合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2024-09-27	[Biosafety risks, control, and biocontainment of engineered microalgae] 2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230812 PMID:39319717	研究论文	本文总结了前沿生物技术在微藻工程中的应用，以及工程微藻逃逸带来的生物安全风险和管理法规，并介绍了针对工程微藻的新型生物遏制技术的进展	本文介绍了基于有毒蛋白的kill switch设计和敲除必需基因以构建营养缺陷型菌株等新型生物遏制技术	NA	探讨工程微藻的生物安全风险及其控制和管理技术	工程微藻及其在自然环境中的生存和扩散	生物技术	NA	合成生物学和基因编辑技术	NA	NA	NA
382	2024-09-27	Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00672 PMID:39150229	研究论文	研究探讨了在太空旅行中使用脱水蓝细菌作为质粒DNA的有效载体	首次展示了脱水蓝细菌能够在无需低温或冷冻储存的情况下，安全地将质粒DNA运输到国际空间站并返回	研究仅限于特定的蓝细菌株和质粒，可能不适用于所有生物系统	探索在太空环境中使用合成生物学和生物制造的有效运输方法	脱水蓝细菌PC73102及其携带的非天然质粒pSCR119	合成生物学	NA	NA	NA	DNA	涉及一种蓝细菌株PC73102和一种质粒pSCR119
383	2024-09-27	Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00248 PMID:39158169	研究论文	本文报道了在Shewanella oneidensis MR-1中开发高效方法，实现非经典氨基酸（ncAAs）在c型细胞色素中的位点特异性插入	本文展示了ncAA插入的生物合成机制与MR-1的天然蛋白质合成、成熟和分泌途径的兼容性和正交性，并成功合成了包含ncAA的c型细胞色素MtrC	NA	开发在Shewanella oneidensis MR-1中实现非经典氨基酸位点特异性插入的方法	c型细胞色素MtrC	生物技术	NA	遗传密码扩展	NA	蛋白质	Shewanella oneidensis MR-1细胞
384	2024-09-27	Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00391 PMID:39163395	研究论文	本文综述了合成生物学在天然产物工程中的最新进展，涵盖了从发现、设计、构建、测试到学习的生物工程循环	介绍了AI支持的基因挖掘、酶和途径工程以及化合物识别的计算工具的最新进展，以及提高生产水平的新宿主系统和新技术	未提及具体的研究局限性	探讨合成生物学在天然产物工程中的应用，强调负责任的研究和创新	基因工程、酶和途径工程、化合物识别、新宿主系统和生产技术	合成生物学	NA	基因工程、酶工程、途径工程	NA	基因组数据	未提及具体样本数量
385	2024-09-27	Optimized CRISPR Interference System for Investigating Pseudomonas alloputida Genes Involved in Rhizosphere Microbiome Assembly 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00312 PMID:39163848	研究论文	描述了一种在KT2440中使用的CRISPR干扰系统，用于研究根际微生物群落中的微生物相互作用	开发了一种包含三种不同启动子系统和dCas9密码子优化的CRISPR干扰系统，适用于Pseudomonas alloputida，并展示了其在根际微生物群落中的功能	讨论了环境因素如培养基选择对CRISPR干扰成功率的影响	研究根际微生物群落中的微生物相互作用	KT2440中的基因及其在根际微生物群落中的功能	合成生物学	NA	CRISPR干扰	NA	基因表达数据	NA
386	2024-09-27	Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00313 PMID:39174016	综述	本文综述了利用微生物群落作为活体材料的研究进展和前景	介绍了两种设计由微生物群落组成的活体材料的策略：自上而下的策略和自下而上的策略	基于微生物群落的活体材料仍处于发展阶段	探讨利用微生物群落作为活体材料的设计策略和技术，并讨论其面临的挑战和未来展望	微生物群落及其在活体材料中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
387	2024-09-27	Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00307 PMID:39230510	研究论文	本文展示了通过JAX库在计算合成生物学中的应用	本文首次展示了JAX在计算合成生物学中的应用，并提供了三个示例项目和相应的Jupyter笔记本	本文未详细讨论JAX在计算合成生物学中的局限性	展示JAX在计算合成生物学中的应用，并促进其在该领域的普及	JAX库在合成生物学和定向进化中的应用	计算生物学	NA	JAX	NA	NA	NA
388	2024-09-27	Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00276 PMID:39300908	review	本文回顾了冷泉港实验室合成生物学夏季课程的历史、发展和结构	该课程整合了实验室实践、研究轮换和领域领袖的讲座，涵盖了合成生物学的多个关键主题	NA	探讨如何通过该课程影响其他合成生物学短期课程的开发	冷泉港实验室合成生物学夏季课程的结构和内容	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
389	2024-09-27	Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding 2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.06.06.543915 PMID:37333159	研究论文	本文研究了生长反馈对适应性基因电路的影响，并揭示了电路故障的动态机制	发现了电路鲁棒性与生长反馈强度之间的缩放规律，并识别出在生长反馈下仍能保持最佳性能的电路	仅限于转录调控电路的适应性研究，未涵盖其他类型的基因电路	理解生长反馈对基因电路动态行为的影响，并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构	适应性基因电路及其在生长反馈下的动态行为	合成生物学	NA	NA	NA	NA	超过四百种拓扑结构
390	2024-09-26	From β-Carotene to Retinoids: A Review of Microbial Production of Vitamin A 2024-Sep-25, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c06851 PMID:39285668	综述	本文综述了从β-胡萝卜素到视黄醇的微生物生产维生素A的过程	介绍了利用合成生物学通过微生物细胞工厂进行维生素A生物合成的创新方法	仍面临挑战，如优化维生素A生物合成的策略和未来发展方向	探讨微生物生产维生素A的现状和未来发展方向	维生素A的生物合成过程及其在食品、制药和动物饲料行业的应用	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
391	2024-09-26	[Developing a curriculum cluster in "Synthetic Biology" to cultivate inter-disciplinary and innovative talents for biomanufacturing] 2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230637 PMID:39319741	研究论文	本文介绍了华东理工大学在合成生物学领域建立的课程集群，旨在培养生物制造领域的跨学科和创新型人才	通过整合合成生物学的核心课程和相关学科，利用国内外知名教授的讲座和丰富的资源，提升学生的创新能力	NA	培养生物制造领域的跨学科和创新型人才	合成生物学课程集群及其对学生创新能力的提升	生物技术	NA	NA	NA	NA	NA
392	2024-09-26	[Design and practice of integrating artificial intelligence into the teaching of "Synthetic Biology" under the background of discipline crossing] 2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.240317 PMID:39319740	研究论文	本文探讨了在学科交叉背景下，将人工智能融入合成生物学教学的设计与实践	提出了将人工智能与合成生物学教学内容相结合的系统设计，并介绍了在江南大学合成生物学课程中的具体实施路径	未详细说明具体的教学效果评估方法	探讨如何将人工智能融入合成生物学教学，以培养跨学科高水平人才和促进协同创新	合成生物学课程的教学内容和方法	合成生物学	NA	人工智能	NA	NA	NA
393	2024-09-26	Y-switch: a spring-loaded synthetic gene switch for robust DNA/RNA signal amplification and detection 2024-Sep-23, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae680 PMID:39149901	研究论文	介绍了一种名为Y-Switch的新型TMSD级联设计，用于增强DNA/RNA信号的检测和放大	Y-Switch设计基于一对热力学弹簧加载的DNA模块，能够在无正确触发器的情况下实现高灵敏度和零背景信号	NA	开发一种经济且高效的核酸检测方法，用于生物医学诊断	Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列	合成生物学	NA	toehold介导的链置换（TMSD）	NA	核酸序列	Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列
394	2024-09-26	Overexpression of RuBisCO form I and II genes in Rhodopseudomonas palustris TIE-1 augments polyhydroxyalkanoate production heterotrophically and autotrophically 2024-09-18, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01438-24 PMID:39162566	研究论文	本研究通过在Rhodopseudomonas palustris TIE-1中过表达RuBisCO I型和II型基因，增强了聚羟基脂肪酸酯（PHA）的异养和自养生产	开发了一种噬菌体整合系统，成功将RuBisCO I型和II型基因整合到TIE-1基因组中，显著提高了PHA产量	NA	通过基因工程手段提高微生物生产生物塑料的能力	Rhodopseudomonas palustris TIE-1及其PHA生产能力	合成生物学	NA	基因编辑	NA	基因组数据	多种代谢突变体和过表达菌株
395	2024-09-26	Harnessing the endogenous Type I-C CRISPR-Cas system for genome editing in Bifidobacterium breve 2024-03-20, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.02074-23 PMID:38319094	研究论文	本文研究了利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中进行基因编辑的可行性	首次利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中实现了基因删除、单碱基替换、基因插入和连续基因编辑	研究仅限于特定的双歧杆菌菌株，未涵盖所有双歧杆菌种类	开发新的基因编辑工具，以促进双歧杆菌的功能基因组编辑和分析	双歧杆菌中的I-C型CRISPR-Cas系统及其在基因编辑中的应用	基因编辑	NA	CRISPR-Cas系统	NA	基因序列	五种双歧杆菌菌株
396	2024-09-26	Measuring differential fitness costs and interactions between genetic cassettes using fluorescent spectrophotometry 2024-02-21, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01419-23 PMID:38299817	研究论文	本文介绍了一种利用荧光分光光度法设计、执行和分析微生物竞争实验数据的方法	本文提出了一种新的方法来测量不同合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用，通过荧光报告基因标记不同的竞争菌株并使用荧光分光光度计解析个体生长曲线	本文提到了在荧光和密度校准以及荧光蛋白成熟速率不同方面的挑战	本文旨在开发一种方法来测量合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用	本文研究的对象是不同合成基因盒在微生物竞争实验中的表现	合成生物学	NA	荧光分光光度法	NA	荧光数据	10种不同的质粒和3种基因组整合的荧光标记的菌株
397	2024-09-25	Treatment of neurologic pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA 2024-Sep-24, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awae304 PMID:39315766	研究论文	本研究开发了一种合成生物学策略，通过重新编程宿主肝脏作为组织底盘，诱导和传递体内自组装siRNA（IVSA-siRNA），以靶向ATXN3基因，治疗Machado-Joseph病（SCA3）	本研究创新性地利用合成生物学方法，通过重新编程肝脏产生并分泌包裹mATXN3-siRNA的小胞外囊泡（sEVs），成功跨越血脑屏障，抑制ATXN3基因表达，改善SCA3症状	本研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠模型中验证了该策略的有效性，尚未进行临床试验	开发一种新的治疗策略，通过靶向ATXN3基因，治疗Machado-Joseph病（SCA3）	Machado-Joseph病（SCA3）患者和小鼠模型	基因治疗	神经退行性疾病	体内自组装siRNA（IVSA-siRNA）	NA	基因表达数据	YACMJD84.2转基因小鼠
398	2024-09-25	Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures 2024-Sep-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52533-w PMID:39294165	研究论文	提出了一种基于几何图学习的酶功能预测模型GraphEC，利用ESMFold预测的结构和预训练的蛋白质语言模型	首次将几何图学习应用于酶功能预测，并结合了酶活性位点和结构特征	NA	开发一种更准确的酶功能预测方法	酶的活性位点、EC编号和最适pH值	机器学习	NA	几何图学习	GraphEC	蛋白质结构	NA
399	2024-09-25	A modular toolkit for environmental Rhodococcus, Gordonia, and Nocardia enables complex metabolic manipulation 2024-08-21, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00340-24 PMID:39082821	研究论文	开发了一种模块化质粒组装框架和一系列遗传控制元件，用于环境中的红球菌、戈登菌和诺卡氏菌，并展示了其在多个环境菌株中的功能	首次为环境中的红球菌、戈登菌和诺卡氏菌开发了模块化遗传工具包，并展示了其在多个菌株中的功能	NA	解决土壤中的放线菌缺乏遗传工具的问题，为这些菌株的表征和生物技术应用提供支持	红球菌、戈登菌和诺卡氏菌的环境菌株	NA	NA	模块化质粒组装	NA	NA	11个环境菌株
400	2024-09-25	Blue valorization of lignin-derived monomers via reprogramming marine bacterium Roseovarius nubinhibens 2024-07-24, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00890-24 PMID:38940564	研究论文	研究通过重新编程海洋细菌Roseovarius nubinhibens，将木质素衍生的芳香碳转化为高附加值化学品	首次在海洋细菌中应用基于CRISPR的调控系统，实现了对目标基因的精确高效抑制	NA	探索利用海洋细菌进行木质素生物转化，实现碳和水的双重节约	木质素衍生的单体4-羟基苯甲酸和海洋细菌Roseovarius nubinhibens	生物技术	NA	CRISPR干扰系统	CRISPRi	NA	NA