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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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381 | 2024-10-29 |
Synthetic Gene Circuits for Regulation of Next-Generation Cell-Based Therapeutics
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309088
PMID:38126677
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综述 | 本文综述了合成基因电路在调控下一代细胞治疗中的应用 | 讨论了基于转录、翻译和翻译后控制机制的开关在体内调控治疗细胞活性的优势和局限性 | 尚未详细讨论合成基因电路在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 探讨合成基因电路在细胞治疗中的应用及其对免疫反应的精确调控 | 合成基因电路、治疗细胞、慢性疾病 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA |
382 | 2024-10-29 |
Tissue engineering applications of recombinant human collagen: a review of recent progress
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1358246
PMID:38419725
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综述 | 本文综述了重组人胶原蛋白在生物医学系统中的应用,重点解决了其在临床应用中的关键问题 | 探讨了重组人胶原蛋白在材料科学和医学领域的创新应用,并介绍了3D打印技术结合重组胶原蛋白在再生修复中的潜力 | 实现重组人胶原蛋白的全部潜力并有效应用于最佳治疗效果仍是一个重大挑战 | 综述重组人胶原蛋白在生物材料领域的进展,促进再生生物材料和治疗手段的创新 | 重组人胶原蛋白及其在伤口愈合、基质再生和骨科等领域的应用 | 生物材料 | NA | 3D打印技术 | NA | NA | NA |
383 | 2024-10-28 |
Multicellular artificial neural network-type architectures demonstrate computational problem solving
2024-Nov, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01711-4
PMID:39285005
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研究论文 | 本文报道了一种通过混合和匹配离散工程细菌细胞创建的模块化多细胞系统,该系统能够设计解决多种计算决策问题 | 首次构建了一种基于工程细菌的模块化多细胞系统,模拟人工神经网络架构,能够执行计算任务 | NA | 开发一种能够解决多种计算决策问题的模块化多细胞系统 | 工程细菌细胞及其在计算任务中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络 | NA | NA |
384 | 2024-10-28 |
Regulatory RNAs in Bacillus subtilis: A review on regulatory mechanism and applications in synthetic biology
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.01.013
PMID:38385150
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综述 | 本文综述了枯草芽孢杆菌中调控RNA的机制及其在合成生物学中的应用 | 本文首次系统总结了枯草芽孢杆菌中内源性调控RNA的机制和功能,并探讨了其在合成生物学领域的工程和实际应用 | 主要集中在枯草芽孢杆菌上,未涵盖其他细菌模型 | 总结枯草芽孢杆菌中调控RNA的机制及其在合成生物学中的应用 | 枯草芽孢杆菌中的调控RNA及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
385 | 2024-10-28 |
An efficient CRISPR/Cas9 genome editing system based on a multiple sgRNA processing platform in Trichoderma reesei for strain improvement and enzyme production
2024-Feb-11, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02468-7
PMID:38342915
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研究论文 | 开发了一种基于多sgRNA处理平台的CRISPR/Cas9基因编辑系统,用于提高Trichoderma reesei菌株的酶产量 | 提出了基于tRNA-sgRNA阵列的CRISPR-Cas9编辑系统,能够高效处理多个sgRNA,实现多基因编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具,提高Trichoderma reesei菌株的酶产量 | Trichoderma reesei菌株及其相关酶的生产 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 基因序列 | NA |
386 | 2024-10-28 |
Towards using bacterial microcompartments as a platform for spatial metabolic engineering in the industrially important and metabolically versatile Zymomonas mobilis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1344260
PMID:38344288
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研究论文 | 研究利用细菌微区作为工业上重要的代谢多样的Zymomonas mobilis的空间代谢工程平台 | 提出了一种利用细菌微区(BMCs)作为代谢酶支架的新方法,以隔离和整合具有挑战性的代谢途径 | NA | 构建基于BMC的空间支架平台,以在未来生产高价值产品 | Zymomonas mobilis细菌 | 合成生物学 | NA | SDS-PAGE, 透射电子显微镜, 动态光散射 | NA | NA | NA |
387 | 2024-10-27 |
Semi-synthesis of a DNA-Tagged Polyketide-Peptide Hybrid Macrocycle Using a Biosynthetically Prepared Fungal Macrolide as a Synthetic Component
2024-Oct-25, Organic letters
IF:4.9Q1
DOI:10.1021/acs.orglett.4c03588
PMID:39415106
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研究论文 | 本文介绍了一种利用基因组挖掘和异源表达系统合成带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物的合成生物学方法 | 该研究展示了合成生物学在扩展构建模块多样性方面的潜力,有助于探索未知的化学空间 | NA | 探索合成生物学在扩展天然产物构建模块多样性方面的应用 | 带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源表达系统 | NA | NA | NA |
388 | 2024-10-27 |
Rhodopsin-based light-harvesting system for sustainable synthetic biology
2024-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14521
PMID:38949508
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评论 | 本文探讨了利用视紫红质在可持续合成生物学中的应用及其未来潜力 | 视紫红质具有显著的光化学特性,可用于开发可持续和节能的技术 | NA | 探索视紫红质在可持续工程中的应用 | 视紫红质及其在生物生产和可再生能源转换中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
389 | 2024-10-26 |
Biosynthesis of novel non-proteinogenic amino acids β-hydroxyenduracididine and β-methylphenylalanine in Escherichia coli
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1468974
PMID:39444519
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研究论文 | 研究在Escherichia coli中合成新型非蛋白质氨基酸β-羟基enduracididine和β-甲基苯丙氨酸 | 首次在E. coli中通过合成操纵子生产非蛋白质氨基酸β-甲基苯丙氨酸和β-羟基enduracididine,并发现外源添加途径前体可以显著提高β-甲基苯丙氨酸的产量 | NA | 探索在E. coli中合成新型非蛋白质氨基酸,以增强现有生物活性分子的多样性和效果 | 非蛋白质氨基酸β-羟基enduracididine和β-甲基苯丙氨酸 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学和代谢组学分析 | NA | NA | NA |
390 | 2024-10-26 |
Complete sequences of pIJ101-based Streptomyces-Escherichia coli shuttle vectors
2024, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000893.v3
PMID:39445316
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研究论文 | 本文通过下一代测序技术确定了两种常用的基于pIJ101的穿梭载体pEM4和pUWL201的完整序列 | 本文提供了这两种穿梭载体更准确的序列信息,纠正了先前报道的序列长度 | NA | 确定并更新两种常用穿梭载体的完整序列 | pIJ101-based穿梭载体pEM4和pUWL201 | 分子生物学 | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 两种穿梭载体pEM4和pUWL201 |
391 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性,以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 |
392 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡(GUVs)的形成过程 | 开发了高速显微镜设置,实时可视化GUV形成过程,揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚,蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理,并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡(GUVs)的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 |
393 | 2024-09-11 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文综述了MultiBac技术的发展过程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | MultiBac技术整合了合成生物学技术,提供了额外的多功能性 | MultiBac技术也存在一些缺点,研究人员在选择表达系统时应考虑其局限性 | 介绍MultiBac技术的发展和应用,为基本研究人员提供新方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac | NA | NA | NA |
394 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
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研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具,用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper,能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达,从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子,包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 |
395 | 2024-10-24 |
Characterization and Degradation of Triphenylmethane Dyes and Their Leuco-Derivatives by Heterologously Expressed Laccase From Coprinus cinerea
2024-Sep, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.4127
PMID:39420654
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法优化了来自Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1,并在Pichia pastoris中异源表达,评估了其对三苯甲烷染料及其无色衍生物的降解能力 | 通过合成生物学方法优化了漆酶基因Lcc1,并在Pichia pastoris中成功表达,展示了其对三苯甲烷染料的高效降解能力 | 研究主要集中在实验室条件下漆酶的表达和降解能力,未涉及实际环境中的应用效果 | 优化漆酶基因的表达,研究其对有机污染物的降解能力,为环境修复提供新方案 | Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1及其对三苯甲烷染料的降解 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 酶活性数据 | NA |
396 | 2024-10-24 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
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综述 | 本文综述了利用蛋白质域模块性在细胞控制应用中的进展 | 利用蛋白质域的模块性设计多功能合成结构和可控的分裂部分,以实现对细胞功能的精确控制 | NA | 探讨如何利用蛋白质域的模块性增强细胞疗法的功能和安全性 | 蛋白质域的模块性及其在细胞控制中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
397 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担,并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks,未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks |
398 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
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研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统,通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统,结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能,实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA |
399 | 2024-10-21 |
Plant synthetic genomics: Big lessons from the little yeast
2024-Oct-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.08.001
PMID:39214084
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母合成基因组学的经验来推动植物合成基因组学的发展 | 利用酵母和苔藓植物的相似性,提出了将酵母合成基因组学的技术应用于植物合成基因组学的新方法 | 植物基因组的复杂性仍然是主要挑战 | 探索将酵母合成基因组学的经验应用于植物合成基因组学的可能性 | 酵母和苔藓植物 Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
400 | 2024-10-21 |
Diagnosis and mitigation of the systemic impact of genome reduction in Escherichia coli DGF-298
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00873-24
PMID:39207109
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研究论文 | 研究了基因组简化对大肠杆菌DGF-298的影响,并通过重建代谢模型和适应性实验室进化来减轻这些影响 | 通过系统级方法和适应性实验室进化相结合,修复和优化基因组工程菌株 | NA | 研究基因组简化对大肠杆菌DGF-298的系统性影响并提出缓解措施 | 大肠杆菌DGF-298及其基因组简化后的代谢和表达调控 | 系统生物学 | NA | 代谢模型重建、iModulon-based转录组分析、适应性实验室进化 | 代谢模型 | 转录组数据 | 单一菌株DGF-298 |