合成生物学相关文章
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当前共找到 76 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Recent advances in systems metabolic engineering
2023-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103004
PMID:37778304
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综述 | 本文综述了系统代谢工程领域的最新工具和策略，包括酶、遗传模块、途径、通量、基因组和细胞层面的工程，并强调了将学术研究转化为商业生产的挑战和前景。 | 系统代谢工程结合了代谢工程、系统生物学、合成生物学和进化工程，通过创建高效的微生物细胞工厂，革新了燃料和材料的可持续生产。 | 文章讨论了将学术级别的代谢工程研究过渡到商业规模生产的挑战。 | 探讨系统代谢工程的最新进展及其在微生物细胞工厂创建中的应用。 | 文章主要研究了微生物细胞工厂的创建及其在燃料和材料生产中的应用。 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Emerging nonmodel eukaryotes for biofuel production
2023-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103015
PMID:37913603
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研究论文 | 本文介绍了非模式真核生物在生物燃料生产中的新兴应用，并讨论了它们的特定优势 | 利用合成生物学和代谢工程的进步，非模式真核生物因其天然的优良表型和代谢特性，成为有前景的生物燃料生产者 | 非模式真核生物作为理想宿主用于未来生物燃料生产仍面临挑战 | 探讨非模式真核生物在生物燃料生产中的应用及其发展前景 | 非模式真核生物及其在生产纤维素乙醇、高级醇和脂肪酸/萜类衍生物生物燃料分子中的能力 | NA | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
pyBrick-DNA: A Python-Based Environment for Automated Genetic Component Assembly
2023-12, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0008
PMID:38010519
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Python的软件环境pyBrick-DNA，用于自动化基因组件组装，加速遗传电路的原型设计 | pyBrick-DNA提供了一个用户友好的环境，允许科学家选择基因序列或输入自定义序列来构建基因组件，所有组件模块化融合生成一个即用型单DNA片段 | NA | 开发自动化工具以加速遗传电路的模拟和实现 | 基因组件的自动化组装 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Optogenetic manipulation of BMP signaling to drive chondrogenic differentiation of hPSCs
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113502
PMID:38032796
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研究论文 | 本研究利用光遗传学技术调控骨形态发生蛋白（BMP）信号，促进人胚胎干细胞（hESCs）的软骨分化 | 通过CRISPR-Cas9介导的光遗传学BMP信号系统（optoBMP），实现了光控BMP信号激活，从而调控hESCs的软骨分化 | NA | 探索光遗传学技术在人胚胎干细胞分化和组织工程中的应用 | 人胚胎干细胞（hESCs）的软骨分化 | 生物技术 | NA | 光遗传学 | CRISPR-Cas9 | 细胞 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
The Effect of Pseudoknot Base Pairing on Cotranscriptional Structural Switching of the Fluoride Riboswitch
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570056
PMID:38106011
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研究论文 | 研究了转录过程中氟离子核开关的结构转换及其对假结碱基配对的影响 | 发现单个摇摆碱基对在功能中的关键作用，并揭示了镁离子在RNA结构转换中的重要角色 | NA | 探讨RNA序列变化如何影响转录过程中动态构象变化 | 氟离子核开关及其在不同温度下的功能 | 生物学 | NA | RNA聚合酶转录和细胞基因表达分析 | 分子动力学模拟 | RNA序列 | 涉及中温和高温氟离子核开关变体 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Two neglected but valuable genetic tools for Escherichia coli and other bacteria: In vivo cosmid packaging and inducible plasmid replication
2023-12, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.15171
PMID:37770255
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研究论文 | 本文介绍了两种被忽视但有价值的遗传工具：大肠杆菌和其他细菌中的体内cosmid包装和可诱导质粒复制 | 通过操纵包装噬菌体和宿主，解决了体内cosmid包装效率低和污染问题，实现了仅包含cosmid DNA的颗粒 | 质粒难以从细胞中去除，但可诱导复制质粒提供了一种“治愈”质粒的方法 | 探索在生理学和合成生物学中，如何高效且无损地将基因引入细菌宿主 | 大肠杆菌和其他细菌 | 合成生物学 | NA | 体内cosmid包装，可诱导质粒复制 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Phaeodactylum tricornutum: An established model species for diatom molecular research and an emerging chassis for algal synthetic biology
2023-12, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.13400
PMID:37975560
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研究论文 | 本文综述了Phaeodactylum tricornutum作为硅藻分子研究和藻类合成生物学新兴底盘的贡献 | Phaeodactylum tricornutum作为一种非典型硅藻，因其易于实验室培养和基因表达操作工具的增加，已成为硅藻分子研究的重要模型，并逐渐成为藻类过程工程和合成生物学的新工具 | NA | 探讨Phaeodactylum tricornutum在硅藻生物学研究和藻类合成生物学中的应用 | Phaeodactylum tricornutum | 分子生物学 | NA | 基因表达操作 | NA | 基因组信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Synthetic biology identifies the minimal gene set required for paclitaxel biosynthesis in a plant chassis
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.016
PMID:37897038
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研究论文 | 本研究通过转录组学、细胞生物学、代谢组学和途径重构的综合方法，确定了在植物底盘中异源生产紫杉醇所需的最小基因集 | 本研究识别了紫杉醇生物合成中缺失的步骤，并通过在烟草中异源表达确认了大部分缺失酶的活性，特别是发现了一种新的C4β-C20环氧化酶，克服了代谢工程的第一个瓶颈 | NA | 确定紫杉醇生物合成所需的最小基因集，并探索植物产生复杂生物活性代谢物的独特化学机制 | 紫杉醇生物合成途径中的基因和酶 | 生物技术 | 癌症 | 转录组学, 细胞生物学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 涉及烟草（Nicotiana benthamiana）作为实验对象 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Graphene oxide aptasensor droplet assay for detection of metabolites secreted by single cells applied to synthetic biology
2023-12-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00959a
PMID:38054213
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研究论文 | 本文开发了一种新型的可修改石墨烯氧化物（GO）适配体传感器，用于检测单细胞分泌的不同目标化合物，应用于合成生物学领域 | 利用荧光标记的适配体通过π-π堆积作用稳定地锚定在GO上，以最小化非特异性相互作用，实现低背景检测和高信噪比 | NA | 开发一种高灵敏度和灵活性的单细胞分泌检测方法，用于合成生物学中的生物生产 | 单细胞分泌的代谢物，如ATP和naringenin | 合成生物学 | NA | 石墨烯氧化物（GO）适配体传感器 | NA | 代谢物 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Biosensor-guided discovery and engineering of metabolic enzymes
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108251
PMID:37690614
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综述 | 本文综述了利用生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和工程化代谢酶方面的应用 | 开发了基于遗传编码的生物传感器，用于在细胞内特定检测由酶活性产生的目标分子，从而促进目标酶的高通量筛选 | 酶发现和工程化中的一个主要挑战是从广泛的酶库中有效筛选具有所需表型的酶 | 探讨生物传感器引导的高通量筛选系统在发现和改进酶特性中的应用 | 代谢酶的发现和工程化 | 生物技术 | NA | 高通量筛选 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
A Small-Molecule Approach to Bypass In Vitro Selection of New Aptamers: Designer Pre-Ligands Turn Baby Spinach into Sensors for Reactive Inorganic Targets
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551132
PMID:38168427
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研究论文 | 本文介绍了一种利用小分子方法，通过设计预配体将婴儿菠菜（一种RNA适配体）转化为传感器，用于检测无机目标物 | 该方法无需体外筛选新的适配体序列，即可检测短寿命目标物，从而扩展了荧光增强适配体系统的能力 | NA | 开发一种新的生物传感平台，用于检测无机分子目标 | 荧光增强适配体系统、无机目标物（如硫化氢和过氧化氢） | 生物化学 | NA | 荧光增强适配体系统 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
A Genetic Circuit Design for Targeted Viral RNA Degradation
2023-Dec-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11010022
PMID:38247899
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综述 | 本文综述了利用合成生物学设计遗传电路以实现靶向病毒RNA降解的过程和方法 | 提出了一个可定制的遗传电路设计模板，利用RNA结合蛋白作为转录激活因子，模拟自然RNA降解途径，实现靶向病毒RNA降解 | NA | 探讨如何通过设计遗传电路来靶向降解病毒RNA，从而干扰病毒复制和感染 | 病毒RNA降解和遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Biphasic amplitude oscillator characterized by distinct dynamics of trough and crest
2023-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.108.064412
PMID:38243441
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研究论文 | 研究了生物系统中双相振幅动态的特定拓扑结构和调控机制 | 识别了实现稳定振荡的核心振荡器，并利用景观理论研究了系统的随机动力学和全局稳定性 | NA | 理解振荡系统中双相振幅动态的发生机制 | 双相振幅动态的振荡器拓扑结构和调控机制 | 生物学 | NA | NA | 振荡器模型 | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
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研究论文 | 本文开发了一种新的植物二元表达系统，源自Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径，并在转基因烟草中实现了基因表达的五倍激活 | 本文利用Penicillium citrinum ML-236B途径中的调控元件开发了合成植物转录因子，并成功在转基因烟草中实现了基因表达的显著提升 | NA | 开发和优化植物合成生物学的遗传工具集 | 植物二元表达系统和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草植物和非转基因对照植物 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
A Self-Regenerating Artificial Cell, that is One Step Closer to Living Cells: Challenges and Perspectives
2023-12, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300182
PMID:37246263
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综述 | 本文综述了可控自再生人工细胞（SRACs）领域的最新进展及其在合成生物学中的应用前景 | 首次探讨了通过重组实验室中的各种生物分子来创造生殖细胞的可能性 | 目前仍难以在人工创造的空间中复制细胞再生过程中的复杂过程，如遗传物质复制和细胞膜分裂 | 旨在实现创造可控自再生人工细胞的目标 | 可控自再生人工细胞及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Biosynthesis, Engineering, and Delivery of Selenoproteins
2023-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010223
PMID:38203392
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综述 | 本文综述了硒代半胱氨酸（Sec）的发现、生物合成及其在工程和递送中的应用 | 强调了遗传密码扩展技术在细菌和酵母中定向插入Sec的最新进展 | NA | 探讨Sec在人类健康和疾病治疗中的重要性及其在合成生物学中的新应用 | Sec的生物合成、遗传编码及其在蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
DNA origami: a tool to evaluate and harness transcription factors
2023-12, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02380-x
PMID:37813986
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研究论文 | 本文探讨了DNA折纸技术在评估和利用转录因子（TFs）中的应用 | 提出DNA折纸作为一种新型合成DNA纳米技术方法，能够利用DNA的多个关键特性，如DNA聚合、DNA互补性、DNA可编程性和DNA可编辑性 | NA | 研究如何通过合成生物学/医学手段辅助转录因子的研究和治疗靶向 | 转录因子及其在基因调控中的作用 | 合成生物学 | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 研究显示，过表达PtRWA-C基因增加了木聚糖的乙酰化水平和木质素含量，从而降低了杨树木质生物质的糖化效率 | 首次揭示了PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化中的功能作用，并发现了AP2家族转录因子HRD对其表达的调控机制 | NA | 探讨PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的作用及其调控机制 | 杨树（Populus trichocarpa）的PtRWA-C基因及其在生物质转化中的作用 | NA | NA | 基因共表达网络分析，表达数量性状位点（eQTL）分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Genome sequence and characterization of a novel Pseudomonas putida phage, MiCath
2023-12-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48634-z
PMID:38071193
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研究论文 | 报道了一种新的Pseudomonas putida噬菌体MiCath，这是首个已知的感染P. putida S12菌株的噬菌体 | MiCath是一种新型噬菌体，与已知的任何噬菌体相比，其基因组中最多只有74%的核苷酸序列相似，且编码许多独特的基因产物 | NA | 研究并描述一种新型Pseudomonas putida噬菌体的基因组特征 | Pseudomonas putida噬菌体MiCath及其基因组 | NA | NA | 比较基因组学 | NA | 基因组 | 涉及一个新型噬菌体MiCath和五个Pseudomonas putida菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Application and Technical Challenges in Design, Cloning, and Transfer of Large DNA
2023-Dec-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10121425
PMID:38136016
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综述 | 本文综述了在合成生物学领域中，设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的技术挑战和应用 | 介绍了在合成基因组学和大型DNA工程领域中，通过设计和克隆大型DNA以及将其转移至宿主细胞的关键步骤 | NA | 推进合成基因组学和大型DNA工程领域的发展 | 大型DNA的设计、克隆和转移 | 合成生物学 | NA | DNA组装和编辑 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |