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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-11-19 |
Co-transcriptional production of programmable RNA condensates and synthetic organelles
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01726-x
PMID:39080489
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化平台,用于从定制的分支RNA纳米结构中工程化合成RNA凝聚物和合成细胞器 | 本文引入了可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的共转录生产方法,通过嵌入的荧光亮起适配体实现荧光染料的选择性积累,并展示了捕获蛋白质的能力 | NA | 开发一种可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的工程化平台,以在合成生物学和合成细胞科学中实现细胞功能的编程 | RNA凝聚物和合成细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米结构设计与合成 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-11-19 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
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研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌诱导的肿瘤特异性抗体促进膀胱癌免疫治疗的效果 | 利用合成生物学技术改造益生菌Nissle 1917表达人趋化因子CXCL13,增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断疗法结合,显著提高治疗效果 | NA | 探索工程化细菌在膀胱癌免疫治疗中的应用 | 膀胱癌及其免疫治疗 | NA | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-11-17 |
Efficient DNA-free co-targeting of nuclear genes in Chlamydomonas reinhardtii
2024-Nov-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00545-3
PMID:39529073
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研究论文 | 本文开发了一种高效的无需DNA标记的基因破坏策略,用于在莱茵衣藻中进行基因编辑 | 提出了无需抗生素抗性标记的基因编辑方法,显著提高了基因编辑效率,并实现了多基因同时破坏 | 主要限制在于DNA整合问题 | 开发一种高效的基因编辑工具,用于莱茵衣藻的基因插入、删除或编辑 | 莱茵衣藻中的基因编辑效率和多基因同时破坏 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-11-17 |
Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization
2024-Nov-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05966-5
PMID:39516723
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研究论文 | 本文提出了一种基于抽象和自适应记忆化的反应网络分段模拟技术 | 利用基于种群的抽象和先前生成的模拟片段组合,提出了一种新的记忆化技术,以更高效地生成新模拟 | NA | 加速复杂随机系统的轨迹生成并准确预测其瞬态行为 | 反应网络的随机模型 | 系统生物学 | NA | 自适应记忆化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-11-17 |
Recent advances in the characterization of essential genes and development of a database of essential genes
2024-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.157
PMID:38868518
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综述 | 本文总结了必需基因的研究进展,概述了相关数据库,并讨论了它们的实际应用 | 建立了必需基因数据库(DEG),并提供了其主要应用的概述和最新版本的全面分析 | 必需基因是一个动态概念而非二元概念,这为未来的发展带来了机遇和挑战 | 促进必需基因的研究,支持药物和疫苗开发以及人工基因组设计与构建 | 必需基因及其相关数据库 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-11-15 |
Sequential delivery of photosensitizers and checkpoint inhibitors by engineered bacteria for enhanced cancer photodynamic immunotherapy
2024-Dec, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28829
PMID:39138638
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研究论文 | 开发了一种基于工程细菌的递送系统,用于顺序递送光敏剂和检查点抑制剂,以增强癌症的光动力免疫治疗 | 引入了一种新的工程细菌递送系统,能够顺序递送光敏剂和检查点抑制剂,显著提高了治疗效率 | NA | 开发一种新的癌症治疗策略,通过工程细菌递送光敏剂和检查点抑制剂,增强光动力免疫治疗的效果 | 癌症治疗中的光动力免疫治疗 | 生物工程 | 癌症 | 光动力疗法 (PDT) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-11-15 |
CILF: CRISPR/Cas9 based integration of large DNA fragments in Saccharomyces cerevisiae
2024-Dec, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28830
PMID:39154293
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9的酵母中大DNA片段整合方法CILF | 开发了一种新的融合蛋白Cas9-Brex27-FadR,用于高效整合大DNA片段,并显著提高了同源重组效率 | NA | 开发一种高效的大DNA片段整合技术,以加速细胞工厂的构建 | 酵母中的大DNA片段整合 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA片段 | 使用10 kb和40 kb的DNA片段进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-11-15 |
Synthesis of β-ionone from xylose and lignocellulosic hydrolysate in genetically engineered oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-024-03534-8
PMID:39377872
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研究论文 | 研究通过基因工程改造的油脂酵母Yarrowia lipolytica从木糖和木质纤维素水解物中合成β-紫罗兰酮 | 通过多轮迭代转化和蛋白质标记策略优化了关键基因的表达,并引入了异源氧化还原酶途径,使工程化的Y. lipolytica能够利用木糖作为唯一碳源生产β-紫罗兰酮 | NA | 开发高效、绿色和可持续的β-紫罗兰酮生产方法 | β-紫罗兰酮的生产和优化 | 生物工程 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-11-15 |
Advanced bacteria-based biomaterials for environmental applications
2024-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131646
PMID:39419409
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综述 | 本文综述了基于微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP)的先进生物材料在环境应用中的发展 | 结合合成生物学和材料科学,开发可持续的工程活体材料(ELMs),作为传统建筑材料的潜在替代品 | 商业规模应用MICP技术面临的经济挑战和环境问题 | 描述细菌载体和基于MICP的先进ELMs的持续发展 | 微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP)和工程活体材料(ELMs) | 材料科学 | NA | 微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-11-15 |
A dual program for CRP-mediated regulation in bacterial alarmone (p)ppGpp
2024-Nov-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02430-24
PMID:39365062
|
研究论文 | 本文研究了cAMP受体蛋白(CRP)在细菌警报素(p)ppGpp稳态中的双重调控作用 | 发现了CRP作为(p)ppGpp稳态的主调控因子,并通过YfiQ依赖的翻译调控机制增强了RelA、SpoT和CRP自身的翻译 | NA | 揭示CRP在基因表达和细胞功能调控中的作用 | cAMP受体蛋白(CRP)、(p)ppGpp、RelA、SpoT | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-11-13 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-Nov-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
|
研究论文 | 设计并探索了一种基于合成生物学的细胞基生物传感器/执行器,用于检测和对抗细菌感染 | 该系统能够感知多种类型的感染,并通过增强内源性免疫系统进行反应,具有通用性和超敏感性 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器,用于早期检测和对抗细菌感染 | 细菌感染及其对免疫系统的影响 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因工程 | NA | 细胞培养 | 多种革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-11-15 |
SUPREM: an engineered non-site-specific m6A RNA methyltransferase with highly improved efficiency
2024-Nov-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae887
PMID:39417589
|
研究论文 | 通过祖先序列重建技术,研究细菌DNA甲基转移酶EcoGII的序列空间,成功设计出一种高效的非特异性RNA甲基转移酶SUPREM | SUPREM表现出比M.EcoGII更高的表达水平、热稳定性和m6A RNA甲基化活性,且能够甲基化更多的RNA甲基化位点 | NA | 开发一种高效的非特异性RNA甲基转移酶,以改善RNA甲基化的研究工具 | 细菌DNA甲基转移酶EcoGII及其RNA甲基化活性 | 生物工程 | NA | 祖先序列重建 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-11-15 |
Multiphase coacervates: mimicking complex cellular structures through liquid-liquid phase separation
2024-Nov-07, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc04533e
PMID:39439431
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综述 | 本文综述了多相共凝聚物在模拟复杂细胞结构方面的最新进展 | 多相共凝聚物提供了一个强大的框架来复制层次复杂的细胞结构,为细胞组织和功能提供了有价值的见解 | NA | 探讨多相共凝聚物在生物模拟中的应用 | 多相共凝聚物的研究进展 | 材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-11-15 |
Potential approaches to create ultimate genotypes in crops and livestock
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01942-0
PMID:39402155
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研究论文 | 本文探讨了在作物和家畜中创建终极基因型的潜在方法 | 提出了三种未来快速实现终极基因型的途径:加速重组与基因编辑、直接编辑全基因组单倍型序列和合成生物学 | 目前通过传统杂交策略组装终极基因型需要许多代 | 探讨快速实现作物和家畜终极基因型的未来途径 | 作物和家畜的终极基因型 | NA | NA | 基因编辑 | NA | 基因型和表型数据 | 数千至数百万个主要作物和家畜物种的个体 | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-11-15 |
Neonatal bioethics, AI, and genomics
2024-Nov, Early human development
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.earlhumdev.2024.106130
PMID:39405800
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研究论文 | 探讨人工智能、合成生物学和基因组学在医学实践中的影响 | 提出人工智能和合成生物学将彻底改变我们对健康、疾病、医学和人类本质的理解 | 主要基于推测,缺乏具体实验数据支持 | 探讨人工智能和合成生物学对医学实践和人类本质的影响 | 人工智能、合成生物学和基因组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-11-15 |
Matching Together Living Cells and Prototissues: Will There Be Chemistry?
2024-Sep-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400378
PMID:39031571
|
综述 | 本文综述了合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞系统的当前研究进展 | 探讨了非生物与生物物质有效整合的化学、生物化学和机械化学方面,为组织工程和新技术的开发提供了新的方向 | NA | 总结当前混合合成细胞/活细胞和原组织/活细胞系统的研究现状,并探讨未来的发展方向 | 合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞的整合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-11-14 |
Engineering peroxisomal surface display for enhanced biosynthesis in the emerging yeast Kluyveromyces marxianus
2024-Nov-01, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.10.014
PMID:39489214
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研究论文 | 本文研究了在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中通过工程化过氧化物酶体表面展示来增强生物合成 | 开发了一种新的酶共定位技术,通过过氧化物酶体表面展示来提高非天然产品的合成效率 | NA | 探索在Kluyveromyces marxianus中通过过氧化物酶体表面展示技术提高非天然产品的生物合成 | Kluyveromyces marxianus酵母中的过氧化物酶体表面展示技术 | 合成生物学 | NA | 过氧化物酶体表面展示 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-11-12 |
Optimisation of surfactin yield in Bacillus using data-efficient active learning and high-throughput mass spectrometry
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.012
PMID:38550972
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研究论文 | 本文报道了使用主动学习结合代谢组学优化枯草芽孢杆菌中表面活性素产量的方法 | 提出了一种数据驱动的媒体优化算法,通过迭代学习产量景观并引导媒体成分向最大生产方向发展,实现了表面活性素产量的显著提升 | NA | 优化合成生物学中设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的下一代方法 | 枯草芽孢杆菌中表面活性素的产量 | 合成生物学 | NA | 高吞吐量质谱 | 主动学习 | 代谢组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-11-11 |
The elimination of two restriction enzyme genes allows for electroporation-based transformation and CRISPR-Cas9-based base editing in the non-competent Gram-negative bacterium Acinetobacter sp. Tol 5
2024-06-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00400-24
PMID:38722179
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研究论文 | 本研究通过删除两种限制性酶基因,实现了非竞争性革兰氏阴性菌Acinetobacter sp. Tol 5的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑 | 首次在Acinetobacter sp. Tol 5中实现了高效的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑,为环境分离菌的基因改造提供了新策略 | NA | 开发环境分离菌Acinetobacter sp. Tol 5的基因改造方法,以促进其在合成生物学中的应用 | Acinetobacter sp. Tol 5菌株及其基因改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基础编辑 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-11-11 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.542877
PMID:37333341
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研究论文 | 研究了茄科植物毛状体中特殊的代谢产物——保护性酰基糖的多样性和进化 | 发现了八种具有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构,并鉴定了一种功能上分化的AcylSugar AcylTransferase 3-Like 1酶 | 仅分析了茄科植物中一小部分物种的酰基糖多样性 | 深入了解茄科植物中酰基糖的化学多样性及其进化和功能 | 茄科植物中的酰基糖及其相关的AcylTransferase酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢物 | 31个茄科植物物种 | NA | NA | NA | NA |