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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
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综述 | 总结人工智能在逆生物合成路径设计中的方法和模型应用进展 | 系统梳理AI在逆生物合成领域的最新进展，涵盖基于反应模板和生成模型的多种技术路径 | 未明确说明具体数据规模或模型验证的局限性 | 促进符合绿色化学理念的生物生产路径规划 | 逆生物合成路径设计方法 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成分析 | 生成模型 | 化学反应数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 322 | 2025-10-05 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
|
综述 | 本文综述了工程活性材料（ELMs）的先进制造技术及其实际应用前景 | 系统整合了自下而上和自上而下的ELMs构建方法，强调合成生物学与材料科学的交叉融合 | NA | 探讨ELMs的制备方法、特性及其在医疗和环境保护等领域的实际应用 | 工程活性材料（ELMs）及其构建技术 | NA | NA | 3D生物打印、静电纺丝、内源性和外源性支架技术、活体组装 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 工程化活细胞 | 具有环境响应能力的生物传感系统，能够响应压力、pH、湿度、温度和光照等刺激 | 医学, 环境保护, 制造业 |
| 323 | 2025-10-05 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
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研究论文 | 本研究开发了一种基于RecT重组酶和Cas9反选择的无标记基因组工程系统，用于乙酸杆菌Eubacterium limosum的精确基因编辑 | 开发了高效的寡核苷酸重组系统，结合Cas9反选择实现无疤痕、无标记的基因组点突变，解决了该菌株基因工程的主要瓶颈 | NA | 开发快速精确的基因组修饰工具，促进Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程应用 | 乙酸杆菌Eubacterium limosum及其基因组 | 合成生物学 | NA | 重组工程、Cas9反选择、基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, RecT重组酶 | Eubacterium limosum | 重组酶系统与Cas9反选择系统的组合设计 | 能源, 环境, 医学 |
| 324 | 2025-10-05 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 开发了一种从多种植物物种制备高活性叶绿体无细胞基因表达系统的通用方案 | 建立了首个源自多种植物物种的叶绿体无细胞表达系统，可同时使用T7 RNA聚合酶和内源性叶绿体聚合酶 | NA | 开发快速原型平台以加速植物合成生物学和叶绿体工程研究 | 小麦、菠菜和杨树等不同植物物种的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 基因表达数据 | 23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 | NA | 小麦、菠菜、杨树 | 基因表达调控序列(启动子、UTR)的表征和原型设计 | 农业 |
| 325 | 2025-10-05 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种基于大肠杆菌Nissle 1917的模块化系统，用于检测和缓解肠道炎症疾病 | 首次在EcN中构建了包含NO传感器、分泌系统和抗TNFα纳米抗体库的集成系统，并建立了评估工程益生菌系统关键参数的数学模型 | 系统灵敏度有所降低 | 开发靶向特异性系统治疗炎症性肠病 | 工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 酶联免疫吸附试验、体外试验 | 数学模型 | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基于转录因子的NO生物传感器、1型溶血素分泌系统、抗TNFα纳米抗体治疗载体 | 医学 |
| 326 | 2025-10-05 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选方法，开发了适用于藻类的合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测顺式调控元件，并通过高通量筛选验证合成启动子活性 | 需要目标藻类物种具有测序的基因组和转录组数据集 | 开发适用于藻类生物技术的合成生物学工具 | 六种不同藻类物种的启动子区域和顺式调控元件 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选、生物信息学分析 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 4533个合成启动子，数百个转基因株系 | 合成生物学方法 | 藻类 | 合成启动子设计，包含1-3个顺式调控元件拷贝 | 工业生物技术,能源 |
| 327 | 2025-10-05 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本研究通过定向进化方法开发具有增强非线性超声散射信号的声学报告基因 | 建立了高通量半自动化声学筛选平台，首次将定向进化应用于声学报告基因的优化 | 研究主要针对细菌培养体系，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发性能更优的声学报告基因用于生物成像 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其编码基因 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量声学筛选、非线性超声散射 | NA | 声学信号数据、蛋白质序列数据 | GvpA/B同源蛋白的扫描位点饱和突变库 | 定向进化 | 细菌 | 声学报告基因系统，基于气体囊泡的超声对比剂 | 医学成像、合成生物学 |
| 328 | 2025-10-05 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定了集胞藻PCC 7942中响应酸性胁迫的关键基因，并通过基因工程成功提高了其耐酸性 | 首次系统鉴定集胞藻PCC 7942中参与酸性胁迫响应的六个关键基因，并通过过表达chlL和chlN基因成功增强菌株耐酸性 | NA | 探究集胞藻PCC 7942的酸性胁迫响应机制并开展耐酸工程改造 | 集胞藻Synechococcus elongatus PCC 7942 | 合成生物学 | NA | RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 表型分析, 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除, 基因过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | NA | 工业生物技术 |
| 329 | 2025-10-05 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
|
综述 | 本文综述了青霉菌中植物多糖降解酶(PPDEs)的分布、功能、生物合成调控机制及高产菌株选育研究进展 | 系统总结了青霉菌PPDE生物合成调控机制的最新研究进展，并提出了通过合成生物学和代谢工程提高PPDE产量的新策略 | 作为小型综述，未包含所有相关研究，且主要关注青霉菌属 | 提高青霉菌植物多糖降解酶(PPDEs)的产量和效率，促进其工业化应用 | 青霉菌属真菌，特别是草酸青霉菌(Penicillium oxalicum) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 青霉菌 | NA | 工业生物技术, 能源 |
| 330 | 2025-10-05 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
|
综述 | 本文总结了利用合成生物学方法改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇效率的策略 | 系统综述了近年来通过基因工程技术改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的合成生物学策略 | NA | 提高从可再生资源微生物发酵生产异丁醇的效率 | 天然和非天然微生物宿主 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 微生物宿主 | 异丁醇生物合成途径 | 能源, 环境 |
| 331 | 2025-10-05 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本研究通过计算机合成生物学流程构建最小代谢网络，定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子 | 提出了网络效率决定因子这一新的功能基因类别，并开发了新的计算机合成生物学流程来构建最小代谢网络 | 研究主要基于计算机模拟，需要实验验证 | 通过最小化代谢网络来识别对代谢效率至关重要的基因 | 代谢网络中的基因和蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟、生物信息学分析 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | NA | 计算机合成生物学流程 | 酵母 | 最小代谢网络设计 | 工业生物技术 |
| 332 | 2025-10-05 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
|
综述 | 本文综述了目前可用于修饰和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 正在开发用户友好的合成生物学工具包，赋予R. eutropha菌株新能力 | NA | 开发适用于Ralstonia eutropha的合成生物学工具包 | Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)工业微生物 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator) | 代谢途径工程，生物传感器 | 工业生物技术，能源，材料 |
| 333 | 2025-10-05 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中表达合成操纵子olsFC生产鸟氨酸脂质，增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次在本身不编码鸟氨酸脂质合成能力的大肠杆菌中实现异源生产鸟氨酸脂质，并证明其能增强胁迫抗性 | 研究仅限于大肠杆菌模型，未在其他宿主中验证 | 通过改造大肠杆菌膜脂质组成增强其非生物胁迫抗性 | 工程化改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程化大肠杆菌菌株 | 合成操纵子表达 | 大肠杆菌 | olsFC合成操纵子表达系统，用于生产未修饰和羟基化鸟氨酸脂质 | 工业生物技术 |
| 334 | 2025-10-05 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本研究开发了能够体外选择性抑制IIS型限制性内切酶活性的重组DNA甲基化酶 | 成功表达并验证了非切换型和切换型甲基化酶对IIS型限制性内切酶活性的位点选择性抑制能力 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用验证 | 开发用于合成生物学和DNA组装技术的新型分子工具 | I型和II型限制修饰系统中的DNA甲基化酶 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、DNA甲基化分析、限制性内切酶消化 | NA | 酶活性分析数据 | 10种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 | His标签纯化、分子克隆 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 335 | 2025-10-05 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中构建了(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 设计了包含来自不同生物界源六种酶的工程化生物合成途径，结合合成生物学、生物催化和合成化学方法 | NA | 开发复杂吲哚生物碱的高效生物合成方法 | (+)-brevianamides A和B等含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程、生物催化 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 包含环二肽合成酶(NascA)、环二肽氧化酶(DmtD2/DmtE2)、异戊二烯基转移酶(NotF)、黄素依赖单加氧酶(BvnB)和激酶(PhoN和IPK)的五步生物合成途径 | 医药 |
| 336 | 2025-10-05 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 开发了一种基于定向三链DNA的人工跨膜信号转导系统 | 首次使用胆固醇标记的定向三链DNA作为合成受体，通过pH驱动的构象变化实现跨膜信号转导 | NA | 构建模拟天然GPCR功能的人工信号转导系统 | 三链DNA合成受体和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、光切割、信号放大 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 三链DNA构象开关、逻辑门调制、信号放大回路 | 生物传感、细胞信号调控、靶向药物递送 |
| 337 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径，利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能，体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块，包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 338 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII，研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII，未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术，SCRaMbLE系统，转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计，可诱导基因组重排系统 | 医学，基础研究 |
| 339 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库，能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子，在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子，转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 340 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构，实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合，实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象，尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |