合成生物学相关文章
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当前共找到 52 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Illuminating protein space with a programmable generative model
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06728-8
PMID:37968394
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研究论文 | 介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于直接采样新颖的蛋白质结构和序列 | 开发了尊重聚合物系综构象统计的扩散过程、支持长程推理的亚二次缩放神经架构、从残基间几何合成三维结构的层，以及扩散模型的低温采样算法 | NA | 探索蛋白质空间的潜力，通过生成模型加速蛋白质设计 | 蛋白质分子和蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 扩散模型，生成模型 | 生成模型，扩散模型 | 蛋白质结构，蛋白质序列 | 310个蛋白质的实验表征，其中两个设计蛋白质的晶体结构解析 | NA | NA | NA | 医学，材料科学，合成生物学 |
| 2 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology for advancing RNA therapeutics and vaccine design
2023-11-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00323-3
PMID:38036580
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综述 | 探讨合成生物学如何通过优化抗原设计、治疗构建体、治疗活性和递送载体来增强RNA疫苗和疗法的功能与疗效 | 系统阐述合成生物学工具在优化RNA疫苗抗原设计、治疗构建体、活性调控及递送载体方面的创新应用 | NA | 推动RNA疗法和疫苗设计的创新发展 | RNA疫苗和治疗方法 | 合成生物学 | 传染病（以COVID-19为例） | mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 3 | 2025-10-05 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
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研究论文 | 本研究通过设计合成B细胞特异性启动子并结合深度学习模型，解析免疫球蛋白基因转录调控机制 | 首次大规模设计合成23,640个B细胞特异性启动子，并构建能直接从序列预测转录强度的深度学习模型 | NA | 解析B细胞特异性转录调控机制并开发合成启动子工具 | B细胞特异性启动子和免疫球蛋白V基因启动子 | 合成生物学 | NA | MPRA（大规模平行报告基因检测）, 深度学习 | 深度学习模型 | DNA序列数据 | 23,640个合成B细胞特异性启动子 | 合成生物学方法 | B细胞 | B细胞特异性启动子设计 | 医学, 生物技术 |
| 4 | 2025-10-05 |
Design of a sorbitol-activated nitrogen metabolism-dependent regulatory system for redirection of carbon metabolism flow in Bacillus licheniformis
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad859
PMID:37850640
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研究论文 | 开发了一种基于氮代谢的合成调控系统，用于重定向地衣芽孢杆菌中的碳代谢流 | 首次利用氮代谢信号构建调控系统，通过改造GlnR转录因子和添加山梨醇响应元件实现碳代谢流重定向 | NA | 开发基于氮代谢的合成调控工具以改善微生物细胞工厂性能 | 地衣芽孢杆菌的碳氮代谢调控 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录因子工程 | NA | NA | NA | 转录因子工程 | 地衣芽孢杆菌 | 山梨醇激活的氮代谢依赖型调控系统，包含工程化GlnR转录因子和山梨醇响应元件 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-10-05 |
Establishing a versatile toolkit of flux enhanced strains and cell extracts for pathway prototyping
2023-11, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.10.008
PMID:37890611
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研究论文 | 本研究开发了一套代谢通量增强的工程菌株和细胞提取物工具包，用于加速生物合成路径的原型构建 | 首次通过CRISPR-dCas9技术构建了多种代谢通量增强的工程菌株，并创建了相应的细胞提取物工具包用于体外路径原型构建 | 不同生物合成路径与代谢网络的相互作用存在差异，工具包的普适性需要进一步验证 | 开发用于生物合成路径快速原型构建的通用工具平台 | 大肠杆菌和酿酒酵母工程菌株及其细胞提取物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9, 代谢工程, 代谢组学分析 | NA | 代谢物数据, 酶活性数据 | 多种工程菌株（针对6种关键代谢前体物）及其细胞提取物 | CRISPR-dCas9 | Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae | 代谢通量重布线，针对乙酰辅酶A、莽草酸、磷酸三糖、草酰乙酸、α-酮戊二酸和葡萄糖-6-磷酸等关键代谢前体物 | 能源, 材料, 医药, 工业生物技术 |
| 6 | 2025-10-05 |
Toward the clinical development of synthetic immunity to cancer
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13245
PMID:37491719
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综述 | 本文提出合成生物学工具在癌症免疫治疗中的应用原则，并概述当前合成生物学细胞疗法设计的现状 | 提出五项指导下一代细胞疗法设计的工程原则，旨在提高临床转化成功率 | NA | 提高合成生物学细胞疗法在癌症治疗中的临床转化成功率 | 合成生物学细胞疗法，特别是嵌合抗原受体(CAR)等免疫细胞工程 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具，嵌合抗原受体(CAR) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 免疫细胞，哺乳动物细胞 | 嵌合抗原受体，免疫细胞工程，生物传感器 | 医学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Bacterial Expression of Promelittin for Safe and Effective Tumor Therapy
2023-Nov-08, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c11457
PMID:37897422
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研究论文 | 本研究构建了基于特洛伊木马策略的细菌表达前蜂毒肽系统，用于安全有效的肿瘤治疗 | 通过融合蛋白限制蜂毒肽毒性，利用基质金属蛋白酶激活前蜂毒肽，并通过膜裂解机制诱导肿瘤细胞死亡 | NA | 开发基于细菌的协同肿瘤治疗方法 | CT26荷瘤小鼠模型中的原始肿瘤 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因技术 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | 前蜂毒肽表达系统，基于特洛伊木马策略的合成生物电路 | 医学 |
| 8 | 2025-10-05 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本研究开发了INSPIRE-seq方法，利用纳米抗体库和二代测序技术从肿瘤微环境中筛选免疫细胞结合纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq这一无偏倚方法，能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | NA | 开发用于发现治疗性生物制剂靶向分子的技术 | 肿瘤微环境中的免疫细胞（树突状细胞等） | 合成生物学 | 肿瘤 | 二代测序，单细胞RNA测序，免疫荧光，结构建模与对接研究 | NA | 测序数据，图像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
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研究论文 | 开发了一种基于simeprevir药物的可诱导分子开关系统，用于控制细胞和基因治疗 | 首次利用已获批口服药物simeprevir及其靶点HCV NS3/4A蛋白酶构建化学诱导二聚化系统 | NA | 开发适用于临床环境的分子开关系统以控制细胞和基因治疗 | 化学诱导二聚化模块、肿瘤细胞、异种移植小鼠模型 | 合成生物学 | 癌症 | 化学诱导二聚化技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 分子开关、基因表达控制系统、细胞凋亡诱导系统 | 医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 本研究通过计算技术和合成生物学方法复活了靶向脂质II的糖肽类抗生素的祖先分子，揭示了其进化历程 | 结合计算预测与合成生物学技术首次复活了糖肽类抗生素的祖先分子，揭示了该类抗生素的进化路径 | NA | 理解自然界如何围绕共同作用机制进化抗生素，特别是靶向脂质II的糖肽类抗生素 | 糖肽类抗生素（以替考拉宁和万古霉素为代表）及其祖先分子paleomycin | 合成生物学 | 细菌感染 | 计算技术，合成生物学技术，非核糖体肽合成酶分析 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医药 |
| 11 | 2025-10-05 |
Advancement of Engineered Bacteria for Orally Delivered Therapeutics
2023-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202302702
PMID:37537714
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综述 | 本文系统综述了口服工程化细菌治疗剂的当前进展、工程策略及疾病治疗应用 | 结合合成生物学和纳米技术对细菌及其生物组分进行工程化改造，实现胃肠道内的定向基因重编程和精确时空控制 | NA | 开发下一代口服细菌疗法 | 工程化细菌及其生物组分 | 合成生物学 | NA | 基因重编程、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 治疗用细菌 | 定向基因重编程系统、精确时空控制系统 | 医药 |
| 12 | 2025-10-05 |
Next-generation chimeric antigen receptors for T- and natural killer-cell therapies against cancer
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13255
PMID:37548050
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综述 | 本文综述了新一代嵌合抗原受体在T细胞和自然杀伤细胞癌症治疗中的应用进展 | 利用合成生物学和基因工程重编程免疫效应细胞，增强对肿瘤的选择性，减轻靶向非肿瘤不良反应 | NA | 改善CAR对肿瘤细胞的选择性，推动基于NK细胞的治疗策略临床转化 | 嵌合抗原受体T细胞和自然杀伤细胞 | NA | 癌症 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞、自然杀伤细胞 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
A synthetic biology approach to engineering circuits in immune cells
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13244
PMID:37464881
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在免疫细胞工程中的应用，重点讨论了合成受体回路在癌症免疫治疗中的策略与应用 | 探讨了用于抗原密度感知的T细胞回路、控制T细胞分化的合成回路设计以及利用细胞通信和分工的合成多细胞回路概念 | NA | 增强免疫细胞功能以改善癌症免疫治疗 | 免疫细胞（特别是T细胞）中的合成生物学回路 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组工程、蛋白质工程、细胞工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成受体回路、抗原密度感知回路、逻辑门回路、合成多细胞回路 | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Eras of designer Tregs: Harnessing synthetic biology for immune suppression
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13254
PMID:37522861
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综述 | 本文回顾了设计性调节性T细胞的发展历程，重点介绍了通过合成生物学技术增强Tregs免疫抑制功能的三个发展阶段 | 首次将设计性Tregs的发展划分为三个时代：FOXP3工程时代、抗原特异性时代和先进基因组编辑时代，并系统总结了各阶段的技术突破 | NA | 探讨如何利用合成生物学技术改进调节性T细胞的治疗效果 | CD4 CD25 FOXP3调节性T细胞及其工程化改造 | 合成生物学 | 自身免疫性疾病 | 基因工程、转基因T细胞受体、嵌合抗原受体、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 免疫调节回路、抗原特异性识别回路 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Engineering the IL-4/IL-13 axis for targeted immune modulation
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13230
PMID:37283511
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综述 | 本文综述了通过分子工程和合成生物学方法调控IL-4/IL-13轴以开发新型免疫疗法的研究进展 | 系统总结了利用细胞因子工程、融合蛋白构建、拮抗剂开发、细胞工程和生物传感器设计等多种新兴生物工程工具调控IL-4/IL-13轴的新策略 | NA | 探讨通过工程化方法调控IL-4/IL-13轴以开发靶向免疫调节疗法 | 白细胞介素-4（IL-4）和IL-13细胞因子及其信号通路 | 合成生物学 | 过敏性疾病,自身免疫疾病,癌症 | 分子工程,合成生物学 | NA | NA | NA | 细胞因子工程,融合蛋白技术,拮抗剂开发,细胞工程,生物传感器设计 | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2024-10-15 |
Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering
2023-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02251-7
PMID:38031061
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研究论文 | 本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术，在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰，以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 通过计算机设计算法和湿实验筛选，成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量 | NA | 通过系统生物学和合成生物学工具，设计高效的微生物细胞工厂，以合成高价值产品 | 工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 代谢工程 | NA | 基于约束的重建与分析（COBRA）方法 | NA | 基因组数据 | 17种基因组修饰，包括9个基因敲除和8个基因过表达 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-15 |
Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438
PMID:38020966
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研究论文 | 本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用 | 本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展，特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台，开启了定制生物学的新时代 | 尽管取得了显著进展，但仍存在一些障碍，限制了工程真核细胞的更广泛应用 | 探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力 | 酵母作为真核生物的研究和工业用途 | 生物技术 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-10-15 |
Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437
PMID:38020969
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研究论文 | 本文描述了在合成酵母染色体VIII中，通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置，研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性 | 发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性，而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性 | NA | 研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性 | 酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能 | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-10-14 |
Module-Based Polyketide Synthase Engineering for de Novo Polyketide Biosynthesis
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00282
PMID:37871264
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研究论文 | 本文探讨了基于模块的聚酮合酶工程在从头合成聚酮化合物中的应用 | 提出了新的模块边界设计原则，并利用最新的结构建模和合成生物学工具加速聚酮合酶工程 | 目前仍处于研究初期，基于现有工程努力的设计原则的普遍性尚不明确 | 探索聚酮合酶工程的新方法，以提高从头合成聚酮化合物的效率 | 聚酮合酶的模块边界和功能 | 合成生物学 | NA | 结构建模和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Navigating the Frontier of Synthetic Biology: An AI-Driven Analytics Platform for Exploring Research Trends and Relationships
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00192
PMID:37648657
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研究论文 | 本研究利用主题建模技术全面映射合成生物学领域的研究主题，揭示子主题及其关系和时间趋势 | 本研究通过分析合成生物学的文献，揭示了研究主题的子领域和它们之间的关系，以及时间趋势 | NA | 旨在深入理解合成生物学并为其分析提供基础 | 合成生物学的研究主题、子主题及其关系和时间趋势 | 合成生物学 | NA | 主题建模 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |