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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本研究揭示了子囊菌门真菌中细胞孢酮类化合物的生物合成途径 | 发现了细胞孢酮生物合成基因簇,阐明了S型芳香环环化机制和结构多样性生成机制 | 仅针对特定子囊菌门真菌进行研究,未涉及其他真菌类群 | 解析细胞孢酮类聚酮化合物的生物合成途径 | 子囊菌门丝状真菌及其细胞孢酮生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶重构 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 特定子囊菌门真菌 | 组合生物合成 | 子囊菌门丝状真菌 | 聚酮合酶对协作组装S型酰基二羟基苯乙酸核心结构 | 医药 |
| 242 | 2025-10-05 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本研究解析了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构并通过定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 首次报道BcmA的晶体结构,并通过结构比较和系统定点突变鉴定了控制酶活性和底物选择性的关键决定因素 | NA | 阐明BcmA酶活性和底物选择性的结构基础和决定因素 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA及其底物特异性 | 结构生物学 | NA | 晶体结构解析、定点突变 | NA | 结构数据、突变分析数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 合成生物学 |
| 243 | 2025-10-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 研究硫原子替换对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响 | 首次系统研究将生物素四氢噻吩环替换为氧杂环或氮杂环对其结合性能的影响,并发现氮杂生物素具有pH依赖性结合特性 | 仅研究了有限的几种类似物,未进行体内验证实验 | 开发适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 生物素类似物(氧杂生物素、氮杂生物素、N-甲基氮杂生物素)与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、荧光滴定实验、晶体学分析 | NA | 分子模拟数据、荧光结合数据 | 三种生物素类似物 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 244 | 2025-10-05 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
|
研究论文 | 本文揭示了同义密码子替换通过调控反义RNA产生影响上游基因转录和翻译的机制 | 首次发现编码序列内部的同义密码子替换可通过产生长链反义RNA影响邻近基因表达,且能绕过天然转录抑制机制 | 研究仅基于质粒系统,未在完整细菌基因组中验证;仅测试了9种重编码序列中的4种显示效应 | 探究同义密码子替换对邻近基因表达的跨基因调控作用 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | 基因重编码、RNA转录分析、蛋白质表达检测 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据、蛋白质定量数据 | 9种同义重编码的cat基因序列 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学 |
| 245 | 2025-10-05 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 通过改进葡萄糖6-磷酸脱氢酶变体提高酵母NADPH水平以增强类异戊二烯产量 | 首次采用基因融合策略将G6PD与下游酶6PGL或HMG-CoA还原酶融合,并通过理性诱变获得活性提高的G6PD突变体 | 融合酶活性略低于野生型酶 | 提高NADPH生成效率以增强酵母类异戊二烯生物合成 | 葡萄糖6-磷酸脱氢酶(G6PD)及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性诱变、遗传筛选 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 多种G6PD变体和融合酶构建体 | 基因融合 | 酵母 | 戊糖磷酸途径代谢工程 | 工业生物技术 |
| 246 | 2025-10-05 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
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研究论文 | 结合微生物代谢途径与钯催化过程在活体生物中原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 首次将微生物发酵过程与钯催化的Heck反应结合,实现生物代谢与化学催化在活体系统中的协同作用 | NA | 开发生物代谢与化学催化相结合的新方法,用于原位调控生物活性 | 工程化大肠杆菌代谢产物与共轭寡聚物的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、Pd催化Heck反应 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 代谢途径工程,将葡萄糖转化为苯乙烯 | 医药, 工业生物技术 |
| 247 | 2025-10-05 |
Information Transmission through Biotic-Abiotic Interfaces to Restore or Enhance Human Function
2024-06-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c00435
PMID:38729914
|
综述 | 本文提出了一个模块化框架,用于定义和描述生物-非生物界面的工程设计,以促进通过光或电实现信息传输,从而恢复或增强人类功能 | 开发了统一的模块化框架来系统描述生物-非生物界面工程,整合了合成生物学、材料科学和电子工程等多学科技术 | NA | 通过生物-非生物界面信息传输技术恢复或增强人类功能 | 神经元细胞、视网膜、脊髓损伤患者、神经系统 | 生物医学工程 | 脊髓损伤、视网膜盲症、神经系统疾病 | 合成生物学、电生理学、光遗传学、脑机接口 | NA | 电信号、光信号 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 光敏感蛋白工程、神经信号控制电路、生物传感器 | 医学 |
| 248 | 2025-10-05 |
CRISPR-Mediated rDNA Integration and Fluorescence Screening for Pathway Optimization in Pichia pastoris
2024-Dec-26, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00104
PMID:39975573
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR的rDNA整合和荧光筛选方法(CRISPO),用于在毕赤酵母中进行多拷贝途径优化 | 建立了单步、无抗生素的多拷贝途径整合方法,利用荧光蛋白作为筛选标记可视化限速步骤 | NA | 优化异源基因和途径在毕赤酵母中的表达性能 | 香叶醇生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 荧光信号,代谢产物浓度 | NA | CRISPR-Cas9 | 毕赤酵母 | 甘油诱导/葡萄糖抑制启动子(CRISPOi)和强组成型启动子(CRISPOc)驱动的荧光报告系统,甲羟戊酸途径优化 | 工业生物技术 |
| 249 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production of l-Homoserine
2024-Apr-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.3c00077
PMID:39974203
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综述 | 总结大肠杆菌生产L-高丝氨酸的系统代谢工程策略进展 | 系统总结并比较了通过阻断竞争降解途径、强化关键酶和前体、改造转运系统等代谢工程策略提高L-高丝氨酸产量的方法 | NA | 提高微生物发酵生产L-高丝氨酸的产量和效率 | 大肠杆菌代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,包括阻断竞争降解途径、强化关键酶和前体、改造转运系统 | 工业生物技术 |
| 250 | 2025-10-05 |
Artificial structural proteins: Synthesis, assembly and material applications
2024-03, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107162
PMID:38308999
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综述 | 本文总结了仿生结构蛋白质的设计生产方法、化学修饰及多尺度组装策略,并探讨其功能定制与应用前景 | 系统阐述如何通过序列和构象编码机械性能,实现从仿生到超越天然结构蛋白质性能的研究视角 | 受生物合成固有局限性和复杂宏观组装模拟难度的制约 | 开发具有优异性能的定制化结构蛋白质及组装体 | 仿生结构蛋白质及其组装体 | 合成生物学 | NA | 模块化蛋白质工程、多肽修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 军事 |
| 251 | 2025-10-05 |
Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024
PMID:37989314
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过重定向E3连接酶来降解特定蛋白的双功能融合蛋白,用于增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效果 | 开发了能够桥接靶蛋白与E3连接酶的双功能降解蛋白,实现了条件性、多特异性的内源蛋白降解 | NA | 克服CAR T细胞疗法中的抑制信号,增强抗肿瘤效力 | CAR T细胞、SMAD依赖性TGFβ信号通路 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质工程、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学平台 | T细胞 | 诱导型降解转基因表达系统、小分子依赖性E3招募系统 | 医学 |
| 252 | 2025-10-05 |
Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007
PMID:37832551
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研究论文 | 本研究揭示了血链球菌通过非典型ComCDE回路整合环境信号调控转化结果的机制 | 发现血链球菌中新型的 competence-predation 协调机制,其ComCDE回路缺少其他链球菌的关键组分,并鉴定出ComCDE依赖性细菌素基因座 | NA | 解析血链球菌非典型ComCDE回路的环境信号整合机制及其对转化结果的影响 | 血链球菌(Streptococcus sanguinis)的ComCDE调控回路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学器件 | 血链球菌 | 连接CSP切割和输出的合成生物学装置,具有可量化读数 | 基础研究 |
| 253 | 2025-10-05 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究进展,并探讨了组学技术在药物开发和农业生物技术中的应用潜力 | 将新兴的草药基因组学应用于罂粟科药用植物研究,整合多组学数据解析药用活性成分的生物合成途径 | NA | 通过组学技术揭示药用植物的遗传信息和调控网络,促进药用植物的定向育种和合成生物学应用 | 罂粟科药用植物,包括罂粟和白屈菜等含乳胶植物 | 生物信息学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 罂粟科植物 | 次生代谢物生物合成途径 | 医药, 农业生物技术 |
| 254 | 2025-10-05 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本研究通过定向内共生方法在酵母细胞内引入光合蓝细菌,构建能进行光合固碳的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了定向内共生方法将光合固碳能力引入酵母,无需传统代谢工程和实验室进化 | NA | 将异养酵母转化为具有光合自养能力的生物 | 芽殖酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 蓝细菌 | 光合固碳和糖分泌系统 | 可持续生物技术, 工业生物技术 |
| 255 | 2025-10-05 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
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研究论文 | 开发了一种通过增加细胞糖磷酸盐水平来增强工程代谢途径中辅因子供应的通用方法 | 利用木糖还原酶/乳糖系统在不显著干扰细胞代谢的情况下提高多种辅因子的生物合成前体水平 | 葡萄糖脱氢酶系统的产量提升效果不如木糖还原酶系统 | 解决代谢工程细胞中辅因子不平衡问题,提高工程代谢途径的生产效率 | 大肠杆菌代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | 非靶向代谢组学分析,转录组学分析 | NA | 代谢组数据,转录组数据 | 三种不同的代谢工程细胞系统(脂肪醇生物合成、生物发光光生成和烷烃生物合成) | NA | 大肠杆菌 | 辅因子生物合成途径工程,代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 256 | 2025-10-05 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究利用植物副逆转录病毒遗传资源开发了一种高效的三元合成启动子MFH17,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 首次将三种副逆转录病毒来源的启动子元件(MMV、FMV、HRLV)通过理性设计和DNA改组技术组合成新型三元杂交启动子MFH17 | NA | 开发适用于高水平基因表达的高效合成启动子,丰富植物组成型启动子库 | 植物副逆转录病毒启动子元件及其合成变体 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术、转基因技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因拟南芥和烟草植物 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 拟南芥, 烟草 | 组成型启动子设计,包含as-1元件的合成启动子 | 农业, 工业生物技术 |
| 257 | 2025-10-05 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
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研究论文 | 开发了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习循环 | 将静态机器人平台转变为动态平台,实现无需人工干预的自主测试-学习循环 | 仅使用绿色荧光蛋白作为目标产物进行评估,未涉及更复杂的生物系统 | 建立完全自动化的设计-构建-测试-学习循环来优化细菌系统的诱导条件 | 细菌系统中的诱导浓度优化和诱导剂与饲料释放的组合优化 | 合成生物学 | NA | 机器人平台自动化技术 | 探索与利用平衡的优化算法 | 测量数据 | NA | 机器人平台 | 细菌 | 诱导表达系统 | 工业生物技术 |
| 258 | 2025-10-05 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
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研究论文 | 通过调查分析公众对基因技术用于入侵害虫控制的态度、参与偏好和信息需求 | 首次将公众对基因技术的态度分为四个细分群体,并针对不同群体提出差异化的公众参与策略 | 样本仅来自澳大利亚,可能无法代表其他国家的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵害虫控制的认知和态度,探索公众参与路径和信息需求 | 1149名澳大利亚公众 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查问卷数据 | 1149名澳大利亚受访者 | NA | NA | NA | 环境 |
| 259 | 2025-10-05 |
Making Neurobots and Chimerical Ctenophores
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620631
PMID:39554129
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研究论文 | 利用栉水母作为模型构建嵌合动物和神经机器人 | 发现栉水母的自我识别特征和祖神经-免疫结构,首次实现三种栉水母物种的神经机器人和嵌合动物构建 | 未明确说明实验构建的神经机器人和嵌合动物的具体功能特性和长期存活能力 | 探索利用生物材料构建活体机器的可能性 | 栉水母(三种物种)的神经和免疫系统 | 合成生物学 | NA | 生物工程 | NA | 实验数据 | 三种栉水母物种 | NA | 栉水母 | 混合神经系统和完整动物的实验构建 | 生物医学 |
| 260 | 2025-10-05 |
Advanced probiotics: bioengineering and their therapeutic application
2024-Feb-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09309-8
PMID:38403783
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综述 | 本文综述了通过合成生物学技术改造益生菌的方法及其在治疗炎症性肠病、癌症等疾病中的应用 | 系统阐述基因编辑技术在益生菌工程化中的应用,开发具有增强耐受性和特定功能的新一代设计型益生菌 | NA | 概述改造益生菌的基因编辑技术方法及其治疗应用的科学原理 | 乳酸菌等益生菌 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 癌症, 细菌感染, 代谢疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 生物传感器, 代谢通路 | 医药 |