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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径,利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能,体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块,包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 362 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII,研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII,未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术,SCRaMbLE系统,转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计,可诱导基因组重排系统 | 医学,基础研究 |
| 363 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库,用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库,能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子,在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子,转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 364 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构,实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合,实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象,尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
| 365 | 2025-10-05 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
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综述 | 本文综述了昆虫再生现象的分子机制,重点关注伤口愈合和组织再生过程 | 强调了表观遗传调控在再生过程中的关键作用,并探讨了从昆虫再生研究中获得的见解对再生医学和合成生物学的潜在贡献 | NA | 探索和回顾再生的分子基础,以促进再生医学的发展 | 昆虫纲不同目的再生能力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 合成生物学, 人类健康 |
| 366 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻中双顺反子转录本通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机理 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是实现双顺反子可调翻译的关键机制,并构建了可逆调控的双报告基因系统 | 研究主要集中于两种绿藻物种,机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻多顺反子基因的翻译机制 | 绿藻(衣藻和团藻)的双顺反子基因位点 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子位点数据集 | NA | 绿藻 | 合成双顺反子双报告基因系统(绿色荧光蛋白和荧光素酶) | 合成生物学 |
| 367 | 2025-10-05 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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荟萃分析 | 通过分析炎症性肠病患者的肠道微生物组,鉴定出与疾病相关的小分子及其对肠道通透性的影响 | 首次通过多队列分析发现梭菌来源的生物合成基因簇与IBD的关联,并解析了六种脂肪酸酰胺的结构和功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组和小分子代谢物 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序,合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个宏基因组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) | 合成生物学 | 小鼠 | NA | 医学 |
| 368 | 2025-10-05 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了合成最小细胞系统中信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的概念设计 | 通过囊泡系统人工重构了展示递归生长和分裂周期的合成最小细胞,避免了使用生物细胞中复杂的分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装体中产生,以及支撑这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的简化设计 | NA |
| 369 | 2025-10-05 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 开发了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器,将蛋白质-蛋白质邻近性转化为功能性CRISPR-Cas9基因编辑活性 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,首次实现将蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导二聚化作为CRISPR基因编辑的触发机制 | 研究目前仅在人类细胞中进行验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件与基因组编辑连接起来 | 蛋白质-蛋白质相互作用、化学诱导二聚化、RNA传感器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、prime editing、base editing、ADAR-based RNA sensing | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 双组分引导RNA系统、分子邻近传感器、可编程输入输出电路 | 医学、工业生物技术 |
| 370 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因,通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因,并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能,未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |
| 371 | 2025-10-05 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 本研究利用植物代谢工程合成动物来源的氨基酸衍生物,通过合成模块化方法成功在植物中生产肌酸、肌肽和牛磺酸 | 开发了合成模块化框架,首次在植物中实现多种动物来源氨基酸衍生物的重定向合成,并发现模块整合可显著提高产量并减少对植物代谢的影响 | 牛磺酸模块的引入意外抑制了植物半胱氨酸生物合成,表明外源途径引入可能导致复杂的代谢调整 | 通过合成生物学方法增强植物性饮食的营养价值,实现动物来源必需营养素的可持续生产 | 肌酸、肌肽和牛磺酸等动物来源氨基酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | 代谢产物定量数据 | NA | 合成模块化框架 | 植物 | 专门设计的合成代谢模块,包括肌酸模块、肌肽模块和牛磺酸模块,通过模块堆叠实现代谢通量重定向 | 农业,食品 |
| 372 | 2025-10-05 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 开发了一种铱催化的定向烯醇化策略,用于高效合成具有连续立体中心的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生物N-H单元的内源性导向能力实现铱催化的定向烯醇化,实现两个连续立体中心的高效构建 | NA | 开发合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | β-取代α-氨基酸的合成 | 有机合成化学 | NA | 铱催化、定向烯醇化、交叉偶联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计、手性催化剂合成、合成生物学 |
| 373 | 2025-10-05 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
|
研究论文 | 本研究开发了通过酶催化聚合诱导自组装合成能够表达蛋白质的聚合物人工细胞 | 首次利用肌红蛋白催化的原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达功能的人工细胞 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并实现其生物学功能模拟 | 基于聚合物的人工细胞微结构 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 分子系统工程, 合成生物学 |
| 374 | 2025-10-05 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本研究开发了一种基于PYR1受体、具有可重编程配体结合特异性的正交化化学诱导二聚化模块 | 设计了带有二聚界面盐桥的正交化PYR1*模块,创建了对特定配体具有纳摩尔级敏感性的新型CID系统 | NA | 扩展PYR1化学诱导二聚化系统,开发可重编程配体结合特异性的正交化模块 | PYR1受体、HAB1磷酸酶及其正交化变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化分析、体内分析 | NA | 晶体结构数据、生化数据、体内功能数据 | NA | CID系统设计 | 拟南芥, 酿酒酵母 | 化学诱导二聚化模块、多输入/输出遗传电路、生物传感器 | 环境监测, 合成生物学 |
| 375 | 2025-10-05 |
Logic "AND Gate Circuit"-Based Gasdermin Protein Expressing Nanoplatform Induces Tumor-Specific Pyroptosis to Enhance Cancer Immunotherapy
2024-03-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c09405
PMID:38377037
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研究论文 | 本研究开发了一种基于逻辑“与门”电路的纳米平台,通过特异性诱导肿瘤细胞焦亡来增强癌症免疫治疗 | 采用合成生物学策略构建了基于Hif-1α和Sox4双输入信号的逻辑“与门”电路,实现肿瘤特异性焦亡诱导 | 未明确说明动物模型类型和长期毒性评估 | 开发具有肿瘤特异性的焦亡诱导系统以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤细胞和免疫系统 | 合成生物学 | 癌症 | 纳米技术、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学电路设计 | 哺乳动物细胞 | 逻辑“与门”电路,以Hif-1α和Sox4为输入信号,gasdermin D诱导焦亡为输出信号 | 医学 |
| 376 | 2025-10-05 |
Translational activation by a synthetic PPR protein elucidates control of psbA translation in Arabidopsis chloroplasts
2024-Oct-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae112
PMID:38593198
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研究论文 | 本研究通过合成PPR蛋白替代HCF173功能,揭示了拟南芥叶绿体中psbA翻译的光调控机制 | 首次证明合成PPR蛋白能够部分替代天然HCF173蛋白的功能激活psbA翻译,但无法实现光响应调控 | 合成PPR蛋白只能部分恢复HCF173功能,且无法实现光响应翻译调控 | 探究叶绿体psbA mRNA翻译的光调控分子机制 | 拟南芥叶绿体psbA mRNA及其翻译调控蛋白HCF173 | 合成生物学 | NA | 合成PPR蛋白设计、体内结合分析、翻译活性检测 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 合成PPR蛋白 | 拟南芥 | 翻译激活系统 | 合成生物学, 基础研究 |
| 377 | 2025-10-05 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 评估多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中的性能,并研究RNA支架对其荧光强度的影响 | 发现DF30-tRNA支架能使Pepper适配体荧光增强199倍,并实现活细胞中双色同时成像 | NA | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中荧光性能的影响 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | NA | RNA合成生物学工具 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,鼠伤寒沙门氏菌 | 多色荧光适配体Pepper, DF30-tRNA支架 | 工业生物技术,医学 |
| 378 | 2025-10-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 本研究探讨了DNA纳米结构与脂质膜相互作用的立体效应控制机制 | 首次系统研究了DNA纳米结构锚点立体环境对膜相互作用的影响,揭示了局部纳米尺度形态比全局囊泡尺寸更关键的作用机制 | 研究仅针对四种特定立体环境,尚未涵盖所有可能的几何构型 | 阐明DNA纳米结构与双层膜相互作用的立体控制原理 | 具有不同立体环境膜锚点的3D DNA纳米结构和不同尺寸的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 实验数据 | 四种不同立体环境的DNA纳米结构锚点 | DNA折纸技术 | NA | 膜相互作用控制系统 | 生物传感,诊断,合成生物学 |
| 379 | 2025-10-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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研究论文 | 开发了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层的软合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关T细胞表型 | 首次将侧向配体流动性作为T细胞体外扩增技术设计的第三关键维度,并揭示了其在调节T细胞表型和激活中的重要作用 | NA | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术 | 治疗相关的T细胞表型,特别是调节性CD8 T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离技术,脂质双分子层技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 人工抗原呈递细胞设计 | 医学 |
| 380 | 2025-10-05 |
Polymerase-Based Signal Delay for Temporally Regulating DNA Involved Reactions, Programming Dynamic Molecular Systems, and Biomimetic Sensing
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400142
PMID:38676334
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA聚合酶的信号延迟系统,用于调控DNA参与反应的时序行为 | 首次通过分子动力学模拟和荧光分析表征DNA聚合酶活性,开发了通过引物悬垂、抑制剂和模板长度调控信号延迟的新策略 | 信号延迟时间范围有限(10分钟至10分钟),在活细胞内的应用效果尚未验证 | 开发能够精确操控分子信号时序行为的仿生分子系统 | DNA聚合酶催化的引物延伸和DNA链置换反应 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,荧光分析,等温DNA扩增 | NA | 分子模拟数据,荧光信号数据 | NA | DNA聚合酶,DNA模板设计 | 无细胞系统 | 信号延迟电路,动态分子信号系统,条形码检测系统 | 无细胞合成生物学,仿生传感 |