合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-10	Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment 2023-11-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-43038-z PMID:37978291	研究论文	介绍了一种名为INSPIRE-seq的新方法，用于在复杂环境中筛选纳米抗体	开发了INSPIRE-seq技术，能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体	未提及具体样本量或实验验证的详细限制	开发筛选纳米抗体的新技术，用于治疗性生物制剂的靶向分子发现	肿瘤微环境中的免疫细胞	合成生物学	肿瘤	NGS, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 结构建模与对接研究	NA	测序数据, 图像数据	NA
2	2025-05-09	A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies 2023-11-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-43484-9 PMID:38012128	research paper	本文介绍了一种基于simeprevir的新型化学诱导二聚化（CID）模块，用于控制细胞和基因治疗中的生物过程	开发了一种基于已获批口服小分子simeprevir的新型CID模块，可用于控制基因表达和细胞凋亡，并在异种移植小鼠模型中展示了其诱导肿瘤细胞凋亡的能力	研究主要集中于体外和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发可用于临床环境的新型分子开关系统	化学诱导二聚化（CID）模块及其在细胞和基因治疗中的应用	合成生物学	肿瘤	化学诱导二聚化技术	异种移植小鼠模型	实验数据	体外细胞实验和异种移植小鼠模型
3	2025-05-08	Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides 2023-11-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-43451-4 PMID:38030603	研究论文	本研究通过计算技术和合成生物学方法，揭示了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin的结构及其抗生素活性，探索了自然界如何通过进化优化这类抗生素	结合计算技术和合成生物学方法，成功预测并复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin，揭示了其结构和抗生素活性	研究主要依赖于计算预测和合成生物学技术，可能无法完全还原自然进化过程中的所有细节	探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化起源及其优化策略	脂质II靶向糖肽抗生素（如teicoplanin和vancomycin）及其祖先分子paleomycin	合成生物学	抗生素耐药性细菌感染	计算技术、合成生物学技术	NA	NA	NA
4	2025-03-27	Advancement of Engineered Bacteria for Orally Delivered Therapeutics 2023-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202302702 PMID:37537714	review	本文综述了工程化细菌用于口服治疗的最新进展，包括细菌及其生物组分的类型、工程化策略及其在疾病治疗中的应用	结合合成生物学和纳米技术的最新发展，对细菌进行定向基因重编程，以提高其在胃肠道中的存活率和治疗效果	尽管工程化细菌在口服治疗中显示出潜力，但仍面临胃肠道恶劣环境的挑战，且治疗效果在体内显著降低	探讨工程化细菌作为口服治疗剂的当前进展、工程化策略及其在疾病治疗中的应用	工程化细菌及其生物组分	合成生物学	NA	合成生物学、纳米技术	NA	NA	NA
5	2025-02-07	Next-generation chimeric antigen receptors for T- and natural killer-cell therapies against cancer 2023-11, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13255 PMID:37548050	综述	本文综述了下一代嵌合抗原受体（CAR）在T细胞和自然杀伤（NK）细胞治疗癌症中的应用	讨论了通过合成生物学和基因工程重新编程免疫效应细胞，以增强其对肿瘤的选择性，从而减轻靶向非肿瘤组织的副作用	CAR技术在髓系恶性肿瘤和实体瘤中的广泛应用受到靶抗原表达稀少和异质性以及缺乏真正的肿瘤特异性抗原的限制	提高CAR对肿瘤细胞的选择性，特别是针对NK细胞的策略	T细胞和自然杀伤（NK）细胞	生物医学工程	癌症	合成生物学和基因工程	NA	NA	NA
6	2025-02-07	A synthetic biology approach to engineering circuits in immune cells 2023-11, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13244 PMID:37464881	综述	本文讨论了合成受体回路在增强免疫细胞功能以用于癌症免疫治疗中的最新策略和应用	利用合成生物学和特定回路架构的特性，设计新一代免疫细胞，以识别癌细胞并最小化脱靶毒性	NA	克服当前癌症免疫治疗中的挑战，如特定靶向癌细胞、增加T细胞增殖和在肿瘤微环境中的持久性	T细胞	合成生物学	癌症	合成生物学技术	NA	NA	NA
7	2025-02-07	Eras of designer Tregs: Harnessing synthetic biology for immune suppression 2023-11, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13254 PMID:37522861	综述	本文回顾了通过合成生物学方法设计的调节性T细胞（Tregs）的发展历程，分为三个时代：FOXP3工程时代、抗原特异性时代和当前利用先进基因组编辑技术的时代	通过合成生物学方法设计Tregs，克服了多克隆Tregs的局限性，并引入了新的特性	Treg疗法的疗效尚未明确，可能受到体内持久性差和缺乏抗原特异性的限制	探讨设计Tregs在免疫介导疾病中的应用和疗效	CD4 CD25 FOXP3调节性T细胞（Tregs）	合成生物学	免疫介导疾病	基因组编辑技术	NA	NA	NA
8	2025-02-06	Engineering the IL-4/IL-13 axis for targeted immune modulation 2023-11, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13230 PMID:37283511	综述	本文综述了通过分子工程和合成生物学方法调控IL-4/IL-13轴以调节免疫行为并开发新型治疗策略的持续努力	探讨了多种工程策略，包括细胞因子工程、融合蛋白配方、拮抗剂开发、细胞工程方法和生物传感器设计，以解析IL-4和IL-13通路并发现针对过敏、自身免疫疾病和癌症的新免疫疗法	NA	通过调控IL-4/IL-13轴来调节免疫行为并开发新型治疗策略	IL-4和IL-13细胞因子及其在免疫调节中的作用	合成生物学	过敏、自身免疫疾病、癌症	分子工程、合成生物学、细胞工程、生物传感器设计	NA	NA	NA
9	2025-02-06	Toward the clinical development of synthetic immunity to cancer 2023-11, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13245 PMID:37491719	研究论文	本文探讨了合成生物学工具在癌症治疗中的应用，特别是嵌合抗原受体（CARs）在激活和增强免疫细胞对肿瘤反应中的作用	提出了五项原则，以指导未来细胞疗法的设计，旨在提高临床影响的可能性，并概述了当前合成生物学细胞疗法在癌症治疗中的设计现状	尽管这些原则基于癌症治疗中的免疫细胞工程，但作者认为它们可以指导其他高需求疾病领域的合成生物学研究	提高合成生物学工具在癌症免疫治疗中的转化成功率	癌症患者，特别是对现有疗法无反应或具有免疫难治性实体瘤的患者	合成生物学	癌症	嵌合抗原受体（CARs）	NA	NA	NA
10	2024-10-15	Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering 2023-Nov-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-023-02251-7 PMID:38031061	研究论文	本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术，在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰，以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产	通过计算机设计算法和湿实验筛选，成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量	NA	通过系统生物学和合成生物学工具，设计高效的微生物细胞工厂，以合成高价值产品	工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产	代谢工程	NA	基于约束的重建与分析（COBRA）方法	NA	基因组数据	17种基因组修饰，包括9个基因敲除和8个基因过表达
11	2024-10-15	Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters 2023-Nov-27, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkad930 PMID:37889080	研究论文	本文设计并合成了23,640个B细胞特异性启动子，并通过深度学习模型预测其转录强度	本文首次将合成生物学与深度学习结合，用于解码和重编DNA调控语法，并设计了大量B细胞特异性启动子	NA	解码B细胞特异性转录调控机制，并为B细胞工程提供大量非相似启动子	B细胞特异性启动子及其在免疫球蛋白V基因转录中的作用	合成生物学	NA	MPRA（大规模并行报告分析）	深度学习模型	DNA序列	23,640个合成的B细胞特异性启动子
12	2024-10-15	Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications 2023-Nov-08, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438 PMID:38020966	研究论文	本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用	本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展，特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台，开启了定制生物学的新时代	尽管取得了显著进展，但仍存在一些障碍，限制了工程真核细胞的更广泛应用	探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力	酵母作为真核生物的研究和工业用途	生物技术	NA	基因组工程	NA	NA	NA
13	2024-10-15	Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII 2023-Nov-08, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437 PMID:38020969	研究论文	本文描述了在合成酵母染色体VIII中，通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置，研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性	发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性，而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性	NA	研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性	酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能	合成生物学	NA	基因组工程	NA	基因组序列	NA
14	2024-10-14	Module-Based Polyketide Synthase Engineering for de Novo Polyketide Biosynthesis 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00282 PMID:37871264	研究论文	本文探讨了基于模块的聚酮合酶工程在从头合成聚酮化合物中的应用	提出了新的模块边界设计原则，并利用最新的结构建模和合成生物学工具加速聚酮合酶工程	目前仍处于研究初期，基于现有工程努力的设计原则的普遍性尚不明确	探索聚酮合酶工程的新方法，以提高从头合成聚酮化合物的效率	聚酮合酶的模块边界和功能	合成生物学	NA	结构建模和合成生物学	NA	NA	NA
15	2024-08-07	Illuminating protein space with a programmable generative model 2023-Nov, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06728-8 PMID:37968394	研究论文	介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于生成新的蛋白质结构和序列，并能够根据特定属性和功能进行条件生成	引入了尊重聚合物集合构象统计的扩散过程，以及用于分子系统的高效神经架构，支持长距离推理并具有次二次缩放特性	NA	加速蛋白质设计的编程，以造福人类健康、材料科学和合成生物学	蛋白质及其复合物的设计	生物信息学	NA	扩散模型	生成模型	蛋白质结构	310种蛋白质
16	2024-08-07	Navigating the Frontier of Synthetic Biology: An AI-Driven Analytics Platform for Exploring Research Trends and Relationships 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00192 PMID:37648657	研究论文	本研究利用主题建模技术全面映射合成生物学领域的研究主题，揭示子主题及其关系和时间趋势	本研究通过分析合成生物学的文献，揭示了研究主题的子领域和它们之间的关系，以及时间趋势	NA	旨在深入理解合成生物学并为其分析提供基础	合成生物学的研究主题、子主题及其关系和时间趋势	合成生物学	NA	主题建模	NA	文本	NA
17	2024-08-07	Nonsterilized Fermentation of Crude Glycerol for Polyhydroxybutyrate Production by Metabolically Engineered Vibrio natriegens 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00498 PMID:37856147	研究论文	本文通过基因工程改造快速生长的盐和有毒物质耐受性强的细菌Vibrio natriegens，实现了从非灭菌发酵的有机废物中高效生产聚羟基丁酸酯（PHB）	通过基因编辑和过表达关键基因，成功提高了PHB的产量和耐受性，且在非灭菌条件下表现出色	NA	探索通过基因工程提高微生物发酵生产聚羟基丁酸酯的效率和成本效益	Vibrio natriegens细菌及其在PHB生产中的应用	合成生物学	NA	基因编辑	NA	微生物发酵	NA
18	2024-08-07	Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types 2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.07.566095 PMID:37986852	研究论文	本研究证明Aquaporin-1（Aqp1）水通道蛋白在多种细胞类型中产生强扩散型磁共振信号，且不影响细胞活性和形态	首次证明Aqp1在多种细胞类型中产生强磁共振信号，且不影响细胞生理功能	NA	验证Aqp1作为基因报告器的可行性和安全性	来自小鼠和人类的不同细胞系	生物医学工程	NA	磁共振成像	NA	细胞	多种细胞系
19	2024-08-07	Application of synthetic lipid droplets in metabolic diseases 2023-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.1441 PMID:37997538	综述	本文综述了内源性脂滴的组装和功能，以及合成脂滴模型在生物学中的最新进展和应用挑战	开发了体外合成脂滴的方法，并在蛋白质结合、脂质功能、膜动力学和酶反应方面取得了显著进展	细胞生物学方法的局限性导致脂滴功能的分子机制尚未完全理解	全面概述脂滴的组装和功能，并探讨合成脂滴模型在未来的实际应用中的作用和挑战	脂滴及其在代谢疾病中的作用	合成生物学	代谢疾病	NA	NA	NA	NA
20	2024-08-07	Mammalian Genomic Manipulation with Orthogonal Bxb1 DNA Recombinase Sites for the Functional Characterization of Protein Variants 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00355 PMID:37922210	研究论文	本文利用两个正交的Bxb1重组酶位点，通过设计带有辅助重组位点的质粒，实现了在同一细胞中避免不希望的细菌DNA元件整合，并创建了同时携带两个正交Bxb1重组酶位点的细胞，用于复杂的细胞遗传学分析。	本文首次利用两个正交的Bxb1重组酶位点，实现了在同一细胞中进行复杂的遗传操作，包括实时监测细胞内钙信号动力学和识别蛋白质相互作用。	NA	利用正交Bxb1重组酶位点进行哺乳动物基因组操作，以功能性表征蛋白质变体。	哺乳动物细胞中的基因组操作和蛋白质变体的功能表征。	基因工程	NA	Bxb1重组酶	NA	基因组数据	NA