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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Evaluation of Reference Genes for Normalizing RT-qPCR and Analysis of the Expression Patterns of WRKY1 Transcription Factor and Rhynchophylline Biosynthesis-Related Genes in Uncaria rhynchophylla
2023-Nov-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216330
PMID:38003520
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研究论文 | 评估用于归一化RT-qPCR的参考基因,并分析钩藤中WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因的表达模式 | 首次报道了钩藤中参考基因的稳定性,并为未来的基因表达分析提供了重要基础 | NA | 选择和评估适用于基因表达分析的适当参考基因,特别是涉及钩藤中生物碱生物合成途径的转录因子和关键酶基因 | 钩藤中的参考基因、WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 14个关键生物碱酶基因和一个转录因子基因在三种实验压力处理下的表达 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Use of an on/off tetracycline riboswitch to control protein production in Komagataella phaffii
2023-Nov-21, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-023-01637-5
PMID:37989852
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研究论文 | 本研究利用四环素激活的RNA适配体在翻译水平上调控Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 首次在Komagataella phaffii中使用四环素激活的RNA适配体精确控制基因表达 | NA | 开发新的遗传工具以精确控制Komagataella phaffii中的基因表达 | Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 合成生物学 | NA | RNA适配体 | NA | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Developing the Limosilactobacillus reuteri Chassis through an Endogenous Programmable Endonuclease-Based Genome Editing Tool
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00450
PMID:37934952
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研究论文 | 本研究开发了一种基于内源性可编程核酸内切酶的基因组编辑工具,用于改进Limosilactobacillus reuteri作为活体生物治疗产品的底盘 | 研究中发现了Limosilactobacillus reuteri中的一种亚型II-A CRISPR-Cas9系统,并对其进行了重新编程,实现了高效的基因删除、点突变、大片段删除和基因整合 | NA | 开发基于内源性核酸内切酶的新型益生菌底盘,为其他微生物的功能基因研究提供基因组编辑工具 | Limosilactobacillus reuteri及其内源性核酸内切酶 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9系统 | CRISPR-Cas9 | 基因组数据 | 304株Limosilactobacillus reuteri菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Physical Laboratory Automation in Synthetic Biology
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00345
PMID:37935025
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综述 | 本文综述了合成生物学中实验工作流程的物理自动化现状,并分类了自动化状态 | 强调了智能硬件和软件工具在自动化实验关键元素方面的显著进展 | 缺乏DBTL模块间的连接以及访问和采用的障碍仍然是实现实验室自动化全部潜力的重大挑战 | 探讨合成生物学中实验自动化的现状及未来发展方向 | 合成生物学中的实验自动化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Rational design of microRNA-responsive switch for programmable translational control in mammalian cells
2023-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43065-w
PMID:37938567
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研究论文 | 本文设计了一种可编程的miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES)翻译激活与抑制(PROMITAR)平台,用于在单一RNA构建体中实现基于miRNA的翻译上调和下调。 | 开发了一种新的PROMITAR平台,能够在单一RNA构建体中实现miRNA介导的翻译调控,并展示了其在构建逻辑门和细胞类型分类器circRNAs中的应用。 | NA | 设计并验证一种新的RNA合成生物学工具,用于未来的生物医学应用。 | 哺乳动物细胞中的可编程翻译控制策略。 | RNA合成生物学 | NA | miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Synthesizing biomaterials in living organisms
2023-Nov-27, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d2cs00999d
PMID:37921625
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综述 | 本文综述了在活体生物中合成生物材料的方法和应用 | 通过精心设计的人工构建块或前体,在活体生物中自组装或聚合成功能性生物材料 | NA | 探讨生物大分子形成机制,并探索合成生物材料的方法 | 生物大分子如DNA、RNA和蛋白质的合成机制及合成生物材料的应用 | 生物化学 | NA | 自组装、聚合 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Investigating and Modeling the Factors That Affect Genetic Circuit Performance
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00151
PMID:37916512
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研究论文 | 研究影响遗传电路性能的因素,并通过实验和建模评估这些因素的影响 | 提出在设计-构建-测试-学习工作流程中引入更广泛的测试步骤,以包括可能影响遗传电路性能的因素 | 目前缺乏在未测试条件下生成模型预测的方法 | 探索遗传电路在实验室外环境中的性能变化,并提出改进方法 | 遗传电路在不同温度、诱导物浓度、非无菌土壤暴露和细菌生长阶段的表现 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 多种条件下的遗传电路测试 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Deciphering triterpenoid saponin biosynthesis by leveraging transcriptome response to methyl jasmonate elicitation in Saponaria vaccaria
2023-11-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42877-0
PMID:37925486
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研究论文 | 本研究利用甲基茉莉酸(MeJA)诱导的转录组响应,解析了Saponaria vaccaria中三萜皂苷的生物合成途径 | 首次鉴定了S. vaccaria中催化三萜类化合物氧化和糖基化的多种酶,并揭示了UDP-D-岩藻糖的生物合成途径 | NA | 解析三萜皂苷的生物合成途径,并探索其在合成生物学中的应用 | Saponaria vaccaria中的三萜皂苷生物合成 | 生物技术 | NA | Pacbio全长转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
First Natural Yeast Strain Trichosporon asahii HZ10 with Robust Flavonoid Productivity and Its Potential Biosynthetic Pathway
2023-Nov-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c05188
PMID:37909088
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研究论文 | 本文报道了一种从原始蜂巢中分离出的天然酵母菌株HZ10,能够高效生产黄酮类化合物,并探索了其潜在的生物合成途径 | HZ10是全球首个能够生产黄酮类化合物的天然酵母菌株,其黄酮类化合物代谢谱广泛,且具有良好的抗氧化活性 | NA | 探索和丰富天然黄酮类化合物的生物合成途径,并推动微生物生产黄酮类化合物的合成生物学策略 | 天然酵母菌株HZ10及其黄酮类化合物的生物合成途径 | NA | NA | 基因组挖掘和转录组分析 | NA | 基因组和转录组数据 | 单一酵母菌株HZ10 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Genetically engineered bacteria: a new frontier in targeted drug delivery
2023-11-01, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d3tb01805a
PMID:37873584
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综述 | 本文综述了基因工程细菌(GEB)在靶向药物递送和癌症治疗中的应用,探讨了其优势、挑战及未来发展方向 | 基因工程细菌具有增强的靶向性、多功能性、生物膜破坏能力、减少药物抗性、自我放大能力和生物可降解性,为靶向药物递送和癌症治疗提供了新的方法 | 基因工程细菌的安全性和可控性是需要解决的关键挑战 | 探讨基因工程细菌在靶向药物递送和癌症治疗中的应用及未来发展 | 基因工程细菌及其在药物递送和癌症治疗中的应用 | 生物医学工程 | 癌症 | 基因工程、合成生物学工具(如CRISPR)、生物信息学驱动设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Complete sequence of the genome-reduced Escherichia coli DGF-298
2023-Nov-16, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00665-23
PMID:37843363
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研究论文 | 报道了DGF-298菌株的完整基因组序列及其注释,该菌株具有系统生物学和合成生物学的研究价值 | 提供了DGF-298菌株的完整基因组序列和详细注释 | NA | 研究DGF-298菌株的基因组特性 | DGF-298菌株的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一个样本,DGF-298菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Selective RNA Processing and Stabilization are Multi-Layer and Stoichiometric Regulators of Gene Expression in Escherichia coli
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301459
PMID:37845007
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研究论文 | 本研究首次在单核苷酸分辨率下,对大肠杆菌中与选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关的酶进行了全基因组目标组分析 | 发现了RNA焦磷酸水解酶加工比率与初级转录本前三核苷酸得分之间的严格线性关系,并验证了SRPS元件的有效性 | NA | 探讨SRPS相关酶的协同作用如何影响大肠杆菌中基因表达的化学计量调控 | 大肠杆菌中的选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关酶及其对基因表达的影响 | 分子生物学 | NA | 全基因组目标组分析 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |