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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-12-06 |
Genetically engineered bacteria as inflammatory bowel disease therapeutics
2024-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100167
PMID:39628589
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学技术开发基因工程细菌作为炎症性肠病治疗和检测的新策略 | 介绍了基因工程细菌在治疗和检测炎症性肠病方面的最新突破 | 讨论了从细菌设计到临床应用的活细菌治疗策略面临的挑战 | 探讨基因工程细菌在炎症性肠病治疗和检测中的应用 | 基因工程细菌及其在炎症性肠病治疗和检测中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-12-06 |
Biofuel production from lignocellulose via thermophile-based consolidated bioprocessing
2024-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100174
PMID:39628591
|
综述 | 本文综述了利用嗜热菌进行整合生物加工(CBP)将木质纤维素转化为生物燃料的最新进展 | 介绍了利用CRISPR/Cas基因编辑工具和Design-Build-Test-Learn合成生物学策略设计构建嗜热CBP宿主的潜力 | NA | 探讨如何开发高度复杂的嗜热CBP宿主以应用于木质纤维素生物炼制 | 嗜热酶、嗜热木质纤维素降解微生物、嗜热CBP候选菌株及基因编辑工具 | 生物工程 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-12-06 |
An upgraded Myxococcus xanthus chassis with enhanced growth characteristics for efficient genetic manipulation
2024-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100155
PMID:39629111
|
研究论文 | 本文通过工程化改造Myxococcus xanthus菌株DK1622,获得了具有增强生长特性的Hu04菌株,以提高遗传操作效率 | 通过基因工程手段,成功改造了Myxococcus xanthus菌株,使其缺乏多细胞行为和色素,同时保持营养生长和相似的代谢背景,显著改善了分散生长特性 | NA | 提高Myxococcus xanthus菌株的遗传操作效率 | Myxococcus xanthus菌株DK1622及其工程化菌株Hu04 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-12-06 |
Steroidal scaffold decorations in Solanum alkaloid biosynthesis
2024-08-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2024.06.013
PMID:38937971
|
研究论文 | 研究报告了通过比较代谢组学-转录组学引导的方法,发现12种酶将胆固醇前体转化为solasodine苷元,以及下游的α-solasonine、α-solamargine和malonyl-solamargine SGA产物 | 首次揭示了植物如何合成这些具有生物活性的类固醇分子,并提供了基因工具箱和平台,用于在异源宿主中通过合成生物学生产高价值的类固醇生物活性分子 | NA | 揭示Solanum植物中类固醇糖苷生物合成的机制 | Solanum植物中的类固醇糖苷及其生物合成酶 | NA | 癌症 | 比较代谢组学-转录组学 | NA | 代谢物 | 数百种Solanum物种,包括番茄、土豆和茄子等重要蔬菜作物 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-12-06 |
Identification and application of a strong bidirectional acmN2p promoter from actinomycin D-producing streptomycetes
2024-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2023.100121
PMID:39628790
|
研究论文 | 本文报道了从放线菌中发现的两个高产放线菌素D(ActD)菌株,并鉴定了一个强双向acmN2p启动子,并将其应用于异源表达三个核心基因,用于细菌生物碱bohemamine的生物合成 | 发现了两个高产ActD的放线菌菌株,并鉴定了一个强双向acmN2p启动子,应用于异源表达 | NA | 研究天然产物生物合成的合成生物学应用 | 放线菌素D(ActD)生产菌株和acmN2p启动子 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | 基因 | 两个高产ActD的放线菌菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-12-05 |
Cofactor recycling strategies for secondary metabolite production in cell-free protein expression systems
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01234-1
PMID:39618802
|
研究论文 | 本文探讨了在无细胞蛋白表达系统中再生辅因子以促进次级代谢产物生产的策略 | 提出了在无细胞蛋白合成系统中再生辅因子的策略,以实现复杂代谢产物的连续生产 | NA | 旨在克服无细胞蛋白合成系统中辅因子再生效率低下的问题,以促进次级代谢产物的生产 | 无细胞蛋白合成系统中的辅因子再生策略 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-12-02 |
Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids
2024-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02599-4
PMID:39609835
|
研究论文 | 通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素 | 通过基因重设计和异源转化,显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量 | 在较高光照强度下,bkt品系的生长速度较慢 | 开发可持续的生产生物分子的过程,利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性 | Nannochloropsis oceanica | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-12-01 |
An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins
2024-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02598-5
PMID:39614317
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY,通过突变提高其稳定性和产量,适用于多种蛋白质和肽的工程化任务 | 通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基,成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体,适用于生物正交应用 | NA | 开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体,用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰 | Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变,以及其在肽和蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质和肽 | 肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-12-01 |
Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae966
PMID:39460615
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型,用于识别细菌中的可逆启动子(invertons),并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式 | 首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子,并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用 | NA | 研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式 | 细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组和宏基因组数据 | 分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组,识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-12-01 |
Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae980
PMID:39526390
|
研究论文 | 本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件(synTCE),并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成,用于多路信号处理和细胞控制 | 引入了一种新的合成翻译耦合元件(synTCE),并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用 | NA | 开发定制化的生物系统功能,增强核糖调节器的计算能力和应用性 | 合成翻译耦合元件(synTCE)及其在生物系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-12-01 |
Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications
2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13111095
PMID:39596788
|
综述 | 本文综述了肉桂醛(TCA)的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用 | 本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用,并介绍了其在化妆品中的应用 | NA | 综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用 | 肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
|
综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险,并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节,主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险,并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-07 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status, developments, and tools in 2024
2024-Mar-01, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2024-0015
PMID:39026464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-12-01 |
Development of modular expression across phylogenetically distinct diazotrophs
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae033
PMID:39257030
|
研究论文 | 本文报道了优化协议和质粒,用于操纵系统发育多样的固氮菌,以实现合成生物学和基因工程 | 开发了三种广宿主范围的质粒,其中一种特定质粒在测试的细菌中表现出最高的兼容性,并展示了模块化表达和基因组编辑 | 仅在少数固氮菌中进行了测试,尚未广泛应用于农业应用 | 开发用于固氮菌的基因操作工具,以减少对合成肥料的需求 | 系统发育多样的固氮菌 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | 测试了三种固氮菌和一种Klebsiella michiganensis M5al | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-11-30 |
Pathway to industrial application of heterotrophic organisms in critical metals recycling from e-waste
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108438
PMID:39218325
|
综述 | 本文综述了异养生物在电子废弃物中回收关键金属的工业应用途径 | 讨论了如何通过简单的优化方法和先进的生物技术克服当前的障碍,并展示了新兴技术在生物浸出溶液中进行低成本、低影响、选择性和高级金属回收的潜力 | NA | 探讨异养生物在生物采矿中的应用及其在工业应用中的障碍和解决方案 | 异养微生物及其分泌的金属结合生物分子 | NA | NA | 生物浸出 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-11-30 |
The biosynthesis of L-phenylalanine-derived compounds by engineered microbes
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108448
PMID:39260779
|
综述 | 本文综述了通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展 | 本文总结了提高L-苯丙氨酸衍生物产量的主要策略,并展望了通过微生物方法合成L-苯丙氨酸衍生物的发展趋势 | 本文主要讨论了L-苯丙氨酸衍生物合成的挑战,如低产量和生产率 | 探讨通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展及其应用前景 | L-苯丙氨酸及其衍生物,包括苯基丙酮酸衍生物、反式肉桂酸衍生物、对香豆酸衍生物和其他L-苯丙氨酸衍生物(如黄酮类化合物) | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-11-30 |
Advances in multi-enzyme co-localization strategies for the construction of microbial cell factory
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108453
PMID:39278372
|
综述 | 本文综述了多酶共定位策略在构建微生物细胞工厂中的最新进展和应用 | 探讨了酶共定位策略在提高天然产物产量中的应用,并展望了未来结合多种策略与先进技术的研究方向 | 未提及具体实验数据或模型验证 | 探讨多酶共定位策略在生物制造中的应用及其未来发展方向 | 微生物细胞工厂及天然产物生产 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-11-30 |
Bioengineered heparin: Advances in production technology
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108456
PMID:39326809
|
综述 | 本文综述了肝素生物工程生产技术的最新进展 | 介绍了通过代谢工程和合成生物学在原核和真核系统中生产生物工程肝素的新方法 | 生物工程肝素生产中控制分子量和硫酸化模式的挑战 | 探讨肝素生物工程生产技术的最新进展及其在医学研究中的潜力 | 肝素的生产技术及其在治疗炎症、癌症和传染病中的应用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-11-30 |
The new chassis in the flask: Advances in Vibrio natriegens biotechnology research
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108464
PMID:39389280
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综述 | 本文综述了近年来在Vibrio natriegens生物技术研究中的进展 | 介绍了Vibrio natriegens作为生物工程工具的新兴潜力,并使用大型语言模型(LLM)和知识图谱加速文献调查过程 | 未具体提及 | 探讨Vibrio natriegens作为生物技术平台的潜力及其在生物工程应用中的影响 | Vibrio natriegens的基本代谢特性、合成生物学工具的开发与表征、系统生物学分析与代谢建模、生物生产与代谢工程以及微生物生态学 | 生物技术 | NA | 大型语言模型(LLM)、知识图谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-11-30 |
Editorial: Recent advances in application of synthetic biology for production of bioactive compounds, volume II
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1517610
PMID:39610939
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |