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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
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综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞治疗方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 探讨了合成生物学在基因工程改造细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎方面的应用前景 | NA | 总结当前软骨缺损再生的细胞治疗方法并探讨其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨、软骨缺损、骨关节炎 | 再生医学 | 骨关节炎 | 细胞治疗、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2025-10-05 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组学方法开发了假单胞菌属特异性的单链DNA退火蛋白,用于改善和扩展该菌属的重组工程能力 | 采用计算生物学工作流程生成属特异性SSAPs库,并通过高通量筛选发现比现有工具更高效的变体,首次在Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens中实现重组工程 | 仅在四种假单胞菌物种中进行了测试,尚未验证在其他假单胞菌物种中的适用性 | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力,扩展其代谢工程应用 | 假单胞菌属细菌,包括Pseudomonas putida、Pseudomonas aeruginosa、Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、计算生物学、Oxford Nanopore NGS、高通量筛选 | NA | 基因组数据、测序数据 | 四种假单胞菌物种 | 单链DNA退火蛋白(SSAPs)、重组工程 | Pseudomonas putida, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas taiwanensis, Pseudomonas fluorescens | NA | 工业生物技术, 环境生物技术 |
| 3 | 2025-10-05 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
|
综述 | 本文综述了受进化观察启发的三个合成生物学领域:基于细胞的生物分子进化组合方法、建立微生物群落的工程互依赖性以及合成免疫学 | 系统梳理了进化观察如何为合成生物学设计提供灵感,并聚焦于三个具体研究方向的进化前提 | 仅涵盖了进化启发合成生物学应用的部分案例,未穷尽所有相关领域 | 探讨进化观察如何启发和塑造合成生物学与生物技术 | 合成生物学中受进化启发的技术平台和应用 | 合成生物学 | NA | 遗传电路构建、合成翻译系统、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞、微生物群落 | 遗传电路、合成翻译系统、代谢途径 | 生物技术 |
| 4 | 2025-10-05 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-12-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
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综述 | 本文综述了2011-2022年间通过合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物的研究进展 | 系统总结了酵母工程化生产萜类化合物的四个关键方向:宿主代谢调控、代谢途径重构、酶催化特性改造以及生产定位策略 | NA | 通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产萜类化合物 | 酵母工程化及植物萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 代谢途径重构、酶催化系统改造、亚细胞区室化 | 工业生物技术, 医药 |
| 5 | 2025-10-05 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
|
综述 | 本文综述了嵌合抗原受体T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用、挑战及临床进展 | 系统总结了合成生物学和细胞工程新技术在实体瘤CAR-T疗法中的应用前景 | NA | 探讨CAR-T疗法在实体瘤治疗中的临床应用现状与发展方向 | 实体瘤患者及CAR-T细胞疗法 | NA | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-12-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
|
研究论文 | 通过访谈澳大利亚合成生物学中心的科学家,探讨合成生物学领域的伦理问题和实践挑战 | 首次通过实证访谈揭示合成生物学家实际面临的日常伦理问题,与文献中推测性伦理讨论形成鲜明对比 | 研究仅局限于澳大利亚一个合成生物学中心的科学家,样本代表性有限 | 理解合成生物学领域的实际伦理挑战及其与伦理文献讨论的差异 | 澳大利亚合成生物学中心的在职合成生物学家 | NA | NA | 定性访谈研究 | NA | 访谈文本数据 | 澳大利亚合成生物学中心的科学家群体 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-10-05 |
An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43272-5
PMID:38052788
|
研究论文 | 提出一种基于无机矿物共凝聚液滴的辐射耐受原始细胞模型 | 首次构建具有辐射耐受性的分区化原始细胞模型,利用非酶抗氧化系统实现辐射防护 | 尚未验证在真实远古地球环境中的长期适应性 | 研究原始细胞在极端前生物辐射条件下的生存适应性 | 基于多聚磷酸盐-锰和聚磷酸盐-三肽的共凝聚液滴系统 | 合成生物学 | NA | 共凝聚液滴组装技术 | 原始细胞模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | 分区化原始细胞结构,包含辐射保护外层和核样凝聚物内层 | 合成生物学, 药物递送系统 |
| 8 | 2025-10-05 |
Redox-enabled electronic interrogation and feedback control of hierarchical and networked biological systems
2023-12-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44223-w
PMID:38129428
|
研究论文 | 通过工程化生物系统的天然氧化还原网络,实现了从蛋白质到细胞群体的多层级电子 interrogation 和反馈控制 | 开发了基于氧化还原反应的电子-生物接口技术,实现了无线实时通信和用户控制的生物系统编程 | NA | 建立电子设备与生物系统之间的直接通信和控制方法 | 蛋白质(辣根过氧化物酶)、大肠杆菌细胞、细胞群体 | 合成生物学 | NA | 电生物制造、氧化还原数据传递、合成生物学、eCRISPR | NA | 电化学信号、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 大肠杆菌 | 氧化还原引导的生物传感器、电子遗传控制回路、群体感应切换系统 | 生物技术, 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Customizing cellular signal processing by synthetic multi-level regulatory circuits
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44256-1
PMID:38110405
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成多级调控电路定制细胞信号处理的方法 | 提出了整合转录和翻译控制的多级电路设计新范式,可显著增强遗传电路的复杂性和功能性 | NA | 通过合成生物学方法定制细胞信号处理电路以满足实际需求 | 合成多级调控电路和细胞信号处理系统 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 整合转录控制和翻译控制的多级混合电路,包括基础电路动力学修改和实际应用促进 | 合成生物学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Detection of viral RNAs at ambient temperature via reporter proteins produced through the target-splinted ligation of DNA probes
2023-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01028-y
PMID:37142844
|
研究论文 | 开发了一种无需仪器的核酸检测方法INSPECTR,可在环境温度下通过报告蛋白实现病毒RNA的准确多重检测 | 利用目标特异性DNA探针连接生成表达盒,通过无细胞合成报告蛋白实现核酸检测,无需温控设备 | NA | 开发适用于即时检测环境的核酸检测技术 | 呼吸道病毒RNA | 合成生物学 | 呼吸道病毒感染 | 目标引导DNA探针连接、无细胞蛋白合成、滚环扩增 | NA | 核酸序列 | 5种呼吸道病毒目标 | NA | 无细胞系统 | 表达盒设计用于报告蛋白合成,包括酶报告蛋白和肽报告蛋白 | 医学诊断 |
| 11 | 2025-10-05 |
Advances in ligand-specific biosensing for structurally similar molecules
2023-12-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.10.009
PMID:38128482
|
综述 | 本文总结了针对结构相似分子的高特异性生物传感器系统的最新进展及其关键应用 | 聚焦于通过合成生物学策略增强遗传编码生物传感器的分子特异性,涵盖理性设计原则、高通量筛选技术和计算机辅助评估方法 | NA | 开发能够特异性识别结构相似分子的生物传感器系统 | 蛋白质、核酸和遗传编码生物传感器 | 合成生物学 | NA | 理性设计、高通量筛选、计算机辅助预测 | NA | NA | NA | NA | NA | 配体特异性生物传感器 | 医学, 环境 |
| 12 | 2025-10-05 |
Molecular switches in plant stress adaptation
2023-Dec-18, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09051-7
PMID:38108912
|
综述 | 本文综述了植物通过分子开关适应生物和非生物胁迫的调控机制及其在作物改良中的应用 | 揭示了单个分子开关可调控多个胁迫网络、多个开关可共同调控单一胁迫条件的新机制 | NA | 探讨植物分子开关在胁迫适应中的调控机制及其在作物改良中的应用前景 | 拟南芥等不同植物物种中的分子开关 | 植物分子生物学 | NA | 基因组学、生物技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 拟南芥, 作物植物 | 分子开关网络、胁迫诱导通路 | 农业 |
| 13 | 2025-10-06 |
A cell-free strategy for host-specific profiling of intracellular antibiotic sensitivity and resistance
2023-Dec-18, npj antimicrobials and resistance
DOI:10.1038/s44259-023-00018-z
PMID:39843793
|
研究论文 | 开发了一种基于肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,用于分析抗生素敏感性和耐药性 | 首次建立了肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,能够进行宿主特异性抗生素敏感性分析 | 初始提取物处理需要生物安全二级实验室,但后续可在生物安全一级实验室进行 | 开发宿主特异性工具研究抗生素敏感性和耐药性 | 肺炎克雷伯菌实验室和临床分离株 | 合成生物学 | 传染病 | 无细胞基因表达(CFE)、蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据、抗生素敏感性数据 | 实验室和临床分离的肺炎克雷伯菌株 | 无细胞基因表达系统 | 肺炎克雷伯菌, 大肠杆菌MG1655 | 抗生素敏感性分析生物传感器 | 医学 |
| 14 | 2024-12-17 |
Synthetic Biology Toolbox for Nitrogen-Fixing Soil Microbes
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00414
PMID:37988619
|
研究论文 | 本文验证了在三种固氮土壤细菌中合成生物学工具箱的有效性 | 开发了适用于非模式微生物的合成生物学工具箱,并成功应用于固氮土壤细菌中,实现了基因编辑和异源基因的表达 | 研究仅限于三种固氮土壤细菌,尚未广泛应用于其他微生物 | 开发和验证适用于非模式微生物的合成生物学工具箱,以增强农业作物的性能 | 三种固氮土壤细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 三种固氮土壤细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-11-22 |
Standardization of Fluorescent Reporter Assays in Synthetic Biology across the Visible Light Spectrum
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00386
PMID:37981737
|
研究论文 | 本文介绍了一种标准化荧光报告基因检测方法,用于合成生物学中可见光谱范围内的荧光报告基因 | 提出了一个简单且易于访问的校准方法,将设备特定的输出转换为标准化的输出,表达每孔的荧光量作为已知等效荧光染料浓度每细胞 | 仅限于可见光谱范围内的荧光报告基因 | 提高不同实验室间板读取器实验结果的可比性和可交换性 | 荧光报告基因的表达水平 | 合成生物学 | NA | 荧光报告基因检测 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-11-17 |
Engineering Nannochloropsis oceanica for the production of diterpenoid compounds
2023-Dec, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12097
PMID:38818264
|
研究论文 | 本文研究了如何通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产二萜化合物 | 首次展示了通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica生产二萜化合物casbene,并通过异源过表达和叶绿体定位上游限速酶进一步提高产量 | NA | 研究如何通过基因工程提高Nannochloropsis oceanica生产二萜化合物的能力 | Nannochloropsis oceanica及其二萜化合物casbene的生产 | NA | NA | 基因工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-11-17 |
High-throughput, microscopy-based screening and quantification of genetic elements
2023-Dec, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12096
PMID:38818273
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研究论文 | 本文介绍了一种高通量显微镜平台,用于筛选和量化遗传元件 | 开发了一种高通量显微镜平台,能够同时处理8×12孔琼脂糖垫板,筛选96种独立菌株或实验条件 | NA | 加速遗传元件的鉴定和表征,理解细胞表型与内部状态之间的关系 | 天然内源性启动子库中的遗传元件 | 合成生物学 | NA | 显微镜 | NA | 图像 | 96种独立菌株或实验条件 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-10-21 |
Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572113
PMID:38187604
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研究论文 | 本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置,能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作 | 开发了一种可编程的分子系统,能够整合多个细胞表面特征,将目标输入转换为用户定义的输出 | NA | 探索细胞表面特征的差异,开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞 | 细胞表面特征和蛋白质装置 | 合成生物学 | NA | 邻近门控蛋白剪接 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-10-20 |
Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution
2023-Dec-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1
PMID:38196584
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研究论文 | 本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法,用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表 | 提出了一种新的酶辅助测序方法(ESEGA),相比之前的测序方法,具有更高的转录效率和保真度 | NA | 开发一种新的测序工具,用于测序通过人工扩展遗传信息系统(AEGIS)创建的分子 | 通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子 | 生物技术 | NA | 酶辅助测序 | NA | DNA序列 | 涉及三种任务的实验,包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-10-19 |
LcSAO1, an Unconventional DOXB Clade 2OGD Enzyme from Ligusticum chuanxiong Catalyzes the Biosynthesis of Plant-Derived Natural Medicine Butylphthalide
2023-Dec-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417417
PMID:38139246
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研究论文 | 研究了川芎中一种非传统的DOXB Clade 2OGD酶LcSAO1在植物源天然药物丁苯酞生物合成中的作用 | 发现了LcSAO1酶在丁苯酞生物合成中的关键作用,并通过结构建模和定点突变揭示了其活性位点 | 研究主要集中在酶的鉴定和功能验证,未涉及完整的生物合成途径 | 揭示丁苯酞生物合成途径中的关键酶及其作用机制 | 川芎中的LcSAO1酶及其在丁苯酞生物合成中的作用 | 生物化学 | 中风 | 2-OGD酶分析 | NA | 转录组数据 | 多个川芎组织样本 | NA | NA | NA | NA |