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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-12-16 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-Nov-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学方法从头构建功能性微生物生态系统的策略 | 提出了一个更全面的设计-构建-测试-学习流程,用于设计和优化微生物生态系统 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 总结和推进基于不同调控电路的微生物生态系统构建策略 | 微生物生态系统中的种内和种间相互作用及正交调控模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-12-16 |
Landscape of human organoids: Ideal model in clinics and research
2024-May-06, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100620
PMID:38706954
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综述 | 本文综述了人类类器官领域的现状和未来发展趋势,涵盖了其在临床和研究中的应用 | 本文首次提供了对类器官领域全面且准确的概述,结合了学术研究、工业应用和临床实践的经验 | 本文主要为综述性质,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 旨在填补类器官领域缺乏全面概述的空白,并为研究人员、临床医生和患者提供有价值的见解 | 类器官技术及其在个性化医疗、肿瘤学、药物发现等领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
|
综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展,并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品,以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中,并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验,未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
|
研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念,通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
|
研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架,利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型,能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系,并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证,尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用,展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-12-14 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
|
研究论文 | 研究从蟾蜍中鉴定出的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的底物多样性和特异性 | 通过分子对接和关键氨基酸突变,解释了这些酶的底物多样性和特异性机制 | NA | 探讨蟾蜍中吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的催化机制 | 蟾蜍中的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶 | 生物化学 | NA | 分子对接,氨基酸突变 | NA | 蛋白质 | 七种酶 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-12-13 |
Multiplex Expression Cassette Assembly: A flexible and versatile method for building complex genetic circuits in conventional vectors
2024-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14454
PMID:39175411
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiplex Expression Cassette Assembly (MECA)的方法,用于在常规载体中构建复杂的遗传电路 | MECA方法通过修改与Golden Gate Assembly兼容的载体,使用嵌入连接语法的引物放大功能元件,能够在不需要专用载体和标准化模块库的情况下,通过两轮Golden Gate组装反应构建复杂结构 | NA | 开发一种灵活且通用的方法来构建复杂的遗传电路,以在合成生物学中实现多种功能,并在作物育种中提高生产力和整体性能 | 复杂的遗传电路构建,以及在烟草和番茄中的基因编辑和代谢产物生产 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 涉及烟草、番茄和Escherichia coli等多种植物和微生物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-12-13 |
Securing Commercial Nucleic Acid Synthesis
2024-Dec, Rand health quarterly
PMID:39664983
|
综述 | 本文综述了商业核酸合成的安全问题,评估了当前的筛查状态,并提出了加强筛查的建议 | 本文提出了加强商业核酸合成筛查的建议,扩展并强化了政府沟通、行业联盟规则和最佳实践 | 本文主要基于现有文献和政策建议,缺乏实证研究 | 评估当前商业基因合成筛查的现状,并提出加强筛查的建议 | 商业核酸合成的安全问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
|
综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法,以激活生物合成基因簇(BGCs)的表达,并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低,且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇,以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-12-13 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
|
研究论文 | 本文开发并优化了Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱,以促进脂肪酸生产 | 验证并表征了一组诱导性和组成性启动子,设计并测试了RBS库,研究了密码子优化对基因表达的影响 | 仍需克服一些障碍,使C. necator广泛用于生物合成过程 | 开发和优化Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱 | Cupriavidus necator中的启动子、RBS和密码子优化 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 一组诱导性和组成性启动子,一个RBS库,gfp和mCherry基因的密码子优化变体 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-12-13 |
Using Euf1 transcription factor as a titrator of erythritol-inducible promoters in Yarrowia lipolytica; insight into the structure, splicing, and regulation mechanism
2024-Jan-09, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foae027
PMID:39169472
|
研究论文 | 本研究使用Euf1转录因子作为调节因子,探索其在Yarrowia lipolytica中对赤藓糖醇诱导型启动子的调控机制 | 通过使用Euf1转录因子作为启动子调节因子,扩展了合成启动子的可调性,并提出了Euf1调控启动子作用的新机制 | 研究中Euf1的过表达导致启动子的赤藓糖醇诱导特性丧失 | 探索合成生物学中可控调节元件的调控机制 | Euf1转录因子及其在Yarrowia lipolytica中的调控作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子调控 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-12-12 |
Ultrahigh yields of giant vesicles obtained through mesophase evolution and breakup
2024-Dec-11, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01109k
PMID:39618312
|
研究论文 | 本文报道了一种通过脂质自组装和膜断裂途径获得超高产率巨型单层囊泡的新方法 | 发现了一种新的脂质自组装途径,称为“剪切诱导的碎片化”,能够实现超过50%的超高产率巨型单层囊泡 | NA | 探索和优化巨型单层囊泡的制备方法,以提高其产率和应用潜力 | 巨型单层囊泡及其在生物物理模型、软材料、合成生物学和生物医学应用中的应用 | NA | NA | 脂质自组装 | NA | 图像 | 包含3 mol% PEG2000-DSPE的脂质膜和不同脂质混合物 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-12-12 |
AuxSynBio: synthetic biology tools to understand and engineer auxin
2024-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103194
PMID:39255527
|
综述 | 本文综述了植物激素生长素在合成生物学中的应用及其在植物生长发育中的关键作用 | 通过在酵母中重现信号通路和设计正交生长素受体对,深入理解生长素通路的调控机制 | NA | 探讨生长素在合成生物学中的双重角色,即作为研究对象和工具 | 植物激素生长素及其信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-12-12 |
T7 phage-assisted evolution of riboswitches using error-prone replication and dual selection
2024-01-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52049-9
PMID:38287027
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研究论文 | 本文展示了利用T7噬菌体辅助进化技术,通过错误倾向复制和双重选择系统,成功进化了茶碱核开关 | 本文创新性地设计了T7AE技术,通过双重选择系统实现了对功能性核开关的有效筛选和富集 | NA | 开发一种新的技术来进化和改进基因开关,特别是基于非编码RNA的开关 | 茶碱核开关及其在T7噬菌体中的进化 | 合成生物学 | NA | 错误倾向复制 | NA | DNA | 65,536个工程化的T7噬菌体 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-12-10 |
Toolbox of Characterized Genetic Parts for Staphylococcus aureus
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00325
PMID:38064657
|
研究论文 | 本文报道了首个用于金黄色葡萄球菌的标准化遗传部件工具箱,包括来自多种细菌的启动子、核糖体结合位点、终止子和质粒复制子,用于精确控制基因表达 | 首次为金黄色葡萄球菌建立了标准化的遗传部件工具箱,并展示了其在理性设计和工程化中的应用 | NA | 开发适用于金黄色葡萄球菌的合成生物学工具 | 金黄色葡萄球菌的遗传部件 | 合成生物学 | NA | DNA组装策略 | NA | 基因表达数据 | 24个组成型启动子,金黄色葡萄球菌ATCC 12600 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-12-08 |
Facile and versatile PDMS-glass capillary double emulsion formation device coupled with rapid purification toward microfluidic giant liposome generation
2024-Dec-05, Microsystems & nanoengineering
IF:7.3Q1
DOI:10.1038/s41378-024-00815-0
PMID:39632792
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于形成双乳液的PDMS-玻璃毛细管混合装置,并展示了其在微流控巨型脂质体生成中的应用 | 提出了一种无需表面处理的PDMS-玻璃毛细管混合装置,简化了双乳液的形成过程,并开发了一种连续快速的无操作员处理分离芯片 | NA | 开发一种简便且多功能的微流控装置,用于生成巨型脂质体,并探索其在生物膜研究和合成生物学中的应用 | 双乳液的形成和分离,以及巨型脂质体的生成 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-12-08 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-Oct-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究了甲烷产生菌Methanosarcina acetivorans在能量保存酶HdrED抑制下的转录响应 | 揭示了甲烷产生菌通过未知机制将甲烷生成与基因调控通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性高效耦合 | NA | 探究细胞如何感知和响应终端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans细胞在HdrED酶缺失下的转录变化 | 代谢网络 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-12-08 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-Oct-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为2PRIM-BOOST的新策略,通过结合底盘菌株工程和生长介质优化,提高Myxococcus xanthus中非核糖体肽合成酶(NRPS)/聚酮合成酶(PKS)次级代谢产物的生产与检测 | 提出了2PRIM-BOOST策略,结合底盘菌株工程和生长介质优化,显著提高了myxoprincomide等次级代谢产物的生产 | NA | 开发一种新策略以提高Myxococcus xanthus中次级代谢产物的生产与检测 | Myxococcus xanthus中的次级代谢产物,特别是myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 底盘菌株工程、生长介质优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |