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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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221 | 2024-11-29 |
Regioselectivity switches between anthraquinone precursor fissions involved in bioactive xanthone biosynthesis
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06369d
PMID:39568878
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研究论文 | 研究了生物活性黄酮类化合物的生物合成途径,特别是如何切换蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性 | 首次揭示了通过BruN和BruM酶的协同作用,实现蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性切换 | NA | 探讨生物活性黄酮类化合物的生物合成机制,特别是蒽醌前体在不同键断裂之间的选择性 | 蒽醌前体在生物活性黄酮类化合物生物合成中的键断裂选择性 | 生物化学 | NA | 多蛋白序列比对、定向蛋白质进化、理论模拟、化学捕获、O追踪、X射线晶体结构分析 | NA | 蛋白质序列、化学结构 | NA |
222 | 2024-11-29 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-Nov-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 本文开发了一种由DNA折纸体素组成的可编程3D连接模块化系统,展示了多功能的DNA折纸体素池,并实现了快速可逆的结构重构 | 提出了一种新的DNA折纸体素模块化系统,能够实现快速和可逆的3D结构重构,并通过多步装配路径提高了产量 | 当前合成系统在分级装配中的产量较低,且在快速和高效重构不同结构方面存在挑战 | 开发一种能够实现复杂3D纳米结构和设备快速自组装的生物启发式自组装方法 | DNA折纸体素及其在纳米材料和纳米机器人系统中的应用 | 纳米技术 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 最多12种独特的DNA折纸体素,组装成50种结构 |
223 | 2024-11-29 |
Construction of engineered probiotic that adhere and display nanobody to neutralize porcine reproductive and respiratory syndrome virus
2024-Nov-14, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04198-8
PMID:39540965
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研究论文 | 研究构建了一种工程益生菌,能够在表面粘附并展示纳米抗体以中和猪繁殖与呼吸综合征病毒 | 首次提出了一种结合粘附蛋白和纳米抗体的工程益生菌构建策略,具有粘附和中和病毒的双重效果 | NA | 开发一种新型工程益生菌,用于预防和治疗猪繁殖与呼吸综合征病毒感染 | 猪繁殖与呼吸综合征病毒、益生菌L. plantarum和E. coli | 合成生物学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 合成生物学技术 | NA | 基因组数据 | NA |
224 | 2024-11-29 |
Different transcriptomic and metabolomic analysis of Saccharomyces cerevisiae BY4742 and CEN.PK2-1C strains
2024-Nov-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04178-y
PMID:39508902
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研究论文 | 研究了两种酵母菌株Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C的转录组和代谢组差异 | 首次系统分析了这两种酵母菌株在代谢和转录水平上的差异 | 研究仅限于两种特定的酵母菌株,结果可能不适用于其他酵母菌株 | 探讨不同酵母菌株间的转录和代谢变化,为高效酵母细胞工厂的建立提供基础 | Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C菌株 | NA | NA | 转录组分析和代谢组分析 | NA | 转录组数据和代谢组数据 | 两种酵母菌株 |
225 | 2024-11-27 |
Optimisation of coumaric acid production from aromatic amino acids in Kluyveromyces marxianus
2024-Dec-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.11.002
PMID:39522732
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研究论文 | 研究利用合成生物学工具优化Kluyveromyces marxianus生产香豆酸的过程 | 通过合成生物学方法,成功构建了能够高效生产香豆酸的Kluyveromyces marxianus菌株,并优化了其代谢途径 | 工程菌株在生物反应器中面临氧化还原平衡挑战,需要进一步优化以适应工业条件 | 开发可持续的生物工艺平台,优化酵母生产香豆酸的效率 | Kluyveromyces marxianus菌株及其生产香豆酸的代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
226 | 2024-11-27 |
Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了蓝藻光敏色素(CBCR)的谱调谐、光转换和光生物学特性及其在合成生物学中的应用 | 本文介绍了CBCR在近紫外到近红外范围内的多样性光循环及其在蓝细菌光生物学中的多方面调控作用 | NA | 探讨蓝藻光敏色素的进化、光转换机制及其在合成生物学中的应用 | 蓝藻光敏色素(CBCR)及其在光生物学中的作用 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
227 | 2024-11-26 |
[Removal, detection, and limits of endotoxin in the industry of recombinant proteins]
2024-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240051
PMID:39584330
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综述 | 本文综述了重组蛋白生产过程中内毒素的去除、检测及其限值设定 | 总结了不同行业中重组蛋白产品的内毒素限值,并强调了无论表达宿主是否为细菌,注射用重组蛋白的最终产品都需要进行内毒素检测 | NA | 为重组蛋白大规模生产过程中内毒素的研究提供参考 | 重组蛋白生产过程中的内毒素去除、检测及其限值设定 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
228 | 2024-11-26 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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研究论文 | 本文通过设计和合成酵母染色体XIII,研究了其在复制衰老中的作用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统获得了具有延长寿命的合成酵母菌株 | NA | 研究合成酵母染色体在复制衰老中的作用 | 酵母染色体XIII及其在复制衰老中的作用 | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 转录组数据 | 20株SCRaMbLEd synXIII菌株 |
229 | 2024-11-24 |
Biosensing strategies using recombinant luminescent proteins and their use for food and environmental analysis
2024-Dec, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-024-05552-x
PMID:39325139
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综述 | 本文综述了基于重组发光蛋白(RLPs)的生物传感策略及其在食品和环境分析中的应用 | 本文介绍了新型融合蛋白和优化表达系统,以提高发光生物传感器的稳定性、亮度和光谱特性 | 本文未提及具体的实验数据或技术细节 | 综述基于重组发光蛋白的生物传感技术在食品和环境监测中的最新进展 | 重组发光蛋白及其在生物传感器中的应用 | 生物技术 | NA | 重组发光蛋白 | NA | NA | NA |
230 | 2024-11-19 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2024-Nov-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文综述了甘草属植物的分类、药理学、活性成分生物合成和合成生物学 | 整合了来自不同领域的知识,提供了一个全面理解甘草属植物的独特视角 | NA | 提供一个全面的视角,为未来的分子育种和合成生物学研究奠定基础 | 甘草属植物的分类、活性成分及其药理活性、甘草的组学、活性化合物的生物合成途径和代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
231 | 2024-11-24 |
Bottom-up synthetic immunology
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01744-9
PMID:39187581
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研究论文 | 本文探讨了自下而上的合成免疫学作为治疗和预防传染病及癌症的新兴领域 | 提出了一种基于纳米技术的自下而上合成免疫学方法,以克服传统基因工程免疫细胞的局限性 | 目前主要限于体外应用,且受到免疫功能固有的复杂调控机制的限制 | 探索利用纳米技术进行免疫系统工程化的新方法,以改善预防和治疗策略 | 传染病和癌症的免疫机制 | 合成生物学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
232 | 2024-11-24 |
Rewiring gene circuitry for plant improvement
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01806-7
PMID:39075207
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综述 | 本文综述了在特定细胞中,随着发育和响应时间的推移,基因调控活动的最新进展及其对植物表型变异的影响 | 介绍了新的合成生物学工具和基因编辑技术,这些技术允许对转基因进行可调节的时空调控,并能够操纵内源基因的调控 | NA | 探讨如何通过重新布线基因电路来解决农业、能源和环境中的最大挑战 | 植物基因调控活动及其对表型的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
233 | 2024-11-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 本文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制 | 提出了酶通过相分离自组织成近似最优大小和间隔的集群,并通过数学模型验证了其对代谢通量和毒性代谢物的显著改善 | 主要基于数学模型研究,缺乏实验验证 | 研究酶集群在细胞内的最优组织方式及其对代谢效率的影响 | 酶集群的形成机制及其对代谢通量和毒性代谢物的影响 | 代谢工程 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
234 | 2024-11-23 |
Enzyme cascades for in vitro and in vivo FMN prenylation and UbiD (de)carboxylase activation under aerobic conditions
2024, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2024.10.015
PMID:39572138
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研究论文 | 本文介绍了在有氧条件下使用酶级联系统进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD(脱)羧酶激活的两种方法 | 开发了在有氧条件下进行FMN法尼基化和UbiD激活的稳健方法,以促进异源活性UbiD酶的生产 | 目前对FMN法尼基化和UbiD激活的实验复杂性了解有限,导致重组UbiD酶的活性不足 | 开发高效的方法进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD激活,以促进活性UbiD酶的异源生产 | UbiD(脱)羧酶及其辅因子FMN的法尼基化 | 生物催化 | NA | 酶级联系统 | NA | NA | 使用重组大肠杆菌细胞进行实验 |
235 | 2024-11-22 |
Superior Photostability of the Unnatural Base 6-Amino-5-nitropyridin-2-ol: A Case Study Using Ultrafast Broadband Fluorescence, Transient Absorption, and Theoretical Computation
2024-Nov-21, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.4c02751
PMID:39526600
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研究论文 | 研究了非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z)在不同溶剂中的激发态动力学 | 首次全面研究了Z的激发态动力学,发现其具有优越的光稳定性 | NA | 探讨非天然碱基Z的光稳定性及其在生物和环境应用中的潜力 | 非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z) | NA | NA | 超快宽带时间分辨荧光光谱和瞬态吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
236 | 2024-11-22 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
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研究论文 | 本文研究了使用平衡和不平衡数据集训练卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM)对CRISPR sgRNA活性的预测效果 | 通过在训练集中添加合成sgRNA,提高了在不平衡数据集上预测sgRNA活性的准确性 | 未提及 | 探讨平衡训练集对深度学习模型预测CRISPR sgRNA活性的影响 | CRISPR-Cas12a筛选数据生成的平衡和不平衡数据集 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas12a筛选 | 卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM) | 文本 | 未提及具体数量 |
237 | 2024-11-22 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究进展,重点介绍了古代代谢途径及其在生物创新重建中的应用 | 本文整合了微生物学、古生物学和进化合成生物学,形成了一个新兴的跨学科领域,用于重建古代生物创新 | 将分子遗传学、群体生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物研究仍然是一个重大挑战 | 探讨早期微生物生命的进化及其对地球生态系统的影响 | 早期微生物生命及其代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
238 | 2024-11-21 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2024-Nov-14, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程酵母的新技术,用于从工业废水中去除铅 | 开发了一种新的操作技术,基于工程酵母的机制理解和响应面优化方法,解决了大规模处理污染物的高操作成本和技术限制问题 | NA | 解决铅污染问题,降低操作成本,实现工程酵母在工业应用中的规模化 | 工程酵母、铅污染的工业废水 | 生物工程 | NA | 基因敲除、响应面优化 | NA | NA | NA |
239 | 2024-11-21 |
High-throughput development and characterization of new functional nanobodies for gene regulation and epigenetic control in human cells
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621523
PMID:39554150
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研究论文 | 开发并表征用于基因调控和表观遗传控制的新型功能性纳米抗体 | 开发了一种新方法,通过酵母展示和高通量筛选,生成针对人类染色质调节因子的小型纳米抗体,用于基因表达的抑制或激活 | NA | 开发新的纳米抗体用于基因表达和染色质状态的调控 | 人类细胞中的基因表达和染色质状态 | NA | NA | 酵母展示 | NA | NA | 数十个功能性纳米抗体 |
240 | 2024-11-20 |
The Enigma of Transcriptional Activation Domains
2024-Nov-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168766
PMID:39214280
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review | 本文综述了真核基因激活域(ADs)的机制模型,提出了一种基于表面活性剂样近随机交互作用的新模型 | 提出了基于表面活性剂样近随机交互作用的新机制模型,与传统生物化学原理不同 | NA | 重新思考和解释真核基因激活域的功能机制 | 真核基因激活域及其与基因启动子核小体的交互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |