序列的差异 | 研究仅限于评估一种NRPS在E. coli中的表达,未涉及其他类型的生物合成蛋白 | 研究链霉菌中生物合成蛋白在E. coli中的异源表达及其折叠问题 | 来自Streptomyces lavendulae的非核糖体肽合成酶(NRPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10 | 2024-10-02 |
Making the connections: physical and electric interactions in biohybrid photosynthetic systems
2023-Oct-11, Energy & environmental science
IF:32.4Q1
DOI:10.1039/d3ee01265d
PMID:38013927
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研究论文 | 本文讨论了共轭有机材料作为生物混合光合系统中的光敏剂的潜力,并比较了其与传统无机半导体的优劣 | 提出共轭有机材料作为生物混合光合系统中的光敏剂,能够调节光物理性质和光敏剂与生物细胞之间的物理化学相互作用,从而提高稳定性和电荷转移 | 当前生物混合光合系统的太阳能效率仍然较低 | 探讨生物混合光合系统中物理和电相互作用,以提高太阳能到化学能的转换效率 | 生物混合光合系统中的光敏剂和电子传输过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11 | 2024-09-28 |
Heterologous Production in the Synechocystis Chassis Suggests the Biosynthetic Pathway of Astaxanthin in Cyanobacteria
2023-Oct-03, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12101826
PMID:37891905
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研究论文 | 研究在Synechocystis底盘中异源生产虾青素的生物合成途径 | 首次揭示了在Synechocystis底盘中虾青素生物合成途径中的羟基化和酮基化反应顺序 | 研究中发现羟基化步骤可能是异源生产虾青素的瓶颈,需要进一步筛选或基因工程改造 | 阐明在Synechocystis底盘中虾青素的生物合成途径 | 虾青素的生物合成途径及其在Synechocystis底盘中的异源生产 | NA | NA | 基因沉默技术、基因引入技术、液相色谱-串联质谱分析 | NA | 基因序列、色素分析数据 | 涉及多个基因工程改造的Synechocystis细胞系 |
12 | 2024-09-26 |
Rational design of small-molecule responsive protein switches
2023-10, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4774
PMID:37656809
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研究论文 | 本文讨论了小分子响应性蛋白质开关的合理设计及其在控制细胞过程中的应用 | 本文介绍了计算蛋白质设计领域的最新进展,这些进展促进了小分子诱导剂范围的扩大和开关机制的复杂化 | NA | 探讨技术进步如何影响化学开关的开发 | 小分子响应性蛋白质开关 | 生物技术 | NA | 计算蛋白质设计 | NA | NA | NA |
13 | 2024-09-20 |
Special Issue "Synthetic Biology for Biosensing in Health and Environmental Applications"
2023-Oct-19, Biosensors
DOI:10.3390/bios13100937
PMID:37887130
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特刊 | 本特刊探讨了生物传感技术在健康和环境应用中的合成生物学方法 | NA | NA | 探讨生物传感技术在健康和环境应用中的合成生物学方法 | 生物传感器的生物感知元件,如酶、抗体、核酸或细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
14 | 2024-08-07 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-Oct-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本文报道了在非固氮宿主大肠杆菌中异源合成氮酶P-和M-簇核心的成功 | 首次通过生化和光谱分析证明了在非固氮宿主中成功合成P-和L-簇 | NA | 研究氮酶的异源表达及其生物合成机制 | 氮酶的P-和M-簇核心 | 生物化学 | NA | 电子顺磁共振(EPR)、X射线吸收光谱(XAS)/扩展X射线吸收精细结构(EXAFS) | NA | 生化数据 | NA |
15 | 2024-08-07 |
Research progress of multi-enzyme complexes based on the design of scaffold protein
2023-Oct-23, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00695-8
PMID:38647916
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综述 | 本文综述了基于支架蛋白设计的多酶复合体在分子酶工程中的设计策略和应用进展 | NA | NA | 探讨多酶复合体的设计策略及其在合成生物学中的应用 | 多酶复合体及其在酶级联反应中的应用 | 分子酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
16 | 2024-08-07 |
De novo synthesis of nervonic acid and optimization of metabolic regulation by Yarrowia lipolytica
2023-Oct-06, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00689-6
PMID:38647797
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在Yarrowia lipolytica中构建了nervonic酸的从头合成途径,并通过代谢工程和发酵优化进一步提高了nervonic酸的产量 | 成功表达和评估了来自不同生物的异源延长酶和脱饱和酶,用于在Y. lipolytica中生产nervonic酸,并分析了添加菜籽油作为辅助碳源对nervonic酸生产的潜力 | NA | 开发一种高效的生产nervonic酸的方法,以替代传统的天然提取或化学合成方法 | nervonic酸的合成及其在Yarrowia lipolytica中的代谢调控 | 合成生物学 | 脑神经系统疾病 | 代谢工程 | NA | NA | 最高浓度达到185.0 mg/L |
17 | 2024-08-07 |
Compact Programmable Control of Protein Secretion in Mammalian Cells
2023-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.04.560774
PMID:37873144
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Compact RELEASE的新型合成生物学平台,用于在哺乳动物细胞中控制蛋白质分泌 | 通过利用内源性14-3-3蛋白的招募和拮抗行为,创建了RELEASE-NOT系统,结合RELEASE和RELEASE-NOT,形成了一套名为Compact RELEASE的蛋白质水平处理和输出模块,实现了单一输入蛋白酶的逻辑处理和模拟信号过滤 | NA | 开发一种新型的合成生物学平台,用于精确控制哺乳动物细胞中的蛋白质分泌,以应用于生物医学领域 | 哺乳动物细胞中的蛋白质分泌控制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 蛋白质 | NA |
18 | 2024-08-07 |
Plasmid Crosstalk in Cell-Free Expression Systems
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00412
PMID:37756020
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研究论文 | 本文探讨了无细胞表达系统中质粒间相互作用(质粒串扰)对蛋白质表达水平的影响 | 首次详细研究了质粒浓度和转录机器类型对质粒串扰效应的影响 | 未提及具体限制 | 研究质粒串扰对无细胞合成生物学应用中遗传电路功能的影响 | 无细胞表达系统中的质粒串扰现象 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质表达 | NA | 蛋白质表达水平 | 未提及具体样本数量 |
19 | 2024-08-07 |
Recent progress and challenges in synthetic biology for improving microbial production of biopolymers
2023-10, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2023.127463
PMID:37479534
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
20 | 2024-08-07 |
Automated Design of Synthetic Gene Circuits in the Presence of Molecular Noise
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00033
PMID:37812682
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研究论文 | 本文探讨了在分子噪声影响下,如何自动化设计合成基因电路 | 结合混合整数非线性全局优化方法与部分积分-微分方程模型,有效近似化学主方程,实现了在分子噪声影响下的合成基因电路自动化设计 | NA | 解决分子噪声对微生物细胞中基因调控动态影响的问题 | 合成生物学中的合成基因电路设计 | 合成生物学 | NA | 混合整数非线性全局优化方法 | 部分积分-微分方程模型 | NA | NA |