合成生物学相关文章
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当前共找到 76 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-23 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-12-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 本研究通过过表达PtRWA-C基因，揭示了其在杨树木质生物质中增加木聚糖乙酰化、木质素含量和S/G比例，从而降低糖化效率的作用，并发现其受HRD转录因子调控 | 首次在杨树中证明PtRWA-C过表达对木聚糖乙酰化和生物质抗降解性的影响，并识别HRD作为其直接调控因子 | 未涉及PtRWA-C在其他植物物种中的功能验证或大规模田间试验 | 探究PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的功能及调控机制 | 毛果杨（Populus trichocarpa）的PtRWA-C基因及其对次级细胞壁特性的影响 | 合成生物学 | NA | 基因共表达网络分析、表达数量性状位点（eQTL）分析、启动子结合实验 | NA | 基因表达数据、生物化学分析数据 | 未明确指定样本数量，但基于杨树转基因材料 | 基因过表达 | 毛果杨（Populus trichocarpa） | NA | 能源、工业生物技术 |
| 2 | 2025-12-16 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-12-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 比较五种噬菌体衍生重组酶在三种生物技术相关假单胞菌株中的重组效率，以开发高效遗传操作工具 | 首次在三种假单胞菌株中系统测试并比较多种噬菌体衍生重组酶的重组效率，为假单胞菌属提供快速、高效的靶向突变方法 | 研究仅针对三种假单胞菌株，可能无法代表整个假单胞菌属的多样性，且未在其他非模式细菌中验证策略的普适性 | 开发适用于假单胞菌属的高效遗传操作工具，以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学等领域的应用 | 三种生物技术相关假单胞菌株：P. putida KT2440、P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 噬菌体衍生重组酶介导的重组工程 | NA | NA | 三种假单胞菌株 | 噬菌体衍生重组酶 | Pseudomonas putida KT2440, Pseudomonas protegens Pf-5, Pseudomonas protegens CHA0 | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 3 | 2025-12-09 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-12-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
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研究论文 | 本文报道了合成酵母染色体synIV的从头合成，并探索了其三维结构对基因调控的影响 | 开发了megachunk组装结合分层整合策略，首次合成最大的真核染色体，并通过操纵三维结构实现染色体范围的转录调控 | 研究发现酵母核质内定位对基因调控作用较小，可能限制了空间调控的应用范围 | 探索合成基因组能否支持生命活动，并研究三维结构在基因调控中的作用 | 合成的酵母染色体synIV | 合成生物学 | NA | megachunk组装、分层整合策略、loxPsym位点锚定 | NA | 基因组序列数据、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酵母 | 通过loxPsym位点将染色体锚定至核内膜，实现转录抑制的合成生物电路 | 工业生物技术 |
| 4 | 2025-11-15 |
A unified approach to dissecting biphasic responses in cell signaling
2023-12-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86520
PMID:38054655
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研究论文 | 本文提供了一个统一的理论框架来分析细胞信号系统中的双相响应现象 | 通过分析从基础生化构件到典型网络结构再到特征明确的实例，建立了双相响应的统一理论框架，并揭示了其设计原则和结构限制因素 | 主要基于理论分析和计算模型，需要实验验证来证实理论预测 | 研究细胞信号系统中双相响应的机制和设计原理 | 细胞信号系统和转录后修饰系统 | 系统生物学 | NA | 分析和计算方法 | NA | 理论模型和计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 系统生物学和合成生物学 |
| 5 | 2025-11-15 |
Soil microbiome engineering for sustainability in a changing environment
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01932-3
PMID:37903921
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综述 | 探讨利用自然和合成土壤微生物群落促进植物生长，以应对环境变化对土壤生态系统的破坏 | 整合微生物生态学和合成生物学技术，开发针对特定应用的微生物产品，实现土壤微生物组的定向工程化 | NA | 通过土壤微生物组工程推动可持续农业发展，缓解环境破坏 | 土壤微生物群落及其在土壤生态系统中的功能 | 合成生物学 | NA | 基因工程方法、微生物群落组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 土壤微生物 | 微生物群落组装、功能模块设计 | 农业, 环境 |
| 6 | 2025-11-15 |
Engineered bacterial orthogonal DNA replication system for continuous evolution
2023-12, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01387-2
PMID:37443393
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研究论文 | 开发了一种基于细菌的正交DNA复制系统BacORep，用于在原核细胞中实现连续进化 | 首次在细菌中建立了正交DNA复制系统，通过改造温和噬菌体GIL16的复制机制和易错正交DNA聚合酶实现高效定向进化 | 目前仅在芽孢杆菌中验证，尚未在其他细菌中广泛测试 | 开发适用于细菌的连续进化平台 | 芽孢杆菌正交DNA复制系统 | 合成生物学 | NA | DNA复制工程、连续进化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | 噬菌体GIL16复制机制、正交DNA聚合酶工程 | Bacillus thuringiensis, Bacillus subtilis, Escherichia coli | 正交DNA复制系统、易错DNA复制机制 | 工业生物技术 |
| 7 | 2025-11-15 |
Widespread biosynthesis of 16-carbon terpenoids in bacteria
2023-12, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01445-9
PMID:37828399
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘和合成生物学平台揭示了细菌中广泛存在16碳萜类化合物的生物合成途径 | 首次系统发现并证实细菌中存在大量非经典的16碳萜类化合物，突破了传统萜类化合物均为5碳倍数的认知 | 仅对部分生物合成基因簇进行了功能验证，尚未对所有预测的700多个基因簇进行完整表征 | 探究细菌中16碳萜类化合物的分布情况和生物合成机制 | 细菌基因组和其中编码的萜类合成酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、酵母合成生物学平台、化学结构分析 | NA | 基因组数据、代谢物化学结构数据 | 700多个已测序细菌基因组 | 酵母合成生物学平台 | 酵母 | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
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综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞治疗方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 探讨了合成生物学在基因工程改造细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎方面的应用前景 | NA | 总结当前软骨缺损再生的细胞治疗方法并探讨其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨、软骨缺损、骨关节炎 | 再生医学 | 骨关节炎 | 细胞治疗、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组学方法开发了假单胞菌属特异性的单链DNA退火蛋白，用于改善和扩展该菌属的重组工程能力 | 采用计算生物学工作流程生成属特异性SSAPs库，并通过高通量筛选发现比现有工具更高效的变体，首次在Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens中实现重组工程 | 仅在四种假单胞菌物种中进行了测试，尚未验证在其他假单胞菌物种中的适用性 | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力，扩展其代谢工程应用 | 假单胞菌属细菌，包括Pseudomonas putida、Pseudomonas aeruginosa、Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、计算生物学、Oxford Nanopore NGS、高通量筛选 | NA | 基因组数据、测序数据 | 四种假单胞菌物种 | 单链DNA退火蛋白(SSAPs)、重组工程 | Pseudomonas putida, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas taiwanensis, Pseudomonas fluorescens | NA | 工业生物技术, 环境生物技术 |
| 10 | 2025-10-05 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
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综述 | 本文综述了受进化观察启发的三个合成生物学领域：基于细胞的生物分子进化组合方法、建立微生物群落的工程互依赖性以及合成免疫学 | 系统梳理了进化观察如何为合成生物学设计提供灵感，并聚焦于三个具体研究方向的进化前提 | 仅涵盖了进化启发合成生物学应用的部分案例，未穷尽所有相关领域 | 探讨进化观察如何启发和塑造合成生物学与生物技术 | 合成生物学中受进化启发的技术平台和应用 | 合成生物学 | NA | 遗传电路构建、合成翻译系统、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞、微生物群落 | 遗传电路、合成翻译系统、代谢途径 | 生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-12-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
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综述 | 本文综述了2011-2022年间通过合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物的研究进展 | 系统总结了酵母工程化生产萜类化合物的四个关键方向：宿主代谢调控、代谢途径重构、酶催化特性改造以及生产定位策略 | NA | 通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产萜类化合物 | 酵母工程化及植物萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 代谢途径重构、酶催化系统改造、亚细胞区室化 | 工业生物技术, 医药 |
| 12 | 2025-10-05 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用、挑战及临床进展 | 系统总结了合成生物学和细胞工程新技术在实体瘤CAR-T疗法中的应用前景 | NA | 探讨CAR-T疗法在实体瘤治疗中的临床应用现状与发展方向 | 实体瘤患者及CAR-T细胞疗法 | NA | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-12-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
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研究论文 | 通过访谈澳大利亚合成生物学中心的科学家，探讨合成生物学领域的伦理问题和实践挑战 | 首次通过实证访谈揭示合成生物学家实际面临的日常伦理问题，与文献中推测性伦理讨论形成鲜明对比 | 研究仅局限于澳大利亚一个合成生物学中心的科学家，样本代表性有限 | 理解合成生物学领域的实际伦理挑战及其与伦理文献讨论的差异 | 澳大利亚合成生物学中心的在职合成生物学家 | NA | NA | 定性访谈研究 | NA | 访谈文本数据 | 澳大利亚合成生物学中心的科学家群体 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43272-5
PMID:38052788
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研究论文 | 提出一种基于无机矿物共凝聚液滴的辐射耐受原始细胞模型 | 首次构建具有辐射耐受性的分区化原始细胞模型，利用非酶抗氧化系统实现辐射防护 | 尚未验证在真实远古地球环境中的长期适应性 | 研究原始细胞在极端前生物辐射条件下的生存适应性 | 基于多聚磷酸盐-锰和聚磷酸盐-三肽的共凝聚液滴系统 | 合成生物学 | NA | 共凝聚液滴组装技术 | 原始细胞模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | 分区化原始细胞结构，包含辐射保护外层和核样凝聚物内层 | 合成生物学, 药物递送系统 |
| 15 | 2025-10-05 |
Redox-enabled electronic interrogation and feedback control of hierarchical and networked biological systems
2023-12-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44223-w
PMID:38129428
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研究论文 | 通过工程化生物系统的天然氧化还原网络，实现了从蛋白质到细胞群体的多层级电子 interrogation 和反馈控制 | 开发了基于氧化还原反应的电子-生物接口技术，实现了无线实时通信和用户控制的生物系统编程 | NA | 建立电子设备与生物系统之间的直接通信和控制方法 | 蛋白质（辣根过氧化物酶）、大肠杆菌细胞、细胞群体 | 合成生物学 | NA | 电生物制造、氧化还原数据传递、合成生物学、eCRISPR | NA | 电化学信号、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 大肠杆菌 | 氧化还原引导的生物传感器、电子遗传控制回路、群体感应切换系统 | 生物技术, 医学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Customizing cellular signal processing by synthetic multi-level regulatory circuits
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44256-1
PMID:38110405
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研究论文 | 本文探讨了通过合成多级调控电路定制细胞信号处理的方法 | 提出了整合转录和翻译控制的多级电路设计新范式，可显著增强遗传电路的复杂性和功能性 | NA | 通过合成生物学方法定制细胞信号处理电路以满足实际需求 | 合成多级调控电路和细胞信号处理系统 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 整合转录控制和翻译控制的多级混合电路，包括基础电路动力学修改和实际应用促进 | 合成生物学 |
| 17 | 2025-10-05 |
Detection of viral RNAs at ambient temperature via reporter proteins produced through the target-splinted ligation of DNA probes
2023-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01028-y
PMID:37142844
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研究论文 | 开发了一种无需仪器的核酸检测方法INSPECTR，可在环境温度下通过报告蛋白实现病毒RNA的准确多重检测 | 利用目标特异性DNA探针连接生成表达盒，通过无细胞合成报告蛋白实现核酸检测，无需温控设备 | NA | 开发适用于即时检测环境的核酸检测技术 | 呼吸道病毒RNA | 合成生物学 | 呼吸道病毒感染 | 目标引导DNA探针连接、无细胞蛋白合成、滚环扩增 | NA | 核酸序列 | 5种呼吸道病毒目标 | NA | 无细胞系统 | 表达盒设计用于报告蛋白合成，包括酶报告蛋白和肽报告蛋白 | 医学诊断 |
| 18 | 2025-10-05 |
Advances in ligand-specific biosensing for structurally similar molecules
2023-12-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.10.009
PMID:38128482
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综述 | 本文总结了针对结构相似分子的高特异性生物传感器系统的最新进展及其关键应用 | 聚焦于通过合成生物学策略增强遗传编码生物传感器的分子特异性，涵盖理性设计原则、高通量筛选技术和计算机辅助评估方法 | NA | 开发能够特异性识别结构相似分子的生物传感器系统 | 蛋白质、核酸和遗传编码生物传感器 | 合成生物学 | NA | 理性设计、高通量筛选、计算机辅助预测 | NA | NA | NA | NA | NA | 配体特异性生物传感器 | 医学, 环境 |
| 19 | 2025-10-05 |
Molecular switches in plant stress adaptation
2023-Dec-18, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09051-7
PMID:38108912
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综述 | 本文综述了植物通过分子开关适应生物和非生物胁迫的调控机制及其在作物改良中的应用 | 揭示了单个分子开关可调控多个胁迫网络、多个开关可共同调控单一胁迫条件的新机制 | NA | 探讨植物分子开关在胁迫适应中的调控机制及其在作物改良中的应用前景 | 拟南芥等不同植物物种中的分子开关 | 植物分子生物学 | NA | 基因组学、生物技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 拟南芥, 作物植物 | 分子开关网络、胁迫诱导通路 | 农业 |
| 20 | 2025-10-06 |
A cell-free strategy for host-specific profiling of intracellular antibiotic sensitivity and resistance
2023-Dec-18, npj antimicrobials and resistance
DOI:10.1038/s44259-023-00018-z
PMID:39843793
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研究论文 | 开发了一种基于肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统，用于分析抗生素敏感性和耐药性 | 首次建立了肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统，能够进行宿主特异性抗生素敏感性分析 | 初始提取物处理需要生物安全二级实验室，但后续可在生物安全一级实验室进行 | 开发宿主特异性工具研究抗生素敏感性和耐药性 | 肺炎克雷伯菌实验室和临床分离株 | 合成生物学 | 传染病 | 无细胞基因表达(CFE)、蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据、抗生素敏感性数据 | 实验室和临床分离的肺炎克雷伯菌株 | 无细胞基因表达系统 | 肺炎克雷伯菌, 大肠杆菌MG1655 | 抗生素敏感性分析生物传感器 | 医学 |