合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-05 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
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综述 | 探讨生物组织自组织模式在胚胎发育和成体组织中的形成机制及其在健康与疾病中的作用 | 提出自组织模式生成是组织稳态和修复的核心机制，并探索通过工程化模式驱动分子回路应用于合成生物学和类器官构建 | NA | 综述组织自组织模式的形成原理及其在生理和病理条件下的作用 | 胚胎组织和成体组织的自组织模式 | 发育生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式驱动分子回路 | 医学、合成生物学 |
| 262 | 2025-10-05 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本研究开发并验证了pXpressome工具包，用于稳健表达和改造α-羧酶体 | 开发了首个能够稳定表达完整功能性α-羧酶体的质粒工具包，并发现通过调节顶点和面形成蛋白比例可理性调控羧酶体形态 | NA | 开发合成生物学工具包以促进羧酶体研究和重新设计 | α-羧酶体及其组成蛋白 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记、蛋白质纯化 | NA | 蛋白质表达数据、形态学观察数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 羧酶体合成途径、纳米封装平台 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 263 | 2025-10-05 |
Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52533-w
PMID:39294165
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研究论文 | 提出基于几何图学习的酶功能预测模型GraphEC，通过ESMFold预测结构和预训练蛋白质语言模型准确预测EC编号、活性位点和最适pH | 首次将几何图学习应用于酶功能预测，结合ESMFold预测结构和活性位点信息，并通过标签扩散算法整合同源信息提升预测性能 | 依赖ESMFold预测的蛋白质结构准确性，未明确说明模型在哪些特定酶类别上表现较差 | 开发更准确的酶功能预测方法，特别关注酶活性位点和结构特征的重要性 | 酶蛋白质及其功能特征（EC编号、活性位点、最适pH） | 生物信息学 | NA | 几何图学习、ESMFold结构预测、蛋白质语言模型、标签扩散算法 | 图神经网络 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因组学 |
| 264 | 2025-10-05 |
Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching
2024-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52282-w
PMID:39289346
|
研究论文 | 本研究通过重编程酵母交配型转换机制实现可调控的细胞分化，促进合成微生物群落形成与协作 | 将天然酵母交配型转换机制改造为可诱导单倍体群体不对称性分化的遗传逻辑门 | NA | 开发可调控细胞分化的合成生物学方法以促进微生物群落协作 | 酿酒酵母单倍体群体 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | NA | NA | 遗传电路设计 | 酿酒酵母 | 基于交配型转换机制的可调谐分化逻辑门 | 工业生物技术 |
| 265 | 2025-10-05 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究生物能量应激如何增强细菌的抗生素耐药性和持久性 | 首次构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统，揭示了生物能量应激通过增强活性氧产生、诱变断裂修复和转录偶联修复促进抗生素耐药性进化的新机制 | 研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他细菌物种中验证 | 探究抗生素诱导的生物能量应激对治疗结果的影响机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统 | 医学 |
| 266 | 2025-10-05 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
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研究论文 | 本研究利用RNA折纸技术开发了一种名为'Traptamer'的RNA机器人装置，能够机械捕获并释放荧光适配体iSpinach | 首次将RNA折纸技术应用于创建具有传感、计算和执行功能的RNA机器人装置，实现了对RNA功能的可逆控制 | 目前仅为原型验证阶段，尚未在细胞系统中进行功能验证 | 开发能够感知、计算和执行的先进RNA机器人装置以增强对分子过程的控制 | RNA纳米机器人装置及其对荧光适配体的控制机制 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术, 冷冻电镜 | 布尔AND门逻辑电路 | 结构数据, 荧光数据 | NA | RNA折纸 | NA | 具有传感、计算和执行模块的RNA机器人装置，能够可逆控制荧光适配体功能 | 医学, 合成生物学 |
| 267 | 2025-10-05 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-02-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法调控细胞因子信号以增强CAR-T细胞功能并减少相关毒性的最新策略 | 系统总结了通过基因工程调控细胞因子信号通路来增强CAR-T细胞疗效和减轻毒副作用的新型合成生物学方法 | NA | 改善CAR-T细胞疗法的疗效和安全性 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T细胞） | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 基因工程、转录和表观遗传修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类T细胞 | 细胞因子信号通路调控、自分泌信号增强、合成信号分子 | 医学 |
| 268 | 2025-10-05 |
Enhancing the safety of CAR-T cell therapy: Synthetic genetic switch for spatiotemporal control
2024-02-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj6251
PMID:38394207
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综述 | 总结合成生物学方法在CAR-T细胞疗法时空控制方面的最新进展 | 提出基于合成基因工程的CAR-T细胞控制模块，实现时空维度的精准调控 | NA | 增强CAR-T细胞疗法的可控性和安全性 | CAR-T细胞疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程技术 | NA | NA | NA | NA | 人工细胞或生物体 | 合成基因开关 | 医学 |
| 269 | 2025-10-05 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
|
研究论文 | 提出合成生物学中的开放式设计方法，强调设计新颖性与功能目标同等重要 | 将开放式设计理念引入合成生物学，主张设计新颖性至少与功能实现同等重要，突破传统目标导向设计的局限 | NA | 探索合成生物学中开放式设计方法，推动生物设计的持续创新 | 合成生物学设计方法论 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 270 | 2025-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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研究论文 | 本研究揭示了水包油乳液中脂滴在酶促反应触发下表现出的内吞样行为及其功能应用 | 首次发现脂肪酶触发的人工脂滴内吞样行为，并阐明其由界面张力降低和膜压缩力增加驱动的机制 | NA | 探索人工脂滴的生物物理动态行为及其在合成生物学中的应用 | 水包油乳液脂滴 | 合成生物学 | NA | 酶促反应分析 | NA | 生物物理数据 | NA | NA | NA | 人工脂滴系统 | 工业生物技术,材料 |
| 271 | 2025-10-05 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了铁硫酶在合成生物学应用中面临的三大核心挑战及相应解决方案 | 系统归纳了铁硫酶在工程化代谢途径中的三大瓶颈问题，并提出蛋白质结构预测与设计技术有望突破这些难题 | 主要基于文献综述，缺乏实验验证数据 | 开发铁硫酶在合成生物学中的可靠工具包，加速工业级生物合成路径的开发 | 铁硫酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测与设计 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 铁硫酶依赖的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 272 | 2025-10-05 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文全面探讨了蛇毒研究领域的最新技术进展，重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 整合合成生物学与多组学方法（统称为毒液组学），深入揭示毒液功能及其治疗潜力 | 毒素功能表征和低成本抗蛇毒血清开发仍面临挑战 | 探索蛇毒分析技术及其生物医学应用 | 蛇毒及其毒素 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 冷冻电镜, mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 273 | 2025-10-05 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
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研究论文 | 本研究系统分析了生长反馈对适应性基因电路的影响，揭示了电路失效的动力学机制 | 发现了生长反馈下电路失效的三种动力学机制，并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构 | 研究主要基于计算模拟，需要实验验证 | 理解生长反馈对合成基因电路的影响机制，识别鲁棒性电路拓扑 | 转录调控适应性基因电路 | 合成生物学 | NA | 计算模拟，系统拓扑分析 | 动力学模型 | 模拟数据 | 400多种电路拓扑结构 | NA | NA | 适应性基因电路，转录调控网络 | 工业生物技术 |
| 274 | 2025-10-05 |
Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051
PMID:38700978
|
研究论文 | 本文提出了一种在体外结合脂肪酸合成和无细胞基因表达合成磷脂的完整实验方案 | 开发了整合脂肪酸合成与无细胞基因表达系统的体外磷脂合成方法，可在一天内完成反应并通过LC-MS进行定量分析 | NA | 建立体外磷脂合成和定量分析的标准化实验流程 | 磷脂生物分子 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS), 无细胞基因表达 | NA | 质谱数据 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 脂肪酸合成与酰基转移酶表达系统 | 合成生物学, 生物燃料 |
| 275 | 2025-10-05 |
Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds
2024-08, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597
PMID:39029799
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综述 | 本文总结了通过细胞膜工程策略构建高柔性细胞膜以促进脂溶性化合物高效生产的研究进展 | 系统归纳了通过构建人工储存区室和改造细胞膜结构两种主要策略增强细胞膜柔性的创新方法 | NA | 探索通过细胞膜工程突破脂溶性化合物生产上限的有效策略 | 微生物细胞工厂中的细胞膜工程 | 合成生物学 | NA | 膜工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 276 | 2025-10-05 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 通过重编程大肠杆菌碳储存调控网络，开发了可实现复杂转录后控制的多层遗传电路 | 利用天然Csr网络相互作用构建转录后逻辑门，实现了在三种工业相关细菌中的跨物种移植 | NA | 开发可编程的转录后调控工具以实现复杂细菌调控 | 大肠杆菌碳储存调控网络及其在工业细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 缓冲门、非门、双向调节器、布尔逻辑门（或门、或非门、与门、与非门）和脉冲发生电路 | 工业生物技术 |
| 277 | 2025-10-05 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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综述 | 本文全面概述了细菌无细胞系统中使用的天然和工程化调控组件及其应用 | 系统总结了无细胞系统中调控组件的功能复杂性增长需求，涵盖天然和工程化两类调控组件 | NA | 为细菌无细胞系统工程提供调控组件的全面概述 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 调控网络、基因电路 | 诊断工具开发、代谢工程 |
| 278 | 2025-10-05 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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综述 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基生物材料的发展及其在工程活性材料中的应用 | 将合成生物学与细菌纤维素材料相结合，开发具有编程生物功能的新型工程活性材料 | NA | 研究合成生物学在细菌纤维素材料工程化中的应用潜力 | 细菌纤维素及其衍生的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物传感器、响应系统 | 生物医学, 材料科学, 工业生物技术 |
| 279 | 2025-10-05 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch合成受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次开发了专门靶向CD206巨噬细胞的synNotch合成受体，为研究肿瘤转移过程中的细胞间相互作用提供了新工具 | 研究中发现了该受体应用中的意外限制和注意事项 | 开发新型合成受体以研究巨噬细胞与癌细胞在肿瘤转移过程中的相互作用机制 | CD206巨噬细胞、癌细胞、小鼠转移模型 | 合成生物学 | 肿瘤转移 | synNotch受体工程、哺乳动物合成生物学 | NA | NA | NA | synNotch | 哺乳动物细胞 | 合成受体、生物传感器 | 医学 |
| 280 | 2025-10-05 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
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研究论文 | 开发了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌光遗传学应用 | 首次将植物光感受器PhyA和FHY1与分裂Cre重组酶结合，创建红光响应系统，实现与蓝光系统的正交控制 | NA | 开发红光响应的光遗传学工具，改善光控基因表达的波长选择性和组织穿透性 | 细菌基因表达控制系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学，基因工程 | NA | NA | NA | Cre重组酶，分裂蛋白系统 | 细菌 | 红光诱导基因表达系统，DNA切除控制 | 工业生物技术 |