合成生物学相关文章
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当前共找到 1128 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
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研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 322 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
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研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 323 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
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研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法，实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联，支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统，多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 324 | 2025-10-05 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
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综述 | 本文综述了靶向G蛋白偶联受体的生物制剂发现技术及其发展前景 | 系统总结了最先进的GPCR靶向生物制剂工程技术，并前瞻性地指出DNA合成和合成生物学技术将推动该领域发展 | NA | 回顾GPCR靶向生物制剂发现的技术现状并展望未来发展方向 | G蛋白偶联受体及其靶向生物制剂 | 生物医药技术 | 代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病 | DNA合成、展示技术、功能筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 325 | 2025-10-05 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造双组分系统开发生物传感器用于环境抗生素检测 | 探索基于EMeRALD的生物传感器，通过合成生物学方法重新利用微生物双组分系统的传感模块 | NA | 开发用于环境抗生素检测的合成生物学工具 | 细菌双组分系统和EMeRALD生物传感器 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | EMeRALD | 细菌 | 双组分调控系统合成调控回路 | 环境监测 |
| 326 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡，用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达，实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统，用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 327 | 2025-10-05 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学元件库 | 首次将系统生物学与合成生物学结合，创建了从组学到元件的流程，为非常规微生物快速开发遗传工具 | 许多推定的调控型启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 差异基因表达分析, 基因本体分析, 荧光素酶检测 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 在不同波长光照和氧化应激条件下的X. dendrorhous样本 | 模块化克隆系统 | Xanthophyllomyces dendrorhous | 组成型和光调控启动子, 整合位点, 终止子, 选择标记, 报告基因 | 工业生物技术 |
| 328 | 2025-10-05 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 本研究开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，并应用于提高Parageobacillus thermoglucosidasius的核黄素产量 | 通过组合xylA5p启动子和XylR调节因子，优化XylR表达强度并降低葡萄糖对木糖摄取的代谢物阻遏，创建了葡萄糖不敏感的木糖诱导表达系统 | NA | 开发适用于Parageobacillus thermoglucosidasius的诱导表达系统 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542菌株 | 合成生物学 | NA | 启动子工程，代谢工程 | NA | NA | NA | 启动子工程，代谢通路重定向 | Parageobacillus thermoglucosidasius | 木糖诱导表达系统，包含xylA5p启动子和XylR转录调节因子 | 工业生物技术 |
| 329 | 2025-10-05 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
|
研究论文 | 本研究在三角褐指藻中鉴定并验证了具有凝血酶样活性的蛋白酶，推进了硅藻在生物技术中的应用 | 首次在三角褐指藻中发现具有凝血酶样活性的新型蛋白酶，并通过体内实验验证其切割效率 | NA | 探索三角褐指藻中凝血酶样蛋白的存在及其在生物工程中的应用潜力 | 三角褐指藻中的凝血酶样蛋白序列及其功能特性 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、分子对接、Western blot | NA | 基因组序列、蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | 三角褐指藻 | 凝血酶识别序列LVPRGS的融合蛋白构建 | 工业生物技术 |
| 330 | 2025-10-05 |
A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00092
PMID:39120429
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研究论文 | 本研究开发了一种通过改造启动子区域来创建稳健基因表达工具的简单有效策略 | 通过在原始启动子-35区域上游引入额外的-35样基序，并在5'-UTR区域整合回文元件，显著增强了启动子活性 | NA | 开发稳健的启动子中心基因表达工具 | 链霉菌及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子改造 | 链霉菌 | 组成型和诱导型基因表达系统，包括木四环素诱导型基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 331 | 2025-10-05 |
Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00672
PMID:39150229
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研究论文 | 本研究探索利用干燥蓝藻作为质粒DNA载体在太空飞行中的有效运输方法 | 首次利用天然耐干燥的蓝藻作为质粒DNA载体，实现无需低温储存的太空往返运输 | 仅为概念验证研究，样本规模有限，需要进一步验证不同质粒和环境的适用性 | 开发适用于太空环境的生物部件运输方法，支持太空合成生物学和生物制造 | 蓝藻菌株PC73102和pSCR119质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒提取、细菌转化 | NA | 分子生物学数据 | 概念验证规模，具体样本数量未明确说明 | NA | 蓝藻PC73102, 大肠杆菌 | 质粒载体系统，包含卡那霉素抗性基因 | 太空生物技术 |
| 332 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00248
PMID:39158169
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研究论文 | 本研究开发了在希瓦氏菌MR-1中实现位点特异性非经典氨基酸掺入的高效方法 | 首次在电活性细菌MR-1中建立遗传密码扩展系统，实现c型细胞色素MtrC的位点特异性修饰 | NA | 扩展电活性细菌中蛋白质的化学功能多样性 | 希瓦氏菌MR-1及其c型细胞色素MtrC | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质结构数据、电化学数据 | NA | 遗传密码扩展 | Shewanella oneidensis MR-1 | 非经典氨基酸掺入系统 | 工业生物技术 |
| 333 | 2025-10-05 |
GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00296
PMID:39162314
|
研究论文 | 提出名为GOLDBAR的组合生物设计框架，用于支持合成生物学中的自动化分析和机器学习 | 能够对生物设计类别进行交集和合并操作，提取共同设计模式并推断新设计，相比现有框架支持形式化设计比较 | NA | 开发支持合成生物学中组合设计形式化比较的框架 | 组合生物设计库和设计规则 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | 基于文法的机器学习 | 生物设计数据 | NA | NA | NA | TetR同源转录逻辑电路、基因簇 | 工业生物技术 |
| 334 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
|
综述 | 本文系统总结了合成生物学在天然产物工程领域的最新进展，涵盖从发现到学习的完整生物工程周期 | 整合了AI辅助基因组挖掘、酶与途径工程、新型宿主系统等最新技术进展，并强调在工艺开发早期进行预期分析的重要性 | NA | 总结天然产物工程领域合成生物学技术的最新发展 | 天然产物生物合成工程 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、AI辅助基因组挖掘、酶工程、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 新型宿主系统 | 生物合成途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 335 | 2025-10-05 |
Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00371
PMID:39229974
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研究论文 | 提出一种深度学习与合成生物学协同设计的少样本训练工作流程，用于优化N端编码序列以增强基因表达 | 开发了结合k近邻编码、word2vec、注意力机制和时间序列网络的深度学习模型，仅需六次迭代实验即可显著提升基因表达 | 仅使用GFP作为报告蛋白验证，在其他蛋白中的应用效果需进一步验证 | 优化N端编码序列以最大化基因表达 | 绿色荧光蛋白(GFP)和N-乙酰神经氨酸合成相关基因 | 机器学习 | NA | 深度学习，基因表达优化 | 注意力机制，时间序列网络，word2vec | 基因序列数据，荧光强度数据 | 少样本训练（六次迭代实验） | NA | 大肠杆菌 | 基因表达优化系统 | 工业生物技术，医药 |
| 336 | 2025-10-05 |
Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00280
PMID:39262282
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研究论文 | 通过多层级系统优化开发大肠杆菌高效整合表达系统 | 从整合位点筛选、启动子优化和T7 RNA聚合酶过表达三个层面系统优化，构建了无需抗生素和诱导剂的高效整合表达系统 | 研究仅针对大肠杆菌BL21(DE3)菌株，未在其他宿主中验证通用性 | 开发稳定高效的外源基因基因组整合表达系统 | 大肠杆菌BL21(DE3)基因组和外源基因表达元件 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、启动子工程、蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | 18个基因组整合位点、16个内源启动子 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 组成型高效整合表达系统，包含优化整合位点、Plpp-T7杂合启动子和T7 RNA聚合酶过表达模块 | 工业生物技术, 酶工程 |
| 337 | 2025-10-05 |
Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00708
PMID:39264040
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研究论文 | 比较五种计算模型对三种实现相同逻辑功能的遗传电路进行预测能力评估 | 首次系统比较不同复杂度模型在预测合成遗传电路鲁棒性方面的表现差异 | 研究基于仿真分析，需要实际实验验证；模型参数获取仍存在挑战 | 评估模型复杂度对合成遗传电路鲁棒性预测能力的影响 | 三种实现相同逻辑功能的遗传电路和五种计算模型 | 合成生物学 | NA | 计算建模、仿真分析 | 多种复杂度计算模型 | 仿真数据 | 五种模型对三种电路设计的分析 | NA | NA | 实现相同逻辑功能的遗传电路 | 工业生物技术 |
| 338 | 2025-10-05 |
Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00317
PMID:39256183
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研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母表面展示淬灭体的新型全细胞生物传感器，用于一步检测甲型流感（H1N1）病毒 | 首次在酵母细胞表面展示VHH基淬灭体，创建了无需分析物跨膜运输即可检测病毒颗粒的全细胞生物传感器新设计 | 检测范围有限（H1N1-HA：0.5-16 μg/mL；H1N1病毒：2.4×10至1.5×10 PFU/mL），未在真实环境样本中进行验证 | 开发能够高效检测空气传播病毒的新型全细胞生物传感器 | 甲型流感（H1N1）病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA | 合成生物学 | 流感 | 酵母表面展示技术、VHH抗体片段筛选、淬灭体技术 | NA | 荧光信号数据 | 17个VHH抗体片段 | 酵母表面展示系统 | 酵母 | 表面展示淬灭体生物传感器 | 医学诊断,环境监测 |
| 339 | 2025-10-05 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
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综述 | 本文回顾了冷泉港实验室合成生物学暑期课程十年来的发展历程、课程结构和教育成果 | 首次系统总结该旗舰课程的教学模式及其对合成生物学人才培养的深远影响 | NA | 分析合成生物学教育课程的设计理念与实际成效 | 冷泉港实验室合成生物学暑期课程 | 合成生物学教育 | NA | 无细胞转录翻译、DNA构建、基因回路计算建模、基因调控工程、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 基因回路 | 教育 |
| 340 | 2025-10-05 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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研究论文 | 介绍BioRECIPE知识表示格式，用于标准化和促进人类与机器在创建、验证和执行细胞内外信号传导可执行模型时的交互 | 开发了一种同时支持人类可读和机器可处理的新型知识表示格式，实现模型组件的便捷预览和修改 | NA | 为系统和合成生物学社区提供标准化的知识表示格式 | 细胞内外信号传导的可执行模型 | 合成生物学 | NA | 知识表示格式 | NA | 模型数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |