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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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341 | 2024-10-19 |
Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00244
PMID:39276360
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综述 | 本文综述了增强子在调控后生动物转录中的作用,并探讨了合成生物学在解析增强子功能机制中的应用 | 本文通过合成报告基因系统量化增强子生物学的动态变化,揭示了增强子在基因组环境和与其他增强子组合中的功能机制 | NA | 探讨增强子功能机制及其在基因表达调控中的作用 | 增强子及其在基因组环境中的功能 | 合成生物学 | NA | 合成报告基因 | NA | 基因表达数据 | NA |
342 | 2024-10-19 |
Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00323
PMID:39294875
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研究论文 | 研究通过优化合成小调控RNA(sRNA)的设计参数,提高其在基因表达调控中的效率,并应用于遗传电路的鲁棒性控制 | 开发了优化合成sRNA设计参数的策略,有效解决了基因表达泄漏问题,提高了遗传电路的可靠性 | NA | 研究提高合成sRNA效率的理性设计策略,并验证其在遗传电路中的应用 | 合成小调控RNA(sRNA)及其在遗传电路中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
343 | 2024-10-19 |
Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00412
PMID:39307986
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研究论文 | 本文介绍了一种用于链霉菌属的模块化克隆工具,并展示了其在合成黄酮霉素酸生物合成途径中的应用 | 开发了一种模块化系统(MoClo),用于链霉菌属的多组分基因簇的从头组装 | 目前受限于合成生物学工具的相对匮乏 | 开发适用于链霉菌属的合成生物学工具,并验证其在异源表达中的应用 | 链霉菌属的基因簇组装和黄酮霉素酸的生物合成 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo) | NA | 基因序列 | 使用了β-葡萄糖苷酸酶(GusA)报告系统进行功能验证 |
344 | 2024-10-19 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
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研究论文 | 本文介绍了vitraPro软件工具包,用于模拟病毒转导和传播过程,优化基于转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 提出了一个多尺度模型和高效的数值技术,能够模拟多达两种病毒的感染和传播过程,并考虑了病毒在裂解期或溶原期的状态 | NA | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度模型 | NA | NA | NA |
345 | 2024-10-19 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
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研究论文 | 研究通过生物信息学分析和合成生物学策略,构建了鼠李糖诱导的调控系统,用于动态控制链霉菌中的代谢途径 | 本研究揭示了鼠李糖代谢途径的调控机制,并成功构建了鼠李糖诱导的调控系统,可广泛应用于多种链霉菌属物种 | NA | 开发有效的基因诱导系统,用于合成生物技术应用中的基因表达精细调控 | 链霉菌属物种中的鼠李糖代谢途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 电泳迁移率变动分析(EMSA) | NA | 序列 | 多个链霉菌属物种 |
346 | 2024-10-19 |
Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development
2024-Oct-16, ChemMedChem
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/cmdc.202400295
PMID:38943237
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综述 | 本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用 | 介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展 | 缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性 | 促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用 | 天然和非天然苝醌及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
347 | 2024-10-19 |
Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008
PMID:39419001
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研究论文 | 本文探讨了转录因子与抑制性染色质在转录记忆形成中的相互作用 | 揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键相互作用 | NA | 研究转录记忆的形成机制 | 转录因子与抑制性染色质的相互作用 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
348 | 2024-10-19 |
Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling
2024-Oct-14, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885
PMID:39352143
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研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞工程和生物材料设计的平台,用于在多能干细胞中实现人工信号传导 | 该平台利用可编程生物材料,通过正交信号传导激活多能干细胞中的形态发生素生产,从而在空间受限的方式下启动形态发生程序 | NA | 探索驱动多能干细胞分化的分子机制 | 多能干细胞的分化过程 | 合成生物学 | NA | 人工信号传导 | NA | NA | NA |
349 | 2024-10-19 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-Oct-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 本文开发了一种通过重构大肠杆菌的碳储存调节(Csr)网络来实现复杂转录后控制的工程方法 | 通过重新设计RNA-蛋白质相互作用,创建了一个包含12个BUFFER门的遗传工具箱,并开发了Csr调节的NOT门和多层逻辑电路 | NA | 开发能够实现多样化调控结果的“拖放”调控工具 | 大肠杆菌的碳储存调节(Csr)网络 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | 涉及三种工业相关细菌 |
350 | 2024-09-30 |
Advances in synthetic biology
2024-Oct, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100197
PMID:39341458
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
351 | 2024-10-19 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
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研究论文 | 描述了一种合成长达401个核苷酸的寡核苷酸的方法,并通过聚合捕获法(CBP)分离和克隆测序选择无错误序列 | 提出了通过聚合捕获法(CBP)和克隆测序选择无错误序列的新方法,解决了现有技术无法解决的替换、删除和添加错误问题 | NA | 开发一种合成无错误长寡核苷酸的新方法,适用于蛋白质工程和合成生物学等领域 | 长寡核苷酸的合成、分离和无错误序列的选择 | NA | NA | 聚合捕获法(CBP)、克隆测序 | NA | NA | NA |
352 | 2024-10-19 |
Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency
2024-Sep-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02041
PMID:39155392
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研究论文 | 本文研究了Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株中的R-M系统,并通过人工改造质粒提高其接合转移效率 | 首次鉴定并表征了DYTN-1菌株中的R-M系统,开发了质粒人工改造方法显著提高了接合转移效率 | NA | 提高DYTN-1菌株的质粒接合转移效率,增强其基因编辑能力 | Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株及其R-M系统 | 合成生物学 | NA | 质粒人工改造 | NA | DNA | 1株菌株 |
353 | 2024-10-17 |
An integrated engineering worldview of synthetic biology education through the lens of webinar based pedagogy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1431374
PMID:39411056
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研究论文 | 本文探讨了通过基于网络研讨会的教学方法,整合合成生物学教育的工程世界观 | 本文介绍了iGEM非营利组织在2020年COVID疫情期间启动的网络研讨会系列,该系列成功吸引了学生,并提供了全球可访问的教学方法 | NA | 探讨如何通过网络研讨会教学方法,促进合成生物学教育的发展 | 合成生物学教育及其教学方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
354 | 2024-10-18 |
An Effective DNA-Based File Storage System for Practical Archiving and Retrieval of Medical MRI Data
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301585
PMID:38807543
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA的文件存储系统,用于实际存档和检索医学MRI数据 | 本文提出了一个有效的DNA存储(EDS)方法,包括一种新的分段策略、基于规则的四进制转码方法和索引技术,以解决数据丢失和提高检索效率 | NA | 开发一种有效的基于DNA的医学数据存储系统,以解决长期、高密度数据存档的需求 | 医学MRI数据 | 计算生物学 | NA | DNA存储 | NA | MRI数据 | NA |
355 | 2024-10-18 |
Leveraging artificial intelligence in vaccine development: A narrative review
2024-09, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106998
PMID:39019262
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综述 | 本文综述了人工智能在疫苗开发中的应用,重点关注抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 人工智能算法利用基因组数据、蛋白质结构和免疫系统相互作用,预测抗原表位、评估免疫原性并优先选择抗原进行实验 | 数据异质性、模型可解释性和监管考虑是实现人工智能在疫苗开发中全部潜力的挑战 | 探讨人工智能在疫苗开发中的作用,加速安全有效疫苗的交付 | 抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 机器学习 | NA | 机器学习和深度学习 | NA | 基因组数据、蛋白质结构 | NA |
356 | 2024-10-18 |
Exploring the secrets of marine microorganisms: Unveiling secondary metabolites through metagenomics
2024-08, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14533
PMID:39075735
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综述 | 本文综述了通过宏基因组技术揭示海洋微生物次级代谢产物的研究进展 | 强调了宏基因组学在揭示次级代谢产物中的关键作用,并探讨了长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现带来的新可能性 | 讨论了通过宏基因组学研究这些代谢产物时存在的当前限制,并指出长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现提供了更多可能性 | 揭示海洋微生物次级代谢产物的秘密 | 海洋微生物及其次级代谢产物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组技术 | NA | 基因组数据 | NA |
357 | 2024-10-18 |
Controlling the expression of heterologous genes in Bdellovibrio bacteriovorus using synthetic biology strategies
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14517
PMID:38934530
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研究论文 | 本文研究了在Bdellovibrio bacteriovorus HD100中使用合成生物学策略控制异源基因表达的方法 | 首次将分层组装克隆技术Golden Standard (GS) 适应于B. bacteriovorus HD100,并结合Tn7转座子的移动元件进行染色体整合,系统地表征了一系列组成型和诱导型启动子,实现了对该细菌中异源基因表达的控制 | 缺乏适用于捕食者驯化的合成生物学工具 | 开发适用于B. bacteriovorus HD100的合成生物学工具,以实现其在微生物生物技术中的应用 | Bdellovibrio bacteriovorus HD100中的异源基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 分层组装克隆技术Golden Standard (GS),Tn7转座子 | NA | NA | NA |
358 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Dec-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102320
PMID:39398225
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9进行同源独立靶向整合(HITI)以实现高表达治疗基因的精确性和有效性 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将报告基因或治疗基因整合到小鼠肌细胞和骨骼肌组织中,实现高水平的基因表达 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的长期基因替代疗法 | 骨骼肌中的肌酸激酶和肌红蛋白启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 小鼠肌细胞和骨骼肌组织 |
359 | 2024-10-17 |
Versatility of threose nucleic acids: synthesis, properties, and applications in chemical biology and biomedical advancements
2024-Oct-15, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc04443f
PMID:39318271
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综述 | 本文深入探讨了α-L-苏糖核酸(TNA)的合成、性质及其在化学生物学和生物医学领域的应用 | TNA具有独特的四碳糖骨架,与天然核酸相比,具有更好的空间排列、稳定的Watson-Crick碱基配对、高结合亲和力、生物稳定性和生物相容性 | TNA研究仍面临合成方法的挑战,尤其是大规模合成和酶工程方面的改进 | 探讨TNA的潜在应用及其在化学生物学和生物医学领域的进展 | α-L-苏糖核酸(TNA)及其在分子检测、免疫治疗、基因治疗、合成生物学和分子计算等领域的应用 | 化学生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
360 | 2024-10-17 |
A comprehensive risk assessment of microplastics in soil, water, and atmosphere: Implications for human health and environmental safety
2024-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117154
PMID:39378647
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研究论文 | 本文对土壤、水和大气中的微塑料进行了全面的风险评估,并探讨了其对人类健康和环境安全的影响 | 提出了基于相关研究进展的微塑料风险评估方法,并建议开发新的评估模型 | 现有的风险评估模型无法很好地评估微塑料的风险 | 评估微塑料在土壤、水和大气中的风险,并提出改进的风险评估方法 | 土壤、水和大气中的微塑料 | 环境科学 | NA | 数据可视化和分析 | NA | 数据集 | 在中国收集了135组土壤、水和大气中的相关数据 |