合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-12-26 |
Intron RPS25Ai, a Novel DNA Element, Has Global Effects on Synthetic Pathway Engineering by Empowering Protein Synthesis
2024-Dec-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11278
PMID:39660479
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研究论文 | 本研究探讨了内含子作为多功能新型生物DNA元件在合成生物学中的潜力，展示了其在转录和翻译层面的时空调控模式，并应用于工程酵母中的异源代谢途径，显著提高了β-胡萝卜素的产量 | 首次将内含子RPS25Ai作为多级调控遗传元件应用于合成生物学，展示了其在转录前和成熟RNA水平的表达增强效果，并实现了基因组规模的调控 | 研究主要局限于酵母细胞，未在其他生物系统中验证其广泛适用性 | 探索内含子作为新型生物DNA元件在合成生物学中的应用潜力 | 内含子RPS25Ai及其在工程酵母中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢途径工程 | NA | 基因表达数据 | 工程酵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-12-25 |
Designed to breathe: synthetic biology applications in plant hypoxia
2024-Dec-23, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae623
PMID:39673416
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综述 | 本文综述了近年来在植物低氧响应监测工具方面的进展，特别是通过合成生物学方法设计的新型遗传电路 | 本文介绍了从细菌和动物研究中改编或专为植物设计的氧气响应报告器、染料和纳米探针，并强调了合成生物学视角在设计植物氧气依赖响应遗传电路中的应用 | 本文讨论了在植物低氧生物学领域实施合成生物学解决方案的当前限制和挑战 | 总结植物低氧响应监测工具的最新进展，并探讨合成生物学在植物低氧生物学中的应用 | 植物低氧响应监测工具和合成生物学方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-12-21 |
Strategies and tools to construct stable and efficient artificial coculture systems as biosynthetic platforms for biomass conversion
2024-Dec-19, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02594-2
PMID:39702246
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具构建稳定高效的人工共培养系统作为生物质转化生物合成平台的策略和方法 | 本文重点介绍了近期在生物质转化方面的进展，并提供了未来研究方向的见解 | 维持系统长期的最优种群比例和平衡合成代谢与分解代谢仍然存在挑战 | 探讨如何改进人工共培养系统的稳定性和生产力，以促进生物质转化 | 人工共培养系统及其在生物质转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-12-21 |
Development of a base editor for convenient and multiplex genome editing in cyanobacteria
2024-08-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06696-3
PMID:39143188
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研究论文 | 本文开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，用于在蓝藻中进行快速、精确的C→T点突变和基因失活 | 开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，能够实现快速、精确的C→T点突变和基因失活，并支持多重编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具，以促进蓝藻的遗传解剖和代谢工程研究 | 蓝藻中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 基因组 | 涉及Synechocystis和Anabaena两种蓝藻 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-12-20 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-Dec-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本文综述了近年来对天然产物生物合成中异戊烯侧链修饰的酶学机制及其在天然产物多样性和复杂性中的作用 | 本文总结了几种新颖的生物合成机制，如环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、不寻常的C-C键断裂和氧化环化 | NA | 揭示异戊烯侧链修饰在天然产物生物合成中的化学和酶学机制，指导未来在发现、表征和应用这些修饰方面的努力 | 天然产物生物合成中的异戊烯侧链修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-12-20 |
Post-genomic illumination of paclitaxel biosynthesis
2024-12, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01869-8
PMID:39604636
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综述 | 本文总结了紫杉醇生物合成研究的关键里程碑，并强调了通过基因组水平分析潜在关键基因所取得的最新进展 | 通过基因组测序和组装揭示了紫杉醇生物合成所需的最小基因集，为合成生物学方法促进紫杉醇的工业化生产铺平了道路 | 紫杉醇生物合成途径的完整阐明仍面临重大挑战，许多中间产物尚未通过实验确定 | 总结紫杉醇生物合成研究进展，探讨通过合成生物学方法实现紫杉醇工业化生产的可能性 | 紫杉醇的生物合成途径及其关键基因 | NA | NA | 基因组测序和组装 | NA | 基因组数据 | 三种红豆杉（Taxus）基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-12-20 |
Research Progress and Application of Miniature CRISPR-Cas12 System in Gene Editing
2024-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312686
PMID:39684395
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综述 | 本文综述了微型CRISPR-Cas12系统的研究进展及其在基因编辑中的应用 | 微型CRISPR-Cas12系统相比常用的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a具有丰富的PAM位点、更高的特异性、更小的体积和较低的细胞毒性 | 微型Cas12蛋白的应用及其编辑效率的改进方法尚未得到系统总结 | 旨在为深入理解微型CRISPR-Cas12系统的功能机制和工程化改造提供参考 | 微型CRISPR-Cas12系统在动物、植物和微生物基因编辑中的应用及其编辑效率的改进策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-12-20 |
Diverting organic waste from landfills via insect biomanufacturing using engineered black soldier flies (Hermetia illucens)
2024-07-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06516-8
PMID:39048665
|
研究论文 | 本文探讨了利用工程化黑水虻（Hermetia illucens）进行昆虫生物制造，以减少有机废物进入垃圾填埋场，并将其转化为高价值产品 | 利用合成生物学开发黑水虻作为可持续的生物制造平台，将多种有机废物转化为增强的动物饲料、高价值生物分子和改良肥料 | NA | 实现循环经济，减少有机废物处理问题 | 黑水虻（Hermetia illucens）及其在有机废物转化中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-12-20 |
Broadening the application of Yarrowia lipolytica synthetic biology tools to explore the potential of Yarrowia clade diversity
2024-06, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001472
PMID:38913407
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研究论文 | 本研究展示了将Yarrowia lipolytica合成生物学工具应用于Yarrowia分支其他酵母菌株的潜力 | 首次将Yarrowia lipolytica的合成生物学工具应用于Yarrowia分支的其他酵母菌株，展示了这些工具的多功能性 | 研究仅限于表达荧光蛋白和类胡萝卜素途径，尚未全面评估其他潜在应用 | 探索Yarrowia分支多样性在工业应用中的潜力 | Yarrowia分支的其他酵母菌株 | 合成生物学 | NA | Golden Gate工具包 | NA | NA | 至少五个Yarrowia分支的成员 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-12-20 |
A vector system for single and tandem expression of cloned genes and multi-colour fluorescent tagging in Haloferax volcanii
2024-05, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001461
PMID:38787390
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研究论文 | 本文开发了一种在嗜盐古菌中进行单基因和串联表达的质粒载体系统，并实现了多色荧光标记 | 本文创新性地设计了包含多种密码子优化荧光蛋白的质粒载体，用于蛋白质的N端或C端标记，并展示了其在细胞骨架蛋白融合中的应用 | 本文未详细讨论该系统在其他古菌物种中的适用性及其在大规模应用中的潜在限制 | 开发用于古菌分子和细胞生物学及生物技术研究的新工具 | 嗜盐古菌中的蛋白质表达、定位及功能研究 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白标记 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-12-20 |
Advancing microbiota therapeutics: the role of synthetic biology in engineering microbial communities for precision medicine
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1511149
PMID:39698189
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综述 | 本文综述了合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的变革潜力，探讨了其在精准医学中的应用 | 本文整合了计算机科学、工程学和生物学，利用CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程和合成寡核苷酸合成等前沿技术，为个性化益生菌和工程微生物等靶向治疗铺平道路 | 本文讨论了遗传稳定性、环境安全性和健全的监管框架等挑战，强调了持续研究以确保安全有效的微生物组干预的重要性 | 探讨合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的作用，特别是其在精准医学中的应用 | 微生物组、合成生物学技术、肠道微生物在疾病中的作用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程、合成寡核苷酸合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-12-19 |
Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937
PMID:39648448
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研究论文 | 本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法，在酵母中异源表达，鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因 | 首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶（AeOSC2和AeOSC3）和两个细胞色素P450（AeCYP716A8和AeCYP716A9），并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径 | NA | 探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能 | 猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径 | 代谢组学 | NA | 转录组测序分析，合成生物学 | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-12-19 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本文利用微流控平台结合数学模型，在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路 | 首次将微流控平台与数学模型结合，用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路，并成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路，样本量较小 | 探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用，发现新的天然产物 | 真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序 | 合成生物学 | NA | 微流控平台 | 数学模型 | 基因表达数据 | 30个转录因子-启动子组合，来自两种代表性真菌基因调控回路，使用模式真菌Aspergillus nidulans | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-12-19 |
Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus
2024-07-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06487-w
PMID:38956406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因 | 使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合 | NA | 开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用 | 非传统酵母Kluyveromyces marxianus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
|
研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络（GAN）和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库，并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法，推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络（GAN），多模型融合 | 生成对抗网络（GAN），双向长短期记忆网络（BiLSTM），卷积神经网络（CNN） | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
|
综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述，未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力，并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
|
研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关，并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学，但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，利用细菌自组装形成生物玻璃多硅酸盐涂层，展示了增强的光聚焦能力 | 本文创新性地利用细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein，使其自组装形成生物玻璃涂层，并展示了比未修饰细菌更强的光聚焦能力 | NA | 开发环境友好且具有可调结构特性的活体微透镜，并探索其在光学和光子技术中的应用潜力 | 表达silicatein酶的工程细菌及其自组装的生物玻璃涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-12-18 |
In vitro generation of genetic diversity for directed evolution by error-prone artificial DNA synthesis
2024-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06340-0
PMID:38789612
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过易错人工DNA合成（epADS）在体外生成遗传多样性的方法，用于定向进化的应用 | 提出了通过易错人工DNA合成（epADS）生成遗传多样性的新方法，丰富了定向进化的工具箱 | NA | 探索在合成生物学中用于定向进化的遗传多样性生成方法 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物对卡贝西林的耐受性 | 合成生物学 | NA | 易错人工DNA合成（epADS） | NA | DNA序列 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物样本 | NA | NA | NA | NA |