合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定了集胞藻PCC 7942中响应酸性胁迫的关键基因，并通过基因工程成功提高了其耐酸性 | 首次系统鉴定集胞藻PCC 7942中参与酸性胁迫响应的六个关键基因，并通过过表达chlL和chlN基因成功增强菌株耐酸性 | NA | 探究集胞藻PCC 7942的酸性胁迫响应机制并开展耐酸工程改造 | 集胞藻Synechococcus elongatus PCC 7942 | 合成生物学 | NA | RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 表型分析, 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除, 基因过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | NA | 工业生物技术 |
| 182 | 2025-10-05 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中植物多糖降解酶(PPDEs)的分布、功能、生物合成调控机制及高产菌株选育研究进展 | 系统总结了青霉菌PPDE生物合成调控机制的最新研究进展，并提出了通过合成生物学和代谢工程提高PPDE产量的新策略 | 作为小型综述，未包含所有相关研究，且主要关注青霉菌属 | 提高青霉菌植物多糖降解酶(PPDEs)的产量和效率，促进其工业化应用 | 青霉菌属真菌，特别是草酸青霉菌(Penicillium oxalicum) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 青霉菌 | NA | 工业生物技术, 能源 |
| 183 | 2025-10-05 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
|
综述 | 本文总结了利用合成生物学方法改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇效率的策略 | 系统综述了近年来通过基因工程技术改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的合成生物学策略 | NA | 提高从可再生资源微生物发酵生产异丁醇的效率 | 天然和非天然微生物宿主 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 微生物宿主 | 异丁醇生物合成途径 | 能源, 环境 |
| 184 | 2025-10-05 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
|
研究论文 | 本研究通过计算机合成生物学流程构建最小代谢网络，定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子 | 提出了网络效率决定因子这一新的功能基因类别，并开发了新的计算机合成生物学流程来构建最小代谢网络 | 研究主要基于计算机模拟，需要实验验证 | 通过最小化代谢网络来识别对代谢效率至关重要的基因 | 代谢网络中的基因和蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟、生物信息学分析 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | NA | 计算机合成生物学流程 | 酵母 | 最小代谢网络设计 | 工业生物技术 |
| 185 | 2025-10-05 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
|
综述 | 本文综述了目前可用于修饰和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 正在开发用户友好的合成生物学工具包，赋予R. eutropha菌株新能力 | NA | 开发适用于Ralstonia eutropha的合成生物学工具包 | Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)工业微生物 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator) | 代谢途径工程，生物传感器 | 工业生物技术，能源，材料 |
| 186 | 2025-10-05 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
|
研究论文 | 通过在大肠杆菌中表达合成操纵子olsFC生产鸟氨酸脂质，增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次在本身不编码鸟氨酸脂质合成能力的大肠杆菌中实现异源生产鸟氨酸脂质，并证明其能增强胁迫抗性 | 研究仅限于大肠杆菌模型，未在其他宿主中验证 | 通过改造大肠杆菌膜脂质组成增强其非生物胁迫抗性 | 工程化改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程化大肠杆菌菌株 | 合成操纵子表达 | 大肠杆菌 | olsFC合成操纵子表达系统，用于生产未修饰和羟基化鸟氨酸脂质 | 工业生物技术 |
| 187 | 2025-10-05 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
|
研究论文 | 本研究开发了能够体外选择性抑制IIS型限制性内切酶活性的重组DNA甲基化酶 | 成功表达并验证了非切换型和切换型甲基化酶对IIS型限制性内切酶活性的位点选择性抑制能力 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用验证 | 开发用于合成生物学和DNA组装技术的新型分子工具 | I型和II型限制修饰系统中的DNA甲基化酶 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、DNA甲基化分析、限制性内切酶消化 | NA | 酶活性分析数据 | 10种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 | His标签纯化、分子克隆 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 188 | 2025-10-05 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中构建了(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 设计了包含来自不同生物界源六种酶的工程化生物合成途径，结合合成生物学、生物催化和合成化学方法 | NA | 开发复杂吲哚生物碱的高效生物合成方法 | (+)-brevianamides A和B等含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程、生物催化 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 包含环二肽合成酶(NascA)、环二肽氧化酶(DmtD2/DmtE2)、异戊二烯基转移酶(NotF)、黄素依赖单加氧酶(BvnB)和激酶(PhoN和IPK)的五步生物合成途径 | 医药 |
| 189 | 2025-10-05 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
|
研究论文 | 开发了一种基于定向三链DNA的人工跨膜信号转导系统 | 首次使用胆固醇标记的定向三链DNA作为合成受体，通过pH驱动的构象变化实现跨膜信号转导 | NA | 构建模拟天然GPCR功能的人工信号转导系统 | 三链DNA合成受体和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、光切割、信号放大 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 三链DNA构象开关、逻辑门调制、信号放大回路 | 生物传感、细胞信号调控、靶向药物递送 |
| 190 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径，利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能，体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块，包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 191 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
|
研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII，研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII，未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术，SCRaMbLE系统，转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计，可诱导基因组重排系统 | 医学，基础研究 |
| 192 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库，能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子，在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子，转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 193 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
|
研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构，实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合，实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象，尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
| 194 | 2025-10-05 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
|
综述 | 本文综述了昆虫再生现象的分子机制，重点关注伤口愈合和组织再生过程 | 强调了表观遗传调控在再生过程中的关键作用，并探讨了从昆虫再生研究中获得的见解对再生医学和合成生物学的潜在贡献 | NA | 探索和回顾再生的分子基础，以促进再生医学的发展 | 昆虫纲不同目的再生能力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 合成生物学, 人类健康 |
| 195 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻中双顺反子转录本通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机理 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是实现双顺反子可调翻译的关键机制，并构建了可逆调控的双报告基因系统 | 研究主要集中于两种绿藻物种，机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻多顺反子基因的翻译机制 | 绿藻（衣藻和团藻）的双顺反子基因位点 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子位点数据集 | NA | 绿藻 | 合成双顺反子双报告基因系统（绿色荧光蛋白和荧光素酶） | 合成生物学 |
| 196 | 2025-10-05 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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荟萃分析 | 通过分析炎症性肠病患者的肠道微生物组，鉴定出与疾病相关的小分子及其对肠道通透性的影响 | 首次通过多队列分析发现梭菌来源的生物合成基因簇与IBD的关联，并解析了六种脂肪酸酰胺的结构和功能 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组和小分子代谢物 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序，合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个宏基因组样本（来自2,033名IBD患者和833名健康对照） | 合成生物学 | 小鼠 | NA | 医学 |
| 197 | 2025-10-05 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了合成最小细胞系统中信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的概念设计 | 通过囊泡系统人工重构了展示递归生长和分裂周期的合成最小细胞，避免了使用生物细胞中复杂的分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装体中产生，以及支撑这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的简化设计 | NA |
| 198 | 2025-10-05 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 开发了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器，将蛋白质-蛋白质邻近性转化为功能性CRISPR-Cas9基因编辑活性 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用，首次实现将蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导二聚化作为CRISPR基因编辑的触发机制 | 研究目前仅在人类细胞中进行验证，尚未在其他生物系统中测试 | 开发可编程的合成分子电路，将分子事件与基因组编辑连接起来 | 蛋白质-蛋白质相互作用、化学诱导二聚化、RNA传感器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、prime editing、base editing、ADAR-based RNA sensing | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 双组分引导RNA系统、分子邻近传感器、可编程输入输出电路 | 医学、工业生物技术 |
| 199 | 2025-10-05 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究开发了一种基于开源硬件的微流控工作流程，用于分析质粒在无抗生素选择压力下的稳定性 | 采用开源硬件微流控技术，通过凝胶微滴培养单细胞并利用荧光显微镜定量分析微菌落，实现了对质粒稳定性的高通量并行分析 | 目前研究主要使用大肠杆菌作为实验模型，在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发一种无需抗生素选择即可分析质粒稳定性的高通量方法 | 质粒在大肠杆菌中的稳定性 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、荧光蛋白表达 | NA | 荧光图像数据 | 大量微滴和微菌落的并行分析 | NA | 大肠杆菌 | 质粒表达的荧光蛋白生物传感器 | 工业生物技术 |
| 200 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因，通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因，并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能，未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程，将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |