合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
Integrated metabolite profiling and transcriptome analysis reveal candidate genes involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis solida
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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研究论文 | 本研究通过整合代谢物分析和转录组分析，揭示了延胡索中苄基异喹啉生物碱生物合成途径的关键候选基因 | 首次在延胡索中鉴定出两个OMT基因（CsOMT1和CsOMT2）的特定甲基化功能，明确了它们在苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的作用 | 仍有许多苄基异喹啉生物碱生物合成相关酶基因尚未被发现 | 阐明延胡索中苄基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 延胡索植物的不同组织 | 合成生物学 | NA | 代谢物分析，转录组分析 | NA | 代谢组数据，转录组数据 | 延胡索不同组织样本 | NA | 延胡索植物 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 202 | 2025-10-05 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造植物木质纤维素以降低其顽固性的最新进展 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略，在降低木质纤维素顽固性的同时减轻产量损失带来的生长缺陷 | 植物系统在工业应用中面临已建立的哺乳动物细胞培养体系的竞争，且木质纤维素途径复杂涉及大量基因 | 开发植物生物质的可持续利用方法，促进植物源性产品的市场化 | 植物木质纤维素（木质素、纤维素和半纤维素） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 木质素和结构聚糖的生物合成途径重新设计 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 203 | 2025-10-05 |
Distribution, biosynthesis, and synthetic biology of phenylethanoid glycosides in the order Lamiales
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文综述了唇形目植物中苯乙醇苷类化合物的分布、生物合成途径及合成生物学研究进展 | 系统总结了典型苯乙醇苷类化合物毛蕊花糖苷在150多个物种中的分布特征及其生物合成机制 | NA | 探讨苯乙醇苷类化合物的植物分布规律、生物合成路径及生物制造策略 | 唇形目植物中的苯乙醇苷类化合物 | 合成生物学 | NA | 生物合成、生物生产 | NA | 文献数据 | 涉及150多个植物物种 | NA | NA | NA | 医药 |
| 204 | 2025-10-05 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 通过理性蛋白质设计和定向进化开发了对它莫西芬响应的雌激素受体α变体TERRA | 结合理性蛋白质设计与多点位定向诱变，在酿酒酵母中通过定向进化成功改变了雌激素受体α的配体偏好性 | NA | 改变雌激素受体α的配体偏好性以扩展合成生物学工具的应用范围 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多点位定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞, 小鼠 | 配体响应型受体设计 | 医学, 合成生物学 |
| 205 | 2025-10-05 |
Between Centralization and Fragmentation: The Past, Present, and Future of Phage Collections
2024-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1089/phage.2023.0043
PMID:40114810
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综述 | 回顾噬菌体保藏库的历史与现状，探讨集中化与碎片化之间的平衡及其未来发展 | 首次系统梳理噬菌体保藏库的演变历程，并提出在合成生物学和人工智能引发范式转变前建立可持续、互联、公平的噬菌体银行基础设施 | 仅提供非详尽的噬菌体保藏库概览，未涉及具体技术实施方案 | 分析噬菌体保藏库的发展困境并探索未来建设方向 | 噬菌体保藏库和微生物保藏库 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 206 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2025-10-05 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
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研究论文 | 通过结构引导的蛋白质工程将倍半萜环化酶改造为α-红没药醇合酶 | 通过双点突变(F95S-F198S)成功将epi-异缬草烯合酶重新设计为能够生成醇类产物的α-红没药醇合酶 | 产物保真度中等(65%-74%)，需要进一步优化提高特异性 | 开发可用于合成生物学应用的设计型环化酶 | 倍半萜环化酶epi-异缬草烯合酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学、生化表征 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | 定点突变 | NA | 活性位点重塑以稳定中间体并定位水分子进行羟基化反应 | 工业生物技术 |
| 208 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质，具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构，将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合，并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 209 | 2025-10-05 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
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研究论文 | 本研究开发了改良的mini-Tn7转座子载体，通过添加诱导型和组成型启动子实现染色体整合基因的差异表达控制 | 在mini-Tn7转座子载体中整合了诱导型(Pcum)和组成型(PcL和Ptac)启动子，首次实现了染色体整合基因的可调控表达 | 目前仅在大肠杆菌K-12菌株MG1655中验证，尚未在其他革兰氏阴性菌中测试 | 开发能够实现染色体整合基因可控表达的转座子载体系统 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655及其染色体Tn7位点 | 合成生物学 | NA | Tn7转座子整合、基因克隆、荧光蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、荧光强度数据 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655 | Tn7转座子 | 大肠杆菌 | 启动子调控的基因表达系统，包括组成型表达和诱导型表达回路 | 工业生物技术,医学 |
| 210 | 2025-10-05 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本研究开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入，实现了高特异性等温信号放大 | NA | 扩展无细胞生物传感能力，开发高灵敏度生物传感器 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换，等温扩增 | 双平衡模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)信号放大电路，模块化生物传感器 | 生物技术 |
| 211 | 2025-10-05 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本研究构建了高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 首次构建了可持续生产该抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂，通过代谢工程和蛋白质工程策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶培养规模进行，尚未进行大规模发酵验证 | 开发高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 酿酒酵母工程菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 代谢物产量数据、酶活性数据 | NA | 代谢工程,蛋白质工程 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径和甾醇生物合成途径优化，转录因子Hac1和mA writer Ime4调控策略 | 农业,医药 |
| 212 | 2025-10-05 |
Towards the first synthetic eukaryotic cell
2024-Dec, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.11.001
PMID:40078978
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综述 | 本文全面探讨了合成真核细胞的设计原理、构建策略及技术突破，重点关注首个合成真核细胞的实现路径 | 系统整合多个人工设计合成的真核生物染色体，推动首个合成真核细胞的实现 | NA | 实现首个重新设计的合成真核细胞 | 真核生物染色体与合成细胞 | 合成生物学 | NA | DNA合成技术 | NA | NA | NA | Sc2.0项目提供的工程化细胞平台 | 酵母 | 真核染色体重新设计 | 医学,工业,农业,科研 |
| 213 | 2025-10-05 |
Cyberbiosecurity: Advancements in DNA-based information security
2024-Aug, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.06.002
PMID:40078663
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综述 | 探讨DNA作为信息存储介质带来的网络生物安全威胁及防控措施 | 首次系统阐述恶意代码通过人工合成DNA片段攻击计算机系统的网络生物安全新威胁 | NA | 为网络生物安全研究提供理论支持并提高风险防控意识 | DNA信息存储技术及其安全威胁 | NA | NA | DNA合成, DNA测序 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 信息安全, 生物安全, 国家安全 |
| 214 | 2025-10-05 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 总结基于智能荧光团的有序纳米结构在特定细胞器中的制备方法，用于高效生物成像和癌症诊疗应用 | 利用刺激响应机制在亚细胞器原位生成分子前体并形成超分子纳米结构，实现精准生物成像 | 未提及具体实验数据验证，主要聚焦于概念总结与展望 | 开发细胞器特异性智能超分子材料用于生物成像和诊疗应用 | 亚细胞器内的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 超分子自组装 | NA | 荧光成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 215 | 2025-10-05 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
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研究论文 | 开发了一种结合Transformer和GCN的深度学习模型DeepEnzyme，通过整合蛋白质序列和三维结构特征来预测酶转换数 | 首次将Transformer与图卷积网络结合，利用蛋白质三维结构特征提升对低序列相似度酶的kcat预测鲁棒性 | NA | 提高酶转换数(kcat)预测的准确性和鲁棒性 | 酶蛋白 | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列数据，三维结构数据 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程，合成生物学 |
| 216 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本研究揭示了子囊菌门真菌中细胞孢酮类化合物的生物合成途径 | 发现了细胞孢酮生物合成基因簇，阐明了S型芳香环环化机制和结构多样性生成机制 | 仅针对特定子囊菌门真菌进行研究，未涉及其他真菌类群 | 解析细胞孢酮类聚酮化合物的生物合成途径 | 子囊菌门丝状真菌及其细胞孢酮生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶重构 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 特定子囊菌门真菌 | 组合生物合成 | 子囊菌门丝状真菌 | 聚酮合酶对协作组装S型酰基二羟基苯乙酸核心结构 | 医药 |
| 217 | 2025-10-05 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本研究解析了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构并通过定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 首次报道BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变鉴定了控制酶活性和底物选择性的关键决定因素 | NA | 阐明BcmA酶活性和底物选择性的结构基础和决定因素 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA及其底物特异性 | 结构生物学 | NA | 晶体结构解析、定点突变 | NA | 结构数据、突变分析数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 合成生物学 |
| 218 | 2025-10-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 研究硫原子替换对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响 | 首次系统研究将生物素四氢噻吩环替换为氧杂环或氮杂环对其结合性能的影响，并发现氮杂生物素具有pH依赖性结合特性 | 仅研究了有限的几种类似物，未进行体内验证实验 | 开发适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 生物素类似物（氧杂生物素、氮杂生物素、N-甲基氮杂生物素）与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、荧光滴定实验、晶体学分析 | NA | 分子模拟数据、荧光结合数据 | 三种生物素类似物 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 219 | 2025-10-05 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文揭示了同义密码子替换通过调控反义RNA产生影响上游基因转录和翻译的机制 | 首次发现编码序列内部的同义密码子替换可通过产生长链反义RNA影响邻近基因表达，且能绕过天然转录抑制机制 | 研究仅基于质粒系统，未在完整细菌基因组中验证；仅测试了9种重编码序列中的4种显示效应 | 探究同义密码子替换对邻近基因表达的跨基因调控作用 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | 基因重编码、RNA转录分析、蛋白质表达检测 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据、蛋白质定量数据 | 9种同义重编码的cat基因序列 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学 |
| 220 | 2025-10-05 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 通过改进葡萄糖6-磷酸脱氢酶变体提高酵母NADPH水平以增强类异戊二烯产量 | 首次采用基因融合策略将G6PD与下游酶6PGL或HMG-CoA还原酶融合，并通过理性诱变获得活性提高的G6PD突变体 | 融合酶活性略低于野生型酶 | 提高NADPH生成效率以增强酵母类异戊二烯生物合成 | 葡萄糖6-磷酸脱氢酶(G6PD)及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性诱变、遗传筛选 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 多种G6PD变体和融合酶构建体 | 基因融合 | 酵母 | 戊糖磷酸途径代谢工程 | 工业生物技术 |