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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-08-07 |
A Genetic Circuit Design for Targeted Viral RNA Degradation
2023-Dec-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11010022
PMID:38247899
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综述 | 本文综述了利用合成生物学设计遗传电路以实现靶向病毒RNA降解的过程和方法 | 提出了一个可定制的遗传电路设计模板,利用RNA结合蛋白作为转录激活因子,模拟自然RNA降解途径,实现靶向病毒RNA降解 | NA | 探讨如何通过设计遗传电路来靶向降解病毒RNA,从而干扰病毒复制和感染 | 病毒RNA降解和遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA |
42 | 2024-08-07 |
Biphasic amplitude oscillator characterized by distinct dynamics of trough and crest
2023-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.108.064412
PMID:38243441
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研究论文 | 研究了生物系统中双相振幅动态的特定拓扑结构和调控机制 | 识别了实现稳定振荡的核心振荡器,并利用景观理论研究了系统的随机动力学和全局稳定性 | NA | 理解振荡系统中双相振幅动态的发生机制 | 双相振幅动态的振荡器拓扑结构和调控机制 | 生物学 | NA | NA | 振荡器模型 | 理论分析 | NA |
43 | 2024-08-07 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
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研究论文 | 本文开发了一种新的植物二元表达系统,源自Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径,并在转基因烟草中实现了基因表达的五倍激活 | 本文利用Penicillium citrinum ML-236B途径中的调控元件开发了合成植物转录因子,并成功在转基因烟草中实现了基因表达的显著提升 | NA | 开发和优化植物合成生物学的遗传工具集 | 植物二元表达系统和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草植物和非转基因对照植物 |
44 | 2024-08-07 |
A Self-Regenerating Artificial Cell, that is One Step Closer to Living Cells: Challenges and Perspectives
2023-12, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300182
PMID:37246263
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综述 | 本文综述了可控自再生人工细胞(SRACs)领域的最新进展及其在合成生物学中的应用前景 | 首次探讨了通过重组实验室中的各种生物分子来创造生殖细胞的可能性 | 目前仍难以在人工创造的空间中复制细胞再生过程中的复杂过程,如遗传物质复制和细胞膜分裂 | 旨在实现创造可控自再生人工细胞的目标 | 可控自再生人工细胞及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
45 | 2024-08-07 |
Biosynthesis, Engineering, and Delivery of Selenoproteins
2023-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010223
PMID:38203392
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综述 | 本文综述了硒代半胱氨酸(Sec)的发现、生物合成及其在工程和递送中的应用 | 强调了遗传密码扩展技术在细菌和酵母中定向插入Sec的最新进展 | NA | 探讨Sec在人类健康和疾病治疗中的重要性及其在合成生物学中的新应用 | Sec的生物合成、遗传编码及其在蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
46 | 2024-08-07 |
DNA origami: a tool to evaluate and harness transcription factors
2023-12, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02380-x
PMID:37813986
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研究论文 | 本文探讨了DNA折纸技术在评估和利用转录因子(TFs)中的应用 | 提出DNA折纸作为一种新型合成DNA纳米技术方法,能够利用DNA的多个关键特性,如DNA聚合、DNA互补性、DNA可编程性和DNA可编辑性 | NA | 研究如何通过合成生物学/医学手段辅助转录因子的研究和治疗靶向 | 转录因子及其在基因调控中的作用 | 合成生物学 | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA |
47 | 2024-08-07 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 研究显示,过表达PtRWA-C基因增加了木聚糖的乙酰化水平和木质素含量,从而降低了杨树木质生物质的糖化效率 | 首次揭示了PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化中的功能作用,并发现了AP2家族转录因子HRD对其表达的调控机制 | NA | 探讨PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的作用及其调控机制 | 杨树(Populus trichocarpa)的PtRWA-C基因及其在生物质转化中的作用 | NA | NA | 基因共表达网络分析,表达数量性状位点(eQTL)分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
48 | 2024-08-07 |
Genome sequence and characterization of a novel Pseudomonas putida phage, MiCath
2023-12-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48634-z
PMID:38071193
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研究论文 | 报道了一种新的Pseudomonas putida噬菌体MiCath,这是首个已知的感染P. putida S12菌株的噬菌体 | MiCath是一种新型噬菌体,与已知的任何噬菌体相比,其基因组中最多只有74%的核苷酸序列相似,且编码许多独特的基因产物 | NA | 研究并描述一种新型Pseudomonas putida噬菌体的基因组特征 | Pseudomonas putida噬菌体MiCath及其基因组 | NA | NA | 比较基因组学 | NA | 基因组 | 涉及一个新型噬菌体MiCath和五个Pseudomonas putida菌株 |
49 | 2024-08-07 |
Application and Technical Challenges in Design, Cloning, and Transfer of Large DNA
2023-Dec-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10121425
PMID:38136016
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综述 | 本文综述了在合成生物学领域中,设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的技术挑战和应用 | 介绍了在合成基因组学和大型DNA工程领域中,通过设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的关键步骤 | NA | 推进合成基因组学和大型DNA工程领域的发展 | 大型DNA的设计、克隆和转移 | 合成生物学 | NA | DNA组装和编辑 | NA | DNA | NA |
50 | 2024-08-07 |
Digital microfluidics as an emerging tool for bacterial protocols
2023-Dec-13, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2023.12.005
PMID:38101571
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研究论文 | 本文探讨了数字微流控技术(DMF)在细菌实验流程中的应用 | DMF技术提供了一个微型化平台,能够简化从样本准备到分析的多步骤细菌实验流程 | 文章指出了当前工作的局限性,并提出了未来该技术在领域内扩展的方向 | 旨在优化细菌实验流程,提高实验效率 | 细菌实验流程及其在合成生物学、测序和诊断测试中的应用 | NA | NA | 数字微流控技术(DMF) | NA | NA | NA |
51 | 2024-08-07 |
Oncolytic Viruses in the Era of Omics, Computational Technologies, and Modeling: Thesis, Antithesis, and Synthesis
2023-Dec-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417378
PMID:38139207
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综述 | 本文综述了在肿瘤免疫病毒治疗中,如何利用大数据分析、模拟、建模和计算技术来整合和解释“组学”信息,并推动新型合成生物学和个性化溶瘤病毒工程方法的发展 | 结合大数据分析和计算技术,推动个性化溶瘤病毒工程方法的发展,实现针对特定患者的肿瘤清除 | NA | 探讨如何利用现代技术和模型来优化溶瘤病毒治疗,实现个性化免疫治疗 | 溶瘤病毒及其在个性化免疫治疗中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 组学技术 | NA | 大数据 | NA |
52 | 2024-08-07 |
Transcriptome Identification and Analysis of Fatty Acid Desaturase Gene Expression at Different Temperatures in Tausonia pullulans 6A7
2023-Dec-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11122916
PMID:38138060
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研究论文 | 本研究对低温酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因表达进行了转录组鉴定和分析 | 本研究发现了8455个差异表达基因,并确定了16个候选基因,这些发现有助于深入研究酵母中脂肪酸代谢相关重要基因的功能和分子机制 | NA | 研究酵母菌株6A7在不同温度下脂肪酸去饱和酶基因的表达 | 酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 在不同温度(15°C、20°C、20°C无玉米油、25°C)下对产脂酶的6A7进行了RNA-seq分析 |
53 | 2024-08-07 |
Customizing cellular signal processing by synthetic multi-level regulatory circuits
2023-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44256-1
PMID:38110405
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研究论文 | 本文探讨了通过合成多级调控电路定制工程化生物系统中的信号处理电路 | 引入了前所未有的复杂性调控机制和遗传电路,如转录和翻译控制,并将其整合到称为“多级电路”的混合电路中 | NA | 旨在通过合成生物学定制细胞信号处理电路,以应对全球挑战 | 多级电路设计及其在遗传电路设计范式中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
54 | 2024-08-07 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-Dec-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
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研究论文 | 本研究通过访谈澳大利亚合成生物学中心的合成生物学家,探讨了合成生物学领域的伦理问题、承诺和实践 | 本研究揭示了合成生物学领域中伦理挑战的实际问题,与伦理文献中的抽象和推测性讨论形成对比 | NA | 理解合成生物学领域的伦理问题及其与伦理文献的关系 | 合成生物学领域的伦理挑战和实践 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈数据 | 参与访谈的合成生物学家 |
55 | 2024-08-07 |
Detection of viral RNAs at ambient temperature via reporter proteins produced through the target-splinted ligation of DNA probes
2023-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01028-y
PMID:37142844
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研究论文 | 本文介绍了一种无需仪器的环境温度下核酸检测方法INSPECTR,通过DNA探针的目标特异性拼接连接生成表达盒,实现报告蛋白的细胞外合成 | INSPECTR方法无需昂贵和复杂的设备,可在环境温度下进行核酸的准确和多重检测 | NA | 开发一种适用于即时护理点无需复杂设备的核酸检测方法 | 环境温度下的核酸检测技术 | 分子生物学 | NA | DNA探针拼接连接、细胞外报告蛋白合成 | NA | 核酸 | 约4,000份病毒RNA |
56 | 2024-08-07 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-Dec-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
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研究论文 | 本文通过计算生物学流程生成了一种属特异性的单链DNA结合蛋白库,并在不同假单胞菌中进行了高吞吐量的重组酶筛选和牛津纳米孔NGS分析,以提高假单胞菌属的基因组编辑能力 | 发现了新的单链DNA结合蛋白变体,这些变体在假单胞菌属中的等位基因替换频率高于现有变体,并扩展了假单胞菌属中的重组工程领域 | NA | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力,增强其在生物转化和合成生物学应用中的潜力 | 假单胞菌属的基因组编辑能力 | 合成生物学 | NA | NGS, ONT | NA | DNA | 四种假单胞菌属物种 |
57 | 2024-08-07 |
Molecular switches in plant stress adaptation
2023-Dec-18, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09051-7
PMID:38108912
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综述 | 本文综述了植物在应对气候变化带来的生物和非生物胁迫时,通过分子开关激活应激诱导途径的适应机制 | 探讨了分子开关在不同植物种类中的调控机制,并讨论了利用分子开关和先进生物技术工具开发抗逆作物的技术 | NA | 研究分子开关在植物应激适应中的调控机制,并探索其在作物改良中的应用 | 不同植物种类中的分子开关及其在应对生物和非生物胁迫中的调控机制 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
58 | 2024-08-07 |
Efficient de novo production of bioactive cordycepin by Aspergillus oryzae using a food-grade expression platform
2023-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02261-5
PMID:38071331
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研究论文 | 本研究开发了一种利用食品级表达平台Aspergillus oryzae高效生产生物活性化合物cordycepin的方法 | 通过合成生物学方法,成功构建了能够过量表达两个参与cordycepin生物合成代谢基因的A. oryzae工程菌株,实现了高效且成本有效的cordycepin生产 | NA | 克服传统Cordyceps spp.生产cordycepin的局限性,满足市场对cordycepin日益增长的需求 | cordycepin的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
59 | 2024-08-07 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-Dec-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产植物萜类化合物的进展,特别是针对酵母的工程化 | 利用合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物,通过操纵宿主代谢、重构代谢途径、工程化酶的催化活性和亚细胞定位等创新方法 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法在酵母中生产植物萜类化合物的技术进展 | 植物萜类化合物在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
60 | 2024-08-07 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-Dec-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 本文比较了五种噬菌体衍生重组酶在三种与生物技术相关的假单胞菌株中的重组效率 | 首次展示了这些重组酶在假单胞菌属中的应用,为该属的基因操作提供了新的有效工具 | 研究仅限于三种特定的假单胞菌株,可能需要进一步验证在其他菌株中的效果 | 探索和优化假单胞菌属的基因操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学中的应用 | 三种生物技术相关的假单胞菌株:P. putida KT2440, P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 重组酶技术 | NA | 基因组数据 | 三种假单胞菌株 |