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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-11-20 |
The Enigma of Transcriptional Activation Domains
2024-Nov-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168766
PMID:39214280
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review | 本文综述了真核基因激活域(ADs)的机制模型,提出了一种基于表面活性剂样近随机交互作用的新模型 | 提出了基于表面活性剂样近随机交互作用的新机制模型,与传统生物化学原理不同 | NA | 重新思考和解释真核基因激活域的功能机制 | 真核基因激活域及其与基因启动子核小体的交互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-11-20 |
Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology
2024-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007
PMID:38622041
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综述 | 本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在合成生物学工具开发、化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha具有快速生长、耐热性和广泛的底物谱等独特特性,通过合成生物学改造,可用于生产高附加值化学品 | NA | 探讨Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha及其在化学品生产和系统生物学中的应用 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-11-20 |
A new era of synthetic biology-microbial community design
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae011
PMID:39086602
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在微生物群落设计中的最新进展,并提出了基于模块化建模的无机体方法 | 提出了将合成生物学与计算模型完全整合的新方法,强调模块化建模在设计多物种群落中的应用 | 尚未完全实现模型与合成设计过程的整合 | 探讨合成生物学在微生物群落设计中的应用,并提出新的设计方法 | 微生物群落及其功能模块 | 合成生物学 | NA | NA | 模块化计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-11-20 |
Data hazards in synthetic biology
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae010
PMID:38973982
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研究论文 | 本文介绍了在合成生物学中数据科学应用的潜在风险,并提出了一个社区开发的框架来评估这些数据风险 | 提出了一个社区开发的框架来评估合成生物学中的数据风险,并应用于两个案例研究 | 未详细说明具体的案例研究细节和框架的具体实施步骤 | 探讨数据科学在合成生物学中的应用风险,并提出相应的评估框架 | 合成生物学中的数据风险 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据 | 两个合成生物学案例研究 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-11-20 |
Navigating the 'moral hazard' argument in synthetic biology's application
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae008
PMID:38828013
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中的'道德风险'问题,并提出了应对策略 | 本文提出了应对合成生物学应用中道德风险的具体方法 | 未提及具体的技术或模型,缺乏实证研究 | 探讨合成生物学应用中的道德风险问题,并提出解决方案 | 合成生物学技术及其应用中的道德风险 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
A new Editor-in-chief for Synthetic Biology
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae006
PMID:38638609
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-11-20 |
Preparing for the future of precision medicine: synthetic cell drug regulation
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae004
PMID:38327596
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研究论文 | 讨论了合成细胞药物在精准医学未来发展中的监管挑战 | 提出了合成细胞作为新型生物反应器的潜力,并探讨了其在合成生物学和生物医学中的应用前景 | 文章主要讨论了监管方面的挑战,未深入探讨技术实现的具体细节 | 探讨合成细胞药物在精准医学中的应用及监管挑战 | 合成细胞及其在生物医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成细胞技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-11-20 |
In vitro transcription-based biosensing of glycolate for prototyping of a complex enzyme cascade
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae013
PMID:39399720
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研究论文 | 开发了一种基于体外转录(IVT)的生物传感工作流程,用于复杂酶级联反应和代谢网络的定量和原型设计 | 提出了基于体外转录的生物传感方法,能够以较低成本和更快速度定量复杂代谢系统中的甘醇酸 | 研究主要集中在甘醇酸传感模块的开发和优化,未涉及其他代谢物的检测 | 开发一种新的生物传感方法,用于复杂代谢系统的定量分析和原型设计 | 甘醇酸传感模块及其在复杂代谢系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录(IVT) | NA | 代谢物 | 涉及13种共因子 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-11-19 |
Advancements in sustainable production of biofuel by microalgae: Recent insights and future directions
2024-Dec-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2024.119902
PMID:39222730
|
研究论文 | 本文综述了利用微藻可持续生产生物燃料的最新进展和未来方向 | 探讨了合成生物学、代谢工程工具、微藻生物炼制和优化藻类生长条件的最新进展 | NA | 探讨微藻作为可持续和可行的生物燃料原料的潜力及其生产过程中的生命周期、能量平衡和环境影响 | 微藻及其在生物燃料生产中的应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-11-19 |
Calcium-Dependent Lipopeptide Antibiotics against Drug-Resistant Pathogens Discovered via Host-Dependent Heterologous Expression of a Cloned Biosynthetic Gene Cluster
2024-Nov-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202410286
PMID:39175099
|
研究论文 | 通过宿主依赖的异源表达克隆的生物合成基因簇,发现了一种钙依赖性脂肽抗生素,用于对抗耐药性病原体 | 发现了一种新的钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A,其通过与Lipid II的不同结合位点抑制细胞壁合成,且在肺表面活性剂存在下仍保持强大的抗菌活性 | 异源宿主的选择对生物活性化合物的产生至关重要,不当的选择会导致非活性衍生物的异常产生 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法,发现新的抗耐药性病原体的抗生素 | 钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A和B,以及其对耐药性革兰氏阳性病原体的活性 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | 多个链霉菌宿主菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-11-19 |
Co-transcriptional production of programmable RNA condensates and synthetic organelles
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01726-x
PMID:39080489
|
研究论文 | 本文介绍了一种模块化平台,用于从定制的分支RNA纳米结构中工程化合成RNA凝聚物和合成细胞器 | 本文引入了可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的共转录生产方法,通过嵌入的荧光亮起适配体实现荧光染料的选择性积累,并展示了捕获蛋白质的能力 | NA | 开发一种可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的工程化平台,以在合成生物学和合成细胞科学中实现细胞功能的编程 | RNA凝聚物和合成细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米结构设计与合成 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-11-19 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
|
研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌诱导的肿瘤特异性抗体促进膀胱癌免疫治疗的效果 | 利用合成生物学技术改造益生菌Nissle 1917表达人趋化因子CXCL13,增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断疗法结合,显著提高治疗效果 | NA | 探索工程化细菌在膀胱癌免疫治疗中的应用 | 膀胱癌及其免疫治疗 | NA | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-11-17 |
Efficient DNA-free co-targeting of nuclear genes in Chlamydomonas reinhardtii
2024-Nov-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00545-3
PMID:39529073
|
研究论文 | 本文开发了一种高效的无需DNA标记的基因破坏策略,用于在莱茵衣藻中进行基因编辑 | 提出了无需抗生素抗性标记的基因编辑方法,显著提高了基因编辑效率,并实现了多基因同时破坏 | 主要限制在于DNA整合问题 | 开发一种高效的基因编辑工具,用于莱茵衣藻的基因插入、删除或编辑 | 莱茵衣藻中的基因编辑效率和多基因同时破坏 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-11-17 |
Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization
2024-Nov-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05966-5
PMID:39516723
|
研究论文 | 本文提出了一种基于抽象和自适应记忆化的反应网络分段模拟技术 | 利用基于种群的抽象和先前生成的模拟片段组合,提出了一种新的记忆化技术,以更高效地生成新模拟 | NA | 加速复杂随机系统的轨迹生成并准确预测其瞬态行为 | 反应网络的随机模型 | 系统生物学 | NA | 自适应记忆化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-11-17 |
Recent advances in the characterization of essential genes and development of a database of essential genes
2024-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.157
PMID:38868518
|
综述 | 本文总结了必需基因的研究进展,概述了相关数据库,并讨论了它们的实际应用 | 建立了必需基因数据库(DEG),并提供了其主要应用的概述和最新版本的全面分析 | 必需基因是一个动态概念而非二元概念,这为未来的发展带来了机遇和挑战 | 促进必需基因的研究,支持药物和疫苗开发以及人工基因组设计与构建 | 必需基因及其相关数据库 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-11-15 |
Sequential delivery of photosensitizers and checkpoint inhibitors by engineered bacteria for enhanced cancer photodynamic immunotherapy
2024-Dec, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28829
PMID:39138638
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研究论文 | 开发了一种基于工程细菌的递送系统,用于顺序递送光敏剂和检查点抑制剂,以增强癌症的光动力免疫治疗 | 引入了一种新的工程细菌递送系统,能够顺序递送光敏剂和检查点抑制剂,显著提高了治疗效率 | NA | 开发一种新的癌症治疗策略,通过工程细菌递送光敏剂和检查点抑制剂,增强光动力免疫治疗的效果 | 癌症治疗中的光动力免疫治疗 | 生物工程 | 癌症 | 光动力疗法 (PDT) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-11-15 |
CILF: CRISPR/Cas9 based integration of large DNA fragments in Saccharomyces cerevisiae
2024-Dec, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28830
PMID:39154293
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9的酵母中大DNA片段整合方法CILF | 开发了一种新的融合蛋白Cas9-Brex27-FadR,用于高效整合大DNA片段,并显著提高了同源重组效率 | NA | 开发一种高效的大DNA片段整合技术,以加速细胞工厂的构建 | 酵母中的大DNA片段整合 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA片段 | 使用10 kb和40 kb的DNA片段进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-11-15 |
Synthesis of β-ionone from xylose and lignocellulosic hydrolysate in genetically engineered oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-024-03534-8
PMID:39377872
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研究论文 | 研究通过基因工程改造的油脂酵母Yarrowia lipolytica从木糖和木质纤维素水解物中合成β-紫罗兰酮 | 通过多轮迭代转化和蛋白质标记策略优化了关键基因的表达,并引入了异源氧化还原酶途径,使工程化的Y. lipolytica能够利用木糖作为唯一碳源生产β-紫罗兰酮 | NA | 开发高效、绿色和可持续的β-紫罗兰酮生产方法 | β-紫罗兰酮的生产和优化 | 生物工程 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-11-15 |
Advanced bacteria-based biomaterials for environmental applications
2024-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131646
PMID:39419409
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综述 | 本文综述了基于微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP)的先进生物材料在环境应用中的发展 | 结合合成生物学和材料科学,开发可持续的工程活体材料(ELMs),作为传统建筑材料的潜在替代品 | 商业规模应用MICP技术面临的经济挑战和环境问题 | 描述细菌载体和基于MICP的先进ELMs的持续发展 | 微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP)和工程活体材料(ELMs) | 材料科学 | NA | 微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-11-15 |
A dual program for CRP-mediated regulation in bacterial alarmone (p)ppGpp
2024-Nov-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02430-24
PMID:39365062
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研究论文 | 本文研究了cAMP受体蛋白(CRP)在细菌警报素(p)ppGpp稳态中的双重调控作用 | 发现了CRP作为(p)ppGpp稳态的主调控因子,并通过YfiQ依赖的翻译调控机制增强了RelA、SpoT和CRP自身的翻译 | NA | 揭示CRP在基因表达和细胞功能调控中的作用 | cAMP受体蛋白(CRP)、(p)ppGpp、RelA、SpoT | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |