合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2024-08-07	Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome 2023-Dec-07, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015 PMID:37944526	research paper	本文报道了迄今为止最大的真核生物染色体synIV的从头合成，该染色体长度为1,454,621 bp，通过广泛的基因组简化和修改得到。	开发了megachunk组装结合分层集成策略，显著提高了合成染色体构建的准确性和灵活性。此外，通过操纵synIV的三维结构，探索了空间基因调控，并发现基因表达变化有限，表明在酵母核质中定位在基因调控中起次要作用。	NA	探索合成基因组是否能驱动生命，并研究染色体三维结构对基因调控的影响。	合成酵母染色体synIV及其三维结构。	synthetic biology	NA	megachunk assembly, hierarchical integration strategy	NA	DNA sequence	一个1,454,621 bp的酵母染色体synIV
62	2024-08-07	Improving statins production: From non-genetic strategies to genetic strategies 2023-Dec, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.202300229 PMID:37563745	综述	本文综述了通过微生物细胞工厂生产他汀类药物的策略，包括传统发酵培养和现代合成生物制造	强调了可回收农业废弃物作为发酵底物在固态发酵中的潜在应用，并讨论了代谢工程策略和定向进化	NA	旨在促进他汀类药物的绿色生产模式	他汀类药物的生产策略	生物技术	NA	发酵技术，代谢工程	NA	NA	NA
63	2024-08-07	Cell-free protein synthesis system: A new frontier for sustainable biotechnology-based products 2023-Dec, Biotechnology and applied biochemistry IF:3.2Q2 DOI:10.1002/bab.2514 PMID:37735977	综述	本文主要探讨了无细胞蛋白合成系统在多种产品生产中的应用及其在生物治疗方面的挑战和未来展望	无细胞蛋白合成系统是一种创新技术，具有广泛的应用潜力，能够挑战现有思维并解决环境和健康问题	尽管无细胞蛋白合成系统在多种应用中已被证明是成功的，但仍存在一些需要克服的障碍	探讨无细胞蛋白合成系统在可持续生物技术产品中的应用及其未来发展	无细胞蛋白合成系统及其在生物医学工业中的应用	合成生物学	NA	无细胞蛋白合成系统	NA	NA	NA
64	2024-08-07	Improving thermo-tolerance of Saccharomyces cerevisiae by precise regulation of the expression of small HSP 2023-Dec-08, RSC advances IF:3.9Q2 DOI:10.1039/d3ra05216h PMID:38090074	研究论文	本研究通过合成生物学方法，验证了通过精确调控小热休克蛋白（HSP）表达来提高酿酒酵母热耐受性的效果	研究首次通过合成生物学方法，精确调控小热休克蛋白的表达，显著提高了酿酒酵母在高温下的生长速率和细胞存活率	研究仅限于特定的酿酒酵母菌株和特定的热休克蛋白基因电路，可能不适用于所有微生物或所有类型的热休克蛋白	探索和应用其他应激耐受基因电路的科学参考价值	酿酒酵母的热耐受性	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	转录组数据	涉及多个酿酒酵母菌株和不同强度启动子的热休克蛋白基因电路
65	2024-08-07	Heterologous biosynthesis of medicarpin using engineered Saccharomyces cerevisiae 2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.003 PMID:38090379	研究论文	本研究通过工程化的酿酒酵母实现了异源生物合成medicarpin	首次通过合成生物学策略在酿酒酵母中实现了medicarpin的异源生物合成，并通过增加特定基因的拷贝数提高了产量	NA	探索通过合成生物学方法实现medicarpin的经济可持续生产	medicarpin的生物合成及其在酿酒酵母中的表达	合成生物学	NA	比较转录组学和生物信息学分析	NA	基因和酶活性数据	涉及八个关键基因和特定的酶反应
66	2024-08-07	An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness 2023-Dec-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-43272-5 PMID:38052788	研究论文	本文介绍了一种基于无机多聚磷酸盐（polyP）与二价金属阳离子和阳离子三肽相互作用形成的两类凝聚滴构建的抗辐射原细胞模型	首次展示了在极端原生条件下，通过特定的凝聚滴组合形成的原细胞模型具有抗辐射能力，并能有效清除活性氧，保护内部核酸样凝聚体	NA	研究原细胞在极端原生条件下的生存能力和适应性，特别是在原生辐射环境中的表现	原细胞模型及其在原生辐射条件下的生存和适应性	NA	NA	NA	NA	NA	NA
67	2024-08-07	Advance of tolerance engineering on microbes for industrial production 2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2023.10.004 PMID:38025766	综述	本文综述了提高工业微生物耐受性的代谢工程技术，并讨论了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路	探讨了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路	NA	提高工业微生物在极端生产条件下的耐受性	工业微生物的耐受性	合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	NA
68	2024-08-07	Recent advances in genome annotation and synthetic biology for the development of microbial chassis 2023-Dec-01, Journal, genetic engineering & biotechnology DOI:10.1186/s43141-023-00598-3 PMID:38038785	综述	本文综述了微生物宿主选择、合成生物学、基因组注释、代谢建模以及预测基因必需性的计算方法，以开发微生物底盘，特别关注乳酸菌作为微生物底盘及其基因组注释策略。	本文提出了基因组注释策略，以优化基因组减少而不损害底盘功能，并探讨了最小基因组底盘开发的潜力。	NA	开发高效和可持续的合成生物学系统，使用具有最小基因组的优化微生物底盘。	乳酸菌（LAB）作为微生物底盘及其基因组注释策略，以Lactococcus lactis为例。	合成生物学	NA	基因组注释、代谢建模、计算方法	NA	基因组数据	以Lactococcus lactis为例
69	2024-08-07	Synthesis and chemical transformations of glycol nucleic acid (GNA) nucleosides 2023-12, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.bioorg.2023.106921 PMID:37871392	综述	本文综述了甘醇核酸（GNA）核苷的合成方法及其后合成化学转化	介绍了GNA化学中使用的多种反应，包括Sonogashira反应、Michael加成、silyl-Hilbert-Johnson反应等，以及合成新型氧化还原活性（二茂铁基）和发光（芘基和菲基）GNA核苷的最新进展	NA	从合成化学的角度介绍GNA核苷，为生物学研究提供起点	GNA核苷的合成方法及其化学转化	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
70	2024-08-07	Bacillus sp. as a microbial cell factory: Advancements and future prospects 2023-12, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108278 PMID:37898328	综述	本文综述了芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的研究进展和未来前景	总结了芽孢杆菌在系统和合成生物学、工程策略改进微生物细胞特性以及在代谢工程应用中的工业应用方面的进展	提出了当前面临的挑战和可能的解决方案	探讨芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的潜力和应用前景	芽孢杆菌属及其在工业生产中的应用	NA	NA	NA	NA	NA	NA
71	2024-08-07	DSEMR: A database for special environment microorganisms resource and associating them with synthetic biological parts 2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2023.09.006 PMID:37840639	research paper	本文介绍了特殊环境微生物数据库DSEMR，该数据库整合了特殊环境微生物的基因组、生理特性、培养基、生物部件和代谢途径等信息，并提供了在线工具分析数据。	DSEMR数据库的创新之处在于它不仅提供了特殊环境微生物的详细信息，还将这些信息与合成生物学部件相关联，为生物技术过程的创新和生物工程的发展提供了重要资源。	NA	研究和开发具有特殊基因型、生理功能和代谢产物的特殊环境微生物，以推动生物技术过程的创新和生物工程的发展。	特殊环境微生物及其在合成生物学中的应用。	合成生物学	NA	NA	NA	数据库	包含5268株来自620个属的特殊环境微生物，31种培养基和42,126个生物部件。
72	2024-08-07	Advances in synthetic biology toolboxes paving the way for mechanistic understanding and strain engineering of gut commensal Bacteroides spp. and Clostridium spp 2023-12, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108272 PMID:37844770	综述	本文综述了合成生物学工具在肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp.中的最新进展及其在解析微生物-宿主相互作用机制和工程化改造中的应用	介绍了针对Bacteroides spp.和Clostridium spp.的合成生物学工具的最新发展，以及这些工具在理解微生物-宿主相互作用中的应用	目前对微生物-宿主相互作用的分子机制了解有限，主要是由于大多数共生细菌缺乏有效的遗传工具	探讨合成生物学工具在理解小分子介导的微生物-宿主相互作用及其在生物医学工程中的应用	肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp.	合成生物学	NA	合成生物学工具	NA	NA	NA
73	2024-08-07	Seamless and orthogonal expression of genetic parts in polyhydroxyalkanoate (PHA)-producing bacterial chassis for plastic bio-upcycling applications 2023-Dec, MethodsX IF:1.6Q2 DOI:10.1016/j.mex.2023.102434 PMID:37846354	研究论文	本研究介绍了在生产聚羟基脂肪酸酯（PHA）的细菌中，通过无缝质粒构建实现重组PET水解酶（PETase）的正交表达	开发了无缝克隆和表达方法，利用SureVector（SV）系统生成pSV-Ortho-PHA（pSVOP）表达平台，实现了PETase在PHA生产细菌中的正交表达	NA	研究旨在开发一种无缝质粒构建方法，用于在PHA生产细菌中实现PETase的正交表达，以促进塑料生物升级循环应用	研究对象包括PHA生产细菌、PETase、遗传部件如Trc启动子、pBBR1复制起点、锚定蛋白和信号序列	合成生物学	NA	无缝克隆技术	NA	NA	NA