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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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361 | 2024-10-17 |
Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules
2024-Oct-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae742
PMID:39193902
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法,利用机器学习定义的共调控基因组(iModulons)作为设计部件,用于调节细菌功能 | 本研究提出了一种基于iModulon的工程方法,通过识别不同背景下遗传电路所需的组件,增强了基因组工程,提高了目标选择和模块行为预测的准确性 | NA | 研究旨在通过基于iModulon的方法,系统且可预测地重新编程细胞功能,提供对复杂调控网络的精细和可适应控制 | 细菌细胞功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 基因组数据 | NA |
362 | 2024-10-17 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-Oct, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
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评论 | 本文讨论了重现内皮细胞功能的下一代血液相容性涂层的潜力 | 提出了一种结合自下而上的合成生物学(特别是合成细胞)与被动和生物活性表面涂层的综合方法,以开发能够重现内皮细胞功能的先进生物材料 | NA | 探讨如何通过先进的涂层技术重现内皮细胞的功能,以提高血液接触医疗设备的血液相容性和性能 | 内皮细胞及其在血液接触医疗设备中的功能重现 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
363 | 2024-10-17 |
Artificial intelligence-based prediction of pathogen emergence and evolution in the world of synthetic biology
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70014
PMID:39364593
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综述 | 本文探讨了人工智能在预测病原体出现和进化中的应用,特别是在合成生物学领域 | 提出了将生成式AI作为溯因推理的资源,以识别新技术(如合成生物学)带来的关键问题 | 本文仅限于动物病原体,未涵盖所有病原体类型 | 探讨人工智能在监测和控制病原体进化中的潜力 | 病原体的出现和进化,特别是由合成生物学引起的新技术 | 人工智能 | NA | 生成式AI | 生成式AI | NA | NA |
364 | 2024-10-17 |
Escherichia coli on colorectal cancer: A two-edged sword
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70029
PMID:39400440
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综述 | 本文创新性地提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,探讨了如何利用大肠杆菌的矛盾性质进行结直肠癌的筛查和治疗 | 提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,并探讨了其在筛查和治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群与结直肠癌之间的关系仍不明确,应用大肠杆菌时应考虑其与其他微生物、宿主和环境因素的相互作用及其自身的变化 | 探讨大肠杆菌在结直肠癌筛查和治疗中的潜在应用 | 大肠杆菌及其在结直肠癌中的作用 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA |
365 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.582796
PMID:38562818
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9和同源独立靶向整合(HITI)技术将报告基因或治疗基因整合到高表达位点的精度和效果 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将基因整合到高表达位点,为基因替换疗法提供了新的方法 | 研究主要在老鼠肌细胞中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的基因替换技术 | 骨骼肌中的肌酸激酶(Ckm)和肌红蛋白(Mb)启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 老鼠肌细胞 |
366 | 2024-10-17 |
Pseudomonas putida as a platform for medium-chain length α,ω-diol production: Opportunities and challenges
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14423
PMID:38528784
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综述 | 本文综述了利用Pseudomonas putida生产中链长度α,ω-二醇的进展,并提出了可持续生产二醇的四模块方法 | 提出了利用Pseudomonas putida作为微生物平台生产中链长度α,ω-二醇的四模块方法 | 尽管取得了进展,但仍存在挑战,如中间产物的毒性等问题 | 探讨利用Pseudomonas putida作为微生物细胞工厂生产中链长度α,ω-二醇的机会和挑战 | Pseudomonas putida和中链长度α,ω-二醇的生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
367 | 2024-10-17 |
Microbial biotechnology and beyond: A roadmap for sustainable development and climate mitigation in the transition from fossil fuels to green chemistry
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14434
PMID:38465780
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研究论文 | 本文探讨了微生物技术在从化石燃料向绿色化学转型中的作用,以及其在可持续发展和气候缓解中的重要性 | 强调了微生物在维持生物循环和合成生物学工具在生产非化石燃料和化学品中的创新应用 | 面临非食品残渣和废物的可用性、成本效益的生物处理厂建设、发酵液中产品回收以及剩余木质素利用等挑战 | 推动从化石燃料向绿色化学的转型,实现可持续发展和气候缓解 | 微生物技术、合成生物学工具、非化石燃料和化学品生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
368 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
369 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
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研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 |
370 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展(GCE)方法将非经典氨基酸(ncAAs)定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展(GCE)方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸(ncAAs)的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸(ncAAs)的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
371 | 2024-10-15 |
Toward the bioactive potential of myricitrin in food production: state-of-the-art green extraction and trends in biosynthesis
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2227262
PMID:37395263
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综述 | 本文综述了蜜柑素在食品生产中的生物活性潜力,包括其绿色提取技术和生物合成趋势 | 本文介绍了创新的绿色提取技术和基于合成生物学的生物合成方法,为蜜柑素的大规模生产提供了新视角 | 蜜柑素的低产量、高成本以及从植物资源中提取带来的环境破坏限制了其实际应用 | 探讨蜜柑素的健康益处及其作用机制,为其应用提供理论基础 | 蜜柑素的生物活性、提取技术和生物合成方法 | NA | NA | 绿色提取技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
372 | 2024-10-14 |
Enhancing fatty acid and omega-3 production in Schizochytrium sp. using developed safe-harboring expression system
2024-Oct-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00447-y
PMID:39390586
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研究论文 | 开发了一种安全的转基因表达系统,用于增强Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 成功建立了一种稳健的同源重组系统,并确定了可靠的安全港基因整合位点,显著提高了DHA的生产 | NA | 开发和应用基因工程工具以增强脂质生产,促进工业生产 | Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | NA | NA |
373 | 2024-10-14 |
Achievements and perspectives of synthetic biology in botanical insecticides
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30888
PMID:36183373
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物源杀虫剂异源生产中的最新进展、挑战和可行策略 | 探讨了通过合成生物学解决植物源杀虫剂生产中当前问题的潜力 | 许多植物源杀虫剂的生物合成途径尚未完全阐明,且这些生物合成酶在新宿主中的低效性和细胞毒性问题仍待解决 | 总结植物源杀虫剂异源生产的最新进展,分析当前挑战,并讨论可行生产策略 | 植物源杀虫剂的生物合成途径、酶工程、宿主工程和细胞毒性工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
374 | 2024-10-14 |
Phylogenetic analysis and functional characterization of norcoclaurine synthase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis in Stephania tetrandra
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31065
PMID:37357496
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研究论文 | 本文对Stephania tetrandra中的norcoclaurine synthase(NCS)进行了系统发育分析和功能表征,该酶参与苯基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成 | 首次在Menispermaceae科植物中鉴定并功能表征了NCS基因,并将其整合到工程酵母中以生产norcoclaurine | NA | 研究NCS基因在苯基异喹啉生物碱生物合成中的作用及其系统发育关系 | Stephania tetrandra中的NCS基因及其功能 | 生物化学 | NA | 酶学分析 | NA | 基因序列 | 两个功能性StNCS基因 |
375 | 2024-10-14 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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review | 本文回顾了过去两个世纪疫苗学领域的关键创新,并展望了未来疫苗技术的变革 | 本文介绍了逆转疫苗学、合成生物学和基于结构的疫苗设计等技术革命,以及mRNA疫苗和新型佐剂的发展对疫苗开发的影响 | NA | 探讨疫苗学领域的历史创新和未来技术变革 | 疫苗学领域的关键创新和技术进步 | NA | NA | 逆转疫苗学、合成生物学、基于结构的疫苗设计 | NA | NA | NA |
376 | 2024-10-13 |
Engineering Synthetic Erythrocytes as Next-Generation Blood Substitutes
2024-Jul-10, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202315879
PMID:39386164
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综述 | 本文综述了血液替代品领域的进展,特别是人工红细胞的开发 | 本文提出了合成工程红细胞作为最强大的方法,并从材料工程的角度描述了红细胞的生物结构和功能 | NA | 探讨血液替代品领域的不同策略及其在安全性和可扩展性方面的潜力 | 人工红细胞的开发和材料工程方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
377 | 2024-10-12 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 研究了硅藻Phaeodactylum tricornutum中凝血酶样蛋白的活性及其在生物技术中的应用 | 发现了Phaeodactylum tricornutum中一种新的凝血酶样蛋白酶,并验证了其在活体内的切割效率 | NA | 探索硅藻Phaeodactylum tricornutum中凝血酶样蛋白的功能及其在生物技术中的应用 | Phaeodactylum tricornutum中的凝血酶样蛋白及其在活体内的切割效率 | 生物技术 | NA | 蛋白质结构预测和对接研究 | NA | 蛋白质序列 | 两个融合蛋白构建体 |
378 | 2024-10-12 |
Bacterial microcompartments as a next-generation metabolic engineering tool: utilizing nature's solution for confining challenging catabolic pathways
2024-06-26, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230229
PMID:38813858
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研究论文 | 本文探讨了细菌微区室作为下一代代谢工程工具的潜力,通过利用自然界提供的解决方案来限制具有挑战性的分解代谢途径 | 本文介绍了细菌微区室(BMCs)作为一种自主催化模块,能够克服异源生产途径中的低通量、酶的杂乱性、有毒中间体的形成或中间体流失到竞争反应中的问题 | NA | 研究细菌微区室在代谢工程中的应用,以提高生物产品的合成效率 | 细菌微区室及其在异源代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
379 | 2024-10-09 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
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综述 | 本文综述了在哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的最新进展及其在生物医学中的应用前景 | 本文介绍了利用可编程的蛋白质结合、蛋白酶解或磷酸化来调节蛋白质相互作用和细胞功能的合成蛋白质电路,这些电路具有性能稳定、功能快速和设计紧凑的优点 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞中的应用及其在生物医学中的潜在价值 | 合成蛋白质电路及其在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合、蛋白酶解、磷酸化 | NA | NA | NA |
380 | 2024-10-11 |
Every road leads to Rome: diverse biosynthetic regulation of plant cell wall-degrading enzymes in filamentous fungi Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei
2024-Nov, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2280810
PMID:38035670
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综述 | 本文综述了青霉菌和木霉菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 本文首次深入比较了青霉菌和木霉菌在植物细胞壁降解酶生物合成调控方面的差异 | NA | 探讨不同丝状真菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 青霉菌和木霉菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |