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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Digital microfluidics as an emerging tool for bacterial protocols
2023-Dec-13, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2023.12.005
PMID:38101571
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研究论文 | 本文探讨了数字微流控技术(DMF)在细菌实验流程中的应用 | DMF技术提供了一个微型化平台,能够简化从样本准备到分析的多步骤细菌实验流程 | 文章指出了当前工作的局限性,并提出了未来该技术在领域内扩展的方向 | 旨在优化细菌实验流程,提高实验效率 | 细菌实验流程及其在合成生物学、测序和诊断测试中的应用 | NA | NA | 数字微流控技术(DMF) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Oncolytic Viruses in the Era of Omics, Computational Technologies, and Modeling: Thesis, Antithesis, and Synthesis
2023-Dec-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417378
PMID:38139207
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综述 | 本文综述了在肿瘤免疫病毒治疗中,如何利用大数据分析、模拟、建模和计算技术来整合和解释“组学”信息,并推动新型合成生物学和个性化溶瘤病毒工程方法的发展 | 结合大数据分析和计算技术,推动个性化溶瘤病毒工程方法的发展,实现针对特定患者的肿瘤清除 | NA | 探讨如何利用现代技术和模型来优化溶瘤病毒治疗,实现个性化免疫治疗 | 溶瘤病毒及其在个性化免疫治疗中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 组学技术 | NA | 大数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Transcriptome Identification and Analysis of Fatty Acid Desaturase Gene Expression at Different Temperatures in Tausonia pullulans 6A7
2023-Dec-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11122916
PMID:38138060
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研究论文 | 本研究对低温酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因表达进行了转录组鉴定和分析 | 本研究发现了8455个差异表达基因,并确定了16个候选基因,这些发现有助于深入研究酵母中脂肪酸代谢相关重要基因的功能和分子机制 | NA | 研究酵母菌株6A7在不同温度下脂肪酸去饱和酶基因的表达 | 酵母菌株6A7在不同温度下的脂肪酸去饱和酶基因 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 在不同温度(15°C、20°C、20°C无玉米油、25°C)下对产脂酶的6A7进行了RNA-seq分析 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Efficient de novo production of bioactive cordycepin by Aspergillus oryzae using a food-grade expression platform
2023-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02261-5
PMID:38071331
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研究论文 | 本研究开发了一种利用食品级表达平台Aspergillus oryzae高效生产生物活性化合物cordycepin的方法 | 通过合成生物学方法,成功构建了能够过量表达两个参与cordycepin生物合成代谢基因的A. oryzae工程菌株,实现了高效且成本有效的cordycepin生产 | NA | 克服传统Cordyceps spp.生产cordycepin的局限性,满足市场对cordycepin日益增长的需求 | cordycepin的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-Dec-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 本文比较了五种噬菌体衍生重组酶在三种与生物技术相关的假单胞菌株中的重组效率 | 首次展示了这些重组酶在假单胞菌属中的应用,为该属的基因操作提供了新的有效工具 | 研究仅限于三种特定的假单胞菌株,可能需要进一步验证在其他菌株中的效果 | 探索和优化假单胞菌属的基因操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学中的应用 | 三种生物技术相关的假单胞菌株:P. putida KT2440, P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 重组酶技术 | NA | 基因组数据 | 三种假单胞菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Improving statins production: From non-genetic strategies to genetic strategies
2023-Dec, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300229
PMID:37563745
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综述 | 本文综述了通过微生物细胞工厂生产他汀类药物的策略,包括传统发酵培养和现代合成生物制造 | 强调了可回收农业废弃物作为发酵底物在固态发酵中的潜在应用,并讨论了代谢工程策略和定向进化 | NA | 旨在促进他汀类药物的绿色生产模式 | 他汀类药物的生产策略 | 生物技术 | NA | 发酵技术,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Cell-free protein synthesis system: A new frontier for sustainable biotechnology-based products
2023-Dec, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.2514
PMID:37735977
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综述 | 本文主要探讨了无细胞蛋白合成系统在多种产品生产中的应用及其在生物治疗方面的挑战和未来展望 | 无细胞蛋白合成系统是一种创新技术,具有广泛的应用潜力,能够挑战现有思维并解决环境和健康问题 | 尽管无细胞蛋白合成系统在多种应用中已被证明是成功的,但仍存在一些需要克服的障碍 | 探讨无细胞蛋白合成系统在可持续生物技术产品中的应用及其未来发展 | 无细胞蛋白合成系统及其在生物医学工业中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Improving thermo-tolerance of Saccharomyces cerevisiae by precise regulation of the expression of small HSP
2023-Dec-08, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d3ra05216h
PMID:38090074
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,验证了通过精确调控小热休克蛋白(HSP)表达来提高酿酒酵母热耐受性的效果 | 研究首次通过合成生物学方法,精确调控小热休克蛋白的表达,显著提高了酿酒酵母在高温下的生长速率和细胞存活率 | 研究仅限于特定的酿酒酵母菌株和特定的热休克蛋白基因电路,可能不适用于所有微生物或所有类型的热休克蛋白 | 探索和应用其他应激耐受基因电路的科学参考价值 | 酿酒酵母的热耐受性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及多个酿酒酵母菌株和不同强度启动子的热休克蛋白基因电路 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Heterologous biosynthesis of medicarpin using engineered Saccharomyces cerevisiae
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.003
PMID:38090379
|
研究论文 | 本研究通过工程化的酿酒酵母实现了异源生物合成medicarpin | 首次通过合成生物学策略在酿酒酵母中实现了medicarpin的异源生物合成,并通过增加特定基因的拷贝数提高了产量 | NA | 探索通过合成生物学方法实现medicarpin的经济可持续生产 | medicarpin的生物合成及其在酿酒酵母中的表达 | 合成生物学 | NA | 比较转录组学和生物信息学分析 | NA | 基因和酶活性数据 | 涉及八个关键基因和特定的酶反应 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Advance of tolerance engineering on microbes for industrial production
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.10.004
PMID:38025766
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综述 | 本文综述了提高工业微生物耐受性的代谢工程技术,并讨论了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | 探讨了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | NA | 提高工业微生物在极端生产条件下的耐受性 | 工业微生物的耐受性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Recent advances in genome annotation and synthetic biology for the development of microbial chassis
2023-Dec-01, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1186/s43141-023-00598-3
PMID:38038785
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综述 | 本文综述了微生物宿主选择、合成生物学、基因组注释、代谢建模以及预测基因必需性的计算方法,以开发微生物底盘,特别关注乳酸菌作为微生物底盘及其基因组注释策略。 | 本文提出了基因组注释策略,以优化基因组减少而不损害底盘功能,并探讨了最小基因组底盘开发的潜力。 | NA | 开发高效和可持续的合成生物学系统,使用具有最小基因组的优化微生物底盘。 | 乳酸菌(LAB)作为微生物底盘及其基因组注释策略,以Lactococcus lactis为例。 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢建模、计算方法 | NA | 基因组数据 | 以Lactococcus lactis为例 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
Synthesis and chemical transformations of glycol nucleic acid (GNA) nucleosides
2023-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.106921
PMID:37871392
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综述 | 本文综述了甘醇核酸(GNA)核苷的合成方法及其后合成化学转化 | 介绍了GNA化学中使用的多种反应,包括Sonogashira反应、Michael加成、silyl-Hilbert-Johnson反应等,以及合成新型氧化还原活性(二茂铁基)和发光(芘基和菲基)GNA核苷的最新进展 | NA | 从合成化学的角度介绍GNA核苷,为生物学研究提供起点 | GNA核苷的合成方法及其化学转化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
Bacillus sp. as a microbial cell factory: Advancements and future prospects
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108278
PMID:37898328
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综述 | 本文综述了芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的研究进展和未来前景 | 总结了芽孢杆菌在系统和合成生物学、工程策略改进微生物细胞特性以及在代谢工程应用中的工业应用方面的进展 | 提出了当前面临的挑战和可能的解决方案 | 探讨芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的潜力和应用前景 | 芽孢杆菌属及其在工业生产中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
DSEMR: A database for special environment microorganisms resource and associating them with synthetic biological parts
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.09.006
PMID:37840639
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research paper | 本文介绍了特殊环境微生物数据库DSEMR,该数据库整合了特殊环境微生物的基因组、生理特性、培养基、生物部件和代谢途径等信息,并提供了在线工具分析数据。 | DSEMR数据库的创新之处在于它不仅提供了特殊环境微生物的详细信息,还将这些信息与合成生物学部件相关联,为生物技术过程的创新和生物工程的发展提供了重要资源。 | NA | 研究和开发具有特殊基因型、生理功能和代谢产物的特殊环境微生物,以推动生物技术过程的创新和生物工程的发展。 | 特殊环境微生物及其在合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 包含5268株来自620个属的特殊环境微生物,31种培养基和42,126个生物部件。 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Advances in synthetic biology toolboxes paving the way for mechanistic understanding and strain engineering of gut commensal Bacteroides spp. and Clostridium spp
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108272
PMID:37844770
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp.中的最新进展及其在解析微生物-宿主相互作用机制和工程化改造中的应用 | 介绍了针对Bacteroides spp.和Clostridium spp.的合成生物学工具的最新发展,以及这些工具在理解微生物-宿主相互作用中的应用 | 目前对微生物-宿主相互作用的分子机制了解有限,主要是由于大多数共生细菌缺乏有效的遗传工具 | 探讨合成生物学工具在理解小分子介导的微生物-宿主相互作用及其在生物医学工程中的应用 | 肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp. | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Seamless and orthogonal expression of genetic parts in polyhydroxyalkanoate (PHA)-producing bacterial chassis for plastic bio-upcycling applications
2023-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102434
PMID:37846354
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研究论文 | 本研究介绍了在生产聚羟基脂肪酸酯(PHA)的细菌中,通过无缝质粒构建实现重组PET水解酶(PETase)的正交表达 | 开发了无缝克隆和表达方法,利用SureVector(SV)系统生成pSV-Ortho-PHA(pSVOP)表达平台,实现了PETase在PHA生产细菌中的正交表达 | NA | 研究旨在开发一种无缝质粒构建方法,用于在PHA生产细菌中实现PETase的正交表达,以促进塑料生物升级循环应用 | 研究对象包括PHA生产细菌、PETase、遗传部件如Trc启动子、pBBR1复制起点、锚定蛋白和信号序列 | 合成生物学 | NA | 无缝克隆技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |