合成生物学相关文章
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当前共找到 46 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-10-15 |
Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering
2023-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02251-7
PMID:38031061
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研究论文 | 本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术，在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰，以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 通过计算机设计算法和湿实验筛选，成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量 | NA | 通过系统生物学和合成生物学工具，设计高效的微生物细胞工厂，以合成高价值产品 | 工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 代谢工程 | NA | 基于约束的重建与分析（COBRA）方法 | NA | 基因组数据 | 17种基因组修饰，包括9个基因敲除和8个基因过表达 |
| 2 | 2024-10-15 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
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研究论文 | 本文设计并合成了23,640个B细胞特异性启动子，并通过深度学习模型预测其转录强度 | 本文首次将合成生物学与深度学习结合，用于解码和重编DNA调控语法，并设计了大量B细胞特异性启动子 | NA | 解码B细胞特异性转录调控机制，并为B细胞工程提供大量非相似启动子 | B细胞特异性启动子及其在免疫球蛋白V基因转录中的作用 | 合成生物学 | NA | MPRA（大规模并行报告分析） | 深度学习模型 | DNA序列 | 23,640个合成的B细胞特异性启动子 |
| 3 | 2024-10-15 |
Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438
PMID:38020966
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研究论文 | 本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用 | 本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展，特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台，开启了定制生物学的新时代 | 尽管取得了显著进展，但仍存在一些障碍，限制了工程真核细胞的更广泛应用 | 探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力 | 酵母作为真核生物的研究和工业用途 | 生物技术 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-10-15 |
Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437
PMID:38020969
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研究论文 | 本文描述了在合成酵母染色体VIII中，通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置，研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性 | 发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性，而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性 | NA | 研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性 | 酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能 | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组序列 | NA |
| 5 | 2024-10-14 |
Module-Based Polyketide Synthase Engineering for de Novo Polyketide Biosynthesis
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00282
PMID:37871264
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研究论文 | 本文探讨了基于模块的聚酮合酶工程在从头合成聚酮化合物中的应用 | 提出了新的模块边界设计原则，并利用最新的结构建模和合成生物学工具加速聚酮合酶工程 | 目前仍处于研究初期，基于现有工程努力的设计原则的普遍性尚不明确 | 探索聚酮合酶工程的新方法，以提高从头合成聚酮化合物的效率 | 聚酮合酶的模块边界和功能 | 合成生物学 | NA | 结构建模和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-16 |
Engineering the IL-4/IL-13 axis for targeted immune modulation
2023-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13230
PMID:37283511
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综述 | 本文综述了通过分子工程和合成生物学方法操纵IL-4/IL-13轴以调节免疫行为和开发新型治疗药物的进展 | 介绍了新兴的生物工程工具，这些工具有望继续推进对IL-4/IL-13生物学的基本理解，并使研究人员能够利用这些见解开发有效的干预措施 | NA | 探讨如何通过操纵IL-4/IL-13轴来分解IL-4和IL-13途径，并发现针对过敏、自身免疫疾病和癌症的新型免疫治疗方法 | IL-4和IL-13细胞因子及其在免疫调节中的作用 | NA | 过敏、自身免疫疾病、癌症 | 分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Illuminating protein space with a programmable generative model
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06728-8
PMID:37968394
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研究论文 | 介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于生成新的蛋白质结构和序列，并能够根据特定属性和功能进行条件生成 | 引入了尊重聚合物集合构象统计的扩散过程，以及用于分子系统的高效神经架构，支持长距离推理并具有次二次缩放特性 | NA | 加速蛋白质设计的编程，以造福人类健康、材料科学和合成生物学 | 蛋白质及其复合物的设计 | 生物信息学 | NA | 扩散模型 | 生成模型 | 蛋白质结构 | 310种蛋白质 |
| 8 | 2024-08-07 |
Navigating the Frontier of Synthetic Biology: An AI-Driven Analytics Platform for Exploring Research Trends and Relationships
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00192
PMID:37648657
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研究论文 | 本研究利用主题建模技术全面映射合成生物学领域的研究主题，揭示子主题及其关系和时间趋势 | 本研究通过分析合成生物学的文献，揭示了研究主题的子领域和它们之间的关系，以及时间趋势 | NA | 旨在深入理解合成生物学并为其分析提供基础 | 合成生物学的研究主题、子主题及其关系和时间趋势 | 合成生物学 | NA | 主题建模 | NA | 文本 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Nonsterilized Fermentation of Crude Glycerol for Polyhydroxybutyrate Production by Metabolically Engineered Vibrio natriegens
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00498
PMID:37856147
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研究论文 | 本文通过基因工程改造快速生长的盐和有毒物质耐受性强的细菌Vibrio natriegens，实现了从非灭菌发酵的有机废物中高效生产聚羟基丁酸酯（PHB） | 通过基因编辑和过表达关键基因，成功提高了PHB的产量和耐受性，且在非灭菌条件下表现出色 | NA | 探索通过基因工程提高微生物发酵生产聚羟基丁酸酯的效率和成本效益 | Vibrio natriegens细菌及其在PHB生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 微生物发酵 | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566095
PMID:37986852
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研究论文 | 本研究证明Aquaporin-1（Aqp1）水通道蛋白在多种细胞类型中产生强扩散型磁共振信号，且不影响细胞活性和形态 | 首次证明Aqp1在多种细胞类型中产生强磁共振信号，且不影响细胞生理功能 | NA | 验证Aqp1作为基因报告器的可行性和安全性 | 来自小鼠和人类的不同细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞 | 多种细胞系 |
| 11 | 2024-08-07 |
Application of synthetic lipid droplets in metabolic diseases
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1441
PMID:37997538
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综述 | 本文综述了内源性脂滴的组装和功能，以及合成脂滴模型在生物学中的最新进展和应用挑战 | 开发了体外合成脂滴的方法，并在蛋白质结合、脂质功能、膜动力学和酶反应方面取得了显著进展 | 细胞生物学方法的局限性导致脂滴功能的分子机制尚未完全理解 | 全面概述脂滴的组装和功能，并探讨合成脂滴模型在未来的实际应用中的作用和挑战 | 脂滴及其在代谢疾病中的作用 | 合成生物学 | 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Mammalian Genomic Manipulation with Orthogonal Bxb1 DNA Recombinase Sites for the Functional Characterization of Protein Variants
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00355
PMID:37922210
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研究论文 | 本文利用两个正交的Bxb1重组酶位点，通过设计带有辅助重组位点的质粒，实现了在同一细胞中避免不希望的细菌DNA元件整合，并创建了同时携带两个正交Bxb1重组酶位点的细胞，用于复杂的细胞遗传学分析。 | 本文首次利用两个正交的Bxb1重组酶位点，实现了在同一细胞中进行复杂的遗传操作，包括实时监测细胞内钙信号动力学和识别蛋白质相互作用。 | NA | 利用正交Bxb1重组酶位点进行哺乳动物基因组操作，以功能性表征蛋白质变体。 | 哺乳动物细胞中的基因组操作和蛋白质变体的功能表征。 | 基因工程 | NA | Bxb1重组酶 | NA | 基因组数据 | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
A Multiplex MoClo Toolkit for Extensive and Flexible Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00423
PMID:37930278
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研究论文 | 本文介绍了一种新的多重MoClo工具包——多重酵母工具包（MYT），该工具包扩展了MoClo酵母工具包（YTK）的能力，并解决了酵母菌株工程的局限性 | MYT工具包提供了新的整合载体和选择性标记，增加了装配盒以增加多基因构建体中的转录单元数量，并引入了CRISPR-Cas9工具和三种正交且可诱导的启动子系统 | YTK工具包在创建新酵母菌株的广度和灵活性方面存在局限 | 扩展酵母合成生物学工具包的能力，以实现更广泛和灵活的酵母工程 | 酵母菌株的工程化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本文介绍了一种名为INSPIRE-seq的方法，利用纳米抗体库和下一代测序技术，在复杂的肿瘤微环境中并行富集免疫细胞结合的纳米抗体 | INSPIRE-seq提供了一种无偏见的方法来研究复杂的微环境，并辅助纳米抗体的开发 | NA | 开发一种新技术来发现治疗性生物制剂的靶向分子 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及肿瘤、淋巴结和脾脏中的免疫细胞亚型 |
| 15 | 2024-08-07 |
The technology, opportunities, and challenges of Synthetic Biological Intelligence
2023-11, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108233
PMID:37558186
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综述 | 本文综述了合成生物智能（SBI）的发展及其潜在应用，并探讨了相关的伦理问题 | 首次详细探讨了合成生物智能技术的伦理机会与挑战 | 尚未深入探索合成生物智能技术背后的具体技术细节 | 提供一个坚实的框架来构建伦理考量，确保SBI技术能够负责任地进行研究和应用 | 合成生物智能技术及其伦理影响 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Next-generation chimeric antigen receptors for T- and natural killer-cell therapies against cancer
2023-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13255
PMID:37548050
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综述 | 本文综述了利用嵌合抗原受体（CAR）T细胞和自然杀伤（NK）细胞进行肿瘤治疗的最新策略 | 介绍了通过合成生物学和遗传工程技术重新编程免疫效应细胞，以提高其对肿瘤的选择性，从而减轻靶向非肿瘤组织的副作用 | 目前CAR T细胞疗法在髓系恶性肿瘤和实体癌中的广泛应用受到目标抗原表达不足和异质性的限制 | 探讨提高CAR对肿瘤细胞选择性的当前策略，并关注这些策略在临床转化中的进展 | CAR T细胞和NK细胞 | NA | 癌症 | 合成生物学和遗传工程 | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Integrating genomic and multiomic data for Angelica sinensis provides insights into the evolution and biosynthesis of pharmaceutically bioactive compounds
2023-11-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05569-5
PMID:38001348
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研究论文 | 本文报道了改进的安国芹（Angelica sinensis var. Qinggui1）染色体规模基因组，并结合基因组测序、代谢组学分析和转录组分析，揭示了安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因 | 首次揭示了安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因，并探讨了这些基因的进化和调控机制 | NA | 研究安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因 | 安国芹根中的药理活性成分 | 基因组学 | NA | 基因组测序、代谢组学分析、转录组分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据、转录组数据 | 安国芹根（正常生长和早花期） |
| 18 | 2024-08-07 |
High-Level Production of scFv-Fc Antibody Using an Artificial Promoter System with Transcriptional Positive Feedback Loop of Transactivator in CHO Cells
2023-11-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12222638
PMID:37998372
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研究论文 | 本研究通过设计基于人工转录因子的基因表达系统，开发了一种在CHO细胞中高效生产scFv-Fc抗体的高产系统 | 利用人工转录因子构建的正反馈回路系统，实现了在CHO细胞中高表达目标基因，从而达到高产量的抗体生产 | NA | 开发一种在CHO细胞中高效生产抗体的高产系统 | scFv-Fc抗体 | 生物技术 | NA | 人工转录因子 | NA | NA | 使用高细胞密度悬浮培养和无血清培养基进行半连续培养 |
| 19 | 2024-08-07 |
A spotlight on global collaboration in the Sc2.0 yeast consortium
2023-11-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100441
PMID:38020973
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研究论文 | 本文重点介绍了合成酵母基因组项目（Sc2.0）中中国研究团队的工作及其对Sc2.0和合成生物学未来的看法 | NA | NA | 创建和优化合成染色体，最终目标是组装一个具有设计特征的合成酵母生物，以促进合成生物学和工程项目的应用 | 合成酵母基因组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Soil as a transdisciplinary research catalyst: from bioprospecting to biorespecting
2023-Nov, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.230963
PMID:38026022
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研究论文 | 本文通过一个公共参与项目，探讨了土壤微生物组在城市六个地点的应用，使用基于纳米孔的DNA测序技术，并结合合成生物学、环境人文学和微生物生态学等多个学科的研究 | 提出了从'生物勘探'到'生物尊重'的概念转变，强调了基因信息使用应考虑其生态系统来源的责任 | NA | 探讨如何公平合理地使用土壤微生物组的潜在价值信息 | 土壤微生物组及其在城市环境中的应用 | 微生物生态学 | NA | 基于纳米孔的DNA测序 | NA | DNA序列 | 六个城市地点的土壤样本 |